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Reference ( gi|52275 ) : GACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T---ACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--C-T-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C-T-T--T--G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---C-T-A-AT--TA-C-G----G--C----TT---A---T----TG--C-C-T--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--G--A----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52255 : GACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-TG--ACCCG-CAT-A--T-C-TCC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--C-T-G-C-G----A-G-GA----CTAA-CTT-T--T--G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---C-T-A-AT--TA-C-G----G--C----TTTA-A---T----TG----C-T--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-GT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-GAA-A-A--T---CC-GT--G--A----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
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gi|52252 : tGACG--TC-A--CAG-TG-A-C-C-A--T-G-TG--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--C-T-G-C-T----A-G-GA--CCCTAA-C-T-T--T--G--A-G----G-C-GT-----AAT-TT-AC------A--AA--C-T-A-AT--TA-C-G----G--C----TTTA-A---T----TG--C-C-T--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A--T----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--G--A----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
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gi|52256 : tatGACG--CG-A--CAGGTG-A-C-C-A--C-G-T---ACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--C-T-G-C-A----G-G-GA--CCCTAA-C-T-T--T--G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---C-T-A-AT--TA-C-G----G--C----TTTA-A---T----TG--C-C----TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-T--A---G-AT----T-A--A---T-A---A---T-AGA-A-A-T-G-T-AATT--T--AT----G-C-C-TGAATA--T-C-T-AG--G-A-AAAT-G--TT-T-G---A-ATGT---CC-AT--G--A----T--A-ATAA----C-T-CCTTTAA
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gi|52263 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T---GCCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T---G-A--C-T-G-C-A--------GA--CCCTAA-T-T-T--T--G--A-G----G-C-GT-----A-T-T--AC------AC-A---C-T-AGAT--TA-C-G----G--T----TA---A---T----T---T-C-T--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---TAA---A---T-TAG-A-A---G-T-AA----T--AT--GCG-C-CTTA---A--T-C-T-AGTTA-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--G--A----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
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gi|52266 : tatGACG--CG-AGACAG-TG-A-C-C-A--C-G-TG--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA--TTCT--AACTC--G-A-----AA-AA--CGATG-A--C-T-G-CAG----A-G-GA--CCC-AA-C-T-TCCT--GCTG-G----G-C-TTGCCTGA-A-TT-AC------A--A---C-T-A-AT--TA-C-G----G--CAGT-TT---A---T----TGC-C-C-T--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--C-A--TG--T-GCCT-T--TT-ATGA---A-AT----TGA--A---T-A---ATATT-TAG-A-ATT-G-T--A-T--T--AT--G-GTC-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---ACA--T---CCGGT--G--A----T--ATA-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52265 : tatGACG--TC-A--CAG-TG-AAC-C-A--C-G-TG--ACCCG-C-T-A--T-C-TCG--AT-T--AA--C--GCA-----AA-AAT-T--TG-A--T-T-G-C------A-A-GA--CCCTAA-A-A-T--C--G--A-G----G-C-G------A-T-TT-AC------A--A---C-T---AT--TA-C-G----G--CG---TTTA-A---T----TG--C-C-T--TT------GTT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TGGCTAG--T-T--TT-A--G---ATATACGGT-A--A---T---------T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--CT--G-G-CAC-TA---A--T-CAT-AG--A-A-AA---G---T-T-G---A-A--T---CC-GT--G--A----TTAA-A-AA----C-TACCTTT
gi|52267 : tatGACGGTCA-A--AAG-GG-A-C-C-A--G-G-G---ACCCG-C-T-A--T-C---A--AT-T--AA--CTGG-A-----AA-GA--T--TG-A--C-T-G-C-G----A-G--A--CCCAAA-C-T-T--T--G--A-G----G-C-GT-----ATT-TT-AC------A--A---C-T-A-ATCGTA-C-G----GCTC----TT---A---A----TG--C-C-T--TT----A-ATT-G-A-A---CTGG-C--GCA--TG--T-G--TGT--TT-A--G---A-TT----T-A--G---T-A---A-----TAG-ACATT-T-T-AA-T--T--A---G-G---C-GA---A--T-C-T-AG--A-ATAA---G--TT-T-GAACA-A--T---CC-GT--G--A----T--A-A-GA----G-C-CCTTTAA
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gi|52269 : GACG--TC-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-TG--ACCCG-C-T-G--T--------AT-T--GA--T--G-G-------------------------G-C-GG---A-G-GA--CCCTAA-CGTGT--T--G--A-G----GAC-GT-----A-T-TT-ACAGAGGAA--A---C-T-A-ATA-TA-T-G----G--CGT--TT---AAG-T----TG--C-C-T--GTGTGAG-ATTAG-A-A---AT-GAT--G-AT-TG--T-G--TAT--TT-A--GAGAA-AT----T-A--AGTTT-A---A---T-TAG-A-ATT-T-T-AA-T--T--AT--G-
gi|52260 : tatACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-TG--ACCCG-C-T-A--T-C--CA--TG-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TGAA--C-T-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C---T--T--G--A-G----G-C-GT-----ATT-TT-AC------A--A---C-T---AT--TA-C-G----G--C----TTTAAA---T----TG--A-A-T--CTA---A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G------T----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AG-A--T--AT--G-G---C-TA---A--T---T-AG----A-AA---G--TTGT-G---A-C--TG--CC-GT--G--A----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52272 : tatgaACG--CG-A--CAG-TG-A-G-C-AAAC-G-TTGAAC--G-C-T-A--T-C-TCC--TT-T--CA--C--G-A-----AA-----T--TGGA--C-T-G-C-G----A-G-GA--CCTTAA-C-T-TACT--A--A-GTAGTG-CTGT-----A-T-AT-AA------A--A---G---A-AT--TA-C-G----T--CGTCTTT---A---TATC-TG--G-CATA-TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-TTAG-ACTTT--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-AT--A---G-TAG-T-A-T-G-T-AA-T--TTGA---G-G-C-C-TA---A--T-C---AG--A-A-AAAAGG--TTGC-G---A-A--T---TC-TT--G--AGTATC--A-A-CA----C-T-CCCTT
gi|52271 : atgaCG--CG-A--CAG-TGTATC-C-A--C-G-TG--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-ATTAAAAACAA--T--TG-AACT-T-G-C-GTAAGA-G-GA--CCCTAA-A-C-T--T--G--AAG----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--AGACT-T-A-AT--TA-C-G----G--C----TTTA-A---T----TG--C-C-T--TT----A-AGT---A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--T--A--G---A-TT----A-A--A---T-A---A---T-TAG-A-ACT-G-T-AA-T--TG-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT-----A----T----A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52277 : atgactCG--CG-A---AG-TG-A-C-C-A--CAG-TG--ACCCGTC-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--CT-G-A-----AA-AA--T--TG-A--C-T-G-C-G----A-G-GC--ACTTAA-C-T-T--T--G--A-GT---T-C-GT-----A---AT-AC------A--A---C-T-A-ATG-TA-C-G----G--C----TTTA-A---T----TGC-C-C-T--TT----A-ATT-GAA-A---CT-G-T--G-A---A--T-G--T-T--TT-T--G---A-TT----A-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--A---G-G-C-C-TA---AATC-C-T-AG--A-A-AAAT-G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--G--A----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52270 : -A--CAG-TG-A-T-C-A--C-G-TG--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA--
gi|52268 : tatgaagtc--CAG-TG-A-C-CCA--C-GATG--ATCAG-C-T--------TCC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--GGT-G---G----A-G-GA--CCCTAA-C-T-T--TTTGTTATG----G-T-GT-----A-T-TT-AC------A--------T-A-AT--TA-C-GC---G--C----TTTAAA---T----TGGAC-C-T--TT----A-ATT-G-T-A---CT-G-T--G-G--TG--T-G--T-TAATT-A--G---A-GT----T-AGTA---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--AT--G-G---C-TA---A--TAC-T-TG--AGA-AA---GTATT-T-A---A-A--TGCGCA-GT--G--A----T--A-A-AA----C-T--CTTTAAtgaa
gi|52278 : tatgactgtagAG-TG-A-C-C-A--C-G-T---GCCCG-C-T-A--TTC-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--C-T-G-C-G----A-G--A--CCCTAA-C-T-T--T--G--A-G----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--A---C-T-A-AT--TA-C-GTACGG--C----TTTAAA---T----TG--C-C-T--TTTT--A-ATT-G-A-----CTAG-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAGAA-A-T-G-T-AA-T--T--AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-C-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CA-GT--G--A----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
gi|52264 : G-A-C-C-A--C-G-TG--ACCCG-C-T-A--T-C-TCG--AT-TT-AA--CC-G-A-----AA-AA--T--TG-A--C-T-G-C-G----A-G-GA--CCA-AA-C-T-T--T--G---------G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---C-T-A-AT--TA-C-G----G--C----TTTA-A---T----TG--C-C-T--T-----A-ATT-G-A-A---CT-G-TG-G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-------T-A--G---T-AT--T---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G---T-T-G---A-A--T----C-GT--G--A----T--A-A-AA----CTT-CCTGTAA
gi|52279 : tatgacgttcacatag--C-G-T---GACCG-C-T-A--T---TCATCAT-TGTAA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--C-T-GCC-G----A-G-GAGGCCCTAA-C-T-T--T--G--A------G-T-G------A-T-AT-AC------AAGA---C---A-A----A-C-G----G--C----TT---A---T----TG--C-C-TAATT----A-ATT-GTATA---CT-G-T----A--TA--T-T--G-T--TT-A--G---A-TTA---T-A--G---T-GGACA---T-TAA-G-A-T-G-T-AA-C--T--TT--G-G-C----A---A--T-C-T-AGA-A-A-AA---G--TT-T-G-----A--T---CC-GTTGG--A----T--ATA-AACTGCC-T-CTTTTAA
gi|52280 : T-T--AA-------A-----AA-AT--T--TG-A--C-T-G-C-G----A-G-GA--CCCTAAAC-T-T--T--G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---C-TTA-AT--TA-C-G----G--C----CTTTAA---T----TT--T-T-T--TT----A-ATTTG-A-A---CT-G-TTGA-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-GTT-AA-T--T--AT--G-G-C-C--A---A--T-C-TAAG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--G--A----T----A-AA----C-T-CCTTT
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gi|52282 : -G----G--C----TTTAAA---T----TG--C-C-T--TT----A-ATT-G-G-AATACT-G-T--G-AAATG--T-G--T-T--TTTA--G---A-------T-A--A---T-A---A---TCTAG-A-A-T-G-T-AA-AAAT--AT--G-G-C-C-TA---AA-T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-TTG---A-A--T---CC-GT--G--A----T--A-A-AA----C-T-TCTTTAA
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Reference ( family-591 ) : GACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52251 : GACG--TC-A--CAG-TG-A-C---A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-CTC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TTA---A-ACT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-T----A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52252 : tatGACG--TC-A--CAG-TG-A-C-C-A--T-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-T----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----AAT-TT-AC------A--AA--CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52253 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-T-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G----CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-T-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG----A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----A--A-A-AA----C-T-
gi|52254 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-TTA--T-C-TCA--TT-A--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--A-T--G--C-C---TT----A-ATG-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--T--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--TC--CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52255 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-CAT-A--T-C-TCC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--C--TAA-C--T-T--TTG--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C--T--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-GT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-GAA-A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52256 : tatGACG--CG-A--CAGGTG-A-C-C-A--C-G-T--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-A----G-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-C---TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-T--A---G-AT----T-A--A---T-A---A---T-AGA-A-A-T-G-T-AATT--T-AT----G-C-C-TGAATA--T-C-T-AG--G-A-AAAT-G--TT-T-G---A-ATGT---CC-AT--GA----T--A-ATAA----C-T-CCTTTAA
gi|52257 : tatGACGG-CG-A--CAGGTG-A-C-C-A--C-G-T-GACC-G-C-T----T-CGTCA---T-T--GA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCC-AA-C--T-T--TGG--A-G----G-C-GT-----A-TCTT-AC------A--A---GC-A-A---T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--CGCT--TT------ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-TT----C-AG-A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT----G-C-C-TA---A--T-C-T-AA--A-G-AA---T--TT-C-G---A-A--T---CC-AT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTA
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gi|52259 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TC---AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-GCGA--CCT--A-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--AC--CT-A-AT--T-ACGG----G-C--T-T---TCA-ATTT-T--G----CT--TT----A-ATT-GAA-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--A---AGAT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-TGG-TGAA-T--T-AT--G-G-C-C-T----A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T----A-AA----C-T-CCTTTAA
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gi|52261 : tatgaGACG--CG-A--CCG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TTC--AT-T--AA-----G-A-----AA-AAAAT--TG-A--CT-G-C-G----A-G--A--CCCTAA-C--T-T----G--A-G----C-G-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--TAAC-G----G-C----T---T-A-A--T-C--G--C-CT--TT------ATT-G-A-A---CT-G-T----A--TG--T-AGTT-T--TT-A--A---G-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT----G-C-C-TC---A--T-C-T-AG--A-A-AA------TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
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gi|52265 : tatgacgttcacatagGACG--TC-A--CAG-TG-AAC-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCG--AT-T--AA--C--GCA-----AA-AAT-T--TG-A--TT-G-C------A-A-GA--CCCTAA-A--A-T--C-G--A-G----G-C-G------A-T-TT-AC------A--A---CT---AT--T-AC-G----G-CG-T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT------GTT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TGGCTAG--T-T--TT-A--G---ATATACGGT-A--A---T---------T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-CT--G-G-CAC-TA---A--T-CAT-AG--A-A-AA---G---T-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----TTAA-A-AA----C-TACCTTT
gi|52266 : tatGACG--CG-AGACAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--TTCT--AACTC--G-A-----AA-AA--CGATG-A--CT-G-CAG----A-G-GA--CCC-AA-C--T-TCCT-GCTG-G----G-C-TTGCCTGA-A-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-CAGT-T---T---A--T-T--GC-C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--C-A--TG--T-GCCT-T--TT-ATGA---A-AT----TGA--A---T-A---ATATT-TAG-A-ATT-G-T--A-T--T-AT--G-GTC-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---ACA--T---CCGGT--GA----T--ATA-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52267 : tatGACGGTCA-A--AAG-GG-A-C-C-A--G-G---GACCCG-C-T-A--T-C---A--AT-T--AA--CTGG-A-----AA-GA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G--A--CCCAAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--A---CT-A-ATCGT-AC-G----G-C--TCT---T-A-A--T----G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CTGG-C--GCA--TG--T-G--TGT--TT-A--G---A-TT----T-A--G---T-A---A-----TAG-ACATT-T-T-AA-T--T-A---G-G---C-GA---A--T-C-T-AG--A-ATAA---G--TT-T-GAACA-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-GA----G-C-CCTTTAA
gi|52268 : tat--CAG-TG-A-C-CCA--C-GAT-GATCAG-C-T--------TCC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-AG-GT-G---G----A-G-GA--CCCTAA-CTTT-T--T-GTTATG----G-T-GT-----A-T-TT-AC------A-------T-A-AT--T-AC-GC---G-C--T-T---TAA-A--T-T--GGAC-CT--TT----A-ATT-G-T-A---CT-G-T--G-G--TG--T-G--T-TAATT-A--G---A-GT----T-AGTA---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G---C-TA---A--TAC-T-TG--AGA-AA---GTATT-T-A---A-A--TGCGCA-GT--GA----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
gi|52269 : tatgactgtagGACG--TC-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-G--T--------AT-T--GA--T--G-G------------------------G-C-GG---A-G-GA--CCCTAA-CG-TGT--T-G--A-G----GAC-GT-----A-T-TT-ACAGAGGAA--A---CT-A-ATA-T-AT-G----G-CG-T-T---T-A-AG-T-T--G--C-CT--GTGTGAG-ATTAG-A-A---AT-GAT--G-AT-TG--T-G--TAT--TT-A--GAGAA-AT----T-A--AGTTT-A---A---T-TAG-A-ATT-T-T-AA-T--T-AT--G-
gi|52270 : tat-A--CAG-TG-A-T-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--
gi|52271 : tatgaagtcCG--CG-A--CAG-TGTATC-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-ATTAAAAACAA--T--TG-AACTT-G-C-GTAAGA-G-GA--CCCTAA-A--C-T--T-G--AAG----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--AGACTT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-AGT---A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--T--A--G---A-TT----A-A--A---T-A---A---T-TAG-A-ACT-G-T-AA-T--TGAT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT---A----T----A-AA----C-T-CCTTTAAtgaa
gi|52272 : atgactACG--CG-A--CAG-TG-A-G-C-AAAC-G-TTGAAC-G-C-T-A--T-C-TCC--TT-T--CA--C--G-A-----AA-----T--TGGA--CT-G-C-G----A-G-GA--CCTTAA-C--T-TACT-A--A-GTAGTG-CTGT-----A-T-AT-A-------A--A---AG-A-AT--T-AC-GTC--GTC--T-T---T-ATA--T-CTGG--C-ATA-TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-TTAG-ACTTT--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-AT--A---G-TAG-T-A-T-G-T-AA-T--T--TGAG-G-C-C-TA---A--T-C---AG--A-A-AAAAGG--TTGC-G---A-A--T---TC-TT--GAGTATC--A-A-CA----C-T-CCCTT
gi|52273 : atgaGATG--TC-A--CAG-TG-A-C---A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-TA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52274 : tGACG--CGGA--CAC-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C----------AA-AA--T--TG-A--CT-T-C-G----A-G--A--CACCAA-T--T-T-------A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-AGAT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TA----A-AT--G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--GT-G--------AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-T----A--T-C-TGAG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GTC-GA----T--A-A-AA----C---CCTTTA
gi|52275 : tGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T-------A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52276 : GACG--CG-C--CAG-CG-A-CGC-G--C---T-GACCCT-CGT-AAAT-CGTCA--TT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CTAG-C-GT---ATG-GA--CCCTAC-T--T-T--T-G--A-G----G-C-GTC----A-T-TT--C------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-CTTAT-A-A--TGT--G--C-CT--TT----ATATT-G-A-AAGCCT-G-T--G-AT-TG--T-G--T-T--TT-A--A---G-ATG---T-A--A---T-A---AT--T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--A-ATTGG-G-C-C-TA---AC-T-C-T--G--A-A-AA---G--TT-TAG---A-A--T---CC-GT--GC----C--GTA-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52277 : CG--CG-A---AG-TG-A-C-C-A--CAG-T-GACCCGTC-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--CT-G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GC--ACTTAA-C--T-T--T-G--A-GT---T-C-GT-----A---AT-AC------A--A---CT-A-ATG-T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--GC-C-CT--TT----A-ATT-GAA-A---CT-G-T--G-A---A--T-G--T-T--TT-T--G---A-TT----A-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-A---G-G-C-C-TA---AATC-C-T-AG--A-A-AAAT-G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52278 : AG-TG-A-C-C-A--C-G-T-G-CCCG-C-T-A--TTC-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--CT-G-C-G----A-G--A--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--A---CT-A-AT--T-AC-GTACGG-C--T-T---T-A-AA-T-T--G--C-CT--TTTT--A-ATT-G-A-----CTAG-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAGAA-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-C-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CA-GT--GA----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
gi|52279 : --C-G-T-GACC-G-C-T-A--T---TCATCAT-TGTAA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-GCC-G----A-G-GAGGCCCTAA-C--T-T--T-G--A------G-T-G------A-T-AT-AC------AAGA---C--A-A-----AC-G----G-C--T-T-------A--T-T--G--C-CTAATT----A-ATT-GTATA---CT-G-T----A--TA--T-T--G-T--TT-A--G---A-TTA---T-A--G---T-GGACA---T-TAA-G-A-T-G-T-AA-C--T-TT--G-G-C----A---A--T-C-T-AGA-A-A-AA---G--TT-T-G-----A--T---CC-GTTGGA----T--ATA-AACTGCC-T-CTTTTAA
gi|52280 : T-T--AA-------A-----AA-AT--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAAAC--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CTTA-AT--T-AC-G----G-CC-T-T---T-A-A--T-T--T--T-TT--TT----A-ATTTG-A-A---CT-G-TTGA-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-GTT-AA-T--T-AT--G-G-C-C--A---A--T-C-TAAG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T----A-AA----C-T-CCTTT
gi|52281 : TAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AT------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----A---------------------------CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-G--TG--T-G--C-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG------AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52282 : -G----G-C--T-T---T-A-AA-T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-G-AATACT-G-T--G-AAATG--T-G--T-T--TTTA--G---A-------T-A--A---T-A---A---TCTAG-A-A-T-G-T-AA-AAAT-AT--G-G-C-C-TA---AA-T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-TTG---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-TCTTTAA
Alignments
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lowQualScore : 44 1 22 3 1 2 1 1 11 1 1 1 1 2 1 11 1 2 3333 1 33 11 44 1 33333 1 333 11 2 44 1 1 2 5555 1 2 11 0 1 33 1 33 2 33 2 4444 1 1 44444 2 1 5 333333 33 666 2 2 44 1 2 5555 1 55 1 222 5 1 77 1 11 44 1 33 7777 1 2 5 1 444 2 1 44 1 66 11 1 33 2 11 1 11 888888 5555 1 33 222 1 444 333 1 1 1 5 2 1 2 1 11 2 33 1 1 1 1 222 44 1 1 4 33 1 1 666 33 2 2 444 1 11 555 1 33 2222 11 4 1 2222 1 1
lowQualScore : .. . .. . . . . . .. . . . . . . .. . . .... . .. .. .. . ..... . ... .. . .. . . . .... . . .. . . .. . .. . .. . .... . . ..... . . . ...... .. ... . . .. . . .... . .. . ... . . .. . .. .. . .. .... . . . . ... . . .. . .. .. . .. . .. . .. ...... .... . .. ... . ... ... . . . . . . . . .. . .. . . . . ... .. . . . .. . . ... .. . . ... . .. ... . .. .... .. . . .... . .
lowQualScore : 00 6 11 0 4 9 4 4 99 4 4 4 4 8 4 99 4 8 7777 4 33 99 77 4 44444 4 666 99 8 77 4 4 8 7777 4 8 99 5 3 22 3 77 7 77 7 2222 3 3 77777 7 3 3 888888 22 333 7 7 55 3 6 8888 3 66 3 333 2 3 44 3 88 44 3 11 1111 3 6 2 3 555 6 3 88 3 11 88 3 55 6 88 3 88 444444 3333 3 11 333 3 888 555 3 3 3 2 6 3 6 3 88 6 55 3 3 3 3 333 55 3 3 0 22 3 3 000 22 7 7 222 3 88 000 3 22 8888 88 0 3 8888 3 3
consensus : GACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
Reference ( family-591 ) : GACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52251 : GACG--TC-A--CAG-TG-A-C---A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-CTC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TTA---A-ACT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-T----A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52252 : tatGACG--TC-A--CAG-TG-A-C-C-A--T-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-T----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----AAT-TT-AC------A--AA--CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52253 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-T-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G----CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-T-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG----A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----A--A-A-AA----C-T-
gi|52254 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-TTA--T-C-TCA--TT-A--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--A-T--G--C-C---TT----A-ATG-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--T--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--TC--CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52255 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-CAT-A--T-C-TCC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--C--TAA-C--T-T--TTG--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C--T--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-GT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-GAA-A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52256 : tatGACG--CG-A--CAGGTG-A-C-C-A--C-G-T--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-A----G-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-C---TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-T--A---G-AT----T-A--A---T-A---A---T-AGA-A-A-T-G-T-AATT--T-AT----G-C-C-TGAATA--T-C-T-AG--G-A-AAAT-G--TT-T-G---A-ATGT---CC-AT--GA----T--A-ATAA----C-T-CCTTTAA
gi|52257 : tatGACGG-CG-A--CAGGTG-A-C-C-A--C-G-T-GACC-G-C-T----T-CGTCA---T-T--GA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCC-AA-C--T-T--TGG--A-G----G-C-GT-----A-TCTT-AC------A--A---GC-A-A---T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--CGCT--TT------ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-TT----C-AG-A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT----G-C-C-TA---A--T-C-T-AA--A-G-AA---T--TT-C-G---A-A--T---CC-AT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTA
gi|52258 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TC---AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-GCGA--CCT--A-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--AC--CT-A-AT--T-ACGG----G-C--T-T---TCA-ATTT-T--G----CT--TT----A-ATT-GAA-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--A---AGAT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-TGG-TGAA-T--T-AT--G-G-C-C-T----A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T----A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52259 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TC---AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-GCGA--CCT--A-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--AC--CT-A-AT--T-ACGG----G-C--T-T---TCA-ATTT-T--G----CT--TT----A-ATT-GAA-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--A---AGAT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-TGG-TGAA-T--T-AT--G-G-C-C-T----A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T----A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52260 : tatACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C--CA--TG-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TGAA--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C----T--T-G--A-G----G-C-GT-----ATT-TT-AC------A--A---CT---AT--T-AC-G----G-C--T-T---TAA-A--T-T--G--A-AT--CTA---A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G------T----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AG-A--T-AT--G-G---C-TA---A--T---T-AG----A-AA---G--TTGT-G---A-C--TG--CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52261 : tatgaGACG--CG-A--CCG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TTC--AT-T--AA-----G-A-----AA-AAAAT--TG-A--CT-G-C-G----A-G--A--CCCTAA-C--T-T----G--A-G----C-G-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--TAAC-G----G-C----T---T-A-A--T-C--G--C-CT--TT------ATT-G-A-A---CT-G-T----A--TG--T-AGTT-T--TT-A--A---G-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT----G-C-C-TC---A--T-C-T-AG--A-A-AA------TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52262 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G---GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT----AA--C--G-A-----AA-A------TG-AA-CT-G-CTG----A-G-GA--CC-TAA-C--T-T--T-G--A-G------C-GT-----A-T-TTTAC------A--A---CTTA-AT--T-AC-G----G-C--T-T-----A-A--T-T--G--C-CT--T-----A-ATT-G-A-A---CT-G-T----A--TG--T-G--T-T--T--A--G---A--T----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--TTAT--G---C-C-TA---A--T-C-TTAG--A-A-AA---AA-TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52263 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-G-CCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T---G-A--CT-G-C-A--------GA--CCCTAA-T--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-T--AC------AC-A---CT-AGAT--T-AC-G----G------T---T-A-A--T-T-----T-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---TAA---A---T-TAG-A-A---G-T-AA----T-AT--GCG-C-CTTA---A--T-C-T-AGTTA-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
gi|52264 : tatG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCG--AT-TT-AA--CC-G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCA-AA-C--T-T--T-G---------G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-C---TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-TG-G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-------T-A--G---T-AT--T---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G---T-T-G---A-A--T----C-GT--GA----T--A-A-AA----CTT-CCTGTAA
gi|52265 : tatgacgttcacatagGACG--TC-A--CAG-TG-AAC-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCG--AT-T--AA--C--GCA-----AA-AAT-T--TG-A--TT-G-C------A-A-GA--CCCTAA-A--A-T--C-G--A-G----G-C-G------A-T-TT-AC------A--A---CT---AT--T-AC-G----G-CG-T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT------GTT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TGGCTAG--T-T--TT-A--G---ATATACGGT-A--A---T---------T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-CT--G-G-CAC-TA---A--T-CAT-AG--A-A-AA---G---T-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----TTAA-A-AA----C-TACCTTT
gi|52266 : tatGACG--CG-AGACAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--TTCT--AACTC--G-A-----AA-AA--CGATG-A--CT-G-CAG----A-G-GA--CCC-AA-C--T-TCCT-GCTG-G----G-C-TTGCCTGA-A-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-CAGT-T---T---A--T-T--GC-C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--C-A--TG--T-GCCT-T--TT-ATGA---A-AT----TGA--A---T-A---ATATT-TAG-A-ATT-G-T--A-T--T-AT--G-GTC-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---ACA--T---CCGGT--GA----T--ATA-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52267 : tatGACGGTCA-A--AAG-GG-A-C-C-A--G-G---GACCCG-C-T-A--T-C---A--AT-T--AA--CTGG-A-----AA-GA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G--A--CCCAAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--A---CT-A-ATCGT-AC-G----G-C--TCT---T-A-A--T----G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CTGG-C--GCA--TG--T-G--TGT--TT-A--G---A-TT----T-A--G---T-A---A-----TAG-ACATT-T-T-AA-T--T-A---G-G---C-GA---A--T-C-T-AG--A-ATAA---G--TT-T-GAACA-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-GA----G-C-CCTTTAA
gi|52268 : tat--CAG-TG-A-C-CCA--C-GAT-GATCAG-C-T--------TCC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-AG-GT-G---G----A-G-GA--CCCTAA-CTTT-T--T-GTTATG----G-T-GT-----A-T-TT-AC------A-------T-A-AT--T-AC-GC---G-C--T-T---TAA-A--T-T--GGAC-CT--TT----A-ATT-G-T-A---CT-G-T--G-G--TG--T-G--T-TAATT-A--G---A-GT----T-AGTA---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G---C-TA---A--TAC-T-TG--AGA-AA---GTATT-T-A---A-A--TGCGCA-GT--GA----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
gi|52269 : tatgactgtagGACG--TC-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-G--T--------AT-T--GA--T--G-G------------------------G-C-GG---A-G-GA--CCCTAA-CG-TGT--T-G--A-G----GAC-GT-----A-T-TT-ACAGAGGAA--A---CT-A-ATA-T-AT-G----G-CG-T-T---T-A-AG-T-T--G--C-CT--GTGTGAG-ATTAG-A-A---AT-GAT--G-AT-TG--T-G--TAT--TT-A--GAGAA-AT----T-A--AGTTT-A---A---T-TAG-A-ATT-T-T-AA-T--T-AT--G-
gi|52270 : tat-A--CAG-TG-A-T-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--
gi|52271 : tatgaagtcCG--CG-A--CAG-TGTATC-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-ATTAAAAACAA--T--TG-AACTT-G-C-GTAAGA-G-GA--CCCTAA-A--C-T--T-G--AAG----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--AGACTT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-AGT---A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--T--A--G---A-TT----A-A--A---T-A---A---T-TAG-A-ACT-G-T-AA-T--TGAT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT---A----T----A-AA----C-T-CCTTTAAtgaa
gi|52272 : atgactACG--CG-A--CAG-TG-A-G-C-AAAC-G-TTGAAC-G-C-T-A--T-C-TCC--TT-T--CA--C--G-A-----AA-----T--TGGA--CT-G-C-G----A-G-GA--CCTTAA-C--T-TACT-A--A-GTAGTG-CTGT-----A-T-AT-A-------A--A---AG-A-AT--T-AC-GTC--GTC--T-T---T-ATA--T-CTGG--C-ATA-TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-TTAG-ACTTT--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-AT--A---G-TAG-T-A-T-G-T-AA-T--T--TGAG-G-C-C-TA---A--T-C---AG--A-A-AAAAGG--TTGC-G---A-A--T---TC-TT--GAGTATC--A-A-CA----C-T-CCCTT
gi|52273 : atgaGATG--TC-A--CAG-TG-A-C---A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-TA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52274 : tGACG--CGGA--CAC-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C----------AA-AA--T--TG-A--CT-T-C-G----A-G--A--CACCAA-T--T-T-------A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-AGAT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TA----A-AT--G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--GT-G--------AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-T----A--T-C-TGAG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GTC-GA----T--A-A-AA----C---CCTTTA
gi|52275 : tGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T-------A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52276 : GACG--CG-C--CAG-CG-A-CGC-G--C---T-GACCCT-CGT-AAAT-CGTCA--TT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CTAG-C-GT---ATG-GA--CCCTAC-T--T-T--T-G--A-G----G-C-GTC----A-T-TT--C------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-CTTAT-A-A--TGT--G--C-CT--TT----ATATT-G-A-AAGCCT-G-T--G-AT-TG--T-G--T-T--TT-A--A---G-ATG---T-A--A---T-A---AT--T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--A-ATTGG-G-C-C-TA---AC-T-C-T--G--A-A-AA---G--TT-TAG---A-A--T---CC-GT--GC----C--GTA-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52277 : CG--CG-A---AG-TG-A-C-C-A--CAG-T-GACCCGTC-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--CT-G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GC--ACTTAA-C--T-T--T-G--A-GT---T-C-GT-----A---AT-AC------A--A---CT-A-ATG-T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--GC-C-CT--TT----A-ATT-GAA-A---CT-G-T--G-A---A--T-G--T-T--TT-T--G---A-TT----A-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-A---G-G-C-C-TA---AATC-C-T-AG--A-A-AAAT-G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52278 : AG-TG-A-C-C-A--C-G-T-G-CCCG-C-T-A--TTC-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--CT-G-C-G----A-G--A--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--A---CT-A-AT--T-AC-GTACGG-C--T-T---T-A-AA-T-T--G--C-CT--TTTT--A-ATT-G-A-----CTAG-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAGAA-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-C-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CA-GT--GA----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
gi|52279 : --C-G-T-GACC-G-C-T-A--T---TCATCAT-TGTAA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-GCC-G----A-G-GAGGCCCTAA-C--T-T--T-G--A------G-T-G------A-T-AT-AC------AAGA---C--A-A-----AC-G----G-C--T-T-------A--T-T--G--C-CTAATT----A-ATT-GTATA---CT-G-T----A--TA--T-T--G-T--TT-A--G---A-TTA---T-A--G---T-GGACA---T-TAA-G-A-T-G-T-AA-C--T-TT--G-G-C----A---A--T-C-T-AGA-A-A-AA---G--TT-T-G-----A--T---CC-GTTGGA----T--ATA-AACTGCC-T-CTTTTAA
gi|52280 : T-T--AA-------A-----AA-AT--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAAAC--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CTTA-AT--T-AC-G----G-CC-T-T---T-A-A--T-T--T--T-TT--TT----A-ATTTG-A-A---CT-G-TTGA-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-GTT-AA-T--T-AT--G-G-C-C--A---A--T-C-TAAG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T----A-AA----C-T-CCTTT
gi|52281 : TAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AT------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----A---------------------------CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-G--TG--T-G--C-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG------AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52282 : -G----G-C--T-T---T-A-AA-T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-G-AATACT-G-T--G-AAATG--T-G--T-T--TTTA--G---A-------T-A--A---T-A---A---TCTAG-A-A-T-G-T-AA-AAAT-AT--G-G-C-C-TA---AA-T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-TTG---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-TCTTTAA
blockSeqs : GT G GA G T A G C AA A A T T A T AA T G ATCA C GT CT TG C TTAAA C AAA GA A AC A C T TAAG T C GG A TT G CC T CT T TAGT A T GCCTG A C T AGAGGA AG GAC T G CG A G TACG T AG C TTA C T TT G TG GA G AA GTGA T A A T AGC G A TA C CT GC A GT G AA T TG AGAAA ACGG G GT GTT A GAC TAT C A C T G T G T AA T GA C T A T AAT AT A A T TT G T AAG TA G A AAC C TG GCG G TG GTAT TA T T CTGC T A
blockSeqs : G . . G . T . . . . . . . G . . . G AT . T . C . . . AT . G A . . A G . C . . G . AC G TT A T . . C T . T . C A T G A . G TC . G . . C . TT . . C . A TT . T A . ATA A . TG . AA . . CC A . . . AGA G . G . . T T . . . T G . G . . G TG . . . . . C . . G A . . AT A G T AA . . C . C . . T . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . C . . A . A . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . ATA . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : A** ****
originalCons : GACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
finalCons : GACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
Alignments
lowQualScore : 1111 111111
lowQualScore : 44 1 22 3 1 2 1 1 11 1 1 1 1 2 1 11 1 2 3333 1 33 11 44 1 33333 1 333 11 2 44 1 1 2 5555 1 2 11 0 1 33 1 33 2 33 2 4444 1 1 44444 2 1 5 333333 33 666 2 2 44 1 2 5555 1 55 1 222 5 1 77 1 11 44 1 33 7777 1 2 5 1 444 2 1 44 1 66 11 1 33 2 11 1 11 888888 5555 1 33 222 1 444 333 1 1 1 5 2 1 2 1 11 2 33 1 1 1 1 222 44 1 1 4 33 1 1 666 33 2 2 444 1 11 555 1 33 2222 11 4 1 2222 1 1
lowQualScore : .. . .. . . . . . .. . . . . . . .. . . .... . .. .. .. . ..... . ... .. . .. . . . .... . . .. . . .. . .. . .. . .... . . ..... . . . ...... .. ... . . .. . . .... . .. . ... . . .. . .. .. . .. .... . . . . ... . . .. . .. .. . .. . .. . .. ...... .... . .. ... . ... ... . . . . . . . . .. . .. . . . . ... .. . . . .. . . ... .. . . ... . .. ... . .. .... .. . . .... . .
lowQualScore : 00 6 11 0 4 9 4 4 99 4 4 4 4 8 4 99 4 8 7777 4 33 99 77 4 44444 4 666 99 8 77 4 4 8 7777 4 8 99 5 3 22 3 77 7 77 7 2222 3 3 77777 7 3 3 888888 22 333 7 7 55 3 6 8888 3 66 3 333 2 3 44 3 88 44 3 11 1111 3 6 2 3 555 6 3 88 3 11 88 3 55 6 88 3 88 444444 3333 3 11 333 3 888 555 3 3 3 2 6 3 6 3 88 6 55 3 3 3 3 333 55 3 3 0 22 3 3 000 22 7 7 222 3 88 000 3 22 8888 88 0 3 8888 3 3
consensus : GACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
Reference ( family-591 ) : GACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52251 : GACG--TC-A--CAG-TG-A-C---A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-CTC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TTA---A-ACT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-T----A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52252 : tatGACG--TC-A--CAG-TG-A-C-C-A--T-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-T----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----AAT-TT-AC------A--AA--CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52253 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-T-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G----CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-T-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG----A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----A--A-A-AA----C-T-
gi|52254 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-TTA--T-C-TCA--TT-A--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--A-T--G--C-C---TT----A-ATG-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T--T--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--TC--CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52255 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-CAT-A--T-C-TCC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--C--TAA-C--T-T--TTG--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C--T--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-GT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-GAA-A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52256 : tatGACG--CG-A--CAGGTG-A-C-C-A--C-G-T--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-A----G-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-C---TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-T--A---G-AT----T-A--A---T-A---A---T-AGA-A-A-T-G-T-AATT--T-AT----G-C-C-TGAATA--T-C-T-AG--G-A-AAAT-G--TT-T-G---A-ATGT---CC-AT--GA----T--A-ATAA----C-T-CCTTTAA
gi|52257 : tatGACGG-CG-A--CAGGTG-A-C-C-A--C-G-T-GACC-G-C-T----T-CGTCA---T-T--GA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCC-AA-C--T-T--TGG--A-G----G-C-GT-----A-TCTT-AC------A--A---GC-A-A---T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--CGCT--TT------ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-TT----C-AG-A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT----G-C-C-TA---A--T-C-T-AA--A-G-AA---T--TT-C-G---A-A--T---CC-AT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTA
gi|52258 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TC---AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-GCGA--CCT--A-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--AC--CT-A-AT--T-ACGG----G-C--T-T---TCA-ATTT-T--G----CT--TT----A-ATT-GAA-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--A---AGAT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-TGG-TGAA-T--T-AT--G-G-C-C-T----A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T----A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52259 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TC---AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-GCGA--CCT--A-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--AC--CT-A-AT--T-ACGG----G-C--T-T---TCA-ATTT-T--G----CT--TT----A-ATT-GAA-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--A---AGAT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-TGG-TGAA-T--T-AT--G-G-C-C-T----A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T----A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52260 : tatACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C--CA--TG-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TGAA--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C----T--T-G--A-G----G-C-GT-----ATT-TT-AC------A--A---CT---AT--T-AC-G----G-C--T-T---TAA-A--T-T--G--A-AT--CTA---A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G------T----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AG-A--T-AT--G-G---C-TA---A--T---T-AG----A-AA---G--TTGT-G---A-C--TG--CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52261 : tatgaGACG--CG-A--CCG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TTC--AT-T--AA-----G-A-----AA-AAAAT--TG-A--CT-G-C-G----A-G--A--CCCTAA-C--T-T----G--A-G----C-G-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--TAAC-G----G-C----T---T-A-A--T-C--G--C-CT--TT------ATT-G-A-A---CT-G-T----A--TG--T-AGTT-T--TT-A--A---G-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT----G-C-C-TC---A--T-C-T-AG--A-A-AA------TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52262 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G---GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT----AA--C--G-A-----AA-A------TG-AA-CT-G-CTG----A-G-GA--CC-TAA-C--T-T--T-G--A-G------C-GT-----A-T-TTTAC------A--A---CTTA-AT--T-AC-G----G-C--T-T-----A-A--T-T--G--C-CT--T-----A-ATT-G-A-A---CT-G-T----A--TG--T-G--T-T--T--A--G---A--T----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--TTAT--G---C-C-TA---A--T-C-TTAG--A-A-AA---AA-TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52263 : tatGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-G-CCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T---G-A--CT-G-C-A--------GA--CCCTAA-T--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-T--AC------AC-A---CT-AGAT--T-AC-G----G------T---T-A-A--T-T-----T-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---TAA---A---T-TAG-A-A---G-T-AA----T-AT--GCG-C-CTTA---A--T-C-T-AGTTA-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
gi|52264 : tatG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCG--AT-TT-AA--CC-G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCA-AA-C--T-T--T-G---------G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-C---TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-TG-G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-------T-A--G---T-AT--T---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G---T-T-G---A-A--T----C-GT--GA----T--A-A-AA----CTT-CCTGTAA
gi|52265 : tatgacgttcacatagGACG--TC-A--CAG-TG-AAC-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCG--AT-T--AA--C--GCA-----AA-AAT-T--TG-A--TT-G-C------A-A-GA--CCCTAA-A--A-T--C-G--A-G----G-C-G------A-T-TT-AC------A--A---CT---AT--T-AC-G----G-CG-T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT------GTT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TGGCTAG--T-T--TT-A--G---ATATACGGT-A--A---T---------T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-CT--G-G-CAC-TA---A--T-CAT-AG--A-A-AA---G---T-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----TTAA-A-AA----C-TACCTTT
gi|52266 : tatGACG--CG-AGACAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--TTCT--AACTC--G-A-----AA-AA--CGATG-A--CT-G-CAG----A-G-GA--CCC-AA-C--T-TCCT-GCTG-G----G-C-TTGCCTGA-A-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-CAGT-T---T---A--T-T--GC-C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--C-A--TG--T-GCCT-T--TT-ATGA---A-AT----TGA--A---T-A---ATATT-TAG-A-ATT-G-T--A-T--T-AT--G-GTC-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---ACA--T---CCGGT--GA----T--ATA-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52267 : tatGACGGTCA-A--AAG-GG-A-C-C-A--G-G---GACCCG-C-T-A--T-C---A--AT-T--AA--CTGG-A-----AA-GA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G--A--CCCAAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--A---CT-A-ATCGT-AC-G----G-C--TCT---T-A-A--T----G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CTGG-C--GCA--TG--T-G--TGT--TT-A--G---A-TT----T-A--G---T-A---A-----TAG-ACATT-T-T-AA-T--T-A---G-G---C-GA---A--T-C-T-AG--A-ATAA---G--TT-T-GAACA-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-GA----G-C-CCTTTAA
gi|52268 : tat--CAG-TG-A-C-CCA--C-GAT-GATCAG-C-T--------TCC--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-AG-GT-G---G----A-G-GA--CCCTAA-CTTT-T--T-GTTATG----G-T-GT-----A-T-TT-AC------A-------T-A-AT--T-AC-GC---G-C--T-T---TAA-A--T-T--GGAC-CT--TT----A-ATT-G-T-A---CT-G-T--G-G--TG--T-G--T-TAATT-A--G---A-GT----T-AGTA---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G---C-TA---A--TAC-T-TG--AGA-AA---GTATT-T-A---A-A--TGCGCA-GT--GA----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
gi|52269 : tatgactgtagGACG--TC-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-G--T--------AT-T--GA--T--G-G------------------------G-C-GG---A-G-GA--CCCTAA-CG-TGT--T-G--A-G----GAC-GT-----A-T-TT-ACAGAGGAA--A---CT-A-ATA-T-AT-G----G-CG-T-T---T-A-AG-T-T--G--C-CT--GTGTGAG-ATTAG-A-A---AT-GAT--G-AT-TG--T-G--TAT--TT-A--GAGAA-AT----T-A--AGTTT-A---A---T-TAG-A-ATT-T-T-AA-T--T-AT--G-
gi|52270 : tat-A--CAG-TG-A-T-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--
gi|52271 : tatgaagtcCG--CG-A--CAG-TGTATC-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-ATTAAAAACAA--T--TG-AACTT-G-C-GTAAGA-G-GA--CCCTAA-A--C-T--T-G--AAG----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--AGACTT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-AGT---A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--T--A--G---A-TT----A-A--A---T-A---A---T-TAG-A-ACT-G-T-AA-T--TGAT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT---A----T----A-AA----C-T-CCTTTAAtgaa
gi|52272 : atgactACG--CG-A--CAG-TG-A-G-C-AAAC-G-TTGAAC-G-C-T-A--T-C-TCC--TT-T--CA--C--G-A-----AA-----T--TGGA--CT-G-C-G----A-G-GA--CCTTAA-C--T-TACT-A--A-GTAGTG-CTGT-----A-T-AT-A-------A--A---AG-A-AT--T-AC-GTC--GTC--T-T---T-ATA--T-CTGG--C-ATA-TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-TTAG-ACTTT--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-AT--A---G-TAG-T-A-T-G-T-AA-T--T--TGAG-G-C-C-TA---A--T-C---AG--A-A-AAAAGG--TTGC-G---A-A--T---TC-TT--GAGTATC--A-A-CA----C-T-CCCTT
gi|52273 : atgaGATG--TC-A--CAG-TG-A-C---A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-TA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52274 : tGACG--CGGA--CAC-TG-A-C-C-A--C-G-T-GACCCG-C-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--C----------AA-AA--T--TG-A--CT-T-C-G----A-G--A--CACCAA-T--T-T-------A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-AGAT--T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--G--C-CT--TA----A-AT--G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--GT-G--------AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-T----A--T-C-TGAG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GTC-GA----T--A-A-AA----C---CCTTTA
gi|52275 : tGACG--CG-A--CAG-TG-A-C-C-A--C-G-T--ACCCG-C-T-A--T-C-TCA--AT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-T-------A--T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G---A-AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-C-TA---A--T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52276 : GACG--CG-C--CAG-CG-A-CGC-G--C---T-GACCCT-CGT-AAAT-CGTCA--TT-T--AA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CTAG-C-GT---ATG-GA--CCCTAC-T--T-T--T-G--A-G----G-C-GTC----A-T-TT--C------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----G-C--T-CTTAT-A-A--TGT--G--C-CT--TT----ATATT-G-A-AAGCCT-G-T--G-AT-TG--T-G--T-T--TT-A--A---G-ATG---T-A--A---T-A---AT--T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--A-ATTGG-G-C-C-TA---AC-T-C-T--G--A-A-AA---G--TT-TAG---A-A--T---CC-GT--GC----C--GTA-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52277 : CG--CG-A---AG-TG-A-C-C-A--CAG-T-GACCCGTC-T-A--T-C-TCA---T-T--AA--CT-G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GC--ACTTAA-C--T-T--T-G--A-GT---T-C-GT-----A---AT-AC------A--A---CT-A-ATG-T-AC-G----G-C--T-T---T-A-A--T-T--GC-C-CT--TT----A-ATT-GAA-A---CT-G-T--G-A---A--T-G--T-T--TT-T--G---A-TT----A-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-A---G-G-C-C-TA---AATC-C-T-AG--A-A-AAAT-G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52278 : AG-TG-A-C-C-A--C-G-T-G-CCCG-C-T-A--TTC-TCA---T-T--AA--C--G-A-----AA-A---T--TG-A--CT-G-C-G----A-G--A--CCCTAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TTTAC------A--A---CT-A-AT--T-AC-GTACGG-C--T-T---T-A-AA-T-T--G--C-CT--TTTT--A-ATT-G-A-----CTAG-T--G-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAGAA-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG--A-C-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CA-GT--GA----T--A-A-AA----C-T--CTTTAA
gi|52279 : --C-G-T-GACC-G-C-T-A--T---TCATCAT-TGTAA--C--G-A-----AA-AA--T--TG-A--CT-GCC-G----A-G-GAGGCCCTAA-C--T-T--T-G--A------G-T-G------A-T-AT-AC------AAGA---C--A-A-----AC-G----G-C--T-T-------A--T-T--G--C-CTAATT----A-ATT-GTATA---CT-G-T----A--TA--T-T--G-T--TT-A--G---A-TTA---T-A--G---T-GGACA---T-TAA-G-A-T-G-T-AA-C--T-TT--G-G-C----A---A--T-C-T-AGA-A-A-AA---G--TT-T-G-----A--T---CC-GTTGGA----T--ATA-AACTGCC-T-CTTTTAA
gi|52280 : T-T--AA-------A-----AA-AT--T--TG-A--CT-G-C-G----A-G-GA--CCCTAAAC--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AC------A--A---CTTA-AT--T-AC-G----G-CC-T-T---T-A-A--T-T--T--T-TT--TT----A-ATTTG-A-A---CT-G-TTGA-A--TG--T-G--T-T--TT-A--G-----AT----T-A--A---T-A---A---T-TAG-A-A-T-GTT-AA-T--T-AT--G-G-C-C--A---A--T-C-TAAG--A-A-AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T----A-AA----C-T-CCTTT
gi|52281 : TAA-C--T-T--T-G--A-G----G-C-GT-----A-T-TT-AT------A--A---CT-A-AT--T-AC-G----A---------------------------CT--TT----A-ATT-G-A-A---CT-G-T--G-G--TG--T-G--C-T--TT-A--G-----AT----T-A--G---T-A---A---T-TAG-A-A-T-G-T-AA-T--T-AT--G-G-C-A-TA---A--T-C-T-AG------AA---G--TT-T-G---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-CCTTTAA
gi|52282 : -G----G-C--T-T---T-A-AA-T-T--G--C-CT--TT----A-ATT-G-G-AATACT-G-T--G-AAATG--T-G--T-T--TTTA--G---A-------T-A--A---T-A---A---TCTAG-A-A-T-G-T-AA-AAAT-AT--G-G-C-C-TA---AA-T-C-T-AG--A-A-AA---G--TT-TTG---A-A--T---CC-GT--GA----T--A-A-AA----C-T-TCTTTAA