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Reference ( gi|110139 )       :                            AAGGTAATCA-TTTT--A---A--AAT-AT-T-T-A----T-C---------GG------TA--TA----A----A-TA---C-GG-GT-TGG------------------------GT--AC-G-T-G-AT---CA--A-A-T-----TT-----T--C--ATAA-AG-CCC--TAC--GGGCT-TTATG------G---AA--T-T--T-----G-AT--C-A-C------------------------GT-GA-CCA-AC-CC-G---TA-T-T-T-A-T-ATCCC-------GA-T----A-A-AT-ATT--T---T--AAAA-TGA-TA-TCTTAT
gi|110138                     :                            AAGGTAATCA-TTTT--A---A--AAT-AT-T-T-A----T-C---------GG------TA--TA----A----A-TA---C-GG-GT-TGG------------------------GT--AC-G-T-G-AT---CA--A-A-T-----TT-----T--C--ATAA-AG-CCC--TAC--GGGCT-TTATG------G---AA--T-T--T-----G-AT--C-A-C------------------------GT-GA-CCA-AC-CC-G---TA-T-T-T-A-T-ATCCC-------GA-T----A-A-AT-ATT--T---T--AAAA-TGA-TA-TCTT
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Reference ( family-620 )      :          AAGGTA-TCATTTT--A---A--AATAT-T-TA-TCGGGATA-T-A-AA-TAC-GGGT-TGGNT--ACGT-G-AT---CA--AA-TTT--CC-ATAA-AG-CCC--TANGGGCT-TTAT-G------GAA--T-TT-----G-AT--C-A-C------------------------GTGA-CCAAC-CCG---TA-T-TTAT-ATCCC-------GA-T----AAAT-ATTT-TAAAA-TGA-TACCTTAT
gi|110138                     :          AAGGTAATCATTTT--A---A--AATAT-T-TA-TCGG--TA-T-A-AA-TAC-GGGT-TGGGT--ACGT-G-AT---CA--AA-TTT--TC-ATAA-AG-CCC--TACGGGCT-TTAT-G------GAA--T-TT-----G-AT--C-A-C------------------------GTGA-CCAAC-CCG---TA-T-TTAT-ATCCC-------GA-T----AAAT-ATTT-TAAAA-TGA-TATCTT
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Reference ( family-620 )      :  AAGGTA-TCATTTT--A---A--AATAT-TT----A-TC----GGGATA-TA-A-A-TA---C-GGGTT-GG-T-ACGTG-ATCA--A-A-TTT--C-----C-ATAA-AGCCC--TT-CGGGCT-TTATGGAA--TTT-----G---ATC-A-C------------------------G-TGA-CCA-AC-CCG-TA-TTTAT-ATCCC-------GA-T-A-AAT-ATTT-TAAAA-TGA-TATCTTAT
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gi|110149                     :      TA-TCATTTT--A---ATTAA-AT-TT----A-TC----GGGATAATA-A-AGTA---CCGGGTT-GG-TCACGTGCATCA--A-AATTT--C-----C-ATAACAGCCC--TT-CGGGCT-TTATGGAA--TTT-----G----TCAA-CG-----------------------G-TGACCCA-AG-CCC-TA-TTTATAATCCCG------GA-T-A-AAT-ATTTCTACAATTGA-TATCTTAT
gi|110150                     : aagaaTA-TCATTTT--A---ATTAA-AT-TT----A-TC----GGGATAATA-A-AGTA---CCGGGTT-GG-TCACGTGCATCA--A-AATTT--C-----C-ATAACAGCCC--TT-CGGGCT-TTATGGAA--TTT-----G----TCAA-CG-----------------------G-TGACCCA-AG-CCC-TA-TTTATAATCCCG------GA-T-A-AAT-ATTTCTACAATTGA-TATCTT
gi|110151                     :  AAGGTA-TCATTTT--A---A--AATAT-TT----AATC----GGGATA-TA-A-A-TA---C-AGGTT-GG-T-AAGTG-ATCA--A-A-TT---C-----T-ATAA-AGCCC--TT-T----------------TTT-----G---ATC-A-C------------------------C-T-A-CCA-AC-CC--T--TTTAT-ATTCC--------A-T-A-AAT-ATTT-T-AAA-TGA-
gi|110152                     :                                                                                            -TTT--C-----C-ATAA-A-CCC--TT-CGGGCT-TTATGGAA--TTT-----G---ATC-A-C------------------------G-TGA-CCA-AC-CCG-TA--TTAT-ATCCC-------GA-T-A-AAT-A-TT-TAAAA-TGA-TATCCTcccattat
gi|110153                     :  AAGGTA-TCAGTTT--ATAAA--AATAT-TT----A-TC----GGGGTATTATA-A-TA---C-GGGTT-GG-TCACGTG-ATCA--A-A--------------------------TT-CGGGCTGTTTTGGAA--TTT-----G---CTC-A-C------------------------G-TGA-CC--AC-GCGTTA-TTTAT-ATC----------G-T-A-AATGATTT---AAA-TGA-
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gi|110162                     :        -TCATTTC--A---AG-AATAT-TT----AATC----GA-ATA-TA-A-A-AA---A-GGGTT-GG-T-AT----ATCA--T-A-T------------ATAA-AG----------GGCT-TTAT---A--TTTATATTG---ATC-A-CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNA-CCA-AC-CTG-TA-TTTAT-ATCCC-------GA-T-A-AAT-AT
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gi|110167                     :                                                                                              TT--C-----C-ATAA-A-CCC--TT-CGGGCT-TTATGGAA--TTT-----G---ATC-A-C------------------------G-TGA-CCA-AC-CCG-TA--TTAT-ATCCC-------GA-T-A-AAT-A-TT-TAAAA-TGA-TATCCTAT

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Reference ( family-620 )      :  AAGGTA-TCATTTT--A---A--AATAT-TT----A-TC----GGGATA-TA-A-A-TA---C-GGGTT-GG-T-ACGTG-ATCA--A-A-TTT--C-----C-ATAA-AGCCC--TT-CGGGCT-TTATGGAA--TTT-----G---ATC-A-C------------------------G-TGA-CCA-AC-CCG-TA-TTTAT-ATCCC-------GA-T-A-AAT-ATTT-TAAAA-TGA-TATCTTAT
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gi|110159                     :        -TCATTTC--A---AG-AATAT-TT----AATC----GA-ATA-TA-A-A-AA---A-GGGTT-GG-T-AT----ATCA--T-A-T------------ATAA-AG----------GGCT-TTAT---A--TTTATATTG---ATC-A-CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNA-CCA-AC-CTG-TA-TTTAT-ATCCC-------GA-T-A-AAT-AT
gi|110160                     :  AAGGTA-TCATTTT--A---A--AATAT-TT----A-TC----GGGATA-TA-A-A-TA---C-GGGTT-GG-T-ACGTG-ATCA--A-A-TTTT-C-----C-ATAA-AGCCC--TT-TGGGCT-TCATGGAA--TTT-----G---ATC-G-C------------------------A-TAA-CCA-AC-CCG-TA-TTTAT-ATCCC-------GA-T-A-AAT-ATTT-T
gi|110161                     :  AGGGTA-ATATTTT--A---A--AATAT-TTAATGA-CCGGGTGGGATA-TA-ACA-TAGTTC-GGG---GG-T-GTACT-ATAA--AGA-TTC--CTGTCTC-ATAA-AGCAT--TT-GGGGC--TTATTGAAT-TTT-----GGGTATTAA-C------------------------GTTGATCCACAC-CCG-TA-TTTAT-TTTCC-------GATT-ATAAT-ATTT-Tat
gi|110162                     :        -TCATTTC--A---AG-AATAT-TT----AATC----GA-ATA-TA-A-A-AA---A-GGGTT-GG-T-AT----ATCA--T-A-T------------ATAA-AG----------GGCT-TTAT---A--TTTATATTG---ATC-A-CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNA-CCA-AC-CTG-TA-TTTAT-ATCCC-------GA-T-A-AAT-AT
gi|110163                     :                                                                 -GGGTT-GG-T-ACGTG-ATTG--A-A-TTTT-C-----C-ATAA-AGGCT--TTATGGAAT-TT---GAA--TTT-----G---ATC-A-C------------------------G-TGA-CCA-AC-CCA-TA-TTTAT-ATCCC-------G
gi|110164                     :                                                                 -GGGTT-GG-T-ACGTG-ATTG--A-A-TTTT-C-----C-ATAA-AGGCT--TTATGGAAT-TT---GAA--TTT-----G---ATC-A-C------------------------G-TGA-CCA-AC-CCA-TA-TTTAT-ATCCC-------G
gi|110165                     :                                                                              CGTA-TTTA--T-A-TCC--C-----G-ATAA-ATATT--TT-CGGGCT-TTATTGAAAATTT-----G---ATC-A-C------------------------G-T-A-CCA-AC-CCG-TA-TTTAT-ATCCC-------AA-T-A-AAT-ATTT-TAAAA-TGA-TATCTTAT
gi|110165                     :  AAGATA-TCATTTT--A---A--AATAT-TT----A-TT----GGGATA-TA-A-A-TA---C-GGGTT-GG-T-ACGTG-ATCA--A-A-TTT--T-----CAATAA-AGCCC--
gi|110166                     :                                                         cgtatttatatcccgataaatattttcTCA--A-A-TTA--C-----T-GTGA-AACTC--TT-CGGGCT-TAACAGGA--TTT-----G---ATC-A-C------------------------G-TGA-CT--AC-CC--TACTTTAT-ATCCC-------AG-TGA-AAT-ATTT-at
gi|110167                     :                                                                                              TT--C-----C-ATAA-A-CCC--TT-CGGGCT-TTATGGAA--TTT-----G---ATC-A-C------------------------G-TGA-CCA-AC-CCG-TA--TTAT-ATCCC-------GA-T-A-AAT-A-TT-TAAAA-TGA-TATCCTAT


blockSeqs                     :        A       TA TAA TT     A  AATG A  GGGT  G   A  T C G  GTT C     A  G C     C    CC G A   CTGTCTC       C     TT  A      G        AA   ATATT GGT   A T TTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T   C   C  G   T  C     A     GAATAAA  T G T   G    C     T   T
blockSeqs                     :        .       TA TAA TT     A  AATG A  GGGT  G   A  T C G  GTT C     A  . C     C    CC G A   CTGTCTC       C     TT  A      G        T    ATATT GGT   A T TTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN T   C   C  G   T  C     A     GAATAAA  T G T   G    C     T   T
blockSeqs                     :        .       .  .   G      .  .    A  .     G   T  . . .  .   .     .  . C     .    C  . .   TCCC          .     .   .      .        T    .     A     A . G                        .   T   .  .   .  .     .     G        T . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   G      .  .    .  .     G   T  . . .  .   .     .  . C     .    C  . .   TCCC          .     .   .      .        .    .     A     A . G                        .   T   .  .   .  .     .     G        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCCC          .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCCC          .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCC           .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCA           .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCC           .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCC           .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCC           .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCC           .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCC           .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TCA           .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     A   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   TC            .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   CC            .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   CC            .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     G   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   CT            .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     .   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   CC            .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .     .   .
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     .   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   CT            .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .          
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     .   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   CG            .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .          
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     .   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   CT            .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .          
blockSeqs                     :        .       .  .   .      .  .    .  .     .   .  . . .  .   .     .  . .     .    .  . .   CC            .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .          
blockSeqs                     :                                                                 .     .  . .     .    .  . .   C             .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .    .          
blockSeqs                     :                                                                 .     .  . .     .    .  . .   C             .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .               
blockSeqs                     :                                                                                  .    .  . .   .             .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .        . . .   .               
blockSeqs                     :                                                                                       .  . .   .             .     .   .      .        .    .     .     . . .                        .   .   .  .   .  .     .     .                                
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blockSeqs                     :                                                                                            .   .             .     .                                                                                                                                
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