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gi|95503 : TAAAT--GA-T--A-T----A-------T---G-ATC---AT-------GGCGAT--AGA--AA---TTT-CA-TATACGT--A----C-CG--T--A-AT---------CTT--T-G-AA--ATAAC--T--CA---TTTC-CCTGCAATTT--C-A---CGAA-CTG--T-TAG---TC-G-CC--GA-TCACTGT-CCA-GCA--C-GTCA--C--T--AATTT--C-A-TT-TT-TC--GC-A-G-CA-CT-T-----C--AG-------TC-TTGG---AA--AC-A-T-G-GT---CTT--ACT--TC-A-A-GAA-TG-TCAT-C-TTG-CAT--ACT--GTCTCT-CTCGCGCAA
gi|95504 : TT--TA-T--A-T----A-------T-A-G-AAC---AT-------GG-GAT--A-A--AA---TTT-CA-T----GG--A----C-CG--A--A-AT---------CTT--T-A-AA--ATTCA--A--CA---TTTC-TCAGCAATTT--C-G---ATAA-CTT--T-TAG---TC-G-CC--GT-TGACTGT-CAA-GCA--C-GTCA--C--G--AAGTT--C-A-TT-TT-TT--GC-A-G-CA-CT-G-----C--AA-------TC-TCGG---AA--AG-A-T-G-AT---CTT--CCT--TC-A-C-GCA-TG-TCAT-C-TCG-GAA--ATT--GTCCCT-TGTGTCCCAAA
gi|95505 : GCAATTT--C-A---CAAA-CTG--T-TAT---AC-G-CC--GA-TCACTGT-CAA-GCA--C-GTCA--A--G--AAGTTC-C-A-TT-TT-TC--GC-A-G-CA-CT-G-----C--AA-------TT-TCGG---AAC-AT-T-T-G-AT---CTTTCCTT--TC-A-C-GCA-T--TCAT-C-CCG-GAA--ACT--G--CCT-TACGTTCAAAA
gi|95506 : atttctaatAA-CTG--TGTAG---TC-GGCC--GA-TCAC-AT-CAT-TCA--C-GTCA--CC-G--AAGTT--C-A-CT-TT-TC--GC-AAG-CA-CT-G-----CCAGA-------TC-TCGGCGGAA--AG-A-CCG-AT---CTT--ACT--TC-A-C-GCA-TG-TCAT-CGCCGAAAA--ACT--GT-CCT-TCCGTCCAAAA
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gi|95508 : ttaCA--A-GTCA--C--A--AATTC--C-A-TT-GT-----GC-A-GGCA-CT-G-----C--AA-------TT-GCGG---AA--AG-A-T-G-GT---TTT--CCT--TC-A-C-
gi|95509 : -GTCA--C--G--AAGTT--C-AATT-TT-TC--AC-G-G-CA-CT-G-----C--AA-------TC-TCGG---AA--AG-A-T-G-GT---CTT--CCT--TC-A-C-GCA-TG-TCA--C-CCG-GGA--ACT--GT--CT-TCCGTCCAAAA
gi|95510 : --C-A-TT-TT-TC--GC-A-G-CA-CT-G-----C--AA-------TC-TCGG---AA--AG-A-C-G-AT---CTT--ACT--TC-A-C-GCA-TG-TCAT-C-GCC-GAA--ACT--GTCCCT-TCCGTCCAAAA
gi|95511 : -A-G-CA-CT-G-----C--AA-------TC-TCGG---AA--AG-A-T-G-AT---CTT--CCT--
blockSeqs : T TATACGTCTGGTTTT T TC A CT C GAAA CATTATA C C A TCA ATGTAGA C AA G GA AAT A T ATAC GG ATAC A GG TA T TTCAAATTT CA A T GA AA CT ATT T T AA ACGCAT A TT C GTA T G CG AG C C AA T TG GT AA AA A T C T AN A A G C G TAAGC CA TGCAAAT G CGG AG A G C C TCA TC . A C G T T CG A AG TA C T
blockSeqs : . . T T . . . . A . . . . GG . . . . . . C TTT T . . T T T G . . . T . . . . T A GGAT A . G . . . . A G . . . A G . C . A . . . . . . . . T . T . . C . G . . . . . . . T . . GA . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . A G ACG . . . . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . GAT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . GAT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . GAA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . GAT . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . GAT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . ACG . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . ACG . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . GAC . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . N . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . ACG . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . GAT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . ACA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AT . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . AT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . GA . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AC . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : TTCT-GGTTT---------------CAT-ACGTAATT--CA-T--A-T----A-------T-A-G-ATC---AT-------GG-GAT--A-A--AA---TTT-CA-T----GT--A----C-CG--A--A-AT---------CTT--T-G-AA--ATTCC--A--CA---TTTC-CCNGCAATTT--C-G---ATAA-CTG--T-TAG---TC-G-CC--GA-TCACTGT-CAA-GCA--C-GTCA--C--G--AAGTT--C-A-TT-TT-TC--GC-A-G-CA-CT-G-----C--AA-------TC-TCGG---AA--AG-A-T-G-GT---CTT--CCT--TC-A-C-GCA-TG-TCAT-C-CCG-GAA--ACT--GTCCCT-TNCGTCCAAAA
finalCons : TTCT-GGTTT---------------CAT-ACGTAATT--CA-T--A-T----A-------T-A-G-ATC---AT-------GG-GAT--A-A--AA---TTT-CA-T----GT--A----C-CG--A--A-AT---------CTT--T-G-AA--ATTCC--A--CA---TTTC-CCNGCAATTT--C-G---ATAA-CTG--T-TAG---TC-G-CC--GA-TCACTGT-CAA-GCA--C-GTCA--C--G--AAGTT--C-A-TT-TT-TC--GC-A-G-CA-CT-G-----C--AA-------TC-TCGG---AA--AG-A-T-G-GT---CTT--CCT--TC-A-C-GCA-TG-TCAT-C-CCG-GAA--ACT--GTCCCT-TNCGTCCAAAA
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Reference ( family-627 ) : TTCT-GGTTT---------------CAT-ACGTAATT--CA-T--A-T----A-------T-A-G-ATC---AT-------GG-GAT--A-A--AA---TTT-CA-T----GT--A----C-CG--A--A-AT---------CTT--T-G-AA--ATTCC--A--CA---TTTC-CCNGCAATTT--C-G---ATAA-CTG--T-TAG---TC-G-CC--GA-TCACTGT-CAA-GCA--C-GTCA--C--G--AAGTT--C-A-TT-TT-TC--GC-A-G-CA-CT-G-----C--AA-------TC-TCGG---AA--AG-A-T-G-GT---CTT--CCT--TC-A-C-GCA-TG-TCAT-C-CCG-GAA--ACT--GTCCCT-TNCGTCCAAAA
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