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lowQualScore                  :      22 77 22 1111       99       5    44 5555 22  0000000 44444 1    1 444 44   1  5555 666 3333     666  666666666666   888 1 22   5 22   9999999999999  2 1 1 22 1   1     7 3  333   8888888       77 4444  22 1      9999  666 22  22  333 555555  44 77 1    88 666 000000000      444444  1      1  22 1      99999  22   333333     444 999 1 888 3333   8888888888 3  22  22  2  2 4   22  99 2  555555   2   2 4 2  6  8888  0   22 2 3333  4     
lowQualScore                  :      .. .. .. ....       ..       .    .. .... ..  ....... ..... .    . ... ..   .  .... ... ....     ...  ............   ... . ..   . ..   .............  . . . .. .   .     . .  ...   .......       .. ....  .. .      ....  ... ..  ..  ... ......  .. .. .    .. ... .........      ......  .      .  .. .      .....  ..   ......     ... ... . ... ....   .......... .  ..  ..  .  . .   ..  .. .  ......   .   . . .  .  ....  .   .. . ....  .     
lowQualScore                  :      44 44 44 1111       55       2    00 4444 44  7777777 99999 7    7 333 11   7  2222 222 5555     000  888888888888   666 7 33   0 33   2222222222222  5 7 7 33 7   7     0 6  222   7777777       77 0000  66 9      5555  888 55  55  222 222222  33 33 8    00 444 111111111      888888  7      7  44 7      44444  44   555555     888 111 7 333 7777   1111111111 8  88  88  0  0 0   88  66 0  888888   0   0 0 5  0  9999  5   99 1 4444  2     
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Reference ( gi|18378 )        : CATTC--TC-G--C----CGGAGTTT-TCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---C-GCCA-A-A-G--GGG-GT----A---G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--C-TCC-AGGAA-C-AT---TTT-CG----GAGAGTT-CT----TG--G-ACAGAA--A-AC---A--GC--GC---A------TT--GT-A-GCTG--C---T-G-------GGGGGAC-----TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--TATCGA---C---A-C---C----TTG----------C-TT--CA--GA-TC-G-GAC--TT-CC-CC------CAA-TTT-G-TATT-AA-C--TGTAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18379                      : CATTC--TC-A--C----CGGAGTTG-TCCCTCA-AAGGT-G----A--AA------TA-A---C-GCCA-A-GTG--GGG-GT----A---G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--TTC-C--AGA-------------CCTG-G-A--C-TAC-AAGAA-C-AT---TTC-CG----GAGAGTT-GT----TT--T-ACAGAA--T-AC---A--GC--AC---A------TT--GT-A-GCTG--C---TCG-------GAGGGGC-----TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C----TTG----------T-TT--CA--GA-TT-G-GGC--TT-CC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA-G--TGAAGC--A-A----AA-CTG
gi|18380                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTTT-TCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------GA-A---C-GCCA-A-G-T--GGG-GT----A---G----CGTCA-A-GG------G-----ACT--CT-T--CTC-C--TGA-------------CCTG-G-A--G-TTC-GGGGA-C-AT---TAT-CC----GAAAGTT-GT----TG--G-GCAGAA--T-AC---A--GC--GC---A------CT--GA-A-GCTG--C---TCG-------GAGAGAC-----TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--A--CG--TTCT-C--CATTGG---C---A-C---C----TTG----------C-TC--CA--GA-TC-G-GAC--TT-CC-CC------CAA-CTT-G-TTTT-AA-G--TGCAGC--A-A----AT-TTGGG
gi|18384                      : CATTA--TC-G--C----AGGAGTTT-CCCTTCA-A-GCC-G----A--AA------TA-A---C-GCTA-A-A-G--GG---T----A---G----T-TCA-A-G-------------ACC--CA-T--CTC-C--AGA-------------CCCG---A--C-TCC-AG-AA-C-AT---TTT-CG----GAGAGTT-GT----TG----ACAGAA--T-AC---A--GC--GC---A------TT--GT-A-GCGG--C---T-C-------GGGAC-C-----TG-TAAATG-TC--C-CAAACG--G--CG--TTCA-T--CATCGA---C---A-C---C----TTG----------CGTT--CA---A-TC-A-GAC--TT--C-CC------AAA-TTT-G-TATT-AAGG--TATAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18381                      : CATTA--TT-G--C----CGGATTTG-TCTCTCA-AAACCAG----A--AA------GA-A---C-AACA-AGA-G--GGG-GT----A---G----CGTCA-A-GG------A-----ACC---T-T--CTT-C--AGA-------------CTTT-G-A--C-TCC-AGGAA-C-AT---TCT-TA----GAGAGTT-GT----TG--G-ATAGAA--T-GC---A--GC--TC---A------TT--AA-A-GCTG--CTTTT-A-------GGGAGA-------A-TAAATG-TT--C-CCAAGA--G--CG--TTCT-C---AACGG---C---A-C---T----TTG----------C-TC--CA--GA-TC-G-GAC--TT--C-CG------CGA-CTT-G-TCTT-AG-G--TGCGGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18387                      : CATTCCTTC-G--C----CGGAGTTT-TCCCCTC-AAGCG-A----A--AA------TA-C---C-TTCA-A-AAG--GGG-GT----T---A----CGTCA-A-GG------GGA---ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-GAA--T-TCC-AGAAA-C-A----TTT-CG----GAG-GTT-GT----TG--GAACAGAA--T-ACA--A--GC--AC---A------TT--GT---GTTT--C---T----------AGGAAA-----TG-TAAATG-TTCGC-CCAAGG--G--C---TTCA-T--CATCGA---C---A-CCTGC----TTG----------C-TT--CA--GA-TC---GAC--TT-TC-CC--------A-TTT-G-TATTAAA-G--TGTAGC----A----AG-CTGGG
gi|18385                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGATG-CCTCTCA-AATCC-G----A--AA------TA-A---T-GCCA-A-GTG--GGG-GT----A---G----CGTCA-A-G---------------------------------A-------------CCTG-G-A--C-TCC-AGGAA-C-AT---TTT-TG----GAGAGTTGCA----TG--G-ACAGAA--T-AC---A--GC--GC---A------TT--GC-A-GTTG--T---TCG-------GGGGGAC-----TG-TAAATA-TT--C-TCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C----------------------------------------------------------CAA-TTT-G-TATG-AA-G--TGCAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18393                      : CATTC--TCCG--C----CGGGGTTC--CCTTCA-AAGCC-A----A--AA------TA-A---C-ACCA-A-A-T--GCG--T----A---GTCCGCGTCA---GG------G-----ACC---T-T--CTC----AGA-------------CCCA-G-A--C-TCC-AGGAA-C-AT---TTT-TC----GGGAGTT--T----TGTTG-ACAGAA--T-AC---A--GT--GC---A------TT--GT-A-GCTG--C---T-C-------GGGGA-------TG-TAAATG-TT--CACAAAGG--G--AGTTTTCACC--CACGGA---C---ATC---C----TTG----------C--T--CA--GA-TCTG-GAC--TT-CC-TC------C-A-TTT-GTTATT-GA-TTATGTAGC----A----AG-CTGGG
gi|18383                      : CATTC--TT-G--C----CGGAGTTG-TCCCTCA-AAGTC-G----A--AA------GA-A---C-GCAA-G-T-G--GGG-GT----A---G----CGTTA-A-GG------A-----ACC---T-T--CTC-C--------------------------------C-A---A-C-AT---TCT-CT----GAGAGTT-GT----TG--G-ACAGAA--T-AC---A--GC--GA---A------TT--GA-A-GCTGC-C---T-G-------GAGGGAC-----TG-TAAATG-AT--C-TCAAGG--GT-CG--TCCT-C--AATCTG---T---A-C---C----TTG----------C-TC--CA--GA-TT-G-GAC--TT-CCGCCGACTTTCGA-CTT-G-TTTT-AA-G--TACAGC--G-A----AG-GTGGG
gi|18382                      : CATTA--TT-G--C-----GGATTTG-TCTCTCA-AAACCAG----A--AA------GA-A---C-AACA-AGA-G--GGG-GT----A---G----CGTCA----G------G-----AAC--CT-T--CTT-C--AGA-------------CTTT-G-A--C-TCC-AGGAA-C-AT---TCT-TA----G-GAGTT-GT----TG--G-ATAGAA--T-GC---A--GC--TC---A------TT--AA-A-GCTG--CATTT-A-------GGGAGA-------A-TAAATG-TT--C-CCAAGA--G--CG--TTCA----TAACGG---C---A-C---T----TTG----------C-TC--CA--GA-TC-GTGAC--TC-TC-CG------CGACTTT-G-TCTT-AG-G--TGCGGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18390                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTTA-TCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----C-GCAA-GTG-G--GGG-GT----A---G----CGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--C-TCC-AGGAAAC-AT---TTC-GG----AAGAGTT-AT----TG--G-ACAGAA--T-AT---A--GC--GC---A------TT--GTAA-ACTG--C---TCG-------GAGGGGC-----TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C----TTGGC--------C-TT--CC--GA-TC-G-GAC--TTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA-G--TGTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
gi|18389                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTTA-TCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----C-GCAA-GTG-G--GGG-GT----A---G----CGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--C-TCC-AGGAAAC-AT---TTC-GG----AAGAGTT-AT----TG--G-ACAGAA--T-AT---A--GC--GC---A------TT--GTAA-ACTG--C---TCG-------GAGGGGC-----TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C----TTGGC--------C-TT--CC--GA-TC-G-GAC--TTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA-G--TGTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
gi|18388                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTTA-TCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----C-GCAA-GTG-G--GGG-GT----A---G----CGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--C-TCC-AGGAAAC-AT---TTC-GG----AAGAGTT-AT----TG--G-ACAGAA--T-AT---A--GC--GC---A------TT--GTAA-ACTG--C---TCG-------GAGGGGC-----TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C----TTGGC--------C-TT--CC--GA-TC-G-GAC--TTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA-G--TGTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
gi|18386                      : CATTT--TC-A--C----CGGAGTTG-TCCCACA-AAGCC-G----A--AA------GA-A---C-GCAA-A-GTG--GGG-GT----AA--G----CGTCA-A-AG------GGAAGGACC--C-----CGC-C--AAAGGGGAGGGGGACCCCCG-C-CTTC-TCC-AGGAA-C-AT---TCT-AGATAGGATGGTT-GT----TG--G-ACAGCA--T-AC---A--GC--GC---A------TT--GA-A-GCAG--C---TCG-------GAGGGAC-----TG-TAAATG-TA--C-CCAGGG--G--TT--TTCT-C--CATCGA---C---A-C---C----TTG----------C-TC--CA----------AAC--TT-CC-CT------CGA-CTT-G-TTTT-AG-G--TGCGGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18391                      : CATTC--TT-G--C----CGGAGTTG-TCTCTCA-AGGCC-G----A--AAGTGCAATGTA---C-ACCA-A-GTG--GGA-GT----T---C----TGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CT--------------------------G--------C-AGGAA-C-AT---TCT-CA----GAGAGTT-TT----TG--G-ATAGAG--T-GT---A--GC--GC---A------TT--GC-A-GCTG--C---TCT-------GAGATAC-----AG-TAAATG-TT--T-TCAAGG--G--CG--TTCT-T--CATCGG---C---A-C---C----TTG----------C-CC--CA--AA-TT-G-GA---TT-TC-CT------CGA-CTT-C-TTTT-AA-G--TGCGGT--A-A----AG-CTGGG
gi|18395                      : CATTC--TCCG--C----CGGAGTTT-TCCCT-A-AAGCC-G----A--AC------TA-AACGC-ACCA-A-AAG--GGG-GT----AA--G----CGTCA-A-GG------------ACC--GT-TATCTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--C-TCCAAGGAA-CAAT---TTT-CG----GAGAGTT-GT----T---G-ACAGGA--ATACA--A--GC--GC---AATTGATTT--GT-A-GCTG--A---T---------GGAGGAC-----TG--AA----TT--C-CCTAGG--G--CG--TT-A-C--TATCTA---C---A-C---C----
gi|18394                      : CATTT--TC-G--A----AGGAGTTTGCCCCTCA-AAGCC-A----A--AA------AT-A---C-GCCACA-A-GT-GGG-GC----A---G----GGTCA-A-GG------G-----ATTTTCT-T--CTC-C--ACA-------------CCTGCG-A--T-TCC-AGGAA-C-AT---TCTACC----GAGAGTG--T----TG--G-ACAAAA--T-GC---ATTG---GC---A------TT--GA-A-GCTG--C---T-CT------GAGGGAC-----AG-TAAATG-TT--C-CCAAAG--G--CG--TCCT-C--GCTCGACCTC---A-C---CCAGGCTGAGGGACACAAC-TC--CA--GG-AC-G-GGC--TT-CC-CC------CAA-CTT-G-TTTT-AA-C--TGT
gi|18392                      : CATTC--TT-G--C----CAGAGTTG-CCTCTCA-AAGCC-G----A--CA------GT-A---C-GTCA-A-GTG--GGA-AC----A---G----GATCA-A-GG------G-----ACT--CT-T--CTC-C--AAA-------------ACTG-G-A--C-ACC-AGGAA-C-AT---TCT---------GAGTT-AT----TG--G-ACAGAA--T-AC---A--AC--GC---A------TT--GA-A-GCTG--C---TCT-------AAGGGAC-----AG-TAAATG-TT--C-CCAGAG--G--CG--CTCT-C--CATTGG---C---A-C---C----TCG----------C-Tgc
gi|18396                      : CATTC--TC-A--C----CGGAGTTA-TCTCTCA-AAGTC-A----A--AA-------A-A---C-GGCA-A-GTA--GGG-GT----A---G----CGTCA-A-GG------G-----GCC--CT-T--CTC-T--AGA-------------CCTG-A-A--T-TCC-AGAAA-c
gi|18397                      : CATTC--TC-G--C----CGGGATCG-CCCCCTA----CC-GCGTCA--AG------TG-G-----GTCA-A-GTG--GGG-GC----G---G----AATCA-C-GG------G-----AAT--CT-T--CAC-C--CTA-------------TCGG-A-A--C-TCG-AGGGA-TGAT---ATT-GC----GA-AGCT-GT----TG--G-ACAGAA--T-GC---A--GC--AT---G------TG--GA-A-GATGCTC---T-G-------AGGGAAA-----TG-CAAA-G-TT--C-CCATGG--A--CC--TTCGTC--TGT-GG---C---A-C---C----T
gi|18398                      : CATTA--T--G--C----CG-AGTTT-TCTCTCA-AAGCC------A--AA------GA-A---CAGC---A-A-GTCGGG-GTA---A---A----CGTCC-A-GG------G-----ATC--AT-T--CTA-CTAAGA-------------CCTG-G-A--T-TCC-acccctgcgaggccaagggacattacaccagaacagacaccccctacatgtttcaagtgtgaaaaagccggg
gi|18399                      :  ATTC--TCAG--C----CGAAGTTG-TCC-TCC-AAGC--A----A--AA------GA-A-----GCCA-A-G-T--GGGTGT----A---G----CGTTA-A-GG------G-----A----CT-T--CTC-C--AG----------------TG-G-A--C-TCC-AGG-A-C-AT---T----G----GGGAGTT-GT----TG--G-ATAGAAT-A-AC---G--AC--GC---A------TT--GT-A-GCTGA-C---TCG-------GAGGGA------TG-TAAATG-TT--C-C---------------TTA-C--C--------C---C-C---T----TTG----------C-TT--CA--GA----G-GAA--CA-CT-TC------CAA-TTT-GATATTCAA-T--GGCAGC--A-A----AG-CTG
gi|18400                      :    TC--TC-AACC----CAGAGTGA-TCCCTCA-AAGCC-G----A--GAAC----CA-C---C-GCCA-A-A-G--TGG-GTCTGGATATG----CATTATA-AGTCATTCG-----ACC--ATAT--CGT-C--AGA-------------TTTG-G-G--CTTCC-TGGAATC-ATATCTTC-TG----GAGAGTG-GTAAAATG--G----GAACGA-ACTTTA--GCCAGCATAA------TT--GT-A-ACTGC-C---T-AC------GGGAGGC-----TG-TAAATATTT--C-CCAAAGATG--CG--GTCA-C--
gi|18401                      :      --TC-G--C----AGGAGTGT-TCTCTCA-A-GCC-GC---AGCAA------TA-A-----ACCG-T-A-A--AGA-GT----A--------CGTCA-A-GG------G-----ACC--TT-A--CTC-C--AGA-------------TCCG-G-A--C-TCC-AGGAA-C-AT---TTT-CG----AAGAG-G-GT----TG--G-ACAGAA--T-AC---A--GC--GC---A------TCTGGT-A-GC-G--C---C-G-------CGCGAGCGTGCGCG-TAAAAG-GT--C-CCAAAGC-G--CG--TTC--C--CATCGAC--C---A-C---C----TTGA---------C-TTTCCA--GA-TC-GAGAC--TT-CC-CA------AAA-TTT-G-TATT-AA----GGTAGCCGA-A----AG-CTGcctcagtggctatccttgtctgtcaagacggaacattcggcaccaacttaatagtatataagatgc
gi|18402                      :                                                                                 G-GT----C---G----CGTCA-A-GG------G-----ACC---T-T--CTC-C--AGA-------------CCCA-G-A--C-TCC-AGGAA-C-AT---
gi|18403                      :                                                                                                                                                                                                                        GAA--C-AC---A--GC--GC---A------TTG-GT-AGGCTG--C---T-GCATGCCTGAGGGAC-----TGTTAAGTG-TT--C-CC---------CA--TCAA-C--TACC-----T---G-T---C----TTT----------CGTT--CATTGATTC-G-GATCGCT-CT-CG------CAA-TTTCT-TATTAAA-G--TGCAGC--ATA----AGCCTGGG
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Reference ( family-663 )      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCCA--A---G-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTTGT----TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--GCGCA------TT--G--NAGCTG-C--T------CG-GAG-GG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CGA-TTT-G-TNTT-AA--GT-GCAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18378                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-TTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCCA--A---A-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTTCT----TG--G--ACA-GAA---AA--C-A--GCGCA------TT--G--TAGCTG-C--T-------G-GGG-GG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--TATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----TCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CAA-TTT-G-TATT-AA--CT-GTAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18379                      : CATTC--TC-A--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGGT-G----A--AA------TA-A---CGCCA--A---GTGG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--TTC-C--AGA-------------CCTG-G-A--CT-ACA-AGAA-C---A-TTTC-C-G----GAGAGTTGT----TT--T--ACA-GAA---TA--C-A--GCACA------TT--G--TAGCTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------T--------------T----TCAGATT-G-GGCTT-CC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GAAGC--A-A----AA-CTG
gi|18380                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-TTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------GA-A---CGCCA--A---G-TG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACT--CT-T--CTC-C--TGA-------------CCTG-G-A--GT-TCG-GGGA-C---A-TTAT-C-C----GAAAGTTGT----TG--G--GCA-GAA---TA--C-A--GCGCA------CT--G--AAGCTG-C--T------CG-GAG-AG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--A--CG--TTCT-C--CATTGG---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CAA-CTT-G-TTTT-AA--GT-GCAGC--A-A----AT-TTGGG
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gi|18385                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGAT-GCCTCTCA-AATCC-G----A--AA------TA-A---TGCCA--A---GTGG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-G---------------------------------A-------------CCTG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-T-G----GAGAGTTGCA---TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--GCGCA------TT--G--CAGTTG-T--T------CG-GGG-GG-AC-TG-TAAATA-TT--C-TCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-----------------------------------------------------------------------------C------CAA-TTT-G-TATG-AA--GT-GCAGC--A-A----AG-CTGGG
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gi|18387                      : CATTCCTTC-G--C----CGGAGTT-TTCCCCTC-AAGCG-A----A--AA------TA-C---CTTCA--A---AAGG---GG-GT-T-A----CGTCA-A-GG------GGA---ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-GAA--TT-CCA-GAAA-C---A--TTT-C-G----GAG-GTTGT----TG--GA-ACA-GAA---TA--CAA--GCACA------TT--G--T-GTTT-C--T----------AG-GA-AA-TG-TAAATG-TTCGC-CCAAGG--G--C---TTCA-T--CATCGA---C---A-CCTGC-------------T-----TG----------C--------------T----TCAGATC---GACTT-TC-CC--------A-TTT-G-TATTAAA--GT-GTAGC----A----AG-CTGGG
gi|18388                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTT-ATCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----CGCAA--GT--G-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--CT-CCA-GGAAAC---A-TTTC-G-G----AAGAGTTAT----TG--G--ACA-GAA---TA--T-A--GCGCA------TT--GT-AAACTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C-------------T-----TGGC--------C--------------T----TCCGATC-G-GACTTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
gi|18389                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTT-ATCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----CGCAA--GT--G-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--CT-CCA-GGAAAC---A-TTTC-G-G----AAGAGTTAT----TG--G--ACA-GAA---TA--T-A--GCGCA------TT--GT-AAACTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C-------------T-----TGGC--------C--------------T----TCCGATC-G-GACTTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
gi|18390                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTT-ATCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----CGCAA--GT--G-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--CT-CCA-GGAAAC---A-TTTC-G-G----AAGAGTTAT----TG--G--ACA-GAA---TA--T-A--GCGCA------TT--GT-AAACTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C-------------T-----TGGC--------C--------------T----TCCGATC-G-GACTTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
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gi|18392                      : CATTC--TT-G--C----CAGAGTT-GCCTCTCA-AAGCC-G----A--CA------GT-A---CGTCA--A---GTGG---GA-AC-A-G----GATCA-A-GG------G-----ACT--CT-T--CTC-C--AAA-------------ACTG-G-A--CA-CCA-GGAA-C---A-TTCT----------GAGTTAT----TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--ACGCA------TT--G--AAGCTG-C--T------CT-AAG-GG-AC-AG-TAAATG-TT--C-CCAGAG--G--CG--CTCT-C--CATTGG---C---A-C---C-------------T-----CG----------C--------------T----C
gi|18393                      : CATTC--TCCG--C----CGGGGTT--CCCTTCA-AAGCC-A----A--AA------TA-A---CACCA--A---A-TG---CG--T-A-GTCCGCGTCA---GG------G-----ACC---T-T--CTC----AGA-------------CCCA-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-T-C----GGGAGTT-T----TGTTG--ACA-GAA---TA--C-A--GTGCA------TT--G--TAGCTG-C--T------CG---G-GG-A--TG-TAAATG-TT--CACAAAGG--G--AGTTTTCACC--CACGGA---C---ATC---C-------------T-----TG----------C--------------T-----CAGATCTG-GACTT-CC-TC------C-A-TTT-GTTATT-GATTAT-GTAGC----A----AG-CTGGG
gi|18394                      : CATTT--TC-G--A----AGGAGTTTGCCCCTCA-AAGCC-A----A--AA------AT-A---CGCCACAA---G-TG---GG-GC-A-G----GGTCA-A-GG------G-----ATTTTCT-T--CTC-C--ACA-------------CCTGCG-A--TT-CCA-GGAA-C---A-TTCTAC-C----GAGAGT-GT----TG--G--ACA-AAA---TG--C-ATTG-GCA------TT--G--AAGCTG-C--T------CT-GAG-GG-AC-AG-TAAATG-TT--C-CCAAAG--G--CG--TCCT-C--GCTCGACCTC---A-C---CCAGG---------C-----TGAGGGACACAAC--------------T----CCAGGAC-G-GGCTT-CC-CC------CAA-CTT-G-TTTT-AACTGT-GC
gi|18395                      : CATTC--TCCG--C----CGGAGTT-TTCCCT-A-AAGCC-G----A--AC------TA-AACGCACCA--A---AAGG---GG-GT-AAG----CGTCA-A-GG------------ACC--GT-TATCTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCAAGGAA-C---AATTTT-C-G----GAGAGTTGT----T---G--ACAGGAA---TA--CAA--GCGCAATTGATTT--G--TAGCTG-A--T-------G-GA--GG-AC-TG--AA----TT--C-CCTAGG--G--CG--TT-A-C--TATCTA---C---A-C---C-------------
gi|18396                      : CATTC--TC-A--C----CGGAGTT-ATCTCTCA-AAGTC-A----A--AA-------A-A---CGGCA--A---GTAG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----GCC--CT-T--CTC-T--AGA-------------CCTG-A-A--TT-CCA-GAAA-
gi|18397                      : CATTC--TC-G--C----CGGGATC-GCCCCCTA----CC-GCGTCA--AG------TG-G----GTCA--A---GTGG---GG-GC-G-G----AATCA-C-GG------G-----AAT--CT-T--CAC-C--CTA-------------TCGG-A-A--CT-CGA-GGGA-TG--A-TATT-G-C----GA-AGCTGT----TG--G--ACA-GAA---TG--C-A--GCATG------TG--G--AAGATG-C--T------CT-GAG-GGAAA-TG-CAAA-G-TT--C-CCATGG--A--CC--TTCG-T--CTGTGG---C---A-C---C-------------TACCCCTG----------CGAGGCCAAGGGACATTACACCAGAAC-A-GAC-A-CC-CC------CTA-CAT-G-TTTC-AA--GT-GTGAA--A-A----AG-CCGGG
gi|18398                      : CATTA--T--G--C----CG-AGTT-TTCTCTCA-AAGCC------A--AA------GA-A---CAGCA--A---GTCG---GG-GTAA-A----CGTCC-A-GG------G-----ATC--AT-T--CTA-CTAAGA-------------CCTG-G-A--TT-CC
gi|18399                      :  ATTC--TCAG--C----CGAAGTT-GTCC-TCC-AAGC--A----A--AA------GA-A----GCCA--A---G-TG---GGTGT-A-G----CGTTA-A-GG------G-----AC----T-T--CTC-C--AG----------------TG-G-A--CT-CCA-GGA--C---A-TT-----G----GGGAGTTGT----TG--G--ATA-GAA---TAA-C-G--ACGCA------TT--G--TAGCTGAC--T------CG-GAG-GG-A--TG-TAAATG-TT--C-C---------------TTA-C--C--------C---C-C---T-------------T-----TG----------C--------------T----TCAGA---G-GAACA-CT-TC------CAA-TTT-GATATT-CA--ATGGCAGC--A-A----AG-CTG
gi|18400                      :    TC--TC-AACC----CAGAGTG-ATCCCTCA-AAGCC-G----A--GAAC----CA-C---CGCCA--AAGTG-GGTCTGG-AT-ATG----CATTATA-AGTCATTCG-----ACC--ATAT--CGT-C--AGA-------------TTTG-G-G--CTTCCT-GGAA-TCATA-TCTT-CTG----GAGAGTGGTAAAATG--GGAAC--GAACTTTAGCC-A--GCATAA-----TT--G--TAACTG-C--CTA----CG-GGA-GG--C-TG-TAAATATTT--C-CCAAAGATG--CG--GTCA-C--CCTC
gi|18401                      :      --TC-G--C----AGGAGTG-TTCTCTCA-A-GCC-GC---AGCAA------TA-AAC-CGTAA--A---G-AG-------T-A------CGTCA-A-GG------G-----ACC--TT-A--CTC-C--AGA-------------TCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----AAGAG-GGT----TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--GCGCA------TCTGG--TAGCGC-C--G------CGCGAGCGT-GCGCG-TAAAAG-GT--C-CCAAAGC-G--CG--TTC--C--CATCGAC--C---A-C---C-------------T-----TGACT-------T--------------T----CCAGATC-GAGACTT-CC-CA------AAA-TTT-G-TATT-AA--G--GTAGCCGA-A----AG-CTGagtggctatccttgtctgtcaagacggaacattcggcaccaacttaatagtatataagatgc
gi|18402                      :                                                                                    G-GT-C-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC---T-T--CTC-C--AGA-------------CCCA-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-T
gi|18403                      :                                                                                                                                                                                                                       -GAA---CA--C-A--GCGCA------TT--GGTAGGCTG-C--TGCATGCCT-GAG-GG-AC-TGTTAAGTG-TT--C-C-------------------C--CATCAA---CT--A-C---CTGTCTTTCGTTCAT-----TG----------A--------------T----TCGGATC-G----CT-CT-CG------CAA-TTTCT-TATTAAA--GT-GCAGC--ATA----AGCCTGGG
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Alignments
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lowQualScore                  :      .. .. .. ....       ..       .    .. .... ..  .............     .. .....  ...  .  . . ....     ...  ...... .....   ... . ..   . ..   .............  . . . ..  .   .    . ... .    ........         ....  .. ..   .   ...  .. . ..     ......  .. ...     . .. ......  .   .  .  .  .      .  .. .      .....  ..   .. ..      ... ... . ................. .....  ......................... ....       . .     .. .  ........ .   . . .  .  ..  .     .. . ....  .     
lowQualScore                  :      33 77 33 6666       44       0    44 2222 33  9999999999999     33 99999  999  6  6 8 4444     444  666666 22222   888 6 22   8 22   8888888888888  0 6 6 22  6   7    0 888 7    55555555         7777  55 33   7   000  11 5 44     777777  44 666     7 44 444444  7   7  7  5  7      7  33 7      66666  33   00 99      666 444 7 00000000000000000 33333  3333333333333333333333333 7777       8 6     99 8  77777777 8   8 6 0  6  88  8     66 9 1111  8     
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Reference ( family-663 )      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCCA--A---G-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTTGT----TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--GCGCA------TT--G--NAGCTG-C--T------CG-GAG-GG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CGA-TTT-G-TNTT-AA--GT-GCAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18378                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-TTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCCA--A---A-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTTCT----TG--G--ACA-GAA---AA--C-A--GCGCA------TT--G--TAGCTG-C--T-------G-GGG-GG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--TATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----TCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CAA-TTT-G-TATT-AA--CT-GTAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18379                      : CATTC--TC-A--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGGT-G----A--AA------TA-A---CGCCA--A---GTGG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--TTC-C--AGA-------------CCTG-G-A--CT-ACA-AGAA-C---A-TTTC-C-G----GAGAGTTGT----TT--T--ACA-GAA---TA--C-A--GCACA------TT--G--TAGCTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------T--------------T----TCAGATT-G-GGCTT-CC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GAAGC--A-A----AA-CTG
gi|18380                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-TTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------GA-A---CGCCA--A---G-TG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACT--CT-T--CTC-C--TGA-------------CCTG-G-A--GT-TCG-GGGA-C---A-TTAT-C-C----GAAAGTTGT----TG--G--GCA-GAA---TA--C-A--GCGCA------CT--G--AAGCTG-C--T------CG-GAG-AG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--A--CG--TTCT-C--CATTGG---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CAA-CTT-G-TTTT-AA--GT-GCAGC--A-A----AT-TTGGG
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gi|18385                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGAT-GCCTCTCA-AATCC-G----A--AA------TA-A---TGCCA--A---GTGG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-G---------------------------------A-------------CCTG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-T-G----GAGAGTTGCA---TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--GCGCA------TT--G--CAGTTG-T--T------CG-GGG-GG-AC-TG-TAAATA-TT--C-TCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-----------------------------------------------------------------------------C------CAA-TTT-G-TATG-AA--GT-GCAGC--A-A----AG-CTGGG
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gi|18387                      : CATTCCTTC-G--C----CGGAGTT-TTCCCCTC-AAGCG-A----A--AA------TA-C---CTTCA--A---AAGG---GG-GT-T-A----CGTCA-A-GG------GGA---ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-GAA--TT-CCA-GAAA-C---A--TTT-C-G----GAG-GTTGT----TG--GA-ACA-GAA---TA--CAA--GCACA------TT--G--T-GTTT-C--T----------AG-GA-AA-TG-TAAATG-TTCGC-CCAAGG--G--C---TTCA-T--CATCGA---C---A-CCTGC-------------T-----TG----------C--------------T----TCAGATC---GACTT-TC-CC--------A-TTT-G-TATTAAA--GT-GTAGC----A----AG-CTGGG
gi|18388                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTT-ATCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----CGCAA--GT--G-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--CT-CCA-GGAAAC---A-TTTC-G-G----AAGAGTTAT----TG--G--ACA-GAA---TA--T-A--GCGCA------TT--GT-AAACTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C-------------T-----TGGC--------C--------------T----TCCGATC-G-GACTTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
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gi|18390                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTT-ATCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----CGCAA--GT--G-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--CT-CCA-GGAAAC---A-TTTC-G-G----AAGAGTTAT----TG--G--ACA-GAA---TA--T-A--GCGCA------TT--GT-AAACTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C-------------T-----TGGC--------C--------------T----TCCGATC-G-GACTTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
gi|18391                      : CATTC--TT-G--C----CGGAGTT-GTCTCTCA-AGGCC-G----A--AAGTGCAATGTA---CACCA--A---GTGG---GA-GT-T-C----TGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CT--------------------------G--------CA-GGAA-C---A-TTCT-C-A----GAGAGTTTT----TG--G--ATA-GAG---TG--T-A--GCGCA------TT--G--CAGCTG-C--T------CT-GAG-AT-AC-AG-TAAATG-TT--T-TCAAGG--G--CG--TTCT-T--CATCGG---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------C----CCAAATT-G-GA-TT-TC-CT------CGA-CTT-C-TTTT-AA--GT-GCGGT--A-A----AG-CTGGG
gi|18392                      : CATTC--TT-G--C----CAGAGTT-GCCTCTCA-AAGCC-G----A--CA------GT-A---CGTCA--A---GTGG---GA-AC-A-G----GATCA-A-GG------G-----ACT--CT-T--CTC-C--AAA-------------ACTG-G-A--CA-CCA-GGAA-C---A-TTCT----------GAGTTAT----TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--ACGCA------TT--G--AAGCTG-C--T------CT-AAG-GG-AC-AG-TAAATG-TT--C-CCAGAG--G--CG--CTCT-C--CATTGG---C---A-C---C-------------T-----CG----------C--------------T----C
gi|18393                      : CATTC--TCCG--C----CGGGGTT--CCCTTCA-AAGCC-A----A--AA------TA-A---CACCA--A---A-TG---CG--T-A-GTCCGCGTCA---GG------G-----ACC---T-T--CTC----AGA-------------CCCA-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-T-C----GGGAGTT-T----TGTTG--ACA-GAA---TA--C-A--GTGCA------TT--G--TAGCTG-C--T------CG---G-GG-A--TG-TAAATG-TT--CACAAAGG--G--AGTTTTCACC--CACGGA---C---ATC---C-------------T-----TG----------C--------------T-----CAGATCTG-GACTT-CC-TC------C-A-TTT-GTTATT-GATTAT-GTAGC----A----AG-CTGGG
gi|18394                      : CATTT--TC-G--A----AGGAGTTTGCCCCTCA-AAGCC-A----A--AA------AT-A---CGCCACAA---G-TG---GG-GC-A-G----GGTCA-A-GG------G-----ATTTTCT-T--CTC-C--ACA-------------CCTGCG-A--TT-CCA-GGAA-C---A-TTCTAC-C----GAGAGT-GT----TG--G--ACA-AAA---TG--C-ATTG-GCA------TT--G--AAGCTG-C--T------CT-GAG-GG-AC-AG-TAAATG-TT--C-CCAAAG--G--CG--TCCT-C--GCTCGACCTC---A-C---CCAGG---------C-----TGAGGGACACAAC--------------T----CCAGGAC-G-GGCTT-CC-CC------CAA-CTT-G-TTTT-AACTGT-GC
gi|18395                      : CATTC--TCCG--C----CGGAGTT-TTCCCT-A-AAGCC-G----A--AC------TA-AACGCACCA--A---AAGG---GG-GT-AAG----CGTCA-A-GG------------ACC--GT-TATCTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCAAGGAA-C---AATTTT-C-G----GAGAGTTGT----T---G--ACAGGAA---TA--CAA--GCGCAATTGATTT--G--TAGCTG-A--T-------G-GA--GG-AC-TG--AA----TT--C-CCTAGG--G--CG--TT-A-C--TATCTA---C---A-C---C-------------
gi|18396                      : CATTC--TC-A--C----CGGAGTT-ATCTCTCA-AAGTC-A----A--AA-------A-A---CGGCA--A---GTAG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----GCC--CT-T--CTC-T--AGA-------------CCTG-A-A--TT-CCA-GAAA-
gi|18397                      : CATTC--TC-G--C----CGGGATC-GCCCCCTA----CC-GCGTCA--AG------TG-G----GTCA--A---GTGG---GG-GC-G-G----AATCA-C-GG------G-----AAT--CT-T--CAC-C--CTA-------------TCGG-A-A--CT-CGA-GGGA-TG--A-TATT-G-C----GA-AGCTGT----TG--G--ACA-GAA---TG--C-A--GCATG------TG--G--AAGATG-C--T------CT-GAG-GGAAA-TG-CAAA-G-TT--C-CCATGG--A--CC--TTCG-T--CTGTGG---C---A-C---C-------------TACCCCTG----------CGAGGCCAAGGGACATTACACCAGAAC-A-GAC-A-CC-CC------CTA-CAT-G-TTTC-AA--GT-GTGAA--A-A----AG-CCGGG
gi|18398                      : CATTA--T--G--C----CG-AGTT-TTCTCTCA-AAGCC------A--AA------GA-A---CAGCA--A---GTCG---GG-GTAA-A----CGTCC-A-GG------G-----ATC--AT-T--CTA-CTAAGA-------------CCTG-G-A--TT-CC
gi|18399                      :  ATTC--TCAG--C----CGAAGTT-GTCC-TCC-AAGC--A----A--AA------GA-A----GCCA--A---G-TG---GGTGT-A-G----CGTTA-A-GG------G-----AC----T-T--CTC-C--AG----------------TG-G-A--CT-CCA-GGA--C---A-TT-----G----GGGAGTTGT----TG--G--ATA-GAA---TAA-C-G--ACGCA------TT--G--TAGCTGAC--T------CG-GAG-GG-A--TG-TAAATG-TT--C-C---------------TTA-C--C--------C---C-C---T-------------T-----TG----------C--------------T----TCAGA---G-GAACA-CT-TC------CAA-TTT-GATATT-CA--ATGGCAGC--A-A----AG-CTG
gi|18400                      :    TC--TC-AACC----CAGAGTG-ATCCCTCA-AAGCC-G----A--GAAC----CA-C---CGCCA--AAGTG-GGTCTGG-AT-ATG----CATTATA-AGTCATTCG-----ACC--ATAT--CGT-C--AGA-------------TTTG-G-G--CTTCCT-GGAA-TCATA-TCTT-CTG----GAGAGTGGTAAAATG--GGAAC--GAACTTTAGCC-A--GCATAA-----TT--G--TAACTG-C--CTA----CG-GGA-GG--C-TG-TAAATATTT--C-CCAAAGATG--CG--GTCA-C--CCTC
gi|18401                      :      --TC-G--C----AGGAGTG-TTCTCTCA-A-GCC-GC---AGCAA------TA-AAC-CGTAA--A---G-AG-------T-A------CGTCA-A-GG------G-----ACC--TT-A--CTC-C--AGA-------------TCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----AAGAG-GGT----TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--GCGCA------TCTGG--TAGCGC-C--G------CGCGAGCGT-GCGCG-TAAAAG-GT--C-CCAAAGC-G--CG--TTC--C--CATCGAC--C---A-C---C-------------T-----TGACT-------T--------------T----CCAGATC-GAGACTT-CC-CA------AAA-TTT-G-TATT-AA--G--GTAGCCGA-A----AG-CTGagtggctatccttgtctgtcaagacggaacattcggcaccaacttaatagtatataagatgc
gi|18402                      :                                                                                    G-GT-C-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC---T-T--CTC-C--AGA-------------CCCA-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-T
gi|18403                      :                                                                                                                                                                                                                       -GAA---CA--C-A--GCGCA------TT--GGTAGGCTG-C--TGCATGCCT-GAG-GG-AC-TGTTAAGTG-TT--C-C-------------------C--CATCAA---CT--A-C---CTGTCTTTCGTTCAT-----TG----------A--------------T----TCGGATC-G----CT-CT-CG------CAA-TTTCT-TATTAAA--GT-GCAGC--ATA----AGCCTGGG
gi|18404                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         -TAAATG-TT--C-ACAAGG--A--CG--TTCT-C--CGTCGG---C---A-C---T-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT--C-CG------TGA-CTT-G-TTTT-AG--GT-TCGGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18405                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATCGT---A---A-C---T-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT--C-AT------CGA-CTT-A-TTTT-AG--GT-ACAGC--A-A----AGACTGG


blockSeqs                     :      CT CC AC AACT       TG       C    CA CGTC GC  GTGCAATGTA        CA AGTG   TCT  T  A A TCCG     TT   TCATTC GAAGG   TTC A AT   A TA   GGGGAGGGGGACC  T C A TT  T   A    A CAT A    AGATAG           AAAA  TT GA   G   CTT  GC A TT     ATTGAT  TG GTA     A AT GCATGC  C   C  A  C  T      T  CG A      AGT    TT   AC CA      CCT AGG T CTGTCTTTCGTTCA    ACCCC  CGAGGCCAAGGGACA           TACA       T T     AC G  GACTTTCG C   C T A  A  TT  G     CG T ATTT  C
blockSeqs                     :      .  CC .  AACT       G        C    CA C    .   TAAACG            .  GT     .    .  . A .        TT   .      GA      C   . .    A .    .              T . . .   .   .    A G   .    ACC              A     .  A    .   .    A  A .      A       .  TA      . .  TA      .   .  .  G  .      .  .  .      AGT    .    A  CA      C   AGG . CCAGG             .      AGGGACACAAC               .          . A     AC .  TA       .   . A T  A  CT  .     .  . ATTT  A
blockSeqs                     :      .  CA .  AACT       T        C    T  .    .   ACCAC             .  GA     .    .  . T .        TT   .      .       C   . .    A .    .              T . . .   .   .    A .   .    CTG              .     .  .    .   .    .  . .      .       .  TA      . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      AGT    .    T  CA      .   AGG . CTGC              .      ACTT                      .          . .     AC .  CA       .   . . C  .  G   .     .  . ATTT  .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          G        .    C  .    .   TAAAC             .  GA     .    .  . . .        TA   .      .       C   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    CG               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  TA      . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      ATG    .    A  .       .   T   . GC                .      GCC                       .          . .     C  .  CG       .   . . C  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          G        .    C  .    .   TAA               .  GT     .    .  . . .        A    .      .       C   . .    . .    .              C . . .   .   .    . .   .    CC               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  T       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      GT     .    T  .       .   .   . GC                .      GCC                       .          . .     C  .  CG       .   . . T  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  T  .  .          G        .    C  .    .   GAA               .  GT     .    .  . . .        A    .      .       C   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    TA               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  A       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      CG     .    A  .       .   .   . GC                .      GCC                       .          . .     T  .  AA       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  T  .  .          G        .    C  .    .   GAA               .  GT     .    .  . . .        A    .      .       C   . .    . .    .              C . . .   .   .    . .   .    TA               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  A       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    A  .       .   .   . C                 .      CG                        .          . .     C  .  CA       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  T  .  .          G        .    C  .    .   GAA               .  AA     .    .  . . .        A    .      .       A   . .    . .    .              C . . .   .   .    . .   .    CT               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  A       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      A      .    T  .       .   .   . C                 .      T                         .          . .     C  .  CG       .   . . T  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          T        .    G  .    .   GAA               .  TG     .    .  . . .        A    .      .       A   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    CG               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  A       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    A  .       .   .   . T                 .      C                         .          . .     T  .  TA       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          A        .    C  .    .   TAA               .  TG     .    .  . . .        A    .      .       A   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    TG               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  T       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    A  .       .   .   . T                 .      C                         .          . .     T  .  TA       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          A        .    C  .    .   TAA               .  TG     .    .  . . .        A    .      .       C   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    CG               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  C       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    A  .       .   .   . C                 .      C                         .          . .     C  .  TA       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          A        .    C  .    .   GAA               .  GT     .    .  . . .        A    .      .       C   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    GG               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  A       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    A  .       .   .   . C                 .      C                         .          . .     C  .  CG       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  T  .  .          G        .    C  .    .   TAC               .  GT     .    .  . . .        A    .      .       G   . .    . .    .              C . . .   .   .    . .   .    GG               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  T       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    T  .       .   .   . C                 .      C                         .          . .     C  .  CA       .   . . T  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  T  .  .          G        .    C  .    .   GTA               .  AA     .    .  . . .        A    .      .       C   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    GG               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  C       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    T  .       .   .   . C                 .      C                         .          . .     C  .  CT       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          T        .    C  .    .   TAA               .  GT     .    .  . . .        A    .      .       C   . .    . .    .              C . . .   .   .    . .   .    CA               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  A       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    T  .       .   .   . C                 .      C                         .          . .     C  .  CA       .   . . T  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          A        .    C  .    .   ATA               .  GT     .    .  . . .        A    .      .       A   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    TC               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  T       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    A  .       .   .   . C                 .      C                         .          . .     C  .  AA       .   . . T  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          G        .    C  .    .   TGG               .  GT     .    .  . . .        A    .      .       A   . .    . .    .              G . . .   .   .    . .   .    CG               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  A       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    G  .       .   .   . C                 .      C                         .          . .     .  .  CA       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          T        .    C  .    .   GAA               .  G      .    .  . . .        C    .      .       T   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    GC               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  T       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    A  .       .   .   . C                 .      C                         .          . .     .  .  TG       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  C  .  .          G        .    C  .    .   GAA               .  A      .    .  . . .        A    .      .       .   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    CG               .     .  .    .   .    .  . .      .       .  A       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      G      .    A  .       .   .   . T                 .      A                         .          . .     .  .  CG       .   . . A  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  .  .  .          A        .    .  .    .   TA                .  A      .    .  . . .        A    .      .       .   . .    . .    .              T . . .   .   .    . .   .    G                .     .  .    .   .    .  . .      .       .  T       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      A      .    T  .       .   .   . C                 .      C                         .          . .     .  .  C        .   . . T  .  .   .     .  . .     .
blockSeqs                     :      .  .  .  .          T        .    .  .    .   TA                .  G      .    .  . . .        A    .      .       .   . .    . .    .              C . . .   .   .    . .   .    .                .     .  .    .   .    .  . .      .       .  T       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      A      .    .  .       .   .   . T                 .      C                         .          . .     .  .  .        .   . . T  .  .   .                 
blockSeqs                     :      .  .  .  .          .        .    .  .    .   TA                .  G      .    .  . . .        A    .      .       .   . .    . .    .              C . . .   .   .    . .   .                                   .   .    .  . .      .       .  T       . .  .       .   .  .  .  .      .  .  .      .      .    .  .       .   .   . T                 .      .                         .                                                                     
blockSeqs                     :      .  .  .  .          .        .    .  .    .   AA                .  G      .    .  . . .        .    .      .       .   . .    . .    .              . . . .   .   .    .                                                                                                           .      .  .  .      .      .    .  .       .   .   . .                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                     .  . . .        .    .      .       .   . .    . .    .              . . . .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                  


blockSeqCons                  :                                                                         GN***
originalCons                  : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCCA--A---G-GG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTTGT----TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--GCGCA------TT--G--NAGCTG-C--T------CG-GAG-GG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CGA-TTT-G-TNTT-AA--GT-GCAGC--A-A----AG-CTGGG
finalCons                     : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCCA--AGN---GG---GG-GT-A-G----CGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTTGT----TG--G--ACA-GAA---TA--C-A--GCGCA------TT--G--NAGCTG-C--T------CG-GAG-GG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CGA-TTT-G-TNTT-AA--GT-GCAGC--A-A----AG-CTGGG





Alignments
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lowQualScore                  :      22 66 22 0000       55       5    33 5555 22  0000000000000   1  1 2 1  5555  4 1 6      555  444444 66666   777 1 22   4 22   8888888888888  2 1 1 22  1   1    5 444 1    88888888       22  5555   44   1   333 1 22 3 22     666666  22 888     1 22 777777  1   1  1  3  1      1  22 1      88888  22   66 66      444 000 1 55555555555555555 44444  3333333333333333333333333 3333       1 3     77 1  66666666 1   1 3 1  3  66  1     22 1 2222  3     
lowQualScore                  :      .. .. .. ....       ..       .    .. .... ..  .............   .  . . .  ....  . . .      ...  ...... .....   ... . ..   . ..   .............  . . . ..  .   .    . ... .    ........       ..  ....   ..   .   ... . .. . ..     ......  .. ...     . .. ......  .   .  .  .  .      .  .. .      .....  ..   .. ..      ... ... . ................. .....  ......................... ....       . .     .. .  ........ .   . . .  .  ..  .     .. . ....  .     
lowQualScore                  :      33 77 33 6666       44       0    44 2222 33  9999999999999   1  7 6 7  0000  8 6 4      444  666666 22222   888 6 22   8 22   8888888888888  0 6 6 22  6   7    0 888 7    55555555       55  7777   33   7   000 7 44 5 44     777777  44 666     7 44 444444  7   7  7  5  7      7  33 7      66666  33   00 99      666 444 7 00000000000000000 33333  3333333333333333333333333 7777       8 6     99 8  77777777 8   8 6 0  6  88  8     66 9 1111  8     
consensus                     : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCCAA-GTG-GG----GG-T-A-GCGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTT--GT----TGG--ACA-GAA---T-A--C-A--GCGCA------TT--G--NAGCTG-C--T------CG-GAG-GG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CGA-TTT-G-TNTT-AA--GT-GCAGC--A-A----AG-CTGGG
Reference ( family-663 )      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCCAA-GNG-GG----GG-T-A-GCGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTT--GT----TGG--ACA-GAA---T-A--C-A--GCGCA------TT--G--NAGCTG-C--T------CG-GAG-GG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CGA-TTT-G-TNTT-AA--GT-GCAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18378                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-TTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCCAA--AG-GG----GG-T-A-GCGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTT--CT----TGG--ACA-GAA---A-A--C-A--GCGCA------TT--G--TAGCTG-C--T-------G-GGG-GG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--TATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----TCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CAA-TTT-G-TATT-AA--CT-GTAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18379                      : CATTC--TC-A--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGGT-G----A--AA------TA-A---CGCCAA-GTG-GG----GG-T-A-GCGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--TTC-C--AGA-------------CCTG-G-A--CT-ACA-AGAA-C---A-TTTC-C-G----GAGAGTT--GT----TTT--ACA-GAA---T-A--C-A--GCACA------TT--G--TAGCTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------T--------------T----TCAGATT-G-GGCTT-CC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GAAGC--A-A----AA-CTG
gi|18380                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGTT-TTCCCTCA-AAGCC-G----A--AA------GA-A---CGCCAA-GTG-GG----G--T-A-GCGTCA-A-GG------G-----ACT--CT-T--CTC-C--TGA-------------CCTG-G-A--GT-TCG-GGGA-C---A-TTAT-C-C----GAAAGTT--GT----TGG--GCA-GAA---T-A--C-A--GCGCA------CT--G--AAGCTG-C--T------CG-GAG-AG-AC-TG-TAAATG-TT--C-CCAAGG--A--CG--TTCT-C--CATTGG---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT-CC-CC------CAA-CTT-G-TTTT-AA--GT-GCAGC--A-A----AT-TTGGG
gi|18381                      : CATTA--TT-G--C----CGGATTT-GTCTCTCA-AAACCAG----A--AA------GA-A---CAACAA-GAG-GG----GG-T-A-GCGTCA-A-GG------A-----ACC---T-T--CTT-C--AGA-------------CTTT-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTCT-T-A----GAGAGTT--GT----TGG--ATA-GAA---T-G--C-A--GCTCA------TT--A--AAGCTG-C--T------TT-TAG-GG-AG-AA-TAAATG-TT--C-CCAAGA--G--CG--TTC--T--CAACGG---C---A-C---T-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT--C-CG------CGA-CTT-G-TCTT-AG--GT-GCGGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18382                      : CATTA--TT-G--C-----GGATTT-GTCTCTCA-AAACCAG----A--AA------GA-A---CAACAA-GAG-GG----GG-T-A-GCGTCA----G------G-----AAC--CT-T--CTT-C--AGA-------------CTTT-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTCT-T-A----G-GAGTT--GT----TGG--ATA-GAA---T-G--C-A--GCTCA------TT--A--AAGCTG-CATT------TA-GGG-AG-A---A-TAAATG-TT--C-CCAAGA--G--CG--TTCA-T--AA-CGG---C---A-C---T-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-GTGACTC-TC-CG------CGACTTT-G-TCTT-AG--GT-GCGGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18383                      : CATTC--TT-G--C----CGGAGTT-GTCCCTCA-AAGTC-G----A--AA------GA-A---CGC-AA-GTG-GG----GG-T-A-GCGTTA-A-GG------A-----ACC---T-T--CTC-C--------------------------------CA----A-C---A-TTCT-C-T----GAGAGTT--GT----TGG--ACA-GAA---T-A--C-A--GCGAA------TT--G--AAGCTG-C--C------TG-GAG-GG-AC-TG-TAAATG-AT--C-TCAAGG--GT-CG--TCCT-C--AATCTG---T---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATT-G-GACTT-CCGCCGACTTTCGA-CTT-G-TTTT-AA--GT-ACAGC--G-A----AG-GTGGG
gi|18384                      : CATTA--TC-G--C----AGGAGTT--TCCCTTC-AAGCC-G----A--AA------TA-A---CGCTAA-A----G----GG-T-A-GT-TCA-A-G-------------ACC--CA-T--CTC-C--AGA-------------CCCG---A--CT-CCA-G-AA-C---A-TTTT-C-G----GAGAGTT--GT----TG---ACA-GAA---T-A--C-A--GCGCA------TT--G--TAGCGG-C--T------CG-G----G-ACCTG-TAAATG-TC--C-CAAACG--G--CG--TTCA-T--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------CG-------------T----TCA-ATC-A-GACTT--C-CC------AAA-TTT-G-TATT-AAG-GT-ATAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18385                      : CATTC--TC-G--C----CGGAGAT-GCCTCTCA-AATCC-G----A--AA------TA-A---TGCCAA-GTG-GG----GG-T-A-GCGTCA-A-G---------------------------------A-------------CCTG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-T-G----GAGAGTT--GCA---TGG--ACA-GAA---T-A--C-A--GCGCA------TT--G--CAGTTG-T--T------CG-GGG-GG-AC-TG-TAAATA-TT--C-TCAAGG--G--CG--TTCA-C--CATCGA---C---A-----------------------------------------------------------------------------C------CAA-TTT-G-TATG-AA--GT-GCAGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18386                      : CATTT--TC-A--C----CGGAGTT-GTCCCACA-AAGCC-G----A--AA------GA-A---CGCAAA-GTG-GG----GG-T-AAGCGTCA-A-AG------GGAAGGACC--C-----CGC-C--AAAGGGGAGGGGGACCCCCG-C-CTTCT-CCA-GGAA-C---A-TTCT-A-GATAGGATGGTT--GT----TGG--ACA-GCA---T-A--C-A--GCGCA------TT--G--AAGCAG-C--T------CG-GAG-GG-AC-TG-TAAATG-TA--C-CCAGGG--G--TT--TTCT-C--CATCGA---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------T----CCA-------AACTT-CC-CT------CGA-CTT-G-TTTT-AG--GT-GCGGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18387                      : CATTCCTTC-G--C----CGGAGTT-TTCCCCTC-AAGCG-A----A--AA------TA-C---CTTCAA-AAG-GG----GG-T-T-ACGTCA-A-GG------GGA---ACC--CT-T--CTC-C--AGA-------------CCCG-GAA--TT-CCA-GAAA-C---A--TTT-C-G----GAG-GTT--GT----TGGA-ACA-GAA---T-A--CAA--GCACA------TT--G--T-GTTT-C--T----------AG-GA-AA-TG-TAAATG-TTCGC-CCAAGG--G--C---TTCA-T--CATCGA---C---A-CCTGC-------------T-----TG----------C--------------T----TCAGATC---GACTT-TC-CC--------A-TTT-G-TATTAAA--GT-GTAGC----A----AG-CTGGG
gi|18388                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTT-ATCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----CGC-AA-GTG-GG----GGGT-A-GCGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--CT-CCA-GGAAAC---A-TTTC-G-G----AAGAGTT--AT----TGG--ACA-GAA---T-A--T-A--GCGCA------TT--GT-AAACTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C-------------T-----TGGC--------C--------------T----TCCGATC-G-GACTTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
gi|18389                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTT-ATCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----CGC-AA-GTG-GG----GGGT-A-GCGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--CT-CCA-GGAAAC---A-TTTC-G-G----AAGAGTT--AT----TGG--ACA-GAA---T-A--T-A--GCGCA------TT--GT-AAACTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C-------------T-----TGGC--------C--------------T----TCCGATC-G-GACTTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
gi|18390                      : CATTC--T--G--CAACTCAGAGTT-ATCCCTTGCAAGC--G----A--AG------TA-----CGC-AA-GTG-GG----GGGT-A-GCGTCA-TTGG------G-----ACC--AT-T--CTAAC--AGA-------------TTTG-G-G--CT-CCA-GGAAAC---A-TTTC-G-G----AAGAGTT--AT----TGG--ACA-GAA---T-A--T-A--GCGCA------TT--GT-AAACTG-C--T------CG-GAG-GG-GC-TG-TAAATG-TT--C-CTAAAG--AGTTG--TTCA-CCACATCGA---CAGGA-CG--C-------------T-----TGGC--------C--------------T----TCCGATC-G-GACTTACC-CC------TAA-TTT-G-TATT-AA--GT-GTAGC--A-AATTTAG-CTGGG
gi|18391                      : CATTC--TT-G--C----CGGAGTT-GTCTCTCA-AGGCC-G----A--AAGTGCAATGTA---CACCAA-GTG-GG----AG-T-T-CTGTCA-A-GG------G-----ACC--CT-T--CT--------------------------G--------CA-GGAA-C---A-TTCT-C-A----GAGAGTT--TT----TGG--ATA-GAG---T-G--T-A--GCGCA------TT--G--CAGCTG-C--T------CT-GAG-AT-AC-AG-TAAATG-TT--T-TCAAGG--G--CG--TTCT-T--CATCGG---C---A-C---C-------------T-----TG----------C--------------C----CCAAATT-G-GA-TT-TC-CT------CGA-CTT-C-TTTT-AA--GT-GCGGT--A-A----AG-CTGGG
gi|18392                      : CATTC--TT-G--C----CAGAGTT-GCCTCTCA-AAGCC-G----A--CA------GT-A---CGTCAA-GTG-GG----AA-C-A-GGATCA-A-GG------G-----ACT--CT-T--CTC-C--AAA-------------ACTG-G-A--CA-CCA-GGAA-C---A-TTCT----------GAGTT--AT----TGG--ACA-GAA---T-A--C-A--ACGCA------TT--G--AAGCTG-C--T------CT-AAG-GG-AC-AG-TAAATG-TT--C-CCAGAG--G--CG--CTCT-C--CATTGG---C---A-C---C-------------T-----CG----------C--------------T----C
gi|18393                      : CATTC--TCCG--C----CGGGGTT--CCCTTCA-AAGCC-A----A--AA------TA-A---CACCAA-ATG-CGT---AG-T-CCGCGTCA---GG------G-----ACC---T-T--CTC----AGA-------------CCCA-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-T-C----GGGAGTTTTGT----TG---ACA-GAA---T-A--C-A--GTGCA------TT--G--TAGCTG-C--T------CG---G-GG-A--TG-TAAATG-TT--CACAAAGG--G--AGTTTTCACC--CACGGA---C---ATC---C-------------T-----TG----------C--------------T-----CAGATCTG-GACTT-CC-TC------C-A-TTT-GTTATT-GATTAT-GTAGC----A----AG-CTGGG
gi|18394                      : CATTT--TC-G--A----AGGAGTTTGCCCCTCA-AAGCC-A----A--AA------AT-A---CGCCAC-AAGTGG----GG-C-A-GGGTCA-A-GG------G-----ATTTTCT-T--CTC-C--ACA-------------CCTGCG-A--TT-CCA-GGAA-C---A-TTCTAC-C----GAGAGT---GT----TGG--ACA-AAA---T-G--C-ATTG-GCA------TT--G--AAGCTG-C--T------CT-GAG-GG-AC-AG-TAAATG-TT--C-CCAAAG--G--CG--TCCT-C--GCTCGACCTC---A-C---CCAGG---------C-----TGAGGGACACAAC--------------T----CCAGGAC-G-GGCTT-CC-CC------CAA-CTT-G-TTTT-AACTGT-GC
gi|18395                      : CATTC--TCCG--C----CGGAGTT-TTCCCT-A-AAGCC-G----A--AC------TA-AACGCACCAA-AAG-GG----GG-T-AAGCGTCA-A-GG------------ACC--GT-TATCTC-C--AGA-------------CCCG-G-A--CT-CCAAGGAA-C---AATTTT-C-G----GAGAGTT--GT----T-G--ACAGGAA---T-A--CAA--GCGCAATTGATTT--G--TAGCTG-A--T-------G-GA--GG-AC-TG--AA----TT--C-CCTAGG--G--CG--TT-A-C--TATCTA---C---A-C---C-------------
gi|18396                      : CATTC--TC-A--C----CGGAGTT-ATCTCTCA-AAGTC-A----A--AA-------A-A---CGGCAA-GTA-GG----GG-T-A-GCGTCA-A-GG------G-----GCC--CT-T--CTC-T--AGA-------------CCTG-A-A--TT-CCA-GAAA-
gi|18397                      : CATTC--TC-G--C----CGGGATC-GCCCCCTA----CC-GCGTCA--AG------TG-G----GTCAA-GTG-GG----GG-C-G-GAATCA-C-GG------G-----AAT--CT-T--CAC-C--CTA-------------TCGG-A-A--CT-CGA-GGGA-TG--A-TATT-G-C----GA-AGCT--GT----TGG--ACA-GAA---T-G--C-A--GCATG------TG--G--AAGATG-C--T------CT-GAG-GGAAA-TG-CAAA-G-TT--C-CCATGG--A--CC--TTCG-T--CTGTGG---C---A-C---C-------------TACCCCTG----------CGAGGCCAAGGGACATTACACCAGAAC-A-GAC-A-CC-CC------CTA-CAT-G-TTTC-AA--GT-GTGAA--A-A----AG-CCGGG
gi|18398                      : CATTA--T--G--C----CG-AGTT-TTCTCTCA-AAGCC------A--AA------GA-A---CAGCAA-GTC-GG----GG-TAA-ACGTCC-A-GG------G-----ATC--AT-T--CTA-CTAAGA-------------CCTG-G-A--TT-CC
gi|18399                      :  ATTC--TCAG--C----CGAAGTT-GTCC-TCC-AAGC--A----A--AA------GA-A----GCCAA-GTG-GG----TG-T-A-GCGTTA-A-GG------G-----A----CT-T--CTC-C--AG----------------TG-G-A--CT-CCA-GG-A-C---A-TT-----G----GGGAGTT--GT----TGG--ATA-GAA---TAA--C-G--ACGCA------TT--G--TAGCTGAC--T------CG-GAG-GG-A--TG-TAAATG-TT--C-C---------------TTA-C--C--------C---C-C---T-------------T-----TG----------C--------------T----TCAGA---G-GAACA-CT-TC------CAA-TTT-GATATT-CA--ATGGCAGC--A-A----AG-CTG
gi|18400                      :    TC--TC-AACC----CAGAGTG-ATCCCTCA-AAGCC-G----A--GAAC----CA-C---CGCCAAAGTG-GGTCTGGA-T-ATGCATTATA-AGTCATTCG-----ACC--ATAT--CGT-C--AGA-------------TTTG-G-G--CTTCCT-GGAA-TCATA-TCTT-CTG----GAGAGTG--GTAAAATGGGAAC--GAACTTT-AGCC-A--GCATAA-----TT--G--TAACTG-C--CTA----CG-GGA-GG--C-TG-TAAATATTT--C-CCAAAGATG--CG--GTCA-C--CCTC
gi|18401                      :      --TC-G--C----AGGAGTG-TTCTCTCA-A-GCC-GC---AGCAA------TA-AAC-CGTAAA-GAG----------T-A--CGTCA-A-GG------G-----ACC--TT-A--CTC-C--AGA-------------TCCG-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-TTTT-C-G----AAGAG-G--GT----TGG--ACA-GAA---T-A--C-A--GCGCA------TCTGG--TAGCGC-C--G------CGCGAGCGT-GCGCG-TAAAAG-GT--C-CCAAAGC-G--CG--TTC--C--CATCGAC--C---A-C---C-------------T-----TGACT-------T--------------T----CCAGATC-GAGACTT-CC-CA------AAA-TTT-G-TATT-AA--G--GTAGCCGA-A----AG-CTGagtggctatccttgtctgtcaagacggaacattcggcaccaacttaatagtatataagatgc
gi|18402                      :                                                                              ----GG-T-C-GCGTCA-A-GG------G-----ACC---T-T--CTC-C--AGA-------------CCCA-G-A--CT-CCA-GGAA-C---A-T
gi|18403                      :                                                                                                                                                                                                                 -GAA---C-A--C-A--GCGCA------TT--GGTAGGCTG-C--TGCATGCCT-GAG-GG-AC-TGTTAAGTG-TT--C-C-------------------C--CATCAA---CT--A-C---CTGTCTTTCGTTCAT-----TG----------A--------------T----TCGGATC-G----CT-CT-CG------CAA-TTTCT-TATTAAA--GT-GCAGC--ATA----AGCCTGGG
gi|18404                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TAAATG-TT--C-ACAAGG--A--CG--TTCT-C--CGTCGG---C---A-C---T-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT--C-CG------TGA-CTT-G-TTTT-AG--GT-TCGGC--A-A----AG-CTGGG
gi|18405                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATCGT---A---A-C---T-------------T-----TG----------C--------------T----CCAGATC-G-GACTT--C-AT------CGA-CTT-A-TTTT-AG--GT-ACAGC--A-A----AGACTGG