lowQualScore : 22222
lowQualScore : 44 222 99 22 1 44 22 3 3 5555555 1 33 555 22 33 1 33 33333 8888 33 22 33 3333 33 22 55555 22 444 1 00000 22 1 1 4 222 66 33 22 1 5555 1 1 444444 22 33 1 1 1
lowQualScore : .. ... .. .. . .. .. . . ....... . .. ... .. .. . .. ..... .... .. .. .. .... .. .. ..... .. ... . ..... .. . . . ... .. .. .. . .... . . ...... .. .. . . .
lowQualScore : 00 999 00 33 7 00 22 2 1 0000000 5 77 444 11 77 5 55 66666 8888 44 00 44 5555 44 00 55555 00 999 4 66666 00 4 4 3 555 22 44 00 4 9999 4 4 111111 00 77 5 5 6
consensus : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---CG--A--GAT-G--AT-----TT--N-T--T--TT--CT-T--T--TGC--T-----G--A-N-TTTG-A---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--ATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GCGGACGGGCC
Reference ( gi|73726 ) : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---CG--A--GAT-G--AT-----TT--G-T--T--TT--CT-T--T--TGC--T-----G--A-T-TTTG-A---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--ATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GCGGACGGGCC
gi|73729 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---CG--A--AAT-G--AT-----TT--G-T--T--TT--CT-T--T--TGC--T-----G--A-T-TTTG-A---GGT--TTT-TTT-C-TTT---AC--ATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-CT-C-GCGGACGGGCC
gi|73730 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---CG--A--GAT-G--AT-----TT--G-T--T--TT--CT-T--T--TGC--T-----G--A-T-TTTG-A---G----TTT-TTT-C-TTT---AC--ATA--TG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-T-GCGGACGGGC
gi|73732 : GAAAAT--G---TCC--TT--G-AA--C--G-T-ACATTGTAT-G--T---CG--A--GAT-G--AT-----TT--G-T--T--TT--CT-T--T--TGC--T-----G--A-T-TTTG-A---GGT--TTT-TTT-C-TTT---AC--ATA--CG--TG-TTACA----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GCGGACGGGCC
gi|73727 : GAAAAT--A---TCC--TT--G-AA-----G-T-A-------T-G--T---CG--A--GAT-G--AT-----TT--G-T--T--TT--CT-T--T--TGC--T-----G--A-T-TTTG-A---G-T--TTT-TTT-C-TTT---AC--ATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GCGGA
gi|73733 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---CG--A--GAT-G--GT-----TT--C-T--T--TT--CT-C--T--TGCCGT-----G--A-A-TTTG-A-----C--TTT-TTT-C-TTT---AT--ACA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TA--C-TT-C-GCGGACGGGC
gi|73736 : GAAAAT--T---TTC--TT--G-AAA-C--G-T-A-------T-A--T---CC--A--GAG-G--AT-----TT--C-T--T--TT--CT-C--T--TGC--T-----G--A-A-TTTG-A---CTT--TTT-TTT-C-TTC---AC--ACA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GCGGACAGGCC
gi|73738 : GAAAAT--T---TCCA-TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---CG--A--GAT-G--AT-----TTTTG-T--T--TT--CT-T--T---GC--T-----G--A-T-TTTGAA---G----TTT-TTT-C-ATT---ACA-ATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------C---TG--C-TT-C-GCGGACCGGCC
gi|73734 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-A--T---CG--G--GAT-G--AT-----TG--C-T--T--TT--CT-C--T--TGC--T-----G--A-A-TTTG-A---CTT--TTT-TT----TTT---AC--ACA--CG--TG-TTACT----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GCGAACAGGCC
gi|73737 : GAAATT--T---TCT--TC--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---CG--A--GAT-G--AA-----TT--C-T--T--TT--CT-T--T--TGC--T-----G--A-A-TTTG-A--------CTT-TTT-C-TTT---GC--CTA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GTGGACGGGCC
gi|73728 : GAAAAT--------C--CT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---CG--A--GAT-G--AT-----TT--G-T--T--TTG-CTAT--T--TGC--T-----G--A-T-TTTG-A---GTT--TTG-TTT-C-TTA---AC--ATA--CGGTCG-TTA-C----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GCGGACGG
gi|73739 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---AG--A--GAT-G--AT-----TT--C-T--T--TT--CT-G--T--TGC--T-----A--A-A-TTTG-ACGGGTT--TTT-------TTA---AC--ACA--CG--TG-TTACC----TTTCG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GCGGGCGGGCC
gi|73735 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-A--T---AG--A--GAT-G--AT-----AT--C-T--A--TT--CT-C--T--TGC--T-----G--A-AATTTA-C---GTT--TT---TT-C-TTT---AC--ATA--CG--TG-TCACC----TTTAG-AT-C------CT--TG--C-TT-C-GCGGACGGGCC
gi|73740 : GAAAAT--T---TCCA-TT--G-AA--CTGG-TGA-------T-G--T---AG--A--GAT-GC-AT-----TT--C-T--T--TT--CT-C--T--TGT--T-----A--A-T-TT-G-A-----C--TTT-TTT-C-TTT---ACCAATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTGC-G-GGGCGGGCC
gi|73741 : GAGATT--T---TCC--TTTTG-AA--C--G-T-A-------T-GG-T---CG--A--GAT-G--AT-----TT--GGTA-T--TT--CT-TATTCGTGC--T-----A--A-T-TTTG-C---GTT--TTT-TGC-A-TTT---AC--ATACGCG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------TT--TGGCT-TT-C-GCGGACGGGCC
gi|73744 : GAAAATA-T---TCCA-TT--G-AAACC--GAT-A-------T----T---CG--A--GATTG--AT-----T---G-T--T--TT--CT-T--T---GC--T-----G--A-T-TTTG-A---GTT--TTT-CCTGC-TTTTACAC--ATA--CA--GG-GTACC----TTTAG-AG-C------CT--GC--C-TT-CAGCGGACGGGCC
gi|73742 : GGAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-------------------------------------------------------GC--T-----G--A-A-TTTG-A-----C--TTT-TTT-CGTTT---AC--ATA--TA--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GC-GACGGGCC
gi|73743 : GAAAATATT---TTC--TT--G-AA--C--G-TCA-------T-GAATAAACAGAA--AAT-T--AT-----TT--C-TCCT--TT--CT-G--T--TGC--TTA---A--A-G-TATG-A----CA--TTT-TTT-C-TTT---AC--ACA--CA--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-T-GCGGGTGGGCC
gi|73745 : GAAAAC--TGTATCT--TT--G-AA--C----T-A-------T-G--T---CG-----GAT-G--AA-----TT--C-T--T--TT--CT-C--T---GC--A-----G--A-A-TTTG-A---CCT--CTT-TTT-C-TTC---AC--A-A--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--T---C-TT-C-
gi|73746 : GAAATT--T---TTC--TT--G-AA--C--G-T-A-------A-T--T---CG--A--TAT-----T-----TT--T-T--T--TTGCCT-TA-T--TGC--T-----G----T-TTTG-A---CTT--TTT-TTT-CATTT---ACA-ATA--CG--TG-TTACCT---TTTAG-AG-C------CT--T
gi|73731 : GAAATT--T---TCCG-TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---CA--ATCGAT-----C-----TT--G-T--T--TT--CT-T--T--TGC--T-----G--ATT-TTTG-A---GTT--TTT-C----------------TA--TG--TG-TTACCTGTTTTTAA-AGACATGGCGCT--TG--G-TT-G-GCGGACGG
gi|73747 : AAAAT--T-----C--TT--G-AA--C--GGT-A-------T-G--T---C---A--G-T-G--AT-----T---G-T--T--TT--CT-T--T--GCC--T-----G--A-T-TGTT-T---CTT--TTT-TGT-CATTT---AC--ATA--CG--TG-TTACCT---TTTAG-A--C------CTTATG--C-TT-
gi|73748 : AAAAT--T---TCCACTT--GTAA--C--G-T-A-------TCG--TATGTG--A--G-T-G--ATCTTCTTT--A-T--A--TT--CT-G--TG-TGC--T-----G--A-A-TTTG-AC--GTT--TTT-----C-TTT---AC--ACAG-TG--TG-TAACC----TTTAG-AG-C------CT--TGC-C-TT-C-GC
gi|73749 : AAAT--T---TCA--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---TG--G--GAT-G--AT-----TT--A-T--T--TT--GT-C--T--TGC--T-----G--A-A-TTTG-A-----C--TGT-TTT-C-TTT---AC--ACA--TG--TG-TTACC----TTTAG-AG-T------CT--TG--C-TT-C-GCGAA--GGCC
gi|73750 : T--T---TTC--TT--G-CA--C--G-T-T-------T-T--C---CG--A--GAT-G--AT-----TC--T-T--T--TT--CT-T--T--TGC--T-----GGAA-T-TCTG-A----CT--TTT-TTT-C-TT--------AT---CT--TG-TTTCC----TCTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GC
gi|73751 : --G-T-A-------T-G--T---AG--A--GAT-T--AT-----CT-------C--TT--CT-T--T--TGC--C-----G--A-T-TTTG-------T--CTT-GTC-C-CTT---GC--ACA--CA--CG-TTACC----TTTAG-AG-C------C
gi|73752 : -A-------T-G--T---CA--AA-GAT-GGAAT-----TT--T-C--TGGTT--CT-C--T--TGA--T-----G--A-A-TT-G-A---AAAAATTT-TTT-C-TCT---AC--ATA--TG--TG-TTATC----GTTAGCAG--------CT--TG--CGTT-C-GCGGATGGGCC
gi|73753 : T-G--TT-----TT--T-T--T--TT--TT-T--T--TGT--TTGTTTG--G-T-TTT--------T--TTT-TTT-T-TTT---AC--ATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT-C-GCG
gi|73754 : T-----TT--G-T--T--TT-----T--T--TGT--T-----T--G-T-TTGG-T---TTT--TTTTTTT-T-TTT---ACA-ATA--CG--TGTTTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG----TT-C-GCGG
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 33 222 88 22 1 33 22 3 3 4444444 1 33 555 22 33 1 33 1 22 44 33 2222 33 1 33 33 11 11 11 333 55555 11 1 1 4 444 44 1 33 11 1 5555 1 1 444444 22 33 1 1 1
lowQualScore : .. ... .. .. . .. .. . . ....... . .. ... .. .. . .. . .. .. .. .... .. . .. .. .. .. .. ... ..... .. . . . ... .. . .. .. . .... . . ...... .. .. . . .
lowQualScore : 88 888 66 22 6 88 11 1 0 8888888 5 55 222 00 55 4 33 4 99 77 33 9999 33 4 33 33 99 99 99 888 66666 99 4 4 1 888 77 4 33 99 4 7777 4 4 000000 00 55 5 5 6
consensus : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTN-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-N-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
Reference ( family-638 ) : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTN-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-N-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73726 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73727 : GAAAAT--A---TCC--TT--G-AA-----G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TT--TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGA
gi|73728 : GAAAAT--------C--CT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----TG-CTAT--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TTG-TTT-C-TTA---AC--A-TA--CGGTCG-TTA-C----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGG
gi|73729 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--AAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GGT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-CTC-GC-GGACGGGCC
gi|73730 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---G----TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--TG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTT-GC-GGACGGGC
gi|73731 : GAAATT--T---TCCG-TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--AATCGAT-----C-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--ATT-TTTGA---GTT--TTT-C-----------------TA--TG--TG-TTACCTGTTTTTAA-AGACATGGCGCT--TG--G-TTG-GC-GGACGG
gi|73732 : GAAAAT--G---TCC--TT--G-AA--C--G-T-ACATTGTAT-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GGT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACA----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73733 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--GT-TTC-T--T--T----T--CT-C--T--TGCCGT--G--A-A-TTTGA-----C--TTT-TTT-C-TTT---AT--A-CA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TA--C-TTC-GC-GGACGGGC
gi|73734 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-A--T---C--GG--GAT-G--AT-TGC-T--T--T----T--CT-C--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA---CTT--TTT-TT----TTT---AC--A-CA--CG--TG-TTACT----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GAACAGGCC
gi|73735 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-A--T---A--GA--GAT-G--AT-ATC-T--A--T----T--CT-C--T--TGC--T--G--A-AATTTAC---GTT--TT---TT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TCACC----TTTAG-AT-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73736 : GAAAAT--T---TTC--TT--G-AAA-C--G-T-A-------T-A--T---C--CA--GAG-G--AT-TTC-T--T--T----T--CT-C--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA---CTT--TTT-TTT-C-TTC---AC--A-CA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACAGGCC
gi|73737 : GAAATT--T---TCT--TC--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AA-TTC-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA--------CTT-TTT-C-TTT---GC--C-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GT-GGACGGGCC
gi|73738 : GAAAAT--T---TCCA-TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTT-TG-T--T----T--TC-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGAA--GTT--TTT-T---C-ATT---AC--AATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------C---TG--C-TTC-GC-GGACCGGCC
gi|73739 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---A--GA--GAT-G--AT-TTC-T--T--T----T--CT-G--T--TGC--T--A--A-A-TTTGACGGGTT--TTT-------TTA---AC--A-CA--CG--TG-TTACC----TTTCG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGGCGGGCC
gi|73740 : GAAAAT--T---TCCA-TT--G-AA--CTGG-TGA-------T-G--T---A--GA--GAT-GC-AT-TTC-T--T--T----T--CT-C--T--TGT--T-----A-A-TTTGA-----C--TTT-TTT-C-TTT---ACCAA-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT--GCGGGGCGGGCC
gi|73741 : GAGATT--T---TCC--TTTTG-AA--C--G-T-A-------T-GG-T---C--GA--GAT-G--AT-TTGGTA-T--T----T--CT-TATTCGTGC--T--A--A-T-TTTGC---GTT--TTT-TGC-A-TTT---AC--A-TACGCG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------TT--TGGCT-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73742 : GGAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G----------------------------------------------------C--T--G--A-A-TTTGA-----C--TTT-TTT-CGTTT---AC--A-TA--TA--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC--GACGGGCC
gi|73743 : GAAAATATT---TTC--TT--G-AA--C--G-TCA-------T-GAATAAACAGAA--AAT-T--AT-TTC-TCCT--T----T--CT-G--T--TGC--TTAA--A-G-TATGA----CA--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-CA--CA--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTT-GC-GGGTGGGCC
gi|73744 : GAAAATA-T---TCCA-TT--G-AAACC--GAT-A-------T----T---C--GA--GATTG--AT-T-G-T--T--T----T--CT-T--T---GC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TTT-CCTGC-TTTTACAC--A-TA--CA--GG-GTACC----TTTAG-AG-C------CT--GC--C-TTCAGC-GGACGGGCC
gi|73745 : GAAAAC--TGTATCT--TT--G-AA--C----T-A-------T-G--T---C--G---GAT-G--AA-TTC-T--T--T----T--CT-C--T---GC--A--G--A-A-TTTGA---CCT--CTT-TTT-C-TTC---AC--A--A--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--T---C-TTC-
gi|73746 : GAAATT--T---TTC--TT--G-AA--C--G-T-A-------A-T--T---C--GA--TAT-----T-TTT-T--T--T----TGCCT-TA-T--TGC--T--G----T-TTTGA---CTT--TTT-TTT-CATTT---ACA-A-TA--CG--TG-TTACCT---TTTAG-AG-C------CT--T
gi|73747 : AAAAT--T-----C--TT--G-AA--C--GGT-A-------T-G--T---C---A--G-T-G--AT-T-G-T--T--T----T--CT-T--T--GCC--T--G--A-T-TGTTT---CTT--TTT-TGT-CATTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACCT---TTTAG-A--C------CTTATG--C-TT
gi|73748 : AAAAT--T---TCCACTT--GTAA--C--G-T-A-------TCG--TATGT--GA--G-T-G--ATCTTC-T--T--TATATT--CT-G--TG-TGC--T--G--A-A-TTTGAC--GTT--TTT-----C-TTT---AC--A-CAG-TG--TG-TAACC----TTTAG-AG-C------CT--TGC-C-TTC-GC-
gi|73749 : AAAT--T---TCA--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---T--GG--GAT-G--AT-TTA-T--T--T----T--GT-C--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA-----C--TGT-TTT-C-TTT---AC--A-CA--TG--TG-TTACC----TTTAG-AG-T------CT--TG--C-TTC-GC-GAA--GGCC
gi|73750 : T--T---TTC--TT--G-CA--C--G-T-T-------T-T--C---C--GA--GAT-G--AT-TCT-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--GGAA-T-TCTGA----CT--TTT-TTT-C-TT--------A-T---CT--TG-TTTCC----TCTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-
gi|73751 : --G-T-A-------T-G--T---A--GA--GAT-T--AT-CTC-T--T----------CT-T--T--TGC--C--G--A-T-TTTG------T--CTT-GTC-C-CTT---GC--A-CA--CA--CG-TTACC----TTTAG-AG-C------C
gi|73752 : -A-------T-G--T---C--AAA-GAT-GGAAT-TTT-C--TGGT----T--CT-C--T--TGA--T--G--A-A-TT-GA---AAAAATTT-TTT-C-TCT---AC--A-TA--TG--TG-TTATC----GTTAGCAG--------CT--TG--CGTTC-GC-GGATGGGCC
gi|73753 : T-G--TT-TTT-T--T--T----T--TT-T--T--TGT--T--T----G-TTTG----GTT--TTT-TTT-T-TTTTTTAC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-
gi|73754 : T-G--TT-TTT-T--TG-T----T--TT-T--T--TGT--T--T--G-T-TTGGT---TTT--TTTTTTT-T-TTT---ACA-A-TA--CG--TGTTTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG----TTC-GC-GG
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 33 222 88 22 1 33 22 3 3 4444444 1 33 555 22 33 1 33 1 22 44 33 2222 33 1 33 33 11 11 11 333 55555 11 1 1 4 444 44 1 33 11 1 5555 1 1 444444 22 33 1 1 1
lowQualScore : .. ... .. .. . .. .. . . ....... . .. ... .. .. . .. . .. .. .. .... .. . .. .. .. .. .. ... ..... .. . . . ... .. . .. .. . .... . . ...... .. .. . . .
lowQualScore : 88 888 66 22 6 88 11 1 0 8888888 5 55 222 00 55 4 33 4 99 77 33 9999 33 4 33 33 99 99 99 888 66666 99 4 4 1 888 77 4 33 99 4 7777 4 4 000000 00 55 5 5 6
consensus : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTN-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-N-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
Reference ( family-638 ) : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTN-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-N-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73726 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73727 : GAAAAT--A---TCC--TT--G-AA-----G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TT--TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGA
gi|73728 : GAAAAT--------C--CT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----TG-CTAT--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TTG-TTT-C-TTA---AC--A-TA--CGGTCG-TTA-C----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGG
gi|73729 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--AAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GGT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-CTC-GC-GGACGGGCC
gi|73730 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---G----TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--TG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTT-GC-GGACGGGC
gi|73731 : GAAATT--T---TCCG-TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--AATCGAT-----C-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--ATT-TTTGA---GTT--TTT-C-----------------TA--TG--TG-TTACCTGTTTTTAA-AGACATGGCGCT--TG--G-TTG-GC-GGACGG
gi|73732 : GAAAAT--G---TCC--TT--G-AA--C--G-T-ACATTGTAT-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GGT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACA----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73733 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--GT-TTC-T--T--T----T--CT-C--T--TGCCGT--G--A-A-TTTGA-----C--TTT-TTT-C-TTT---AT--A-CA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TA--C-TTC-GC-GGACGGGC
gi|73734 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-A--T---C--GG--GAT-G--AT-TGC-T--T--T----T--CT-C--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA---CTT--TTT-TT----TTT---AC--A-CA--CG--TG-TTACT----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GAACAGGCC
gi|73735 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-A--T---A--GA--GAT-G--AT-ATC-T--A--T----T--CT-C--T--TGC--T--G--A-AATTTAC---GTT--TT---TT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TCACC----TTTAG-AT-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73736 : GAAAAT--T---TTC--TT--G-AAA-C--G-T-A-------T-A--T---C--CA--GAG-G--AT-TTC-T--T--T----T--CT-C--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA---CTT--TTT-TTT-C-TTC---AC--A-CA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACAGGCC
gi|73737 : GAAATT--T---TCT--TC--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AA-TTC-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA--------CTT-TTT-C-TTT---GC--C-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GT-GGACGGGCC
gi|73738 : GAAAAT--T---TCCA-TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTT-TG-T--T----T--TC-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGAA--GTT--TTT-T---C-ATT---AC--AATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------C---TG--C-TTC-GC-GGACCGGCC
gi|73739 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---A--GA--GAT-G--AT-TTC-T--T--T----T--CT-G--T--TGC--T--A--A-A-TTTGACGGGTT--TTT-------TTA---AC--A-CA--CG--TG-TTACC----TTTCG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGGCGGGCC
gi|73740 : GAAAAT--T---TCCA-TT--G-AA--CTGG-TGA-------T-G--T---A--GA--GAT-GC-AT-TTC-T--T--T----T--CT-C--T--TGT--T-----A-A-TTTGA-----C--TTT-TTT-C-TTT---ACCAA-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT--GCGGGGCGGGCC
gi|73741 : GAGATT--T---TCC--TTTTG-AA--C--G-T-A-------T-GG-T---C--GA--GAT-G--AT-TTGGTA-T--T----T--CT-TATTCGTGC--T--A--A-T-TTTGC---GTT--TTT-TGC-A-TTT---AC--A-TACGCG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------TT--TGGCT-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73742 : GGAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G----------------------------------------------------C--T--G--A-A-TTTGA-----C--TTT-TTT-CGTTT---AC--A-TA--TA--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC--GACGGGCC
gi|73743 : GAAAATATT---TTC--TT--G-AA--C--G-TCA-------T-GAATAAACAGAA--AAT-T--AT-TTC-TCCT--T----T--CT-G--T--TGC--TTAA--A-G-TATGA----CA--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-CA--CA--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTT-GC-GGGTGGGCC
gi|73744 : GAAAATA-T---TCCA-TT--G-AAACC--GAT-A-------T----T---C--GA--GATTG--AT-T-G-T--T--T----T--CT-T--T---GC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TTT-CCTGC-TTTTACAC--A-TA--CA--GG-GTACC----TTTAG-AG-C------CT--GC--C-TTCAGC-GGACGGGCC
gi|73745 : GAAAAC--TGTATCT--TT--G-AA--C----T-A-------T-G--T---C--G---GAT-G--AA-TTC-T--T--T----T--CT-C--T---GC--A--G--A-A-TTTGA---CCT--CTT-TTT-C-TTC---AC--A--A--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--T---C-TTC-
gi|73746 : GAAATT--T---TTC--TT--G-AA--C--G-T-A-------A-T--T---C--GA--TAT-----T-TTT-T--T--T----TGCCT-TA-T--TGC--T--G----T-TTTGA---CTT--TTT-TTT-CATTT---ACA-A-TA--CG--TG-TTACCT---TTTAG-AG-C------CT--T
gi|73747 : AAAAT--T-----C--TT--G-AA--C--GGT-A-------T-G--T---C---A--G-T-G--AT-T-G-T--T--T----T--CT-T--T--GCC--T--G--A-T-TGTTT---CTT--TTT-TGT-CATTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACCT---TTTAG-A--C------CTTATG--C-TT
gi|73748 : AAAAT--T---TCCACTT--GTAA--C--G-T-A-------TCG--TATGT--GA--G-T-G--ATCTTC-T--T--TATATT--CT-G--TG-TGC--T--G--A-A-TTTGAC--GTT--TTT-----C-TTT---AC--A-CAG-TG--TG-TAACC----TTTAG-AG-C------CT--TGC-C-TTC-GC-
gi|73749 : AAAT--T---TCA--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---T--GG--GAT-G--AT-TTA-T--T--T----T--GT-C--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA-----C--TGT-TTT-C-TTT---AC--A-CA--TG--TG-TTACC----TTTAG-AG-T------CT--TG--C-TTC-GC-GAA--GGCC
gi|73750 : T--T---TTC--TT--G-CA--C--G-T-T-------T-T--C---C--GA--GAT-G--AT-TCT-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--GGAA-T-TCTGA----CT--TTT-TTT-C-TT--------A-T---CT--TG-TTTCC----TCTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-
gi|73751 : --G-T-A-------T-G--T---A--GA--GAT-T--AT-CTC-T--T----------CT-T--T--TGC--C--G--A-T-TTTG------T--CTT-GTC-C-CTT---GC--A-CA--CA--CG-TTACC----TTTAG-AG-C------C
gi|73752 : -A-------T-G--T---C--AAA-GAT-GGAAT-TTT-C--TGGT----T--CT-C--T--TGA--T--G--A-A-TT-GA---AAAAATTT-TTT-C-TCT---AC--A-TA--TG--TG-TTATC----GTTAGCAG--------CT--TG--CGTTC-GC-GGATGGGCC
gi|73753 : T-G--TT-TTT-T--T--T----T--TT-T--T--TGT--T--T----G-TTTG----GTT--TTT-TTT-T-TTTTTTAC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-
gi|73754 : T-G--TT-TTT-T--TG-T----T--TT-T--T--TGT--T--T--G-T-TTGGT---TTT--TTTTTTT-T-TTT---ACA-A-TA--CG--TGTTTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG----TTC-GC-GG
blockSeqs : AT GTA AC TT T AC TG A G CATTGTA C AA AAA AG TC T GA C GG CC GG ATAT GC A AT CG CG TA GA TT CGGGT AA T G G TAC CA A CG GT T TGTT C A ATGGCG TA GC G A G
blockSeqs : A . G . . A . G C . . G ATG . A . C . G G G . G . A G . . . AA AGT . . . A TTT A . G . . T . . . . C . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . T CGT . . . A . A . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A CC . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . G AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTN-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-N-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
finalCons : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTN-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-N-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 33 222 88 22 1 33 22 3 3 4444444 1 33 555 22 33 1 33 1 22 44 33 2222 33 1 33 33 11 11 11 333 55555 11 1 1 4 444 44 1 33 11 1 5555 1 1 444444 22 33 1 1 1
lowQualScore : .. ... .. .. . .. .. . . ....... . .. ... .. .. . .. . .. .. .. .... .. . .. .. .. .. .. ... ..... .. . . . ... .. . .. .. . .... . . ...... .. .. . . .
lowQualScore : 88 888 66 22 6 88 11 1 0 8888888 5 55 222 00 55 4 33 4 99 77 33 9999 33 4 33 33 99 99 99 888 66666 99 4 4 1 888 77 4 33 99 4 7777 4 4 000000 00 55 5 5 6
consensus : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTN-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-N-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
Reference ( family-638 ) : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTN-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-N-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73726 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73727 : GAAAAT--A---TCC--TT--G-AA-----G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TT--TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGA
gi|73728 : GAAAAT--------C--CT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----TG-CTAT--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TTG-TTT-C-TTA---AC--A-TA--CGGTCG-TTA-C----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGG
gi|73729 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--AAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GGT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-CTC-GC-GGACGGGCC
gi|73730 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---G----TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--TG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTT-GC-GGACGGGC
gi|73731 : GAAATT--T---TCCG-TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--AATCGAT-----C-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--ATT-TTTGA---GTT--TTT-C-----------------TA--TG--TG-TTACCTGTTTTTAA-AGACATGGCGCT--TG--G-TTG-GC-GGACGG
gi|73732 : GAAAAT--G---TCC--TT--G-AA--C--G-T-ACATTGTAT-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTG-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGA---GGT--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACA----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73733 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--GT-TTC-T--T--T----T--CT-C--T--TGCCGT--G--A-A-TTTGA-----C--TTT-TTT-C-TTT---AT--A-CA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TA--C-TTC-GC-GGACGGGC
gi|73734 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-A--T---C--GG--GAT-G--AT-TGC-T--T--T----T--CT-C--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA---CTT--TTT-TT----TTT---AC--A-CA--CG--TG-TTACT----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GAACAGGCC
gi|73735 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-A--T---A--GA--GAT-G--AT-ATC-T--A--T----T--CT-C--T--TGC--T--G--A-AATTTAC---GTT--TT---TT-C-TTT---AC--A-TA--CG--TG-TCACC----TTTAG-AT-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73736 : GAAAAT--T---TTC--TT--G-AAA-C--G-T-A-------T-A--T---C--CA--GAG-G--AT-TTC-T--T--T----T--CT-C--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA---CTT--TTT-TTT-C-TTC---AC--A-CA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGACAGGCC
gi|73737 : GAAATT--T---TCT--TC--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AA-TTC-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA--------CTT-TTT-C-TTT---GC--C-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GT-GGACGGGCC
gi|73738 : GAAAAT--T---TCCA-TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---C--GA--GAT-G--AT-TTT-TG-T--T----T--TC-T--T--TGC--T--G--A-T-TTTGAA--GTT--TTT-T---C-ATT---AC--AATA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------C---TG--C-TTC-GC-GGACCGGCC
gi|73739 : GAAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---A--GA--GAT-G--AT-TTC-T--T--T----T--CT-G--T--TGC--T--A--A-A-TTTGACGGGTT--TTT-------TTA---AC--A-CA--CG--TG-TTACC----TTTCG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-GGGCGGGCC
gi|73740 : GAAAAT--T---TCCA-TT--G-AA--CTGG-TGA-------T-G--T---A--GA--GAT-GC-AT-TTC-T--T--T----T--CT-C--T--TGT--T-----A-A-TTTGA-----C--TTT-TTT-C-TTT---ACCAA-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TT--GCGGGGCGGGCC
gi|73741 : GAGATT--T---TCC--TTTTG-AA--C--G-T-A-------T-GG-T---C--GA--GAT-G--AT-TTGGTA-T--T----T--CT-TATTCGTGC--T--A--A-T-TTTGC---GTT--TTT-TGC-A-TTT---AC--A-TACGCG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------TT--TGGCT-TTC-GC-GGACGGGCC
gi|73742 : GGAAAT--T---TCC--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G----------------------------------------------------C--T--G--A-A-TTTGA-----C--TTT-TTT-CGTTT---AC--A-TA--TA--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC--GACGGGCC
gi|73743 : GAAAATATT---TTC--TT--G-AA--C--G-TCA-------T-GAATAAACAGAA--AAT-T--AT-TTC-TCCT--T----T--CT-G--T--TGC--TTAA--A-G-TATGA----CA--TTT-TTT-C-TTT---AC--A-CA--CA--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTT-GC-GGGTGGGCC
gi|73744 : GAAAATA-T---TCCA-TT--G-AAACC--GAT-A-------T----T---C--GA--GATTG--AT-T-G-T--T--T----T--CT-T--T---GC--T--G--A-T-TTTGA---GTT--TTT-CCTGC-TTTTACAC--A-TA--CA--GG-GTACC----TTTAG-AG-C------CT--GC--C-TTCAGC-GGACGGGCC
gi|73745 : GAAAAC--TGTATCT--TT--G-AA--C----T-A-------T-G--T---C--G---GAT-G--AA-TTC-T--T--T----T--CT-C--T---GC--A--G--A-A-TTTGA---CCT--CTT-TTT-C-TTC---AC--A--A--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--T---C-TTC-
gi|73746 : GAAATT--T---TTC--TT--G-AA--C--G-T-A-------A-T--T---C--GA--TAT-----T-TTT-T--T--T----TGCCT-TA-T--TGC--T--G----T-TTTGA---CTT--TTT-TTT-CATTT---ACA-A-TA--CG--TG-TTACCT---TTTAG-AG-C------CT--T
gi|73747 : AAAAT--T-----C--TT--G-AA--C--GGT-A-------T-G--T---C---A--G-T-G--AT-T-G-T--T--T----T--CT-T--T--GCC--T--G--A-T-TGTTT---CTT--TTT-TGT-CATTT---AC--A-TA--CG--TG-TTACCT---TTTAG-A--C------CTTATG--C-TT
gi|73748 : AAAAT--T---TCCACTT--GTAA--C--G-T-A-------TCG--TATGT--GA--G-T-G--ATCTTC-T--T--TATATT--CT-G--TG-TGC--T--G--A-A-TTTGAC--GTT--TTT-----C-TTT---AC--A-CAG-TG--TG-TAACC----TTTAG-AG-C------CT--TGC-C-TTC-GC-
gi|73749 : AAAT--T---TCA--TT--G-AA--C--G-T-A-------T-G--T---T--GG--GAT-G--AT-TTA-T--T--T----T--GT-C--T--TGC--T--G--A-A-TTTGA-----C--TGT-TTT-C-TTT---AC--A-CA--TG--TG-TTACC----TTTAG-AG-T------CT--TG--C-TTC-GC-GAA--GGCC
gi|73750 : T--T---TTC--TT--G-CA--C--G-T-T-------T-T--C---C--GA--GAT-G--AT-TCT-T--T--T----T--CT-T--T--TGC--T--GGAA-T-TCTGA----CT--TTT-TTT-C-TT--------A-T---CT--TG-TTTCC----TCTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-
gi|73751 : --G-T-A-------T-G--T---A--GA--GAT-T--AT-CTC-T--T----------CT-T--T--TGC--C--G--A-T-TTTG------T--CTT-GTC-C-CTT---GC--A-CA--CA--CG-TTACC----TTTAG-AG-C------C
gi|73752 : -A-------T-G--T---C--AAA-GAT-GGAAT-TTT-C--TGGT----T--CT-C--T--TGA--T--G--A-A-TT-GA---AAAAATTT-TTT-C-TCT---AC--A-TA--TG--TG-TTATC----GTTAGCAG--------CT--TG--CGTTC-GC-GGATGGGCC
gi|73753 : T-G--TT-TTT-T--T--T----T--TT-T--T--TGT--T--T----G-TTTG----GTT--TTT-TTT-T-TTTTTTAC--A-TA--CG--TG-TTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG--C-TTC-GC-
gi|73754 : T-G--TT-TTT-T--TG-T----T--TT-T--T--TGT--T--T--G-T-TTGGT---TTT--TTTTTTT-T-TTT---ACA-A-TA--CG--TGTTTACC----TTTAG-AG-C------CT--TG----TTC-GC-GG