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Reference ( gi|59021 )        : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC-CTC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CAATAT-A-GA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTTTCT
gi|59022                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGCCCCCC-CTC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACT--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CAATAT-A-GA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTTTCT
gi|59027                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC--TC-CTCTTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-TAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GCC-CACC--G------A-TGTTA--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-G------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CAATAT-A-GA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGC--------TT--T--T--CAC-AA-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AA-C-GA-T-GGACCT--AAT----CC-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTT
gi|59025                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC--TC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--AA-C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AAAT--TTT---TCT--T--GCA-AA----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTT---G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-GC----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-GTTA-T-GT-TT--CAATAT-A-GA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-A--AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-T-A-C-GT-T--T-T--CC---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTTTCT
gi|59023                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC-CTCTCTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CCG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--ATTC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--GCC--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAA----G-TA-T-GT-TT--CAATAT-A-GA-CT-TA-------------TGGT-TTA--CAAT-AAG----------T--T--TA-AAC-AA-TAGC-A-C-AT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC----TTTTC-TAATTTTCT
gi|59026                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGCGCCCC-CTC-CTCCTTTC-A-GTTAAA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AA-TATTTT---TCT--T--GCATAA----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TACC-AT--------G--T--A-TC---TC------AATGTC-CACC--G------A-TGTGT--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GA--G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CAATATAA-GA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-A--AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-T-A-C-GT-T--T-C-ACA---AC---GA-C-GGACCT--AATGAACCC-G-CCCCC--T-TTTTCTTAATTTTCT
gi|59028                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC-CTT-CCTCTT-C-A-GT--AA-A--AACC-TTGC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-GA-T--TTTC--TAT--T--GCAGAT----CTT-GG-T-A-CCT-GCA-T-TC-ACTTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-G-C-CACC--G------A-TGTTG--G-CCAA-T-C--T-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------A-A------AAAC-T-G-TA-T-GT-TT--CAATATGA-GA-TT-TA-------------TGGT-TTA--CTAT-AAGT--------TTTCT--TA-CAC--A-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---ACAA-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC----TTTTC-TAATTTTCT
gi|59029                      : CTCCA---AGA---ATA-AGG-----C-CCC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-A------TT---TCT--T--GCA-AT-----TT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TCTAATTT-CAT-A-A-TA-CAAT-GGTTAGTG--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T---G-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-G--TT--CAA-AT-A-AATTT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAG---------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-A--T--T-C-AC----AC-A-GA-C-AGCACT--AATAA--C----CCCCC--T-TTT
gi|59024                      : CTCCA----GA---ATA-AGGGCCCCCTCTC-CT--TT-C-A-GT--AA-A--A----TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GCTT---TTT-AA-T--TTTTTCTCT--T--GCA-AT----CTG-CG-T-A-C-T-GCA-T-TCAAATTT-CAT-A-ACTA-C--T-G------GTTT--A-GC---CCTGGCAGAA-GTC-GACG--C------A-TGTTG--A-T----T-C-ATAT--GG-ATT-G-----------CAGG-T---------T-A------CAAATT-G-TA-TAGT-CT----ATAT-G-GG-----A--------------GGT-TTA--C-ATAAAGT--------TT--T--TA-AAC-AA-GA-C-A-C-AT-T--TCC-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA-------CCCCC--T-TTTTC-TAATTTTCT
gi|59030                      : CTCCG---AGA---ATA-AGGGCCCC--CTC-CTCCTC-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---ATT-AA-T--TTT---TCT--A--GTA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTG-CAT-ATT-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTAG--G-C--ATT-C-AT-
gi|59031                      : CTCCA---AGA---ATA-AGG-CCCCC-CTC-CTCCAT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAT-GTT-C-C-AG-CAG-A-----GC-A---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-CG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CATAA-A-TA-C-AT-G------G-----A-TC---TC------AA-GTCGCACCGTG------A-TGTTG--G-CT-A-T-G-AT-C--GG-AATAG-----------CG-A-T---------T-
gi|59032                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGACCTCC-CTC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTGC-GTT-A-C-AG-TAG------------------------------TCT--T--GCA-AT----CAT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT--AT-A-A-TA-C-AT-GCATG--G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-C--GG-AAT-
gi|59033                      :  TCCACTTAGA---ATA-AGGGCCCCC--TC-CCCTTT-G-A-AT--AA-A--A--C-TTA--ACT-A-TTAG-TAA-C-----AT-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--A--GCA-AT----CTT-TG-T-A-T-T-GCA-T-TA-TATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TCG--TC------A
gi|59034                      :   CCA---AGAGAAATATAGGGCCCC---TC-CTCCTT-CCA-GT--AA-AGTA--C-TTAC-GTT-ATC-AGGCAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---T-T--T--GCAGAT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-A--TT-CAT-A-A-TA-C-ATGG------G--T--A-TCGTGTG------AA-GTC-CACC--GAATCGTA-TATTG--G-C--A-TGC-AT-T--GGAGATGG-----------CA-G-T---------TAA------AAAA-A-G-TA-T-GT-TTGAAAATAC-A-GA-TT-TAATCATCATTATTGTAGTCTTACTC-AT-TAGTAG------TT--T--TA-CATAAA-TATC-A-C-GT-T--TCC-AGA---CC-ATGA-C-GACCTT--TATAAC-CC-G-CTCCCCAC-TTTTC-TAATTTTCT
gi|59035                      :    CA---AGA---ATA----GCCCCC-CCT-CTGCTT-C-A-GT--AATA--A--TATTAC-TGT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTTTAA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT-----TT-GG-TTA-C---GCT-T-AC-AATTT-CAT-A-A-TAAC-AT-G------T--T--A-TC---GC------AA-GTC-CAC----------A-TGTTGTGA-C--A-T-C-AT-T--GG-GATAG-----------CA-GAT---------T-A------AAAA-T-A-TA-T-GTGTT--CA-TAT-ATGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-CTGT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA---T-G-CGCCC--T-TTTTC-TAATTTTC
gi|59036                      :    CA---AGA---A-A-AGGGCCCCC--TC-CTCCTT-C-A--T--AA-AT-A--C-TTACTGTTTA-A-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AG-A--TTT---TCT--T--GCA-AT----ATT-GGTT-A-C-T-GCATT-TC-A--TT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GT---ACC--G------A-TGTTG--G----A-T-T-A--T--GG-GAT-G-----------CG-G-TG--------T-A------AAAT-TGG-TATT-GT-TT--CAATATAA-GA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-GAAT--------TT--T--TA--AC-AA-TA-CGA-C-GT-T--T-C-AC----AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA-----G-CTCA-----TTTTC-TAATTTTCT
gi|59037                      :    CA---AGA----TA-AGGGCGCCC-CTC-CTG--T-C-A-GT--AA-A-------TTGC-GTT-A-C--G-CAG-A-----GC-T---TTT-GA-T--TTT---TAT-----GCA--T----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-A-TTT-CAT-A-A-TA---AT-G---------T--A--C---TC------A--GTC-CAC---G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CAAG-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CA-TAT-A-GA-TT--A-------------TGGT-TTAT-C-AT-A-GT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-GT-TTAT-C--CA---AC-A------GGACCT--AATAA---C-G-CCCC-----TTTTC-TAATTT
gi|59038                      :    CA---AGA---ATA-AGGGCTCC---TT-CTCCTT-C-A-AT--AA-A--C--G-TT-C-GTT-A-C-AG-TAG-A-----GC-T---ATT-AAAT--TTT---CCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AGTTT-CAT-A-A-
gi|59039                      :     A---AGA---ATA-AGGGCCCCC--TC-CCCCGT-G-A-AT--AA-A--A--C-TTAC-CTT-A-T-AG-TAA-C-----GT-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--A--GCA-AT----CGT-GG-T-G-C-T-GCA-T-TG-AACTT-CAT-A-A-TG-C-AT-G------G--A--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--A------A-CATCG--G-C--A-T-C-TT-C--AG-AATAG-----------CG-A-TATTTTCCAGT-G------ACAA-T-G-CA----T-TT--CAATGT-
gi|59040                      :                                   CTTT-A-A-AT--AA-A--G--C-TTAT-GTT-A-T-AG-CGG-A-----GG-C---TTT-AA-T--CTT---TCT--CTAACA-ATAAATCTT-GG-A-A-C-T-GCA-T-TT-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--C--A-
gi|59041                      :                                   cCTT-C-AAGT--AA-------C-TTAC-GTC-T-C-AC-CAG-AAGAGCGC-TCCCTTT-AA-T--TTTT--TCT--T--GCA-AT----CTTCGG-T-ACC-T-GCA-T-TC--ATCT-TAT---A-TA-A-AT-G------G--
gi|59042                      :                                                                   -A-C-AG-CAGGA-----GC-T---TTT-AA-A--TTT---TCTATT--GCA-AT----CTC-GA-C---C-C-GCA-TCTC-AATTTTCAT-G-A----C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------ACTGTTG----C--A-TTC-AT-TTTGG-CATTG-----------CA-G-T---------T-A------AAAC-T-G--G-T-GT-TT--CAATAT-A-GA-TTGCA-------------TGG--TTA--C-AT-ATCA--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-AGC-GT-T--T-CGACA---AC-A--A-C-GGACCT--AATAA---C-G-CCCCC----TTTTC-TAATTT
gi|59043                      :                                                                                -----GC-C---TAT-AAGT--TTT---TCT--A--GCA--T----CTT-GG-TTA-C-TAGCA-T-TG-AATTT-CAT-A-A-TA-T-AT-G------G--GGGA-TC---TTTCAA--AA-GTC-CACT--G------A-TGTTG--G-C--A-T-CAAT-T--GG-AAT--------------------------------------AGA-C-A-TA-T--T-TT--CAAT
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Reference ( family-597 )      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC-CTC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CA-ATAT-AGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTTTCT
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gi|59029                      : CTCCA---AGA---ATA-AGG-----C-CCC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-A------TT---TCT--T--GCA-AT-----TT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TCTAATTT-CAT-A-A-TA-CAAT-GGTTAGTG--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T---G-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-G--TT--CA-A-AT-AAATTT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAG---------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-A--T--T-C-AC----AC-A-GA-C-AGCACT--AATAA--C----CCCCC--T-TTT
gi|59030                      : CTCCG---AGA---ATA-AGGGCCCC--CTC-CTCCTC-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---ATT-AA-T--TTT---TCT--A--GTA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTG-CAT-ATT-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTAG--G-C--ATT-C-AT-
gi|59031                      : CTCCA---AGA---ATA-AGG-CCCCC-CTC-CTCCAT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAT-GTT-C-C-AG-CAG-A-----GC-A---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-CG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CATAA-A-TA-C-AT-G------G-----A-TC---TC------AA-GTCGCACCGTG------A-TGTTG--G-CT-A-T-G-AT-C--GG-AATAG-----------CG-A-T---------T-
gi|59032                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGACCTCC-CTC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTGC-GTT-A-C-AG-TAG------------------------------TCT--T--GCA-AT----CAT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT--AT-A-A-TA-C-AT-GCATG--G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-C--GG-AAT-
gi|59033                      :  TCCACTTAGA---ATA-AGGGCCCCC--TC-CCCTTT-G-A-AT--AA-A--A--C-TTA--ACT-A-TTAG-TAA-C-----AT-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--A--GCA-AT----CTT-TG-T-A-T-T-GCA-T-TA-TATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TCG--TC------A
gi|59034                      :   CCA---AGAGAAATATAGGGCCCC---TC-CTCCTT-CCA-GT--AA-AGTA--C-TTAC-GTT-ATC-AGGCAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---T-T--T--GCAGAT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-A--TT-CAT-A-A-TA-C-ATGG------G--T--A-TCGTGTG------AA-GTC-CACC--GAATCGTA-TATTG--G-C--A-TGC-AT-T--GGAGATGG-----------CA-G-T---------TAA------AAAA-A-G-TA-T-GT-TTGAAA-ATAC-AGA-TT-TAATCATCATTATTGTAGTCTTACTC-AT-TAGTAG------TT--T--TA-CATAAA-TATC-A-C-GT-T--TCC-AGA---CC-ATGA-C-GACCTT--TATAAC-CC-G-CTCCCCAC-TTTTC-TAATTTTCT
gi|59035                      :    CA---AGA---ATA----GCCCCC-CCT-CTGCTT-C-A-GT--AATA--A--TATTAC-TGT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTTTAA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT-----TT-GG-TTA-C---GCT-T-AC-AATTT-CAT-A-A-TAAC-AT-G------T--T--A-TC---GC------AA-GTC-CAC----------A-TGTTGTGA-C--A-T-C-AT-T--GG-GATAG-----------CA-GAT---------T-A------AAAA-T-A-TA-T-GTGTT--CATATAT--GA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-CTGT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA---T-G-CGCCC--T-TTTTC-TAATTTTC
gi|59036                      :    CA---AGA---A-A-AGGGCCCCC--TC-CTCCTT-C-A--T--AA-AT-A--C-TTACTGTTTA-A-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AG-A--TTT---TCT--T--GCA-AT----ATT-GGTT-A-C-T-GCATT-TC-A--TT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GT---ACC--G------A-TGTTG--G----A-T-T-A--T--GG-GAT-G-----------CG-G-TG--------T-A------AAAT-TGG-TATT-GT-TT--CA-ATATAAGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-GAAT--------TT--T--TA--AC-AA-TA-CGA-C-GT-T--T-C-AC----AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA-----G-CTCA-----TTTTC-TAATTTTCT
gi|59037                      :    CA---AGA----TA-AGGGCGCCC-CTC-CTG--T-C-A-GT--AA-A-------TTGC-GTT-A-C--G-CAG-A-----GC-T---TTT-GA-T--TTT---TAT-----GCA--T----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-A-TTT-CAT-A-A-TA---AT-G---------T--A--C---TC------A--GTC-CAC---G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CAAG-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CA--TAT-AGA-TT--A-------------TGGT-TTAT-C-AT-A-GT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-GT-TTAT-C--CA---AC-A------GGACCT--AATAA---C-G-CCCC-----TTTTC-TAATTT
gi|59038                      :    CA---AGA---ATA-AGGGCTCC---TT-CTCCTT-C-A-AT--AA-A--C--G-TT-C-GTT-A-C-AG-TAG-A-----GC-T---ATT-AAAT--TTT---CCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AGTTT-CAT-A-A-
gi|59039                      :     A---AGA---ATA-AGGGCCCCC--TC-CCCCGT-G-A-AT--AA-A--A--C-TTAC-CTT-A-T-AG-TAA-C-----GT-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--A--GCA-AT----CGT-GG-T-G-C-T-GCA-T-TG-AACTT-CAT-A-A-TG-C-AT-G------G--A--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--A------A-CATCG--G-C--A-T-C-TT-C--AG-AATAG-----------CG-A-TATTTTCCAGT-G------ACAA-T-G-CA----T-TT--CA-ATGT-
gi|59040                      :                                   CTTT-A-A-AT--AA-A--G--C-TTAT-GTT-A-T-AG-CGG-A-----GG-C---TTT-AA-T--CTT---TCT--CTAACA-ATAAATCTT-GG-A-A-C-T-GCA-T-TT-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--C--A-
gi|59041                      :                                   cCTT-C-AAGT--AA-------C-TTAC-GTC-T-C-AC-CAG-AAGAGCGC-TCCCTTT-AA-T--TTTT--TCT--T--GCA-AT----CTTCGG-T-ACC-T-GCA-T-TC--ATCT-TAT---A-TA-A-AT-G------G--
gi|59042                      :                                                                   -A-C-AG-CAGGA-----GC-T---TTT-AA-A--TTT---TCTATT--GCA-AT----CTC-GA-C---C-C-GCA-TCTC-AATTTTCAT-G-A----C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------ACTGTTG----C--A-TTC-AT-TTTGG-CATTG-----------CA-G-T---------T-A------AAAC-T-G--G-T-GT-TT--CA-ATAT-AGA-TTGCA-------------TGG--TTA--C-AT-ATCA--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-AGC-GT-T--T-CGACA---AC-A--A-C-GGACCT--AATAA---C-G-CCCCC----TTTTC-TAATTT
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lowQualScore                  :      777   777   1         99  1      9 9 9  66  9 44444 9    9   8 8 8  8   8 33333  7 000   7  2 44   555   11111   2  7777   7  7 5 7 7 7   7 7  5     7   7 7 7  5 7  7 777777 44 55 8  222  555555  0   0    88 888888 0     88 0 88 0 8 7  6 22  5   4 88888888888  1 5 777777777 5 666666    6 2 6  2 6  6  22  6    7   8  8  0000000000000    8   33 6  8    11111111  55 55  8   8  8  6 8 8 8  8 55 6 8   000  8 8  8 8      55     555 8 8     4444     0         
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Reference ( family-597 )      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC-CTC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CA-ATAT-AGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTTTCT
gi|59021                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC-CTC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CA-ATAT-AGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTTTCT
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gi|59023                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC-CTCTCTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CCG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--ATTC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--GCC--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAA----G-TA-T-GT-TT--CA-ATAT-AGA-CT-TA-------------TGGT-TTA--CAAT-AAG----------T--T--TA-AAC-AA-TAGC-A-C-AT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC----TTTTC-TAATTTTCT
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gi|59027                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC--TC-CTCTTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-TAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GCC-CACC--G------A-TGTTA--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-G------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CA-ATAT-AGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGC--------TT--T--T--CAC-AA-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AA-C-GA-T-GGACCT--AAT----CC-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTT
gi|59028                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGGCCCCC-CTT-CCTCTT-C-A-GT--AA-A--AACC-TTGC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-GA-T--TTTC--TAT--T--GCAGAT----CTT-GG-T-A-CCT-GCA-T-TC-ACTTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-G-C-CACC--G------A-TGTTG--G-CCAA-T-C--T-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------A-A------AAAC-T-G-TA-T-GT-TT--CA-ATATGAGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--CTAT-AAGT--------TTTCT--TA-CAC--A-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---ACAA-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC----TTTTC-TAATTTTCT
gi|59029                      : CTCCA---AGA---ATA-AGG-----C-CCC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-A------TT---TCT--T--GCA-AT-----TT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TCTAATTT-CAT-A-A-TA-CAAT-GGTTAGTG--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T---G-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-G--TT--CA-A-AT-AAATTT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAG---------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-A--T--T-C-AC----AC-A-GA-C-AGCACT--AATAA--C----CCCCC--T-TTT
gi|59030                      : CTCCG---AGA---ATA-AGGGCCCC--CTC-CTCCTC-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAC-GTT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---ATT-AA-T--TTT---TCT--A--GTA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTG-CAT-ATT-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTAG--G-C--ATT-C-AT-
gi|59031                      : CTCCA---AGA---ATA-AGG-CCCCC-CTC-CTCCAT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTAT-GTT-C-C-AG-CAG-A-----GC-A---TTT-AA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT----CTT-CG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT-CATAA-A-TA-C-AT-G------G-----A-TC---TC------AA-GTCGCACCGTG------A-TGTTG--G-CT-A-T-G-AT-C--GG-AATAG-----------CG-A-T---------T-
gi|59032                      : CTCCA---AGA---ATA-AGGACCTCC-CTC-CTCCTT-C-A-GT--AA-A--A--C-TTGC-GTT-A-C-AG-TAG------------------------------TCT--T--GCA-AT----CAT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AATTT--AT-A-A-TA-C-AT-GCATG--G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-C--GG-AAT-
gi|59033                      :  TCCACTTAGA---ATA-AGGGCCCCC--TC-CCCTTT-G-A-AT--AA-A--A--C-TTA--ACT-A-TTAG-TAA-C-----AT-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--A--GCA-AT----CTT-TG-T-A-T-T-GCA-T-TA-TATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TCG--TC------A
gi|59034                      :   CCA---AGAGAAATATAGGGCCCC---TC-CTCCTT-CCA-GT--AA-AGTA--C-TTAC-GTT-ATC-AGGCAG-A-----GC-T---TTT-AA-T--TTT---T-T--T--GCAGAT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-A--TT-CAT-A-A-TA-C-ATGG------G--T--A-TCGTGTG------AA-GTC-CACC--GAATCGTA-TATTG--G-C--A-TGC-AT-T--GGAGATGG-----------CA-G-T---------TAA------AAAA-A-G-TA-T-GT-TTGAAA-ATAC-AGA-TT-TAATCATCATTATTGTAGTCTTACTC-AT-TAGTAG------TT--T--TA-CATAAA-TATC-A-C-GT-T--TCC-AGA---CC-ATGA-C-GACCTT--TATAAC-CC-G-CTCCCCAC-TTTTC-TAATTTTCT
gi|59035                      :    CA---AGA---ATA----GCCCCC-CCT-CTGCTT-C-A-GT--AATA--A--TATTAC-TGT-A-C-AG-CAG-A-----GC-T---TTTTAA-T--TTT---TCT--T--GCA-AT-----TT-GG-TTA-C---GCT-T-AC-AATTT-CAT-A-A-TAAC-AT-G------T--T--A-TC---GC------AA-GTC-CAC----------A-TGTTGTGA-C--A-T-C-AT-T--GG-GATAG-----------CA-GAT---------T-A------AAAA-T-A-TA-T-GTGTT--CATATAT--GA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-CTGT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA---T-G-CGCCC--T-TTTTC-TAATTTTC
gi|59036                      :    CA---AGA---A-A-AGGGCCCCC--TC-CTCCTT-C-A--T--AA-AT-A--C-TTACTGTTTA-A-AG-CAG-A-----GC-T---TTT-AG-A--TTT---TCT--T--GCA-AT----ATT-GGTT-A-C-T-GCATT-TC-A--TT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GT---ACC--G------A-TGTTG--G----A-T-T-A--T--GG-GAT-G-----------CG-G-TG--------T-A------AAAT-TGG-TATT-GT-TT--CA-ATATAAGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-GAAT--------TT--T--TA--AC-AA-TA-CGA-C-GT-T--T-C-AC----AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA-----G-CTCA-----TTTTC-TAATTTTCT
gi|59037                      :    CA---AGA----TA-AGGGCGCCC-CTC-CTG--T-C-A-GT--AA-A-------TTGC-GTT-A-C--G-CAG-A-----GC-T---TTT-GA-T--TTT---TAT-----GCA--T----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-A-TTT-CAT-A-A-TA---AT-G---------T--A--C---TC------A--GTC-CAC---G------A-TGTTG--G-C--A-T-C-AT-T--GG-GAT-G-----------CAAG-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CA--TAT-AGA-TT--A-------------TGGT-TTAT-C-AT-A-GT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-GT-TTAT-C--CA---AC-A------GGACCT--AATAA---C-G-CCCC-----TTTTC-TAATTT
gi|59038                      :    CA---AGA---ATA-AGGGCTCC---TT-CTCCTT-C-A-AT--AA-A--C--G-TT-C-GTT-A-C-AG-TAG-A-----GC-T---ATT-AAAT--TTT---CCT--T--GCA-AT----CTT-GG-T-A-C-T-GCA-T-TC-AGTTT-CAT-A-A-
gi|59039                      :     A---AGA---ATA-AGGGCCCCC--TC-CCCCGT-G-A-AT--AA-A--A--C-TTAC-CTT-A-T-AG-TAA-C-----GT-T---TTT-AA-T--TTT---TCT--A--GCA-AT----CGT-GG-T-G-C-T-GCA-T-TG-AACTT-CAT-A-A-TG-C-AT-G------G--A--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--A------A-CATCG--G-C--A-T-C-TT-C--AG-AATAG-----------CG-A-TATTTTCCAGT-G------ACAA-T-G-CA----T-TT--CA-ATGT-
gi|59040                      :                                   CTTT-A-A-AT--AA-A--G--C-TTAT-GTT-A-T-AG-CGG-A-----GG-C---TTT-AA-T--CTT---TCT--CTAACA-ATAAATCTT-GG-A-A-C-T-GCA-T-TT-AATTT-CAT-A-A-TA-C-AT-G------G--C--A-
gi|59041                      :                                   cCTT-C-AAGT--AA-------C-TTAC-GTC-T-C-AC-CAG-AAGAGCGC-TCCCTTT-AA-T--TTTT--TCT--T--GCA-AT----CTTCGG-T-ACC-T-GCA-T-TC--ATCT-TAT---A-TA-A-AT-G------G--
gi|59042                      :                                                                   -A-C-AG-CAGGA-----GC-T---TTT-AA-A--TTT---TCTATT--GCA-AT----CTC-GA-C---C-C-GCA-TCTC-AATTTTCAT-G-A----C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------ACTGTTG----C--A-TTC-AT-TTTGG-CATTG-----------CA-G-T---------T-A------AAAC-T-G--G-T-GT-TT--CA-ATAT-AGA-TTGCA-------------TGG--TTA--C-AT-ATCA--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-AGC-GT-T--T-CGACA---AC-A--A-C-GGACCT--AATAA---C-G-CCCCC----TTTTC-TAATTT
gi|59043                      :                                                                                -----GC-C---TAT-AAGT--TTT---TCT--A--GCA--T----CTT-GG-TTA-C-TAGCA-T-TG-AATTT-CAT-A-A-TA-T-AT-G------G--GGGA-TC---TTTCAA--AA-GTC-CACT--G------A-TGTTG--G-C--A-T-CAAT-T--GG-AAT--------------------------------------AGA-C-A-TA-T--T-TT--CA-AT
gi|59044                      :                                                                                                                                                                   -TG-C-AT-G------G--T--A-TC---TC------AA-GTC-CACC--G------A-AATCA--G-C--A-T-C-AT-C--GG-AAT-AACGATATTTTCCA-G-----------T-A------ACAA-T-G-CA----T-TT--CA-ATGT-gcaacaatgcatttcaatgtccctccatgttttaaaaag
gi|59045                      :                                                                                                                                                                                                                                             -C-AT-T--GG--AT-G-----------CT-C-T---------A-A------AAAA-T-G-TAAT-GT-TT--CA-ATATTAGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--AA-CAC-AA--A-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AC-A-GAGC-GCACCC--AATAC--CA-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTT
gi|59046                      :                                                                                                                                                                                                                                          tttag-AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CA-ATAT-AGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-C-GGACCT--AATAA--CC-GTCCCCC--T-TTTTC-TAATCTTCT
gi|59047                      :                                                                                                                                                                                                                                               -AT-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-ACATGTAAAAA-T-G-TA-T-GT-TT--CA-ATAT-AGA-TT-TA-------------TGGT-TTA--G-AT-ACGT--------TT--T--TA-CAC-AA-TA-C-A-G-GT-T--T-C-ACA---GT-A-GA-T-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCCC--T-TTTTC-TAATTTTCT
gi|59048                      :                                                                                                                                                                                                                                               -AT-T--GG-AAT-G-----------CA-G-T---------T-A------GAAA-T-G-TA-T-GT-T---CA-ATAT-AGA-TT-TG-------------TGAT-T-A--C-AT-AAGT--------TT--T--TA-TAT-AA-TA-C-A-C-GT-T--T-C-ACA---AC-A-GA-A-GGACCT--AATAA--CC-G-CCCA-----TTTTC-TAA
gi|59049                      :                                                                                                                                                                                                                                                 T-T--GG-GAT-G-----------CA-G-T---------T-A------AATA-T-G--A-T-GT-TT--CA-ATAT-ATA-TT-TA--------------GAT-TT---T-AA-AAGT--------TT--T--TAACAT-AAATA-C-A-C-ATGT--T-C-ACAG--AC-A-GA-C-GGACTT--A-TAA--CC-G-CCCCC--T-TTTT
gi|59050                      :                                                                                                                                                                                                                                                    --GG-AAT-G-----------CA-G-A---------T-T------AAAA-T-C-TG-T-AA-TT--CA-ATAT-GGA-TT-TA-------------TGCT-TTA--C-AT---GTACATATCCTT--T--TC-CAC-AA-TG-C-A-A-GT-T--T-C-TCA---AC-A-AA-C-AGATCT--AGTAA--CC-G-TTCCC--C-TTTTC-TAATTTTTT
gi|59051                      :                                                                                                                                                                                                                                                       G-GGT-G-----------CG-G-T---------T-T------TAAA-A-G-TA-T-GT-TT--CA-TTAT-GGA-AT-TA-------------TGAT-ATG--T-AT-ATCT--------TT--T--TG-CAC-AA-TG-C-A-A-GC-T--T-C-AAA---AC-A-GA-T-AGACCT--ATTAA--CTAG-CCCCC--CATTTTC-TAATTTT
gi|59052                      :                                                                                                                                                                                                                                                           T-G-----------CA-G-T---------A-G------GAAA-TCG-TA-T-GT-TT--CA-A-AT--GA-TT-T----------------GT-T----C-AT-AAGA--------TT--TAGTT-TAC-AA--A-C-A-C-GT-A--T-C-ACAGAAAC-A-GA-CAGGACCTTAAATAAA-CC-G-CCCC------TTTC-TAATTTTCT


blockSeqs                     :      CTT   GAA   T         TC  T      T C A  TA  T AAC   A    T   T T T  G   G AGAGC  T CCC   T  A AT   TTC   CTA     T  AAAT   C  T T C C A   T C  A     T   A T C  C A  G GTTAGT TT GG T  GTG  TGGCAG  T   G    GT AATCGT C     TG C CA T G A  A TT  A   A ACGATATTTTC  G A ATTTTCCAG A CATGTA    T G T  T A  G  GA  T    A   T  G  ATCATCATTATTG    C   CT A  A    ACATATCC  TC AG  A   A  A  G G G T  G TA C G   GAA  A T  G A      TA     ACC A T     CAC      T
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . GTA   .    .   . . .  .   . .      . .     .  A .    C     ATT     G  .      .  . T . . .   . .  T     .   . . .  A .  . CATG   .  .  .  G    TCAA    .   .    .  .      .     .  . T  . T .  . .   .   G C            A . G         . .         . C .  A .  .  .   .    G   .  .  .                .   T  T  .    AG        .  .   .   .  .  T . . .  . .  C .   G    . .  . .      .      CC  . .     CA       .
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . AA    .    .   . . .  .   . .      . .     .  G .    T     T       G  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   A .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    A   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      AC  . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . TA    .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   A .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    T   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   T .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         C   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     A       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         .   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         .   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     T        .
blockSeqs                     :      .     .     .         .   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     A       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     C        .
blockSeqs                     :      .     .     .         .   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     .        .
blockSeqs                     :      .     .     .         .   .      . . .  .   . C     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      C   . .     .        .
blockSeqs                     :      .     .     .         .   .      . . .  .   . A     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      .   . .     .        .
blockSeqs                     :      .     .     .         .   .      . . .  .   . G     .    .   . . .  .   . .      . .     .  . .    .     T       .  .      .  . . . . .   . .  .     .   . . .  . .  . .      .  .  .  .    .       .   .    .  .      .     .  . .  . . .  . .   .   . .            . . .         . .         . . .  . .  .  .   .    .   .  .  .                .   .  .  .    .         .  .   .   .  .  . . . .  . .  . .   .    . .  . .      .      .   . .     .        .
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