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lowQualScore                  :    .  . .. ....  .. .   .  . . . . .. .  .  ........ ..   . .. ..... . .   .   ..... . ...  ..    ..  . .. . ..... ..   .  . . .. .. .. .     . .   .. .  .............  .. ...   .....  .. . . .. .. ...... .  ..  ........................    .   ...........  ...... .... ...  .  ....     .  .      
lowQualScore                  :    9  9 66 4444  22 3   1  1 1 3 1 00 1  1  11111111 55   1 88 33333 1 1   1   55555 1 555  88    77  4 77 9 22222 88   8  4 4 99 88 99 4     4 4   99 8  7777777777777  33 444   88888  33 4 4 44 44 111111 9  44  888888888888888888888888    5   44444444444  555555 0000 999  3  1111     9  9      
consensus                     : AAA-AC-T--C---TCT--G-CCG-GT-C-A-A-T--A-TT-TT-N-A----A--AAA-T--A-----T-T-GAC-CGG-C---A-A---TA--TTTT--TC-GNNG-GA----G--CAA-AT-A-T--C--A--A-TTATG-T-TGA--G-CG-T-----------TT--T---CTC-----TA--T-A-T--A--G------A-GA--AT------------------------ATAG-AGA-------CT--AT------T---AT---TT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
Reference ( gi|63341 )        : AAA-AC-T--C---GCT--G-CCG-GT-C-A-A-T--A-TT-TT-A-A----A--AAA-T--A-----T-T-GAC-CGG-T---A-A---TA--TTTT--TC-GTCG-G-----G--CAA-AT-A-T--C--A--A-TTATG-T-TGA--G-CG-C-----------TT--T---CTC-----TA--T-A-T--A--G------A-AA--AT------------------------ATAG-AGA-------AC--AT------T---AT---TT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
gi|63340                      : AAA-AC-T--C---TCT--G-CCG-GT-C-A-A-T--A-TT-TT-A-A----A--AAAAT--A-----T-T-GAC-CAG-C---A-A---TA--TTTT--TC-GTCG-GA----G--TAA-AT-A-T--C--A--A-TTATG-T-TGA--G-CG-T-----------TT--T---CTC-----TA--T-A-T--A--G------A-AA--AT------------------------ATAG-AGA-------AT--AC------T---AT---TT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
gi|63342                      : AAA-AC-T--C-----T--G-CCG-GT-C-A-A-C--A-TT-TT-A-A----A--AAA-T--A-----T-T-GAC-CGG-C---A-A---TA--TTTT--TC-GTCGTA-----G--CAA-AT-A-T--C--A--A-TTATG-T-TGA--G-CG-T-----------TT--T---CTC-----TA--T-A-T--A--G------A-AA--AT------------------------ATAG-AGA-------AT--AG------T---AT---TT-AC----TGAAT-AT-AACAA
gi|63344                      : AAA-AC-T--C---GCT--G-CCG-GT-C-A-A-T--A-TT-TT-T-A----A--AAA-T--A-----T-T-GAC-CAG-C---A-A---TA--TTTT--TC-GTTG-GA----G--CAA-AT-A-T--C--A--A-TTATG---TGA--G-CG-------------TT--T---CTC-----TA--T-A-T--A--G------A-AA--AT------------------------ATAG-AGA-------CT--AA------T---AT---TT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
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gi|63346                      : AAA-AC-T--C---GCT--G-CCGCGT-CCA-A-T--A-TT-TT-G-A----A--AAA-T--A-----T-T-GAC-CGG-C---A-A---TA--TTTT--TC-GTCG-GA----G--CAA-AT-A-T--C--A--A-TTATGCT-TGAGTG-TG-T-----------TT--T---CTCTCCA-TA--T-A-T--A--G------ATAA--AT------------------------ATAGCAGACT-----AA--AT------A---AT---TT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
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gi|63343                      :        aaaactcgcT--G-CCG-GT-C-A-A-T--A-TT-TT-T-T----A--AAA-T--A-----T-T-GAC-CGG-C---A-atatttttcgttggagcaaatatcaattatgtgagcgtttctctatatagaaaatatagagactaatatttactgaatataacaat
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gi|63345                      :        aaaactcgcT--G-CCG-GT-C-A-T-TTAA-TT-TT-A-A----C------T--A-----T-T-GAC-CGG-C---A-atatttttcgtcggagcaaatatcaattatgcttgagtgtgttttctctccatatatagataaatatagcagactaaataatttactgaatataacaat
gi|63352                      :     aaaactctctgcT--G-CCG-GT-C-A-A-T--A-TT-TT-TTA----A--AAA-T--A-----T-T-GAC-CGA-C---A-G---AG--TTTT--atatttttcggaggagcaaatatcaattattttgagtgttttctctatttagagaatatagagactattctttacttaatataacaat
gi|63354                      :                 T--G-CCG-GT-C---A-T--A-TT-TT--------T--AAA-T--A-----TCT-GAC-CGG-C---AGA---TA--GTTT--Tatattttcgtcggagcaattatttcatgttgagcgttttttctttatagaaactatagaaactattattcactgaatcta
gi|63355                      :                 T--G-CCG-GT-C-A-A-T--A-TT-TT-T-A----A--AAA-TA-A-----T-T-GAC-CGG-CCAAG-A---TA--GTTT--Tatatttttcgtcggagcaaataatcaattaacttgtgacgttgttctatataggaaaataatagaaatattattactgaatataacaa
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gi|63351                      :        aaaactctcT--G-CCG-GT-C-A-A-T--A-TT-TT---T----A--AAA-T--A-----T-T-GAC-CGG-C---A-atatttttcgtcgtggcaaatatctattatgttgagcgtttcttttatctggtgcatcaaaatggtaccgtatatgatttatattatatagaaaatgtagagaatatcatttactgaatataacaat
gi|63361                      :        aaaactctcT--G-CCG-GT-C-A-A-T--A-TT-TT-T-A----A--AAA-TA-A-----T-T-GAC-CGG-CCAAG-A---TAGTTTTT--TC-Gatatttcggtcgtggcaaatatctattatgttgagcgttttcttat
gi|63353                      :                  --G-CCG-GT-C-A-T-TTTA-TT-TT-A-A----A------T--A-----T-T-GAC-CAG-C---A-
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gi|63365                      :                                  aaaactcgctgccgcgtccaatatttt--A-----C-T-GAC-TTG-T---A-AAATTA--TTTT--TC-G--G-GAGGAGG--CAA-AT-AAT--C--A--A-CTATG-T-TGA--G-TGTC-----------TT--T---CTCA----TA--T-T-T--A--G------AGAA--AT------------------------ATAG-CGA-------cgtcggagcaaatatcaattatgcttgagtgtgttttctctccatatatagataaatatagcagactaaataatttactgaatataacaat
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Reference ( family-586 )      :                                                                                                                               AAA-AC-TCTCT--G-C---CG-GT-C-A-A-T-A-TT-TTN-A----A--AA-A-T--A-----TTGACCGG-C-AA---TA----TTTT--TCGNN-GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-C-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-G-A--AT--------------------AT--AG-AGACT--AT-------TATTT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
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gi|63342                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCT----G-C---CG-GT-C-A-A-C-A-TT-TTA-A----A--AA-A-T--A-----TTGACCGG-C-AA---TA----TTTT--TCGTC-GT--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-C-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-A-A--AT--------------------AT--AG-AGAAT--AG-------TATTT-AC----TGAAT-AT-AACAA
gi|63343                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCGCT--G-C---CG-GT-C-A-A-T-A-TT-TTA-A----A--AA-A-T--A-----TTGACCGG-C-AA---TA----TTCT--TTGGA-GG--AA-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-C-TT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-A-A--AT--------------------AT--AG-AGACT--AT-------TATTT-AC----TGAAT-AT-
gi|63344                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCGCT--G-C---CG-GT-C-A-A-T-A-TT-TTT-A----A--AA-A-T--A-----TTGACCAG-C-AA---TA----TTTT--TCGTT-GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG---TGA--G-C-G--TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-A-A--AT--------------------AT--AG-AGACT--AA-------TATTT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
gi|63345                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCTCT--G-CTGCCG-GT-C-A-A-T-A-GT-T--------A--AA-A-TTAA-----ATGACCGG-C-AA---TA----TTTT--TCGGA-GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATT-T-TGA--G-T-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-TT-A-GA-G-A--AT--------------------AT--AG-AGACT--AT-------TCTTT-AC----TTAAT-AT-AACAAT
gi|63346                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCGCT--G-C---CGCGT-CCA-A-T-A-TT-TTG-A----A--AA-A-T--A-----TTGACCGG-C-AA---TA----TTTT--TCGTC-GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATGCT-TGAGTG-T-GT-TT-T---CTCTCCA-T-------A--T-AT-A-GATA-A--AT--------------------AT--AGCAGACTAAAT-------AATTT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
gi|63347                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCTCT--G-C---TG-GT-C-A-A-T-A-GT-TAC-A----ATTAA-A-T----------GACTGT-C-AA---TA----TTTT--TCTGA-GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------GTG-T-TGA--G-T-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-G-TA-G-A--AT--------------------AT--AG-AGACT--AT-------TCTTT-AC----TGAAT-AT-AACA
gi|63348                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCTAT--G-C---CG-GT-C-A-A-T-AGTTGTTC-A----A--AA------------TTAACCCGTC-AA---TA----TTTT--TCGTT-GG--AG-CTA-AT-A-T--C--A--A-AT-----------ATG-T-TGC--G-T-GT-CT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-G-A--AC--------------------AT--AG-AGACT--AT-------TCTTT-AC----TGAAT-AT-AACAA
gi|63349                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCGCT--GAC---CG-GT-C-A-A-T-T-AT-TTA-A----A--AT-A-A--A-----ATGACCGGGC-AA---TA----TTTT---CGGA-GG--AA-AAC-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-C-GT-TT-T---CTCTACGGT-------A--T-AT-A-CA-A-A--AA--------------------AT--AG-AGACT--AT-------TATTT-AC----TGAAT-AT-AAC
gi|63350                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCTCT--G-C---CG-GT-C-A---T-A-TT-TCA-A----A--AA-A-T--A-----TTGACCGG-C-AA---TA----TTTT--TCGTC-GT--GG-CAA-AT-A-T--C--T--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-C-GT-TT-C---TTT-----T-------A--T-
gi|63350                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -----T-------A--T-AT-A-GA-A-A--AT--------------------GT--AG-AGAAT--AT-------CATTT-AC----TGAAT-AT-AACAATctggtgcatcaaaatggtaccgtatatgatttatattatatagaaaatgtagagaatatcatttactgaatataacaat
gi|63351                      : aaaactctctgccggtcatatttcaaaaaatattgaccggcaatatttttcgtcgtggcaaatatctattatgttgagcgtttcttttatctggtgcatcaaaatggtaccgtatatgatttatatAAA-AC-TCTCT--G-C---CG-GT-C-A-A-T-A-TT-TT--A----A--AA-A-T--A-----TTGACCGG-C-AA---TA----TTTCGGTCGTG------G-CAA-AT-A-T--C--T--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-C-GT-TT-T---CT------T-------A--T-
gi|63352                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCT----G-T---CG-GT-C-A-A-T-A-TT-TTT-A----A--AA-AAT--A-----TTGACCGG-C-AA---TA----TTTT---CGTC-GG--AG-CAA-TT-A-T--T-------TC-----------ATG-T-TGA--G-C-GT-TT-T---TTC-----T-------T--T-AT-A-GA-A-A--CT--------------------AT--AG-AAACT--AT-------TATTC-AC----TGAAT-CT-
gi|63353                      :                                                                                                                               AAATAC-TCGCT--G-C---TG-GT-C-A-A-T-A-TT-T--------A--AA-A-TAAA-----ATGACCGGCC-AA---TA----TTTT--TCGAA-GG--AA-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-C-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-AA-A-A--CT--------------------A---AG-A---T--AT-------CATTT-A
gi|63354                      :                                                                                                                               AAA-AC-TATCT--G-C---CG-GT-C-AGA-T-A-TT-T---A----A--AA-A-T--A-----T-GACCGG-C-AA---TA----TTTT--TCGTC-GG--AG-CAA-ATAA-T--C--A--A-TT-----------AAC-T-TGT--GAC-GT-TG-T----TC-----T-------A--T-AT-AGGA-A-A--ATA-------------------AT--AG-AAA-T--AT-------TA-TT-AC----TGAAT-AT-AACAA
gi|63355                      :                                                                                                                               AAA-AC-TATCTTGG-C---CG-GT-C-A-A-TTA-TT-TTT-A----A--AA-A-T--A-----TTGACCGG-C-AA---TA----TTTT--TCGTC--G--AG-CAACAT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-AGA--G-CGGT-TTGT---CTC-----T-------A--T-AT-A-AG-G-A--A
gi|63356                      :                                                                                                                               AAA-AC-TATC---G-CT--CG-GT-C-T-A-T-A-TT-T---A----A--AA-A-T--AGT---TCGACCG--C-AAG--TA----TTTT---CGTC-GG--AG--AA-AT-A-T--TCAA--A-TT-----------ATG-T-AGA----C-GTATT-TATCCTC-----T-------ACTT-AT-A-GA-A-A--aacat
gi|63357                      :                                                                                                                               AAA-ACATCTCT--A-C---CG-GT-C-A-AAT-A-TC-TAA-ACCTTA--AA-T-T--A-----TTG----G-C-AA---TA----TTTT--TCGGA-GG--AG-CAA-AT-A-TATT--A--A-TT-----------ATG-T-TTA--G-C-GT-TT-T---CTC-----T-------G--T-AT-A-GA-G-A--AT------------------------------C--------------TTT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
gi|63358                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCTTT--G-C---CG-GT-C-A----------------------------------------CCAG-CCAA---TAGTTTTTTT--TCGGA-GC--AG-CAA-AT-A-A--C--A--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-T-GT-TT-T---CTC-----TATAATTGA--T-AT-A-AA-G-A--AT--------------------A
gi|63359                      :                                                                                                                               AAA-AC-TCTCT--G-C---CG-GT-C-A-A-T-A-TT-TTA-A----A--A
gi|63360                      :                                                                                                                                AA-AC-TCTCT--GTC---CA-GTTC-AGA-T-A-TT-TTTTA----A--AA-A-T--AAAGAATTGCTCAGTC-AAG--TA----TTTT--CGGTC-GGTTAG-CAA-AT-A-T--C--AGAA-TT-----------ATG-T-TAG--G-C-GT-AT-T---TTC-----TA------A--TAAT-A-GA-A-A--AT--------------------ATACAG-AAATT--GT-------AGTTT-ACT---TGAAT-AT-AACAAT
gi|63361                      :                                                                                                                               AAA-AC-TATCTTGG-C---CG-GT-C-A-A-TTA-TT-TTT-A----A--AA-A-T--A-----TTGACCGG-C-A
gi|63362                      :                                                                                                                                                                                                                        TT--TTGTA-AG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-TAA--G-T-GC-TT-T---TTC-----T-------A--T-AT-A-GA-G-A--AT--------------------AT--AG-AGACT--AT-------TCTTT-AT----TGAAT-AT-AACAAttcg
gi|63363                      :                                                                                                                                                                                       ttgtaaaaaaaaaaaaa-C-AA---TA----TTTT--TTGGA-GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-T-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AA-A-GA-G-A--AT--------------------AC--AG-ATGCT--AT-------TCTTT-AC----TGAAT-AT-AACAA
gi|63364                      :                                                                                                                                                                                   aaacaaaacgaatcTGACCGG-C-AA---TA----TTTT--TTGGA-GG--AG-CAA-AT-A-T--TTAA--A-TT-----------ATG-C-TTA--G-T-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-G-A--AT--------------------AT--AG-AGGCT--AT-------TGTTT-AC----TGAAT-AT-AACAA
gi|63365                      :                                                                                                                                                                                     aaa--A-----CTGACTTG-T-AAAATTA----TTTT--TCGGGAGG--AGGCAA-AT-AAT--C--A--A-CT-----------ATG-T-TGA--G-T-GTCTT-T---CTCA----T-------A--T-TT-A-GA-GAA--AT--------------------AT--AG-CGACT--A
gi|63366                      :                                                                                                                                                                                                                 A----TTTT--CCTGA-GG--AA-CAA-AT-A-T--C--A--A-CT-----------ATG-C-TGA--G-T-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-G-A--CT--------------------AT--AT-TTA-T--AT-------TGTTT-ACTGCATGACT-AT-AACAA
gi|63367                      :                                                                                                                                                                                                                 A----TTTT--TCGGA-G---AG-CAA-AT-A-T--C--A--ACTT-----------ATG-C-TGA--G-TTGT-TT-TT--CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-G-AAGAT--------------------AT--AA-AGACA--ATTCCAAACTATTTCAC----TGA
gi|63368                      :                                                                                                                                                                                                                 A----TTTT--CCGA--GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-CTATGCTGAGTGCATG-C-TGA--G-T-GT-TT-T---CTC-----T-------A--C-AT-A-GA-G-AGTAT--------------------AT--AA-AGGCA--AT-------TA
gi|63369                      :                                                                                                                                                                                                                       TTT--TCGGA-GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-CT-----------ATG-TCTGA--G-A-GT-TTCT---CTC-----T-------A--C-ATAA-GA-G-A--AT--------------------AT--AG-AGACT--ATC------TGTTT-ATTGCATGAAT-ATAAACAAcaaactatttcactga
gi|63370                      :                                                                                                                                                                                                                       TTT--TCGGA-GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-CT-----------ATG-C-AGA--G-T-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-G-AT-ATAAGATAATAGAGATAAGATAAT--AG-AGACT--AT-------TGTTT-AC----TGCCTCAT-AACAA
gi|63371                      :                                                                                                                                                                                                                                            -AT-A-T--T--C--A-GT-----------ATG-T-TGA--G-T-GT-TT-T---CT--------------A--T-AT-A-GG-------C--------------------CT--AG-AGACT--AT-------TCTTT-AC----TGAAT-AT-AACAA


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blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     TG T T    .  . . G . T .  . TA  .    .   . . TAA             G .  G    .       .    TC   .   .   .  . . .  TA .  .  .             . .   .  . T  C  C T     TCCA  A       .  .  . .  GA  GT  A                     .   .     .   C           .  TGCA     .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . TA  .    .   . . AAA             C .  G    .       .    TC   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     A     .       .  .  . .  A   T   .                     .   .     .   .           .  T        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . TA  .    .   . . AGT             T .  .    .       .    GA   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . TT  .    .   . . A               . .  .    .       .    TT   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . TG  .    .   . . A               . .  .    .       .    GA   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . AC  .    .   . . A               . .  .    .       .    TC   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  G   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . TC  .    .   . . A               . .  .    .       .    GA   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  G   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . TA  .    .   . . A               . .  .    .       .    TT   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  G   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . CA  .    .   . . A               . .  .    .       .    GA   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . TT  .    .   . . A               . .  .    .       .    TC   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . TT  .    .   . . A               . .  .    .       .    TG   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . AA  .    .   . . A               . .  .    .       .    TC   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . TA  .    .   . . A               . .  .    .       .    AA   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . T   .    .   . . A               . .  .    .       .    TC   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . .   .    .   . . A               . .  .    .       .    TC   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  G   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . .   .    .   . . A               . .  .    .       .    GA   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  G   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                  .  .     .  . .    .  . . . . . .  . .   .    .   . . .               . .  .    .       .    GA   .   .   .  . . .  .  .  .  .             . .   .  . .  .  . .     .     .       .  .  . .  A   .   .                     .   .     .   .           .  .        .  .
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Reference ( family-586 )      :                                                                                                                               AAA-AC-TCTCT--G-C---CG-GT-C-A-A-T-A-TT-TTN-A----A--AA-A-T--A-----TTGACCGG-C-AA---TA----TTTT--TCGNN-GG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-TGA--G-C-GT-TT-T---CTC-----T-------A--T-AT-A-GA-G-A--AT--------------------AT--AG-AGACT--AT-------TATTT-AC----TGAAT-AT-AACAAT
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gi|63362                      :                                                                                                                                                                                                                        TT--TTGTA-AG--AG-CAA-AT-A-T--C--A--A-TT-----------ATG-T-TAA--G-T-GC-TT-T---TTC-----T-------A--T-AT-A-GA-G-A--AT--------------------AT--AG-AGACT--AT-------TCTTT-AT----TGAAT-AT-AACAAttcg
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gi|63365                      :                                                                                                                                                                                     aaa--A-----CTGACTTG-T-AAAATTA----TTTT--TCGGGAGG--AGGCAA-AT-AAT--C--A--A-CT-----------ATG-T-TGA--G-T-GTCTT-T---CTCA----T-------A--T-TT-A-GA-GAA--AT--------------------AT--AG-CGACT--A
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