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Reference ( gi|112473 )       : TAAAATAAAC-C----GA----T-TT-T--T-TGC-C-A---T-A------T--T--A-C-AT--G------T-G-CC--T-CTTT-CG---TG-T------G-------A-CAA-G-T-T--C---T-CT---GC-T----AT-CT-ACTCT-T-----------GG-G--A----T-A--GA-G---TT-CAAG----C-T-A-TT-C--A--A--C-G--A--C--AA-C-A-T--CG-A--T-TT-C-C-CG-CA----C-AAA-G--CGG-C-A--T-T-G-T-G--A--C-G-T--C-A--AA-T---A--CA-AA--G-A-C---C--A-G-T-G-AC-A---T-G-T-------T-C-----A-A--CG---------T--C-------A-C-C--AC---T---A-T-A----AA--C--A-A---T-A---T----------T-CA-T---G----------A--------T--------------A--------------------A------A-T----------ATGT----T-G-----C-C-G-T--AGAC-T-----TTC-AA----TA--A-TT--AA-A---G-A-A--TGA-A--AT----T--TTTTTGTT
gi|112476                     : TAAGATAAAC-C----GACT--T-TT-T--T-TGC-C-A---C-A------T--T--A-C-AT--G------T-G-CC--T-CTTT-CG---TG-T------G-------A-CAA-G-T-T--C---T-TT---GC-T----AT-CT-ACTCT-T-----------GG-G--A----T-A--GA-G---TT-CAAG----C-T-A-TT-C--A--A--C-G--A--C--AA-C-A-T--CG-A--T-TT-C-C-CG-CA----C-AAA-G--CGG-C-A--T-T-G-T-G--A--C-G-T--C-A--AA-T---A--CA-AA--G-A-C---C--A-G-T---AC-A---T---T-------T-C-----A-A--CG---------T--C-------A-C-C--AC---T---A-T-A----AA--T--A-A---T-A---G----------T---------------------------------------------------------------------------------------T----T-G-----C-C-G-T--AGAC-T-----TTC-AA----TA--A-TT--AA-A---G-A-A--TGA-A--GA----T--TTTTTGTT
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gi|112486                     :  AGAATAAAC-C----GAC---T-TT-T--T-TGC-C-A---T-A------T-----A-C-AT--G------T-G-C---T-CTTT-CG---TG-T------G-------AACAA-G-T-TT-C---T-CT---GC-T----ATTCT-ACTCT-T-----------GG-G--A----T-A--GA-GT--TT-CAAGA---C-T-A-T-----A--A--C-G--AG-C--AA-C-ATT--CG-A--T-TT-C-CGCG-TA----C-AAA-G---GG-C-T--T-TGG-T-GA-A--C-G-T--C-A--AA-T---A--CA-AA--GAA-CG--C--A-G-T---AC-A---T-G-T-------T-C-----A-A--CG---------T--C-------A---C--AC---T---A-T------AA--C--ATA---T-A---T----------TCCA-T---G----------------------------------A--------------------A------A-T----------ATGT----T-G-----C-C-G-TA-AGAC-T-----TTT-AA----TA--A-TT--TA-A---G---A--TAG-C--AT----A--TTTTT
gi|112489                     : taAGATAAAC-CCCCTAACT--T-TT-T--T-TGC-C-A---T-A------C--T--G-C-ATATG------T-G-CCGAT-CTTT-CG---TG-T------G-------A-CCA-G-T-T--C---T-CT---GCCT----AT-CT-ACTCT-A-----------GG-G--A----T-AT-GA-G---TT-CAAG----C-T-A-TT-C-----A--C-A--ACTC--AA---A-T--CG-A--T-TT-C-C-CG-CA----C-AAA-A--CGG-C-A--TGT-G-T-G--A--C-GTT--C-A--AA-T---A--CA-AG--G-G-C---C--ACA-T-G-AC-AACTC-GAT-------T-C-------A--CG---------T--C-------A-G-C--AC---T---A-T-A----AA--T--AGA---T-A---TCGTGGATAAAT-TA-T---A----------A--------TTCA-----------A--------------------A------A-TATTTAATTCAATGT----T-G-------C-G-T--AGAC-T-----TTCAAA----TAC-A-TA--AA-A---G-A-AGCTGA-A--GA----T--TTGTTGTT
gi|112488                     :   AGATAAAA-CTT--GAC---T-TT-T--T-TGC-CCA---TCA------T--TC-A-C-AT--G------T-A-CC--T-CTTTTCG---TG-T------G-------A-CAA-G-T-T--C---T-CCTCAAC-T----AT-CT-ACTCT-A-----------GG-G--A----T----TA-C---TT-CAAG----C-T-A-TT-C--A-----C-G-----C--A--T-A-T--CG-A--T-TT-C-C-CGTCA----C-TAA-TT-CGG-C-A--T-T-G-T-G--A--C-G-T--C-A--A--T---C--GA-AA--G-A-C---C--ATG-T-G-AC-A---T-G-T---------C-----A-G--CG---------T--C-------A-C-C--A----T---A-T-A----AA--T--A-A---T-----T----------T-CA-T---G----------A--------TCGATTTATAATCTAA--------------------A------A-T-----------TGTG---T-G-----C-CCG-T--AGACTT-----TTC-AA----TAC-G-TT--AA-A---A-A-AG-TGA-AG-AT----T--TTTTT
gi|112491                     :   AGATAAAC-C----GA----C-TC-TCTT-TGCAC-A---T-AGAGGGGT--T--G-CCAT--G------T-G-CC--T-C-TT-CGCCCTA-T--------------A-CTA-G-T-T--CACGT-CT---AT-T-----T-CT-ACT-T-T-----------GT-GTCG----T-A--GAGG---TT-CAAAGCTCC-T-T-CT-C--A--A--G-G--A--C--AA-C---------------T-C-T-CG-TATTAGC-AAA--------C-A--T-T-G-T-G--A--C-G-T-------AA-C---A--TG-AA--G-A-A---C----G-C-A-AG-A---T-G-CGCGATCAT-C-----A-AATTGGC-------T--C-------A-C-G--AC---CTGGA-T-A----GA--T--A-GATTT-A---T----------T-AA-T---G----------A--------T--------------A--------------------A------A------------ATATAGAAT-G-----C-C-A-TA-AGAC--------TC-AA----GA--AGTTTGGA-A---C-A-A--TGG-C--AC----C--TTTTTGTTtt
gi|112493                     :       AAAC-T----GAC---T-TT-T--T-TGC-C-AA--T-C------T--T--A-C-AT--G------T-G-CC--T-CTTT-CG---TGGT------GG------A-CAA-G-T-TTAC---TACT---GC-T----AT-CT-ACTT---------------A-G--A----T-A--GA-G---TT-CAAG----CCT-A-TT-C--A--A--C-G--A--C--AAAC-A-T--CG-A--TCTT-C-C-TG-CA----C-AAA-T--CGG-C-A--T-T---T-G--A--C-GCT--C-A--AA-TTGTAT-CA-AA--G-A-C------A-G-TTG-AC-A---T-G-T-------T-CCA---A-A--CG---------T--C-------A-C----AC---T---A-T-A----AAA-T--A-A---T-A---T----------T-CAAT---G----------A--------TCAATCTATAATCT-A--------------------A------A-T----------A-GT----T-G-----A-C-G-T--AGAC-T-----TTCCAA----TA--C-TT--AA-AA--G-A-G--TGA-A--GA----T--TTTTTGTT
gi|112490                     :       AAAC-C----GA----C-TT-T--T-TGC-C-A---T-A------TTCT--A-T-AT--GACAATTT-G-CCTTT-CTTT-GGGT-TG-T------G-------A-CAA-G-C-T------T-CT---GCTT----AT-CT-GTAGT-C-----------GG-G--A----T-AATAA-G---TT-CAAG----C-T-A-TT-C--A--AGTC-G--A--A--AA-C-A-TC-CG-A--TGTT-CTC-CGACA----C-AAA-G--CGGTC-ATGT-T-G-TCG--A--C-A------A--AA-T---AACTA-GA--T-A-C---C--G-G-T-G-AC-C---T-T-C-------TGC-----ACA--CGTGGACGTATT--C-------A-C-T--AC---TA--A-T-ACTATGA--T--A-A---T-A--------------T-CA-TCCGG----------A--------G--------------A--------------------G------G-T-----------TAT----T-GTGGCAC-C-G-G--GGAT-TGACACTTC-AATGTGTA--A-TTC-AA-A---G-A-A--TGA-A--
gi|112494                     :    agaAAGC-C----GC----TACT-T--T-TGC-C-GCAGT-A------T--T--A-T-AC--GG-----T-G-C---T-CTGT-GG---TG-C------ATCAGTCTA-CAA-G-T-C--C---T--------------AT-CT-GCTCC-T-----------AG-A--ACA--T-A--GA-G---TT-CAAA----T-T---TT-C--A--A--C----------AA-C-A-TA-CG-A--T-TC-C-C-CG-CA----C-AAT-T--C-G-C-A--T-C-C-T-G--A--C-GTT--C-AACAA-T---A--CA-AA--A-G-C---C----G-A-G-AC-A---T-G-C-------T-C-----A-A--AG---------T--C-------A-C-T--GC---A---A-T-A----TA--C--A-G---T-A---ga
gi|112495                     :        AAC-C----AAACTCT-TTAT--T-TGC-C-A---T-A------TG-T--G-C-ATTCGC-----T-G-CC--TACTTT-CG----G-T------G-------A-CAA-G-T-T--CA--T-GT---GC-T----ATTCT-ACTCTAT-----------GG-G--ACGATT-A--GA-GCCCTT-AGAG----A-A-A-TT-C--A--AA-C-GG-A--C--AA-CCA-TTCCGCA--T-TT-C-C--G-CA------AAA-T--CGG-A-T--T-T-GCT-G--A--C-G-T--C-A--AA-T---A--CA-AA--G-GGC---C--A-G-T-G-AC-A---T-G-T-------T-C-----A-AAACG---------TACC-------AGC-T--AC---T---A-T-A----AA--T--A-A---T-A---T----------T-CG-T---G----------A--------T--------------AAATTATAATCTAAAATATTTA------A-T----------ATGT----T-G-----C-C-G-T--AGAC-T-----TTC-AA----TAC-A-TA--AA-A---G-A-G--TGA-A--GA----T--TTTTTGTTagactatgtta
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Reference ( family-640 )      :                                 TAAGA-TAAAC-C----GA---CT-TT-TT-T-GC-C-A---T-A------T-T--A-CAT--G------T-G-CC--T--CTTT-CG---TG-T------G-------ACAA-G-T-T--C---T-CT---GC-T----A-T-CT-ACTCT-T-----------GG-G--A----T-A-G--A-G---TT-CAAG----C-T-A-TT-C--A--A--C-G--A--C--AA-C-A-T--CG-AT-TT--C-C-CG-CA----C-AAA-N--CGG-C-A--T-T-G-T-G--A--C-G-T--CA--AA-T---A--CA-AA--G-A-C---C--A-G-T-G-AC-A---T-G-T-------T-C-----A-A--C-G---------T--C-------A-C--C--AC---T---A-T-A----A-A--T-A-A---T-A---T----------T-CA-T---G-A--------T---------------A--------------------A-A-T----------ATGT----TG-----C-C-G-T--AGAC-T-----TTC-AA----TA--A-TT--AA-A---G-A-A--TG-A-A---G-NT---TTTTTGTT
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gi|112486                     :                                 TAAGAATAAAC-C----GA---CT-TT-TT-T-GC-C-A---T-A--------T--A-CAT--G------T-G--C--T--CTTT-CG---TG-T------GA------ACAA-GTT-T--C---T-CT---GC-T----ATT-CT-ACTCT-T-----------GG-G--A----T-A-G--A-GT--TT-CAAGA---C-T-A-T-----A--A--C-G--AG-C--AA-C-ATT--CG-AT-TT--C-CGCG-TA----C-AAA-G---GG-C-T--T-TGG-T-GA-A--C-G-T--CA--AA-T---A--CA-AA--GAA-CG--C--A-G-T---AC-A---T-G-T-------T-C-----A-A--C-G---------T--C-------A----C--AC---T---A-T-A----ACA--T---A---T-A---T----------TCCA-T---G--------------------------A--------------------A-A-T----------ATGT----TG-----C-C-G-TA-AGAC-T-----TTT-AA----TA--A-TT--TA-A---G-A-gct
gi|112487                     :                                 TGAGA-TAAAC-T----GA---CT-TT-TT---GC-C-A---T-A------T-T--ATCAT---------T-G-CC--T--CTTT-CGC--TG-T------G-------ACAA-G-T-TT-C---T-CT---GC-T----A-TTCA-ACTTT-TTTTTTTTTTTAGGCG--A----T-A-T--A-A---TTTCAAG----C-T-A-T-----------C-G-----C--AA-T----------T-TT--C-C-CG-CA----CTAAA-T--CAG-C-A--T-T-A-T-GC-A--C-GCT--CA--AAAT---A--CA-AAA-G-A-C---C--A---T-G-AC-A---T-G-T-------T-C-----A-A--C-G---------T--C-------A-C--C--AC---T---A-T-A----A-A--T-AGA---T-A---T----------T-TA-T---G-A--------T---------------ACAATTATAACCTA-------A-A-T----------AAGT----TA-----C-C-G-T--AGAC-T-----TCT-AA----T---A-CT--AA-A---G-tagcatattttt
gi|112488                     :                                   AGA-TAAAA-CTT--GA---CT-TT-TT-T-GC-CCA---TCA------T-TC-A-CAT--G------T-A-CC--T--CTTTTCG---TG-T------G-------ACAA-G-T-T--C---T-CCTCAAC-T----A-T-CT-ACTCT-A-----------GG-G--A----T---T--A-C---TT-CAAG----C-T-A-TT-C--A-----C-G-----C--A--T-A-T--CG-AT-TT--C-C-CGTCA----C-TAA-TT-CGG-C-A--T-T-G-T-G--A--C-G-T--CA--A--T---C--GA-AA--G-A-C---C--ATG-T-G-AC-A---T-G-T---------C-----A-G--C-G---------T--C-------A-C--C--A----T---A-T-A----A-A--T-A-A---T-----T----------T-CA-T---G-A--------TCGATTTATAATCTA-A--------------------A-A-T-----------TGTG---TG-----C-CCG-T--AGACTT-----TTC-AA----TAC-G-TT--AA-A---A-A-AG-TG-A-A---G-AT---TTTTTTTT
gi|112489                     :                                   AGA-TAAAC-CCCCTAA---CT-TT-TT-TTGC-C-A---T-A------C-T--G-CATATG------T-G-CCGAT--CTTT-CG---TG-T------G-------ACCA-G-T-T--C---T-CT---GCCT----A-T-CT-ACTCT-A-----------GG-G--A----T-ATG--A-G---TT-CAAG----C-T-A-TT-C-----A--C-A--ACTC--AA---A-T--CG-AT-TT--C-C-CG-CA----C-AAA-A--CGG-C-A--TGT-G-T-G--A--C-GTT--CA--AA-T---A--CA-AG--G-G-C---C--ACA-T-G-AC-AACTC-GAT-------T-C-------A--C-G---------T--C-------A-G--C--AC---T---A-T-A----A-A--T-AGA---T-A---TCGTGGATAAAT-TA-T---A-A--------TTCA------------A--------------------A-A-TATTTAATTCAATGT----TG-------C-G-T--AGAC-T-----TTCAAA----TAC-A-TA--AA-A---G-A-AGCTG-A-A---G-AT---TTGTTGTT
gi|112490                     :                                   AGA--AAAC-C----GA---CT-TT-TT---GC-C-A---T-A------T-TCTA-TAT--GACAATTT-G-CC--TTTCTTT-GGGT-TG-T------G-------ACAA-G-C-T------T-CT---GC-TT---A-T-CT-GTAGT-C-----------GG-G--A----T-A-ATAA-G---TT-CAAG----C-T-A-TT-C--A--AGTC-G--A--A--AA-C-A-TC-CG-ATGTT--CTC-CGACA----C-AAA-G--CGGTC-ATGT-T-G-TCG--A--C-A-----A--AA-T---AACTA-GA--T-A-C---C--G-G-T-G-AC-C---T-T-C-------TGC-----ACA--C-GTGGACGTATT--C-------A-C--T--AC---TA--A-T-ACTATG-A--T-A-A---T-A--------------T-CA-TCCGG-A--------G---------------A--------------------G-G-T-----------TAT----TGTGGCAC-C-G-G--GGAT-TGACACTTC-AATGTGTA--A-TTC-AA-A---G-A-A--TG-A-A---G-
gi|112491                     :                                   AGA-TAAAC-C----GA---CTCTC-TT-T-GCAC-A---T-AGAGGGGT-T--GCCAT--G------T-G-CC--T--C-TT-CGCCCTA-T--------------ACTA-G-T-T--CACGT-CT---AT-T------T-CT-ACT-T-T-----------GT-GTCG----T-A-G--AGG---TT-CAAAGCTCC-T-T-CT-C--A--A--G-G--A--C--AA-C-------------T--C-T-CG-TATTAGC-AAA--------C-A--T-T-G-T-G--A--C-G-T------AA-C---A--TG-AA--G-A-A---C----G-C-A-AG-A---T-G-CGCGATCAT-C-----A-AATT-GGC-------T--C-------A-C--G--AC---CTGGA-T-A----G-A--T-A-GATTT-A---T----------T-AA-T---G-A--------T---------------A--------------------A-A------------ATATAGAATG-----C-C-A-TA-AGAC--------TC-AA----GA--AGTTTGGA-A---C-A-A--TG-G-C---A-CC---TTTTTGTTa
gi|112492                     :                                                                                                                   TTT-TG---TA-TT-----G-------ACAA-GCT-T--C---T-C----GC-T----A-T-CTTACTCTGT-----------GC-G--A----T-A-G--A-GC--TT-CAAG----C-TCA-TT-C--AGTA--C-ATTA--C--AA-C-AGT--CG-AT-TT--C-C-CG-CA----C-AAA-G--CGG-CCA--T-TTG-T-G--A--C-G-T--CA--TA-T---A--CA-GAAGG-A-C---C--A-G-T-GGAC-A---T-GCT-------T-C-----A-A--C-G---------T--CG------A-T--C--AC---T---A-T-A----A-A--T-A-A---T-A---T----------T-CA-T---G-A--------T---------------A--------------------A-A-T----------ATGT----TG-----CTC-G-T--AGAC-T-----TTC-AA----TAGTA-TT--AA-A---G-AGA--TGCA-ACGGG-AT---TTTTTGTT
gi|112493                     : taaacatttcttcctaactacaactaaagcattggcgtaAAAC-T----GA---CT-TT-TT-T-GC-C-AA--T-C------T-T--A-CAT--G------T-G-CC--T--CTTT-CG---TGGT------GG------ACAA-G-T-TTAC---TACT---GC-T----A-T-CT-ACTT---------------A-G--A----T-A-G--A-G---TT-CAAG----CCT-A-TT-C--A--A--C-G--A--C--AAAC-A-T--CG-ATCTT--C-C-TG-CA----C-AAA-T--CGG-C-A--T-T---T-G--A--C-GCT--CA--AA-TTGTAT-CA-AA--G-A-C------A-G-TTG-AC-A---T-G-T-------T-CCA---A-A--C-G---------T--C-------A-C-----AC---T---A-T-A----A-AA-T-A-A---T-A---T----------T-CAAT---G-A--------TCAATCTATAATCT--A--------------------A-A-T----------A-GT----TG-----A-C-G-T--AGAC-T-----TTCCAA----TA--C-TT--AA-AA--G-A-G--TG-A-A---G-AT---TTTTTGTT
gi|112494                     :                                        AAGC-C----G----CTACT-TT-T-GC-C-GCAGT-A------T-T--A-TAC--GG-----T-G-C---T--CTGT-GG---TG-C------ATCAGTCTACAA-G-T-C--C---T--------------A-T-CT-GCTCC-T-----------AG-A--ACA--T-A-G--A-G---TT-CAAA----T-T---TT-C--A--A--C----------AA-C-A-TA-CG-AT-TC--C-C-CG-CA----C-AAT-T--C-G-C-A--T-C-C-T-G--A--C-GTT--CAACAA-T---A--CA-AA--A-G-C---C----G-A-G-AC-A---T-G-C-------T-C-----A-A--A-G---------T--C-------A-CTGC--AA---T---A-T-AC---A-G--T-A-A---G-A---C----------T--A-T---G-T--------T---------------A--------------------
gi|112495                     :                                         AAC-C----AAACTCT-TTATT-T-GC-C-A---T-A------TGT--G-CATTCGC-----T-G-CC--TA-CTTT-CG----G-T------G-------ACAA-G-T-T--CA--T-GT---GC-T----A-TTCT-ACTCTAT-----------GG-G--ACGATT-A-G--A-GCCCTT-AGAG----A-A-A-TT-C--A--AA-C-GG-A--C--AA-CCA-TTCCGCAT-TT--C-C--G-CA------AAA-T--CGG-A-T--T-T-GCT-G--A--C-G-T--CA--AA-T---A--CA-AA--G-GGC---C--A-G-T-G-AC-A---T-G-T-------T-C-----A-AAAC-G---------TACC-------AGC--T--AC---T---A-T-A----A-A--T-A-A---T-A---T----------T-CG-T---G-A--------T---------------AAATTATAATCTAAAATATTTA-A-T----------ATGT----TG-----C-C-G-T--AGAC-T-----TTC-AA----TAC-A-TA--AA-A---G-A-G--TG-A-A---G-AT---TTTTTGTT
gi|112496                     :                                                                                              --G------T-G-CC--T--CTGT-CG---TA-T------G-------ACAA-G-T-T--C---G-CT---GC-TTAAGA-T-CT-ACTTTCT-----------AG-G--A----TAA-G--A-G---TT-CAAG----C-T-A-TT-C--A--A--C-GA-A--CAGAA-C-A-C--CGTAT-TT--CGC-CG-CA----C-AAATT--CGG-C-C--T-T-G-T-G--A--C-G-T--CAG-AA-T---A--CA-AA--G-A-CAATC--A-G-T-G-AC-AG--TGG-T-------T-C-----A-A--C-G---------T--C-------A-C--C--AC---T---A-TAA----A-A--TAA-A---TGA---T----------TCCA-T---G-A--------T---------------A--------------------A-A-
gi|112497                     :                                                                                                           ataataacctcttc---TG-T--------------ACAA-G-T-T--C---T-CT---GC-T----A-T-CT-ACTCT-A-----------GG-G-------T-A----A-C---TT-CA-G----C-T-A-GTGC--AT-A--C-G--A--C--AT-C-A-T--CG-AT-TT--C-C-CG-CA----C-AAA-T--CGG-C-A--T-T-G-T-G--A--C-G-T--CA--AA-T---A--CA-AA--G-A-C---C--A-G-T-G-ACTA---T-G-T-------C---------A--C-G---------T--C-------A-C--C--AC---T---AAT-A----A-A--T-A-A---T-A---T----------T-CA-T---G-A--------TCGATTATAATCT---A--------------------A-A-T----------ATGT----TG-----C-C-G-T--AGAC-T-----TTC-AA----TA--C-TT--AA-A---A-A-AG-TG-A-A---G-AT---TTTTTGTT
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gi|112501                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -G---------T--C-------A-C--C--AC---T---A-T-A----A-A--T-G-A---T-A---T----------T-CA-T---G-A--------TCAATGATAATCA---A--------------------A-A-T----------ATGT----TG-----C-C-G-T--AGAC-T-----TTC-AA----TA--C-TTA-AA-A---G-A-G--TG-A-A---G-AT---TTTTTGTT