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Reference ( gi|15802 )        : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAAAAAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--AA--A--AC--AA-----AT--C-ATC--T--C-G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--GGA---A--A-T-TTTC-G---TG--AG----C--CAT-AA--TG------G----GC-G-C-CGCCA--------T------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AA-TAAACCTA
gi|15806                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CA--TA-T--GT---AAA-G-AAAA--AAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--AA--A--AC--AA-----AT--C-ATC--T--C-G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--GGA---A--A-T-TTTC-G---TG--AG----C--CAT-AA--TG------G----GC-G-C-CGCCA--------T------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------ATA-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AG-TAAACCTA
gi|15803                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAA-AAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--AA--A--AC--AA-----AT--C-ATC--T--C-G---A--C-A-------T-A-C-----TT-CAA--GGA---T--A-T-TTTC-G---TG--AG----C--AAT-AA--TG------G----GC-G-C-CGCCA---------------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-TT-TC--A-A--CAA--AT-A--TT-----C---G-AG-TAAACCTA
gi|15805                      : AGGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAAAAACC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--AA--A--AC--AA-----AT--C-ATT--T--C-G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--GGA---A--A-T-TTTC-G---TG---G----C--CAT-AA--AG------G----GCGG-C-CG-CA--------T------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-A-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AG-TAAACCTA
gi|15807                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-AGTAACA--CG--TG-T--GT---AAA----AAAAAAAG---T--CAAAT-T--C--A--GCA---A-G-AG--AA--A--AG--CA-----AT--C-ATC--C--C-G---A--T-A-------T-A-C--G--TT-CAA--GGA---A--A-T-TTTC-G---TG--GC----C--CAT-GA--AG------G----GC-G-C-CGCCA--------TTTTG--T-T-T----TA-TT-----C---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC--A-A--CAA--AT-A--TT-----C---G-AG-TTAAC
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gi|15820                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-TTGGT---AAA-G-AAAAAAG-----T--C-AAA-T--T--A--ACA---A-G-AG--AA--A--AG--AA-----ATG-C-ATC--T--C-T---A--C-A-------TCA-CCAG--TT-CAAT-GGA---A--A-T-TTTC-G---CG--
gi|15823                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--TG--TG-T--GT---AAA-G-AAAAAATG----T--CATAC-T--TTAA--GCA---A-C-AG--AA--AGGAG--AA-----AT--A-ATT--TTCT-GTTTATTC-A-------TGA-C--G--TT-CAA--GAA---AATA-T-TTTC-GGGTTG--CA----CCACAT-GA--AG------G----GC-G-CTTACCATCTTGTTTT------T-T-T----TG-TTC----A---G-T----G------G-G-TA-G-CT-TC--A-T--C-G--AT-A--TTATATCC---G-AG-TAAACC
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gi|15824                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-A-AAAAAAA---------AAAA-C--CA-A--ACA---A-A-CA--AA--A--AA--AA-----gaaagggtcgtggtcttgttttctt
gi|15825                      :   GC-A--AG-CTGCTAAC-GATAACA--CA--TA-T--GT---AGA-G-AAAAAATTT---TTTCAAT--T--C--A--TCA---A-G-AG--AACCA--GA--AA-----ATTCC-ATC--T--TTG---A--C-A-------T---C--A--CT-C---------------------------------------C-T-AA--AG------G----GT-G-C-CGC-A--------T------T-T-TGTTTTA-TT-----C---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC-------CAGA-ATGA--TT-----C---A-AG-TAAACCTA
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lowQualScore                  :     6 11     5     9       00  44  4 44  555   3 4       77777 00    33 44 44 00   999 000  44 0000 00 88 99  4  55 5   00  55 222 00 0 8888888 0 5 55 55  5   00 4  555 4 5555    4 999  44444444  22  7 33 999 7 7777777  5 7  7    7777777777777 7 7 1111  7  333333333 8 00000000000 8 6  6 8  8  44 9 66   11  9 66  77777 222 9  222        
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Reference ( family-618 )      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAAAAAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AN-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--G-GA---A-A-T--TTTC-G---TG--AG----CC--AT-A--A--NG-G-------GC-G-CC-GCCA----T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AG---TAAACCTA
gi|15802                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAAAAAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AC-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--G-GA---A-A-T--TTTC-G---TG--AG----CC--AT-A--A--TG-G-------GC-G-CC-GCCA----T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AA---TAAACCTA
gi|15803                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAA-AAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AC-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C-----TT-CAA--G-GA---T-A-T--TTTC-G---TG--AG----CA--AT-A--A--TG-G-------GC-G-CC-GCCA-------------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-TT-TC--A-A--CAA--AT-A--TT-----C---G-AG---TAAACCTA
gi|15804                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-G-TAACGACCG--TA-T--GT---TAA-G-AAACAAAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-ATAGC-A----A--A--AC-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAG--G--------A-T--TTTC-G---TG--AG-----C--AT-A--A--TG-G-------GC-G-CC-AGCAT---T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T-------------A-TT-G-TT-TC--A-A--CAA--AT-A--TT-----C---G-AG---TAAACCTA
gi|15805                      : AGGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAAAAACC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AC-AA-AT--C-ATT--TC--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--G-GA---A-A-T--TTTC-G---TG---G----CC--AT-A--A--AG-G-------GCGG-CC-G-CA----T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-A-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AG---TAAACCTA
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gi|15817                      : AAGC-A--AGGCT-CTAGA-GGAAACA--AG---A-T--------AA-G-AAAAAAAG----T--CAGAA-TTCC--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AA-GA-AT--C-ATC--TC--G---G--A-A-------A-A-C--G--TG-CAA--GAAA---A-A-A--TTTC-G---TG--GT----CC--AT-A--A--AG-G-------GC-G-CC-GCCA----T--------T-T-T----TC-TT-----T---A-T----A------T-G-TT-G-CT-TCA-A-A--CAG--TT-A--TT-----CA--G-AGAACTAAAC
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gi|15822                      : AGGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTTACA--CAC-TG-T--GT---AAA-G----AAAAACG--T--CAAAT-T--C--A--GCAC--A-C-AG--AATATA--A--AG-AAGAT--C-A-C--TC--ACATA--CGA-------T-A-C--G--TTACAAGTG-GA---A-ATT--TTTT-G---TG---G----CTCAAT-G--A--AGTC-------GC-GACC-GCCA----T--------TCT-C----TA-TT-----ATT-A-T----TCATTAGA-G-TTAG-CT-TCT-A-ACTCAGC-AT-A--TT-----CTCAG-AG---TAAAgaaagggtcgtggtcttgttttctt
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Reference ( family-618 )      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAAAAAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AN-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--G-GA---A-A-T--TTTC-G---TG--AG----CC--ATA--AA---G-G-------GC-G-CC-GCCA----T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AG---TAAACCTA
gi|15802                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAAAAAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AC-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--G-GA---A-A-T--TTTC-G---TG--AG----CC--ATA--AT---G-G-------GC-G-CC-GCCA----T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AA---TAAACCTA
gi|15803                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAA-AAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AC-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C-----TT-CAA--G-GA---T-A-T--TTTC-G---TG--AG----CA--ATA--AT---G-G-------GC-G-CC-GCCA-------------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-TT-TC--A-A--CAA--AT-A--TT-----C---G-AG---TAAACCTA
gi|15804                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-G-TAACGACCG--TA-T--GT---TAA-G-AAACAAAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-ATAGC-A----A--A--AC-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAG--G--------A-T--TTTC-G---TG--AG-----C--ATA--AT---G-G-------GC-G-CC-AGCAT---T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T-------------A-TT-G-TT-TC--A-A--CAA--AT-A--TT-----C---G-AG---TAAACCTA
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gi|15822                      : AGGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTTACA--CAC-TG-T--GT---AAA-G----AAAAACG--T--CAAAT-T--C--A--GCAC--A-C-AG--AATATA--A--AG-AAGAT--C-A-C--TC--ACATA--CGA-------T-A-C--G--TTACAAGTG-GA---A-ATT--TTTT-G---TG---G----CTCAATG--AA---GTC-------GC-GACC-GCCA----T--------TCT-C----TA-TT-----ATT-A-T----TCATTAGA-G-TTAG-CT-TCT-A-ACTCAGC-AT-A--TT-----CTCAG-AG---TAAAgaaagggtcgtggtcttgttttctt
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lowQualScore                  :     6 11     5     9       00  44  4 44  555   3 4       77777 00    33 44 44 00   999 000  44 0000 00 88 99  4  55 5   00  55 222 00 0 8888888 0 5 55 55  5   00 4  555 4 5555    4 999  88888888  22   33  888 7 7777777  5 7  7    7777777777777 7 7 1111  7  333333333 8 00000000000 8 6  6 8  8  44 9 66   11  9 66  77777 222 9  222        
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Reference ( family-618 )      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAAAAAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AN-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--G-GA---A-A-T--TTTC-G---TG--AG----CC--ATA--AA---G-G-------GC-G-CC-GCCA----T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AG---TAAACCTA
gi|15802                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-G-AAAAAAAAC---T--CAAAA-T--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AC-AA-AT--C-ATC--TC--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAA--G-GA---A-A-T--TTTC-G---TG--AG----CC--ATA--AT---G-G-------GC-G-CC-GCCA----T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC--A-A--CAG--AT-A--TT-----C---G-AA---TAAACCTA
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gi|15821                      : AAG--A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--T--T--GT---GAA-G-AAAAAGAGG---T--CAAAT-T--C--T--GC----A-G-AG--A----A--A--AG-AA-TT--C-ATC---C--G---A--C-A-------T-A----G--TT-CAA--A-GATACA-G-T--TTTC-G---
gi|15822                      : AGGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTTACA--CAC-TG-T--GT---AAA-G----AAAAACG--T--CAAAT-T--C--A--GCAC--A-C-AG--AATATA--A--AG-AAGAT--C-A-C--TC--ACATA--CGA-------T-A-C--G--TTACAAGTG-GA---A-ATT--TTTT-G---TG---G----CTCAATG--AA---GTC-------GC-GACC-GCCA----T--------TCT-C----TA-TT-----ATT-A-T----TCATTAGA-G-TTAG-CT-TCT-A-ACTCAGC-AT-A--TT-----CTCAG-AG---TAAAgaaagggtcgtggtcttgttttctt
gi|15823                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--TG--TG-T--GT---AAA-G-AAAAAATG----T--CATAC-T--TTAA--GCA---A-C-AG--A----A--AGGAG-AA-AT--A-ATT--TTCTGTTTATTC-A-------TGA-C--G--TT-CAA--G-AA---A-A-TATTTTC-GGGTTG--CA----CC--ACATGAA---G-G-------GC-G-CTTACCA----TCTTGTTTTT-T-T----TG-TTC----A---G-T----G------G-G-TA-G-CT-TC--A-T--C-G--AT-A--TTATATCC---G-AG---TAAACC
gi|15824                      : AAGC-A--AGGCT-CTAAA-GGTAACA--CG--TA-T--GT---AAA-A-AAAAAAA---------AAAA-C--CA-A--ACA---A-A-CA--A----A--A--AA-AA-
gi|15825                      :   GC-A--AG-CTGCTAAC-GATAACA--CA--TA-T--GT---AGA-G-AAAAAATTT---TTTCAAT--T--C--A--TCA---A-G-AG--A----ACCA--GA-AA-ATTCC-ATC--TTT-G---A--C-A-------T---C--A--CT-C--------------------------------------C---TA--AA---G-G-------GT-G-CC-GC-A----T--------T-T-TGTTTTA-TT-----C---A-T----T------A-G-TT-G-CT-TC-------CAGA-ATGA--TT-----C---A-AG---TAAACCTA
gi|15826                      :     -A--AGGCT-CTAAAAGGTAACA--CG--TA-TT-GT---AAATG-AAAAAAAAG---T--CAAAA----C--A--GCA---ATA-AGGCA----A--A--AA-AA-A-----ATA--TC--G---A--A-T-------T-A-C--G--TT-CAA--G-AA---A-A-A--TTTC-G---TG--AT----CC--AT---AA---T-G-------GC-G-CT-GCCA----T--------T-TGT----GA-TT-----T---A-TTTCAT------A-G-TT-G-CT-TC--A-A--TTGA-AT-A--TT-----C---G-AGT--TAAACTTA
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gi|15829                      :                   A-GGTAACA--CA--TA-----------------GAAAAAC---T--CAAAAAT--C--A--GCA---A-A-AG--A----A--A--AC-AA-G-----ATCGATT--G---A--C-A-------T-A-C--G--TT-CAAC-G-GA---A-A-A--TTTC-G---TGACAG----CC--ATA--AT---G------------G-CC-GCCA----T--------T-T-T----TA-TT-----A---A-T----T------A-A-GT-G-CT----------CAA--AT-G--AT-----C---G-A----TAAAC
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blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     T .       ACG   .     A  .  .  .    .   TA   .  .    .  T  C   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   T  .  .   . T       . .    AG        .    .   .   . .        . .  .    TTTTG         . . GTTT  .  ATTC      . TTCAT       . .  . .  .  T  . .    C   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AC    .     A  .  .  .    .   A    .  .    .  .  C   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   T  .  .   . T       . .    AG        .    .   .   . .        . .  .    TCTTT         . . .     .  ATT       . TA          . .  . .  .  .  . .    A   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AC    .     A  .  .  .    .   A    .  .    .  .  C   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   T  .  .   . T       . .    AG        .    .   .   . .        . .  .    ATTTT         . . .     .  CA        . T           . .  . .  .  .  . .    A   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       CC    .     T  .  .  .    .   A    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   C  .  .   . T       . .    GC        .    .   .   . .        . .  .    TGG           . . .     .  A         . T           . .  . .  .  .  . .    T   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AC    .     T  .  .  .    .   G    .  .    .  .  T   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    GC        .    .   .   . .        . .  .    TT            . . .     .  A         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AG    .     T  .  .  .    .   G    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . A       . .    AC        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  A         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AG    .     A  .  .  .    .   A    .  .    .  .  A   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    AG        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  A         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AC    .     A  .  .  .    .   A    .  .    .  .  C   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    AG        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  C         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       CC    .     A  .  .  .    .   A    .  .    .  .  C   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . A       . .    AG        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  A         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AG    .     A  .  .  .    .   A    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    AG        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  C         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       GG    .     T  .  .  .    .   C    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    CC        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  A         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       TT    .     T  .  .  .    .   G    .  .    .  .  A   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    GT        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  C         . A           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AG    .     T  .  .  .    .   A    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    GC        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  T         . G           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AC    .     A  .  .  .    .   G    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . A       . .    CA        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  C         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       AC    .     T  .  .  .    .   G    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    AT        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  T         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       C     .     T  .  .  .    .   G    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    AG        .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  A         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       G     .     A  .  .  .    .   G    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    G         .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  C         . T           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       G     .     T  .  .  .    .   C    .  .    .  .  G   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    C         .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  A         . C           . .  . .  .  .  . .    .   . .   .     .   .  .  
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       .     .     T  .  .  .    .   C    .  .    .  .  A   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . A       . .    G         .    .   .   . .        . .  .    T             . . .     .  .         . .           . .  . .  .                                      
blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       .     .     C  .  .  .    .   A    .  .    .  .  A   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . T       . .    G         .    .   .   . .        . .  .    .             . . .     .                                                                           
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blockSeqs                     :     . .      .     .       .   .   . .   .     . .       .     .     A  .  .  .    .   A    .  .    .  .  C   .  .  .   .   .  .   .  . .       . . .  .   .   .  .  .   . A       . .    .         .                                                                                                                                     
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