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lowQualScore                  :       .. .       .       ...... .   . ..  ... .  .......................... .  .   .  . .  .   .     .. .. .    . .......    .... .    .       ......   ....  . .. .    ...........       ... ..  ... .   . ....    ....    ..  .  .   ...... ....   . .  .   .       ...... . ..  . ..........   ....    ............     .  ..  . . . .   ..       
lowQualScore                  :       55 0       9       222222 8   8 55  000 3  66666666666666666666666666 8  7   7  2 7  6   6     22 22 6    2 9999999    4444 6    2       666666   4444  8 55 8    55555555555       999 66  777 8   8 4444    9999    44  7  7   777777 7777   7 0  0   0       111111 1 99  2 8888888888   5555    999999999999     2  11  2 4 4 4   22       
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Reference ( gi|98036 )        : CATAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CCGT--------T-AC---T---A---T--G-TA-AAC-AA-T-GG-AGG-AAATT--C--G-AACC-A-----T-GAAT----A-AATA-TTTTTCT------CCA-A--CA-T--A-TGTC----------CTCTCTTTTC-A--CA--CT-TTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGA----TTAC-----T------AATTT-AT--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
gi|98037                      : CATAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CCGT--------T-AC---T---A---T--G-TA-AAC-AA-T-GG-AGG-AAATT--C--G-AACC-A-----T-GAAT----A-AAAT-TTTTTCT------CCA-A--CA-T--A-TGTC----------CTCTCTTTTC-A--CA--CT-TTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGA----TTAC-----T------AATTT-AT--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
gi|98039                      : CATGGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CTGT--------T-AC---T---A---TATG-TA-AAC-AA-T-GT-AGG-AAATT--C--G-AACC-A-----C-GAAT----A-AATA-TTTTTCT------CCA-A--CA-T--A-TGTC----------ATCACTTTTC-A--CA--CT-TTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-AGTAC-A-----T----AGA----TTAC-----C------AATTT-GT--TC-A-C-G-TTT--TAAACAA
gi|98042                      : CATAAGAGC-ACCTGGG-TCAACGA------T-ATT-G--CA---CTGT--------T-AC---T---A---TA-G-TA---C-AA-T-GG-AGG-AAATT--C--G-AACC-A-----T-GAAT----A-AA-A-TTTTAGT------CCA-A--CA-T--A-TGCC----------ATCTCTTT-C-A--CA--TT-TTT-T----CATG----TTTC--AG-TA-AGC------T----TAA-C-TACCAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGG----TTAC-----T------AATTT-AT--TCAA-C-T-TTT--TAAAAA
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gi|98040                      : CACAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---TTATAAATTTATT-AC---T---A---TATG-TA-AAC-AAAT-GG-AGG-ATATT--C--G-AACT-A-----T-GAAT----A------TTTTTCT------CCA-T--TC-T--A-TGCT----------ATCTTTTTTC-A--CA--CT-TTT-T----CGTG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCCT------T-A--TC-A-----TAATCAGA----TTAC-----T------AATTT-AT--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
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gi|98047                      : CATAGGGGC-GCCTGG--TCAAGGG------T-ATTTG--CAATACCGT--------T-AC---T---AATAT--G-TA-AAC-AA-T-GG-AGA-AAATT--C--GCAACC-A-----C-GGAT----A-AA-A-TTTTTATAATAAACAA-A--CA-TCAG-TGTG----------ATCTCTTTTA-AAGCA---T-TTT-T----CATGGGTCTTGC--AG-GATAGCCATTGTT----TAT-CTTA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----TG---AGA----TTAC-----A------AATTT-ATGGCC-A-C-G-TTT--
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Alignments
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Reference ( family-635 )      : CATAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CCGT--------T-AC---T---A---T--G-TA-AAC-AA-TG-G-AGG-AAATT--C--G-AACC-A--C-GAATA-AATA---------TTTTTCT------CCA-AC--A-T--A-T-GTC----------GTCTCTTTTC-A--CA--TTTTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGATTAC-----T------AAT-TT-A---T--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
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gi|98039                      : CATGGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CTGT--------T-AC---T---A---TATG-TA-AAC-AA-TG-T-AGG-AAATT--C--G-AACC-A--C-GAATA-AATA---------TTTTTCT------CCA-AC--A-T--A-T-GTC----------ATCACTTTTC-A--CA--CTTTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-AGTAC-A-----T----AGATTAC-----C------AAT-TT-G---T--TC-A-C-G-TTT--TAAACAA
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blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TGTAT          .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . T        .    .               .        .  C    .  . .   A                  T  .   T      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          T              .  . .   .   . . . .   . 
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TATAT          .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . T        .    .               .        .  A    .  . .   G                  T  .   T      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          A              .  . .   .   . . . .   . 
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TATAT          .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . C        .    .               .        .  A    .  . .   A                  C  .   T      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          T              .  . .   .   . . . .   . 
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TATAT          .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . C        .    .               .        .  G    .  . .   G                  C  .   C      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          T              .  . .   .   . . . .   . 
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TATA           .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . T        .    .               .        .  A    .  . .   G                  C  .   T      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          T              .  . .   .   . . . .   . 
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TATA           .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . C        .    .               .        .  A    .  . .   C                  T  .   T      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          A              .  . .   .   . . . .   . 
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TAAT           .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . C        .    .               .        .  C    .  . .   A                  G  .   T      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          T              .  . .   .   . . . .   . 
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TAT            .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . T        .    .               .        .  A    .  . .   G                  C  .   T      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          T              .  . .   .   . . . .   . 
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TAT            .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . A        .    .               .        .  A    .  . .   A                  C  .   T      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          C              .  . .   .   . . . .   . 
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TAT            .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . C        .    .               .        .  A    .  . .   A                  .  .   T      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          A              .  . .   .   .           
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TAA            .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . T        .    .               .        .  C    .  . .   A                  .  .   .      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .       .      . .   . .     .          .              .                        
blockSeqs                     :       .  .       .       .      .   . .   .      .        .  TAT            .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . T        .    .               .        .  A    .  . .   A                  .  .   .      . .       .       .   .  .   .      .      . .  .   .                                                                               
blockSeqs                     :                  .       .      .   . .   .      .        .  AT             .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . T        .    .               .        .  .    .  . .   C                  .  .   .      . .       .       .   .  .   .      .      .                                                                                        
blockSeqs                     :                          .      .   . .   .      .        .  AT             .  .   .  .  . .   .     .  .  .    . .        .    .               .        .  .    .                                  .      . .       .       .   .  .   .      .      .                                                                                        
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blockSeqCons                  :                                                              TATAT*********
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Alignments
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lowQualScore                  :       77 1       1       555555 1   1 22  333 1  22222222 1 66666 3 1 1    1     1  5  1    1     22 22 1    3 9999     1    777777777       444444   3  3333 22 1 1   33333333333        22 22  666    1 3333    3333    22  1  1   666666 3333   1 1  1   1       555555 2 22  4 55555 6666       111111111111   2  2 333 22  2 2 2 2   33       
lowQualScore                  :       .. .       .       ...... .   . ..  ... .  ........ . ..... . . .    .     .  .  .    .     .. .. .    . ....     .    .........       ......   .  .... .. . .   ...........        .. ..  ...    . ....    ....    ..  .  .   ...... ....   . .  .   .       ...... . ..  . ..... ....       ............   .  . ... ..  . . . .   ..       
lowQualScore                  :       11 9       8       000000 7   7 44  000 2  66666666 7 11111 5 7 7    7     7  2  7    7     22 22 6    2 1111     6    777777777       444444   5  1111 44 8 8   00000000000        00 55  555    7 7777    7777    33  7  7   555555 5555   7 9  9   9       888888 0 88  0 00000 2222       999999999999   0  1 777 99  1 2 2 2   11       
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Reference ( family-635 )      : CATAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CCGT--------T-A-----C-T-A-TATG-TAAAC-AA-TG-GAGG-AAATT--C--G-AACC-A--C-GAATA-AATA---------TTTTTCT------CCA-AC--A-T--A-T-GTC----------GTCTCTTTTC-A--CA--TTTTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGATTAC-----T------AAT-TT-A---T--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
gi|98036                      : CATAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CCGT--------T-A-----C-T-A-T--G-TAAAC-AA-TG-GAGG-AAATT--C--G-AACC-A--T-GAATA-AATA---------TTTTTCT------CCA-AC--A-T--A-T-GTC----------CTCTCTTTTC-A--CA--CTTTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGATTAC-----T------AAT-TT-A---T--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
gi|98037                      : CATAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CCGT--------T-A-----C-T-A-T--G-TAAAC-AA-TG-GAGG-AAATT--C--G-AACC-A--T-GAATA-AAAT---------TTTTTCT------CCA-AC--A-T--A-T-GTC----------CTCTCTTTTC-A--CA--CTTTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGATTAC-----T------AAT-TT-A---T--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
gi|98038                      : CATAGG--T-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CCGT--------T-A-----C-T-A-TATG-TAAAC-AA-TT-GAGG-AAAC-------------------AATA-TATA---------TTATTTT------CC
gi|98039                      : CATGGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CTGT--------T-A-----C-T-A-TATG-TAAAC-AA-TG-TAGG-AAATT--C--G-AACC-A--C-GAATA-AATA---------TTTTTCT------CCA-AC--A-T--A-T-GTC----------ATCACTTTTC-A--CA--CTTTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-AGTAC-A-----T----AGATTAC-----C------AAT-TT-G---T--TC-A-C-G-TTT--TAAACAA
gi|98040                      : CACAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---TTATAAATTTATT-A-----C-T-A-TATG-TAAAC-AAATG-GAGG-ATATT--C--G-AACT-A--T-GAATA--------------TTTTTCT------CCA-TT--C-T--A-T-GCT----------ATCTTTTTTC-A--CA--CTTTT-T----CGTG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCCT------T-A--TC-A-----TAATCAGATTAC-----T------AAT-TT-A---T--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
gi|98041                      : CATAAG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---TTATAAATTTATT-A-----C-T-A-TATG-TAAAC-AAATG-GAGG-ATATT--C--G-AACT-A--T-------AATA---------TTTT-CT------C-A-TT--C-T--A-T-GCT----------ATCT-TTTTC-A--CA--CTTTT-T----CGTG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TA--C-TA-CAT-GTGTCCT------T-A--TC-AATAATC----AGATTAC-----T------AAT-TT-A---T--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
gi|98042                      : CATAAGAGC-ACCTGGG-TCAACGA------T-ATT-G--CA---CTGT--------T-A-----C-T-A-TA-G-TA--C-AA-TG-GAGG-AAATT--C--G-AACC-A--T-GAATA-AA-A---------TTTTAGT------CCA-AC--A-T--A-T-GCC----------ATCTCTTT-C-A--CA--TTTTT-T----CATG----TTTC--AG-TA-AGC------T----TAA-C-TACCAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGGTTAC-----T------AAT-TT-A---T--TCAA-C-T-TTT--TAAAAA
gi|98043                      : CATAGG--C-ACCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-GGCCA---CTGT--------T-A-----C-T-A-TA-G-TACCC-AA-TG-GGAG-GAATT--C--G-AACCCA--T-GAATA-AATA---------TTTTTAA------TCA-AC--A-T--A-T-GCC----------ATCTC--TTCAA--CA--TTTTT-T----CATG----TTTC--AG-TA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GGTTCAT------TCA--CCAA-----T----AG-TTAC-----T------AAT-TTAA---T--CA-A-C-G-TTT--TAAAAAA
gi|98044                      : CATTGG--T-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CTGT--------T-A-----C-T-A-TATG-
gi|98045                      : CATAGG--C-GTCTGGG-TAAAGGC------T-ATT-G--CA---TTGC--------T-A-----C-T-G-TATG-TACAC-AA-TG-GAGG-AAATT--C--G-AAAC-A--T-GAATA-CATA---------TTTTTCT------CCA-AC--C-T--T-T-GTT----------ATCTCTTTTC-A--CAGCTTTTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TTA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGATTGC-----T------AAT-TT-A---T--CC-gtaggaaaa
gi|98046                      : CATAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------TAATT-G---A---CCGT--------T-A-----C-TGA-GATGTTAAAC-AA-T--GAGG-AAATT--T--G-CACCTA--CGGAATA-AATAG--------TTGTTCT------CCA-AC--ATT--A-T-GGT----------GTATCTCTT--A--C---TGTTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAT-C-TA-CATCGTGTCAT------T-A--CCAA-----T----AGATTACAAA--TTTTTGAAAT-TT-A---T--CC-A-C-GTTTT--TAAAAAA
gi|98047                      : CATAGGGGC-GCCTGG--TCAAGGG------T-ATTTG--CAATACCGT--------T-A-----C-T-AATATG-TAAAC-AA-TG-GAGA-AAATT--C--GCAACC-A--C-GGATA-AA-A---------TTTTTATAATAAACAA-AC--A-TCAG-T-GTG----------ATCTCTTTTA-AAGCA---TTTT-T----CATGGGTCTTGC--AG-GATAGCCATTGTT----TAT-CTTA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----TG---AGATTAC-----A------AAT-TT-A---TGGCC-A-C-G-TTT--
gi|98048                      : CATAGGG-C-GCCTGGG-TCAATGA------T-ATT-G--CA---CTAT--------A-A-----CCT-A-CATG-TAAAC-AA-CAAGAGG-AAATT--C--G-AACC-A--C-GATTA-AAT----------CTTTTCT------CCATTC--A----A-T-ATT----------GTCTCTTTGT-A--CA---TTTT-T----CATG----TTTCCAGG-GA-AG-------T----TAATT-TA-CAC-GT
gi|98049                      : CATAGG--C-GCCTAGG-TCAAGGA------T-ATT-A--CA---CTAT--------A-AC----C-C-A-CATG-TAAAC-AA-TG-GAGA-AAA-T--CAGG-AATC-AGTG-GGATGCAATA---------TTTTTTT------TAA-AC--G-T--
gi|98050                      : CATAGG--CCGCCTGGG-TCAATGA------T-ATT-G--CA-----GC--------T-ATAGACC-T-A-CATG-TAAAC-AACTA-GAGG-AAATT--C--G-AACC-AA-C-GATTA-AATAAAAAAATAGTTTTTCT------CCATTC--A----A-T-ATT----------GTCTCTTTGT-A--CAT-TTTTT-T----CATG----TTTC--AGTGA-AGC------T----TAA-
gi|98051                      :  ATAGG--C-GCCTGGG-TCAAGGA------T-ATT-G--CA---CCGT--------T-A-----C-T-A-TATG-TAAAC-AA-TG-GAGG-AAATT--C--G-AACC-A--T-GAATA-AATA---------TTTTTCT------CCA-TC--A-T--A----TC----------CACTCTTTTC-A--CA--TTTTT-T----CATG----TGTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----GGATTAC-----T------AAT-TT-A---T--CC-A-C-G-TTT--AAAAAAA
gi|98052                      :  ATAGG--C-GCCTGG--TCA-GGA------T-AT------G---CCGT--------TCA-----C-T-A--ATG-TAAAC-AA-TG-GAGG-AAATT--C--G-ACCC-A----GAATA-AATA---------TTTTT-T------CCA---------------TC----------ATCCTCTTTC-A--CA---TTTT-T----CATG-----TTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GT-TCAT------T-A--CC-A-----T----GGATT-C-----T------AAT-TT-A---T--CC-AGC-G-TTT--AAAAAAA
gi|98053                      :  ATAGG--C-GCCAGGG-TCAAGGGCACTAGT-ACT-G--CA---CTAT--------A-A-----CCT-A-TATG-TAAAC-AA-TG-GAG------------------------GGATA-AATA---------TTTCTCC------CGA-AT--C-T--A-C-GTC----------GTCTCT-------------------------TG----TTCC--AG-GC-TACA-----T----CAA-C--A-TGT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----C----AGA----------------AATCTT-AAATT--CC-A-CTG-GTT--TAA
gi|98054                      :   TAGG--C-ACCTGGG-TCAAGAA------T-ATT-G--CA---CTGT--------T-A-----C-T-A-TATG-TAAACAAA-TG-GAGG-AAATT--C--G-AACC-A--C-GA--A-GATA---------CTTTTTT------ttaagtagaaaa
gi|98055                      :   TAGG--C-ACCTGGG-TCAAGAA------T-ATT-G--CA---CTTT--------T-------C-T-A-TATG-TAACA-AA-T--GAGG-AAATT--C--G-AACC-A--C-GA--A-GATA---------CTTTTTT------
gi|98056                      :      G--T-GCCTGGGATCAAGGA------T-ATT-G--CA---CTG-----------A-----C-T-A-AA----AAAC-AA-TG-GAGGGAAATT--C--G-AACC-A--T-GAATA-AATA-----------TTTAT------CCA-AC--A-T--ATT-GTCA---------GTCTCTT-----------TTTTA-A----CATG-----TTC--AG-GA-AGC------T----TAA-
gi|98057                      :            CCTGGG-TCAAGGA------T-A-------------------------------C-T-A-TATG-TATAA-AA-TG-GTGG-AAATT--C--G-AGCC-A--A-GAATA-AATA---------TTTTTCT------CCA-A-----T--A-T-GTC----------ATCTCTT--C-A--CA--CTTTT-C----CTTG----TTTC--AG-GA-AGC------T----AAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----C----AGATTAC-----T------AAT-TT-A---T--TC-A-C-G-TTT--TAAAAAA
gi|98058                      :                        GA------T-ATT-G--CA---CCGT--------T-G-----C-T-A-TATG-TAAAC-AA-TG-GAGG-AAATT--C--G-AACC-A--C-GAATA-AATA---------TTTTTCT------CCA-AC--A-T--A-T-GTC----------ATCTCTTTTT-A--CA--TTTTT-T----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCATTAGATCT-A--CC-A-----T----AGATTAC-----A------AAT-T
gi|98059                      :                                                                              AAAC-AA-TG-GAGG-AAATT--C--G-AACC-A--T-GAATG--------------TGGTTCT------CCA-ATCTA-T--A-TTGTCATTTATTATTGTCTCTTTTG-A--TA--TTTTG-T----CGTG----TTTA--AG-GA-AGC------T----TAA-T-TA-CAC-ATGTCAT------T-A--CC-A-----C----AGAATAC-----T------AAT-TT-G---T--CC-A-C-G-TTT--AAAAAAA
gi|98060                      :                                                                                        -GAGG-AA-TT--C--G-AACC-A--T-GAATA-AATA---------TTTTTAT------CCA-AC--A-T--A-T-GTC----------ATCTCCT-----------TTTTA-A----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------T----TAA-
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gi|98062                      :                                                                                 aggaaattgcactgAATTTAC--N-AACC-A--T-GAATA-AATA---------TTTTTCT------CCA-TC--A-T--A-T---C----------CACTCTTTTC-A--CA--TTTTT-T----CATG----TGTC--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----GGATTAC-----T------AAT-TT-A---T--CC-A-C-G-TTT--AAAAAAA
gi|98063                      :                                                                                                                                                                                                 A--TTTTTAT----CATG----TTTC--AG-GA-AGC------TAAATTAA-G-TA-CAC-GTTTCAT------T-A--CC-A-----C----AGAATAC-----C------ATT-TT-A---T--CC-A-C-G-TTTAATAAAAA
gi|98064                      :                                                                                                                                                                                                                          C--AG-GA-AGC------T----TAA-C-TA-CAT-GTGTCAT------T-A--CC-A-----T----AGATTAC-----A------AA-----A---T--CC-A-C-G-TTT--TAAAAAA