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Reference ( family-642 )      : ACAGTAACCAACATTGA-TTCACTAAT--T-CAA-A-CAGCC-TTGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTT--C----------CAN-CTT-AA-C-AAA-TGACAA--T-ATTTCA----GAATAG-A-GTAATT-GA------A---T--G----T-AA-TT-GAA--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-AC--C---G---CAA--AATTT---A-GC--TG-TAATCGA-TT--A-AA----TTA-CG-AT-TA-C-----AN--GTAA---------T-T--G---AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-TNT-CA--A-T--------T-ACTTG-----A--AAA-----A-ANG-TAA-----------T--G-A--T-TAC-----A-------A----T--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--CCCAT-GCCTG
gi|112146                     : ACAGTAACCAACATTGA-TTCACTAAT--T-CAA-A-CAGCC-TTGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTT--C----------CAA-CTT-AA-C-AAA-TGACAA--T-ATTTCA----GAATAG-A-GTAATT-GA------A---T--G----T-AA-TT-GAA--AAAGT--AATCA----TA--ATT-AC-AC--C---A---CAA--AATTT---A-GC--TG-TAATCGA-TT--A-AA----TTA-CG-AT-TA-C-----AA--GTAA---------T-T--G---AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAAA-TT-----AC-TGT-CA--A-T--------T-ACTTG-----A--AAA-----A-AAG-TAA-----------T--G-A--T-TAC-----A-------A----T--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--CCCAT-GCCTG
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gi|112149                     : ACAGTAACAAACATTGA-TTCACTAAT--T-CAA-A-CAGC---TGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTTGTC----------CAA-AAT-AAAC-AAAATGACAA--TCAT--CA----GAATAGCA-GTAAA--GAGAGAAGA---T--G----TGAA-TT-GAA--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-AC--C---AA--CAA--AATTT---A-GC--TG-CAATCGA-TT--A-A-----TTA-CG-AT-TA-------AA--GTAA---------T-T--G---AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-TGT-CA--A-T--------T-ACTTGA----A--AAA-----A-AAG-TAA-----------T--G-A--TACAT-----A-------A----T--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--TCGAT-
gi|112150                     : ACAGTAACCAACACTAA-TTCATTAAT--TTCAA-A-CAGCAATTGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTT--C-----------AA-CTT-AA-C-AAA-TGACAA--T-ATTTCA----GAATAG-A-GTAATT-GA------A---T--G----T-AA-TTTGAA--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-AC--C---A---CAA--AATTA---A-GC--TG-TAATCGA-TT--A-A------TA-CG-AT-TA-C-----AA--GTAAT--------T-T--G---AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-TGT-CC--A-A--------T-AC-TG-----A--AAA-----A-AAG-TAA-----------T--G-A--T-TAC-----A-------A----T--CGTTAACGATTACTC----G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--CCCAT-GC
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gi|112155                     :                                 AA-A-CAGCC-TTGC--CAGT--------AATTTCAACT------AT------ATTT--C----------CAT-CTT-AAAC-AAA-TGACAA--T-AGTTTG----GAGTAG-A-GTAATT-GA------A---------------------A--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-ACAAC---A---CAA--AATTT---A-G---TG-TAATCGA-TT--A-AA----TTA-CG-AT-TA-C-----AA--GTAA---------T-T--G---AAA-----A---AAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-TGT-CA--A-T--------T-ACTTG-----A--AAA-----ACAAG-TAA-----------T--G-A--T-TAC-----A-------A----T--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTA---CCCAT-GCCTG
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gi|112163                     :                                                                                                                              --T-GTCTTA----GAATGA-T-GTAATT-GG------A---GA-G----T-AA-TT-GAA--AA-GT--AATTC----AA--ATT-AC-AT------G---TTA----TTT---T-GCAATG-TAATTAA-TT--A-AA----TTA-CA-AT-TA-C-----TT--GTAA---------T-TAAA---AAA-----A---AAA-C-TT-C-A----ATT----------A-CAAA-TTACTTGAC-TTC-CA--A-T--------T-ACTTG-----A--AAATATGTA-CCG-TAA-----------TC-A-A--T-TAC-----A-------C----T--C------------------A--------------A--T------------TA------CAA-TTAC--
gi|112164                     :                                                                                                                                                  -A-GTAATC-AA------A---AA-G----T-AA-TC-TAA--AT-GT--AATCA----TG--ATT-AC-AG--G---G---TAA--AATTA---A-----TG-TAATCGA-TT--ACAA----TTA--A-AT-TA-C-----AT--GTAA---------T-CTAA---AAA-----A---TA----CA-C-G----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-ATT-CG--A-T--------T-ACTTG-----A--AAA-----A-CTG-TAATCAATTACAGCT--G-A--T-TAC-----A-------A----T--TACA---------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--CCCAT-CTCTG
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gi|112166                     :                                                                                                                                                  -A-GTAATC-GA------A---A--G----C-A--TT-AAA--AAAGT--AATTA----TG--ACT-GC-AA--C---G---TAATTAATTT---A-GC--TG-CAATCAA-TT--A-CA----TTA-CG-AT-TA-A-----AC--GTAA---------T-T--G---AAA----------------T-C-T----ATT------------C-GA-T--------------A--A----------------------A--AAA-----T-AAA-TAA-----------T--A-A--T-TAT-----A-------A----T--C------------------A--------------A--T------------CA------CGA-TTAT--CCTAC-GCC
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gi|112169                     :                                                                                                                                                aatcaaaAATT-GG------A---A--A----T-AA-TT-GAA--AA-GT--AATTG----GA--ATT-TC-AT------G---TTA--TTTTT-----GCAGTG-TGATTAA-TT--A-AA----TTA-CC-AT-TA-T-----TT--GTAA---------C-T--G---AAA-----AAAATA--C-TT-C-A----AT-----------A-CC-A-TT-----AC-TTC-CA--A-T--------T-ACTTA-----A--AAA-----T-ATG-TAA-----------TT-A-A--T-TAC-----A-------C----T--C------------------G--------------A--T-------------------------TAC--CCCAT-CCCT
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blockSeqs                     :                  .         .  .   . .     A    AA    AATTTCAA          .       .         .  .           A    .  A A   A      .  T      A         . .      .  .      TTT    .    .  . T    .   A  .      .     GC   .  T  TAGGG        A      TGAAA      .       .  .  C  AA     .  .  .  . AA           CTGAAA               .     T    G  .  T . TGC    .          A    .  .      . CTG  .  . .        .     A     .    AC      A .   TTACATGTA        T  .   AATCGTTAACGATTACTCG                                     .  CAG           .        .    .      .
blockSeqs                     :                  .         .  .   . .     .    AA    AATTTCAA          .       .         .  .           A    .  A .   A      .  .      .         . .      .  .      AAA    .    .  . T    .   A  .      .     T    .  .  AACA         A      TGAAA      .       .  .  C  A      .  .  .  . AA           TCTAA                .     T    G  .  . . T      .          .    .  .      . GT   .  . .        .     A     .    AC      A .   ATTGT            .  .   AACGCATTACCATTCCAC                                      .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                  .         .  .   . .     .    AA    AATTTCAA          .       .         .  .           A    .  . .   .      .  .      .         . .      .  .      GA     .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  CAA          A      TGCAA      .       .  .  C  .      .  .  .  . AA           TTAAA                .     T    G  .  . . .      .          .    .  .      . GT   .  . .        .     .     .    A       A .   TCGG             .  .   AGCTGATTACAG                                            .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                  .         .  .   . .     .    AA    AA                .       .         .  .           A    .  . .   .      .  .      .         . .      .  .      GA     .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  CAA          A      TGCAA      .       .  .  .  .      .  .  .  . AA           TCTAA                .     T    G  .  . . .      .          .    .  .      . GT   .  . .        .     .     .    A       C .   TTTA             .  .   AGCTGATTATAG                                            .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                  .         .  .   . .     .    .     AA                .       .         .  .           T    .  . .   .      .  .      .         . .      .  .      AA     .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  CA           A      TGCAG      .       .  .  .  .      .  .  .  . AA           TCTAA                .     T    G  .  . . .      .          .    .  .      . GT   .  . .        .     .     .    A       A .   TGC              .  .   ACTAAAATTACA                                            .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                  .         .  .   . .     .    .     AA                .       .         .  .           T    .  . .   .      .  .      .         . .      .  .      T      .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  CA           A      TGCAA      .       .  .  .  .      .  .  .  . AA           ACTAA                .     T    G  .  . . .      .          .    .  .      . GT   .  . .        .     .     .    A       A .   TCA              .  .   GATTACTCG                                               .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                  .         .  .   . .     .    .     AA                .       .         .  .           T    .  . .   .      .  .      .         . .      .  .      T      .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  CA           A      TAGC       .       .  .  .  .      .  .  .  . AA           TTTG                 .     T    G  .  . . .      .          .    .  .      . GT   .  . .        .     .     .    A       A .   TGC              .  .   AATTACAG                                                .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                   . .     .    .     AA                .       .         .  .           T    .  . .   .      .  .      .         . .      .  .      T      .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  CA           A      GCAG       .       .  .  .  .      .  .  .  . AA           TTTG                 .     A    G  .  . . .      .          .    .  .      . GT   .  . .        .     .     .    A       A .   TTA              .  .   ACCTCG                                                  .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                   . .     .    .     AA                .       .         .  .           T    .  . .   .      .  .      .         . .      .  .      T      .    .  . C    .   A  .      .     .    .  .  CA           A      AGC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AA           TTGA                 .     A    G  .  . . .      .          .    .  .      . GT   .  . .        .     .     .    A       A .   TCA              .  .   ATACG                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                              .  . .   .      .  .      .         . .      .  .      T      .    .  . C    .   A  .      .     .    .  .  CA           A      AGC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AG           TCTA                 .     C    G  .  . . .      .          .    .  .      . AT   .  . .        .     .     .    A       T .   TCA              .  .   AATCG                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                              .  . .   .      .  .      .         . .      .  .      A      .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  CA           A      AGC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AT           TTGC                 .     C    G  .  . . .      .          .    .  .      . AG   .  . .        .     .     .    A       A .   TCA              .  .   AATCG                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                       .      .  .      .         . .      .  .      A      .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  CA           C      AAC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AT           TTGG                 .     T    G  .  . . .      .          .    .  .      . TT   .  . .        .     .     .    A       T .   TTA              .  .   AATCG                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                              .  .      .         . .      .  .      T      .    .  . C    .   A  .      .     .    .  .  TG           A      GGC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AT           TTG                  .     C    A  .  . . .      .          .    .  .      . AG   .  . .        .     .     .    A       C .   TTA              .  .   AATCG                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                              .  .      .         . .      .  .      T      .    .  . C    .   A  .      .     .    .  .  GG           A      AGC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AT           TTG                  .     A    A  .  . . .      .          .    .  .      . TC   .  . .        .     .     .    T       T .   TTA              .  .   ATTCG                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                              .  .      .         . .      .  .      T      .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  GG           T      AGT        .       .  .  .  .      .  .  .  . TT           TTG                  .     A    A  .  . . .      .          .    .  .      . TC   .  . .        .     .     .    A       T .   TGA              .  .   AGCTG                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                        .         . .      .  .      A      .    .  . C    .   T  .      .     .    .  .  CG           A      AGC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AT           TTG                  .     T    A  .  . . .      .          .    .  .      . TT   .  . .        .     .     .    A       A .   TG               .  .   AATGC                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  . .      .  .      A      .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  GG           A      AGC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AT           TTG                  .     T    A  .  . . .      .          .    .  .      . TT   .  . .        .     .     .    T       T .   TG               .  .   ACTCA                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  . .      .  .      A      .    .  . G    .   A  .      .     .    .  .  GG           A      TGC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AC           TTG                  .     C    .  .  . . .      .          .    .  .      . TT   .  . .        .     .     .    A       T .   TG               .  .   ACTCA                                                   .  .             .        .    .      .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                  . .      .  .      T      .    .  . T    .   A  .      .     .    .  .  TT           A      TGC        .       .  .  .  .      .  .  .  . AT           TTG                  .     T    .  .  . . .      .          .    .  .      . TC   .  . .        .     .     .    A       T .   TG               .  .   AATCA                                                   .  .             .        .    .       
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Reference ( family-642 )      : ACAGTAACCAACATTGA-TTCACTAAT--T-CAA-A-CAGCC-TTGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTT--C----------CAN-CTT-AA-C-AAA-TGACAA--T-ATTTCA----GAATAG-A-GTAATT-GA------A---T--G----T-AA-TT-GAA--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-AC--C---G---CAA--AATTT---A-GC--TG-TAATCGA-TT--A-AA----TTA-CG-AT-TA-C-----AN--GTAA---------T-T--G-AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-TNT-CA--AT--------T-ACT--TG-AAAA-----A-ANGTAA-T-----G-A-AT--TAC--A-------A----T--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--CCCAT-GCCTG
gi|112146                     : ACAGTAACCAACATTGA-TTCACTAAT--T-CAA-A-CAGCC-TTGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTT--C----------CAA-CTT-AA-C-AAA-TGACAA--T-ATTTCA----GAATAG-A-GTAATT-GA------A---T--G----T-AA-TT-GAA--AAAGT--AATCA----TA--ATT-AC-AC--C---A---CAA--AATTT---A-GC--TG-TAATCGA-TT--A-AA----TTA-CG-AT-TA-C-----AA--GTAA---------T-T--G-AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAAA-TT-----AC-TGT-CA--AT--------T-ACT--TG-AAAA-----A-AAGTAA-T-----G---AT--TAC--A-------A----T--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--CCCAT-GCCTG
gi|112147                     : ACAGTAACCAACACTGA-TTCATTAAT--T-CAA-A-CAGCC-TTGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTT--C----------CAA-CTT-AA-C-AAA-TGACAA--T-ATTTCA----GAATAG-A-GTAATC-GA------A---T--G----T-AA-TT-GAA--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-AC--C---A---CAA--AATTA---A-GC--TG-TAATCGA-TT----AA----TTA-CG-AT-TA-C-----AA--GTAT---------T-T--G-AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA--T-----AC-TGT-CA--AT--------T-ACT--TG-AAAA-----A-AAGTAA-T-----G---AT--TAC--G-------ATTACT--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--CCCAT-GCCTG
gi|112148                     : ACAGTAACAACCATTGAATTCACTAAT--T-CAA-A-CAGCC-TTGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTT--C----------CAAACTA-AA-C-AAA-TGACAA--T-ATTTCAA---GAATAG-A-GTAAT--GA------A---T--C----T-AA-TT-GAA--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-AC--C---A---CAA--AATTTT--A-GC--TG-CAATCGA-TTTAA-AA----TTA-CG-AT-TA-C-----AA--GTAA---------T-T--G-AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-TGT-CA--AT--------T-ACT--TGAAAAA-----A-AAATAA-T-----G---AT--TAC--A-------T----A--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--CCCAT-GCCTG
gi|112149                     : ACAGTAACAAACATTGA-TTCACTAAT--T-CAA-A-CAGC---TGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTTGTC----------CAA-AAT-AAAC-AAAATGACAA--TCAT--CA----GAATAGCA-GTAAA--GAGAGAAGA---T--G----TGAA-TT-GAA--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-AC--C---AA--CAA--AATTT---A-GC--TG-CAATCGA-TT--A-A-----TTA-CG-AT-TA-------AA--GTAA---------T-T--G-AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-TGT-CA--AT--------T-ACT--TGAAAAA-----A-AAGTAA-T-----G-A-----TACATA-------A----T--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--TCGAT-
gi|112150                     : ACAGTAACCAACACTAA-TTCATTAAT--TTCAA-A-CAGCAATTGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTT--C-----------AA-CTT-AA-C-AAA-TGACAA--T-ATTTCA----GAATAG-A-GTAATT-GA------A---T--G----T-AA-TTTGAA--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-AC--C---A---CAA--AATTA---A-GC--TG-TAATCGA-TT--A-A------TA-CG-AT-TA-C-----AA--GTAAT--------T-T--G-AAA-----A---TAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-TGT-CC--AA--------T-AC---TG-AAAA-----A-AAGTAA-T-----G---AT--TAC--A-------A----T--CGTTAACGATTACTC----G--------------A--T------------TA------CGA-TTAC--CCCAT-GC
gi|112151                     : ACAGTAACCA-CACTAA-TTC-TTAATGTT-CAA-AACAGCAATTGCAACAGG--------AA------CT------AT------ATTT--C-----------AA-CTT-AA-CTAAA-TGACAAAAT-ATTTCA----GA-TAG-A-GTAATT-GA------A---T--G----T-AA-TT-GAA--AAAGT--AGATA----TA--ATTAACAAC--C---A---CAA--A--TT---A-AC--TG-TAATCGA-TT----AA----TTAGCG-AT-TA-C-----AA--GTAAT--------T-T--G---------A---TAG-CTTT-C-A----ATT----------A--AGA-TT-----AC-TGTCCA--AT--------T-ACT--TG-AAAA-----A-A-GTAA-TC----G-G-AT--TACCAG-------A----T--CGTTAACGCGATTATCTTCG--------------A--T------------TA------CGA-TTACCTCCCAT-GCCTG
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gi|112155                     :                                 AA-A-CAGCC-TTGC--CAGT--------AATTTCAACT------AT------ATTT--C----------CAT-CTT-AAAC-AAA-TGACAA--T-AGTTTG----GAGTAG-A-GTAATT-GA------A---------------------A--AAAGT--AATTA----TA--ATT-AC-ACAAC---A---CAA--AATTT---A-G---TG-TAATCGA-TT--A-AA----TTA-CG-AT-TA-C-----AA--GTAA---------T-T--G-AAA-----A---AAG-C-TT-C-A----ATT----------A-CAGA-TT-----AC-TGT-CA--AT--------T-ACT--TG-AAAA-----ACAAGTAA-T-----G---AT--TAC--A-------A----T--C------------------G--------------A--T------------TA------CGA-TTA---CCCAT-GCCTG
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gi|112172                     :                                                                                                                                                                            ----T-AA-TT-GAA--AAA-T--AATTG----GA--ATT-AC-AT------G---TTA----TTT---T-GCAATG-TTATTAA-TT--G-AA----TTA-CA-AT-TA-CCCGGTACTTGTAA---------T-T--G-AAA-----A---AAAAC-TT-C-A----ATT----------A-CAAA-TT-----AC-TTC-CA--AT--------T-ACT--TG-AAAA-----T-ATGTAA-T-----T-A-AT--CAC--A-------C----T--C------------------A--------------A--T------------TA------CAA-TTAC--
gi|112173                     :                                                                                                                                                                                      T-AAA--AAAGT--AATTG----GA--ATT-AC-AT------G---TTA----TTT---T-GC--AG-TG--TGA-TT--A-A-----TTA-CA-AT-TA-T-----TT--GTAA---------C-T--G-AAA-----AAAATA--C-TT-C-A----ATT----------A-CACA-TT------C-TTC-CA--AT--------T-ACT--TA-AAAT-----G-ATGTAA-T-----T-A-AT--TAC--AC------C----T--C------------------G--------------A--T------------TA------C
gi|112174                     :                                                                                                                                                                                                                                       --AATTT---T-GC--T----ATTAA-TT--A-AA----TTA-AT-AT-TA-C-----TT--GTAA---------T-T--GGAAA-----A---AAA-C-TG-C-A----CTT----------A-CAAA-TT-----AC-TTC-CA--AT--------T-ACT--TG-AAAA-----T-ATGTAA-T-----G-A-AT--TAC--G-------T----T--C------------------A--------------G--T------------TA------CAA-TTAC--