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Reference ( family-634 ) : AAAGCC-ATAGGCT-CTNGN-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TT-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--C----C--------G----------AA------CAG-TATC-C--A-A--G--AAGA-AA---C-CT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT-A-A---A----------AACAA-A-AC-AAC--A--A--CA-T------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-AC--TTA-C-GCA-T--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATTG
gi|68001 : AAAGCC-GTAGGCT-CTTGT-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TT-ACAA--AA-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--C----C--------G----------AA------CAG-TATC-C--A-A--G--AAGA-AA---C-CT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AC-T------A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-TAAAT---A---A----------AAC-A-A-AC-AAC--A--A--CA-T------T-TT---GA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-AC--TTA-C-GCA-T--ATATCTA--A-TC-A-T-AAGATTG
gi|68002 : AAAGCC-ATAGGCT-GTAGG-CGTC-G-T-GA--TCGCCTGA-T-TT-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--C----C--------G----------AG------CAG-TATC-C--A-A--G--AAGA-AA---C-CT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-T-T-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAATGA-A---A----------AACAACA-AC-AAC--A--A--CA-G------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-AC--TTA-C-GCA-T--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATTG
gi|68003 : AAAGGC-ACAAGCA-CTTGT-GATC-G-T-GG--TTGCTTTA-T-TT-ACAA--AA-T-AAA-C-------------------A-AAA----C--A--C----C--------G----------AA------CAG-TATC-C--A-A--G--AAGA-AA---C-CT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AA-TGA-A-TC------AA-TA-T-A-A-CT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT---A---A----------AACAA-A-G--AAC--A--A--TA-T------T-TT---AA-AT--G--GG---T-TTCGA--TT-AC--TTA-C-GCA-TA-G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATT
gi|68004 : AAAGCC-ATAGGCT-CTTGTTCATCCG-TTGA--TCGCTTGA-T-T--ACAA--AAAT-AAA-C-------------------A-AAAA---A--A--C----C--------G----------AA------CAGTTATC-A--A-A--G--AA-A-AA---C-CT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--CG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A-ATTT--TT---T---C---A--TT-TT-GAGAA-GC-T-AAAAT-A-A---A----------AACAA-A-AC-AAC--A--A--CA-TTG----T-TT---AA-AT--A--TG---T-TTCGA--TT-AC---TA-CGGCA-TAAG-ATCTA--ATTC-ACC-AAGATTG
gi|68005 : AAAGGC-ATAGGCT-CTTGT-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TT-ACAA--AA-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--C----C--------G----------AA------CAG-TATC-C--A-A--G--AAGA-AA---C-CT-C-C---TCAATAC-A---AAGTAG-T-TTTTCTGA--AT-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TA------TA-TA-T-A-A-AT--TT---T---C---A--TT-TT-AAG-A-GC-T-AAAGT---A---A----------AAC-A-A-AC-AGC--A--A--CA-T------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-AC--TTA-C-GCA-TTAG-ATATATTA-TC-A-C--AGAT
gi|68006 : AAAATC-AT-GGCT-CTAGG-CATC-G-T-GG--TCGCTTGC-C-TT-ACATTTAG-T-AAA-C-------------------G-AAA----A--A--G----C--------G----------AA------CAG-CATT-C--A-A--G--AAGA-AA---C-TT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT---A---A----------AAC-A-A-AC-AAC--A--A--CATT------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--AT-CC--TTT-C-GCA-T--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATTG
gi|68007 : AAAGCC-ATAGGCTTCTTGT-CATC-G-T-GA--TCGTTTGA-T-TT-ACAA--AA-TAAAA-C-------------------A-AAA----A--A-------C--------G----------AA------CAG-TATCTC--A-A--G--AAG--AA---C-GT-CAC---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGAATTA-------T-TC--C------A--------TCA-A-T---T----G-TGA-A-TC------AATTA-T-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A--C-T-AAAAT-A-A---A----------CACAA-ACAC-AA----------A-T------T-T-------AT------G---T-TCCGATTTT-AC--TTACC-GCA-TA-G-ATCT---A-TC-A-C-AAGATTG
gi|68008 : AAAGTC-ATAGGCC-ATAG--CA-C-G-T-GG--TCGCTT---C-TA-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--------------------------------------CAG-CATT-C--A-A--T--AAGA-AG---C-TT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------TCACA-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-A-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-T---AG-A-GC-T-AAAATAA-A---A----------AACAA-A-AC-AAC--A--A--CA--------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT--C--CTA-C-GCATT--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAG
gi|68009 : AAAGTC-ATAGGCC-ATAG--CA-C-GCT-GG--T-GCTTGT-C-TA-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--C---------------------------------AG-CATT-C--A-A--T--AAGA-AG---C-TTTC-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TCA-AG-TGA-A-TC------AA-TA-TAA-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-TAG-A-GC-T-AAAAT-------A----------AAC---A-AC-AAC--A--A--CA-T------T-TT---AACAT--A--GG---T-TCCGA--TT--C--TTA-C-GCA-T--G-ATCT---A-TC-A-C-AAG
gi|68010 : AAAGCC-ATAGGCT-CTAGG-CATG-G-C-GAG-TCGCTTGAAT-TT-ACAA--AG-T-AAA-CAAAAAAAAACAAAAACAAAA-AAA----A--A--CAAAAC--------G----------AAA-----CAG-TATC-C--A-A--A--GAGAGAA---C-TT-C-C---ACAATAC-G---AAATAG-AATTTTCTGA--TA-------T-CA--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TT------AA-AA-T-A-A-TT--T------------A--TTATT-GAG-A-GC-T-AAAAT-A-AAACA----------AACAA-A-AC-A-----------A-T------T-TT---AA-TT--A--GGTT-T-TCCAT--TT-AC--TTA-C-GCA-T--G-ATGTA--A-TCAA-CAAAGATTG
gi|68011 : AAAGCC-ATAGGCT-CTAGG-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TT-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--A----CAAAAAAAAA----------AA------CAA-AAAA-C--A-A--A--AAAA-AA---A-A--C-C---AAAAAAA-A---AACCAG----TATCCAA--GAAGAAACCT-TC--ACAATAGA--------T-A-G-TCTTTC--TG-TGA-A-TC------AA-TA-T-ATA-TT--TT---T---TTTAA--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT---A---A----------AAC-A-A-AC-AAT--A--C--C-----------------A-GT--A--GG---T-TTCGA--TT-AC--TTA-C-GCA-T--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATTG
gi|68012 : AAAGCC-ATAGGCT-CTAGG-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TT-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----AACA--C----C--------G----------AA------CAG-TAT
gi|68013 : AAAGCC-GT-GGCT-CTATG-CACC-C-T-GT--TCGCTTGC-C-TT-ACAA--AG-T-GAA-C-------------------A-AAA----A-----C----C--------A----------AA------CAG-CATT-C--A-A--G--AAGA-AA---T-TT-C-C---AC
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gi|68015 : AAGCC-ATAGGCT-CTTGT-CATC-G-T-GAATTCGCTTG--T-TT-ACAA--A--T-AAA-C-------------------A-AAA----A--AACC----C--------G-----------A------CAG-TATC-A--A-ACGG--AAG---A---C-CT-C-CA--ACAATAC-----AAATAG-T-TTTTATT---TA-------T-TC--A------AG-------T-A-ATT---TC--AGCTGA-A-TC------AA-TA-T-A-A-TT--TT---T---C---A---T-TT-GAA-A-GC-T-ACAAT-A-A---A----------AACAA-A-AC-AACCAA--A--CA-T------T-TT---GA-AT--A--GG---C-TCCGA--TT-ACT-TTA-C-GCA-TAGG-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATT
gi|68016 : AGCC-ATAGGCT-CTAGT-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TT-ACAA--AG-T-AAA-C---------------------AAA----A--A--C----C--------G----------AA------CAG-TGTC-C--A-A--G--AACA-AA---C-CT-C-C---ACAATAC-A---AAATAGTT-TTTTCTGA--TA-------C-TC--A------A--------T-A-A-T---TT--AG-TGA-A-TG------AA-TA-T-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAA-A-GC-T--ACAT-GTA---A----------AATAA-A-ACAAAC--A--T--CA-T------T-TT---AA-AT--A--GG---C-TCCGA--TT-AC--TCA-C-GC-------ATCTA--A-TC-A-C-AAGATTG
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gi|68018 : C-ATAGGCT-CTTGG-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TTCAAAA--AG-T-AAAGC-------------------A-AAA----A--A--
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gi|68023 : -AAA----A--A--C----C--------G----------AA------CAG-TATC-C--A-A--G--AAAA-AA---C-AC-C-T---ACAATAC-A---AAATAGTT-TTTTCTGA--T--------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A-A-TT--TTTCAT---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT---A---A----------AACAA-A----AAC--A--A------------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCTGA--TT-AC--TTG-C-GCA-T--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATTG
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gi|68025 : --TA-------T-TC--A------A--------G-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-GAGC-A-A-TT--TT---T-------A--TT-TT-TAG-A-GC-T-TAAAT---A---A----------AAC-A-A-AC-AAT--A--G---A-T------TATT---TA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-TC--TTA-C-GCA-T--
gi|68026 : aaacaattttcacgcgataactcaaaagagct-C---ACAATAC-G---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------TTA-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A----T--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT-A-A---A----------A-CAA-A--C-AAC--A--A--CA-T------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-CC--TTA-C-TCA-T--G-ACCTA--A-TC-G-C-GAGATTGactgtagccattcaaaa
gi|68027 : -T-TTTTTTGGATTA-------T-CC--A------A--------T-A-A-T---TC--AT-TGA-A-TCTAGAAAAA-AA-A-A-A-TT--TC---T-----------------AA-A-GC-T-AAAAT---A---A----------AAC-A-A-AC-AGT--AGCA--CA-T------T-TC------AT--A--GG---T-TCTGA--TT-TC--TTA-C-GCA-T--G-CTGTA--A-TC-A-C-AAGATTG
gi|68028 : -TTTTCTGAA-TA-------TCTC--A------A--------TTA-A-T---TC--AG-TGACA-TC------AA-TA-A-A-AATT--TT---C---C---A--TTCTT-GA--A-GC-T-AAAAT-A-A---A----------AACCA-A-AC-AAC--A--A--CC-T------T-TT---AA-
gi|68029 : TTCTGA--TA-------T-AC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TAA-A-TC------AA-TA-T-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-C-AAAAT---A---A----------AACA-------AAC--A--A--CA-T------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-AC--TTA-T-GCT-T--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGGTTGcagaacagtgacgattattcatcgtaaatcagaatacaaaa
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Reference ( family-634 ) : AAAGCC-ATAGGCT-CTNGT-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TT-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--C----C--------G----------AA------CAG-TATC-C--A-A--G--AAGA-AA---C-CT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT-A-A---A----------AACAA-A-AC-AAC--A--A--CA-T------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-AC--TTA-C-GCA-T--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATTG
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gi|68004 : AAAGCC-ATAGGCT-CTTGTTCATCCG-TTGA--TCGCTTGA-T-T--ACAA--AAAT-AAA-C-------------------A-AAAA---A--A--C----C--------G----------AA------CAGTTATC-A--A-A--G--AA-A-AA---C-CT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--CG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A-ATTT--TT---T---C---A--TT-TT-GAGAA-GC-T-AAAAT-A-A---A----------AACAA-A-AC-AAC--A--A--CA-TTG----T-TT---AA-AT--A--TG---T-TTCGA--TT-AC---TA-CGGCA-TAAG-ATCTA--ATTC-ACC-AAGATTG
gi|68005 : AAAGGC-ATAGGCT-CTTGT-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TT-ACAA--AA-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--C----C--------G----------AA------CAG-TATC-C--A-A--G--AAGA-AA---C-CT-C-C---TCAATAC-A---AAGTAG-T-TTTTCTGA--AT-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TA------TA-TA-T-A-A-AT--TT---T---C---A--TT-TT-AAG-A-GC-T-AAAGT---A---A----------AAC-A-A-AC-AGC--A--A--CA-T------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-AC--TTA-C-GCA-TTAG-ATATATTA-TC-A-C--AGAT
gi|68006 : AAAATC-AT-GGCT-CTAGG-CATC-G-T-GG--TCGCTTGC-C-TT-ACATTTAG-T-AAA-C-------------------G-AAA----A--A--G----C--------G----------AA------CAG-CATT-C--A-A--G--AAGA-AA---C-TT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT---A---A----------AAC-A-A-AC-AAC--A--A--CATT------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--AT-CC--TTT-C-GCA-T--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATTG
gi|68007 : AAAGCC-ATAGGCTTCTTGT-CATC-G-T-GA--TCGTTTGA-T-TT-ACAA--AA-TAAAA-C-------------------A-AAA----A--A-------C--------G----------AA------CAG-TATCTC--A-A--G--AAG--AA---C-GT-CAC---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGAATTA-------T-TC--C------A--------TCA-A-T---T----G-TGA-A-TC------AATTA-T-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A--C-T-AAAAT-A-A---A----------CACAA-ACAC-AA----------A-T------T-T-------AT------G---T-TCCGATTTT-AC--TTACC-GCA-TA-G-ATCT---A-TC-A-C-AAGATTG
gi|68008 : AAAGTC-ATAGGCC-ATAG--CA-C-G-T-GG--TCGCTT---C-TA-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--------------------------------------CAG-CATT-C--A-A--T--AAGA-AG---C-TT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------TCACA-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-A-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-T---AG-A-GC-T-AAAATAA-A---A----------AACAA-A-AC-AAC--A--A--CA--------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT--C--CTA-C-GCATT--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAG
gi|68009 : AAAGTC-ATAGGCC-ATAG--CA-C-GCT-GG--T-GCTTGT-C-TA-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--C---------------------------------AG-CATT-C--A-A--T--AAGA-AG---C-TTTC-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TCA-AG-TGA-A-TC------AA-TA-TAA-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-TAG-A-GC-T-AAAAT-------A----------AAC---A-AC-AAC--A--A--CA-T------T-TT---AACAT--A--GG---T-TCCGA--TT--C--TTA-C-GCA-T--G-ATCT---A-TC-A-C-AAG
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gi|68015 : AAGCC-ATAGGCT-CTTGT-CATC-G-T-GAATTCGCTTG--T-TT-ACAA--A--T-AAA-C-------------------A-AAA----A--AACC----C--------G-----------A------CAG-TATC-A--A-ACGG--AAG---A---C-CT-C-CA--ACAATAC-----AAATAG-T-TTTTATT---TA-------T-TC--A------AG-------T-A-ATT---TC--AGCTGA-A-TC------AA-TA-T-A-A-TT--TT---T---C---A---T-TT-GAA-A-GC-T-ACAAT-A-A---A----------AACAA-A-AC-AACCAA--A--CA-T------T-TT---GA-AT--A--GG---C-TCCGA--TT-ACT-TTA-C-GCA-TAGG-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATT
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gi|68026 : aaacaattttcacgcgataactcaaaagagct-C---ACAATAC-G---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------TTA-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A----T--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT-A-A---A----------A-CAA-A--C-AAC--A--A--CA-T------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-CC--TTA-C-TCA-T--G-ACCTA--A-TC-G-C-GAGATTGactgtagccattcaaaa
gi|68027 : -T-TTTTTTGGATTA-------T-CC--A------A--------T-A-A-T---TC--AT-TGA-A-TCTAGAAAAA-AA-A-A-A-TT--TC---T-----------------AA-A-GC-T-AAAAT---A---A----------AAC-A-A-AC-AGT--AGCA--CA-T------T-TC------AT--A--GG---T-TCTGA--TT-TC--TTA-C-GCA-T--G-CTGTA--A-TC-A-C-AAGATTG
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blockSeqs : . . T T . . . . . . . . A . . . . . . . . GGAATTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . .
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Reference ( family-634 ) : AAAGCC-ATAGGCT-CTNGT-CATC-G-T-GA--TCGCTTGA-T-TT-ACAA--AG-T-AAA-C-------------------A-AAA----A--A--C----C--------G----------AA------CAG-TATC-C--A-A--G--AAGA-AA---C-CT-C-C---ACAATAC-A---AAATAG-T-TTTTCTGA--TA-------T-TC--A------A--------T-A-A-T---TC--AG-TGA-A-TC------AA-TA-T-A-A-TT--TT---T---C---A--TT-TT-GAG-A-GC-T-AAAAT-A-A---A----------AACAA-A-AC-AAC--A--A--CA-T------T-TT---AA-AT--A--GG---T-TCCGA--TT-AC--TTA-C-GCA-T--G-ATCTA--A-TC-A-C-AAGATTG
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