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Reference ( gi|109882 ) : CCTG-C--CC---T---AA---GCTG-CGGCCCT--------CTGCCTTTAA-GA-AGG-TATC-ATGT--AT-GCCCT------TG---AAACT--A-T-TTTGAA-----AAA----AGATTTT--AAAAA--T-GCAT-TGTTT-----ACGATC--------CCT------T--A---A--CC-----AT----TGCCTAGAGCCAAGGTTGT-G-T-CCAAT-TA-T-CC--A-A--T-T-GGG-ATC-------TCTTT-------------AA-TCT-----G---TGTA--T-----AGTC-A-GCGTGGA--------T-AGGT-G--------ATAA-T-T---A----G-C---T-A-TT-A-TT-GACACC-TC---GGGGCTTT--C--TATA---A-T---CA-CTGGC-TC-----C-TGGCG-AAATG-TCAC-CGCT----AA-T-CGC---C-GA----C-TCGAATT--T--C-CTC-TA--CC-GT-AAATA---A-T-A-TG-G-TTGT-CAA-TC-ATG---A---TA-----T--AGCAA--TAT--T-T-CAAGA--T-CTGT-TTTTAA-T-A-AAAT-AACAT-G-T-T-AT--TTA-TT-CAG---TT-A--A-T--AAA-G--TA-T---TG-T-GC-TA--TTCT--GG-G-TTGT----ATGCA-GG-T---TTTG------TTTA--AT---GTTTTTT
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gi|109898 : CTG-C--CT------TTA-G--CTGC--ACC--CCT--------CTGCCTACAA-GA-AGG-AATC-ATGT--AT-GCCCT------TGT--ACATT----T-TTTGAAAAAGATGAGA-----TTTA--AAAAAA-T-GTTT-T-GTTTACAATT---GGT-----AGT-CC--A-------TGA--AT-TGCCTAGAG-----GTTGT-G-T-CCAAT-TA-T-CC--A-A--T-T-GGG-ATA-------TC-TTT-------------AA-TCTG-C---A-T------G--TAG-T-CA-GGATGGA-GAG--------GT-G---A--------T-AAT-T---G----G-C---C-A-TT-A-TT-GACACC-TCA-G---GG-C-TTT--C-A-AT-A---AGC-A-G----------AGG-----CA-CC-TGATG-AAAT----GC-TGCT----AA-TCG-----C---CAA---------C-TCGAAT--T-T--C--CTC-T-ACT-GT-CA---AT----AA-CA-T-G-A-TTG-T-AT-TC-AT-G-C---TATCTATT--AACAA--TAT--T-T-CGAGA--T-CTG--TTTTAA-T-C-A-AAT-AACAT-G-T-TA--T-TTA-TTCAG---TT-A--A-T--AAA-A--TA-----TG-TGC-TA--TTCT--GG-G-TTAT----ATGCA-GGTTTT--TGTTTA--CTTA--ATT--TTTT
gi|109899 : TG-C--CT------TTA-G--CTGC--GCC--CCTTGATCTAGCTGCCTTTAA-GATTGG-AATC-ATGC--AT-GCC
gi|109900 : C-ATGT--AT-GCCCT------TG---AACCT--A-T-TTTGA----------ATTTTTTTTT--TTAAA--T-GCTT-T-GTTTACGATC---------------CC--T-------TAA--AT-TGGCTAGAG--
gi|109900 : -TCG-----C---CGA---------C-TCGAAT--T-T--C--CTC-T-ACC-GT-AA---AT----GA-TA-T-G-G-TTG-TCAA-TC-AT-G-C---TA-----T--AACAA--TAgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctctgtaaacaatgcctactttgtaagaatgctaactgtggtaagacaggttcagatttttgcagagttggaggttcactataaccgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgccgactcgaatttcctctaccgtaaatgatatggttgtcaatcatgctataacaata
gi|109901 : catgtatgcccttgaacctattttgaatttttttttttaaatgctttgtttacgatcccttaaattggctagaggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctctgtaaacaatgcctactttgtaagaatgctaactgtggtaagacaggttcagatttttgcagagttggaggttcactataaccgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTTT--AAAAAACT-GTTTCT-GTTT-CAATC---GGTTAGG-G---CC--TCAATCCATGA--AT-TGCCTAGAC----GTTTGT-G-TTCCAAT-TA-T-C---A-A--T-TAGGG-ATA-------TC-TTT-------------AA-TCTG-C---ACT------G--TAT-TTCA-GAGTGGA-GAG--------CG-G---A--------T-ATT-A---A----G-C---C-AGTT-A-TT-GACACCGTCA-G---GG-C-TTC--A-A-GT-A---AGCCA-C----------AAG-----CA-CCCTGACG-AAATG-TCAC-CGCT----AA-TCG-----C---GCA---------C-TCGAAT--TGT--C--CTC-T-ACC-G--AA---AT----AA-CA-T-GAG-TGG-TCAA-TC-AT-G-CGTTTC-----T--AACAACTTAT--TCT-CAAGA--T-CTG---TTTAATT-C-A-AAT-AACAT-GTT-TA--T-TTATTTCAG---TT-A--A-T--AAATA--TA-C---TGTTGC-TA--TTCT--AG-GCTTGT----TTGCAGGG-TTT--TGTTTA--TT----TTT--TTTT
gi|109902 : -------TGA--AT-TG-----AG--A-GGTGAT-G-T-CCAAT-TAAT-CC--ACA--TGT-AGG-ATA-------TC-TTT-------------AA-TCAG-C-----T------G--TCG-T-AA-G-GTGGA-GAG--------AT-ATGAA--------T-AAT-T---A----GGC---T-A-TT-AATTAGACAC--TCA-G---CG-A-TTTATCGA-AC-T---AGC-A-T----------TGG-----CA-CC-TGA-G-AAAT--TCGC-CGCT----AA-TCG-----C---CAA---------C-TCGAA---T-T--C--CTC-T-ACCAGT-AA---AA----AA-GA-T-----CTG-TCAA-TC-AT-G-C---TATC---T--AACAAG-TGT--T-TCCAAGA--T-ATAT-TATTAA-T-CAA-AAT-AACAT-G-T-AA--TGTTA-TTCAG---TT-A--A-T--AAA-A---A-TGCCTG-TGA-CA--TTCTTCGGTG-TTAC-----TGCA-GG--TT--TATTTA--TTTTA-ATT--TTTT
gi|109903 : -G-T-CCAAT-TA-T-CC--A-A--T-T-AGG-ATCAATTAAATC-TTT-------------AA-TCTC-CCAAG-TTATTTAG--TGG-T-CA-GCATGGA-TAG--------GT-G---A--------T-AAT-T---AATTGG-C---T-A-TG-A-TT-GACAAT-GCAGG---GG-C---C--C-A-AT-A---GGC-A-C----------CAG-----TA-
gi|109904 : CA-G---AG-T-TTT--C-A-GT-A---AGC-A-C----------TTG-----CA-CC-AACCA-GAATG-TTGT-TGC------A-TTGAAATTC---TGAAATTCTGGGC-TAGAAT--T-T--T--CAC-T-AAA-GT-GATGCAC----AA-TT-T-T-A-CTG-TCAA-TC-AC-A-C---TA-----T--AACAA--T
gi|109905 : tattatgaagtaCA-G---AGAC-TTT--C-A-AT-A---AGC-A-CGTTAAAACACTGG-----CA-CCGTGACG-AAATGATCGC-CGCTTTATAA-T-G-----CGGGCAAAACG-----C-TTGAAT--T-TTTC--CTC-T--CC-GTCAA---AT----AAACA-T-G-AATCG-TCAACTC-GT-G-C---TA-----TCTAACAA--TAA--T-T-AAAGAGAT-CTG--TTTTAA-T-C-A-AATAAACGT-G-T-TA--T-TTATTTCAGAGATT-A--A----AAA-
gi|109906 : CA-G---GG-T-TTT--C-A-AT-A---AGC-A-C----------CGGCACGCCA-CC-CGGTG-AAATG-TCGC-CG
gi|109907 : G-TCAC-CGCT----AA-TCG-----C---TGA---------C-TCGAAT--T-T--C--CTC-T-ACC-GT-AA---AT----AA-TA-T-G-G-TTG-TCAA-TC-AT-G-C---TA-----T--AACAA--TAT--T-T-CAAGA--T-CTGT-ATTTAA-T-C-A-AAT-AACAT-G-T-TA--T-TTA-TTCAG---TT-AATA-T--AAA-G--TA-T---TG-TGC-TT--TTTT--GG-A-TTGT----ATGTC-GG-TTT--TGTTTA--TT----GTT--TT
blockSeqs : G TG AAGTAA T AA TC AC TGATCTAG A T A C GA C AAGCCT TACAAATTAA C GATGAGAT TTA AC A CG C A GGTTAGTAA TCAATCCA CC G GTAA G A T C A G TT C CC G A T CAATCAAC T GCAGAACTACAGA T CCAAG TATTTAG A C A C G TGACATAG T TGA CATGGTGA A G TTA ATTG G ACT C T TG A A CGT G AGT A T TG G T A CCC C T GTTAAAACAC CACGC G C A T A TTAT T AAATT GGG AATTCTGGG A TC G TC AT T A A TC TGC GCTC AC C A AG T C A A T GTT TCTAT CT CT TA C C GA A TG T C A C A C T A TG G T AGA G AT C TA T AT TGCC T T AT TC T C TGGCA G T TG TT TTAA CA
blockSeqs : . . . A . . . . T . . . . . . TACATTTCA . ATTTTTT T A . CA . . GGTTTAGT TAT . . CCAA . . . . . . C . . G . . CAATTAAA . . . CGA GAC . T . C . . G . . . . . . . CT . G G . . CGT . . . . AT . . . . . . . . . G G A . G . C . AACG A . . TT G . . . T . . T . . AA . . . . . . GTC . T . . . . . T . . . C A . . C . . T . . G . . . . CT T . . . . . A . . . T TTA .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TACATTT . AGAT A . . CA . . GGTTAGGG CGA . . GTAA . . . . . . . . . . . . C . . . ACA GT . . . T . . T . . . . . . . . . . T . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . T . . G . . . . . . TCC . G . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . T T . . . . . A . . . . TTA .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TACATTT . AGAT A . . CC . . GGTAGTT T . . GTAA . . . . . . . . . . . . C . . . CAC A . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . G . . . . . . CTC . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . . TA .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . ATCCTA . AGAT T . . CC . . GGTAGT T . . GTAA . . . . . . . . . . . . C . . . TG A . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . G . . . . . . TC . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . . TA .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AAACTA . GCAT T . . TT . . GGTAGT T . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . TG A . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . G . . . . . . TC . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AACCTA . GAT A . . TT . . TCTAGT T . . A . . . . . . . . . . . . A . . . TG A . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . G . . . . . . TC . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AAACTA . GAT T . . TT . . GGTAGT A . . A . . . . . . . . . . . . A . . . TG A . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AAACTA . GAT T . . TT . . GGTAG A . . A . . . . . . . . . . . . A . . . TG G . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TACATT . AGA T . . TT . . AGTAG A . . A . . . . . . . . . . . . C . . . CA G . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . GACCCA . AGA T . . CT . . . A . . A . . . . . . . . . . . . G . . . TG A . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TACGTT . AGA A . . GT . . . A . . A . . . . . . . . . . . . A . . . CA G . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TACATT . GAT T . . TT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . CA A . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AACCTA . GAT T . . CT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . TG G . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CACCT . AT . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . C . . . CA G . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TAATT . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . TG G . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TACA . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . CA G . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : T** A***
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gi|109900 : -TCG-----C---CGA---------C-TCGAAT--T-T--C--CTC-T-ACC-GT-AA---AT----GA-TA-T-G-G-TTG-TCAA-TC-AT-G-C---TA-----T--AACAA--TAgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctctgtaaacaatgcctactttgtaagaatgctaactgtggtaagacaggttcagatttttgcagagttggaggttcactataaccgtgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgccgactcgaatttcctctaccgtaaatgatatggttgtcaatcatgctataacaata
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