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lowQualScore                  :       ..   ....     .  .     ..   .  .   ..   ............    . .....   .....   .. .....  .         ......    .  ............   ........  . ..... ..  . ... .   .      ...    ..... ..  ..... ......   . .  ......  .........  . .  . ........  ..................................................   .     ..........  .........    .. . ................................................... . .....   .......    . .....  .  .    ...  .  . . ...   ... .. ..  ...     .  .  ........................................................................................................................   .... . ..  ..  .... .  ........ .. ..   . ..  ....  ... .    ..  . ..................    .  ..   .. .   .  .  ..  . . ..    .  .     .  .... .  . .   ...      . . ..    
lowQualScore                  :       55   6666     8  3     33   7  3   66   333333333333    3 55555   88888   22 99999  5         888888    0  222222222222   88888888  6 88888 44  5 444 4   5      777    99999 55  77777 555555   3 7  333333  999999999  7 2  7 99999999  55555555555555555555555555555555555555555555555555   0     0000000000  666666666    88 0 333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 22222   6666666    8 33333  5  8    222  7  6 8 666   222 33 55  888     2  7  000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000   5555 7 99  88  0000 6  22222222 22 00   5 33  6666  999 7    44  7 444444444444444444    4  44   66 3   7  7  11  7 7 44    7  1     5  9999 4  1 5   444      5 9 00    
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Reference ( gi|25634 )        : GGGACT-TTGCCT-CACCAGGTCAGGGGA-TATCTTG-GTC--AGT--A-TG----TTTACT-ATC---GATA--G-AAGT-CGTTA-CA-AAATTGTCC------GTTA-TC-A----------GGGG-------CAGAG----A--GT-G---ACACAGGAAATA---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCAAACC-C----AT------C--TA-TCAA-G-GA-----GG-GA-----A----AT--ACT--T----T-T-TA---TT---T-GTG-GCAGAG-AACAA-------C--AA--TG--GT-GACA--T-C---GTG-------GC--T---T--CG-GA-----------TGT---T----A-A---T-GCT-A--A-AACAG-TG----GTAGT-GGTG---AA-CA-G-GACTGGA---A--AGGTCA--GATTCCGA-TA------------------TAA-C--G--A---CAA-----AC-----CA-----C-C--A-GG---TG--GGA-G---GGA---A---TCA----TTCCA--CCCA----G--A------ACA-G--A-TA-GTG-ACC---G-AC--T-CAATG-GG--TCATA--TC---ATT---G-TGGCA-GA-T----A-TT---G-C----CAATGAC--TGTC-TACAC-AT-TC--TA-G-A--CCAG-AATGGACAATT----CATTAA-ATG---TGTGGAAA-AA-TGTG
gi|25632                      : GGGACT-TTGCTG-CACCAGATCAGGGGA-TATCCTG-ATC--AGT----T-----TTTACT-ATT---GATA--A-AAGT-CATCG-CA-AAATTGTTC------GTTA-TC-A----------GGGA-------CAGAA----A--GT-G---ATACAAGAAATA---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCAAACC-C----AT------T--TA-TCAA-G-GA-----GG--------A----ATG-GCT--C----A-A-TA---TT---T-GTG-AC--AG-AACAA-------C--AA--TG--GT-GACA--T-C---GTG-------GC------A--CG-GA-----------TTT---T----A-A---T-GCT-A--A-AACAG-TG----GTAGT-GGTG---AA-CA-G-GACAGGA---G--ATGTC---GATTCCGA-TA------------------CAA-C--G--A---CAA-----AC-----CA-----C-C--A-GG---GG--ACA-G---AAA---A----CA----TTCGA--TCCA----G--G------ACA-G--A-TA-GTG-ACC---G-AC--T-CAATG-GG--TCGTA--TC----TT---G-TGGCA-GA-T----T-TT---A-A----CAATGAC--TGTC-TACAC-AT-TC--TA-G-A--TCAG--ATGGAC-ATT----CATTAA-ATG---TGTGGACA-AA-TGTG
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gi|25636                      : GGGACT-GTGCTG-TACCAGATTCAGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TG----CATACT-ACT---GATG--G-AAGT-CTTCA-CA-AAATTGTCC------GTTA-TC-A----------GGGA-------CAGAG----A--GT-G---ACACAGGAAATA---GATAA----GA-TG-----A-ACTT-GGCAATCC-A----AT------C--TA-TC---GTGA-----GG-G----------------TT--TGGTGT-C-TA---GTGTAT-GTA-ACAGAG-AACAC-------C--AA--TG--GT-GACA--T-C---GGG-------GC--C---T--TG--A-----------TAT---T----A-A---T-GCTTA--G-AGCAG-TG----GTAGT-GGTG---GA-CA-G-GACGGGA---A--AAGTCC--GATTCCGA-TA------------------CAA-C--G--C---CAA-----GC-----CA-----C-C--A-GG----G--GGACA---GAA---A---CCA----TTCAG--TCCA----A--AG-----ACA-G--A-TA-GTG-GAC---G-AC--T-CCATG-GG--TC-TA--TC---ATT---G-TGGCA-GA-T----C-CT---G-A----CAATGCC--TGTC-TACAC-AT-TC--TA-G-A--TCAG-AATGGACAATT----CATTAA-ATG---TGTGGACA-AT-TGTG
gi|25637                      : GGGGTT-ATGCTG-TACCAGATACGGTGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGAGCATTGATC-AT----GAT---G-A--C-CAATA-TA-AGATAGTTC------GTTA-TC-A----------GGGA-------AACAC----A--GT-G---AAACAGGAAATC---GATAGA---GA-TG-----A-AAAT-GGTGAGAT-A----AT------C--TA-TAAA-G-GA-----GGTGA-----AGGC-AT--AC------------TG---TG---G-GTA-GTGGAG-AACAA-------C--AA--TG--GA-GACA--T-T----TGC------GC--T---T--CT-GA-----------TTA---T----A-A---T-GCT-G--G-AATGG-TG----GTCGT-GGTG---GA-CA-A-ATCAGGA---A--AAGTCC--GATTCCGA-TA------------------CGA-C--G--G---GAA-----AC-----CAG----C-C--A-GG----A--GAA-A---GAA---G---TCA----TTTAT--TCCT----G--A------ACA-A--T-TA-GTG-ACG---G-AT--T-CCATG-AA--TCAGA--TC---ATT---G-TGGCA-GA-T----A-AA---A-A----CAATAAC--TGTC-TACAC-AT-CC--TG-A-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTGAG-ATG---TGTGGACA-AT-TGTG
gi|25641                      :   GACT-ATGCTG-CACGAAGTCAGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TG----GATACT-ACT---GATT--A-TAGC-CAAAA-TA-AAATTGCCC------GTTA-TC-A----------TGGA-------GACAC----A--GT-G---AAACAAGAAATA---GATAGA---GA-TG-----A-AGAT-GGAGAACC-A----AT------C--TA-TAAA-G-GA-----GG-GG-----A----AT--ACC--C----A-C-CG---TA---T-GTG-GTGGAG-AACAA-------C--AA--TG--GA-GATG--T-CT--GTG-------TC------T--CT-GA-----------TCA---G----A-A---T-GCT-C--A-CACCG-TG----GTCGT-GGTG---AA-CA-A-GTCAGGA---A--GAGTCC--GATTCCGA-TA------------------CGA-C--G--G---TA-------------CA-----C-C--A-GG---CA--GGA-GGGAGGA---G---TCA----TTTAG--TCCT----G--C------ACA-T--A-TA-GTG-ACA---G-AC--
gi|25642                      :    ACTATTGCGT--ACTAG-TCAGGGGA-CATCCTG-GTCG-AGT--A-TGA---CGTACT-CAA---GATA--A-AAG--CGCAAACATAAATTGTCC------GTTA-TC-A----------GGAAA------CACC-----A--GT-G---A-ACAAGA--TA---CATGG----GA-TG-----A-G-AT-GGAGAACC-A----AT------C--TT-GAAA-G-GA-----GG-GA-----A----GT--ACC--G----C-TGTA---T------GTG-GTGGAG-AACAA----------AA--TG--GA-GACA--T-CT--GTG-------GC--C---T--CTTGA------------GT---T----A-A---T-GCT-G--A-TACCA-TG----GTTGT-CGTG---AA-CA-A-GTCAGGA---AG-AAGTC---CATTCAGA-TA------------------CGA-C--G--G---TAC-----AT-----CAG----C-G--A-GG---AG--GAA-G---AG----A---TCT----TTTTA--TCCT----A--G------ACA-T--A-TA-GTG-ACA---G-ACT-T-CCATGAGA--TCAGA--TC---ATT---G-TGGCA-G-------A-TT---C-CAAAACAATGAC--TGCCTTACAC-AT-CC--TG-G-A--TCA--AACGGGCAGTT----CCTGAG-ATGT--TGTGG-AC-AA-TGTG
gi|25643                      :    ACT-TTGCT---ACTAG-TCAGGGGAACATCCTGAGTCTTAGT--A-TGCCA-TCTACC-A-----GATA--A-AAGGGCAATA-CT-AAAATGTCCCTCTACGTTA-TC-ATATATGTGCTGAAA-------CACAGTTTTG--AT-A---AAACAGAAGATA---CATG-----GA-TG-----AGATA--GGAGAACC-A----AT------C--TT-AAAA-G-GA-----GG-GA-----AGGAGAT--ACT--CGC--T-G-TAGTGTT---C-GTG-G-AGAACAACAATGAGGAGC--AA--TACTGT-GACGCCT-C---TTGAGTTAATGC--TGGAC--CG-GAGTCATCGCAACTGT---TCTAAA-A---G-GTC-G--G-AACAG-TG----TCAG---------AA-AA-A-GAATGGA---AGTAAGCC---GATTCAGA-T-------------------TA--C--G--A---CGAGGCTTAC-----AT-----C-C--A-GG---CGAAGGA-G---GAA---AGA-TC-----TTTTA--TCCT----A--G------ACA-T--A-TC-ATG-AC----G-AC--T-CCATG-AGA-TCAGAACTC---ATT---G-TGGCACGA-TTCGCA-AA---G-C----CAATGAC--TGCC-TACAC-ATCTCCTTG-G-ATTTCA--AACGGGCAGTT----C-TGAG-ATGT--TGTGG-AC-AA-TGTG
gi|25638                      :                 CCAGATC-TGGGA-CATCCTG-CTCC-AGT----TG----AGTACT-ACT---GATACAG-GAAT-CATTT-CA-AAATTCTCT------GTTA-TC-A----------GGAA-------CAGAG----A--GT-GATTACACAGAAATTT---GATAAA---AA-TG-----A-GCGCAGGCAATCCAA----AT------A--TG-TCAA-A-GATGAGGGG-GG-----C----AT--GC--------A-G-TG---TT---T-GT--ACAGAGAAACAA-------C--AA--TG--ACAGACAT-T-C---GTG-------GC--T---C--TT-GA-----------TCC---T----A-A---C-GCT-A--G-AGCAT-T------TAGT--TTG---CG-CA-G-GATGGGA---A--AAATCC--GATTCCGATTA------------------CAA-C--G--A---C-A-----AC-----CA-----C-C-----G---CG--GGA-C---AGG---A---GCA----TT-CA--ACCA----G---------ACA-GT-ATTA-GTG--CC-----AC--T-CCATG-GGTATCAT--------ATT---G-TCGCA--A-T----GCTT---GAC----CAA-GCC--TGTC-TACAC-AT-TC--TA-GTA--TCAGAAATGGAC-ATT----CAGT-A-ATG---TGTGGAAACAATTGTG
gi|25644                      :         ggaacttctgtacTCTGGAGA-TCTCCTG-GTT--AACCCA-TG----ATCAGT-GAT---GACA--G-AAAT-CAATC-CA-AAGTTGTCC------GTT
gi|25639                      :           tttgttgtacctccGAGAA-CATCATG-GACG-AGT--AATG----TGTACTTATTCGTGATT--A-ATAT-CGTCAACA-AA--TGTCC------GTTA-TCTA----------GGGGA------CAGAG----GAGGT-G---ACACATGGAATATTAGATAAA---GA-TG-----A-ACGC-AGCTAATC-CA---AT------C--TA-CCAA-G-GA-----GA-TG-----ATATCAT--GCTGCG----C-T-CA--------T-GTGAACGAAA-AACAA-------C--AAG-TG--GA-GATA--T-C---GTG-------AC------T--CT-GA-----------TGT---T----A-A---TCGCG-G--A-CACAGATGTGA-GTAGT---TG---GA-CA-G-GAGAGGGAACA--AGGTCAGCGAT--CGA-TACCTTTTAG----------TAAGC--ATTA---CAA-----ACT----CAG----C-C--A-TG---GG--GAA-T---AGA---AC--TCA----TTCAG--TCCAATT-A--G------GCA-GT-A-TAGGTGAAAC---GTACT-T-CCTTG-GG--TC-TT--TC---A-T---G-TGTAA-GA-T------TTCTAA-C----CAATGCC--TGTC-TACAT-AT-TC--CGCG-A--TCAG-AATGGACTATT----CATTAATTTG---TGTGGAtctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtgagaacagaaacctaaatatctgtgtggctgacagtatagctagagcagtagtggtggttaatcaggctgggaaattaagattcagatacactggacataccccttttccaaaaaacaaaccattcgttccaacaggaatcactacagacagtcagagtcacatcctttcatctgatgataacaatcaatgtgtccacatcatagaccaagacggacagttcctt
gi|25645                      : gggatctagctgctgtactccgatctgGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TG----ATCAGT-GAT---GATA--GGAAAC-CATC--CA-AAGTTGTCC------GTTACTCTA----------GCTC-------CACAG----A-----G---ACACAtcaattgtg
gi|25649                      :                                                                    tctgcagtaccgcttctgat-CA-AAGTTGTCC------GTTA-TT-C----------TGGCTC-----CACAG----A--G------ACACA--AACTA---T-TCAATTTGA-TG-----A-TCAG-GGTCGTCC-T----CT------C--TA-TTCA-T-CT-----GG-TA-----G----AT--ATT--T----C-A-GA---TA---C-ATT-ACTGAA-AACAG-------G--AACCTG--G---ATG--T-CTGTGTG-------GC--T---------GAC----------TGT---G----G-A---C--CT-A--A-AGAAT-TA----GTGGT-GGTC---AATCA-G-G-CCGGG---A--AACTGA--GATTCAGG-TA------------------CAC-T--G--G---TCA-----TC-----CT-----C-C--T-TC---TC--CAA-A---GAACCAA---CCA----TTCAA--TCCA----A--A------AGG-A--A-TC-ACC-ACA---A-ACAGT-CA--G-AG--TCACA--TC---CTT---A-TATCT-GA-T----G-AT---A-A----AAATGAC--TGTG-TCCAC-AT-CA--TA-G-A--CCAG-GACGGACTGTT----Caaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggagctaaggcagtagtggtggttaattagttaggaaaactccaatttagatacactggtcatccctctaatacgagggaattattcgatccagccggcatcactacagacagccatagtcacatcctaacagcagactacatgaatcaccgtatccatatcctagatcaggacggacagttca
gi|25650                      :                                                                                       atcA-AAGTAGTCC------GTTACTC-T----------GGTT-------C-TAC----A--GT-C---ACACAAGAAATAC--AATACA---G--TG-----ATACA--GGCAAACC-TTTATAT------TCTTA-TCCA-G---------------------------ACT--T----TAT-TA---CT------------GAG-AACAA-------G--AA--CC--TT-GACA--T-T---GTT-------GT----------G-AG-----------TG-----------A---T-TCT-G--A-TACAG-TA----GAGGT-GGTG---GA-CAAG-GAC-GGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TA------------------TAA-T--GG-A---CA-------T-----CT-----C-C--A-AT---TA----A-A---GGA---A---TCA----TTTAG--TCC-----G--A------GT--G--G-T--GTG-ACCACAG-AC--A-GCATG-TG--TCACA--TC---CTG---A-TCGCT-GA-C----A-T-----------CAATAACCACGTTATACAT-AT-CA--TT-G-A--TCAG-AACGGACAGTT----CCTCCA-GTA---CATAGACA-AC-TGT
gi|25647                      :                                                                                          A-AAGTAGTCC------GTTA-CT-C----------TGGA-------CCTAC----A--GT-C---ACACAAGAAATAC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAATCC-------T------T--TA-T----------------------------AT--TCT--TA---T-C-CAGCCTA---T-ATT-ACTGAG-AACAA-------G--AA--CC--AT-GACA--T-T---GTT-------GTGAT---T-----GA-----------GTT---T----A-G---A-ACA-G--A-CACAG-TA----GAGGT-GGTG---GA-TA-A-GGATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TA------------------TAA-T--G--G---C-A-----AT-----CT-----C-C--A-AT---T----AA-A---GGA---A---TCA----TTTAA--TCC---------------ACGTG--G-T--GTG-ACCACAG-AC--A-GCATG-TG--TCACA--TC---CTG---A-TCGCT-GA-C----C-GT---G-G----TAACCAC--GTTA-TACAT-AT-CA--TT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GTA---CATAGAAA-AC-TGT
gi|25648                      :                                                      ctggtcaccatgctgtctgatgtttatataccagctA-AAGTAGTCC------GTTACTC-T----------GGTT-------C-TAC----A--GT-C---ACACAAGAAATAC--AACACA---G--TG-----ATACA--GGCGAACC-T----TT------A--TACTTAA-G------------------------TCCATT--C----T-T-TA---TT---------ACTGAG-AACAA-------G--AA--CC--AT-GATA--T-T---GT-----------------------------------TGTAAGT----G-ACTCT-GCT-ACAACAACAG-TA----ATGGT-GGTG---AA-CA-ATGA-TGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TA------------------TAA-T--G--G----AA-----AT-----CT-----C-C--A-AT---CA----A-A---GAA---A---TCA----TTTAA--TCCAT---G-----------T-G--G-T--GTG-ACCACAG-AC--A-GCACG-TG--TCACA--TCCTGATT---GCTGACC-GT-G----G-TC---A-C----CA-------CGTTATACAT-AT-CA--TT-G-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTTCA-GTA---CATAGACA-AC-TGTG
gi|25651                      :                                                                                    tcaccagctAATTGTCT------GTTAATC-A----------GGTGTAATAATCACAT----A--GTTG---AAACAGGAAATC---GATAGA---GACTGTTAAAA-AAAT-GTTGAAGT-T----GTAGAATTC--TA-TTAAAG-GA-----AG-GATGAAGG----AT--ACT--C----T-G-TG---GG---TAGTG-ATTG-G-AACAA-------CCGAC--TC--GG-AACA--T-T---TTGC------GC--T---TTACT-GA-----------T-T---G----ATA---T-GCT-G--G-AATTG-TGTCGTGTACTTGGAA---AATCA-G-G----GA---A--AG-TCC--GATTCCGA-TA------------------CA-----G--A---GAA-----AC-----CAG----C-C--ACAG---TT--TGA-G---AAA---AAAGTCA----TTTCATTCCCG----A--A------ACA-A--T-TA-GTG---C---G-AT--T-CCATG-AA--TCAGA--TCT--ATTGTAG-TGGCA-GA-T----A-
gi|25654                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGAG-AACAA-------A--AACCTG--GA-TATA--TGT---GTG-------GC--TGACT--GG-GG-----------AGC---T----G-G---T-GC----------AG-TA----GTGGT-GGTC---AA-CC-A-GGCTGGA---A--AACTAC--GATTTAGA-TACACTGGTCATTCTTCTACTAA-C--A--AACTCGA-----AC-----CA-----TTC--A-AACCCTG--GG-------GA---A---TCA----C-----------------A------ACA-G--A-CA-GT----------------CA--G-AG--TCAGA--TC---CTG---A-CAGCA-GA-C----A-GT---G-A----TAATCAC--TGTA-TCCAC-AT-CC--TG-G-A--CCAG-AATGGACAGTT----CCTCCG-CTA---TATAGAGA-AC-TGTGaaaacaataac
gi|25653                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GAA-AACAG-------A--AACTTG--G---ATA--T-CTGTGTG-------GC--T---------GAC----------TGT---G----G-A-----GCT-A--A-AGCAG-T-------AGT-GGTGGTCAATCA-G-G-CCGGA---G--AACTGA--GATTCAGA-TA------------------CAC-T--G---------------------CT-----C-C--A--A---TG--GAA------GA---A---CCA----TTCAA--CCCA----C--A------AGG-A--A-TC-ACC-ACA---G-ACAGT-CA--G-AG--TCGCA--TT---CTT---A-TAACT-GA-TG---A-TT---A------CAAGCAC--TGTG-TCCAC-AT-TT--TA-G-A--CGAG-AACGGACAGTT----C
gi|25640                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           acatctgtGAG-AACAG-------G--AA--CC--AG-GATA--T-CTGTGTG-------AC--TGACT--GG-GG-----------AGC---T----A-A---T-GC----------AG-TA----GTGGT-GGTC---AATCA-G-G-CCGGG---A--AACTGA--GATTCAGG-TA------------------CA--CTGG--A---CAT-----ACTCCTACT-----C-C--A-AA--------GA-A---CCA---A---TCA----TTCAA--TCCACTAGG--AATCACCACA-G--A-CA-G---------------T-CAGT---G--TCACA--TC---CTT---A-CAGCT-GATT----A-TT---A------CAATAAC--TGTG-TCCAC-AT-CA--TA-G-A--CCGG-GACGGACA
gi|25644                      :                                                                                                                           ggattctgcagtacctcctctggtgatctcctggttaccatggagagtgataaagacagacaatccaaagttgtccgttactctggctccacagagacacaaaccattcagtttgatgatcagggtcgtcctctctattcatctggacattataacagatacatcactGAG-AACAG-------A--AA--CC--TA-AATA--T-CTGTGTG-------GC--T---------GA-----------CAG---T----A-T---A-GCT-A--G-AGCAG-TA----GTGGT-GGTT---AATCA-G-G-CTGGG---A--AATTAA--GATTCAGA-TA------------------C-A-CTGG--A---CAT-----AC-----CCCTTTTC-C--A-------A--AAA-A---CAA---A---CCA----TTCGT--TCC--------A------ACA-GGAA-TC-ACT-ACA---G-ACAGT-CA--G-AG--TCACA--TC---CTT---T-CATCT-GA-T----G-AT---A-A----CAATCAA--TGTG-TCCAC-AT-CA--TA-G-A--CCAA-GACGGACAGTT----CCTT
gi|25646                      :                                                                                                                             tttgttgtacctcctctggagatctcctggttaacccatgatcagtgatgacagaaatcaatccaaagttgtccgtttctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtGAG-AACAA-------G--AACCTG--GA-TATA--TGT---GTG-------GC--T---------GA-----------C----------A-A---T-----A--G-AGCAG-TA----GTAGT-GGTC---AATCA-G-TA-TGGA---A--AATTCC--GATTCAGA-TA------------------CA
gi|25655                      :                                                                                                                                                                                                                                                             gatctcctggttaccatgaacagtaaagataacaagcaatccaaagttgtccgttattttgactccacagagagacaaaccattcagtttaatgatcaaggtcaacctctctattcatctgctggttacatcatt-GCT-A--G-CGCAG-TA----GTGGT-GGTC---AATCA-G-G-CCGGG---A--AGCTGA--GATTCAGG-TA------------------CA--CTGG--A---CAT-----ACTCCTGCT-----C-C--A-AA--------GA-A---CAA---A---CCA----TTCAA--TCCA----C--G------AGG-A--A-TC-ACC-ACA---G-ACAGT-CA--G-AA--TCACA--TC---CTT---A-CAGCT-GA-T----G-TT---A-A----CAATGAC--TGTG-TGCAC-AT-CA--TA-G-A--CCAG-GACGGACAGTTCCTCCATTAC-ATAGACTGTGGAgtggtcatccctataattccaagaaaaccttttatccatacggcattacagcagacagccagtcacatcctgacggcagactataacaataactgtattcacatcctggatcaggatgggcagttc
gi|25652                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-A--A-CGCAG-TT----GTGGT-GGTC---AA-TAAG-GACGGGA---A--AC-TGA--GATTCAGG-TA------------------CA--CTGG--A---CAT-----ACTCCTACT-----C-C--A-AA----------------GA---A---TCAAATATTCTC--TCCA----C--G------AGG-A--A-TC-ACC-ACA---G-ACAAT-CA--G-AG--TCACA--TC---CTT---A-CAGCT-GA-T----T-AT---A-A----CAATCAC--TGTA-TCCAC--T-TCA-TA-G-A--CCAG-GACGGACAGTT----Cc
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Reference ( family-661 )      :                                                                                                                                                                    GGGA-CTN--T-GCTGCAC-C-AGATCAGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGNN---TACT-ANT---G---ATA--G-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----ATTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--C---ACAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCGAA-CC-N----AT------C--TA-T-CAA-G---GAGG-GA-----A----AT-ACT---C-C----GT-A-TTT-GTG-ACG-----GAG-AACAAC--AA--T--G----G-NGACA-T-C---GTG--GC--T---T--C-G-GA-T-GTTA-AT-G---CTG-----A-AA-C--AGTGGTG-GT-------------GG-T--GAA-CA-G-----------GA----CNGGA---A--AANTCA--GATTCAGA-TAC---------AAC--G--A--CAAAC------C--N-------C-----C-AG---G-G-G--GA-A-G---GA---A-TCA----TT-CAATCC---A---G--GA-CAG----A-TA-GT-G-ACC---G-AC--TCNATG-GGTCACA--TCN-TTGC---GGCA-GAT--N--T-T--AA---CAATGACTG-TNTNCAC-AT---CCTA-G-A--CCAG-AACGGACAGTT----CNTTAA-AT---G---TGTGG--A-CAANTGTG
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gi|25637                      :                                                                                                                                                                    GGGG-TTA--T-GCTGTAC-C-AGATACGGTGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGAG---CATT-GAT---C---AT---G-A---TGAC-CA-AT-A-T-AAG-----ATAGTTC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--A---ACAC----A--GT-G---AAACAGGAA--AT--C---GATAGA---GA-TG-----A-AAAT-GGTGAG-AT-A----AT------C--TA-T-AAA-G---GAGGTGA-----AGGC-AT-ACT----------GT-G---G-GTA-GTG-----GAG-AACAAC--AA--T--G----G-AGACA-T-T----TGC-GC--T---T--C-T-GA-T-TATA-AT-G---CTG-----G-AA-T--GGTGGTC-GT-------------GG-T--GGA-CA-A-----------AT----CAGGA---A--AAGTCC--GATTCCGA-TAC---------GAC--G--G--GAAAC------CA-G-------C-----C-AG---G-A-G--AA-A-G---AA---G-TCA----TT-TATTCC---T---G--AA-CAA----T-TA-GT-G-ACG---G-AT--TCCATG-AATCAGA--TCA-TTGT---GGCA-GAT--A--A-A--AA---CAATAACTG-TCTACAC-AT---CCTG-A-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTGAG-AT---G---TGTGG--A-CAATTGTG
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gi|25641                      :                                                                                                                                                                      GA-CTA--T-GCTGCAC-G-AAGTCAGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGGA---TACT-ACT---G---ATT--A-T---AG-C-CA-AA-A-T-AAA-----ATTGCCC------GTTA-TC--A----------TG------G-A--G---ACAC----A--GT-G---AAACAAGAA--AT--A---GATAGA---GA-TG-----A-AGAT-GGAGAA-CC-A----AT------C--TA-T-AAA-G---GAGG-GG-----A----AT-ACCCA-C-C----GT-A---T-GTG-GTG-----GAG-AACAAC--AA--T--G----G-AGATG-T-CT--GTG--TC------T--C-T-GA-T-CAGA-AT-G---CTC-----A-CA-C--CGTGGTC-GT-------------GG-T--GAA-CA-A-----------GT----CAGGA---A--GAGTCC--GATTCCGA-TAC---------GAC--G--G--TACAC------CA-G-------G-----C-AG---G-A-G--GG-A-G---GA---G-TCA----TT-TAGTCC---T---G--CA-CAT----A-TA-GT-G-ACA---G-AC--
gi|25642                      :                                                                                                                                                                       A-CTA--TTGC-GTAC-T-AG-TCAGGGGA-CATCCTG-GTCG-AGT--A-TGACG--TACT-CAA---G---ATA--A-A---AG-------C-G-C-AAACATAAATTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------A-AA-C---ACC-----A--GT-G---A-ACAAGA----T--A---CATGG----GA-TG-----A-G-AT-GGAGAA-CC-A----AT------C--TT-G-AAA-G---GAGG-GA-----A----GT-ACCG--C-T----GT-A-T---GTG-GTG-----GAG-AACAA---AA--T--G----G-AGACA-T-CT--GTG--GC--C---T--C-TTGA---GTTA-AT-G---CTG-----A-TA-C--CATGGTT-GT-------------CG-T--GAA-CA-A-----------GT----CAGGA---AG-AAGTC---CATTCAGA-TAC---------GAC--G--G--TACAT------CA-G-------C-----G-AG---G-A-G--GA-A-G---AG---A-TCT----TT-TTATCC---T---A--GA-CAT----A-TA-GT-G-ACA---G-ACT-TCCATGAGATCAGA--TCA-TTGT---GGCA-GAT--T--C-CAAAA---CAATGACTGCCTTACAC-AT---CCTG-G-A--TCA--AACGGGCAGTT----CCTGAG-AT---GT--TGTGG--A-CAA-TGTG
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gi|25645                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -G---CTA-----A-GG-C--AGTAGTG-GT-------------GG-T--TAA-TT-A-----------GT----TAGGA---A--AACTCC--AATTTAGA-TAC---------ACT--G--GT-CATCC------C--T-------C-----T-AA---T-A-C--GA-G-G---GA---A-TTA----TT-CGATCC---A---GCCGG-CA-------TC-AC-T-ACA---G-ACA-GCCATA-G-TCACA--TCC-TAAC---AGCA-GAC--T--A-C--AT---GAATCACCG-TATCCAT-AT---CCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----Caaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggagctaaggcagtagtggtggttaattagttaggaaaactccaatttagatacactggtcatccctctaatacgagggaattattcgatccagccggcatcactacagacagccatagtcacatcctaacagcagactacatgaatcaccgtatccatatcctagatcaggacggacagttca
gi|25646                      : tctgcagtaccgcttctgatgatctcctggttaccatgatcagtgatgataggaaaccatccaaagttgtccgttactctagctccacagagacacaaaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggaTCCTG-GTT--ACC--A-TGAA---CAGT-AAA---G---ATA--ACA---AG-C-AA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TT-------------TT------G-A--CTCCACAG----A--GA-G---ACA----AACCATTCA---GTTTAA------TG-----A-TCAA-GGTCAA-CC-T----CT------C--TA-TTCA----------------------------T---C-T----GC----TG-GTT-ACATCATTGAG-AACAAG--AACCT--G----G-ATATA-TGT---GTG--GC--T----------GA-C----A-AT-A-----------G-AG-C--AGTAGTA-GT-------------GG-T--CAATCA-G-----------TA-----TGGA---A--AATTCC--GATTCAGA-TAC---------AGT--G--G--TCATC------C--CTATAATTC-----C-A--------------A-G---AA---A-ACC----TT-TTATCC---A---T---A-CGGCATTA-CA-GCAG-ACA---G------CCA----GTCACA--TCC-TGAC---GGCA-GAC--T--A-T--AA---CAATAACTG-TATTCAC-AT---CCTG-G-A--TCAG-GATGGGCAGTT----Ca
gi|25647                      :                                                                                                                                                                                                      gatcCTG-GTC--ACC--A-TGCT---GTCT-GAT---GTTTATA--T-A------C-CA----G-CTAAA-----GTAGTCC------GTTA-CT--C----------TG------G-A--C---CTAC----A--GT-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAAT-CC-TTTATAT------TCTTA-T-CCA-G-------------------------C---C-T----AT-A-TT------ACT-----GAG-AACAAG--AA--C--C----A-TGACA-T-T---GTT--GTGAT---T------GA-G-TTTA-GA-A---CAG-----A-CA-C--AGTAGAG-GT-------------GG-T--GGA-TA-A-----------GG----ATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--G--G--CAA-T------C--T-------C-----C-AA---T-T-A---A-A-G---GA---A-TCA----TT-TAATCC---A---C--G---TG----G-T--GT-G-ACCACAG-AC--AGCATG-TGTCACA--TCC-TGAT---CGCT-GAC--C--G-T--GG---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-AAACTGT
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Reference ( family-661 )      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTN--T-GCTGTAC-C-AGATCNGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGNN---TACT-ANT---G---ATA--G-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--C---ACAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCGAA-CC-N----AT------C--TA-T-CAA-G---GAGG-GA-----A----AT-ACT---C-C----GT-A-TTT-GTG-ACG-----GAG-AAC-------AACAA--C--G----G-NGAC--A--T-C---GTG-------GC--T---T--CG-GA-----------TGTT----A-AT-G---CTG-----A-AA-CAGTGGTG-GTGG-TGAA-CA-G-GA----CNGGA---A--AANTCA--GATTCAGA-T-AC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--N-------C-----C------AG---G-G-G--GA-A-G---GA-A---TCA----TT-CAATCC---A---G--GA-CAG----A-TA-GC-G-ACC---G-AC--TCCATG-GG--TCACA--TCC-TTGC---GGCA-GA-TNN-T--AA---CAATGACTG-TNTNCAC-AT---CCTA-G-A--CCAG-AACGGACAGTT----CNTTAA-AT---G---TGTGG--A-CAACTGTG
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gi|25644                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -----GAG-AAC-------AGAAA--C--C----T-AAAT--A--T-CTGTGTG-------GC--T---------GA-----------CAGT----A-TA-G---CTA-----G-AG-CAGTAGTG-GTGG-TTAATCA-G-G-----CTGGG---A--AATTAA--GATTCAGA-T-AC---------A-CTGG--A--CATAC-----C--C-------CTTTTCC------AA---A-A-----A-A-C---AA-A---CCA----TT-CGTTCC---A-------A-CAGGA--A-TC-AC-T-ACA---G-ACAGTC-A-G-AG--TCACA--TCC-TTTC---ATCT-GA-TGA-T--AA---CAATCAATG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCAA-GACGGACAGTT----CCTTtctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtgagaacagaaacctaaatatctgtgtggctgacagtatagctagagcagtagtggtggttaatcaggctgggaaattaagattcagatacactggacataccccttttccaaaaaacaaaccattcgttccaacaggaatcactacagacagtcagagtcacatcctttcatctgatgataacaatcaatgtgtccacatcatagaccaagacggacagttcctt
gi|25645                      : tttgttgtacctcctctggagatctcctggttaacccatgatcagtgatgacagaaatcaatccaaagttgtccgtttctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtTC--T-GCAGTAC-C-GCTTCTGATGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGAT---CAGT-GAT---G---ATA--GGA---AA-C-CA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTCT-A----------GC------T-C--C---ACAG----A-----G---ACACA
gi|25645                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AA--C--A----G-AAACCTA--T-CTGTGTG-------GC---------CG-AC-----------CGTG----G-A--G---CTA-----A-GG-CAGTAGTG-GTGG-TTAA-TT-A-GT----TAGGA---A--AACTCC--AATTTAGA-T-AC---------ACT--G--GT-CATCC-----C--T-------C-----T------AA---T-A-C--GA-G-G---GA-A---TTA----TT-CGATCC---A---GCCGG-CA-------TC-AC-T-ACA---G-ACA-GCCATA-G---TCACA--TCC-TAAC---AGCA-GA-CTA-C--AT---GAATCACCG-TATCCAT-AT---CCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----Caaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggagctaaggcagtagtggtggttaattagttaggaaaactccaatttagatacactggtcatccctctaatacgagggaattattcgatccagccggcatcactacagacagccatagtcacatcctaacagcagactacatgaatcaccgtatccatatcctagatcaggacggacagttca
gi|25646                      :                              tctgcagtaccgcttctgatgatctcctggttaccatgatcagtgatgataggaaaccatccaaagttgtccgttactctagctccacagagacacaaaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagTCCTG-GTT--ACC--A-TGAA---CAGT-AAA---G---ATA--ACA---AG-C-AA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TT-------------TT------G-A--CTCCACAG----A--GA-G---ACA----AACCATTCA---GTTTAA------TG-----A-TCAA-GGTCAA-CC-T----CT------C--TA-TTCA----------------------------T---C-T----GC----TG-GTT-ACATCATTGAG-AAC-------AAGAA--CCTG----G-ATAT--A--TGT---GTG-------GC--T---------GA-----------C-------A-AT-A-----------G-AG-CAGTAGTA-GTGG-TCAATCA-G-TA-----TGGA---A--AATTCC--GATTCAGA-T-AC---------AGT--G--G--TCATC-----C--CTATAATTC-----C------A--------------A-G---AA-A---ACC----TT-TTATCC---A---T---A-CGGCATTA-CA-GCAG-ACA---G------CCA----G--TCACA--TCC-TGAC---GGCA-GA-CTA-T--AA---CAATAACTG-TATTCAC-AT---CCTG-G-A--TCAG-GATGGGCAGTT----Ca
gi|25647                      :                                                                                                                                                                                                   gatcCTG-GTC--ACC--A-TGCT---GTCT-GAT---GTTTATA--T-A------C-CA----G-CTAAA-----GTAGTCC------GTTA-CT--C----------TG------G-A--C---CTAC----A--GT-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAAT-CC-TTTATAT------TCTTA-T-CCA-G-------------------------C---C-T----AT-A-TT------ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----A-TGAC--A--T-T---GTT-------GTGAT---T-----GA-----------GTTT----A-GA-A---CAG-----A-CA-CAGTAGAG-GTGG-TGGA-TA-A-GG----ATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--G--G--CAA-T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA-A---TCA----TT-TAATCC---A---C--G---TG----G-T--GT-G-ACCACAG-AC--AGCATG-TG--TCACA--TCC-TGAT---CGCT-GA-CCG-T--GG---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-AAACTGT
gi|25648                      :                                                                                                                                                                                                                                                          -T-CA-CCAG-CTAAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AACACA---G--TG-----ATACA--GGCGAA-CC-T----TT------A--TACT-TAA-G-------------------------T---C-C----ATTC-TTT-ATT-ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----A-TGAT--A--T-T---GT-----------------------------------TGTA----A-GT-GACTCTGCTACAACAA-CAGTAATG-GTGG-TGAA-CA-ATGA-----TGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--G--G---AAAT-----C--T-------C-----C------AA---T-C-A---A-A-G---AA-A---TCA----TT-TAATCC---A---T--GT---G----G-T--GT-G-ACCACAG-AC--AGCACG-TG--TCACA--TCC-TGAT---TGCT-GA-CCG-T--GG---TCACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTTCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGTG
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gi|25650                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      -AAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----ATACA--GGCAAA-CC-------T------T--TA-T--------------------------AT-TCTTATC-C----AG-ACTTT-ATT-ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----T-TGAC--A--T-T---GTT-------GT----------G-AG-----------TG--------AT-T---CTG-----A-TA-CAGTAGAG-GTGG-TGGA-CAAG-GA----C-GGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--GG-A--CA--T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA-A---TCA----TT-TAGTCC----------GA-GTG----G-T--GT-G-ACCACAG-AC--AGCATG-TG--TCACA--TCC-TGAT---CGCT-GA-CAT-C--AA---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAG-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGT
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Reference ( family-661 )      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTN--T-GCTGTAC-C-AGATCNGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGNN---TACT-ANT---G---ATA--G-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--C---ACAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCGAA-CC-N----AT------C--TA-T-CAA-G---GAGG-GA-----A----AT-ACT---C-C----GT-A-TTT-GTG-ACG-----GAG-AAC-------AACAA--C--G----G-NGAC--A--T-C---GTG-------GC--T---T--CG-GA-----------TGTT----A-AT-G---CTG-----A-AA-CAGTGGTG-GTGG-TGAA-CA-G-GA----CNGGA---A--AANTCA--GATTCAGA-T-AC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--N-------C-----C------AG---G-G-G--GA-A-G---GA-A---TCA----TT-CAATCC---A---G--GA-CAG----A-TA-GC-G--ACNGAC--TCCATG-GG--TCACA--TCC-TTGC---GGCA-GA-TNN-T--AA---CAATGACTG-TNTNCAC-AT---CCTA-G-A--CCAG-AACGGACAGTT----CNTTAA-AT---G---TGTGG--A-CAACTGTG
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gi|25640                      :                                                                                                                                                                  GGA-TTC--T-GCAGTAC-C-TCCTCTGGTGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGGA---GA----GT---G---ATA--A-AGACAG-A-CAATC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTC--T----------GG------CTC--C---ACAG----A--G------ACACAAACC--ATTCA---GTTT-----GA-TG-----A-TCAG-GGTCGT-CC-T----CT------C--TA-T-TCA-T---CTGG-AC-----A----TT-ATA---A-C----AG-A-TAC-ATC-ACT-----GAG-AAC-------AGGAA--C--C----A-GGAT--A--T-CTGTGTG-------AC--TGACT--GG-GG-----------AGCT----A-AT-G---C-------------AGTAGTG-GTGG-TCAATCA-G-G-----CCGGG---A--AACTGA--GATTCAGG-T-AC---------A-CTGG--A--CATACTCCTAC--T-------C-----C------AA---A-G-----A-A-C---CA-A---TCA----TT-CAATCCACTA---G--GA--------A-TC-AC-C--ACAGACAGTCAGT---G--TCACA--TCC-TTAC---AGCT-GA-TTA-T--TA---CAATAACTG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCGG-GACGGACA
gi|25641                      :                                                                                                                                                                   GA-CTA--T-GCTGCAC-G-AAGTCAGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGGA---TACT-ACT---G---ATT--A-T---AG-C-CA-AA-A-T-AAA-----ATTGCCC------GTTA-TC--A----------TG------G-A--G---ACAC----A--GT-G---AAACAAGAA--AT--A---GATAGA---GA-TG-----A-AGAT-GGAGAA-CC-A----AT------C--TA-T-AAA-G---GAGG-GG-----A----AT-ACCCA-C-C----GT-A---T-GTG-GTG-----GAG-AAC-------AACAA--T--G----G-AGAT--G--T-CT--GTG-------TC------T--CT-GA-----------TCAG----A-AT-G---CTC-----A-CA-CCGTGGTC-GTGG-TGAA-CA-A-GT----CAGGA---A--GAGTCC--GATTCCGA-T-AC---------GAC--G--G--TACAC-----CA-G-------G-----C------AG---G-A-G--GG-A-G---GA-G---TCA----TT-TAGTCC---T---G--CA-CAT----A-TA-GT-G--ACAGAC--
gi|25642                      :                                                                                                                                                                    A-CTA--TTGC-GTAC-T-AG-TCAGGGGA-CATCCTG-GTCG-AGT--A-TGACG--TACT-CAA---G---ATA--A-A---AG-------C-G-C-AAACATAAATTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------A-AA-C---ACC-----A--GT-G---A-ACAAGA----T--A---CATGG----GA-TG-----A-G-AT-GGAGAA-CC-A----AT------C--TT-G-AAA-G---GAGG-GA-----A----GT-ACCG--C-T----GT-A-T---GTG-GTG-----GAG-AAC-------AA-AA--T--G----G-AGAC--A--T-CT--GTG-------GC--C---T--CTTGA------------GTT----A-AT-G---CTG-----A-TA-CCATGGTT-GTCG-TGAA-CA-A-GT----CAGGA---AG-AAGTC---CATTCAGA-T-AC---------GAC--G--G--TACAT-----CA-G-------C-----G------AG---G-A-G--GA-A-G---AG-A---TCT----TT-TTATCC---T---A--GA-CAT----A-TA-GT-G--ACAGACT-TCCATGAGA--TCAGA--TCA-TTGT---GGCA-GA-TTC-CAAAA---CAATGACTGCCTTACAC-AT---CCTG-G-A--TCA--AACGGGCAGTT----CCTGAG-AT---GT--TGTGG--A-CAA-TGTG
gi|25643                      :                                                                                                                                                                    A-CTT--T-GCT--AC-T-AG-TCAGGGGAACATCCTGAGTCTTAGT--A-TGCCATCTACC-A-----G---ATA--A-A---AG-GGCA-AT-A-C-TAA-----AATGTCCCTCTACGTTA-TC--ATATATGTGCTGA------A-A--C---ACAGTTTTG--AT-A---AAACAGAAG--AT--A---CATG-----GA-TG-----AGATA--GGAGAA-CC-A----AT------C--TT-A-AAA-G---GAGG-GA-----AGGAGAT-ACT---CGCTGTAGT-G-TTC-GTG-GAG-----AAC-AACAATGAGGAGCAATAC--T----G-TGAC--GCCT-C---TTGAGTTAATGC--TGGAC--CG-GAGTCATCGCAACTGTTCTAAA-AG-G---TCG-----G-AA-CAGTGTCA-G------AA-AA-A-GA----ATGGA---AGTAAGCC---GATTCAGA-TTAC---------GAC--G--AGGCTTAC-----A--T-------C-----C------AG---G-C-GAAGG-A-G---GA-AAGATCT----TT-TA-TCC---T---A--GA-CAT----A-TC-AT-G--AC-GAC--TCCATG-AGA-TCAGAACTCA-TTGT---GGCACGA-TTCGC--AAAGCCAATGACTG-CCTACAC-ATCTCCTTG-G-ATTTCA--AACGGGCAGTT----C-TGAG-AT---GT--TGTGG--A-CAA-TGTG
gi|25644                      :                                                                                                                                                                       TT--T-GTTGTAC-C-TCCTCTGGAGA-TCTCCTG-GTT--AACCCA-TGAT---CAGT-GAT---G---ACA--G-A---AA-T-CAATC---C-AAA-----GTTGTCC------GTT
gi|25644                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -----GAG-AAC-------AGAAA--C--C----T-AAAT--A--T-CTGTGTG-------GC--T---------GA-----------CAGT----A-TA-G---CTA-----G-AG-CAGTAGTG-GTGG-TTAATCA-G-G-----CTGGG---A--AATTAA--GATTCAGA-T-AC---------A-CTGG--A--CATAC-----C--C-------CTTTTCC------AA---A-A-----A-A-C---AA-A---CCA----TT-CGTTCC---A-------A-CAGGA--A-TC-AC-T--ACAGACAGTC-A-G-AG--TCACA--TCC-TTTC---ATCT-GA-TGA-T--AA---CAATCAATG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCAA-GACGGACAGTT----CCTTtctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtgagaacagaaacctaaatatctgtgtggctgacagtatagctagagcagtagtggtggttaatcaggctgggaaattaagattcagatacactggacataccccttttccaaaaaacaaaccattcgttccaacaggaatcactacagacagtcagagtcacatcctttcatctgatgataacaatcaatgtgtccacatcatagaccaagacggacagttcctt
gi|25645                      : tttgttgtacctcctctggagatctcctggttaacccatgatcagtgatgacagaaatcaatccaaagttgtccgtttctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtTC--T-GCAGTAC-C-GCTTCTGATGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGAT---CAGT-GAT---G---ATA--GGA---AA-C-CA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTCT-A----------GC------T-C--C---ACAG----A-----G---ACACA
gi|25645                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AA--C--A----G-AAACCTA--T-CTGTGTG-------GC---------CG-AC-----------CGTG----G-A--G---CTA-----A-GG-CAGTAGTG-GTGG-TTAA-TT-A-GT----TAGGA---A--AACTCC--AATTTAGA-T-AC---------ACT--G--GT-CATCC-----C--T-------C-----T------AA---T-A-C--GA-G-G---GA-A---TTA----TT-CGATCC---A---GCCGG-CA-------TC-AC-T--ACAGACA-GCCATA-G---TCACA--TCC-TAAC---AGCA-GA-CTA-C--AT---GAATCACCG-TATCCAT-AT---CCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----Caaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggagctaaggcagtagtggtggttaattagttaggaaaactccaatttagatacactggtcatccctctaatacgagggaattattcgatccagccggcatcactacagacagccatagtcacatcctaacagcagactacatgaatcaccgtatccatatcctagatcaggacggacagttca
gi|25646                      :                              tctgcagtaccgcttctgatgatctcctggttaccatgatcagtgatgataggaaaccatccaaagttgtccgttactctagctccacagagacacaaaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagTCCTG-GTT--ACC--A-TGAA---CAGT-AAA---G---ATA--ACA---AG-C-AA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TT-------------TT------G-A--CTCCACAG----A--GA-G---ACA----AACCATTCA---GTTTAA------TG-----A-TCAA-GGTCAA-CC-T----CT------C--TA-TTCA----------------------------T---C-T----GC----TG-GTT-ACATCATTGAG-AAC-------AAGAA--CCTG----G-ATAT--A--TGT---GTG-------GC--T---------GA-----------C-------A-AT-A-----------G-AG-CAGTAGTA-GTGG-TCAATCA-G-TA-----TGGA---A--AATTCC--GATTCAGA-T-AC---------AGT--G--G--TCATC-----C--CTATAATTC-----C------A--------------A-G---AA-A---ACC----TT-TTATCC---A---T---A-CGGCATTA-CA-GCAG--ACAG-----CCA----G--TCACA--TCC-TGAC---GGCA-GA-CTA-T--AA---CAATAACTG-TATTCAC-AT---CCTG-G-A--TCAG-GATGGGCAGTT----Ca
gi|25647                      :                                                                                                                                                                                                   gatcCTG-GTC--ACC--A-TGCT---GTCT-GAT---GTTTATA--T-A------C-CA----G-CTAAA-----GTAGTCC------GTTA-CT--C----------TG------G-A--C---CTAC----A--GT-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAAT-CC-TTTATAT------TCTTA-T-CCA-G-------------------------C---C-T----AT-A-TT------ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----A-TGAC--A--T-T---GTT-------GTGAT---T-----GA-----------GTTT----A-GA-A---CAG-----A-CA-CAGTAGAG-GTGG-TGGA-TA-A-GG----ATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--G--G--CAA-T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA-A---TCA----TT-TAATCC---A---C--G--TGGT---G-TG-AC-C--ACAGAC--AGCATG-TG--TCACA--TCC-TGAT---CGCT-GA-CCG-T--GG---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-AAACTGT
gi|25648                      :                                                                                                                                                                                                                                                          -T-CA-CCAG-CTAAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AACACA---G--TG-----ATACA--GGCGAA-CC-T----TT------A--TACT-TAA-G-------------------------T---C-C----ATTC-TTT-ATT-ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----A-TGAT--A--T-T---GT-----------------------------------TGTA----A-GT-GACTCTGCTACAACAA-CAGTAATG-GTGG-TGAA-CA-ATGA-----TGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--G--G---AAAT-----C--T-------C-----C------AA---T-C-A---A-A-G---AA-A---TCA----TT-TAATCC---A---T--G--TGGT---G-TG-AC-C--ACAGAC--AGCACG-TG--TCACA--TCC-TGAT---TGCT-GA-CCG-T--GG---TCACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTTCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGTG
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gi|25650                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      -AAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----ATACA--GGCAAA-CC-------T------T--TA-T--------------------------AT-TCTTATC-C----AG-ACTTT-ATT-ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----T-TGAC--A--T-T---GTT-------GT----------G-AG-----------TG--------AT-T---CTG-----A-TA-CAGTAGAG-GTGG-TGGA-CAAG-GA----C-GGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--GG-A--CA--T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA-A---TCA----TT-TAGTCC-------G--AG-TGGT---G-TG-AC-C--ACAGAC--AGCATG-TG--TCACA--TCC-TGAT---CGCT-GA-CAT-C--AA---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAG-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGT
gi|25651                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         A-----ATTGTCT------GTTAATC--A----------GGTGTAATA-AT-C---ACAT----A--GTTG---AAACAGGAA--AT--C---GATAGA---GACTGTTAAAA-AAAT-GTTGAA-GT-T----GTAGAATTC--TA-T-TAAAG---GAAG-GATGAAGG----AT-ACT---C-T----GT-G-GGTAGTG-ATT-----G-G-AAC-------AAC----C--GACTCG-GAAC--A--T-T---TTGC------GC--T---TTACT-GA-----------T-TG----ATAT-G---CTG-----G-AA-TTGTG-----TCG-TGTA-CTTG-GAAAATCAGGG---A--AAGTCC--GATTCCGA-T-AC---------A----G--A--GAAAC-----C--AGC-----CA----C------AGTTTG-A-G--AA-A-A---AA-G---TCA----TTTCATTCC---C---G--AAACAA----T-TA-GT-G----CGAT--TCCATG-AA--TCAGA--TCTATTGTAGTGGCA-GA-TAA-A--AA---CAATAAC
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Reference ( family-661 )      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTN--T-GCTGTAC-C-AGATCNGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGNN---TACT-ANT---G---ATA--G-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--C---ACAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCGAA-CC-N----AT------C--TA-T-CAA-G---GAGG-GA-----A----AT-ACT---C-C----GT-A-TTT-GTG-ACG-----GAG-AAC-------AACAA--C--G----G-NGAC--A--T-C---GTG-------GC--T---T--CG-GA-----------TGTT----A-AT-G---CTG-----A-AA-CAGTGGTG-GTGG-TGAA-CA-G-GA----CNGGA---A--AANTCA--GATTCAGA-T-AC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--N-------C-----C------AG---G-G-G--GA-A-G---GA-A---TCA----TT-CAATCCA---G--GA-CGG----A-TA-GC-G--ACAGAC--TCCATG-GG--TCACA--TCC-TTGC---GGCA-GA-TNN-T--AA---CAATGACTG-TNTNCACA-T---CCTA-G-A--CCAG-AACGGACAGTT----CNTTAA-AT---G---TGTGG--A-CAACTGTG
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gi|25637                      :                                                                                                                                                                 GGGG-TTA--T-GCTGTAC-C-AGATACGGTGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGAG---CATT-GAT---C---AT---G-A---TGAC-CA-AT-A-T-AAG-----ATAGTTC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--A---ACAC----A--GT-G---AAACAGGAA--AT--C---GATAGA---GA-TG-----A-AAAT-GGTGAG-AT-A----AT------C--TA-T-AAA-G---GAGGTGA-----AGGC-AT-ACT----------GT-G---G-GTA-GTG-----GAG-AAC-------AACAA--T--G----G-AGAC--A--T-T----TGC------GC--T---T--CT-GA-----------TTAT----A-AT-G---CTG-----G-AA-TGGTGGTC-GTGG-TGGA-CA-A-AT----CAGGA---A--AAGTCC--GATTCCGA-T-AC---------GAC--G--G--GAAAC-----CA-G-------C-----C------AG---G-A-G--AA-A-G---AA-G---TCA----TT-TATTCCT---G--AA-CAA----T-TA-GT-G--ACGGAT--TCCATG-AA--TCAGA--TCA-TTGT---GGCA-GA-TAA-A--AA---CAATAACTG-TCTACACA-T---CCTG-A-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTGAG-AT---G---TGTGG--A-CAATTGTG
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gi|25644                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -----GAG-AAC-------AGAAA--C--C----T-AAAT--A--T-CTGTGTG-------GC--T---------GA-----------CAGT----A-TA-G---CTA-----G-AG-CAGTAGTG-GTGG-TTAATCA-G-G-----CTGGG---A--AATTAA--GATTCAGA-T-AC---------A-CTGG--A--CATAC-----C--C-------CTTTTCC------AA---A-A-----A-A-C---AA-A---CCA----TT-CGTTCCA---A--CA-GGA----A-TC-AC-T--ACAGACAGTC-A-G-AG--TCACA--TCC-TTTC---ATCT-GA-TGA-T--AA---CAATCAATG-TGTCCACA-T---CATA-G-A--CCAA-GACGGACAGTT----CCTTtctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtgagaacagaaacctaaatatctgtgtggctgacagtatagctagagcagtagtggtggttaatcaggctgggaaattaagattcagatacactggacataccccttttccaaaaaacaaaccattcgttccaacaggaatcactacagacagtcagagtcacatcctttcatctgatgataacaatcaatgtgtccacatcatagaccaagacggacagttcctt
gi|25645                      : tttgttgtacctcctctggagatctcctggttaacccatgatcagtgatgacagaaatcaatccaaagttgtccgtttctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtTC--T-GCAGTAC-C-GCTTCTGATGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGAT---CAGT-GAT---G---ATA--GGA---AA-C-CA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTCT-A----------GC------T-C--C---ACAG----A-----G---ACACA
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gi|25647                      :                                                                                                                                                                                                   gatcCTG-GTC--ACC--A-TGCT---GTCT-GAT---GTTTATA--T-A------C-CA----G-CTAAA-----GTAGTCC------GTTA-CT--C----------TG------G-A--C---CTAC----A--GT-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAAT-CC-TTTATAT------TCTTA-T-CCA-G-------------------------C---C-T----AT-A-TT------ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----A-TGAC--A--T-T---GTT-------GTGAT---T-----GA-----------GTTT----A-GA-A---CAG-----A-CA-CAGTAGAG-GTGG-TGGA-TA-A-GG----ATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--G--G--CAA-T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA-A---TCA----TT-TAATCCA---C--G--TGGT---G-TG-AC-C--ACAGAC--AGCATG-TG--TCACA--TCC-TGAT---CGCT-GA-CCG-T--GG---TAACCACGT-TATACATA-T---CATT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-AAACTGT
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gi|25650                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      -AAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----ATACA--GGCAAA-CC-------T------T--TA-T--------------------------AT-TCTTATC-C----AG-ACTTT-ATT-ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----T-TGAC--A--T-T---GTT-------GT----------G-AG-----------TG--------AT-T---CTG-----A-TA-CAGTAGAG-GTGG-TGGA-CAAG-GA----C-GGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--GG-A--CA--T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA-A---TCA----TT-TAGTCC----G--AG-TGGT---G-TG-AC-C--ACAGAC--AGCATG-TG--TCACA--TCC-TGAT---CGCT-GA-CAT-C--AA---TAACCACGT-TATACATA-T---CATT-G-A--TCAG-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGT
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Reference ( family-661 )      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTN--T-GCTGTAC-C-AGATCNGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGNN---TACT-ANT---G---ATA--G-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--C---ACAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCGAA-CC-N----AT------C--TA-T-CAA-G---GAGG-GA-----A----AT-ACT---C-C----GT-A-TTT-GTG-ACG-----GAG-AAC-------AACAA--C--G----G-NGAC--A--T-C---GTG-------GC--T---T--CG-GA-----------TGTT----A-AT-G---CTG-----A-AA-CAGTGGTG-GTGG-TGAA-CA-G-GA----CNGGA---A--AANTCA--GATTCAGA-T-AC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--N-------C-----C------AG---G-G-G--GA-A-G---GA-A---TCA----TTCGAT--CCA---N-GACGG-A-T-NGCG--ACAGAC--TCCATG-GG--TCACA--TCC-TTGC---GGCA-GA-TNN-T--AA---CAATGACTG-TNTNCAC-AT---CCTA-G-A--CCAG-AACGGACAGTT----CNTTAA-AT---G---TGTGG--A-CAACTGTG
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gi|25634                      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTT--T-GCCTCAC-C-AGGTCAGGGGA-TATCTTG-GTC--AGT--A-TGTT---TACT-ATC---G---ATA--G-A---AG-T-CG-TT-A-C-AAA-----ATTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-G--C---AGAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCAAA-CC-C----AT------C--TA-T-CAA-G---GAGG-GA-----A----AT-ACT---T-T----TT-A-TTT-GTG-GCA-----GAG-AAC-------AACAA--T--G----G-TGAC--A--T-C---GTG-------GC--T---T--CG-GA-----------TGTT----A-AT-G---CTA-----A-AA-CAGTGGTA-GTGG-TGAA-CA-G-GA----CTGGA---A--AGGTCA--GATTCCGA-T-AT---------AAC--G--A--CAAAC-----C--A-------C-----C------AG---GTG-G--GA-G-G---GA-A---TCA----TTCCAC--CCA---G-AACAG-A-T-AGTG--ACCGAC--TCAATG-GG--TCATA--TCA-TTGT---GGCA-GA-TAT-T--GC---CAATGACTG-TCTACAC-AT---TCTA-G-A--CCAG-AATGGACAATT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-AAAATGTG
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gi|25644                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -----GAG-AAC-------AGAAA--C--C----T-AAAT--A--T-CTGTGTG-------GC--T---------GA-----------CAGT----A-TA-G---CTA-----G-AG-CAGTAGTG-GTGG-TTAATCA-G-G-----CTGGG---A--AATTAA--GATTCAGA-T-AC---------A-CTGG--A--CATAC-----C--C-------CTTTTCC------AA---A-A-----A-A-C---AA-A---CCA----TTCGTT--CCA---A-CAGGA-A-T-CACT--ACAGACAGTC-A-G-AG--TCACA--TCC-TTTC---ATCT-GA-TGA-T--AA---CAATCAATG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCAA-GACGGACAGTT----CCTTtctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtgagaacagaaacctaaatatctgtgtggctgacagtatagctagagcagtagtggtggttaatcaggctgggaaattaagattcagatacactggacataccccttttccaaaaaacaaaccattcgttccaacaggaatcactacagacagtcagagtcacatcctttcatctgatgataacaatcaatgtgtccacatcatagaccaagacggacagttcctt
gi|25645                      : tttgttgtacctcctctggagatctcctggttaacccatgatcagtgatgacagaaatcaatccaaagttgtccgtttctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtTC--T-GCAGTAC-C-GCTTCTGATGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGAT---CAGT-GAT---G---ATA--GGA---AA-C-CA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTCT-A----------GC------T-C--C---ACAG----A-----G---ACACA
gi|25645                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AA--C--A----G-AAACCTA--T-CTGTGTG-------GC---------CG-AC-----------CGTG----G-A--G---CTA-----A-GG-CAGTAGTG-GTGG-TTAA-TT-A-GT----TAGGA---A--AACTCC--AATTTAGA-T-AC---------ACT--G--GT-CATCC-----C--T-------C-----T------AA---T-A-C--GA-G-G---GA-A---TTA----TTCGAT--CCA-----GCCGGCA-T-CACT--ACAGACA-GCCATA-G---TCACA--TCC-TAAC---AGCA-GA-CTA-C--AT---GAATCACCG-TATCCAT-AT---CCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----Caaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggagctaaggcagtagtggtggttaattagttaggaaaactccaatttagatacactggtcatccctctaatacgagggaattattcgatccagccggcatcactacagacagccatagtcacatcctaacagcagactacatgaatcaccgtatccatatcctagatcaggacggacagttca
gi|25646                      :                              tctgcagtaccgcttctgatgatctcctggttaccatgatcagtgatgataggaaaccatccaaagttgtccgttactctagctccacagagacacaaaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagTCCTG-GTT--ACC--A-TGAA---CAGT-AAA---G---ATA--ACA---AG-C-AA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TT-------------TT------G-A--CTCCACAG----A--GA-G---ACA----AACCATTCA---GTTTAA------TG-----A-TCAA-GGTCAA-CC-T----CT------C--TA-TTCA----------------------------T---C-T----GC----TG-GTT-ACATCATTGAG-AAC-------AAGAA--CCTG----G-ATAT--A--TGT---GTG-------GC--T---------GA-----------C-------A-AT-A-----------G-AG-CAGTAGTA-GTGG-TCAATCA-G-TA-----TGGA---A--AATTCC--GATTCAGA-T-AC---------AGT--G--G--TCATC-----C--CTATAATTC-----C------A--------------A-G---AA-A---ACC----TTTTAT--CCA---T--ACGGCA-T-TACA--GCAGACA-GCCA----G--TCACA--TCC-TGAC---GGCA-GA-CTA-T--AA---CAATAACTG-TATTCAC-AT---CCTG-G-A--TCAG-GATGGGCAGTT----Ca
gi|25647                      :                                                                                                                                                                                                   gatcCTG-GTC--ACC--A-TGCT---GTCT-GAT---GTTTATA--T-A------C-CA----G-CTAAA-----GTAGTCC------GTTA-CT--C----------TG------G-A--C---CTAC----A--GT-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAAT-CC-TTTATAT------TCTTA-T-CCA-G-------------------------C---C-T----AT-A-TT------ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----A-TGAC--A--T-T---GTT-------GTGAT---T-----GA-----------GTTT----A-GA-A---CAG-----A-CA-CAGTAGAG-GTGG-TGGA-TA-A-GG----ATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--G--G--CAA-T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA-A---TCA----TTTAAT--CCA---C-G-TGGTG-T-GACC--ACAGAC--AGCATG-TG--TCACA--TCC-TGAT---CGCT-GA-CCG-T--GG---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-AAACTGT
gi|25648                      :                                                                                                                                                                                                                                                          -T-CA-CCAG-CTAAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AACACA---G--TG-----ATACA--GGCGAA-CC-T----TT------A--TACT-TAA-G-------------------------T---C-C----ATTC-TTT-ATT-ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----A-TGAT--A--T-T---GT-----------------------------------TGTA----A-GT-GACTCTGCTACAACAA-CAGTAATG-GTGG-TGAA-CA-ATGA-----TGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--G--G---AAAT-----C--T-------C-----C------AA---T-C-A---A-A-G---AA-A---TCA----TTTAAT--CCA---T-G-TGGTG-T-GACC--ACAGAC--AGCACG-TG--TCACA--TCC-TGAT---TGCT-GA-CCG-T--GG---TCACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTTCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGTG
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gi|25650                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      -AAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----ATACA--GGCAAA-CC-------T------T--TA-T--------------------------AT-TCTTATC-C----AG-ACTTT-ATT-ACT-----GAG-AAC-------AAGAA--C--C----T-TGAC--A--T-T---GTT-------GT----------G-AG-----------TG--------AT-T---CTG-----A-TA-CAGTAGAG-GTGG-TGGA-CAAG-GA----C-GGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-T-AT---------AAT--GG-A--CA--T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA-A---TCA----TTTAGT--CCG---A-G-TGGTG-T-GACC--ACAGAC--AGCATG-TG--TCACA--TCC-TGAT---CGCT-GA-CAT-C--AA---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAG-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGT
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Reference ( family-661 )      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTN--T-GCTGTAC-C-AGATCNGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGNN---TACT-ANT---G---ATA--G-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--C---ACAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCGAA-CC-N----A------TC--TA-T-C-AAG---GAGG-GA-----A----AT-ACT---C-C----GT-A-TTT-GTG-ACG-----GAG-AACAACAA-C--G----G-NGAC--A-T-C---GTG--GC--T---T--C-G-GA-TGTTA-AT-G---CTG-----A-AA-C--AGTGGTG-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CNGGA---A--AANTCA--GATTCAGA-TAC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--N-------C-----C------AG---G-G-G--GA-A-G---GA---A-TC----ATTCGAT--CCA---N-GACGG--AT---C-GCG-ACAGACATCCATG-GG--TCACA--TCC-TT---GCGGCA-GA-TNNT--AA---CAATGACTG-TNTNCAC-AT---CCTA-G-A--CCAG-AACGGACAGTT----CNTTAA-AT---G---TGTGG--A-CAACTGTG
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gi|25640                      :                                                                                                                                                                  GGA-TTC--T-GCAGTAC-C-TCCTCTGGTGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGGA---GA----GT---G---ATA--A-AGACAG-A-CAATC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTC--T----------GG------CTC--C---ACAG----A--G------ACACAAACC--ATTCA---GTTT-----GA-TG-----A-TCAG-GGTCGT-CC-T----C------TC--TA-T-T-CAT---CTGG-AC-----A----TT-ATA---A-C----AG-A-TAC-ATC-ACT-----GAG-AACAGGAA-C--C----A-GGAT--A-T-CTGTGTG--AC--TGACT--G-G-GG-AGCTA-AT-G---C---------------AGTAGTG-GT-------------GG-T--CAATC-A-G-----------G-----CCGGG---A--AACTGA--GATTCAGG-TAC---------A-CTGG--A--CATACTCCTAC--T-------C-----C------AA---A-G-----A-A-C---CA---A-TC----ATTCAAT--CCA---C-TAGGA--AT---C-ACC-ACAGACAGTCA-G-TG--TCACA--TCC-TT---ACAGCT-GA-TTAT--TA---CAATAACTG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCGG-GACGGACA
gi|25641                      :                                                                                                                                                                   GA-CTA--T-GCTGCAC-G-AAGTCAGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGGA---TACT-ACT---G---ATT--A-T---AG-C-CA-AA-A-T-AAA-----ATTGCCC------GTTA-TC--A----------TG------G-A--G---ACAC----A--GT-G---AAACAAGAA--AT--A---GATAGA---GA-TG-----A-AGAT-GGAGAA-CC-A----A------TC--TA-T-A-AAG---GAGG-GG-----A----AT-ACCCA-C-C----GT-A---T-GTG-GTG-----GAG-AACAACAA-T--G----G-AGAT--G-T-CT--GTG--TC------T--C-T-GA-TCAGA-AT-G---CTC-----A-CA-C--CGTGGTC-GT-------------GG-T--GAA-C-A-A-----------GT----CAGGA---A--GAGTCC--GATTCCGA-TAC---------GAC--G--G--TACAC-----CA-G-------G-----C------AG---G-A-G--GG-A-G---GA---G-TC----ATTTAGT--CCT---G-CACAT--AT---A-GTG-ACAGAC
gi|25642                      :                                                                                                                                                                    A-CTA--TTGC-GTAC-T-AG-TCAGGGGA-CATCCTG-GTCG-AGT--A-TGACG--TACT-CAA---G---ATA--A-A---AG-------C-G-C-AAACATAAATTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------A-AA-C---ACC-----A--GT-G---A-ACAAGA----T--A---CATGG----GA-TG-----A-G-AT-GGAGAA-CC-A----A------TC--TT-G-A-AAG---GAGG-GA-----A----GT-ACCG--C-T----GT-A-T---GTG-GTG-----GAG-AACAA-AA-T--G----G-AGAC--A-T-CT--GTG--GC--C---T--C-TTGA--GTTA-AT-G---CTG-----A-TA-C--CATGGTT-GT-------------CG-T--GAA-C-A-A-----------GT----CAGGA---AG-AAGTC---CATTCAGA-TAC---------GAC--G--G--TACAT-----CA-G-------C-----G------AG---G-A-G--GA-A-G---AG---A-TC----TTTTTAT--CCT---A-GACAT--AT---A-GTG-ACAGACTTCCATGAGA--TCAGA--TCA-TT---GTGGCA-GA-TTCCAAAA---CAATGACTGCCTTACAC-AT---CCTG-G-A--TCA--AACGGGCAGTT----CCTGAG-AT---GT--TGTGG--A-CAA-TGTG
gi|25643                      :                                                                                                                                                                    A-CTT--T-GCT--AC-T-AG-TCAGGGGAACATCCTGAGTCTTAGT--A-TGCCATCTACC-A-----G---ATA--A-A---AG-GGCA-AT-A-C-TAA-----AATGTCCCTCTACGTTA-TC--ATATATGTGCTGA------A-A--C---ACAGTTTTG--AT-A---AAACAGAAG--AT--A---CATG-----GA-TG-----AGATA--GGAGAA-CC-A----A------TC--TT-A-A-AAG---GAGG-GA-----AGGAGAT-ACT---CGCTGTAGT-G-TTC-GT----G-----GAG-AACAACAA-T--GAGGAG-CAAT--A-C-T---GTGACGC--C---T--CTT-GA--GTTA-AT-G---CTG-----G-AC-CGGAGTCATC-GCAACTGTTCTAAAAGG-TCGGAA-C-A-GTGTCAGAAAAAGA----ATGGA---AGTAAGCC---GATTCAGATTAC---------GAC--G--AGGCTTAC-----A--T-------C-----C------AG---G-C-GAAGG-A-G---GAAAGA-TC-----TTTTAT--CCT---A-GACAT--AT---C-ATG-AC-GAC-TCCATGAGA--TCAGAACTCA-TT---GTGGCACGATTCGC--AAAGCCAATGACTG-CCTACAC-ATCTCCTTG-G-ATTTCA--AACGGGCAGTT----C-TGAG-AT---GT--TGTGG--A-CAA-TGTG
gi|25644                      :                                                                                                                                                                       TT--T-GTTGTAC-C-TCCTCTGGAGA-TCTCCTG-GTT--AACCCA-TGAT---CAGT-GAT---G---ACA--G-A---AA-T-CAATC---C-AAA-----GTTGTCC------GTT
gi|25644                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -----GAG-AACAGAAA-C--C----T-AAAT--A-T-CTGTGTG--GC--T----------GA-CAGTA-TA-G---CTA-----G-AG-C--AGTAGTG-GT-------------GG-T--TAATC-A-G-----------G-----CTGGG---A--AATTAA--GATTCAGA-TAC---------A-CTGG--A--CATAC-----C--C-------CTTTTCC------AA---A-A-----A-A-C---AA---A-CC----ATTCGTT--CCA---A-CAGGA--AT---C-ACT-ACAGACAGTCA-G-AG--TCACA--TCC-TT---TCATCT-GA-TGAT--AA---CAATCAATG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCAA-GACGGACAGTT----CCTTtctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtgagaacagaaacctaaatatctgtgtggctgacagtatagctagagcagtagtggtggttaatcaggctgggaaattaagattcagatacactggacataccccttttccaaaaaacaaaccattcgttccaacaggaatcactacagacagtcagagtcacatcctttcatctgatgataacaatcaatgtgtccacatcatagaccaagacggacagttcctt
gi|25645                      : tttgttgtacctcctctggagatctcctggttaacccatgatcagtgatgacagaaatcaatccaaagttgtccgtttctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtTC--T-GCAGTAC-C-GCTTCTGATGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGAT---CAGT-GAT---G---ATA--GGA---AA-C-CA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTCT-A----------GC------T-C--C---ACAG----A-----G---ACACA
gi|25645                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AA-C--A----G-AAACCTA-T-CTGTGTG--GC---------C-G-AC-CGTGG-A--G---CTA-----A-GG-C--AGTAGTG-GT-------------GG-T--TAA-T-T-A-----------GT----TAGGA---A--AACTCC--AATTTAGA-TAC---------ACT--G--GT-CATCC-----C--T-------C-----T------AA---T-A-C--GA-G-G---GA---A-TT----ATTCGAT--CCA-----GCCGGC-AT---C-ACT-ACAGACAGCCATA-G---TCACA--TCC-TA---ACAGCA-GA-CTAC--AT---GAATCACCG-TATCCAT-AT---CCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----Caaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggagctaaggcagtagtggtggttaattagttaggaaaactccaatttagatacactggtcatccctctaatacgagggaattattcgatccagccggcatcactacagacagccatagtcacatcctaacagcagactacatgaatcaccgtatccatatcctagatcaggacggacagttca
gi|25646                      :                              tctgcagtaccgcttctgatgatctcctggttaccatgatcagtgatgataggaaaccatccaaagttgtccgttactctagctccacagagacacaaaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagTCCTG-GTT--ACC--A-TGAA---CAGT-AAA---G---ATA--ACA---AG-C-AA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TT-------------TT------G-A--CTCCACAG----A--GA-G---ACA----AACCATTCA---GTTTAA------TG-----A-TCAA-GGTCAA-CC-T----C------TC--TA-TTC-A---------------------------T---C-T----GC----TG-GTT-ACATCATTGAG-AACAAGAA-CCTG----G-ATAT--A-TGT---GTG--GC--T----------GA-C---A-AT-A-----------G-AG-C--AGTAGTA-GT-------------GG-T--CAATC-A-G-----------TA-----TGGA---A--AATTCC--GATTCAGA-TAC---------AGT--G--G--TCATC-----C--CTATAATTC-----C------A--------------A-G---AA---A-AC----CTTTTAT--CCA---T--ACGGC-AT---T-ACA-GCAGACAGCCA----G--TCACA--TCC-TG---ACGGCA-GA-CTAT--AA---CAATAACTG-TATTCAC-AT---CCTG-G-A--TCAG-GATGGGCAGTT----Ca
gi|25647                      :                                                                                                                                                                                                   gatcCTG-GTC--ACC--A-TGCT---GTCT-GAT---GTTTATA--T-A------C-CA----G-CTAAA-----GTAGTCC------GTTA-CT--C----------TG------G-A--C---CTAC----A--GT-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAAT-CC-TTTATA------TTCTTA-T-C-CAG-------------------------C---C-T----AT-A-TT------ACT-----GAG-AACAAGAA-C--C----A-TGAC--A-T-T---GTT--GTGAT---T------GA-GTTTA-GA-A---CAG-----A-CA-C--AGTAGAG-GT-------------GG-T--GGA-T-A-A-----------GG----ATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--G--G--CAA-T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA---A-TC----ATTTAAT--CCA---C-G-TGGT-GT---G-ACC-ACAGACAGC-ATG-TG--TCACA--TCC-TG---ATCGCT-GA-CCGT--GG---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-AAACTGT
gi|25648                      :                                                                                                                                                                                                                                                          -T-CA-CCAG-CTAAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AACACA---G--TG-----ATACA--GGCGAA-CC-T----T------TA--TACT-T-AAG-------------------------T---C-C----ATTC-TTT-ATT-ACT-----GAG-AACAAGAA-C--C----A-TGAT--A-T-T---GT---------------------TGTAA-GT-GACTCTGCTACAACAA-C--AGTAATG-GT-------------GG-T--GAA-C-A-AT----------GA-----TGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--G--G---AAAT-----C--T-------C-----C------AA---T-C-A---A-A-G---AA---A-TC----ATTTAAT--CCA---T-G-TGGT-GT---G-ACC-ACAGACAGC-ACG-TG--TCACA--TCC-TG---ATTGCT-GA-CCGT--GG---TCACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTTCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGTG
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gi|25650                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      -AAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----ATACA--GGCAAA-CC-------------TT--TA-T--------------------------AT-TCTTATC-C----AG-ACTTT-ATT-ACT-----GAG-AACAAGAA-C--C----T-TGAC--A-T-T---GTT--GT-----------G-AG-TG----AT-T---CTG-----A-TA-C--AGTAGAG-GT-------------GG-T--GGA-C-AAG-----------GA----C-GGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--GG-A--CA--T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA---A-TC----ATTTAGT--CCG---A-G-TGGT-GT---G-ACC-ACAGACAGC-ATG-TG--TCACA--TCC-TG---ATCGCT-GA-CATC--AA---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAG-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGT
gi|25651                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         A-----ATTGTCT------GTTAATC--A----------GGTGTAATA-AT-C---ACAT----A--GTTG---AAACAGGAA--AT--C---GATAGA---GACTGTTAAAA-AAAT-GTTGAA-GT-T----GTAGAATTC--TA-T-TAAAG---GAAG-GATGAAGG----AT-ACT---C-T----GT-G-GGTAGTG-ATT-----G-G-AACAAC---C--GACTCG-GAAC--A-T-T---TTGC-GC--T---TTAC-T-GA-T-TGATAT-G---CTG-----G-AA-T--TGT-----GT-------------CG-T--GTA-CTT-G-----------GAAAATCAGGG---A--AAGTCC--GATTCCGA-TAC---------A----G--A--GAAAC-----CA-G-------CCA---C------AGTTTG-A-G--AA-A-A---AA---G-TC----ATTTCATTCCCG---A-AACAATTAG---T-GCG-AT-----TCCATG-AA--TCAGA--TCTATTGTAGTGGCA-GA-TAAA--AA---CAATAAC
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Reference ( family-661 )      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTN--T-GCTGTAC-C-AGATCNGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGNN---TACT-ANT---G---ATA--G-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--C---ACAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCGAA-CC-N----A------TC--TA-T-C-AAG---GAGG-GA-----A----AT-ACT---C-C----GT-A-TTT-GTGA-CG-----GAG-AACAACAA-C--G----G-NGAC--A-T-C---GTG--GCT-TC--GA-T-G-TTA--AT-G---CTG-----A-AA-C--AGTGGTG-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CNGGA---A--AANTCA--GATTCAGA-TAC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--N-------C-----C------AG---G-G-G--GA-A-G---GA---A-TCA----TTCGAT--CCA---N-GACGG--AT---C-GCG-ACAGACANCCATG-GG--TCACA--TCC-TT---GCGGCA-GA-TNNT--AA---CAATGACTG-TNTNCAC-AT---CCTA-G-A--CCAG-AACGGACAGTT----CNTTAA-AT---G---TGTGG--A-CAACTGTG
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gi|25637                      :                                                                                                                                                                 GGGG-TTA--T-GCTGTAC-C-AGATACGGTGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGAG---CATT-GAT---C---AT---G-A---TGAC-CA-AT-A-T-AAG-----ATAGTTC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--A---ACAC----A--GT-G---AAACAGGAA--AT--C---GATAGA---GA-TG-----A-AAAT-GGTGAG-AT-A----A------TC--TA-T-A-AAG---GAGGTGA-----AGGC-AT-ACT----------GT-G---G-GTAG-TG-----GAG-AACAACAA-T--G----G-AGAC--A-T-T----TGC-GCT-TCT-GA-T-T-ATA--AT-G---CTG-----G-AA-T--GGTGGTC-GT-------------GG-T--GGA-C-A-A-----------AT----CAGGA---A--AAGTCC--GATTCCGA-TAC---------GAC--G--G--GAAAC-----CA-G-------C-----C------AG---G-A-G--AA-A-G---AA---G-TCA----TTTATT--CCT---G-AACAA--TT---A-GTG-ACGGAT-TCCATG-AA--TCAGA--TCA-TT---GTGGCA-GA-TAAA--AA---CAATAACTG-TCTACAC-AT---CCTG-A-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTGAG-AT---G---TGTGG--A-CAATTGTG
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gi|25639                      :                                                                                                                                                                 GGGATCTAGCT-GCTGTACTC-CGATCTGGAGAACATCATG-GACG-AGT--AATGTG---TACTTATTCGTG---ATT--A-A---TA-T-CG-TC-AAC-AAA-------TGTCC------GTTA-TCTAG----------GG------G-A--C---AGAG----GAGGT-G---ACACATGGA--AT--ATTAGATAAA---GA-TG-----A-ACGC-AGCTAATCC-A----A------TC--TA-C-C-AAG---GAGA-TG-----ATATCAT-GCT---G-C----GC-T-CAT-GTGAACG-----AAA-AACAACAAGT--G----G-AGAT--A-T-C---GTG--ACT-CT--GA-T-G-TTA--ATCG---CGG-----A-CA-C--AGATGTGAGT-------------AGTT--GGA-C-A-G-----------GA----GAGGGAACA--AGGTCAGCGATC--GA-TACCTTTTAGTAAGC--ATTA--CAAAC-----TCAG-------C-----C------AT---G-G-G--GA-ATA---GA---ACTCA----TTCAGT--CCAATTA-GGCAGT-ATAGGT-GAA-ACGTACTTCCTTG-GG--T--CT--TTC-AT---GTGTAA-GATTTCT--AAC--CAATGCCTG-TCTACAT-AT---TCCGCG-A--TCAG-AATGGACTATT----CATTAATTT---G---TGTGG--ATCAATTGTG
gi|25640                      :                                                                                                                                                                  GGA-TTC--T-GCAGTAC-C-TCCTCTGGTGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGGA---GA----GT---G---ATA--A-AGACAG-A-CAATC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTC--T----------GG------CTC--C---ACAG----A--G------ACACAAACC--ATTCA---GTTT-----GA-TG-----A-TCAG-GGTCGT-CC-T----C------TC--TA-T-T-CAT---CTGG-AC-----A----TT-ATA---A-C----AG-A-TAC-ATCA-CT-----GAG-AACAGGAA-C--C----A-GGAT--A-T-CTGTGTG--ACT-----GACT-G-GGG--A--G---CTA-----A-TG-C--AGTAGTG-GT-------------GG-T--CAATC-A-G-----------G-----CCGGG---A--AACTGA--GATTCAGG-TAC---------A-CTGG--A--CATACTCCTAC--T-------C-----C------AA---A-G-----A-A-C---CA---A-TCA----TTCAAT--CCA---C-TAGGA--AT---C-ACC-ACAGACAGTCA-G-TG--TCACA--TCC-TT---ACAGCT-GA-TTAT--TA---CAATAACTG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCGG-GACGGACA
gi|25641                      :                                                                                                                                                                   GA-CTA--T-GCTGCAC-G-AAGTCAGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGGA---TACT-ACT---G---ATT--A-T---AG-C-CA-AA-A-T-AAA-----ATTGCCC------GTTA-TC--A----------TG------G-A--G---ACAC----A--GT-G---AAACAAGAA--AT--A---GATAGA---GA-TG-----A-AGAT-GGAGAA-CC-A----A------TC--TA-T-A-AAG---GAGG-GG-----A----AT-ACCCA-C-C----GT-A---T-GTGG-TG-----GAG-AACAACAA-T--G----G-AGAT--G-T-CT--GTG--TCT-CT--GA-T-C-AGA--AT-G---CTC-----A-CA-C--CGTGGTC-GT-------------GG-T--GAA-C-A-A-----------GT----CAGGA---A--GAGTCC--GATTCCGA-TAC---------GAC--G--G--TACAC-----CA-G-------G-----C------AG---G-A-G--GG-A-G---GA---G-TCA----TTTAGT--CCT---G-CACAT--AT---A-GTG-ACAGAC
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gi|25643                      :                                                                                                                                                                    A-CTT--T-GCT--AC-T-AG-TCAGGGGAACATCCTGAGTCTTAGT--A-TGCCATCTACC-A-----G---ATA--A-A---AG-GGCA-AT-A-C-TAA-----AATGTCCCTCTACGTTA-TC--ATATATGTGCTGA------A-A--C---ACAGTTTTG--AT-A---AAACAGAAG--AT--A---CATG-----GA-TG-----AGATA--GGAGAA-CC-A----A------TC--TT-A-A-AAG---GAGG-GA-----AGGAGAT-ACT---CGCTGTAGT-G-TTC-GT----G-----GAG-AACAACAA-T--GAGGAG-CAAT--A-C-T---GTGACGCC-TCTTGA---G-TTA--AT-G---CTG-----G-AC-CGGAGTCATC-GCAACTGTTCTAAAAGG-TCGGAA-C-A-GTGTCAGAAAAAGA----ATGGA---AGTAAGCC---GATTCAGATTAC---------GAC--G--AGGCTTAC-----A--T-------C-----C------AG---G-C-GAAGG-A-G---GAAAGA-TC-----TTTTAT--CCT---A-GACAT--AT---C-ATG-AC-GAC-TCCATGAGA--TCAGAACTCA-TT---GTGGCACGATTCGC--AAAGCCAATGACTG-CCTACAC-ATCTCCTTG-G-ATTTCA--AACGGGCAGTT----C-TGAG-AT---GT--TGTGG--A-CAA-TGTG
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gi|25644                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -----GAG-AACAGAAA-C--C----T-AAAT--A-T-CTGTGTG--GCT-----GA-C-A-GTA--TA-G---CTA-----G-AG-C--AGTAGTG-GT-------------GG-T--TAATC-A-G-----------G-----CTGGG---A--AATTAA--GATTCAGA-TAC---------A-CTGG--A--CATAC-----C--C-------CTTTTCC------AA---A-A-----A-A-C---AA---A-CCA----TTCGTT--CCA---A-CAGGA--AT---C-ACT-ACAGACAGTCA-G-AG--TCACA--TCC-TT---TCATCT-GA-TGAT--AA---CAATCAATG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCAA-GACGGACAGTT----CCTTtctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtgagaacagaaacctaaatatctgtgtggctgacagtatagctagagcagtagtggtggttaatcaggctgggaaattaagattcagatacactggacataccccttttccaaaaaacaaaccattcgttccaacaggaatcactacagacagtcagagtcacatcctttcatctgatgataacaatcaatgtgtccacatcatagaccaagacggacagttcctt
gi|25645                      : tttgttgtacctcctctggagatctcctggttaacccatgatcagtgatgacagaaatcaatccaaagttgtccgtttctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtTC--T-GCAGTAC-C-GCTTCTGATGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGAT---CAGT-GAT---G---ATA--GGA---AA-C-CA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTCT-A----------GC------T-C--C---ACAG----A-----G---ACACA
gi|25645                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AA-C--A----G-AAACCTA-T-CTGTGTG--GC---C--GA-CCG-TGG--A--G---CTA-----A-GG-C--AGTAGTG-GT-------------GG-T--TAA-T-T-A-----------GT----TAGGA---A--AACTCC--AATTTAGA-TAC---------ACT--G--GT-CATCC-----C--T-------C-----T------AA---T-A-C--GA-G-G---GA---A-TTA----TTCGAT--CCA-----GCCGGC-AT---C-ACT-ACAGACAGCCATA-G---TCACA--TCC-TA---ACAGCA-GA-CTAC--AT---GAATCACCG-TATCCAT-AT---CCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----Caaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggagctaaggcagtagtggtggttaattagttaggaaaactccaatttagatacactggtcatccctctaatacgagggaattattcgatccagccggcatcactacagacagccatagtcacatcctaacagcagactacatgaatcaccgtatccatatcctagatcaggacggacagttca
gi|25646                      :                              tctgcagtaccgcttctgatgatctcctggttaccatgatcagtgatgataggaaaccatccaaagttgtccgttactctagctccacagagacacaaaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagTCCTG-GTT--ACC--A-TGAA---CAGT-AAA---G---ATA--ACA---AG-C-AA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TT-------------TT------G-A--CTCCACAG----A--GA-G---ACA----AACCATTCA---GTTTAA------TG-----A-TCAA-GGTCAA-CC-T----C------TC--TA-TTC-A---------------------------T---C-T----GC----TG-GTTA-CATCATTGAG-AACAAGAA-CCTG----G-ATAT--A-TGT---GTG--GCT-----GA-C-----A--AT-A-----------G-AG-C--AGTAGTA-GT-------------GG-T--CAATC-A-G-----------TA-----TGGA---A--AATTCC--GATTCAGA-TAC---------AGT--G--G--TCATC-----C--CTATAATTC-----C------A--------------A-G---AA---A-ACC----TTTTAT--CCA---T--ACGGC-AT---T-ACA-GCAGACAGCCA----G--TCACA--TCC-TG---ACGGCA-GA-CTAT--AA---CAATAACTG-TATTCAC-AT---CCTG-G-A--TCAG-GATGGGCAGTT----Ca
gi|25647                      :                                                                                                                                                                                                   gatcCTG-GTC--ACC--A-TGCT---GTCT-GAT---GTTTATA--T-A------C-CA----G-CTAAA-----GTAGTCC------GTTA-CT--C----------TG------G-A--C---CTAC----A--GT-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAAT-CC-TTTATA------TTCTTA-T-C-CAG-------------------------C---C-T----AT-A-TT-----A-CT-----GAG-AACAAGAA-C--C----A-TGAC--A-T-T---GTT--GTGATT--GA-G-T-TTA--GA-A---CAG-----A-CA-C--AGTAGAG-GT-------------GG-T--GGA-T-A-A-----------GG----ATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--G--G--CAA-T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA---A-TCA----TTTAAT--CCA---C-G-TGGT-GT---G-ACC-ACAGACAGC-ATG-TG--TCACA--TCC-TG---ATCGCT-GA-CCGT--GG---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-AAACTGT
gi|25648                      :                                                                                                                                                                                                                                                          -T-CA-CCAG-CTAAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AACACA---G--TG-----ATACA--GGCGAA-CC-T----T------TA--TACT-T-AAG-------------------------T---C-C----ATTC-TTT-ATTA-CT-----GAG-AACAAGAA-C--C----A-TGAT--A-T-T---GT--------------T-G-TAA--GT-GACTCTGCTACAACAA-C--AGTAATG-GT-------------GG-T--GAA-C-A-AT----------GA-----TGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--G--G---AAAT-----C--T-------C-----C------AA---T-C-A---A-A-G---AA---A-TCA----TTTAAT--CCA---T-G-TGGT-GT---G-ACC-ACAGACAGC-ACG-TG--TCACA--TCC-TG---ATTGCT-GA-CCGT--GG---TCACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTTCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGTG
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gi|25650                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      -AAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----ATACA--GGCAAA-CC-------------TT--TA-T--------------------------AT-TCTTATC-C----AG-ACTTT-ATTA-CT-----GAG-AACAAGAA-C--C----T-TGAC--A-T-T---GT--------------T-G-TGA--GT-GATTCTG-----A-TA-C--AGTAGAG-GT-------------GG-T--GGA-C-AAG-----------GA----C-GGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--GG-A--CA--T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA---A-TCA----TTTAGT--CCG---A-G-TGGT-GT---G-ACC-ACAGACAGC-ATG-TG--TCACA--TCC-TG---ATCGCT-GA-CATC--AA---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAG-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGT
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Reference ( family-661 )      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTN--T-GCTGTAC-C-AGATCNGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGNN---TACT-ANT---G---ATA--G-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--C---ACAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCGAA-CC-N----A------TC--TA-T-C-AAG---GAGG-GA-----A----AT-ACT---C-C----GT-A-TTT-GTGA-CG-----GAG-AACAACAA-C--G----G-NGAC--A-T-C---GTG--GCT-TC--GA-T-G-TTA--AT-G---CTG-----A-AA-C--AGTGGTG-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CNGGA---A--AANTCA--GATTCAGA-TAC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--N-------C-----C------AG---G-G-G--GA-A-G---GA---A-TCA----TTCGAT--CCA---N-GACGG--AT---C-GCG-ACAGACANCCATG-GG--TCACA--TCC-TT---GCGGCA-GA-TNNT--AA---CAATGACTG-TNTNCAC-AT---CCTA-G-A--CCAG-AACGGACAGTT----CNTTAA-AT---G---TGTGG--A-CAACTGTG
gi|25632                      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTT--T-GCTGCAC-C-AGATCAGGGGA-TATCCTG-ATC--AGT--T-T--T---TACT-ATT---G---ATA--A-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----ATTGTTC------GTTA-TC--A----------GG------G-A--C---AGAA----A--GT-G---ATACAAGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCAAA-CC-C----A------TT--TA-T-C-AAG---GAGG--------A----ATGGCT---C-A----AT-A-TTT-GTGA-C-------AG-AACAACAA-T--G----G-TGAC--A-T-C---GTG--GCA-CG--GA-T-T-TTA--AT-G---CTA-----A-AA-C--AGTGGTA-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CAGGA---G--ATGTC---GATTCCGA-TAC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--A-------C-----C------AG---G-G-G--AC-A-G---AA---A-ACA----TTCGAT--CCA---G-GACAG--AT---A-GTG-ACCGAC-TCAATG-GG--TCGTA--T-C-TT---GTGGCA-GA-TTTT--AA---CAATGACTG-TCTACAC-AT---TCTA-G-A--TCAG--ATGGACA-TT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-CAAATGTG
gi|25633                      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTT--T--CTGCAC-C-AGATCAGGGGA-TATCCTG-ATC--AGT--T-T--T---TAC--ATT---G---ATA--A-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----ATTGTTC------GT-A-TC--A----------GG------G-A--C---AGAA----A--GT-G---ATACAAGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCAAA-CC-C----A------TT--TA-T-C-AAG---GAGG--------A----AT-GGC---T-C----AA-A-TTT-GTGA-CA-----GAG-AACAACAA-T--G----G-TGAC--A-T-C---GTG---CA-CG--GA-T-T-TTA--AT-G---CTA-----A-AA-C--AGTGGTA-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CAGGA---G--ATGTCA--GATTCCGA-TAC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--A-------C-----C------AG---G-ACA--GA-A------A---A-ACA----TTCGAT--CCA---G-GACAG--AT---A-GTG-ACCGAC-TCAATG-GG--TCGTA--TCA-TT---GTGGCA-GA-TTTT--AA---CAATGACTG-TCTACACAAT---TCTA-G-A--TCAG--ATGGACAATT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-CAAATGTG
gi|25634                      :                                                                                                                                                                 GGGA-CTT--T-GCCTCAC-C-AGGTCAGGGGA-TATCTTG-GTC--AGT--A-TGTT---TACT-ATC---G---ATA--G-A---AG-T-CG-TT-A-C-AAA-----ATTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------G-G--C---AGAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCAAA-CC-C----A------TC--TA-T-C-AAG---GAGG-GA-----A----AT-ACT---T-T----TT-A-TTT-GTGG-CA-----GAG-AACAACAA-T--G----G-TGAC--A-T-C---GTG--GCT-TCG-GA-T-G-TTA--AT-G---CTA-----A-AA-C--AGTGGTA-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CTGGA---A--AGGTCA--GATTCCGA-TAT---------AAC--G--A--CAAAC-----C--A-------C-----C------AG---GTG-G--GA-G-G---GA---A-TCA----TTCCAC--CCA---G-AACAG--AT---A-GTG-ACCGAC-TCAATG-GG--TCATA--TCA-TT---GTGGCA-GA-TATT--GC---CAATGACTG-TCTACAC-AT---TCTA-G-A--CCAG-AATGGACAATT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-AAAATGTG
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gi|25644                      :                                                                                                                                                                       TT--T-GTTGTAC-C-TCCTCTGGAGA-TCTCCTG-GTT--AACCCA-TGAT---CAGT-GAT---G---ACA--G-A---AA-T-CAATC---C-AAA-----GTTGTCC------GTT
gi|25644                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -----GAG-AACAGAAA-C--C----T-AAAT--A-T-CTGTGTG--GCT-----GA-C-A-GTA--TA-G---CTA-----G-AG-C--AGTAGTG-GT-------------GG-T--TAATC-A-G-----------G-----CTGGG---A--AATTAA--GATTCAGA-TAC---------A-CTGG--A--CATAC-----C--C-------CTTTTCC------AA---A-A-----A-A-C---AA---A-CCA----TTCGTT--CCA---A-CAGGA--AT---C-ACT-ACAGACAGTCA-G-AG--TCACA--TCC-TT---TCATCT-GA-TGAT--AA---CAATCAATG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCAA-GACGGACAGTT----CCTTtctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtgagaacagaaacctaaatatctgtgtggctgacagtatagctagagcagtagtggtggttaatcaggctgggaaattaagattcagatacactggacataccccttttccaaaaaacaaaccattcgttccaacaggaatcactacagacagtcagagtcacatcctttcatctgatgataacaatcaatgtgtccacatcatagaccaagacggacagttcctt
gi|25645                      : tttgttgtacctcctctggagatctcctggttaacccatgatcagtgatgacagaaatcaatccaaagttgtccgtttctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtTC--T-GCAGTAC-C-GCTTCTGATGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGAT---CAGT-GAT---G---ATA--GGA---AA-C-CA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTCT-A----------GC------T-C--C---ACAG----A-----G---ACACA
gi|25645                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AA-C--A----G-AAACCTA-T-CTGTGTG--GC---C--GA-CCG-TGG--A--G---CTA-----A-GG-C--AGTAGTG-GT-------------GG-T--TAA-T-T-A-----------GT----TAGGA---A--AACTCC--AATTTAGA-TAC---------ACT--G--GT-CATCC-----C--T-------C-----T------AA---T-A-C--GA-G-G---GA---A-TTA----TTCGAT--CCA-----GCCGGC-AT---C-ACT-ACAGACAGCCATA-G---TCACA--TCC-TA---ACAGCA-GA-CTAC--AT---GAATCACCG-TATCCAT-AT---CCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----Caaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggagctaaggcagtagtggtggttaattagttaggaaaactccaatttagatacactggtcatccctctaatacgagggaattattcgatccagccggcatcactacagacagccatagtcacatcctaacagcagactacatgaatcaccgtatccatatcctagatcaggacggacagttca
gi|25646                      :                              tctgcagtaccgcttctgatgatctcctggttaccatgatcagtgatgataggaaaccatccaaagttgtccgttactctagctccacagagacacaaaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagTCCTG-GTT--ACC--A-TGAA---CAGT-AAA---G---ATA--ACA---AG-C-AA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TT-------------TT------G-A--CTCCACAG----A--GA-G---ACA----AACCATTCA---GTTTAA------TG-----A-TCAA-GGTCAA-CC-T----C------TC--TA-TTC-A---------------------------T---C-T----GC----TG-GTTA-CATCATTGAG-AACAAGAA-CCTG----G-ATAT--A-TGT---GTG--GCT-----GA-C-----A--AT-A-----------G-AG-C--AGTAGTA-GT-------------GG-T--CAATC-A-G-----------TA-----TGGA---A--AATTCC--GATTCAGA-TAC---------AGT--G--G--TCATC-----C--CTATAATTC-----C------A--------------A-G---AA---A-ACC----TTTTAT--CCA---T--ACGGC-AT---T-ACA-GCAGACAGCCA----G--TCACA--TCC-TG---ACGGCA-GA-CTAT--AA---CAATAACTG-TATTCAC-AT---CCTG-G-A--TCAG-GATGGGCAGTT----Ca
gi|25647                      :                                                                                                                                                                                                   gatcCTG-GTC--ACC--A-TGCT---GTCT-GAT---GTTTATA--T-A------C-CA----G-CTAAA-----GTAGTCC------GTTA-CT--C----------TG------G-A--C---CTAC----A--GT-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAAT-CC-TTTATA------TTCTTA-T-C-CAG-------------------------C---C-T----AT-A-TT-----A-CT-----GAG-AACAAGAA-C--C----A-TGAC--A-T-T---GTT--GTGATT--GA-G-T-TTA--GA-A---CAG-----A-CA-C--AGTAGAG-GT-------------GG-T--GGA-T-A-A-----------GG----ATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--G--G--CAA-T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA---A-TCA----TTTAAT--CCA---C-G-TGGT-GT---G-ACC-ACAGACAGC-ATG-TG--TCACA--TCC-TG---ATCGCT-GA-CCGT--GG---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-AAACTGT
gi|25648                      :                                                                                                                                                                                                                                                          -T-CA-CCAG-CTAAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AACACA---G--TG-----ATACA--GGCGAA-CC-T----T------TA--TACT-T-AAG-------------------------T---C-C----ATTC-TTT-ATTA-CT-----GAG-AACAAGAA-C--C----A-TGAT--A-T-T---GT--------------T-G-TAA--GT-GACTCTGCTACAACAA-C--AGTAATG-GT-------------GG-T--GAA-C-A-AT----------GA-----TGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--G--G---AAAT-----C--T-------C-----C------AA---T-C-A---A-A-G---AA---A-TCA----TTTAAT--CCA---T-G-TGGT-GT---G-ACC-ACAGACAGC-ACG-TG--TCACA--TCC-TG---ATTGCT-GA-CCGT--GG---TCACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTTCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGTG
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gi|25650                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      -AAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------T-T--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----ATACA--GGCAAA-CC-------------TT--TA-T--------------------------AT-TCTTATC-C----AG-ACTTT-ATTA-CT-----GAG-AACAAGAA-C--C----T-TGAC--A-T-T---GT--------------T-G-TGA--GT-GATTCTG-----A-TA-C--AGTAGAG-GT-------------GG-T--GGA-C-AAG-----------GA----C-GGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--GG-A--CA--T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA---A-TCA----TTTAGT--CCG---A-G-TGGT-GT---G-ACC-ACAGACAGC-ATG-TG--TCACA--TCC-TG---ATCGCT-GA-CATC--AA---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAG-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGT
gi|25651                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         A-----ATTGTCT------GTTAATC--A----------GGTGTAATA-AT-C---ACAT----A--GTTG---AAACAGGAA--AT--C---GATAGA---GACTGTTAAAA-AAAT-GTTGAA-GT-T----GTAGAATTC--TA-T-TAAAG---GAAG-GATGAAGG----AT-ACT---C-T----GT-G-GGTAGTGA-TT-----G-G-AACAAC---C--GACTCG-GAAC--A-T-T---TTGC-GCT-TT--AC-T-GATTGATAT-G---CTG-----G-AA-T--TGT-----GT-------------CG-T--GTA-CTT-G-----------GAAAATCAGGG---A--AAGTCC--GATTCCGA-TAC---------A----G--A--GAAAC-----CA-G-------CCA---C------AGTTTG-A-G--AA-A-A---AA---G-TCA----TTTCATTCCCG---A-AACAATTAG---T-GCG-AT-----TCCATG-AA--TCAGA--TCTATTGTAGTGGCA-GA-TAAA--AA---CAATAAC
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gi|25656                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gctagcg--GATTTAGA-TAC---------ACT--G--G--TCATC-----C--A-------T-----CT-----AA---G-G-A--GA-A-A---GG---A-TCA----TTTGAT--CCA-----GTTGGC-AT---T-GCA-ACAGACAGTCA-G-AG--TCACA--TCC-TG---ACAGCA-GA-CTGC--AA---CAAACATCG-TATCCAC-AT---TCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----CCTTCG-TT---A---CATTG--A-TAACTGTG
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  T   .       . .  G  A     A       .   C    .  .  ACG      ATT     .     GG   .    GG   CCAG   T   A           .         C  AGGTGTAATAATC                     GAG      . .       G   .   TCA       AA    A   .     T   CA   A A   TTTATA         .   . TA    TG     GATGAAGGATACTCTGTGGGTA                  G . A        .     C  . GACTCGG      .  . G TGT   C   CTCTT   CCG     .  T  ATT   .     A  . .    G   .  .              . .    T . A GAAAATCA              .   G   G  A          T   .         CTGGACATACTCCTACTCCAAAG                                   C TA     T   A   .      C  .    AAACAATT      TA     G   C   AG   T AG .      .    .  .       A   T TCCAA  TT     G    . C A   .  .      . . .     .           CCTC A    .  .   GAC     .  .   A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  T   .       . .  A  A     .       .   G    .  .  TT       ATC     .     AC   .    T    TCG    .   A           .         C  TAGGGGAC                          A        . .       G   .   TCA       AA    A   .     T   C    A A   AAA            .   . C     G      TGATATCATGCTGCGCTCAT                    A . A        .     C  . CTGGA        .  . . TGT   C   TTCG    CTG     .  T  .     .     A  . .    G   .  .              . .    T . . GACA                  .   .   G  A          .   .         ACGAGGCTTACATCCAGGCGAAG                                   . G      .   T   .      A  .    AAGACAG       A      G   T   TT   A G  .      .    .  .       A   . TTT    C      A    . C A   .  .      . . .     .           CCTC A    .  .   T       .  .   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  G   .       . .  A  C     .       .   G    .  .  TG       ATT     .     A    .    T    TTA    .   A           .         C  TTGACTCC                          A        . .       G   .   AC        AA    A   .     .   C    A T   CA             .   . C     G      GTTTGGTGTCTAGTGTAT                      A . A        .     C  . CTGGA        .  . . TGT   .   CTCT    TGA     .  T  .     .     C  . .    G   .  .              . .    T . . GACT                  .   .   G  C          .   .         CTGGACATACCCCTTTTCCAAAA                                   . G      .   G   .      A  .    GGACAG        A      G   G   AG   T G  .      .    .  .       A   . ATT    .      G    . C A   .  .      . . .     .           .    A    .  .   T       .  .   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  G   .       . .  A  C     .       .   .    .  .  CA       ACT     .     G    .    T    TAG    .   A           .         A  CTGGCTCC                          A        . .       G   .   AC        GA    A   .     .   C    G T   CA             .   . C     G      ATTCTTATCCAGACTTT                       A . A        .     C  . GACA         .  . . TGT   .   TTCT    CTG     .  T  .     .     G  . .    G   .  .              . .    T . . GACG                  .   .   G  C          .   .         CTGGTCATCCTCCTTCTCCAAAG                                   . G      .   C   .      A  .    GAACAG        A      G   G   AG   T G  .      .    .  .       A   . TTC    .      A    . C A   .  .      . . .     .           .    C    .  .   .       .  .   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  A   .       . .  A  T     .       .   .    .  .  AG       GAT     .     G    .    T    TCA    .   A           .         .  TGGCTCC                           A        . .       G   .   AC        AA    A   .     .   T    A G   AA             .   . C     G      GAAATACTTTTTATTT                        G . G        .     C  . GGT          .  . . T     .   TCTT    CTG     .  T  .     .     A  . .    T   .  .              . .    T . . GACG                  .   .   A  C          .   .         GAGAAACCAGCCACAGTTTGAGA                                   . G      .   T   .      A  .    AGACAG        A      G   A   AG   T G  .      .    .  .       A   . CCT    .      G    . C A   .  .      . . .     .           .    A    .  .   .       .  .   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  T   .       . .  A  T     .       .   .    .  .  AG       ACT     .     G    .    T    ATA    .   A           .         .  AGGAAAC                           A        . .       T   .   A         AA    A   .     .   T    T T   AA             .   . A     G      GAAATGCTTTGTACTT                        C . A        .     C  . GGT          .  . . T     .   GATT    TT      .  C  .     .     A  . .    A   .  .              . .    . . . ATCA                  .   .   G  C          .   .         CTGGACATACTCCTGCTCCAAAG                                   . G      .   T   .      A  .    GAACAA        A      A   A   AG   T A  .      .    .  .       A   . AAA    .      G    . C A   .  .      . . .     .           .    A    .  .   .       .  .   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  C   .       . .  C  T     .       .   .    .  .  TG       ACT     .     G    .    T    TTT    .   G           .         .  TAGCTCC                           A        . .       A   .   A         GA    A   .     .   C    C T   AA             .   . C     C      TGAAGGCATACTGTGG                        G . G        .     G  . GGT          .  . . .     .   ACG     TG      .  T  .     .     C  . .    G   .  .              . .    . . . GATG                  .   .   C  A          .   .         GTGGTCATCCCTATAATTCCA                                     . C      .   T   .      A  .    GACAGT        C      C   A   AG   T G  .      .    .  .       A   . TCT    .      A    . G C   .  .      . . .     .           .    C    .  .   .       .  .   C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  A   .       . .  G  A     .       .   .    .  .  GA       CAA     .     A    .    A    ATC    .   A           .         .  TGGTTCT                           A        . .       A   .   A         AA    A   .     .   G    G A   AA             .   . C     G      GGGGCATGCAGTGTTT                        G . T        .     C  . GGT          .  . . .     .   CTT     TC      .  T  .     .     T  . .    G   .  .              . .    . . . GAGA                  .   .   G  C          .   .         ACGACAAACCACCAGGACAG                                      . G      .   T   .      A  .    CTAGGA        A      G   A   AG   T G  .      .    .  .       T   . TAT    .      G    . T A   .  .      . . .     .           .    C    .  .   .       .  .   C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  A   .       . .  C  A     .       .   .    .  .  GA       GAT     .     A    .    C    AAA    .   A           .         .  TGGTTCT                           A        . .       A   .   A         CA    A   .     .   T    G A   TC             .   . T     G      ACATTATAACAGATAC                        T . G        .     C  . GGA          .  . . .     .   TCT     TA      .  T  .     .     C  . .    C   .  .              . .    . . . GTCA                  .   .   G  A          .   .         ACGACAAACCACCAGGTGGG                                      . G      .   T   .      T  .    GCACAT        A      G   A   AG   T T  .      .    .  .       A   . CGC    .      G    . C A   .  .      . . .     .           .    C    .  .   .       .  .   C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                     .  T   .       . .  T  A     .       .   .    .  .  AT       GAT     .     A    .    T    ATA    .   G           .         .  AGGGAC                            A        . .       G   .   C         CA    A   .     .   T    G A   AA             .   . A     G      GGAATACCCACCGTAT                        T . G        .     A  . GGA          .  . . .     .   TCT     TT      .  A  .     .     T  . .    A   .  .              . .    . . . GTCA                  .   .   G  C          .   .         ACGGGAAACCAGCCAGGAGA                                      . G      .   C   .      T  .    AGACAT        C      G   A   AA   T A  .      .    .  .       T   . GAT    .      C    . G C   .  .      . . .     .           .    C    .  .   .       .  .   C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        T   .       . .  .  T     .       .   .    .  .  AT       AAA     .     A    .    C    ATC    .   G           .         .  AGGGGC                            A        . .       A   .   T         CA    A   .     .   A    C A   AA             .   . A     C      TAGATATTTCAGATAC                        T . G        .     G  . CAG          .  . . .     .   TTT     TC      .  T  .     .     A  . .    A   .  .              . .    . . . GTTA                  .   .   T  C          .   .         ACGGTACACCAGGCAGGAGG                                      . C      .   T   .      G  .    AGACAT        C      T   A   AG   C G  .      .    .  .       A   . TAC    .      C    . A C   .  .      . . .     .           .    C    .  .   .       .  .   C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                        C   .       . .  .  T     .       .   .    .  .  AA       GAT     .     A    .    C    CG     .   G           .         .  AGGGAC                            A        . .       A   .   A         GA    A   .     .   G    A T   AA             .   . A     G      GAAGTACCGCTGTAT                         T . T        .     G  . GGA          .  . . .     .   T       TG      .  A  .     .     A  . .    A   .  .              . .    . . . GGAT                  .   .   C  A          .   .         ACGGTACATCAGCGAGGAGG                                      . G      .   A   .      G  .    ACAGGA        C      T   A   AG   T T  .      .    .  .       A   . TAT    .      A    . A T   .  .      . . .     .           .    G    .  .   .       .  .   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .   .    .  .  CT       GT      .     G    .    C    TC     .   G           .         .  AGGGAC                            A        . .       A   .   A         A     .   .     .   T    G A   TC             .   . C     .      AATGGCTCAAATTT                          G . T        .     G  . GGA          .  . . .     .   T       TC      .  T  .     .     G  . .    A   .  .              . .    . . . TGAT                  .   .   T  A          .   .         CTGGTCATCCCTCTAATACG                                      . G      .   T   .      T  .    GCCGGC        T      A   A   AG   T T  .      .    .  .       T   . CGT    .      C    . A A   .  .      . . .     .           .    C    .  .   .       .  .   T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                          .   .    .  .  T        A       .     T    .    T    TC     .   G           .         .  AGGGAA                            A        . .       G   .   A         G     .   .     .   .    C T   TT             .   . T     .      TCCATTCTTT                              . . T        .     G  . CTA          .  . . .     .   C       CA      .  C  .     .     A  . .    A   .  .              . .    . . . GACG                  .   .   T  A          .   .         CTGGACATACTCCTACTCCA                                      . G      .   T   .      A  .    TACGGC        G      C   A   AG   T A  .      .    .  .       T   . CGT    .      C    . A A   .  .      . . .     .           .    A    .  .   .       .  .   .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                               G      .   G           .         .  ATGGAG                            .        . .       .   .   C         .     .   .     .   .    G A   .              .   . .     .      TCTGCTG                                 . . T        .     C  . CAT          .  . . .     .   T       TG      .  T  .     .     A  . .    A   .  .              . .    . . . GCC                   .   .   C  C          .   .         CTGGTCATCCATCTAAGGAG                                      . C      .   T   .      A  .    TGTGGT        C      C   A   T    . A  .      .    .  .       T   . ATC    .      C    . A A   .  .      . . .     .           .    A    .  .   .       .  .    
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                          .           .                                                                                                                                                                                                         .     A  . CTG          .  . . .     .   T       G       .  .  .     .     A  . .    A   .  .              . .    . . . TAT                   .   .   G  A          .   .         ACGCCAAGCCACCAGGGGG                                       . A      .   T   .      C  .    AGTGGT        T      G   A   T    . A  .      .    .  .       T   . TAT    .      C    . G C   .  .      . . .     .           .    A    .  .   .       .  .    
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Reference ( family-661 )      :                                                                                                                                                                    GGGA-CTN--T-GCTGTAC-C-AGATCNGGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGNN---TACT-ANT---G---ATA--G-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------GA--C---ACAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCGAA-CC-N----A------TC--TA-TC-AAGGA-----GG---G-----GA----AT-GCC---C-C----G--TAC-T-T-G--TG-ACNGAG-AACAACAA-C--G----G-NGACA-T-C---GTG-G-----C---T-T--GA-TG-TTA--AT-G---CTG-----A-AAC--AGTGGTG-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CNGGA---A--AANTCA--GATTCAGA-TAC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--N-------C-----C------AG---G-G-G--GA-A-G---GA---A-TC----ATTCGAT--CC-A---NGACGG--AT---C-GC-GACAGAC-AGCCATG-GG--TCACA--TCC-TT---GCGGCA-GA-TNNT--AA---CAATGACTG-TNTNCAC-AT---CCTA-G-A--CCAG-AACGGACAGTT----CNTTAA-AT---G---TGTGG--A-CAACTGTG
gi|25632                      :                                                                                                                                                                    GGGA-CTT--T-GCTGCAC-C-AGATCAGGGGA-TATCCTG-ATC--AGT--T-T--T---TACT-ATT---G---ATA--A-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----ATTGTTC------GTTA-TC--A----------GG------GA--C---AGAA----A--GT-G---ATACAAGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCAAA-CC-C----A------TT--TA-TC-AAGGA----------G-----GA----ATGGCT---C-A----A--TAT-T-T-G--TG-AC--AG-AACAACAA-T--G----G-TGACA-T-C---GTG-G-----CA--C-G--GA-TT-TTA--AT-G---CTA-----A-AAC--AGTGGTA-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CAGGA---G--ATGTC---GATTCCGA-TAC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--A-------C-----C------AG---G-G-G--AC-A-G---AA---A-AC----ATTCGAT--CC-A---GGACAG--AT---A-GT-GACCGAC--TCAATG-GG--TCGTA--T-C-TT---GTGGCA-GA-TTTT--AA---CAATGACTG-TCTACAC-AT---TCTA-G-A--TCAG--ATGGACA-TT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-CAAATGTG
gi|25633                      :                                                                                                                                                                    GGGA-CTT--T--CTGCAC-C-AGATCAGGGGA-TATCCTG-ATC--AGT--T-T--T---TAC--ATT---G---ATA--A-A---AG-T-CA-TC-G-C-AAA-----ATTGTTC------GT-A-TC--A----------GG------GA--C---AGAA----A--GT-G---ATACAAGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCAAA-CC-C----A------TT--TA-TC-AAGGA-----GG----------A----AT-GGC---T-C----A--AAT-T-T-G--TG-ACAGAG-AACAACAA-T--G----G-TGACA-T-C---GTG-C-----A---C-G--GA-TT-TTA--AT-G---CTA-----A-AAC--AGTGGTA-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CAGGA---G--ATGTCA--GATTCCGA-TAC---------AAC--G--A--CAAAC-----C--A-------C-----C------AG---G-ACA--GA-A------A---A-AC----ATTCGAT--CC-A---GGACAG--AT---A-GT-GACCGAC--TCAATG-GG--TCGTA--TCA-TT---GTGGCA-GA-TTTT--AA---CAATGACTG-TCTACACAAT---TCTA-G-A--TCAG--ATGGACAATT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-CAAATGTG
gi|25634                      :                                                                                                                                                                    GGGA-CTT--T-GCCTCAC-C-AGGTCAGGGGA-TATCTTG-GTC--AGT--A-TGTT---TACT-ATC---G---ATA--G-A---AG-T-CG-TT-A-C-AAA-----ATTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------GG--C---AGAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GATAAA---GA-TG-----A-ACAC-GGCAAA-CC-C----A------TC--TA-TC-AAGGA-----GG---G-----AA----AT-ACT---T-T----T--TAT-T-T-G--TG-GCAGAG-AACAACAA-T--G----G-TGACA-T-C---GTG-G-----C---T-TCGGA-TG-TTA--AT-G---CTA-----A-AAC--AGTGGTA-GT-------------GG-T--GAA-C-A-G-----------GA----CTGGA---A--AGGTCA--GATTCCGA-TAT---------AAC--G--A--CAAAC-----C--A-------C-----C------AG---GTG-G--GA-G-G---GA---A-TC----ATTCCAC--CC-A---GAACAG--AT---A-GT-GACCGAC--TCAATG-GG--TCATA--TCA-TT---GTGGCA-GA-TATT--GC---CAATGACTG-TCTACAC-AT---TCTA-G-A--CCAG-AATGGACAATT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-AAAATGTG
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gi|25636                      :                                                                                                                                                                    GGGA-CTG--T-GCTGTAC-C-AGATTCAGGGA-CATCCTG-GTC--AGT--A-TGCA---TACT-ACT---G---ATG--G-A---AG-T-CT-TC-A-C-AAA-----ATTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------GA--C---AGAG----A--GT-G---ACACAGGAA--AT--A---GAT-AA---GA-TG-----A-ACTT-GGCAAT-CC-A----A------TC--TA-TC-GTGAG-----GGTTTG-----G------T-GTC---T-A----G--TGT-A-T-G--TA-ACAGAG-AACACCAA-T--G----G-TGACA-T-C---GGG-GC----C---T-T--GA-TA-TTA--AT-G---CTT-----AGAGC--AGTGGTA-GT-------------GG-T--GGA-C-A-G-----------GA----CGGGA---A--AAGTCC--GATTCCGA-TAC---------AAC--G--C--CAAGC-----C--A-------C-----C------AG---G-G-G--GACA-G---AA---A-CC----ATTCAGT--CCAA---AGACAG--AT---A-GTGGAC-GAC--TCCATG-GG--TC-TA--TCA-TT---GTGGCA-GA-TCCT--GA---CAATGCCTG-TCTACAC-AT---TCTA-G-A--TCAG-AATGGACAATT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-CAATTGTG
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gi|25640                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -ACTGAG-AACAGGAA-C--C----A-GGATA-T-CTGTGTG-A-----C---T----GACTG-GGG--A--G---CTA-----A-TGC--AGTAGTG-GT-------------GG-T--CAATC-A-G-----------G-----CCGGG---A--AACTGA--GATTCAGG-TAC---------A-CTGG--A--CATACTCCTAC--T-------C-----C------AA---A-G-----A-A-C---CA---A-TC----ATTCAAT--CC-A---CTAGGA--AT---C-AC-CACAGAC-AGTCA-G-TG--TCACA--TCC-TT---ACAGCT-GA-TTAT--TA---CAATAACTG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCGG-GACGGACAaaccattcagtttgatgatcagggtcgtcctctctattcatctggacattataacagatacatcactgagaacaggaaccaggatatctgtgtgactgactggggagctaatgcagtagtggtggtcaatcaggccgggaaactgagattcaggtacactggacatactcctactccaaagaaccaatcattcaatccactaggaatcaccacagacagtcagtgtcacatccttacagctgattattacaataactgtgtccacatcatagaccgggacggaca
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gi|25642                      :                                                                                                                                                                       A-CTA--TTGC-GTAC-T-AG-TCAGGGGA-CATCCTG-GTCG-AGT--A-TGACG--TACT-CAA---G---ATA--A-A---AG-------C-G-C-AAACATAAATTGTCC------GTTA-TC--A----------GG------AAA-C---ACC-----A--GT-G---A-ACAAGA----T--A---CATGG----GA-TG-----A-G-AT-GGAGAA-CC-A----A------TC--TT-GA-AAGGA-----GG---G-----AA----GT-ACCG--C-T----G--TA----T-G--TG-GTGGAG-AACAA-AA-T--G----G-AGACA-T-CT--GTG-G-----CCTCT-T--GA--G-TTA--AT-G---CTG-----A-TAC--CATGGTT-GT-------------CG-T--GAA-C-A-A-----------GT----CAGGA---AG-AAGTC---CATTCAGA-TAC---------GAC--G--G--TACAT-----CA-G-------C-----G------AG---G-A-G--GA-A-G---AG---A-TC----TTTTTAT--CC-T---AGACAT--AT---A-GT-GACAGAC-TTCCATGAGA--TCAGA--TCA-TT---GTGGCA-GA-TTCCAAAA---CAATGACTGCCTTACAC-AT---CCTG-G-A--TCA--AACGGGCAGTT----CCTGAG-AT---GT--TGTGG--A-CAA-TGTG
gi|25643                      :                                                                                                                                                                       A-CTT--T-GCT--AC-T-AG-TCAGGGGAACATCCTGAGTCTTAGT--A-TGCCATCTACC-A-----G---ATA--A-A---AG-GGCA-AT-A-C-TAA-----AATGTCCCTCTACGTTA-TC--ATATATGTGCTGA------AA--C---ACAGTTTTG--AT-A---AAACAGAAG--AT--A---CATG-----GA-TG-----AGATA--GGAGAA-CC-A----A------TC--TT-AA-AAGGA-----GG---G-----AAGGAGAT-ACT---CGCTGTAG--TGT-T-C-G--TG----GAG-AACAACAA-T--GAGGAG-CAATA-C-T---GTG-ACGCCTC---T-T--GA--G-TTA--AT-G---CTG-----G-ACCGGAGTCATC-GCAACTGTTCTAAAAGG-TCGGAA-C-A-GTGTCAGAAAAAGA----ATGGA---AGTAAGCC---GATTCAGATTAC---------GAC--G--AGGCTTAC-----A--T-------C-----C------AG---G-C-GAAGG-A-G---GAAAGA-TC-----TTTTAT--CC-T---AGACAT--AT---C-AT-GAC-GAC--TCCATGAGA--TCAGAACTCA-TT---GTGGCACGATTCGC--AAAGCCAATGACTG-CCTACAC-ATCTCCTTG-G-ATTTCA--AACGGGCAGTT----C-TGAG-AT---GT--TGTGG--A-CAA-TGTG
gi|25644                      :                                                                                                                                                                          TT--T-GTTGTAC-C-TCCTCTGGAGA-TCTCCTG-GTT--AACCCA-TGAT---CAGT-GAT---G---ACA--G-A---AA-T-CAATC---C-AAA-----GTTGTCC------GTT
gi|25644                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAG-AACAGAAA-C--C----T-AAATA-T-CTGTGTG-G-----C---T----GA-CA-GTA--TA-G---CTA-----G-AGC--AGTAGTG-GT-------------GG-T--TAATC-A-G-----------G-----CTGGG---A--AATTAA--GATTCAGA-TAC---------A-CTGG--A--CATAC-----C--C-------CTTTTCC------AA---A-A-----A-A-C---AA---A-CC----ATTCGTT--CC-A---ACAGGA--AT---C-AC-TACAGAC-AGTCA-G-AG--TCACA--TCC-TT---TCATCT-GA-TGAT--AA---CAATCAATG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCAA-GACGGACAGTT----CCTTtctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtgagaacagaaacctaaatatctgtgtggctgacagtatagctagagcagtagtggtggttaatcaggctgggaaattaagattcagatacactggacataccccttttccaaaaaacaaaccattcgttccaacaggaatcactacagacagtcagagtcacatcctttcatctgatgataacaatcaatgtgtccacatcatagaccaagacggacagttcctt
gi|25645                      :    tttgttgtacctcctctggagatctcctggttaacccatgatcagtgatgacagaaatcaatccaaagttgtccgtttctctggttcaaaagcgactcaaaccattcagtttgatgaccagactcgtcctctctattcatctgattatagcgataaatacatcagtTC--T-GCAGTAC-C-GCTTCTGATGA-TCTCCTG-GTT--ACC--A-TGAT---CAGT-GAT---G---ATA--GGA---AA-C-CA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTACTCT-A----------GC------TC--C---ACAG----A-----G---ACACA
gi|25645                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -G---CTA-----A-GGC--AGTAGTG-GT-------------GG-T--TAA-T-T-A-----------GT----TAGGA---A--AACTCC--AATTTAGA-TAC---------ACT--G--GT-CATCC-----C--T-------C-----T------AA---T-A-C--GA-G-G---GA---A-TT----ATTCGAT--CC-A----GCCGGC-AT---C-AC-TACAGAC-AGCCATA-G---TCACA--TCC-TA---ACAGCA-GA-CTAC--AT---GAATCACCG-TATCCAT-AT---CCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----Caaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggagctaaggcagtagtggtggttaattagttaggaaaactccaatttagatacactggtcatccctctaatacgagggaattattcgatccagccggcatcactacagacagccatagtcacatcctaacagcagactacatgaatcaccgtatccatatcctagatcaggacggacagttca
gi|25646                      : tctgcagtaccgcttctgatgatctcctggttaccatgatcagtgatgataggaaaccatccaaagttgtccgttactctagctccacagagacacaaaccattcaatttgatgatcaggatcgtcctctctattcatctgatcataactataaatatactagttagaacagaaacctatctgtgtggccgaccgtggaTCCTG-GTT--ACC--A-TGAA---CAGT-AAA---G---ATA--ACA---AG-C-AA-TC---C-AAA-----GTTGTCC------GTTA-TT-------------TT------GA--CTCCACAG----A--GA-G---ACA----AACCATTCA---GTTTAA------TG-----A-TCAA-GGTCAA-CC-T----C------TC--TA-TT-CATC------------------------T-GCT---G-G----T--TAC-----A--TC-ATTGAG-AACAAGAA-CCTG----G-ATATA-TGT---GTG-G-----C---T----GA-C----A--AT-A-----------G-AGC--AGTAGTA-GT-------------GG-T--CAATC-A-G-----------TA-----TGGA---A--AATTCC--GATTCAGA-TAC---------AGT--G--G--TCATC-----C--CTATAATTC-----C------A--------------A-G---AA---A-AC----CTTTTAT--CC-A---T-ACGGC-AT---T-AC-AGCAGAC-AGCCA----G--TCACA--TCC-TG---ACGGCA-GA-CTAT--AA---CAATAACTG-TATTCAC-AT---CCTG-G-A--TCAG-GATGGGCAGTT----Ca
gi|25647                      :                                                                                                                                                                                                      gatcCTG-GTC--ACC--A-TGCT---GTCT-GAT---GTTTATA--T-A------C-CA----G-CTAAA-----GTAGTCC------GTTA-CT--C----------TG------GA--C---CTAC----A--GT-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----A--CACAGGCAAT-CC-TTTATA------TTCTTA-TC-CAG-----------------------------C---C-T----A--TAT-T---------ACTGAG-AACAAGAA-C--C----A-TGACA-T-T---GTT-G-----TGA-T-T--GA-GT-TTA--GA-A---CAG-----A-CAC--AGTAGAG-GT-------------GG-T--GGA-T-A-A-----------GG----ATGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--G--G--CAA-T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA---A-TC----ATTTAAT--CC-A---CG-TGGT-GT---G-AC-CACAGAC-AGC-ATG-TG--TCACA--TCC-TG---ATCGCT-GA-CCGT--GG---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAT-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-AAACTGT
gi|25648                      :                                                                                                                                                                                                                                                             -T-CA-CCAG-CTAAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------TT--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AACACA---G--TG-----ATACA--GGCGAA-CC-T----T------TA--TACTT-AAG-----------------------------T---C-C----A--TTC-T-TTA--TT-ACTGAG-AACAAGAA-C--C----A-TGATA-T-T---GT--------------------TG-TAA--GT-GACTCTGCTACAACAAC--AGTAATG-GT-------------GG-T--GAA-C-A-AT----------GA-----TGGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--G--G---AAAT-----C--T-------C-----C------AA---T-C-A---A-A-G---AA---A-TC----ATTTAAT--CC-A---TG-TGGT-GT---G-AC-CACAGAC-AG-CACG-TG--TCACA--TCC-TG---ATTGCT-GA-CCGT--GG---TCACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAA-AACGGACAGTT----CCTTCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGTG
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gi|25650                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         -AAA-----GTAGTCC------GTTACTC--T----------GG------TT--CT--ACAG--------T-C---ACACAAGAA--AT--AC--AATACA---G--TG-----ATACA--GGCAAA-CC-------------TT--TA-T-----------------------------AT-TCTTATC-C----A--GAC-T-TTA--TT-ACTGAG-AACAAGAA-C--C----T-TGACA-T-T---GTT-G-----------T--GA--G-T-G--AT-T---CTG-----A-TAC--AGTAGAG-GT-------------GG-T--GGA-C-AAG-----------GA----C-GGC---A--AGTTCA--GGTTCAGC-TAT---------AAT--GG-A--CA--T-----C--T-------C-----C------AA---T-T-A---A-A-G---GA---A-TC----ATTTAGT--CC-G---AG-TGGT-GT---G-AC-CACAGAC-AGC-ATG-TG--TCACA--TCC-TG---ATCGCT-GA-CATC--AA---TAACCACGT-TATACAT-AT---CATT-G-A--TCAG-AACGGACAGTT----CCTCCA-GT---A---CATAG--A-CAACTGT
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gi|25652                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C--AGTTGTG-GT-------------GG-T--CAA-TAA-G-----------GA----CGGG----A--AACTGA--GATTCAGG-TAC----------ACTGG--A--CATACTCCTAC--T-------C-----C-------------------A-A-A---GA---A-TCAAATATTCTCT--CC-A---CGAGGA--AT---C-AC-CACAGAC-AATCA-G-AG--TCACA--TCC-TT---ACAGCT-GA-TTAT--AA---CAATCACTG-TATCCAC-TT---CATA-G-A--CCAG-GACGGACAGTTCCTCCGTTAC-ATAGAA---TGTGG--A-C
gi|25653                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcttatagcagatttattactgaaaacaggaatctggatatatgtgtgactgactggagagataacgGAA-AACAGAAA-C--T----T-GGATA-T-CTGTGTG-G-----C---T----GACTG-TGG--A--G---CTA-----A-AGC--AGTAGTG-GT-------------GG-T--CAATC-A-G-----------G-----CCGGA---G--AACTGA--GATTCAGA-TAC---------ACT--G---------------C--T-------C-----C------AA---T-G-G--AA-------GA---A-CC----ATTCAAC--CC-A---CAAGGA--AT---C-AC-CACAGAC-AGTCA-G-AG--TCGCA--TTC-TT---ATAACT-GA-TGAT--TA---CAAGCACTG-TGTCCAC-AT---TTTA-G-A--CGAG-AACGGACAGTT----C
gi|25654                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acatctgtGAG-AACAAAAA-CCTG----G-ATATA-TGT---GTG-G-----C---T----GACTG-GGG--A--G---CTG-----G-TGC--AGTAGTG-GT-------------GG-T--CAA-C-C-A-----------GG----CTGGA---A--AACTAC--GATTTAGA-TAC---------ACT--G--GT-CATTC-----T--T-------C-----T------AC---T-A-A--CA-A-ACTCGA---A-CC----ATTCAAA--CC-C---TGGGGA--AT---C-AC-AACAGAC-AGTCA-G-AG--TCAGA--TCC-TG---ACAGCA-GA-CAGT--GA---TAATCACTG-TATCCAC-AT---CCTG-G-A--CCAG-AATGGACAGTT----CCTCCG-CT---A---TATAG--A-GAACTGTG
gi|25655                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aC--AGTAGTG-GT-------------GG-T--CAATC-A-G-----------G-----CCGGG---A--AGCTGA--GATTCAGG-TAC---------A-CTGG--A--CATACTCCTGC--T-------C-----C------AA---A-G-----A-A-C---AA---A-CC----ATTCAAT--CC-A---CGAGGA--AT---C-AC-CACAGAC-AGTCA-G-AA--TCACA--TCC-TT---ACAGCT-GA-TGTT--AA---CAATGACTG-TGTGCAC-AT---CATA-G-A--CCAG-GACGGACAGTTCCTCCATTAC-AT---AGACTGTGG--A-C
gi|25656                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gctagcg--GATTTAGA-TAC---------ACT--G--G--TCATC-----C--A-------T-----CT-----AA---G-G-A--GA-A-A---GG---A-TC----ATTTGAT--CC-A----GTTGGC-AT---T-GC-AACAGAC-AGTCA-G-AG--TCACA--TCC-TG---ACAGCA-GA-CTGC--AA---CAAACATCG-TATCCAC-AT---TCTA-G-A--TCAG-GACGGACAGTT----CCTTCG-TT---A---CATTG--A-TAACTGTG
gi|25657                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---------AAC--G--A--CAAAC-----C--A-------C-----C------GG---G-G-A--GA-C-G---GCT--A-CC----ATGCAGT--CC-T---ACACAG--AT---A-GT-GACCGAC--TCCATG-GG--TCACA--TCA-TA---GTGGGA-GA-TGGA--TT---CAATGACTG-CATTCAT-AT---TCTA-G-A--TCAG-AATGGACAACT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-CAATTGTG
gi|25658                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 C----ATTTGGT--CC-A---CAAGGA--AT---C-AC-CACAGAC-AGTCA-G-AG--TCACA--TCC-TT---ACAGCT-GA-TTAT--AA---CAATGACTG-TGTCCAC-AT---CATA-G-A--CCAG-GACGGACAGTTCCTCCGTTAC-AT---AGACTGTGG--A-C
gi|25659                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCAAG-GG--TCATA--TCA-TA---GTGGGA-GA-CC----AATT-CAATGCCTG-TCTTCAT-AT---TCTA-G-A--CCAG-AATGGACGATT----CATTAA-AT---G---TGTGG--A-CAATTGTG