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Reference ( gi|94919 ) : ACGCAATTAC---GTT-A---AGGT--CT-CCCAT-AAGA-A-AA---TG-C-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-T-G-TG-AAA-T-----T-ACA--C------C-----C---A--AAT---TC----A----C-A--A------TG-C---CA-A---T-T----TT-A-A----T--TG----TA-T--C--G-G-TTAAAC--A-------CC-GAG-AC-C---AT-ACTTC------CC-G-T-ACC-T-T-AAC-TG--T-GAC----C-G------G----G--T---A------C-ATA--CAT---T----------TC--C-C--AC-A-T-ACT---AAT-T---A--CC-G-T-G-ACGTC-AGC-T-ATGA
gi|94922 : ACGCAAT-AC---ATT-A-----GT--CT-CCCAT-AAGA-A-AA---TG-C-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-T-G-TA-AAA-T-----T-ACA--C------T-----CTTCA--AAT---TC----A----C-A--A------TG-C---CA-A---T-T----TT-A-A----T--TG----TA-T--C--G-G-TTAAAC--A-------CC-GAA-CC-C---AT-ACTT-------CC-G-T-ACC-T-T-GAC-TG--T-GAC----C-G------G----G--T---AT-----C-ATA--CAT---T----------TT--C-C--AC-A-T-ACT---AAT-T---A--CC-G-CGG-ACGTC-AGC-T-ATGA
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gi|94921 : ACGCAATTAC---GTT-A---AAGG--CT-CCCAT-AAGA-A-AA---TG-C-AG--TC----ATAA-T-CTG-G-T-G-TG-AAA-T-----T-ACAA-C------T-----C---A--AAT---TC----A----C-A--A------TA-A---CA-A---T-T----TT-A-A----T--TG----TA-T--C--G-G-TTAAAC--T-------CC-GAG-AC-C---AT-GCTTC------CC-A-T-ACC-T-T-GAC-TG--C-GAT----CGG------G----G--T---AT-----C-ATA--CAT---T----------TC--C-C--AC-A-T-ACT---AAT-T---AC-CC-G-T-G-ACGT
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Reference ( family-604 ) : ACGCAATTAC---G-TT-A---AG-GGCTCCC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-T-G-TG-AAAT-----T-ACA--C-C------C---A--AA-T---TCA----C----A-A------TG-C---CA-A---T-T----TT-A-A----T--T-----G----TA-T--C--G-G-TTAAAC--A-------CC-GAG--AC-C---A-T-ACT--TCCC-A-T-A---CC-T-TG-AC-TG----C-GAC----C-G------G-G-T----A-----T---CATA--CATT-T---C--C-C--AC-A-T-ACT---AA--T-TA-CC-CGTG-ACGTC-AGC-T-ATGA
gi|94919 : ACGCAATTAC---G-TT-A---AG-GTCTCCC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-T-G-TG-AAAT-----T-ACA--C-C------C---A--AA-T---TCA----C----A-A------TG-C---CA-A---T-T----TT-A-A----T--T-----G----TA-T--C--G-G-TTAAAC--A-------CC-GAG--AC-C---A-T-ACT--TCCC-G-T-A---CC-T-TA-AC-TG----T-GAC----C-G------G-G-T----A---------CATA--CATT-T---C--C-C--AC-A-T-ACT---AA--T-TA--C-CGTG-ACGTC-AGC-T-ATGA
gi|94920 : ACGCAATTAC---G-TT-A---AA-GGTTCCC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-T-G-TG-AAAT-----T-ACAACC-T------C---A--AA-T---TCA----C----A-A------TA-C---CA-A---T-T----TT-A-A----T--T-----G----TA-T--C--G-G-TTAAAC--A-------CC-GAGC-AC-C---A-T-ACT--TCTC-A-T-A---CC-T-TG-AC-TG----C-GAC----C-G------G-G-T----A-----T---CATA--CCTT-T---C--C-C--CCTA-T-AAT---AA--T-TA-CC-CGTG-ACGTC-AGC-T-ATGA
gi|94921 : ACGCAATTAC---G-TT-A---AA-GGCTCCC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TC----ATAA-T-CTG-G-T-G-TG-AAAT-----T-ACAA-C-T------C---A--AA-T---TCA----C----A-A------TA-A---CA-A---T-T----TT-A-A----T--T-----G----TA-T--C--G-G-TTAAAC--T-------CC-GAG--AC-C---A-T-GCT--TCCC-A-T-A---CC-T-TG-AC-TG----C-GAT----CGG------G-G-T----A-----T---CATA--CATT-T---C--C-C--AC-A-T-ACT---AA--T-TA-CC-CGTG-ACGT
gi|94922 : ACGCAAT-AC---A-TT-A------GTCTCCC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-T-G-TA-AAAT-----T-ACA--C-T------CTTCA--AA-T---TCA----C----A-A------TG-C---CA-A---T-T----TT-A-A----T--T-----G----TA-T--C--G-G-TTAAAC--A-------CC-GAA--CC-C---A-T-ACT--TCC--G-T-A---CC-T-TG-AC-TG----T-GAC----C-G------G-G-T----A-----T---CATA--CATT-T---T--C-C--AC-A-T-ACT---AA--T-TA-CCGCG-G-ACGTC-AGC-T-ATGA
gi|94923 : ACGCAATTAC---G-TT-A---AG-GTCTCCC-AT-AAGA-ACAA---T--C-A---T-----ATAA-T-CTGCG-T-G-TG-AAAT-----T-ACA--C-CT-----C---A--AA-T---TCA----C----A-A------TGGC---CA-A---T-T----TTTA-A----T--T-----G----TA-T--C--G-G-TTTAAA--A-------CC-GAG--AC-C---A-TAACT--TCCC-G---A---CC-T-TG-ACGTG----T-GAC----CGG------G-G-T----A-----T---TATA--CATT-T---C--C-C--AC-A-T-ATT----A--T-TA-CC-CGTG-AC-TC-AGC-T-ATGA
gi|94924 : ATGCAATTAC---G-TT-A---AA-GGCTTCC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TG----ATAA-T-TTG-G-C-G-TG-AAAT-----T-ACAG-C-T------T---A--AA-T---TCA----C----A-A------T-------A-A---T-A----AT-A-A----T--T-----G----TA-T--T--G-G-TTCAAC--A-------CC-GAG--GC-C---A-T-AAT--TCCA-C-T-A---TG-C-TG-AT-TG----G-GAT----C-A------ATA-T----A-----T---CATA--CATT-T---T--C-C--AC-A-A-AGT---AA--T-TA-CC-CGAG-ACGTC-AGC-T-AT
gi|94925 : ACACAACTAC---G-TA-A---AG-GGCTCCC-AT-AAGA-A-AA---T-AC-AG--TG----ATCA-T-TTG-G-C-G-TT-AAAT-----T-AAA--C-TAAACTTC---A--AA-T---TCA----A----A-A------T-------A-A---T-A----AT-A-A----C--T-----G----TG-T--T--G-G-CTAAAC--A-------CC-GAT--AT-C---A-T-ACG--TCCA-A-T-A---CG-T-TG-AC-TG----C-CCC----G-G------G-G-T----A-----T---CATA--CATT-G---T--C-C--AT-A-T-ACT---AA--T-CA-TT-AGTT-ACGTC-AGC-TGATGA
gi|94926 : ACG-AACTAC---G-TA-A---AG-GGCTCCC-AT-AATA-G-AA---TAAC-AG--TG----ATCA-T-TTG-G-C-G-TT-AAAT-----T-AAA--C-T------C---A--AA-C---TTA---------A-A------TT-C---AA-A---T-T----AT-A-A----TAAT-----G----TG-T--T--G-G-CTAAACAAA-------CCAGAT--AT-C---T-G-ACG--TCCCAA-T-A---CG-T-TG-AC-TGTCCCC-G------C-G------G-GTT----A-----T---CATA--CATTGT---T--C-C--AT-A-TAACT---AA--T-CA-TT-AGTT-ACCCC-GAC-TGATGA
gi|94927 : ACACAATTTT---G-TT-A---AG-GGCTTCC-AT-AGCA-A-AA---T-TT-AA--TGCACTATAA-T-TTG-G-C-G-TG-AAAT-----T-ACT--C-C------T---A--AA-T-----------------A------T-------A-A---T-A----GT-A-A----C--G-----G----TA-A--T--G-G-TTAAAC--A-------CC-AAA--AC-A---A-T-ACT--TCCC-T-G-A---TG-T-TG-AC-TG----C-CAG----C-A------AAG-T----A-----T---CATA--CATT-T---T--C-C--AC-A-T-GGT---AA--A-TA-CC-CGTG-ACATC-AGCTT-ATGA
gi|94928 : ACGCAATTGTATGG-TT-ACTGGG-GGCTCAC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TGG---ATAA-TGCAG-G-C-G-TG-AAAT-----T-ACA--C--------------------------------------------G-C---TA-A---CGT----TT--------T--T-----G----TAAT--C--A-G-TTTAAC--G-------CC-GAG--AC-T---A-T-AAT--TCCC-A-T-A---CC-T-TGAAC-TG----CGGAC----T-A------G-G-G----A-----TGTCCATA--TATT-T---C--CAT--AT-A-T-ACT----A--T-TA-CC-CGTG-ACGTCAAGC-T-
gi|94929 : ACGCAAC-AA---G-TA-A---AG-GGCTCCC-AT-AGTA-A-AA---T-AT-AC--TA----ACAA-T-ATT-G-T-G-TG-GAAT-----T-ACA--C-CT-----C---A--AA-T---TCA----C----G-A------GA-A---GA-A-----T----TT-A-A----T--T-----C----TT-A--C--G-G-AT-AGT--A-------CC-AAA--AC-A---G-C-ACT--ACTC-A-TAA---TG-T-TG-GC-TA----A-AGC----C-G------T-G-T----A-----C---TATA---ATC-C---C--C-CTTA--A-T-GGT---AA--T-TA-CC-CGTG-ACGTC-AGC-T-
gi|94930 : ACGCAATTAC---G-TT-A---AG-GGCTTCC-ATAAAAA-A-AA---T-GC-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-T-G-T
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gi|94935 : CGCAATTGC---G-TT-A------GGCTCCT-A--AAAA-A-AA---T-AG-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-C-G-TG-AAAT-----T-ACA--CTT------C---A--AA-T---TCA----C----A-A------TA-C---CA-A---T-T----TT---A----T--T-----G----TATT--T--A-G-TT-AAT--A-------CG-GAG--A--C---A-T-TCT--TCCT-A-T-A---CC-T-TG-AC-TG----C-GAC----C-G------GTG-T----A-----T---CATA--CA
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gi|94945 : AA-T-TTG-G-T-G--G-GAAT-----T-ACA--C-C------T---A--AAAT---TCA----CCA--ACA------TG--------A---T-T----AT-A-A----T--TCTTACG----TA-T--A--A-G-T---AC----------CC-AAGCAAC-A---A-T-ACC--T------T-A---TG-T-TG-AC-TA----C-AAA----C-A------TTA-T----A-----T---TATA--AGTC-C---C--C-C-------T-AGTGGAAA--T-TC-CC-CGTG-ACGTC-GGC-T-
gi|94946 : TG-G-T-G-TG-GAAT-----TTACA--C-T------A---A--AT-T---TCA----CCAACA-A------TG--------A---T-T----AT-A-A----T--T-----C----T--T--T--A-G-TTAAGT--A-------CC-CAGC-AA-C---A-T-A----TCCT---T-A---TG-T-TG-AC-TA----A-AAA----C-----------------A-----T---TATA--TATA-TAAGT--C-C--AC---T-AGTGGAAA--T-TC-CC-CGTG-ACGTC-GGC-T-
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Alignments
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Reference ( family-604 ) : ACGCAATTAC---G-TT-A---AG-GGCTCCC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-T-G-TG-AAAT-----T-ACA--C-C------C---A--AA-T---TCA----C----A-A------TG-C---CA-A---T-T----TT-A-A----T--T-----G----TA-T--C--G-G-TTAAAC--A-------CC-GAG--AC-C---A-T-ACT--TCCC-A-T-A---CC-T-TG-AC-TG----C-GAC----C-G------G-G-T----A-----T---CATA--CATT-T---C--C-C--AC-A-T-ACT---AA--T-TA-CC-CGTG-ACGTC-AGC-T-ATGA
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gi|94924 : ATGCAATTAC---G-TT-A---AA-GGCTTCC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TG----ATAA-T-TTG-G-C-G-TG-AAAT-----T-ACAG-C-T------T---A--AA-T---TCA----C----A-A------T-------A-A---T-A----AT-A-A----T--T-----G----TA-T--T--G-G-TTCAAC--A-------CC-GAG--GC-C---A-T-AAT--TCCA-C-T-A---TG-C-TG-AT-TG----G-GAT----C-A------ATA-T----A-----T---CATA--CATT-T---T--C-C--AC-A-A-AGT---AA--T-TA-CC-CGAG-ACGTC-AGC-T-AT
gi|94925 : ACACAACTAC---G-TA-A---AG-GGCTCCC-AT-AAGA-A-AA---T-AC-AG--TG----ATCA-T-TTG-G-C-G-TT-AAAT-----T-AAA--C-TAAACTTC---A--AA-T---TCA----A----A-A------T-------A-A---T-A----AT-A-A----C--T-----G----TG-T--T--G-G-CTAAAC--A-------CC-GAT--AT-C---A-T-ACG--TCCA-A-T-A---CG-T-TG-AC-TG----C-CCC----G-G------G-G-T----A-----T---CATA--CATT-G---T--C-C--AT-A-T-ACT---AA--T-CA-TT-AGTT-ACGTC-AGC-TGATGA
gi|94926 : ACG-AACTAC---G-TA-A---AG-GGCTCCC-AT-AATA-G-AA---TAAC-AG--TG----ATCA-T-TTG-G-C-G-TT-AAAT-----T-AAA--C-T------C---A--AA-C---TTA---------A-A------TT-C---AA-A---T-T----AT-A-A----TAAT-----G----TG-T--T--G-G-CTAAACAAA-------CCAGAT--AT-C---T-G-ACG--TCCCAA-T-A---CG-T-TG-AC-TGTCCCC-G------C-G------G-GTT----A-----T---CATA--CATTGT---T--C-C--AT-A-TAACT---AA--T-CA-TT-AGTT-ACCCC-GAC-TGATGA
gi|94927 : ACACAATTTT---G-TT-A---AG-GGCTTCC-AT-AGCA-A-AA---T-TT-AA--TGCACTATAA-T-TTG-G-C-G-TG-AAAT-----T-ACT--C-C------T---A--AA-T-----------------A------T-------A-A---T-A----GT-A-A----C--G-----G----TA-A--T--G-G-TTAAAC--A-------CC-AAA--AC-A---A-T-ACT--TCCC-T-G-A---TG-T-TG-AC-TG----C-CAG----C-A------AAG-T----A-----T---CATA--CATT-T---T--C-C--AC-A-T-GGT---AA--A-TA-CC-CGTG-ACATC-AGCTT-ATGA
gi|94928 : ACGCAATTGTATGG-TT-ACTGGG-GGCTCAC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TGG---ATAA-TGCAG-G-C-G-TG-AAAT-----T-ACA--C--------------------------------------------G-C---TA-A---CGT----TT--------T--T-----G----TAAT--C--A-G-TTTAAC--G-------CC-GAG--AC-T---A-T-AAT--TCCC-A-T-A---CC-T-TGAAC-TG----CGGAC----T-A------G-G-G----A-----TGTCCATA--TATT-T---C--CAT--AT-A-T-ACT----A--T-TA-CC-CGTG-ACGTCAAGC-T-
gi|94929 : ACGCAAC-AA---G-TA-A---AG-GGCTCCC-AT-AGTA-A-AA---T-AT-AC--TA----ACAA-T-ATT-G-T-G-TG-GAAT-----T-ACA--C-CT-----C---A--AA-T---TCA----C----G-A------GA-A---GA-A-----T----TT-A-A----T--T-----C----TT-A--C--G-G-AT-AGT--A-------CC-AAA--AC-A---G-C-ACT--ACTC-A-TAA---TG-T-TG-GC-TA----A-AGC----C-G------T-G-T----A-----C---TATA---ATC-C---C--C-CTTA--A-T-GGT---AA--T-TA-CC-CGTG-ACGTC-AGC-T-
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gi|94936 : CGCAATTAC---GGTT-A---GGTGGCTCC--A--AAGA-A-AACTGT-GCCAG--T-----ATA--T-CTG-G-G-GGTG-ATAT-----TTACA--C-C------T---G--AA-TATTTCA----C----A-A------TG-TACACACA---T-T----TC-ATG----TG-T-----G----TA-T--C--G-G-TTAATG--A-------CC-GAG--ACGC---AAT-ACT--TCCC-G-T-A---CCGT-TG-AC-TG------GAC----C-G------GCG-TTGGAA-----T---CATAATCATT-T---C--C-C--CA-A-T-ACT---AA--T-TA-CC-AGTG-ACGTC-AGC-T-ATGA
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gi|94942 : AC---T-TT-A---AG-GGTTTTC-AT-AGTA-A-AA---T-GT-AC--TA----CAAA-T-TTG-G-T-G-TGAAAATCGATAT-ACA--C-CTCAGT-T---A--AA-T---TCA----T----A-A-------G-CA--TA-A---T-T----AT-A-A----T--T-----AT---TA-T-----G-G-ATAAAC--A-------CT-AAA--AC-A---A-T-ACTACTCCT-A-T-A------T-TG-AC-CA----A-GAC----CTA------G-G-T----T-----C---TATA--AATT-C---C--C-T--TC-A-T-ATT---AATTT-TC-CC-CGTG-ACGTC-AAC-T-
gi|94943 : ---AG-GGTTTCC-AC-AGCA-C-AA--------AG--TA----AT---T-TTG-G-T-G-TG-AAAT-----T-GCA--CTC------C---A--AA-T---TCG----C------A------TG-TA--TA-A---C-T----AT-A-A----A--T-----G----TA------------TAAAC--A-------CT------AC-C---A---------CCA-A-T-C---TG-T-TG-AC-TC----A-GAC----C-G------A-GCT----G-----C---CAGA--CATT-T---CTGC-C--AG-A---A-----AA--T-TT-TC-ATTG-ACGTT-AG
gi|94944 : gtcAGC-A-AACC-T-GC-AG--TG----ATAA-T-CTG-GCT-G-TGAAAAT-----T-ACA--C-CAATA--CTCGA--AA-T---TCACGAGC----A-A------TG-A---CA-A---T-CACTGTT-A-A----TA-T-----GGTGATA-C--CATG-G-TTAAGC--AAACATCTCT-GAGT-AC-T---T-C-ACT--T-CC-G-T-A---CC-TATA-AC-TG----T-GAC----C-GAGAGGCG-A-T----A-----G---CATA--CATT-T---T--CGC--ACTA-T-ACTCA-AA--TATACCC-CGTGAACGTC-AGC-
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blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . G A . . . . . A . . A CTCAGTT . . . . A . TGGC . . . T . . . A . . ATC . . TAT . T GC . . . . G . . C . . . CG . GGG . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . G TCTTC . . . . . . TGCT . . . T . . . A . . TTT . . TA . C AG . . . . . . . C . . . C . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C CATTC . . . . . . TGTA . . . T . . . . . . TC . . AA . . C . . . . . . . C . . . C . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . CTC . . . . . . TAC . . . A . . . . . . TC . . A . . C . . . . . . . G . . . T . TTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . CTC . . . . . . TAA . . . A . . . . . . TC . . T . . C . . . . . . . G . . . T . GGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . CTC . . . . . . TGC . . . A . . . . . . TC . . A . . C . . . . . . . G . . . G . GGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . GTC . . . . . . AAC . . . T . . . . . . TT . . A . . C . . . . . . . G . . . A . GGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . TTC . . . . . . TAC . . . T . . . . . . AT . . A . . A . . . . . . . G . . . T . ATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . CTC . . . . . . TAG . . . T . . . . . . AC . . G . . T . . . . . . . C . . . C . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . TCC . . . . . . TAC . . . T . . . . . . TC . . A . . A . . . . . . . G . . . C . ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . TC . . . . . . TAC . . . T . . . . . . TC . . A . . A . . . . . . . C . . . C . GGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-604 ) : ACGCAATTAC---G-TT-A---AG-GGCTCCC-AT-AAGA-A-AA---T-GC-AG--TG----ATAA-T-CTG-G-T-G-TG-AAA-----T-T-ACA--C------C----C-----A--AA-T---TCA----C----A-A------TG-C---CA-A---T-T----TT-A-A----T--T-----G----TA-TC--G--G-TTAAAC--A-------CC-GAG--AC-C---A-T-ACT--TCCC-A-T-A---CC-T-TG-AC-TG----C-GACC--G-G-----GGT----A-----T-CATA--CATT-T---C--C-C--AC-A-T-ACT---AA--T-TA-CC-CGTG-ACGTC-AGC-T-ATGA
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