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lowQualScore                  :        ..    .  . ............   .  ..  .   .. .. . . . ... .  ..... ..  . . . .  .....      .  . . .  ... .. ..  ......   ...  .  .. ...  .  .. ...... ..... ........ . .. . ..  ... .     ... .    
lowQualScore                  :        55    9  6 333333333333   0  00  8   44 44 6 6 6 888 6  99999 11  5 1 5 4  66666      4  4 4 4  555 00 00  111111   555  5  00 666  5  55 222222 77777 99999999 5 00 5 00  222 5     000 8    
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Reference ( gi|17788 )        : TCGGATG--GGAC-GT-T------------AAAAGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC--C------T-----G--------A-T--G-T--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17787                      : TCGGATG--GGAC-GT-T------------AAAGAG--TGGCCC--CC-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC--C------T-----G--------A-T--G-T--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17789                      : TCGGATG--GGAC-GT-T------------AAA-GG--TG-CCC--C--C-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-A------CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC--C------T-----G--------A-T--G-T--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
gi|17790                      : TCGGATG--GGAC-GT-T------------AAA-GG--TG-TCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CT--T---TT-CA--C------T-----G--------A-T--T-T--TC--GA-AAAAG---A-GTA
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lowQualScore                  :        ..     . . ............     ...  .   .. .. . . . ... .  ..... ..  . . . .  .....      .  . . .  ... .. ..  ......   ...  .  .. ...  .  . ...... ..... ........ . ..  ..  ..  .     ... .    
lowQualScore                  :        33     7 5 999999999999     222  7   33 99 5 5 5 777 5  77777 00  5 5 9 4  44444      4  4 4 4  444 99 99  000000   444  4  00 555  4  4 222222 77777 99999999 5 00  11  11  5     999 7    
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Reference ( family-644 )      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
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gi|17807                      :     ATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--AG-T-A-T-C---A-AGTTAAGG--AT-T-A-C-AA-----CCCCCT-TG-T-C-AT---G--A--AA------AAG---AT-AG--T---AT-CT-C------T-----G--------A-T----------GA-AAAAA---A-
gi|17808                      :        --GGACG-T-T------------AAAGGA--TG-TCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----ACCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------TGATCAG--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-ATa
gi|17809                      :               -T-T------------AAATGC--TG-CCC--CG-T-T-T-C---A-AG-----G--AT-A-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AAAAACGCAAA---GT-C---T---AT-CC-CA-----T-----G--------ATT--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTA
gi|17810                      :                                           CC--CG-T-G-T-T---A-AG-----G--TT-C-A-C-GA-----CTCCCTATA-A-CCAG---G--T--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17811                      :                                                 -T-G-T-C---A-AG-----G--AT-A-A-C-TA-----CCCCCT-CA-G-T-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-TC-C------T-----G--------A-T--GT--TT--TA-AAAAG---A-GTAG
gi|17812                      :                                               ct-T-G-T-C---A-AA-----G--AT-T-T-C-AG-----CCCCCT-TG-G-C-AC---A--A--AA------ATT---AT-AG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--AT--TC--GA-AA
gi|17813                      :                                                                -----G--AT-C-A-C-AA-----CCTCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-AC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTA
gi|17814                      :                                                                              -C-AA-----TCCCCT-TG-G-C-AC---A--C--AG------AAG---GT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GT
gi|17815                      :                                                                                -AA-----CTTCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAT---AT-TG--T---TT-TC-C------T-----G--------A-T---T--TC--GA-AAAA----A-GTAG





Alignments
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lowQualScore                  :        ..     . . ............     ...  .   .. .. . . . ... .  ..... ..  . . . .  .....      .  . . .  ... .. ..  ......   ...  .  .. ...  .  . ...... ..... ........ . ..  ..  ..  .     ... .    
lowQualScore                  :        33     7 5 999999999999     222  7   33 99 5 5 5 777 5  77777 00  5 5 9 4  44444      4  4 4 4  444 99 99  000000   444  4  00 555  4  4 222222 77777 99999999 5 00  11  11  5     999 7    
consensus                     : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
Reference ( family-644 )      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
gi|17787                      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGAG--TGGCCC--CC-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17788                      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAAGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17789                      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGG---TG-CCC--C--C-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-A------CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
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gi|17791                      : TCGGATG--GGACT-T-T------------AAATGG--TG-CCC--CA-T-G-C-C---A-AG-----G--AT-A-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-T-AC---G--C--AA------AAG---AC-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--TA-AAAAG---A-GTAG
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gi|17795                      : TCGGATGCGGGA-G-T-T------------AAGAGGATTG-CCC--CAATAG-T-C---A-AGA----G--AT-C-A-C-AATTTAACCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAA---AT-CG--TTCATT-GC-C------T-----GC-------A-T--GT--TCCGAA-AAAAG---A-GTAG
gi|17796                      : TCAGATG--GGACG-T-T------------AATGGT--TG-CCC--TG-C-G-T-G---A-AG-----A--AT-C-A-C-AA-----TCCTCT-TG-A-C-AC---A--G--AA------AAG---AC-CC--T---TT-CC-C------T-----G--------T-T--AT--TC--GA-AAACG---A-GTAG
gi|17797                      : TCAGAAG--GGACG-T-T------------TAAGGG--TG-TCC--TG-T-G-T-C---A-AA-----A--AT-C-A-C-AA-----TCCTCT-CG-G-C-AC---A--G--AA------AGG---AT-AG--T---TT-CC-C------T-----G--------T-T--GT--TG--GA-AAAAG---A-GTAG
gi|17798                      : TCAGATG--GGACG-T-T------------AATGGT--TG-CCC--TG-C-G-------A-AG-----A--AT-CCA-C-AT-----CACTCT-TG-A-C-AC---A--G--AA------AAG---AC-CA--T---TT-CC-C------T-----G----------T--AT--TC--G--AAACG---A-GTAG
gi|17799                      : TCGGATTT-GGACG-T-T------------AAAAGG--TG-CCC--CG-T-G-A-CTGTA-AG-----G---T-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-GCC-AC---G--C--AA------AGG---AT-CG--T---TT-TT-CCAACATT-----G--------A-T--GTAATC--GT-AAAAGTATA-GTAG
gi|17800                      : TTGGATG--GGATG-T-T------------AAAGG--------------T-G-T-C---A-AG-----A--TC-C-A-C-AA-----CCTCCT-TT-G-T-AT---G--C--AA------AAT----T-TG--T---TT-CCAC------TTG---G--------A-T--GT--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17801                      : TTGGGTG--AGACA-T-T------------AAAAAA--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AG-----GCCCAT----A-C--C---A--C--AA------AAT---AT-CG--T---TT-TC-C------T-----G--------T-T--GT--TT--GA-AAAAG---A-
gi|17802                      : TCGGATG--GGACG-T-T------------TAAGGG--CG-CTC--CT-T-G-T-C---A-GG-----G--AT-T-G-T-AA-----CCCCCT-TG-A-C-AC---A--A--CA------AAG---AG-CG--T---TT-TC-
gi|17803                      : TCGGATG--GGACG-T-TACATACATGTACAAAGGG--TA-CAC--CT-T-G-T-C---G-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCTC--GG-G-C-AC---G--C--AA------AGG---tacttctccaaaa
gi|17804                      :  CGGATG--GGACG-T-T------------AAA-AG--TG-CCCGTCG-T-GTT-C---AGAG-----G--ATCC-A-CAAA-----CCCCCT-T--G-C-AC---G--CCAAA------AAG---AT-CG--T---TTACC-CA-----T-----GTGGAGCCAA-T--GT--TC--GA-AAAGG---
gi|17805                      :  CGGATA--TGATG-TCT------------AAATGGAATG-GCC--CG-T-G-TAC---A-AGA----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-T--G-C-AC---GTTT--AA------AAATTTAT-CG------TT-CC-C------T-----G--------A-T--G
gi|17806                      :   GAATC--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CTC--TT-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---CT-AG--T---CT-CC-C------T-----G--------A-C--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAactcaa
gi|17807                      :     ATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--AG-T-A-T-C---A-AGTTAAGG--AT-T-A-C-AA-----CCCCCT-TG-T-C-AT---G--A--AA------AAG---AT-AG--T---AT-CT-C------T-----G--------A-T----------GA-AAAAA---A-
gi|17808                      :        --GGACG-T-T------------AAAGGA--TG-TCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----ACCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------TGATCAG--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-ATa
gi|17809                      :               -T-T------------AAATGC--TG-CCC--CG-T-T-T-C---A-AG-----G--AT-A-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AAAAACGCAAA---GT-C---T---AT-CC-CA-----T-----G--------ATT--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTA
gi|17810                      :                                           CC--CG-T-G-T-T---A-AG-----G--TT-C-A-C-GA-----CTCCCTATA-A-CCAG---G--T--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17811                      :                                                 -T-G-T-C---A-AG-----G--AT-A-A-C-TA-----CCCCCT-CA-G-T-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-TC-C------T-----G--------A-T--GT--TT--TA-AAAAG---A-GTAG
gi|17812                      :                                               ct-T-G-T-C---A-AA-----G--AT-T-T-C-AG-----CCCCCT-TG-G-C-AC---A--A--AA------ATT---AT-AG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--AT--TC--GA-AA
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gi|17814                      :                                                                              -C-AA-----TCCCCT-TG-G-C-AC---A--C--AG------AAG---GT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GT
gi|17815                      :                                                                                -AA-----CTTCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAT---AT-TG--T---TT-TC-C------T-----G--------A-T---T--TC--GA-AAAA----A-GTAG


blockSeqs                     :        CG     G G ACATACATGTAC     GAT  .   GT AA A T A TGT G  TTAAG TG  C C A A  TTTAA      A  A C C  CAT TT CA  AAACGC   TTT  C  AT TCA  A  A CAACAT GATCA TGGAGCCA T TG  AA  CG  C     TAT G
blockSeqs                     :        T      . C .                GAA  .   .  G  . . . .   .  A     .   . . T .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . A      TG    C        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                G    .   .  G  . . . .   .  A     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . A      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                G    .   .  A  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                C    .   .  T  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
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blockSeqs                     :        .      . . .                G    .   .  T  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                G    .   .  G  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                A    .   .  G  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                C    .   .  T  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                .    .   .  G  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                .    .   .  G  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                .    .   .  G  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :        .      . . .                .    .   .  G  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :               . . .                .    .   .  .  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .   .
blockSeqs                     :                                             .  .  . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .     .    
blockSeqs                     :                                                   . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .          
blockSeqs                     :                                                   . . . .   .  .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .   .   .   .          
blockSeqs                     :                                                                .     .   . . . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  . .      .     .        . .                      
blockSeqs                     :                                                                              . .  .          .  . . .  .   .  .   .        .    .  .  .    .  .                                                
blockSeqs                     :                                                                                .  .          .  . . .  .   .  .   .        .                                                                   


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
finalCons                     : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG





Alignments
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lowQualScore                  :        ..     . . ............     ...  .   .. .. . . . ... .  ..... ..  . . . .  .....      .  . . .  ... .. ..  ......   ...  .  .. ...  .  . ...... ..... ........ . ..  ..  ..  .     ... .    
lowQualScore                  :        33     7 5 999999999999     222  7   33 99 5 5 5 777 5  77777 00  5 5 9 4  44444      4  4 4 4  444 99 99  000000   444  4  00 555  4  4 222222 77777 99999999 5 00  11  11  5     999 7    
consensus                     : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
Reference ( family-644 )      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
gi|17787                      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGAG--TGGCCC--CC-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17788                      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAAGG--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17789                      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGG---TG-CCC--C--C-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-A------CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
gi|17790                      : TCGGATG--GGACG-T-T------------AAAGG---TG-TCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CT--T---TT-CA-C------T-----G--------A-T--TT--TC--GA-AAAAG---A-GTA
gi|17791                      : TCGGATG--GGACT-T-T------------AAATGG--TG-CCC--CA-T-G-C-C---A-AG-----G--AT-A-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-T-AC---G--C--AA------AAG---AC-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--TA-AAAAG---A-GTAG
gi|17792                      : TCGGACA--GGACG-TGT------------AAAG----CG-CTC--TT-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----ACCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---ATCCG--T---TT-TC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAG
gi|17793                      : TCGGATG--GGACGGT-T------------AAAAGC--T--CCC--CA-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-AAC-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CGATT---TT-CC-C------T-----G--------A-TTGGT--TC--GACAAAAG---AGGTAG
gi|17794                      : TCGGATG--GGACG-T-A------------AAAG-------TCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----GTGAT-C-ATC-AA-----CCCACT-TGAG-C-ACCATG--C--AA------A-G---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAA
gi|17795                      : TCGGATGCGGGA-G-T-T------------AAGAGGATTG-CCC--CAATAG-T-C---A-AGA----G--AT-C-A-C-AATTTAACCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAA---AT-CG--TTCATT-GC-C------T-----GC-------A-T--GT--TCCGAA-AAAAG---A-GTAG
gi|17796                      : TCAGATG--GGACG-T-T------------AATGGT--TG-CCC--TG-C-G-T-G---A-AG-----A--AT-C-A-C-AA-----TCCTCT-TG-A-C-AC---A--G--AA------AAG---AC-CC--T---TT-CC-C------T-----G--------T-T--AT--TC--GA-AAACG---A-GTAG
gi|17797                      : TCAGAAG--GGACG-T-T------------TAAGGG--TG-TCC--TG-T-G-T-C---A-AA-----A--AT-C-A-C-AA-----TCCTCT-CG-G-C-AC---A--G--AA------AGG---AT-AG--T---TT-CC-C------T-----G--------T-T--GT--TG--GA-AAAAG---A-GTAG
gi|17798                      : TCAGATG--GGACG-T-T------------AATGGT--TG-CCC--TG-C-G-------A-AG-----A--AT-CCA-C-AT-----CACTCT-TG-A-C-AC---A--G--AA------AAG---AC-CA--T---TT-CC-C------T-----G----------T--AT--TC--G--AAACG---A-GTAG
gi|17799                      : TCGGATTT-GGACG-T-T------------AAAAGG--TG-CCC--CG-T-G-A-CTGTA-AG-----G---T-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-GCC-AC---G--C--AA------AGG---AT-CG--T---TT-TT-CCAACATT-----G--------A-T--GTAATC--GT-AAAAGTATA-GTAG
gi|17800                      : TTGGATG--GGATG-T-T------------AAAGG--------------T-G-T-C---A-AG-----A--TC-C-A-C-AA-----CCTCCT-TT-G-T-AT---G--C--AA------AAT----T-TG--T---TT-CCAC------TTG---G--------A-T--GT--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17801                      : TTGGGTG--AGACA-T-T------------AAAAAA--TG-CCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AG-----GCCCAT----A-C--C---A--C--AA------AAT---AT-CG--T---TT-TC-C------T-----G--------T-T--GT--TT--GA-AAAAG---A-
gi|17802                      : TCGGATG--GGACG-T-T------------TAAGGG--CG-CTC--CT-T-G-T-C---A-GG-----G--AT-T-G-T-AA-----CCCCCT-TG-A-C-AC---A--A--CA------AAG---AG-CG--T---TT-TC-
gi|17803                      : TCGGATG--GGACG-T-TACATACATGTACAAAGGG--TA-CAC--CT-T-G-T-C---G-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCTC--GG-G-C-AC---G--C--AA------AGG---tacttctccaaaa
gi|17804                      :  CGGATG--GGACG-T-T------------AAA-AG--TG-CCCGTCG-T-GTT-C---AGAG-----G--ATCC-A-CAAA-----CCCCCT-T--G-C-AC---G--CCAAA------AAG---AT-CG--T---TTACC-CA-----T-----GTGGAGCCAA-T--GT--TC--GA-AAAGG---
gi|17805                      :  CGGATA--TGATG-TCT------------AAATGGAATG-GCC--CG-T-G-TAC---A-AGA----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-T--G-C-AC---GTTT--AA------AAATTTAT-CG------TT-CC-C------T-----G--------A-T--G
gi|17806                      :   GAATC--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CTC--TT-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---CT-AG--T---CT-CC-C------T-----G--------A-C--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTAactcaa
gi|17807                      :     ATG--GGACG-T-T------------AAAGGG--TG-CCC--AG-T-A-T-C---A-AGTTAAGG--AT-T-A-C-AA-----CCCCCT-TG-T-C-AT---G--A--AA------AAG---AT-AG--T---AT-CT-C------T-----G--------A-T----------GA-AAAAA---A-
gi|17808                      :        --GGACG-T-T------------AAAGGA--TG-TCC--CG-T-G-T-C---A-AG-----G--AT-C-A-C-AA-----ACCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------TGATCAG--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-ATa
gi|17809                      :               -T-T------------AAATGC--TG-CCC--CG-T-T-T-C---A-AG-----G--AT-A-A-C-AA-----CCCCCT-TG-G-C-AC---G--C--AAAAACGCAAA---GT-C---T---AT-CC-CA-----T-----G--------ATT--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTA
gi|17810                      :                                           CC--CG-T-G-T-T---A-AG-----G--TT-C-A-C-GA-----CTCCCTATA-A-CCAG---G--T--AA------AAG---AT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--AA-AAAAG---A-GTAG
gi|17811                      :                                                 -T-G-T-C---A-AG-----G--AT-A-A-C-TA-----CCCCCT-CA-G-T-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-TC-C------T-----G--------A-T--GT--TT--TA-AAAAG---A-GTAG
gi|17812                      :                                               ct-T-G-T-C---A-AA-----G--AT-T-T-C-AG-----CCCCCT-TG-G-C-AC---A--A--AA------ATT---AT-AG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--AT--TC--GA-AA
gi|17813                      :                                                                -----G--AT-C-A-C-AA-----CCTCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAG---AT-CG--T---TT-AC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GTA
gi|17814                      :                                                                              -C-AA-----TCCCCT-TG-G-C-AC---A--C--AG------AAG---GT-CG--T---TT-CC-C------T-----G--------A-T--GT--TC--GA-AAAAG---A-GT
gi|17815                      :                                                                                -AA-----CTTCCT-TG-G-C-AC---G--C--AA------AAT---AT-TG--T---TT-TC-C------T-----G--------A-T---T--TC--GA-AAAA----A-GTAG