lowQualScore : 3 1 111111111111111111111111 1111
lowQualScore : 5 1 1 1 666 222 2 1 1 3 3333 22 1 7 22 6 444444444444444444444444 1 5555 6666 5555 22 33333 444444 5 1 1 1 4 33 1 666666 4444 1 1 666 1
lowQualScore : . . . . ... ... . . . . .... .. . . .. . ........................ . .... .... .... .. ..... ...... . . . . . .. . ...... .... . . ... .
lowQualScore : 9 7 6 6 000 888 9 5 5 1 3333 11 5 7 00 3 333333333333333333333333 5 2222 3333 7777 00 77777 333333 1 5 5 5 6 77 2 000000 8888 7 7 222 7
consensus : AAT-TGCAAA-G-AAAA-TT--NTAA---ATCAAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGCACA-TTT--GCGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCATGAC--ACGA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
Reference ( gi|47693 ) : AATATGCAAA-G-AAAA-TT--ATAA---ATGAAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGCACA-TCT--GCGTAGTAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--AT-----A------TAGTGCTT-TTAGTCA-T-TCATAAC--ACGA------TGCGG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47698 : AAT-TGCAAA-G-AAAA-TT--CTAA---ATACAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGCACA-TTT--GAGTAACAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCATGAC--ACAA------TACAG--TA-TTT-A---AAAAC-AAACAAT
gi|47691 : AAT-TACAAA-G-AAAA-TT--ATAA---ATCAAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGAAAA-TTT--ACGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TTATAC--AT-----A------TAGTACAT-TTAGTCA-T-TCATGAC--ACAA------TGCAC--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47694 : AAT-TACAAA-G-AAAA-TT--GTAA---GCCTAA-A-GTTT-ATTT----CAGT--GGCACA-TTT--GCGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--AT-----A------GAGTATTT-CTAGTCA-T-TCATGAC--ACGA------TGCAG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47692 : AAT-TGCAAA-G-AAAA-TT--CTAA---ATCTAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGCACA-TTT--GCTTAATGATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--AT-----ATACATGTAGTACTT-TTAGTCA-T-TCATGAC--ACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47701 : AATA-GCAAA-G-AAAA-TT--CAAA---ATCAAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGCACA-TTT--GCGTAATAACTAC------------------------T-T----C----G----TTACAC--TT-----A------TAGCACTT-TTAGTCA-T-TGATGAC--ACGC------TGCAA--CA-TTT-C---AAAAC-GAACAA
gi|47700 : AAT-TGCAGA-G-AAAA-TT--CTAA---ACCAAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGCACA-TTT--GTGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----ATATAC--ATATATGA------TAGTACTT-TTAATCA-T-TCATGAC--ACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-ACACAAT
gi|47699 : AAT-TACAAA-G-AAAA-TT--CTAA---ATCAAA-A-GTTT-AATT----GAGT--TGCACA-TTT--GCGTAATAATTAC------------------------T-T----T----C----TTATAC--AT-----A------CATTACTT-TTAGTCA-T-TCGCGAC--ATAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47702 : AAT-TGCAGA-G-AATA-TT--CTAA---ATCAAA-A-GTTT-ATTT----TAGT--GGTGCA-TTT--GCATAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--AT-----C------TAGTACTG-TTAGTCA-T-TCATGAC--ACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AA
gi|47704 : AAT-TGCAGA---AAGA-TG--ATAA---ATACAA-ATGTTT-ATTT----GAGT--G-CACA-TTT--GCGTAATATATAC------------------------T-T---------G----TTACAC--AT-----A------TAGTACTT----ATCA-T-TCA-AACG-ACCG------TGCAG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47703 : AAT-TGCAAA-G-AAAA-AA--TTAA---ATCAAA-A-GTTTTATTT----GAGT--GGAACA-TTT--ACGTAATAATTAT------------------------G-T----T----G----TTATA---GC-----A------TAGTATTT-TAAGTCAGT-TCATGA---ACAA------TGCAA--TATTTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47705 : AAT-TGCAAA-G-AAA--TT--ATAA---ATCAAA-A-GTTT-ATAT----GAGT--GGCACA-TTT--GCGTAATAATTACTGTGACCAGGCTACACCCCAACTAT-T----T----G----TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTA-T---T-TCAAAACAAACGA------T
gi|47706 : AAT-TGCAAA-G-AAAA-TT--ATGA---ATCAAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGAACA-TTT--AC
gi|47695 : TGCAAA-G-AAAA-TT--ATAA---ATCAAA-A-GTTT-ATTT----GAAT--GGCACA-TTT--GCGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--A------A------TAGTACTT-CTAGCTA-T-TCATGAC--AAGA------TGCAA--TA-TTT-C---AATAC-AAACGATtaat
gi|47696 : aagTGCAAA-G-AAAA-TT--CTAT---ATCAAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGCACA-TTT--GCGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--TT-----A------TAGTACTT-TTGGTCA-T-TCATGAC--ACGA------TGTAA--TA-TTT-A---AAAAC-AAACAA
gi|47711 : aacTACAAA-G-GAAA-TT--ATAA---ATCAAA-A-G-----TTT----GAGT--GGCACA-TTT--GTGTAATAATTGC------------------------C-T----TGAACG----TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCATGAC--ACAG------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47697 : tTGCAAA-G-AAAA-TT--CTAT---AT-CAA-A-GTTT-ATTT----GAGT--GGCACATTTT--GCGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--TT-----A------TAGTAC-T-TTGGTCA-T-TCATGAC--ACGA------TGT-A--TA-TTT-TA--AAAAC-AAACAA
gi|47712 : aacTGCAAA-G-AAA--TT--ATAA---ATCAAA-A-G-----TTT----GAGT--GGCACA-TTT--GCGTAATAATTGC------------------------C-TGGAAC----G----TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGGCT-T-TCATGAC--ACAG------CGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACAA
gi|47708 : tTGCAAAAG-AAAA-TT--CTAA---ATCAAATA-ATTT-TTTT----GAGT--GGCACA-TTT--GCGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAT--AT-----A------TAGTACT----------------GAC--ACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAGC-AAACGAT
gi|47713 : atTGCAAA-G-AAAA-TT--ATTA---ATCAAA-A-G-----TTT----GAGT--GGCACG-TTT--GCGTAATAATTGC------------------------C-T----TGAACG----TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCATGAC--ACAG------TGC
gi|47714 : tTGCAAA-GCAAAA-TT--ATAA---ATCAAA-A-GTTT----T----GAGTTGAGCACA-TTTTGGTTTGATAATTGC------------------------C-TGA--C----A----TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-TGTCATGAC--AAAAAAAGTTTGCAA--TA-TTT-TCCAAAAAC-AAACaa
gi|47716 : tCAAA-G-AAAA-TT--CTAA---ATAAAA-A-GTTT-ATTTTTAAGAGT--GGCACA-TTT--GCGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--AC-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCATGAC--ACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47707 : CAAA-G-AAAAGCC--ATCA----TCAAA-A-TTGC-GCTT----GAGA--TGCACA-TGT--GCGCATTA-TTGC------------------------C-T----T----G----TTACGC--TT-----A------TAGTACTTATTGGT-A-T-TCATAAC--ATAA------TGCAA--TA-TTT-A---GAAAA-AAA
gi|47710 : aatttCAAA-G-GAAA-TTC-ATAATTTGTGAAA----TTTCATTA----GAGC--GGCACA-TTT--GC---ATAATTAG------------------------TAG----T----G----TTTCAC--TT-----A------TAGCACTT-ATTGTCA-T-TC----------A------TGCAA--TA-TTT-T---AAAAC-AAACAA
gi|47709 : atttAA-G-AAAA-TT--A-AA---ATCAAA-A-GTTG-A--------AGT--G-CACA-TTT--GC-TAATAATTGC------------------------C-T----T----GAAC-TGACAA--AT-----A------TAG-----------CA----CATGAC--ACAG------TGCAAATTA-TTTTC---AAAAC-AAAC
gi|47717 : attacac-AAAA-TTTCATAA---TTGAAA---GATC-ATT-----GAGT--AGCACA-T-T--GCGTAATTATTAC------------------------T-T----T----C----TTACGC--TT-----A------TAGTGCTC-CTAGTCA-C-TCGTGAA--ACGAC-----TGTTA--TA-TTT-T---AAAAC--AACGA
gi|47718 : AA-A-GTTT-TTTT----CAGT--GGTAAA-TTT--GCGTAATAATTGC------------------------T-C----T----GATCGTTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-T
gi|47719 : T--GCGTAATAATTAC------------------------T-T----T----G----TAACACTTAT-----A------TATTGTTT-TTGGTCA-T-TCATGAC--ACGT------TGCAA--CT-CTT-C---AAAGG-GAACGA
gi|47715 : tTTAC------------------------T-T----T----G----TTACAC--CT-----A------TCGTAATT-TTAGTCA-T-TCATGGC--ACGA------TGCCA--TA-TTT-CG--AAAACTAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 444 22 1 1 22 1 1 22 3333 1 22 2 11 1 888888888888888888888888 5555 6666 222 22 33333 444444 1 1 1 22 0 555555 22 1 1 555 1
lowQualScore : . . . . ... .. . . .. . . .. .... . .. . .. . ........................ .... .... ... .. ..... ...... . . . .. . ...... .. . . ... .
lowQualScore : 6 5 5 5 111 55 5 5 00 4 4 00 0000 4 00 9 99 4 222222222222222222222222 0000 1111 555 00 66666 111111 4 4 4 00 7 777777 00 5 5 888 5
consensus : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTN-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
Reference ( family-646 ) : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTN-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47691 : AAT-TACA-AA-G-AAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGAAAA-TTT--AC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTATAC--AT-----A------TAGTACAT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAC--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47692 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-CT--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-TTAATGATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----ATACATGTAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47693 : AATATGCA-AA-G-AAAA---TTA-TA-AAT-GA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TCT--GC-GTAGTAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTGCTT-TTAGTCA-T-TCA--TAACACGA------TGCGG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47694 : AAT-TACA-AA-G-AAAA---TTG-TA-AGC-CT--AA-AGTTT-A--TTT----CAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------GAGTATTT-CTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47695 : AAG-TGCA-AA-G-AAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAA-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--A------A------TAGTACTT-CTAGCTA-T-TCA--TGACAAGA------TGCAA--TA-TTT-C---AATAC-AAACGAT
gi|47696 : AAC-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-TAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--TT-----A------TAGTACTT-TTGGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGTAA--TA-TTT-A---AAAAC-AAACAA
gi|47697 : AAC-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-TAT-C---AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACATTTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--TT-----A------TAGTAC-T-TTGGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGT-A--TA-TTT-TA--AAAAC-AAACAA
gi|47698 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-AC--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GA-GTAACAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TACAG--TA-TTT-A---AAAAC-AAACAAT
gi|47699 : AAT-TACA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--ATT----GAG-T--TGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----C---TTATAC--AT-----A------CATTACTT-TTAGTCA-T-TCG--CGACATAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47700 : AAT-TGCA-GA-G-AAAA---TTC-TA-AAC-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GT-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---ATATAC--ATATATGA------TAGTACTT-TTAATCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-ACACAAT
gi|47701 : AAT-AGCA-AA-G-AAAA---TTC-AA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAACTACT------------------------T----C----G---TTACAC--TT-----A------TAGCACTT-TTAGTCA-T-TGA--TGACACGC------TGCAA--CA-TTT-C---AAAAC-GAACAA
gi|47702 : AAT-TGCA-GA-G-AATA---TTC-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----TAG-T--GGTGCA-TTT--GC-ATAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----C------TAGTACTG-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AA
gi|47703 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---AAT-TA-AAT-CA--AA-AGTTTTA--TTT----GAG-T--GGAACA-TTT--AC-GTAATAATTATG------------------------T----T----G---TTATA---GC-----A------TAGTATTT-TAAGTCAGT-TCA--TGA-ACAA------TGCAA--TATTTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47704 : AAT-TGCA-GA---AAGA---TGA-TA-AATACA--AA-TGTTT-A--TTT----GAG-T--G-CACA-TTT--GC-GTAATATATACT------------------------T---------G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT----ATCA-T-TCAAACGAC-CG-------TGCAG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47705 : AAT-TGCA-AA-G-AAA----TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TAT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACTGTGACCAGGCTACACCCCAACTATT----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-T-----------------------------------TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47706 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTA-TG-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGAACA-TTT--AC--TAAT
gi|47707 : AAT-TTCA-AA-G-AAAAG--CCA-TC-A-T-CA--AA-ATTGC-G--CTT----GAG-A--TGCACA-TGT--GC-GCATTA-TTGCC------------------------T----T----G---TTACGC--TT-----A------TAGTACTTATTGGT-A-T-TCA--TAACATAA------TGCAA--TA-TTT-A---GAAAA-AAA
gi|47708 : AT-TGCA-AAAG-AAAA---TTC-TA-AAT-CA--AATAATTT-T--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAT--AT-----A------TAGTACT------------------GACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAGC-AAACGAT
gi|47709 : AT-TACACAA-G-AAAA---TTA--A-AAT-CA--AA-AGTTG-A----------AG-T--G-CACA-TTT--GC--TAATAATTGCC------------------------T----T----GAACTGACAA--AT-----A------TAGCAC---------------A--TGACACAG------TGCAAATTA-TTTTC---AAAAC-AAAC
gi|47710 : AT-TTCA-AA-G-GAAA---TTCATA-ATT-TGTGAA-ATTTC-A--TTA----GAG-C--GGCACA-TTT--GC----ATAATTAGTA-----------------------G----T----G---TTTCAC--TT-----A------TAGCACTT-ATTGTCA-T-TC----------A------TGCAA--TA-TTT-T---AAAAC-AAACAA
gi|47711 : T-TACA-AA-G-GAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AG-------TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GT-GTAATAATTGCC------------------------T----TGAACG---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAG------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47712 : T-TGCA-AA-G-AAA----TTA-TA-AAT-CA--AA-AG-------TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTGCC------------------------TGGAAC----G---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGGCT-T-TCA--TGACACAG------CGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACAA
gi|47713 : T-TGCA-AA-G-AAAA---TTA-TT-AAT-CA--AA-AG-------TTT----GAG-T--GGCACG-TTT--GC-GTAATAATTGCC------------------------T----TGAACG---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAG------TGCAA--
gi|47714 : T-TGCA-AA-GCAAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT------T----GAG-TTGAGCACA-TTTTGGT-TTGATAATTGCC------------------------TGA--C----A---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-TGTCA--TGACAAAAAAAGTTTGCAA--TA-TTT-TCCAAAAAC-AAAC
gi|47715 : T-TTCA-AA-G-AAAAGACTTG-CA---T-CA--CA---TTT-AAATTC----AAGCT--GGAACAATTT--GCCACAATT-TTACT------------------------T----T----G---TTACAC--CT-----A------TCGTAATT-TTAGTCA-T-TCA--TGGCACGA------TGCCA--TA-TTT-CG--AAAACTAAAC
gi|47716 : CA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-AA--AA-AGTTT-A--TTTTTAAGAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AC-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47717 : -AAAA---TTT-CATAAT-TG--AA-AGATC-A--TT-----GAG-T--AGCACA-TT---GC-GTAATTATTACT------------------------T----T----C---TTACGC--TT-----A------TAGTGCTC-CTAGTCA-C-TCG--TGAAACGAC-----TGTTA--TA-TTT-T---AAAAC--AACGA
gi|47718 : --AA-AGTTT-T--TTT----CAG-T--GGTAAA-TTT--GC-GTAATAATTGCTCTGA--------------------T----C----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-T
gi|47719 : TT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TAACACTTAT-----A------TATTGTTT-TTGGTCA-T-TCA--TGACACGT------TGCAA--CT-CTT-C---AAAGG-GAACGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 444 22 1 1 22 1 1 22 3333 1 22 2 11 1 888888888888888888888888 5555 6666 222 22 33333 444444 1 1 1 22 0 555555 22 1 1 555 1
lowQualScore : . . . . ... .. . . .. . . .. .... . .. . .. . ........................ .... .... ... .. ..... ...... . . . .. . ...... .. . . ... .
lowQualScore : 6 5 5 5 111 55 5 5 00 4 4 00 0000 4 00 9 99 4 222222222222222222222222 0000 1111 555 00 66666 111111 4 4 4 00 7 777777 00 5 5 888 5
consensus : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTN-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
Reference ( family-646 ) : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTN-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47691 : AAT-TACA-AA-G-AAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGAAAA-TTT--AC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTATAC--AT-----A------TAGTACAT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAC--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47692 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-CT--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-TTAATGATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----ATACATGTAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47693 : AATATGCA-AA-G-AAAA---TTA-TA-AAT-GA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TCT--GC-GTAGTAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTGCTT-TTAGTCA-T-TCA--TAACACGA------TGCGG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47694 : AAT-TACA-AA-G-AAAA---TTG-TA-AGC-CT--AA-AGTTT-A--TTT----CAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------GAGTATTT-CTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47695 : AAG-TGCA-AA-G-AAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAA-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--A------A------TAGTACTT-CTAGCTA-T-TCA--TGACAAGA------TGCAA--TA-TTT-C---AATAC-AAACGAT
gi|47696 : AAC-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-TAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--TT-----A------TAGTACTT-TTGGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGTAA--TA-TTT-A---AAAAC-AAACAA
gi|47697 : AAC-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-TAT-C---AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACATTTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--TT-----A------TAGTAC-T-TTGGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGT-A--TA-TTT-TA--AAAAC-AAACAA
gi|47698 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-AC--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GA-GTAACAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TACAG--TA-TTT-A---AAAAC-AAACAAT
gi|47699 : AAT-TACA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--ATT----GAG-T--TGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----C---TTATAC--AT-----A------CATTACTT-TTAGTCA-T-TCG--CGACATAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47700 : AAT-TGCA-GA-G-AAAA---TTC-TA-AAC-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GT-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---ATATAC--ATATATGA------TAGTACTT-TTAATCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-ACACAAT
gi|47701 : AAT-AGCA-AA-G-AAAA---TTC-AA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAACTACT------------------------T----C----G---TTACAC--TT-----A------TAGCACTT-TTAGTCA-T-TGA--TGACACGC------TGCAA--CA-TTT-C---AAAAC-GAACAA
gi|47702 : AAT-TGCA-GA-G-AATA---TTC-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----TAG-T--GGTGCA-TTT--GC-ATAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----C------TAGTACTG-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AA
gi|47703 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---AAT-TA-AAT-CA--AA-AGTTTTA--TTT----GAG-T--GGAACA-TTT--AC-GTAATAATTATG------------------------T----T----G---TTATA---GC-----A------TAGTATTT-TAAGTCAGT-TCA--TGA-ACAA------TGCAA--TATTTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47704 : AAT-TGCA-GA---AAGA---TGA-TA-AATACA--AA-TGTTT-A--TTT----GAG-T--G-CACA-TTT--GC-GTAATATATACT------------------------T---------G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT----ATCA-T-TCAAACGAC-CG-------TGCAG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47705 : AAT-TGCA-AA-G-AAA----TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TAT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACTGTGACCAGGCTACACCCCAACTATT----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-T-----------------------------------TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47706 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTA-TG-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGAACA-TTT--AC--TAAT
gi|47707 : AAT-TTCA-AA-G-AAAAG--CCA-TC-A-T-CA--AA-ATTGC-G--CTT----GAG-A--TGCACA-TGT--GC-GCATTA-TTGCC------------------------T----T----G---TTACGC--TT-----A------TAGTACTTATTGGT-A-T-TCA--TAACATAA------TGCAA--TA-TTT-A---GAAAA-AAA
gi|47708 : AT-TGCA-AAAG-AAAA---TTC-TA-AAT-CA--AATAATTT-T--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAT--AT-----A------TAGTACT------------------GACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAGC-AAACGAT
gi|47709 : AT-TACACAA-G-AAAA---TTA--A-AAT-CA--AA-AGTTG-A----------AG-T--G-CACA-TTT--GC--TAATAATTGCC------------------------T----T----GAACTGACAA--AT-----A------TAGCAC---------------A--TGACACAG------TGCAAATTA-TTTTC---AAAAC-AAAC
gi|47710 : AT-TTCA-AA-G-GAAA---TTCATA-ATT-TGTGAA-ATTTC-A--TTA----GAG-C--GGCACA-TTT--GC----ATAATTAGTA-----------------------G----T----G---TTTCAC--TT-----A------TAGCACTT-ATTGTCA-T-TC----------A------TGCAA--TA-TTT-T---AAAAC-AAACAA
gi|47711 : T-TACA-AA-G-GAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AG-------TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GT-GTAATAATTGCC------------------------T----TGAACG---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAG------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47712 : T-TGCA-AA-G-AAA----TTA-TA-AAT-CA--AA-AG-------TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTGCC------------------------TGGAAC----G---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGGCT-T-TCA--TGACACAG------CGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACAA
gi|47713 : T-TGCA-AA-G-AAAA---TTA-TT-AAT-CA--AA-AG-------TTT----GAG-T--GGCACG-TTT--GC-GTAATAATTGCC------------------------T----TGAACG---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAG------TGCAA--
gi|47714 : T-TGCA-AA-GCAAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT------T----GAG-TTGAGCACA-TTTTGGT-TTGATAATTGCC------------------------TGA--C----A---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-TGTCA--TGACAAAAAAAGTTTGCAA--TA-TTT-TCCAAAAAC-AAAC
gi|47715 : T-TTCA-AA-G-AAAAGACTTG-CA---T-CA--CA---TTT-AAATTC----AAGCT--GGAACAATTT--GCCACAATT-TTACT------------------------T----T----G---TTACAC--CT-----A------TCGTAATT-TTAGTCA-T-TCA--TGGCACGA------TGCCA--TA-TTT-CG--AAAACTAAAC
gi|47716 : CA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-AA--AA-AGTTT-A--TTTTTAAGAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AC-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47717 : -AAAA---TTT-CATAAT-TG--AA-AGATC-A--TT-----GAG-T--AGCACA-TT---GC-GTAATTATTACT------------------------T----T----C---TTACGC--TT-----A------TAGTGCTC-CTAGTCA-C-TCG--TGAAACGAC-----TGTTA--TA-TTT-T---AAAAC--AACGA
gi|47718 : --AA-AGTTT-T--TTT----CAG-T--GGTAAA-TTT--GC-GTAATAATTGCTCTGA--------------------T----C----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-T
gi|47719 : TT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TAACACTTAT-----A------TATTGTTT-TTGGTCA-T-TCA--TGACACGT------TGCAA--CT-CTT-C---AAAGG-GAACGA
blockSeqs : A C A C GAC CA T A TG T T AA TTAA C TG T TG C GTGACCAGGCTACACCCCAACTAT GGAA GAAC AAC TT ATATG TACATG A G G AA AAAGTT AT T T CCA T
blockSeqs : . . . . G C . . . . . . . . . A . . CTGA GA GAAC . . . . . . . . C . . . A .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTN-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
finalCons : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTN-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 444 22 1 1 22 1 1 22 3333 1 22 2 11 1 888888888888888888888888 5555 6666 222 22 33333 444444 1 1 1 22 0 555555 22 1 1 555 1
lowQualScore : . . . . ... .. . . .. . . .. .... . .. . .. . ........................ .... .... ... .. ..... ...... . . . .. . ...... .. . . ... .
lowQualScore : 6 5 5 5 111 55 5 5 00 4 4 00 0000 4 00 9 99 4 222222222222222222222222 0000 1111 555 00 66666 111111 4 4 4 00 7 777777 00 5 5 888 5
consensus : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTN-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
Reference ( family-646 ) : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTN-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47691 : AAT-TACA-AA-G-AAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGAAAA-TTT--AC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTATAC--AT-----A------TAGTACAT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAC--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47692 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-CT--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-TTAATGATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----ATACATGTAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47693 : AATATGCA-AA-G-AAAA---TTA-TA-AAT-GA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TCT--GC-GTAGTAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTGCTT-TTAGTCA-T-TCA--TAACACGA------TGCGG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47694 : AAT-TACA-AA-G-AAAA---TTG-TA-AGC-CT--AA-AGTTT-A--TTT----CAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------GAGTATTT-CTAGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGCAG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47695 : AAG-TGCA-AA-G-AAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAA-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--A------A------TAGTACTT-CTAGCTA-T-TCA--TGACAAGA------TGCAA--TA-TTT-C---AATAC-AAACGAT
gi|47696 : AAC-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-TAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--TT-----A------TAGTACTT-TTGGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGTAA--TA-TTT-A---AAAAC-AAACAA
gi|47697 : AAC-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-TAT-C---AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACATTTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--TT-----A------TAGTAC-T-TTGGTCA-T-TCA--TGACACGA------TGT-A--TA-TTT-TA--AAAAC-AAACAA
gi|47698 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-AC--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GA-GTAACAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TACAG--TA-TTT-A---AAAAC-AAACAAT
gi|47699 : AAT-TACA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--ATT----GAG-T--TGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----C---TTATAC--AT-----A------CATTACTT-TTAGTCA-T-TCG--CGACATAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47700 : AAT-TGCA-GA-G-AAAA---TTC-TA-AAC-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GT-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---ATATAC--ATATATGA------TAGTACTT-TTAATCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-ACACAAT
gi|47701 : AAT-AGCA-AA-G-AAAA---TTC-AA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAACTACT------------------------T----C----G---TTACAC--TT-----A------TAGCACTT-TTAGTCA-T-TGA--TGACACGC------TGCAA--CA-TTT-C---AAAAC-GAACAA
gi|47702 : AAT-TGCA-GA-G-AATA---TTC-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----TAG-T--GGTGCA-TTT--GC-ATAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AT-----C------TAGTACTG-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AA
gi|47703 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---AAT-TA-AAT-CA--AA-AGTTTTA--TTT----GAG-T--GGAACA-TTT--AC-GTAATAATTATG------------------------T----T----G---TTATA---GC-----A------TAGTATTT-TAAGTCAGT-TCA--TGA-ACAA------TGCAA--TATTTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47704 : AAT-TGCA-GA---AAGA---TGA-TA-AATACA--AA-TGTTT-A--TTT----GAG-T--G-CACA-TTT--GC-GTAATATATACT------------------------T---------G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT----ATCA-T-TCAAACGAC-CG-------TGCAG--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47705 : AAT-TGCA-AA-G-AAA----TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TAT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACTGTGACCAGGCTACACCCCAACTATT----T----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-T-----------------------------------TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47706 : AAT-TGCA-AA-G-AAAA---TTA-TG-AAT-CA--AA-AGTTT-A--TTT----GAG-T--GGAACA-TTT--AC--TAAT
gi|47707 : AAT-TTCA-AA-G-AAAAG--CCA-TC-A-T-CA--AA-ATTGC-G--CTT----GAG-A--TGCACA-TGT--GC-GCATTA-TTGCC------------------------T----T----G---TTACGC--TT-----A------TAGTACTTATTGGT-A-T-TCA--TAACATAA------TGCAA--TA-TTT-A---GAAAA-AAA
gi|47708 : AT-TGCA-AAAG-AAAA---TTC-TA-AAT-CA--AATAATTT-T--TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAT--AT-----A------TAGTACT------------------GACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAGC-AAACGAT
gi|47709 : AT-TACACAA-G-AAAA---TTA--A-AAT-CA--AA-AGTTG-A----------AG-T--G-CACA-TTT--GC--TAATAATTGCC------------------------T----T----GAACTGACAA--AT-----A------TAGCAC---------------A--TGACACAG------TGCAAATTA-TTTTC---AAAAC-AAAC
gi|47710 : AT-TTCA-AA-G-GAAA---TTCATA-ATT-TGTGAA-ATTTC-A--TTA----GAG-C--GGCACA-TTT--GC----ATAATTAGTA-----------------------G----T----G---TTTCAC--TT-----A------TAGCACTT-ATTGTCA-T-TC----------A------TGCAA--TA-TTT-T---AAAAC-AAACAA
gi|47711 : T-TACA-AA-G-GAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AG-------TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GT-GTAATAATTGCC------------------------T----TGAACG---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAG------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47712 : T-TGCA-AA-G-AAA----TTA-TA-AAT-CA--AA-AG-------TTT----GAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTGCC------------------------TGGAAC----G---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGGCT-T-TCA--TGACACAG------CGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACAA
gi|47713 : T-TGCA-AA-G-AAAA---TTA-TT-AAT-CA--AA-AG-------TTT----GAG-T--GGCACG-TTT--GC-GTAATAATTGCC------------------------T----TGAACG---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAG------TGCAA--
gi|47714 : T-TGCA-AA-GCAAAA---TTA-TA-AAT-CA--AA-AGTTT------T----GAG-TTGAGCACA-TTTTGGT-TTGATAATTGCC------------------------TGA--C----A---TTACAA--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-TGTCA--TGACAAAAAAAGTTTGCAA--TA-TTT-TCCAAAAAC-AAAC
gi|47715 : T-TTCA-AA-G-AAAAGACTTG-CA---T-CA--CA---TTT-AAATTC----AAGCT--GGAACAATTT--GCCACAATT-TTACT------------------------T----T----G---TTACAC--CT-----A------TCGTAATT-TTAGTCA-T-TCA--TGGCACGA------TGCCA--TA-TTT-CG--AAAACTAAAC
gi|47716 : CA-AA-G-AAAA---TTC-TA-AAT-AA--AA-AGTTT-A--TTTTTAAGAG-T--GGCACA-TTT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TTACAC--AC-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-TCA--TGACACAA------TGCAA--TA-TTT-C---AAAAC-AAACGAT
gi|47717 : -AAAA---TTT-CATAAT-TG--AA-AGATC-A--TT-----GAG-T--AGCACA-TT---GC-GTAATTATTACT------------------------T----T----C---TTACGC--TT-----A------TAGTGCTC-CTAGTCA-C-TCG--TGAAACGAC-----TGTTA--TA-TTT-T---AAAAC--AACGA
gi|47718 : --AA-AGTTT-T--TTT----CAG-T--GGTAAA-TTT--GC-GTAATAATTGCTCTGA--------------------T----C----G---TTACAC--AT-----A------TAGTACTT-TTAGTCA-T-T
gi|47719 : TT--GC-GTAATAATTACT------------------------T----T----G---TAACACTTAT-----A------TATTGTTT-TTGGTCA-T-TCA--TGACACGT------TGCAA--CT-CTT-C---AAAGG-GAACGA