lowQualScore : 11111 1 1111 22222222222222222222 111111
lowQualScore : 2 4 1 1 1 1 1 33333 444 22 1 88888 3 22 1 44 1 3 1 1 444 1 4444 1 0000 999 1 4444444 1 44 00000000000000000000 222 22 1 3 1 1 44 22 1 1 1 22 44444 7777777 4444 66 1 4 111111 22 1 4 1 22 1 1 1 1 1 1 22 33
lowQualScore : . . . . . . . ..... ... .. . ..... . .. . .. . . . . ... . .... . .... ... . ....... . .. .................... ... .. . . . . .. .. . . . .. ..... ....... .... .. . . ...... .. . . . .. . . . . . . .. ..
lowQualScore : 1 5 7 6 5 5 5 77777 999 00 5 88888 2 11 5 77 5 0 4 4 555 4 5555 4 4444 111 4 6666666 4 88 99999999999999999999 555 00 5 0 5 5 55 22 7 7 7 33 22222 1111111 9999 11 8 0 777777 33 7 5 7 33 7 7 7 7 7 7 33 88
consensus : TACNCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----T--NA--AATCG-A-GGTTGCAGCT--GA-CC-G-GTAAGAA-A-T-TC---A-A----C-ATA----CGATA-C-AA-------TAT-ATT--A-----------T--------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TG-T-A--A-----A-------GG-A-GT--G-CAACGT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
Reference ( gi|78300 ) : TACTCCTAATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----T--GA--AATCG-A-GGTTGCAGAT--GA-CT-G-GTAAGAA-A-T-TC---A-A----C-ATA----CGACA-C-AA-------TAT-ATT--A-----------T--------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TC-AA--AATC-TG-T-A--A-----A-------GG-A-AT--G-CAATGC-----A--A-TCCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78297 : TACACCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCCTATT-----T--GA--AATCG-A-GGT-GCAGCT--GA-CT-G-GTAAGAA-A-T-TT---A-A----C--TA----CGATA-C-AA-------TAT-ATT--A-----------T--------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-A-TT-AA--AATT-TG-T-A--A-----A-------GG-T-GT--G-CAACAT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TCA-TGAA
gi|78299 : TACTCCTGATTAAAT-CT-TAGAAATA-GA-T-TGTCTATT-----T--AA--AATCG-T-GGT-GCAGCT--GA-CC-G-GTAAGGA-A-T-TT---A-A----C-ATA----CGATA-C-AA-------TAT-ATT--A-----------T--------TAT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TA-AA--AATC-TG-C-A--A-----A-------GG-T-GT--G-CAACGT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TA
gi|78298 : TACACCTGATGAAAT-CT-TAAGAATA-AA-T-TGCTTATT-----T--GA--AATCG-A-GGT-GCAGCT--GA-CC-G-GTAAGAA-A-T-TG---A-A----C-ATA----CGATA-C-AA-------TAT-ATT--A-----------T--------TTA----AACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TG-T-A--A-----A-------GG-T-GT--G-CAACGT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-T--TTA-TAAAA
gi|78294 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----T--TA--AAACG-A-TGT-GCAGCT--GA-CC-G-GTAAGAA-A-T-TG---A-A----C-ATA----CGATA-C-AT-------TAT-ATT--A-----------T--------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TG-T-A--T-----A-------GG-T-GT--G-CAACGT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-G--TTA-TAAAA
gi|78302 : TACACCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCTGATT-----T--GA--AATCG-A-GG-TGCATCT--GA-CC-G-GTACAAA-A-T-TG---C-A----C-ATG----CGATA-CAAA-------TAT-ATC--A-----------T--------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TG-T-A--G-----A-------GG-GTGT--G-TAACGT-----T--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78295 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----T--TA--AAACG-A-TGT-GCAGCT--GA-CC-G-GTAAGAA-A-T-TG---A-A----C-ATA----CGATA-C-AT-------TATAATT--A--------------------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TG-T-A--T-----A-------GG-T-GT--G-CAACGT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-G--TTA-TAAAA
gi|78296 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----T--TA--AAACG-A-TG-TGCAGCT--GA-C--G-GTAAGAA-A-TATCTGTA-ATAATC-ATA----CG------AA-------TA--ATT--A-----------T--------TTC---TA
gi|78301 : ACTCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTTTT-----T--GA--AATCG-A-GGT-GCAGTT--GA-CC-G-GTAAGAA-A-T-TT---A-A----C-ATA----CGATA-C-AA-------TAT-ATC--A-----------T--------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TA-T-A--A-----A-------GG-A-GT--G-CAAGGT-----T--A-TTAAT-G--A-ACT-A-CA-GA-GA-A--TTT-TAAAAtatattaagaatttagaaaataatttatgaa
gi|78304 : tgcACTCCTAATGAAAT-CA-TAGAAAAA-TA-T-TGTCTATT-----T--GA--AATCG-A-GGTTGCC-AT--GAACTCG-GTAAGAA-AAT-TC---A-A----T-ACATTACCAATA-C-AA-------TAT-TTT--A-----------T--------TTT----AACAA--TTAT-A-A-G-TC-AA--AATC-TG-T-A--A-----A-------GG-A-AT--G-CAACGT-----A--A-TCCAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GT-T--TTA-TAAAA
gi|78305 : tgcACTCCTAATGAAAT-CA-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----T--GA--AATCGAA-GGTTGCAG-T--GA-CT-G-GTAAGAA-A-T-TT---C-A----C-ATAC---CGATA-C----------TAT-ATT--A-----------TTG------TTT---TAACAA--TTCT-AGA-G-TCAAA--AATC-TG-T-A--A-----AC------GG-A-AT----CAACG------A--A-T-CAT-A--A-ACT-AGCA-GA--G-T--TTA-TAAAA
gi|78303 : tgcACTTTTTATGAAAT-CT-TAGAAATC-AA-T-ATTCCATT-----T--TA--AATTA-A-AAT-GCAGTT--GA-CC-A-GTAAAAA-A-G-TC---A-A----T-ATA----CGAGA-A-AA-------TAT-ATT--A-----------A--------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TG-T-A--A-----A-------GG-A-TA--G-CAACAT-----A--A-TCCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTG-TAAA
gi|78306 : tacACTTCTGATGAAAT-CT-TAGAAATATAA-T-T--TTAAT-----T--CA--AAT---------GCAGTT--GA-CC-G-GTAAGAA-A-T-TC---A-A----C-ACA----TGAGG-T-AA-------TTT-ATT--A-----------T--------TTT---T---TA--TTAT-C-A-G-TT-AA--AATA-TG-T-A--A-----A-------TT-A-TT--G-CAACAT-----A--A-TCCAT-A--A-ACT-T-AA-AA-GG-T--TTT-TAAAA
gi|78308 : tgcACTCCTGATGAAATGCT-TAGAA-TA-AA-TATGTCTATTGTGTTT--GA--ATTCG-A-G-CTGCAC-T--GA-CC-A-GTAAGAA---T-TC---ATA----C-ATA----CGATA-C-AAATGCATGTAT-ATTT-A-----------T--------TTT---AAACAA--TTAT-A-A-A-GC-TA--AATC--A-T-A--A-----A-------
gi|78307 : tgcATTCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----T--CA--AAactacaaggtcttaaacaattcat
gi|78309 : tacCCTGGTGAAAT-CT-TAGAAACA-AA-T------------------------CG-A-GATT-CAGAA--GA-CC-G-ATACTAA-A-T-TT---A-A----C-ATA----CGATA-C-AA-------TAT-AAT--A-----------T--------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-AA--AACC-TG-T-A--A-----A-------GG-G-AT--G-CAACGT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-G-CA-GA-GA-T--TTT-TAAAA
gi|78312 : CCTGATGAAAT-GT-TGCAAATA-AA-T-TGACCATT-----T--TA--GATAA-A-AAT-GCAGTT--GA-CT-G-GTAAAAA-A-T-TC---A-A----C-ATA----GGAGG-C-AA-------TAT-ATT--A--------------------TTC---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-AA--A
gi|78313 : CCTGATGAAAT-CT---GCAATA-AAAT-TGACCATT-----T--TA--GATAA-A-AAT-GCAGTT--GA-CT-G-GTAAAAA-A-T-TC---A-A----C-ATA----GGAGT-C-AA-------TAT-ATT--A--------------------TTC---TAACAA--TTAT-A-A-G-
gi|78310 : CCTGATAAGAT-AT-TA---ATT-AA-T-TGTCCATT-----G--TA--GATTA-A-AAT-GTAATT--GA-CC-G-AAAAAGA-T-T-TC---A-A----A-ATA----CAATG-A-AA-------TAT-ATT--A-----------T--------TTTTTTTAACAA--TCAT-A-A-G-TT-AA--ATTC-TG-T-A--A-----C-------GA-A-TT--G-CAACAT-----A--A-TTCAT-A--A-AAT-A-CA-GA-CG-T--TAT-TAAAAatacatcatttacggtaccaaatttttatgcaccaagatgcgacattcgacaaattatgtctctaatataattcataaactacagggatttctagaa
gi|78314 : CCTGATGAAAT-CT-TGCAAATA-AA-T-TGACCATT-----TTAGA--AA----A-AAT-GCAGTT--GA-CT-G-GTAAAAA-A-T-TC---A-A----CAATA----GGAGT-C-AA-------TAT-ATT--A---------------------TC---TAAC-A--TTAT-A-A-G-
gi|78311 : CCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCTTATT-----T--GA--AATCG-A-TG--GCAGCT--GA-CC-T-GTAAatacatcatttacggtaccaatttttatgcaccagcaatgcgcatttcgacaaattatgtctctaatataattcataaactacagggatttctagaa
gi|78316 : TAATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTTAATT-----T--GA--AATCG---GGTTGCAGGA--GA--T-GTGTAAG-A-A-T-TCAA-A-A----C-GTA----C--------A-------TAT-A-T--A-----------T--------ATT---TGACAA---TAG-A-A-G-TC-AA--AATC-TGTT-A--A-----A-------G----AT----CGATG-------------CAT-AACA-ACT-G-CACGA-AG-T--TTA-
gi|78315 : TGATAAAAT-CT-T-GAAATA-AA-T-TATTTATT-----T--CA--AATCA-A-AAT-GCAGTT--AA-CT-G-GTAAGAA-T-T-TC---A-A----C-AAG----CAATC-C-AA-------TAT-ATC--A--------------------TTT---TAAAAA--TTATAA-A-A-TT-GA--AATC-TG-T-A-----------------T-A-AC--GTCACAGC-----ATTT-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GT-GG-TTGTTA-CAAA
gi|78317 : GAAAT-CTATAGAAATA-AA-T-TGTCT--T-----T--GG--AAACG-T-AGTTGCAGATCGGA-CT-G-GTAAGAA-A-T-TC---A-AC---C-ATA----C--CA-T-AA-------CA--ATT--A-----------TACACCCTATTT---TAACAAACTTAT-A-A-GATC-CACGAATCATG-T-A--A-----A--------G-A-ATA-G-CACCACCCGTAA--A-TCCATCA--A-ACT-A-CA-GA-GG----TTA-TAAAA
gi|78318 : T-TAGAAA----G-T-TGTCTA-T-----T--AA--AATCG-GTGGATGCAGCT--GA-CG-A-GTAAGGGCA-T-TT---A-A----C-ATAGC--CTAC--C-AA-------TA--ATTTAA-----------T--------TCA---T-ACAA--ATAT-ATA-G-TA-AC--AAT--TG---A--A-----A-------GGTG-GT--G-CAAAGT-----A--A-TTCAT-A--AGACT-A--A-GA--G-T--TTA-TA
gi|78319 : -TAGAAATG-AA-T-TGTCTATT-----T--CA--AATCG-A-GAT-GCAGTT--GA-CC-C-GTAAAAC-A-T-TC---A-A----C-ATA----CGATA-T-AA-------TAT-ATT--A-----------T--------TTT---AAACAA--CTAT-C-A-G-AT-AA--AATT-TG-T-A--A-----A-------GG-A-TT--G-CAGTAT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-TA-GA-GA-T--CTT-TAAAA
gi|78320 : AATC-AA-T-TATCTATT-----T--GACGAATCG-A-G-TTGCAGAT--GA-CT-G-GTAAGAAGA-T-TC---A-A----C-AAG----CGATAAC-AA-------TAT-ATTT-A-----------T--------TTT---TAACAA---TAT-A-ATG-TC-AA--AATC-TG-TAA--A-----A-------GG-A-AT--G-CCAAGT-----A--ATTCCAT----A-ACTAA-CA-GATGGTT--TTACTAAAA
gi|78322 : T-----T--AA--AATGG-A-GTGTACAAGT--GA-C--G-AT--------T-TC---A-A----C-ATATA--CGATA-C-AA-------TAT-ATT--ACATTTGATAA-T--------TTT---TACCAA--TTAT-G-A-G-TT-AA--AATC-TC-T-A--A-----ACTTCTAAAG-A-ATT-G-CAATGT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-A--TTT-TAAAA
gi|78323 : TAAGAA-A-T-TT---A-A----C-ATA----CTATT-C-AA-------TAT-ATT--A-----------T--------TTT---TAAC-A--TTAT-A-T-G-TT-AA--AATC-TG-T-A--A-----A-------G
gi|78324 : aaacgtgtacagtggacctggggctA-A-T-TC---A-A----C-ATA----CAAGG-C-AA-------TAT-ATT--A-----------T--------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TG-T-A--A-----A-------GG-A-AT--G-CAACAT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CT-GA-GG-T--TTA-AAAAA
gi|78321 : -T-TC---A-A----C-ATATA--CGATA-C-CA-------TAT-ATT--ACATTTGAATAAT--------TTT---TACCAA--TTAT-G-A-G-TT-AA--AATC-TC-T-ACAACCTCCA-------AG-A-ATTTG-CAATGT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TT--TAAAA
gi|78313 : tatttaaaagtgtacaatgacgatAATAT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TTC-TAGAA
gi|78314 : cctgatgaaatctgcaataaaattgaccattttagataaaaatgcagttgactggtaaaaaattcaacataggagtcaatatattattctaacaattataagatacatcatttacggtaccaaatttttatgcaccaagatgcgacattcgacaaattatgtctctAATAT-----A--A-TTCAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TTC-TAGAA
Alignments
lowQualScore : 11111 11111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 33333 1 22 1 55555 3333 333 222 22 2 1 1 222 1 1 1 8888 1 2 2 5555555 1 4444 33 44444444444444 222 11 1 2 1 2 1 33 1 1 55555555 77777777 6666 1 22 22 6666666 1 1 22 1 1 1 1 1 1 22 33
lowQualScore : . . . . . . ..... . .. . ..... .... ... ... .. . . . ... . . . .... . . . ....... . .... .. .............. ... .. . . . . . .. . . ........ ........ .... . .. .. ....... . . .. . . . . . . .. ..
lowQualScore : 0 7 5 5 5 5 66666 0 00 5 00000 0000 999 555 00 9 4 4 444 4 4 4 1111 4 8 8 9999999 4 3333 33 88888888888888 444 99 4 8 4 8 4 55 5 5 66666666 11111111 7777 7 11 11 5555555 5 5 22 6 6 6 6 6 6 22 33
consensus : TACNCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TNA--AATCG-A-GGTTGC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-NT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
Reference ( family-605 ) : TACNCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TNA--AATCG-A-GGTTGC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78294 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----TTA--AAACG-A-TGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TG---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AT-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------TA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-G--TTA-TAAAA
gi|78295 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----TTA--AAACG-A-TGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TG---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AT-------TATAA----TT--A--------------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------TA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-G--TTA-TAAAA
gi|78296 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----TTA--AAACG-A-TG-TGC----AG--CTGA-C---GG--TAAGAA-A-TATCTGTA-A-T-A-A----TCAT-A-CGAA-------TA--A----TT--A-----------T--TTC---TA-------TAT-A-----TT-AAG-AATT-TAG-A--------AA--------
gi|78297 : TACACCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCCTATT-----TGA--AATCG-A-GGT-GC----AG--CTGACT---GG--TAAGAA-A-T-TT---A-A-C--TA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-A-TT-AA--AATT-TGT-A--------AA--------GG-T-GT-GCA--A--CAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TCA-TGAAataatttatgaa
gi|78298 : TACACCTGATGAAAT-CT-TAAGAATA-AA-T-TGCTTATT-----TGA--AATCG-A-GGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TG---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTA----AACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-T--TTA-TAAAA
gi|78299 : TACTCCTGATTAAAT-CT-TAGAAATA-GA-T-TGTCTATT-----TAA--AATCG-T-GGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGGA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TAT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TA-AA--AATC-TGC-A--------AA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TA
gi|78300 : TACTCCTAATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TGA--AATCG-A-GGTTGC----AG--ATGACT---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAC-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TC-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-AT-GCA--A--TGC-------AATC-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78301 : ACTCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTTTT-----TGA--AATCG-A-GGT-GC----AG--TTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TC--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TAT-A--------AA--------GG-A-GT-GCA--A--GGT-------TATT-AAT-G--A-ACT-A-CA-GA-GA-A--TTT-TAAAA
gi|78302 : tgcTACACCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCTGATT-----TGA--AATCG-A-GG-TGC----AT--CTGACC---GG--TACAAA-A-T-TG---C-A-C-ATG----CGAT-A-CAAA-------TAT-A----TC--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------GA--------GG-GTGT-GTA--A--CGT-------TATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78303 : ATGAAAT-CT-TAGAAATC-AA-T-ATTCCATT-----TTA--AATTA-A-AAT-GC----AG--TTGACC---AG--TAAAAA-A-G-TC---A-A-T-ATA----CGAG-A-A-AA-------TAT-A----TT--A-----------A--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-TA-GCA--A--CAT-------AATC-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTG-TAAA
gi|78304 : tacactttttACTCCTAATGAAAT-CA-TAGAAAAA-TA-T-TGTCTATT-----TGA--AATCG-A-GGTTGCCATGAA--CT---C---GG--TAAGAA-AAT-TC---A-A-T-ACATTACCAAT-A-C-AA-------TAT-T----TT--A-----------T--TTT----AACAA--TTAT-A-A-G-TC-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-AT-GCA--A--CGT-------AATC-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GT-T--TTA-TAAAA
gi|78305 : tgcACTCCTAATGAAAT-CA-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TGA--AATCGAA-GGTTGC----AG---TGACT---GG--TAAGAA-A-T-TT---C-A-C-ATAC---CGAT-A-C----------TAT-A----TT--A-----------TTGTTT---TAACAA--TTCT-AGA-G-TCAAA--AATC-TGT-A--------AAC-------GG-A-AT--CA--A--CG--------AA-T-CAT-A--A-ACT-AGCA-GA--G-T--TTA-TAAAA
gi|78306 : tgcACTTCTGATGAAAT-CT-TAGAAATATAA-T-T--TTAAT-----TCA--AAT---------GC----AG--TTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ACA----TGAG-G-T-AA-------TTT-A----TT--A-----------T--TTT---T---TA--TTAT-C-A-G-TT-AA--AATA-TGT-A--------AA--------TT-A-TT-GCA--A--CAT-------AATC-CAT-A--A-ACT-T-AA-AA-GG-T--TTT-TAAAA
gi|78307 : tgcATTCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TCA--AA
gi|78308 : tacACTCCTGATGAAATGCT-TAGAA-TA-AA-TATGTCTATTGTGTTTGA--ATTCG-A-G-CTGC----A---CTGACC---AG--TAAGAA---T-TC---ATA-C-ATA----CGAT-A-C-AAATGCATGTAT-AT---TT--A-----------T--TTT---AAACAA--TTATAA-A-G-CT--A--AATC--AT-A--------AA-----------A-CT-ACA--A--GGTCTTAAACAATT-CAT-
gi|78309 : tgcCCTGGTGAAAT-CT-TAGAAA----------------------CA--AATCG-A-GATT-C----AG--AAGACC---GA--TACTAA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----AT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-AA--AACC-TGT-A--------AA--------GG-G-AT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-G-CA-GA-GA-T--TTT-TAAAA
gi|78310 : CCTGATAAGAT-AT-TA---ATT-AA-T-TGTCCATT-----GTA--GATTA-A-AAT-GT----AA--TTGACC---GA--AAAAGA-T-T-TC---A-A-A-ATA----CAAT-G-A-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTTTTTTAACAA--TCAT-A-A-G-TT-AA--ATTC-TGT-A--------AC--------GA-A-TT-GCA--A--CAT-------AATT-CAT-A--A-AAT-A-CA-GA-CG-T--TAT-TAAAA
gi|78311 : CCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCTTATT-----TGA--AATCG-A-TG--GC----AG--CTGACC---TG--TAA
gi|78312 : CCTGATGAAAT-GT-TGCAAATA-AA-T-TGACCATT-----TTA--GATAA-A-AAT-GC----AG--TTGACT---GG--TAAAAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----GGAG-G-C-AA-------TAT-A----TT--A--------------TTC---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-AA--A
gi|78313 : CCTGATGAAAT-CT---GCAATA-AAAT-TGACCATT-----TTA--GATAA-A-AAT-GC----AG--TTGACT---GG--TAAAAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----GGAG-T-C-AA-------TAT-A----TT--A--------------TTC---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-A
gi|78313 : A--A--TAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TTC-TAGAAcatcatttacggtaccaaatttttatgcaccaagatgcgacattcgacaaattatgtctctaatataattcataaactacagggatttctagaa
gi|78314 : cctgatgaaatctgcaataaaattgaccattttagataaaaatgcagttgactggtaaaaaattcaacataggagtcaatatattattctaacaattataagatacatcatttacggtaccaaatttttatgcaccaagatgcgacattcgacaaattatgtctctCCTGATGAAAT-CT-TGCAAATA-AA-T-TGACCATT-----TTA--GA--A-A-AAATGC----AG--TTGACT---GG--TAAAAA-A-T-TC---A-A-CAATA----GGAG-T-C-AA-------TAT-A----TT--A---------------TC---TAAC-A--TTAT-A-A-G-AT-A
gi|78314 : A--A--TAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TTC-TAGAAcatcatttacggtaccaatttttatgcaccagcaatgcgcatttcgacaaattatgtctctaatataattcataaactacagggatttctagaa
gi|78315 : cctgatgaaatcttgcaaataaattgaccattttagaaaaaatgcagttgactggtaaaaaattcaacaataggagtcaatatattatctaacattataagatacatcatttacggtaccaatttttatgcaccagcaatgcgcatttcgacaaattatgtctctTGATAAAAT-CT-T-GAAATA-AA-T-TATTTATT-----TCA--AATCA-A-AAT-GC----AG--TTAACT---GG--TAAGAA-T-T-TC---A-A-C-AAG----CAAT-C-C-AA-------TAT-A----TC--A-----------T--TTT----AAAAA--TTAT-A-A-AATT-GA--AATC-TGT-A--------TA--------AC-G-TC-ACA--G--CAT-------TTTT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GT-GG-TTGTTA-CAAA
gi|78316 : TAATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTTAATT-----TGA--AATCG---GGTTGC----AG--GAGATG---TG--TAAG-A-A-T-TC---A-A---A-A----CG-T-A-C--A-------TAT-A-----T--A-----------T--ATT---TGACAA---TAG-A-A-G-TC-AA--AATC-TGT-T--------AA--------AG-A-TC-G------------------ATG-CAT-AACA-ACT-G-CACGA-AG-T--TTA-
gi|78317 : GAAAT-CTATAGAAATA-AA-T-TGTC--TT-----TGG--AAACG-T-AGTTGC----AGATCGGACT---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-ACC-ATA----CCATAA-C-AAT------TAT-ACACCCT--A--------------TTT---TAACAAACTTAT-A-A-GATC-CACGAATCATGT-A--------AA--------GA-A-TA-GCACCACCCGTA------AATC-CATCA--A-ACT-A-CA-GA-GG----TTA-TAAAA
gi|78318 : T-TAGAAA----G-T-TGTCTATT------AA--AATCG-GTGGATGC----AG--CTGACG---AG--TAAGGGCA-T-TT---A-A-C-ATA----GCCT-ACC-AA-------TA--A----TTTAA-----------T--TCA---T-ACAA--ATAT-ATA-G-TA-AC--AAT--TG--A--------AA--------GGTG-GT-GCA--A--AGT-------AATT-CAT-A--AGACT-A--A-GA--G-T--TTA-TA
gi|78319 : -TAGAAATG-AA-T-TGTCTATT-----TCA--AATCG-A-GAT-GC----AG--TTGACC---CG--TAAAAC-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-T-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---AAACAA--CTAT-C-A-G-AT-AA--AATT-TGT-A--------AA--------GG-A-TT-GCA--G--TAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-TA-GA-GA-T--CTT-TAAAA
gi|78320 : AATC-AA-T-TATCTATT-----TGACGAATCG-A-G-TTGC----AG--ATGACT---GG--TAAGAAGA-T-TC---A-A-C-AAG----CGAT-AAC-AA-------TAT-A----TTT-A-----------T--TTT---TAACAA---TAT-A-ATG-TC-AA--AATC-TGTAA--------AA--------GG-A-AT-GCC--A--AGT-------AATTCCAT----A-ACTAA-CA-GATGGTT--TTACTAAAA
gi|78321 : -T-TC---A-A-C-ATATA--CGAT-A-C-CA-------TAT-A----TT--ACATTTGAATAAT--TTT---TACCAA--TTAT-G-A-G-TT-AA--AATC-TCT-ACAACCTCCAA--------GA-A-TTTGCA--A--TGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TT--TAAAA
gi|78322 : tatttaaaagtgtacaatgacgatT-----TAA--AATGG-A-GTGTAC----AA--GTGAC----GA--T--------T-TC---A-A-C-ATATA--CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--ACATTTGATAA-T--TTT---TACCAA--TTAT-G-A-G-TT-AA--AATC-TCT-A--------AACTTCTAAAGA-A-TT-GCA--A--TGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-A--TTT-TAAAA
gi|78323 : TAC----AG--TGGACCTGGGGCTTAAGAA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CTAT-T-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAAC-A--TTAT-A-T-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------G
gi|78324 : aaacgtgA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CAAG-G-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-AT-GCA--A--CAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CT-GA-GG-T--TTA-AAAAA
Alignments
lowQualScore : 11111 11111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 33333 1 22 1 55555 3333 333 222 22 2 1 1 222 1 1 1 8888 1 2 2 5555555 1 4444 33 44444444444444 222 11 1 2 1 2 1 33 1 1 55555555 77777777 3333 1 22 22 6666666 1 1 22 1 1 1 1 1 1 22 33
lowQualScore : . . . . . . ..... . .. . ..... .... ... ... .. . . . ... . . . .... . . . ....... . .... .. .............. ... .. . . . . . .. . . ........ ........ .... . .. .. ....... . . .. . . . . . . .. ..
lowQualScore : 0 7 5 5 5 5 66666 0 00 5 00000 0000 999 555 00 9 4 4 444 4 4 4 1111 4 8 8 9999999 4 3333 33 88888888888888 444 99 4 8 4 8 4 55 5 5 66666666 11111111 2222 7 11 11 5555555 5 5 22 6 6 6 6 6 6 22 33
consensus : TACNCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TNA--AATCG-A-GGTTGC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-NT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
Reference ( family-605 ) : TACNCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TNA--AATCG-A-GGTTGC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-NT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78294 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----TTA--AAACG-A-TGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TG---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AT-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------TA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-G--TTA-TAAAA
gi|78295 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----TTA--AAACG-A-TGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TG---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AT-------TATAA----TT--A--------------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------TA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-G--TTA-TAAAA
gi|78296 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----TTA--AAACG-A-TG-TGC----AG--CTGA-C---GG--TAAGAA-A-TATCTGTA-A-T-A-A----TCAT-A-CGAA-------TA--A----TT--A-----------T--TTC---TA-------TAT-A-----TT-AAG-AATT-TAG-A--------AA--------
gi|78297 : TACACCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCCTATT-----TGA--AATCG-A-GGT-GC----AG--CTGACT---GG--TAAGAA-A-T-TT---A-A-C--TA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-A-TT-AA--AATT-TGT-A--------AA--------GG-T-GT-GCA--A--CAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TCA-TGAAataatttatgaa
gi|78298 : TACACCTGATGAAAT-CT-TAAGAATA-AA-T-TGCTTATT-----TGA--AATCG-A-GGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TG---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTA----AACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-T--TTA-TAAAA
gi|78299 : TACTCCTGATTAAAT-CT-TAGAAATA-GA-T-TGTCTATT-----TAA--AATCG-T-GGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGGA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TAT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TA-AA--AATC-TGC-A--------AA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TA
gi|78300 : TACTCCTAATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TGA--AATCG-A-GGTTGC----AG--ATGACT---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAC-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TC-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-AT-GCA--A--TGC-------AATC-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78301 : ACTCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTTTT-----TGA--AATCG-A-GGT-GC----AG--TTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TC--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TAT-A--------AA--------GG-A-GT-GCA--A--GGT-------TATT-AAT-G--A-ACT-A-CA-GA-GA-A--TTT-TAAAA
gi|78302 : tgcTACACCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCTGATT-----TGA--AATCG-A-GG-TGC----AT--CTGACC---GG--TACAAA-A-T-TG---C-A-C-ATG----CGAT-A-CAAA-------TAT-A----TC--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------GA--------GG-GTGT-GTA--A--CGT-------TATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78303 : ATGAAAT-CT-TAGAAATC-AA-T-ATTCCATT-----TTA--AATTA-A-AAT-GC----AG--TTGACC---AG--TAAAAA-A-G-TC---A-A-T-ATA----CGAG-A-A-AA-------TAT-A----TT--A-----------A--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-TA-GCA--A--CAT-------AATC-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTG-TAAA
gi|78304 : tacactttttACTCCTAATGAAAT-CA-TAGAAAAA-TA-T-TGTCTATT-----TGA--AATCG-A-GGTTGCCATGAA--CT---C---GG--TAAGAA-AAT-TC---A-A-T-ACATTACCAAT-A-C-AA-------TAT-T----TT--A-----------T--TTT----AACAA--TTAT-A-A-G-TC-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-AT-GCA--A--CGT-------AATC-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GT-T--TTA-TAAAA
gi|78305 : tgcACTCCTAATGAAAT-CA-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TGA--AATCGAA-GGTTGC----AG---TGACT---GG--TAAGAA-A-T-TT---C-A-C-ATAC---CGAT-A-C----------TAT-A----TT--A-----------TTGTTT---TAACAA--TTCT-AGA-G-TCAAA--AATC-TGT-A--------AAC-------GG-A-AT--CA--A--CG--------AA-T-CAT-A--A-ACT-AGCA-GA--G-T--TTA-TAAAA
gi|78306 : tgcACTTCTGATGAAAT-CT-TAGAAATATAA-T-T--TTAAT-----TCA--AAT---------GC----AG--TTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ACA----TGAG-G-T-AA-------TTT-A----TT--A-----------T--TTT---T---TA--TTAT-C-A-G-TT-AA--AATA-TGT-A--------AA--------TT-A-TT-GCA--A--CAT-------AATC-CAT-A--A-ACT-T-AA-AA-GG-T--TTT-TAAAA
gi|78307 : tgcATTCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TCA--AA
gi|78308 : tacACTCCTGATGAAATGCT-TAGAA-TA-AA-TATGTCTATTGTGTTTGA--ATTCG-A-G-CTGC----A---CTGACC---AG--TAAGAA---T-TC---ATA-C-ATA----CGAT-A-C-AAATGCATGTAT-AT---TT--A-----------T--TTT---AAACAA--TTATAA-A-G-CT--A--AATC--AT-A--------AA-----------A-CT-ACA--A--GGTCTTAAACAATT-CAT-
gi|78309 : tgcCCTGGTGAAAT-CT-TAGAAA----------------------CA--AATCG-A-GATT-C----AG--AAGACC---GA--TACTAA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----AT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-AA--AACC-TGT-A--------AA--------GG-G-AT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-G-CA-GA-GA-T--TTT-TAAAA
gi|78310 : CCTGATAAGAT-AT-TA---ATT-AA-T-TGTCCATT-----GTA--GATTA-A-AAT-GT----AA--TTGACC---GA--AAAAGA-T-T-TC---A-A-A-ATA----CAAT-G-A-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTTTTTTAACAA--TCAT-A-A-G-TT-AA--ATTC-TGT-A--------AC--------GA-A-TT-GCA--A--CAT-------AATT-CAT-A--A-AAT-A-CA-GA-CG-T--TAT-TAAAA
gi|78311 : CCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCTTATT-----TGA--AATCG-A-TG--GC----AG--CTGACC---TG--TAA
gi|78312 : CCTGATGAAAT-GT-TGCAAATA-AA-T-TGACCATT-----TTA--GATAA-A-AAT-GC----AG--TTGACT---GG--TAAAAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----GGAG-G-C-AA-------TAT-A----TT--A--------------TTC---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-AA--A
gi|78313 : CCTGATGAAAT-CT---GCAATA-AAAT-TGACCATT-----TTA--GATAA-A-AAT-GC----AG--TTGACT---GG--TAAAAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----GGAG-T-C-AA-------TAT-A----TT--A--------------TTC---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-A
gi|78313 : A--A--TAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TTC-TAGAAcatcatttacggtaccaaatttttatgcaccaagatgcgacattcgacaaattatgtctctaatataattcataaactacagggatttctagaa
gi|78314 : cctgatgaaatctgcaataaaattgaccattttagataaaaatgcagttgactggtaaaaaattcaacataggagtcaatatattattctaacaattataagatacatcatttacggtaccaaatttttatgcaccaagatgcgacattcgacaaattatgtctctCCTGATGAAAT-CT-TGCAAATA-AA-T-TGACCATT-----TTA--GA--A-A-AAATGC----AG--TTGACT---GG--TAAAAA-A-T-TC---A-A-CAATA----GGAG-T-C-AA-------TAT-A----TT--A---------------TC---TAAC-A--TTAT-A-A-G-AT-A
gi|78314 : A--A--TAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TTC-TAGAAcatcatttacggtaccaatttttatgcaccagcaatgcgcatttcgacaaattatgtctctaatataattcataaactacagggatttctagaa
gi|78315 : cctgatgaaatcttgcaaataaattgaccattttagaaaaaatgcagttgactggtaaaaaattcaacaataggagtcaatatattatctaacattataagatacatcatttacggtaccaatttttatgcaccagcaatgcgcatttcgacaaattatgtctctTGATAAAAT-CT-T-GAAATA-AA-T-TATTTATT-----TCA--AATCA-A-AAT-GC----AG--TTAACT---GG--TAAGAA-T-T-TC---A-A-C-AAG----CAAT-C-C-AA-------TAT-A----TC--A-----------T--TTT----AAAAA--TTAT-A-A-AATT-GA--AATC-TGT-A--------TA--------AC-G-TC-ACA--G--CAT-------TTTT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GT-GG-TTGTTA-CAAA
gi|78316 : TAATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTTAATT-----TGA--AATCG---GGTTGC----AG--GAGATG---TG--TAAG-A-A-T-TC---A-A---A-A----CG-T-A-C--A-------TAT-A-----T--A-----------T--ATT---TGACAA---TAG-A-A-G-TC-AA--AATC-TGT-T--------AA--------AG-A-TC-G------------------ATG-CAT-AACA-ACT-G-CACGA-AG-T--TTA-
gi|78317 : GAAAT-CTATAGAAATA-AA-T-TGTC--TT-----TGG--AAACG-T-AGTTGC----AGATCGGACT---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-ACC-ATA----CCATAA-C-AAT------TAT-ACACCCT--A--------------TTT---TAACAAACTTAT-A-A-GATC-CACGAATCATGT-A--------AA--------GA-A-TA-GCACCACCCGTA------AATC-CATCA--A-ACT-A-CA-GA-GG----TTA-TAAAA
gi|78318 : T-TAGAAA----G-T-TGTCTATT------AA--AATCG-GTGGATGC----AG--CTGACG---AG--TAAGGGCA-T-TT---A-A-C-ATA----GCCT-ACC-AA-------TA--A----TTTAA-----------T--TCA---T-ACAA--ATAT-ATA-G-TA-AC--AAT--TG--A--------AA--------GGTG-GT-GCA--A--AGT-------AATT-CAT-A--AGACT-A--A-GA--G-T--TTA-TA
gi|78319 : -TAGAAATG-AA-T-TGTCTATT-----TCA--AATCG-A-GAT-GC----AG--TTGACC---CG--TAAAAC-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-T-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---AAACAA--CTAT-C-A-G-AT-AA--AATT-TGT-A--------AA--------GG-A-TT-GCA--G--TAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-TA-GA-GA-T--CTT-TAAAA
gi|78320 : AATC-AA-T-TATCTATT-----TGACGAATCG-A-G-TTGC----AG--ATGACT---GG--TAAGAAGA-T-TC---A-A-C-AAG----CGAT-AAC-AA-------TAT-A----TTT-A-----------T--TTT---TAACAA---TAT-A-ATG-TC-AA--AATC-TGTAA--------AA--------GG-A-AT-GCC--A--AGT-------AATTCCAT----A-ACTAA-CA-GATGGTT--TTACTAAAA
gi|78321 : -T-TC---A-A-C-ATATA--CGAT-A-C-CA-------TAT-A----TT--ACATTTGAATAAT--TTT---TACCAA--TTAT-G-A-G-TT-AA--AATC-TCT-ACAACCTCCAA--------GA-A-TTTGCA--A--TGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TT--TAAAA
gi|78322 : tatttaaaagtgtacaatgacgatT-----TAA--AATGG-A-GTGTAC----AA--GTGAC----GA--T--------T-TC---A-A-C-ATATA--CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--ACATTTGATAA-T--TTT---TACCAA--TTAT-G-A-G-TT-AA--AATC-TCT-A--------AACTTCTAAAGA-A-TT-GCA--A--TGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-A--TTT-TAAAA
gi|78323 : TAC----AG--TGGACCTGGGGCTTAAGAA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CTAT-T-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAAC-A--TTAT-A-T-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------G
gi|78324 : aaacgtgA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CAAG-G-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-AT-GCA--A--CAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CT-GA-GG-T--TTA-AAAAA
blockSeqs : A G A T A A GTGTT T CG A TGGAT CATG ATC TGG CT C A A TGT T C A TTAC A C G ATGCATG A CACC TA CATTTGAATAAT TTT AC A G T A A CG A A CAACCTCC CTTCTAAA GTG T CC CC CTTAAAC C C AC G A G C T T TG AC
blockSeqs : A . . . . . . T . . GGTT . C . . G . . . . . . TA . A A T . T T CATTTGATAAT . . . T . A . G . . . C TGG . . . A . . . . . . . . . . A
blockSeqs : A . . . . . . G . . GGTT . C . . . . . . . . . TA . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : A . . . . . . G . . GGTT . C . . . . . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : T . . . . . . A . . GATT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : T . . . . . . G . . AAAT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : T . . . . . . G . . GGTT . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : A . . . . . . G . . AGTT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : T . . . . . . T . . GTGT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : T . . . . . . G . . TGT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : T . . . . . . G . . TGT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : T . . . . . . C . . GGT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : T . . . . . . C . . GGT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . G . . GGT . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . C . . GGT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . T . . GGT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . G . . AAT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T . . GCT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T . . AAT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T . . AAT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . C . . AAT . G . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . G . . AAT . C . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . G . . GAT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . A . . GTT . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . TG . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TACNCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TNA--AATCG-A-GGTTGC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-NT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
finalCons : TACNCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TNA--AATCG-A-GGTTGC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-NT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
Alignments
lowQualScore : 11111 11111111111111
lowQualScore : 1 1 1 1 1 1 33333 1 22 1 55555 3333 333 222 22 2 1 1 222 1 1 1 8888 1 2 2 5555555 1 4444 33 44444444444444 222 11 1 2 1 2 1 33 1 1 55555555 77777777 3333 1 22 22 6666666 1 1 22 1 1 1 1 1 1 22 33
lowQualScore : . . . . . . ..... . .. . ..... .... ... ... .. . . . ... . . . .... . . . ....... . .... .. .............. ... .. . . . . . .. . . ........ ........ .... . .. .. ....... . . .. . . . . . . .. ..
lowQualScore : 0 7 5 5 5 5 66666 0 00 5 00000 0000 999 555 00 9 4 4 444 4 4 4 1111 4 8 8 9999999 4 3333 33 88888888888888 444 99 4 8 4 8 4 55 5 5 66666666 11111111 2222 7 11 11 5555555 5 5 22 6 6 6 6 6 6 22 33
consensus : TACNCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TNA--AATCG-A-GGTTGC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-NT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
Reference ( family-605 ) : TACNCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TNA--AATCG-A-GGTTGC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-NT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78294 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----TTA--AAACG-A-TGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TG---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AT-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------TA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-G--TTA-TAAAA
gi|78295 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----TTA--AAACG-A-TGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TG---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AT-------TATAA----TT--A--------------TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------TA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-G--TTA-TAAAA
gi|78296 : TACACTTGATGAAAT-CT-TAGATATA-AA-T-TGTTTATT-----TTA--AAACG-A-TG-TGC----AG--CTGA-C---GG--TAAGAA-A-TATCTGTA-A-T-A-A----TCAT-A-CGAA-------TA--A----TT--A-----------T--TTC---TA-------TAT-A-----TT-AAG-AATT-TAG-A--------AA--------
gi|78297 : TACACCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCCTATT-----TGA--AATCG-A-GGT-GC----AG--CTGACT---GG--TAAGAA-A-T-TT---A-A-C--TA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-A-TT-AA--AATT-TGT-A--------AA--------GG-T-GT-GCA--A--CAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TCA-TGAAataatttatgaa
gi|78298 : TACACCTGATGAAAT-CT-TAAGAATA-AA-T-TGCTTATT-----TGA--AATCG-A-GGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TG---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTA----AACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GA-T--TTA-TAAAA
gi|78299 : TACTCCTGATTAAAT-CT-TAGAAATA-GA-T-TGTCTATT-----TAA--AATCG-T-GGT-GC----AG--CTGACC---GG--TAAGGA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TAT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TA-AA--AATC-TGC-A--------AA--------GG-T-GT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TA
gi|78300 : TACTCCTAATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TGA--AATCG-A-GGTTGC----AG--ATGACT---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAC-A-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TC-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-AT-GCA--A--TGC-------AATC-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78301 : ACTCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTTTT-----TGA--AATCG-A-GGT-GC----AG--TTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TC--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TAT-A--------AA--------GG-A-GT-GCA--A--GGT-------TATT-AAT-G--A-ACT-A-CA-GA-GA-A--TTT-TAAAA
gi|78302 : tgcTACACCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCTGATT-----TGA--AATCG-A-GG-TGC----AT--CTGACC---GG--TACAAA-A-T-TG---C-A-C-ATG----CGAT-A-CAAA-------TAT-A----TC--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------GA--------GG-GTGT-GTA--A--CGT-------TATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTA-TAAAA
gi|78303 : ATGAAAT-CT-TAGAAATC-AA-T-ATTCCATT-----TTA--AATTA-A-AAT-GC----AG--TTGACC---AG--TAAAAA-A-G-TC---A-A-T-ATA----CGAG-A-A-AA-------TAT-A----TT--A-----------A--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-TA-GCA--A--CAT-------AATC-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-T--TTG-TAAA
gi|78304 : tacactttttACTCCTAATGAAAT-CA-TAGAAAAA-TA-T-TGTCTATT-----TGA--AATCG-A-GGTTGCCATGAA--CT---C---GG--TAAGAA-AAT-TC---A-A-T-ACATTACCAAT-A-C-AA-------TAT-T----TT--A-----------T--TTT----AACAA--TTAT-A-A-G-TC-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-AT-GCA--A--CGT-------AATC-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GT-T--TTA-TAAAA
gi|78305 : tgcACTCCTAATGAAAT-CA-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TGA--AATCGAA-GGTTGC----AG---TGACT---GG--TAAGAA-A-T-TT---C-A-C-ATAC---CGAT-A-C----------TAT-A----TT--A-----------TTGTTT---TAACAA--TTCT-AGA-G-TCAAA--AATC-TGT-A--------AAC-------GG-A-AT--CA--A--CG--------AA-T-CAT-A--A-ACT-AGCA-GA--G-T--TTA-TAAAA
gi|78306 : tgcACTTCTGATGAAAT-CT-TAGAAATATAA-T-T--TTAAT-----TCA--AAT---------GC----AG--TTGACC---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-A-C-ACA----TGAG-G-T-AA-------TTT-A----TT--A-----------T--TTT---T---TA--TTAT-C-A-G-TT-AA--AATA-TGT-A--------AA--------TT-A-TT-GCA--A--CAT-------AATC-CAT-A--A-ACT-T-AA-AA-GG-T--TTT-TAAAA
gi|78307 : tgcATTCCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTCTATT-----TCA--AA
gi|78308 : tacACTCCTGATGAAATGCT-TAGAA-TA-AA-TATGTCTATTGTGTTTGA--ATTCG-A-G-CTGC----A---CTGACC---AG--TAAGAA---T-TC---ATA-C-ATA----CGAT-A-C-AAATGCATGTAT-AT---TT--A-----------T--TTT---AAACAA--TTATAA-A-G-CT--A--AATC--AT-A--------AA-----------A-CT-ACA--A--GGTCTTAAACAATT-CAT-
gi|78309 : tgcCCTGGTGAAAT-CT-TAGAAA----------------------CA--AATCG-A-GATT-C----AG--AAGACC---GA--TACTAA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CGAT-A-C-AA-------TAT-A----AT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-AA--AACC-TGT-A--------AA--------GG-G-AT-GCA--A--CGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-G-CA-GA-GA-T--TTT-TAAAA
gi|78310 : CCTGATAAGAT-AT-TA---ATT-AA-T-TGTCCATT-----GTA--GATTA-A-AAT-GT----AA--TTGACC---GA--AAAAGA-T-T-TC---A-A-A-ATA----CAAT-G-A-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTTTTTTAACAA--TCAT-A-A-G-TT-AA--ATTC-TGT-A--------AC--------GA-A-TT-GCA--A--CAT-------AATT-CAT-A--A-AAT-A-CA-GA-CG-T--TAT-TAAAA
gi|78311 : CCTGATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGCTTATT-----TGA--AATCG-A-TG--GC----AG--CTGACC---TG--TAA
gi|78312 : CCTGATGAAAT-GT-TGCAAATA-AA-T-TGACCATT-----TTA--GATAA-A-AAT-GC----AG--TTGACT---GG--TAAAAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----GGAG-G-C-AA-------TAT-A----TT--A--------------TTC---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-AA--A
gi|78313 : CCTGATGAAAT-CT---GCAATA-AAAT-TGACCATT-----TTA--GATAA-A-AAT-GC----AG--TTGACT---GG--TAAAAA-A-T-TC---A-A-C-ATA----GGAG-T-C-AA-------TAT-A----TT--A--------------TTC---TAACAA--TTAT-A-A-G-AT-A
gi|78313 : A--A--TAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TTC-TAGAAcatcatttacggtaccaaatttttatgcaccaagatgcgacattcgacaaattatgtctctaatataattcataaactacagggatttctagaa
gi|78314 : cctgatgaaatctgcaataaaattgaccattttagataaaaatgcagttgactggtaaaaaattcaacataggagtcaatatattattctaacaattataagatacatcatttacggtaccaaatttttatgcaccaagatgcgacattcgacaaattatgtctctCCTGATGAAAT-CT-TGCAAATA-AA-T-TGACCATT-----TTA--GA--A-A-AAATGC----AG--TTGACT---GG--TAAAAA-A-T-TC---A-A-CAATA----GGAG-T-C-AA-------TAT-A----TT--A---------------TC---TAAC-A--TTAT-A-A-G-AT-A
gi|78314 : A--A--TAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TTC-TAGAAcatcatttacggtaccaatttttatgcaccagcaatgcgcatttcgacaaattatgtctctaatataattcataaactacagggatttctagaa
gi|78315 : cctgatgaaatcttgcaaataaattgaccattttagaaaaaatgcagttgactggtaaaaaattcaacaataggagtcaatatattatctaacattataagatacatcatttacggtaccaatttttatgcaccagcaatgcgcatttcgacaaattatgtctctTGATAAAAT-CT-T-GAAATA-AA-T-TATTTATT-----TCA--AATCA-A-AAT-GC----AG--TTAACT---GG--TAAGAA-T-T-TC---A-A-C-AAG----CAAT-C-C-AA-------TAT-A----TC--A-----------T--TTT----AAAAA--TTAT-A-A-AATT-GA--AATC-TGT-A--------TA--------AC-G-TC-ACA--G--CAT-------TTTT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GT-GG-TTGTTA-CAAA
gi|78316 : TAATGAAAT-CT-TAGAAATA-AA-T-TGTTAATT-----TGA--AATCG---GGTTGC----AG--GAGATG---TG--TAAG-A-A-T-TC---A-A---A-A----CG-T-A-C--A-------TAT-A-----T--A-----------T--ATT---TGACAA---TAG-A-A-G-TC-AA--AATC-TGT-T--------AA--------AG-A-TC-G------------------ATG-CAT-AACA-ACT-G-CACGA-AG-T--TTA-
gi|78317 : GAAAT-CTATAGAAATA-AA-T-TGTC--TT-----TGG--AAACG-T-AGTTGC----AGATCGGACT---GG--TAAGAA-A-T-TC---A-ACC-ATA----CCATAA-C-AAT------TAT-ACACCCT--A--------------TTT---TAACAAACTTAT-A-A-GATC-CACGAATCATGT-A--------AA--------GA-A-TA-GCACCACCCGTA------AATC-CATCA--A-ACT-A-CA-GA-GG----TTA-TAAAA
gi|78318 : T-TAGAAA----G-T-TGTCTATT------AA--AATCG-GTGGATGC----AG--CTGACG---AG--TAAGGGCA-T-TT---A-A-C-ATA----GCCT-ACC-AA-------TA--A----TTTAA-----------T--TCA---T-ACAA--ATAT-ATA-G-TA-AC--AAT--TG--A--------AA--------GGTG-GT-GCA--A--AGT-------AATT-CAT-A--AGACT-A--A-GA--G-T--TTA-TA
gi|78319 : -TAGAAATG-AA-T-TGTCTATT-----TCA--AATCG-A-GAT-GC----AG--TTGACC---CG--TAAAAC-A-T-TC---A-A-C-ATA----CGAT-A-T-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---AAACAA--CTAT-C-A-G-AT-AA--AATT-TGT-A--------AA--------GG-A-TT-GCA--G--TAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-TA-GA-GA-T--CTT-TAAAA
gi|78320 : AATC-AA-T-TATCTATT-----TGACGAATCG-A-G-TTGC----AG--ATGACT---GG--TAAGAAGA-T-TC---A-A-C-AAG----CGAT-AAC-AA-------TAT-A----TTT-A-----------T--TTT---TAACAA---TAT-A-ATG-TC-AA--AATC-TGTAA--------AA--------GG-A-AT-GCC--A--AGT-------AATTCCAT----A-ACTAA-CA-GATGGTT--TTACTAAAA
gi|78321 : -T-TC---A-A-C-ATATA--CGAT-A-C-CA-------TAT-A----TT--ACATTTGAATAAT--TTT---TACCAA--TTAT-G-A-G-TT-AA--AATC-TCT-ACAACCTCCAA--------GA-A-TTTGCA--A--TGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GG-GA-T--TT--TAAAA
gi|78322 : tatttaaaagtgtacaatgacgatT-----TAA--AATGG-A-GTGTAC----AA--GTGAC----GA--T--------T-TC---A-A-C-ATATA--CGAT-A-C-AA-------TAT-A----TT--ACATTTGATAA-T--TTT---TACCAA--TTAT-G-A-G-TT-AA--AATC-TCT-A--------AACTTCTAAAGA-A-TT-GCA--A--TGT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CA-GA-GG-A--TTT-TAAAA
gi|78323 : TAC----AG--TGGACCTGGGGCTTAAGAA-A-T-TT---A-A-C-ATA----CTAT-T-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAAC-A--TTAT-A-T-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------G
gi|78324 : aaacgtgA-A-T-TC---A-A-C-ATA----CAAG-G-C-AA-------TAT-A----TT--A-----------T--TTT---TAACAA--TTAT-A-A-G-TT-AA--AATC-TGT-A--------AA--------GG-A-AT-GCA--A--CAT-------AATT-CAT-A--A-ACT-A-CT-GA-GG-T--TTA-AAAAA