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lowQualScore                  :         1 1 1 99999999     5  5 5     22  5555  4   4 99  4   555 888888888888888888 9 4   22   3 00   33 99 000  555    00 00  00 555 44 88   9999 4 4 4 444 9999   4 7777  8888 555 88      0000   4 4 99 4   99 4  111111111111111111111111111111111111111111111111111111111   5 3333  666666  777 5  11  6 6   
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Reference ( gi|29637 )        : AAATCCGT-T-G-GAGCCCA--GCTGT-CG-C-TCGAT--AT----TT-GAT-A--AA-TCC---A---------T---G----T-T-TTT--CTC-G--GGTA-C--AT--TA---TAAG--T--TT--T---C--T--AAC----A-A-G-A---C----AAC-G----AT-G--C--GT--AAACGA--A-TTT-C-T--T-TGCA-T-TT-G-----TA------------T-C------A------C---------A---------TCT-A----CA---T--AT---T-TT--CC-A-ATT
gi|29638                      : AAATCCGT-T-G-GAGCCCA--GCTGT-CG-C-TCGAT--AT----TT-GAT-ATAAA-TCC---A---------T---G----T-T-TTT--CTC-G--GGTG-C--AT--TA---TAAG--T--TT--T---A--T--AAC----A-A-G-A---C----AAC-G----AT-G--T--GT--AAACGA--A-TTT-C-T--T-TGCA-T-TT-G-----TA------------A-C------A------C---------A---------TGT-A----CA---G--AT---T-TT--CC-A-ATT
gi|29639                      : AAATCCGT-T-G-GAGCCGA--GCTGT-CG-C-TCGAT--AT----TT-GAT-A--AAATCC---A---------T---G----T-T-TTT--CTC-G--GGTG-C--AT--TA---TAAG--T--TT--T---C--T--AAC----A-A-G-A---C----AAC-G----AT-G--C--GT--AAACGA--G-TTT-C-T--T-TGCATT-TT-T-----TA------------A-C------A------C---------A---------TCT-A----CA---G--AT---T-TT--CT-A-ATT
gi|29640                      : AAATCCGT-T-G-GAGCCCA--GCTGT-CG-C-TCGATA-AT----TT-GAC-A--AA-TCC---A---------T---G----T-T-TTT--C------GTTG-C--AT--TA---TAAG--T--TT--T---C--TA-AAC----A-A-GAA---C----AAC-G----AT-G--C--GT--AAACGA--G-TTT-C-T--T-CGCA-T-TT-G-----TA------------A-C------A------C---------A---------TC--A----CA---G--AT---T-TT--CT-A-ATT
gi|29641                      : AAATCCGTAT-G-GAGCCC---GCTGT-CG-C-TCGATA-AT----TT-GAC-A--AA-TCC---A---------T---G----T-T-TTTC-CTC-----GTC-A--ATTATA---TAAG--T--TT--T---C--TA-AACAAGAA-A-G-A---CAACAAAC-G----ATGG--C--GT--AAACGC--GTTTT-C-T--T-CGCA-TGTT-G-----TA------------TAA------A------C---------A---------TCT-A----CAG--G--AT---TGTT--CCTA-AT
gi|29642                      : AAATCCGT-TTGTGAGCCAAAAGCTGTTCG-CATCGATT-AT----TT--AT-A--AA-TCC---T---------T---G----T-T-TTTT-CTCCG--GGTA----AT--TA---TAAG--T--CT--TTTGC--T--AAC----A-A-A-AGACC----AACCGC---ATAG--CTGGT--AAACGATGA-TTT-CCT--T-TGCA-T-TTTG-----TAGAGG--------T-C------A------C---------A---------TCT-A----CA---G--AT---T-TT--CC-AGATT
gi|29643                      :  AGTTCGT-T-A-GTGCCCA--GCTGT-CG-C-TTGAT--AT----TA-GAT-A--AA-TCC---A---------T---G----T-T-TTT--CTC-G--GGTG-C--AT--TA---TATG--T--TT--T---C--T--AAC----A-A-G-A---C----AAC-G----AT-A--C--GT--AAACGA--G-TTT-C-T--T-TACA-T-TT-G-----TA------------A-T------A------C---------A---------TCT-A----CA---G--AT---T-TT--AC-A-ATT
gi|29644                      :  AATCCAT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--AT----TC-GAT-A--AA-CCC---A---------T---G----T-T-TTT--CTT-G--GGTG-CATAT--TA---CAAG--T--GT--T---C--T--AAC----ACA-G-A---C----AAC-G----AT-G--C--AT--AAACGA--G-TTT-C-T--T-TGCA-T-TT-A---------------------C------A------C---------A---------TCT-A----CA---G--AT---T-TT--CC-A-ATT
gi|29645                      :  AATCTGT-T-G-G---------CTGT-CG-T-TCGAT--AT----TT-GAT-A--AA-TCC---A---------T---G----T-T-TTT--CTC-G--GGTG-C--ATAATA---TAAG--T--TT--T---C--T--AAC----ATA-G-A---C----AAC-G----AT-A--C--GT--AAACGA--G-TTT-C-TAAA-TGCG-T-TT-A-----T----------------------A------C---------A---------TCT-A----CA---C--AT---T-TT--CC-A-
gi|29647                      :  AATCCTT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--AT----TT-GAT-A--AT-TGC---A---------T---GG---T-T-TTT--CTC-G--GGTG-C--AT--TA---TAAG--T--TT--T---C--T--AAC----ATA-C-A---T----AAC-G----AT-A--C--GT--AAACGA--G-GTT-C-T--T-TGCG-A-TT-A---------------------C------A------C---------A---------TCT-A----C----C--GC---T-TT--CC-A-
gi|29646                      :  AATCCGT-T-G-G---------CTGT-CA-A-TCGAT--AT----T--GATTA--AA-TCC---A---------T---G----T-T-TTTTCTTC-G--GGTG-T--AT--TT---TAAG--T--TT--T---C--T--AAC----ACA-G-A---C----AAC-GT---AT-A--C--GT--AAACAA--G-TTT-C-T--T-TGCG-T-T--------TA------------G-C------A------C---------A---------TCT-A----CA---G--AT---T-TT--TC-C-ATT
gi|29648                      :  AATCCGT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--ATAAATTT-GAT-A--AA-TCC---A---------T---T----T-T-TTT--CTC-G--GATG-T--AT--CA---TAAG--T--TT--T---C--T-------------G-A---G----AAC-A----AT-A--C--GT--AAACGA--G-TTT-C-T--T-T
gi|29649                      :  AATCCGT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--AT----TT----------------------------------------TTT--CTC-G--GTTG-C--AT---A---TAA------TT--T---T--T--AAC----A-CCG-A---C----AAC-G----AT-G--C--CT--AAACGA--G-TTT-C-T--T-GGTG-T-TT-A-----TACCATCTCTAGAAT-C------A------C---------G---------CTT-A----CA---C--AT---T-CT--CC-A-ATTctgcagattttcta
gi|29650                      :  AATCCGT-T-G-G----C---GCTGT-CGGC-TC-AT--ATA---TT-GAT-A--AA-TCC---A---------T---T----T-T-TTT--CCC-G--GATG-T--AT--
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Alignments
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gi|29641                      : AAATCCGTAT-G-GAGCCC---GCTGT-CG-C-TCGATA-A-T----TT-GAC-A--AATCCA---------T---G----T-T-TTTCC--TC-----GT-CA-A--TTATA---TAAG--TTTT---C--TAA--ACAAGAAA-GACAACAAAC-G----ATGG--C--GT--AAA--CGC-GT-TTT-C-T--T-CGCA-TGTT-------G---T------------A-----TAAA------C---------A--------------TC------T-ACAGGATTGTT--CCTA-AT
gi|29642                      : AAATCCGT-TTGTGAGCCAAAAGCTGTTCG-CATCGATT-A-T----TT--AT-A--AATCCT---------T---G----T-T-TTTTC--TCCG--GGT-A--A--T--TA---TAAG--TCTTTTGC--TAA-CAA-----AAGACC---AACCGC---ATAG--CTGGT--AAA--CGATGATTTC-C-T--T-TGCA-T-TTT------G---T------------AGAGG-T-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-AGATT
gi|29643                      :  AGTTCGT-T-A-GTGCCCA--GCTGT-CG-C-TTGAT--A-T----TA-GAT-A--AATCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TATG--TTTT---C--TAA-CA------A-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TACA-T-TT-------G---T------------A-----A-TA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--AC-A-ATT
gi|29644                      :  AATCCAT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TC-GAT-A--AACCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TT-G--GGT-GC-A--TATTA---CAAG--TGTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-G--C--AT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TGCA-T-TT-------A------------------------CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29645                      :  AATCTGT-T-G-G---------CTGT-CG-T-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AATCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--TAATA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAT-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-TAAA-TGCG-T-TT-------A---T---------------------A------C---------A--------------TC------T-ACA-CATT-TT--CC-A-
gi|29646                      :  AATCCGT-T-G-G---------CTGT-CA-A-TCGAT--A-T----T--GATTA--AATCCA---------T---G----T-T-TTT-TCTTC-G--GGT-GT-A--T--TT---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-GT---AT-A--C--GT--AAA--CAA-G--TTT-C-T--T-TGCG-T-T------------T------------A-----G-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--TC-C-ATT
gi|29647                      :  AATCCTT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--ATTGCA---------T---GG---T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAT-----A-CAT----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--GTT-C-T--T-TGCG-A-TT-------A------------------------CA------C---------A--------------TC------T-ACC-G-CT-TT--CC-A-
gi|29648                      :  AATCCGT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--A-TAAATTT-GAT-A--AATCCA---------T---T----T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GT-A--T--CA---TAAG--TTTT---C--T-------------GAG----AAC-A----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T---------------------------------------------------------------------------TC------T-GCA-GATT-TT--CT-A-
gi|29649                      :  AATCCGT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT------------------------------------TTT-C--TC-G--GTT-GC-A--T---A---TAA----TTT---T--TAA-CAC-----C-GAC----AAC-G----AT-G--C--CT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-GGTG-T-TT-------A---TACCATCTCTAGAA-----T-CA------C---------G--------------CT------T-ACA-CATT-CT--CC-A-ATT
gi|29650                      :  AATCCGT-T-G-G----C---GCTGT-CGGC-TC-AT--A-TA---TT-GAT-A--AATCCA---------T---T----T-T-TTT-C--CC-G--GAT-GT-A--T--
gi|29651                      :                 CCCA--GCTGT-CG-C-TTGAT--A-T----T--GAT-ATAAATCCA---------TT--G----T-T-TTT-C--TC-GAGGGT-GA-A--T--TA---T--G--TTTT---CGTTAA-CAC-----G-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTTAC-T--T-TACG-T-TT-------G---T------------A-----T---------C---------A--------------TC------T-ACA--ATT-TT--
gi|29652                      :                    A--GCTGT-CG-C-TCAAT--A-C----TT-GAT-A--AATCCA---------T---AATA-T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--G--TG---CAAG--TTTT---C--AAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CG--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------C---------AAGACTAAAG-----TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29653                      :                    A--GCTGT-CG-C-TCAGT--A-C----TT-GAT-A--AATCCA---------TA--A----T-A-TTT-C--TCTG--GAT-GC-A--G--TG---CAAG--TTTT---CA-AAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CG--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------C---------AAGACTAAAG-----TT------T-ATA-GA-T-TT--CC-A-ATT
gi|29654                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AATCCAT--------T---A----TAT-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--G--TT---TAAG--TTTT---C--TAA--AC-----A-GAC----AAC-G----AT-G--C---T--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------C---------GAGACTTAAC-----TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29655                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TTCGAT-A--AATCCA---------TTATA----T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--G--TAGTTTAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-GCTACAT-GTAC--CT--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------A---C------------A-----C-TA------A---------AACGAGACTTAAAAGTT------T-ATA-GATT-GT--CC-A-ATT
gi|29656                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AATCCA---------C---GATA-T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GCCA--G--TT---TA-G--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CTTAAAA--CG--T--TTT-C-T--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CAGGAGACT---------AAAGT----------TC------T-ATA-GATT-TTTCCC-A-ATT
gi|29657                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AATCCAGATCCATTGT---A----T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--A--TA---TTAT--TTTT---C--TAA-CAC-----A-CAC----AAC-G----AT-A--A--CT--AAA--CGA-T--TTT-C-T--TGTTCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------CGAGACTTAAG--------------TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
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Reference ( family-606 )      : AAATCCGT-T-G-GAGCCCA--GCTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AATCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-G--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TGCG-T-TT-------A---T------------A-----T-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT
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gi|29645                      :  AATCTGT-T-G-G---------CTGT-CG-T-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AATCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--TAATA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAT-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-TAAA-TGCG-T-TT-------A---T---------------------A------C---------A--------------TC------T-ACA-CATT-TT--CC-A-
gi|29646                      :  AATCCGT-T-G-G---------CTGT-CA-A-TCGAT--A-T----T--GATTA--AATCCA---------T---G----T-T-TTT-TCTTC-G--GGT-GT-A--T--TT---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-GT---AT-A--C--GT--AAA--CAA-G--TTT-C-T--T-TGCG-T-T------------T------------A-----G-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--TC-C-ATT
gi|29647                      :  AATCCTT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--ATTGCA---------T---GG---T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAT-----A-CAT----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--GTT-C-T--T-TGCG-A-TT-------A------------------------CA------C---------A--------------TC------T-ACC-G-CT-TT--CC-A-
gi|29648                      :  AATCCGT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--A-TAAATTT-GAT-A--AATCCA---------T---T----T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GT-A--T--CA---TAAG--TTTT---C--T-------------GAG----AAC-A----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T---------------------------------------------------------------------------TC------T-GCA-GATT-TT--CT-A-
gi|29649                      :  AATCCGT-T-G-G---------CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT------------------------------------TTT-C--TC-G--GTT-GC-A--T---A---TAA----TTT---T--TAA-CAC-----C-GAC----AAC-G----AT-G--C--CT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-GGTG-T-TT-------A---TACCATCTCTAGAA-----T-CA------C---------G--------------CT------T-ACA-CATT-CT--CC-A-ATT
gi|29650                      :  AATCCGT-T-G-G----C---GCTGT-CGGC-TC-AT--A-TA---TT-GAT-A--AATCCA---------T---T----T-T-TTT-C--CC-G--GAT-GT-A--T--
gi|29651                      :                 CCCA--GCTGT-CG-C-TTGAT--A-T----T--GAT-ATAAATCCA---------TT--G----T-T-TTT-C--TC-GAGGGT-GA-A--T--TA---T--G--TTTT---CGTTAA-CAC-----G-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTTAC-T--T-TACG-T-TT-------G---T------------A-----T---------C---------A--------------TC------T-ACA--ATT-TT--
gi|29652                      :                    A--GCTGT-CG-C-TCAAT--A-C----TT-GAT-A--AATCCA---------T---AATA-T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--G--TG---CAAG--TTTT---C--AAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CG--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------C---------AAGACTAAAG-----TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29653                      :                    A--GCTGT-CG-C-TCAGT--A-C----TT-GAT-A--AATCCA---------TA--A----T-A-TTT-C--TCTG--GAT-GC-A--G--TG---CAAG--TTTT---CA-AAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CG--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------C---------AAGACTAAAG-----TT------T-ATA-GA-T-TT--CC-A-ATT
gi|29654                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AATCCAT--------T---A----TAT-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--G--TT---TAAG--TTTT---C--TAA--AC-----A-GAC----AAC-G----AT-G--C---T--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------C---------GAGACTTAAC-----TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29655                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TTCGAT-A--AATCCA---------TTATA----T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--G--TAGTTTAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-GCTACAT-GTAC--CT--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------A---C------------A-----C-TA------A---------AACGAGACTTAAAAGTT------T-ATA-GATT-GT--CC-A-ATT
gi|29656                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AATCCA---------C---GATA-T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GCCA--G--TT---TA-G--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CTTAAAA--CG--T--TTT-C-T--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CAGGAGACT---------AAAGT----------TC------T-ATA-GATT-TTTCCC-A-ATT
gi|29657                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AATCCAGATCCATTGT---A----T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--A--TA---TTAT--TTTT---C--TAA-CAC-----A-CAC----AAC-G----AT-A--A--CT--AAA--CGA-T--TTT-C-T--TGTTCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------CGAGACTTAAG--------------TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29658                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AATCCAGATACAT--T---G----TAT-TTTAC--TC-A--AAT-GC-A--G--TA---TTAT--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AC-A--C--CT--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACATT------------A-----T-CA------CGAG------A--------------CT------TAATA-GATT-TT--CC-C-ATT
gi|29659                      :                    A--GCTAT-CG-C-TCAAT--A----------------AATCCA---------TTATA----T-T-TTT-C--TT-T--GAT-GC-A--G--TT---TAAG--TTTC---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CT--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------CGAGACTTAAG--------------TT------T-ATA-GATT-TT--CC-T-ATT
gi|29660                      :                    A--GCCTT-CG-C-TCAAT--A----------------AATCCA---------TTATA----T-T-TTT-C--TT-T--GAT-GC-A--G--TT---TAAG--TTTC---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT----C--CT--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-T
gi|29661                      :                    A--GCTGT-CG-C-TCAATGGA-C----TT-AAT-A--AATCCA---------T---AATTAT-TGTTT-C--TC-G--GATCGC-AGGT----------G--TTTT---C--AAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CT--AAAAACGA-T--TTC-T-T--T-TGCG-T-TTGACCACTA---T------------ACAAGAT-AA------C---------G--------------TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATTacactattcacgagactt
gi|29662                      :                    A--GCTGT-CG-C-TCAAT--A-C----TT-GAT----AATCCA---------TAAGA----T-T-TTT-C--TCTG--GAT-G--A--G--TG---T-AG--TT--------CAA-C-C-------GAT-----AC-G----ATAG--C--CT--AAA--C---G--TTT-CTT--T-TGCG-T-TTA------A---T------------A-----T-CA------C---------A--------------GCTAAGCTT-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29663                      :                     --GCTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AATCCA---------T---G----C-T-TTT-T--TCTG--GGT-GC-A--T--GA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-A----AT-G--C--TT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--A-T-CA---TT-------A---G------------A-----C-CA------A---------G--------------TA------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29664                      :                                      T--A-T----TT-GAT-A--ATTCCA---------T---G----T-T-TT--C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-T--C--GT--AAA----------------------CG-T-TT-------A------------------------CA------C---------A--------------TC------T-ACA-TATT-TT--CC-A-
gi|29665                      :                                      T--A-T----TT-GAT-A--ATTCCA---------T---G----T-T-TT--C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAC-AAC-----A-GAC----AAC-G----AT-T--C--GT--AAA----------------------CG-T-TT-------A------------------------CA------CG--------A--------------TC------T-ACA-TATT-TT--TC-C-ATT
gi|29666                      :                                                                                                     T-AC-A--G--TA---TAAAGTTTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CAA-G--TTT-C-T--T-TGCG-T-TT-------A------------------------CA------C---------A--------------TC------T-TCA-GATT-TT--CC-A-
gi|29667                      :                                                                                                                                            -----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TACG-T-TT-------G---T------------A-----A-TA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT


blockSeqs                     :         A T T AGCCAAAA     T  G A     GG TAAAT   C   A TA      GATCCATTGTA        A G   C CT  C AG   C  C TTA    GTT    GT    TTG GT   A  CAAGAA A   AACA   C CTAC  GTA  TGG TA   AA   TGAT   A T AA G    T G  ACACTAAAACGAGACTTAAAAG                                             TAAGCT A   G    G  TC  T G
blockSeqs                     :         . . . AGCCCA       .  . .     A  AT      .   T TA      GATACATTG          A .   T .   T .    .  . TAT    .      .     .   A    .  A      .   C      . C     GG   G   .    .    GT     . T .  .    . .  ACACTATCAGGAGACTAAAGT                                              .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . AGCCGA       .  . .     T  TA      .   . .       TAATTA             . .   A .   T .    .  . TAA    .      .     .   .    .  A      .   .      . T     AG   G   .    .    A      . T .  .    . .  ATACCATCTCTAGAATCACG                                               .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . AGCCCA       .  . .     .  T       .   . .       TAATA              . .   . .   T .    .  . GGT    .      .     .   .    .  C      .   .      . .     AG   G   .    .    G      . T .  .    . .  ACACTATCACAAGACTAAAG                                               .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . TGCCCA       .  . .     .  T       .   . .       TTATA              . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  T      .   .      . .     G    G   .    .    G      . T .  .    . .  ACACTATCACAAGACTAAAG                                               .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . AGCCC        .  . .     .  T       .   . .       CGATA              . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     G    G   .    .    G      . T .  .    . .  ACACTATCACGAGACTTAAC                                               .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . C            .  . .     .  T       .   . .       TTATA              . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  T      .   .      . .     G    A   .    .    G      . T .  .    . .  ACACTATCACGAGACTTAAG                                               .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . .            .  . .     .  T       .   . .       TTATA              . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    G   .    .    G      . T .  .    . .  ACACTATCACGAGACTTAAG                                               .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . .            .  . .     .  T       .   . .       TAAGA              . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     G    G   .    .    G      . . .  .    . .  GACCACTATACAAGATAACG                                               .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . .            .  . .     .  T       .   . .       TGG                . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    G   .    .    G      . . .  .    . .  ACATTATCACGAGA                                                     .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . .            .  . .     .  T       .   . .       TTG                . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    G   .    .    G      . . .  .    . .  TGTAGAGGTCACA                                                      .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . .            .  . .     .  T       .   . .       TAA                . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    C   .    .    G      . . .  .    . .  GTATAAACA                                                          .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :         . . . .            .  . .     .  T       .   . .       TTA                . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    G   .    .    G      . . .  .    . .  AATATCACA                                                          .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  T       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     G    C   .    .    T      . . .  .    . .  GTAACACA                                                           .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  C       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    C   .    .    T      . . .  .    . .  TTAACACA                                                           .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  C       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . G      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    C   .    .    T      . . .  .    . .  GTAACACA                                                           .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  C       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . G      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    C   .    .    T      . . .  .    . .  GTAATACA                                                           .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  C       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . G      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     G    C   .    .    T      . . .  .    . .  AGACCAAG                                                           .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  C       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . G      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    C   .    .    T      . . .  .    . .  GTAATACA                                                           .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  C       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . G      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    C   .    .    T      . . .  .    . .  TAGCACA                                                            .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  C       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . A      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    C   .    .    T      . . .  .    . .  GTATCA                                                             .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  C       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . G      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    C   .    .    T      . . .  .    . .  ACACGA                                                             .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  C       .   . .       TT                 . .   . .   . .    .  . G      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     A    C   .    .    T      . . .  .    . .  ACACA                                                              .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  T       .   . .       TT                 . .   . .   . .    .  . G      .      .     .   .    .  C      .   .      . .     G    T   .    .    G      . . .  .    . .  ATACA                                                              .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  T       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . G      .      .     .   .    .  .      .   .      . .     T    G   .    .    G      . . .  .    . .  ACACA                                                              .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                            .  . .     .  T       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  .      .   .      . .     T    G   .    .    G      . . .  .    . .  ACACA                                                              .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                                       .  .       .   . .       TG                 . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  .      .   .      . .     A    G   .    .    G      . . .  .    . .  ACACA                                                              .      .   .    .  .   . .
blockSeqs                     :                                       .  .       .   . .       .                  . .   . .   . .    .  . T      .      .     .   .    .  .      .   .      . .     A    G   .    .    .      . . .  .    . .  .                                                                  .      .   .    .  .      
blockSeqs                     :                                                                                                      .  . G                                      .   .      . .     .    .   .    .    .      . . .  .    . .                                                                                               


blockSeqCons                  :               GCC*****                                                                                                                    C*****
originalCons                  : AAATCCGT-T-G-GAGCCCA--GCTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AATCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-G--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TGCG-T-TT-------A---T------------A-----T-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT
finalCons                     : AAATCCGT-T-G-GGCC-----GCTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AATCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-G--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TGCG-T-TT-------A---T------------A-----T-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT





Alignments
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lowQualScore                  :         . ...  .......... ..    .  . .     .. ......  .   . ..  .    .................. . .   . ..  . ..   .  . .....  ...    ..    ... ..   .  ...... .   ....   . ....  .... ... ..   ..   ....   . . .. .    . .  .................................................................  ...... .   .    .  ..  . .   
lowQualScore                  :         9 000  3333333333 11    5  5 5     44 999999  4   4 88  4    444444444444444444 8 8   1 99  5 99   3  3 22222  444    99    444 99   8  999999 3   2222   3 5555  2222 000 88   88   6666   3 7 88 3    3 3  00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000  000000 4   4    4  99  4 4   
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Reference ( family-606 )      : AAATCCGT-T---GG-G--CC----G--CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AA-TCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-G--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TGCG-T-TT-------A---T------------A-----T-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29637                      : AAATCCGT-T---GGAG--CCCA--G--CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AA-TCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-AC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CA------A-GAC----AAC-G----AT-G--C--GT--AAA--CGA-A--TTT-C-T--T-TGCA-T-TT-------G---T------------A-----T-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-TATT-TT--CC-A-ATT
gi|29638                      : AAATCCGT-T---GGAG--CCCA--G--CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-ATAAA-TCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---A--TAA-CA------A-GAC----AAC-G----AT-G--T--GT--AAA--CGA-A--TTT-C-T--T-TGCA-T-TT-------G---T------------A-----A-CA------C---------A--------------TG------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29639                      : AAATCCGT-T---GGAG--CC----GAGCTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AAATCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CA------A-GAC----AAC-G----AT-G--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TGCATT-TT-------T---T------------A-----A-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CT-A-ATT
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gi|29641                      : AAATCCGTAT---GG-AGCCC----G--CTGT-CG-C-TCGAT--AAT----TT-GAC-A--AA-TCCA---------T---G----T-T-TTTCC--TC-----GT-CA-A--TTATA---TAAG--TTTT---C--TAA--ACAAGAAA-GACAACAAAC-G----ATGG--C--GT--AAA--CGC-GT-TTT-C-T--T-CGCA-TGTT-------G---T------------A-----TAAA------C---------A--------------TC------T-ACAGGATTGTT--CCTA-AT
gi|29642                      : AAATCCGT-TTGTGA-G--CCAAAAG--CTGTTCG-CATCGATT-A-T----TT--AT-A--AA-TCCT---------T---G----T-T-TTTTC--TCCG--GGT-A--A--T--TA---TAAG--TCTTTTGC--TAA-CAA-----AAGACC---AACCGC---ATAG--CTGGT--AAA--CGATGATTTC-C-T--T-TGCA-T-TTT------G---T------------AGAGG-T-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-AGATT
gi|29643                      :  AGTTCGT-T---AGTG--CCCA--G--CTGT-CG-C-TTGAT--A-T----TA-GAT-A--AA-TCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TATG--TTTT---C--TAA-CA------A-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TACA-T-TT-------G---T------------A-----A-TA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--AC-A-ATT
gi|29644                      :  AATCCAT-T---GG-------------CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TC-GAT-A--AA-CCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TT-G--GGT-GC-A--TATTA---CAAG--TGTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-G--C--AT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TGCA-T-TT-------A------------------------CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29645                      :  AATCTGT-T---GG-------------CTGT-CG-T-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AA-TCCA---------T---G----T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--TAATA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAT-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-TAAA-TGCG-T-TT-------A---T---------------------A------C---------A--------------TC------T-ACA-CATT-TT--CC-A-
gi|29646                      :  AATCCGT-T---GG-------------CTGT-CA-A-TCGAT--A-T----T--GATTA--AA-TCCA---------T---G----T-T-TTT-TCTTC-G--GGT-GT-A--T--TT---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-GT---AT-A--C--GT--AAA--CAA-G--TTT-C-T--T-TGCG-T-T------------T------------A-----G-CA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--TC-C-ATT
gi|29647                      :  AATCCTT-T---GG-------------CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AT-TGCA---------T---GG---T-T-TTT-C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAT-----A-CAT----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--GTT-C-T--T-TGCG-A-TT-------A------------------------CA------C---------A--------------TC------T-ACC-G-CT-TT--CC-A-
gi|29648                      :  AATCCGT-T---GG-------------CTGT-CG-C-TCGAT--A-TAAATTT-GAT-A--AA-TCCA---------T---T----T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GT-A--T--CA---TAAG--TTTT---C--T-------------GAG----AAC-A----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T---------------------------------------------------------------------------TC------T-GCA-GATT-TT--CT-A-
gi|29649                      :  AATCCGT-T---GG-------------CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-------------------------------------TTT-C--TC-G--GTT-GC-A--T---A---TAA----TTT---T--TAA-CAC-----C-GAC----AAC-G----AT-G--C--CT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-GGTG-T-TT-------A---TACCATCTCTAGAA-----T-CA------C---------G--------------CT------T-ACA-CATT-CT--CC-A-ATT
gi|29650                      :  AATCCGT-T---GG-----C----G--CTGT-CGGC-TC-AT--A-TA---TT-GAT-A--AA-TCCA---------T---T----T-T-TTT-C--CC-G--GAT-GT-A--T--
gi|29651                      :                      ----G--CTGT-CG-C-TTGAT--A-T----T--GAT-ATAAA-TCCA---------TT--G----T-T-TTT-C--TC-GAGGGT-GA-A--T--TA---T--G--TTTT---CGTTAA-CAC-----G-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTTAC-T--T-TACG-T-TT-------G---T------------A-----T---------C---------A--------------TC------T-ACA--ATT-TT--
gi|29652                      :                  ccca----G--CTGT-CG-C-TCAAT--A-C----TT-GAT-A--AA-TCCA---------T---AATA-T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--G--TG---CAAG--TTTT---C--AAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CG--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------C---------AAGACTAAAG-----TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29653                      :                     a----G--CTGT-CG-C-TCAGT--A-C----TT-GAT-A--AA-TCCA---------T---A----A-TATTT-C--TCTG--GAT-GC-A--G--TG---CAAG--TTTT---C--AAAACAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CG--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------C---------AAGACTAAAG-----TT------T-ATA-GA-T-TT--CC-A-ATT
gi|29654                      :                     a----G--CTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AA-TCCA---------TT--A----TAT-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--G--TT---TAAG--TTTT---C--TAA--AC-----A-GAC----AAC-G----AT-G--C---T--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------C---------GAGACTTAAC-----TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29655                      :                     a----G--CTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TTCGAT-A--AA-TCCA---------TTATA----T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--G--TAGTTTAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-GCTACAT-GTAC--CT--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------A---C------------A-----C-TA------A---------AACGAGACTTAAAAGTT------T-ATA-GATT-GT--CC-A-ATT
gi|29656                      :                     a----G--CTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AA-TCCA---------C---GATA-T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GCCA--G--TT---TA-G--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CTTAAAA--CG--T--TTT-C-T--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CAGGAGACT---------AAAGT----------TC------T-ATA-GATT-TTTCCC-A-ATT
gi|29657                      :                     a----G--CTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AA-TCCAGATCCATTGT---A----T-T-TTT-C--TC-G--GAT-GC-A--A--TA---TTAT--TTTT---C--TAA-CAC-----A-CAC----AAC-G----AT-A--A--CT--AAA--CGA-T--TTT-C-T--TGTTCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------CGAGACTTAAG--------------TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29658                      :                     a----G--CTAT-CG-C-TCAAT--A-C----TC-GAT-A--AA-TCCAGATACAT--T---G----TAT-TTTAC--TC-A--AAT-GC-A--G--TA---TTAT--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AC-A--C--CT--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACATT------------A-----T-CA------CGAG------A--------------CT------TAATA-GATT-TT--CC-C-ATT
gi|29659                      :                     a----G--CTAT-CG-C-TCAAT--A----------------AA-TCCA---------TTATA----T-T-TTT-C--TT-T--GAT-GC-A--G--TT---TAAG--TTTC---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CT--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-TT-------ACACT------------A-----T-CA------CGAGACTTAAG--------------TT------T-ATA-GATT-TT--CC-T-ATT
gi|29660                      :                                                        aAT-A--AA-TCCA---------TTATA----T-T-TTT-C--TT-T--GAT-GC-A--G--TT---TAAG--TTTC---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT----C--CT--AAA--CGA-T--TTT-CTT--T-TGCG-T-T
gi|29661                      :          agccttcgctca----G--CTGT-CG-C-TCAATGGA-C----TT-AAT-A--AA-TCCA---------T---AATTAT-TGTTT-C--TC-G--GATCGC-AGGT----------G--TTTT---C--AAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--CT--AAAAACGA-T--TTC-T-T--T-TGCG-T-TTGACCACTA---T------------ACAAGAT-AA------C---------G--------------TT------T-ATA-GATT-TT--CC-A-ATTacactattcacgagactt
gi|29662                      :                     a----G--CTGT-CG-C-TCAAT--A-C----TT-GAT----AA-TCCA---------TAAGA----T-T-TTT-C--TCTG--GAT-G--A--G--TG---T-AG--TT--------CAA-C-C-------GAT-----AC-G----ATAG--C--CT--AAA--C---G--TTT-CTT--T-TGCG-T-TTA------A---T------------A-----T-CA------C---------A--------------GCTAAGCTT-ATA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29663                      :                     a----G--CTGT-CG-C-TCGAT--A-T----TT-GAT-A--AA-TCCA---------T---G----C-T-TTT-T--TCTG--GGT-GC-A--T--GA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-A----AT-G--C--TT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--A-T-CA---TT-------A---G------------A-----C-CA------A---------G--------------TA------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT
gi|29664                      :                                           T--A-T----TT-GAT-A--AT-TCCA---------T---G----T-T-TT--C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-T--C--GT--AAA----------------------CG-T-TT-------A------------------------CA------C---------A--------------TC------T-ACA-TATT-TT--CC-A-
gi|29665                      :                                           T--A-T----TT-GAT-A--AT-TCCA---------T---G----T-T-TT--C--TC-G--GGT-GC-A--T--TA---TAAG--TTTT---C--TAC-AAC-----A-GAC----AAC-G----AT-T--C--GT--AAA----------------------CG-T-TT-------A------------------------CA------CG--------A--------------TC------T-ACA-TATT-TT--TC-C-ATT
gi|29666                      :                                                                                                           T-AC-A--G--TA---TAAAGTTTTT---C--TAA-CAC-----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CAA-G--TTT-C-T--T-TGCG-T-TT-------A------------------------CA------C---------A--------------TC------T-TCA-GATT-TT--CC-A-
gi|29667                      :                                                                                                                                                  -----A-GAC----AAC-G----AT-A--C--GT--AAA--CGA-G--TTT-C-T--T-TACG-T-TT-------G---T------------A-----A-TA------C---------A--------------TC------T-ACA-GATT-TT--CC-A-ATT