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lowQualScore                  :        1 22    2222  44 77 555   22 1   3333 1  1    3333 888  3  1 44   1  22 1 1   1 1 1  777 333  1   2 22 2 22   777 55  4  2  2 77 4444   2  333 4   2 33 33 33  2  2       999   2   33 0 5555  2 55555   2  4444444444444444444 2   2  77 2  55555 2 2 2 2 4   55  6 2  666666   4   33333333333333333       555  2  22 2 2  7777 1     1 1 11111111111111111111 4444  3 1  1  88  1 1  22 22   1   1   22 1 5  22   1 1  1  9 1  1 3333333333333333 22 3     1      000 1    1   1    3333    22  7     33     
lowQualScore                  :        . ..    ....  .. .. ...   .. .   .... .  .    .... ...  .  . ..   .  .. . .   . . .  ... ...  .   . .. . ..   ... ..  .  .  . .. ....   .  ... .   . .. .. ..  .  .       ...   .   .. . ....  . .....   .  ................... .   .  .. .  ..... . . . . .   ..  . .  ......   .   .................       ...  .  .. . .  .... .     . . .................... ....  . .  .  ..  . .  .. ..   .   .   .. . .  ..   . .  .  . .  . ................ .. .     .      ... .    .   .    ....    ..  .     ..     
lowQualScore                  :        8 55    8888  11 33 555   33 7   3333 7  7    0000 000  3  7 00   7  33 7 8   9 9 9  999 333  9   0 88 0 88   777 00  2  1  1 11 5555   1  777 2   2 11 11 11  4  4       777   4   22 3 0000  2 33333   1  5555555555555555555 1   1  99 1  00000 1 1 1 1 2   00  3 1  111111   7   66666666666666666       555  0  88 0 0  8888 9     9 9 33333333333333333333 0000  0 8  8  22  8 8  44 44   7   7   33 7 0  00   7 7  7  8 7  7 0000000000000000 44 5     8      111 8    8   8    9999    44  1     55     
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Reference ( gi|109994 )       : AAGAGTT-T--CAAT--A-TC--A--A--TCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-A--T-C-CA-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-C-AG---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-A-T--GG-AT-CT-A--T----TTA-GA---C-AGT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAA--TGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-GC------GATAAAA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAAAA-C-A-C-C------A-A-------A----GAAA-CC-CAC-GA-A-TT--C--CGT-AAA-CAG--T-C-GGG-AAA-A-CA-TTTT-AA-T------------A---T--G-GGCCG-TTCATT-G-G-TGTT-TAA-GCGA----TATA-AAATATTTTTGGGACG
gi|109995                     : AAGAGTT-T--TAAT--G-TC--A--AA-CCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G--T-T-CA-GA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-C-AG---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--C----TTA-GA---C-AGT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAAAACGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-A-AGA--GC-A-GC------GATAAAC-------------T---TTTGTGT---AG-AT--A-T-TG----G-AAAAA-A-C-C-C------A-A-------A----GAAA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAG-CAG--T-C-GGG-AAA-A-CA-TTGT-AA-T------------G---T--T-GGCCG-TTTATA-A-T-TGTT-TAA-ATGA----TATA-GAAGATTTTT-GGACG
gi|109996                     : AAGAGTT-T--CAAT--A-TC--A--AA-TCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G--T-T-CA-AA-G--TAT-CG--A-A-TTA-G-C-AG---A---CA-AAT-C--A-A--GAT-T-T--GG-AT-CT-A--T----TTA-GA---C-AGT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCGA--AAA-AAA--TGA----CATT-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG-------------------G-AGA--GC-A-GC------GAT-AAA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A---CG----G-AAAAA-C-A-C-CCAAGAAA-A-------A----GAAA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAA-CAG--T-C-GGG-AAA-A-CA-TGGT-AA-T------------A---T--G-GGCCG-TTCATT-ATG-T-TT-TCA-GCGA----TATA-AAAAATTTT--GGACG
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gi|110007                     : AAGAGTT-TATCA-T--G-TCCAA--A--CCTGATC-AAA----T-TT-GAAC-G--T-T-CA-AA-GGTTAT-C-----A-ATA-G-T-AG---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CTTA--T----TTA-GA---CTAGT-T--T--C---T-CA-TTGTCGA---AAA-AAA--TGA----CG-T-----TTT-AG---------G---------A-AAA-GGCTT-GG-----A-GGC-A-G-AGA--GCTA-GA------GATACAAT-----------GT---TTTCTGT----G-ATTAA-T-CGCCG-G-GTAAA-CTA-C-C------C-A------------GAGA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGTTAAATCAA--T-C-TGGCAAA-A-CA-TTGT-AA-T------------G---T--G-AGCCG-TCTCTT-A-G-TGTT-TAA-GTGA----TATA-AAA-ATTTTTGtgac
gi|110008                     : AAGAATT-T--CAAT--G-TG--AC-A--CCTG--C-AAA---TT-GT-GAAC-G--T-T-CA-AA-G--TAT-CA--A-A-AAA-G-T-AG---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-T-T--GA-TT-CT-A--TTTAATTA-AA---C-AGT-T--T--T--GT-CA-TTTTTTG---AAC-GTA--TGA----CG-T-----TTT-----------------------------------G-----A-G-----A-AGA--GC-A-GC------GGTAAGA------------A----TTTGTGT---AG-AT--A-A-AG----G-AAAAA-C-A-C-C--------------------------C------------------------A-TAG--T-C-GGG-AAACA-CA----T-AA-T------------A------------G-TTCATT-A-G-TTCT-TAA-GCGA----TA-A-AAAGAGTTTTGaacg
gi|110009                     : AAGAGTTCT--CAAG--G-TC--A--AAATCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G--T-T-CA-AA-G--TAT-CGACA-A-ATA-G-C-AG---A---GA-AAT-C--G-A---GT-ATT--GG-ATCCT-AC-T----TTA-AA---C-AGTCT--T--C--GT-CA-TTGTTCGAA-AAA-AAA--T-A----CG-T-----TTTGCGC--------G---------A-AAA-GGC-T-GG-----atg
gi|109997                     : AAGAGTT-T--CAAT--A-TC--A--AA-TCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G--T-T-CA-AA-G--TAT-CG--A-A-TTA-G-C-AG---A---CA-AAT-C--A-A--GAT-T-T--GG-AT-CT-A--T----TTA-GA---C-AGT-T--T--C--
gi|110010                     : AAGAGTT-T--CAAT--G-TC--A--AA-CCTG--C-AAA---AT-TT-GATC-G--T-T-AA-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-A-AG---A---GA-AAT-T--G-A--GGT-
gi|110003                     : AAGAGTT-T--CAAT--A-TC--A--AG-TCTG--G-AAA---TT-TT-TAAC-G--T-T-CA-AA-GT-TAT-TG--A-A-ATA-G-C-AG---A---GA-t
gi|110011                     : AAGAGTT-T--CAAT--G-CC--AC-A--CCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G--T-T-CA-AA-G--TAT-TG--A-
gi|110004                     : AAGAGTT-T--CAAT--A-TC--A--AG-TCTG--G-AAA---TT-TT-TAAC-G--T-T-CA-AA-G--TAT-TG--A-A-AT
gi|110012                     : AAGAATT-T--CATT--A-TC--A--AA-CCTG--G-AAA---AT-TT-GAAC-G--T-T-TA-AA-G--TAT-TG--
gi|110013                     :  AGAGTT-T--CCAT--AATC--A--A--TCTG--C-CAA---AT-TT-GAAC-G--TTC-CACAA-G--TA--CG--A-AGATA-G-C-AG---A---GA-AAT-TCTG-A--CGT-G-TT-GG-AT-CT-AATC----TTA-AA---CCAGT-C--TTGC--GT-CA-TTGTTCGGATAAA-ATA--TGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GGTAT-GA-----G-G-CAA-G-AGACTGC-A-GC------GATAAAATGTGTGTTGGTCAT---CTTGTA----AC-AT--ATT-CGTGGTG-ATAAA-C-A-T-CCCA---A-A-------A----GAAA-CC-TAT-GA-A-TTCGC--TGT-AAC-CAG--T-C-GGG-GAA-ATCC-TTGTAAA-T------------A---T--G-GGCCG-CTCATTCA-T-TGTT-T-A-GCAAGAATTATG-AAATATTTT--GGACG
gi|110014                     :      TT-T--CAAT--A-TC--A--AA-CCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G--T-T-CA-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-C-AGG--A---GA-AAT-C--G-A--CGT-T-T--GGGAT-CT-AA-T----TTA-GA---C-AAT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAA--TGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAATGG--TGGG-----A-G-C-A---AGA--GC-AGGC------GAT-ACA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-GAAAA-T-A-T-C------A-C-------A----G--A-CCACAT-GA-ATTT--C--TAT-ATA-GAG--T-C-CG---AA-A-CA-TTGT-AG-T------------G---T--G-GGCCG-TTCACT-G-G-TGTT-AAA-GCGA----TGTA-GAAGATTTT--GGACG
gi|110015                     :      TT-T--CAAT--A-TC--A--AG-CCTG--G-AAA---TT-TT-GAAC-G--T-TTCATAA-G--TAT-TG--A-A--TA-G-C-AG---AAGAGA-AGT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--T----T-A-GA---C-AGT-CGCT--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAA--TTA----CG-T-----TTT-CG---------G---------ATAAA-GG--T-GG-------G-C-A-GAAGAT-GC-A--C------GATAAAC------------TC---TTTGTGTA--AG-AT--A-T-CG----G--AAAA-C-A-C-C------A-C-------ATGATGAA---C-CAT-GA-A-AT--T--CGT-TAA-AAG--T-C-GGG-AAA-A-CA-TTGT-AA-T------------ATCTT--G-G--CG-TTCATT-A-G-TGTT-T---GCAG----TATA-GAAGATTTTT-GGACG
gi|110016                     :      TT-T--TAATGCA-CC--ATAA--CCTG--C-AA-----T-TT-GAAT-GG-T-T-CA-AA-G--TTC-TG--A-A-ATG-G-C--G---A---GG-AA----------------------AC-CT-A--T----TAA-GAGTAC-GGT-C--T--C---T-CAATTAT-CG---AAACAAA--TGATGAACG-T-----ATT--G---------A---------A-AAA-AA--T-GG-----A-G---------A--GCAA-GCAAGATGAATAAAA------------ATAAGTTTGGGT-----------------------AAGA-C-A---C------A-C-------A----GAGA-CC-TATAGA-C-TT--A--C-T-AAA-CAG--T-CTGAT-AAA-A-CA-ATTG-AA-T------------A---T--G-G
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Reference ( family-580 )      : AAGAGTT-T--CAATG-T--C-A-A-A-CCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-C-A-G---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--T----TTA-GA---C-AGT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAATGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-G--CGA-TAAAA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAAAA-C-A-C-C------AA-------A-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAA-CAG--T-C-GGG-AAA-A-C-A-TTGT-AA---------TG---T--G----G-G----CCG-TTCAT-T-AG-TG-TT-TAA-GCGA----TATA-GAAGATTTTT-GGACG
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gi|109998                     : AAGAGTT-T--CAATG-T--C-A-A-AACCTG--CTAAA---AT-TT-GAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-CC--G-A-ATCCG-C-A-G---A---GA-AAT-C--GGA--GGA-T-T--GG-TT-CT-A--T----TTA-GA---C-AGT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAATTA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-A--CGA-T-AAA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAAAA-C-ACC-C------AC-------A-AA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAG-CAG--T-C-GGT-AAA-A-C-A-TTGT-AATCCCGGGATTG---T--AATGTG-G----CCG-TTCTT-T-AA-TG-TT-TAA-GTGA----TATG-GAGGA-TTTT-GGAC
gi|109999                     : AAGAGTT-T--CAATG-T--T-A-C-A-CCTG--C-AAA---AT-TT-GATC-G-TT-C-A-AA-G--TTT-CG--A-A-ATG-G-T-A-G---A---GA-AAT-C--G-A--AAT-T-T--GA-AT-CT-A--T----AAA-GT---C-AGG-A--A--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAATTA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAT-GG--T-GG-----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-G--TAA-T-AAA------------AT---TTTGTTT---AG-AC--A-T-CG----G-AAAAA-C-A-CGT------AA-------A-GA-GA-CC-CAT-AA-A-TT--C--CTT-AAA-CAG--T-C-GGG-AAA-A-C-A-CTGT-AA---------TG---T--G----A-G----CCG-TTCAT-T-AG-TG-TT-TAA-GTGA----CACA-AAATATTTTC-GGACG
gi|110000                     : AAGAGTT-T--CAATA-T--C-A-A---TCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-C-A-AATG--TAT-CG--A-C-GTG-G-T-A-----A---GA-A-T-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--T----TTA-GA---C-AGT-T--T--C--GT-CG-TTGTGC----AAA-AAATGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----ATG-C-AGG-AGA--GC-A-G--TG--TAAAA------------TT---TTTGTGT---AG-AT--A-TCCG----G-AAAAA-C-ACC-C------AA-------A-GA-AACCC-CAT-GA-A-TT--C--CGT--AA-CAG--T-C-GGG-AAA-A-C-A-TTGT-AA---------TG---T--G----G-G-----CG--TCAT-T-CT-TG-TT-T-G-GCGA----TATA-AAAGATTTTT-GGACG
gi|110001                     : AAGAGTT-T--CAATG-T--C-A-A-A-GCTG--C-AAA---AT-T--GAAC-G-TT-C-A-A--G--TAT-CG--A-A-ATA-G-C-A-G---A---GA-AAT-T--A-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--T----TTA-GA---C-AGT-T--T--TCGGT-CA-TTGTTCG---AAA-AAGTGA----CG-T-----TTT-CG---------GA--------A-AAA-GG--C-GGGCGGAA-G-C-A-G-AGA--GCAA-G--CGA-TAAAA-----------------TTTGTGT---CG-AT--A-T-CG----GAAAAAA-C-ACC-C------AA-------A-TA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CG--AAC-CAT--T-C-GG---AA-A-C-A-TTGT-AAC--------TGT--T--G----G-G----CCG-TTCAT-T-AG-TG-TTGTAA--CGA----TATA-AAATATTTTT-GGACG
gi|110002                     : AAGAGTT-T--CAATG-T--C-A-A-AACCTG--C-AAA---A--TT-GAAC-T-CT-C-A-AA-G--TAT-CG--ATA-ATA-G-C-A-G---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--T----TTA-AA---C-AGT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCG----AA-AAATGA----CG-T-----TTT-CG---------GAAGAAAGGTA-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-G-AGA--AC---G--CGA-TAAAA------------TT---GTTGT-T---AGTAT--G-T-CG----G-GAAAA-C-ACC-C------AC-------A-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--TCGCGT-AAT-CAG--T-T-GGG-AAA-A-C-A-TTTT-AA---------TA---T--AT---G-G----CC--TTCAT-T-A---G-TT-TAT-GCGA----TATAGGAATATTTTT-GGACG
gi|110003                     : AAGAGTT-T--CAATA-T--C-A-A-G-TCTG--G-AAA---TT-TT-TAAC-G-TT-C-A-AA-GT-TAT-TG--A-A-ATA-G-C-A-G---A---GA-
gi|110004                     : AAGAGTT-T--CAATA-T--C-A-A-G-TCTG--G-AAA---TT-TT-TAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-TG--A-A-AT
gi|110005                     : AAGAGTT-T--CA-TG-T----A-A-A-CCTG--C-AAA------TT-GAATTG-TT-C-A-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-AAC-A-G---A---GA-AAT-C--G-A--GTT-T-T--GGGAT-CT-A--T----CTA-GA---C-AGT-T--T--C--GT-CA-TTTTTAA---AAA-AAAATA----CG-T-----TTC-AG---------C---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-GCAGA--GC-A-G--CG--TATAA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CA----G-AAAAA-C-ACC-C------AC-------A-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAA-CAA--T-C-AGG-AAA-A-C-A--TGTAAA---------TG---T--G----G-G----CCG-TTCAT-T-AGCTG-TT-TAA-GTGA----TAT--GAAATTTTCT-GGATG
gi|110006                     : AAGAGTT----CAATA-T--C-A-A-A-CCTG----GAA---AT-TT-GAAC-G-TT-A-A-TA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-C-A-G---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--T----TCA-GA---C-AAT-T--T--C--GT-CC-TTGTTC----AAA-AAATTA-----G-T-----TTT-TC---------G---------C-AAA-GT--T-GG-----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-G--C---TAAAA-----------------TTTGCGTATAAG-A---A-T-C-----G-AAATA-C-A-C-C------AC-------A--A-GA-CC-CAT-GA-A--T--C--CGT-GAA-CAG--T-C-GGA-AAA-A-A-A--TGT-AAC--------TA---T-------G-G----CCG-TT-AC-T--G-TG--T-TAA-GC------TATA-GAATATTTCT-TGAC
gi|110007                     : AAGAGTT-TATCA-TG-T--CCA-A-A-CCTGATC-AAA----T-TT-GAAC-G-TT-C-A-AA-GGTTAT-C-----A-ATA-G-T-A-G---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CTTA--T----TTA-GA---CTAGT-T--T--C---T-CA-TTGTCGA---AAA-AAATGA----CG-T-----TTT-AG---------G---------A-AAA-GGCTT-GG-----A-GGC-A-G-AGA--GCTA-G--AGA-TACAAT-----------GT---TTTCTGT----G-ATTAA-T-CGCCG-G-GTAAA-CTA-C-C------CA---------GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGTTAAATCAA--T-C-TGGCAAA-A-C-A-TTGT-AA---------TG---T--G----A-G----CCG-TCTCT-T-AG-TG-TT-TAA-GTGA----TATA--AAAATTTTT-GAACG
gi|110008                     : AAGAATT-T--CAATG-T--G-A-C-A-CCTG--C-AAA---TT-GT-GAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-CA--A-A-AAA-G-T-A-G---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-T-T--GA-TT-CT-A--TTTAATTA-AA---C-AGT-T--T--T--GT-CA-TTTTTTG---AAC-GTATGA----CG-T-----TTT-----------------------------------G-----A-G-----A-AGA--GC-A-G--CGG-TAAGA------------A----TTTGTGT---AG-AT--A-A-AG----G-AAAAA-C---------------------------A-CC-CAT----------------------AG--T-C-GGG-AAACA-C-A----T-AA---------TA--------------------G-TTCAT-T-AG-TT-CT-TAA-GCGA----TA-A-AAAGAGTTTT-GGATG
gi|110009                     : AAGAGTTCT--CAAGG-T--C-A-A-AATCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-CGACA-A-ATA-G-C-A-G---A---GA-AAT-C--G-A--GTA-T-T--GG-ATCCT-AC-T----TTA-AA---C-AGTCT--T--C--GT-CA-TTGTTCGAA-AAA-AAAT-A----CG-T-----TTTGCGC--------G---------A-AAA-GGC-T-GG-----
gi|110010                     : AAGAGTT-T--CAATG-T--C-A-A-A-CCTG--C-AAA---AT-TT-GATC-G-TT-A-A-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-A-A-G---A---GA-AAT-T--G-A--GGT-T-
gi|110011                     : AAGAGTT-T--CAATG-C--C-A-C-A-CCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-TG--A-
gi|110012                     : AAGAATT-T--CATTA-T--C-A-A-A-CCTG--G-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-T-A-AA-G--TAT-TG--
gi|110013                     :  AGAGTT-T--CCATAAT--C-A-A---TCTG--C-CAA---AT-TT-GAAC-G-TT-CCACAA-G--TA--CG--A-AGATA-G-C-A-G---A---GA-AAT-TCTG-A--CGTGT-T--GG-AT-CT-AATC----TTA-AA---CCAGT-C--TTGC--GT-CA-TTGTTCGGATAAA-ATATGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GGTAT-GA-----G-G-CAA-G-AGACTGC-A-G--CGA-TAAAATGTGTGTTGGTCAT---CTTGTA----AC-AT--ATT-CGTGGTG-ATAAA-C-A-T-CCCA---AA-------A-GA-AA-CC-TAT-GA-A-TTCGC--TGT-AAC-CAG--T-C-GGG-GAA-ATC-C-TTGTAAA---------TA---T--G----G-G----CCG-CTCAT-TCAT-TG-TT-T-A-GCAAGAATTATG-AAATA-TTTT-GGACG
gi|110014                     :      TT-T--CAATA-T--C-A-A-A-CCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-C-AGG---A---GA-AAT-C--G-A--CGT-T-TG-GG-AT-CTAA--T----TTA-GA---C-AAT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAATGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAATGG--TGGG-----A-G-C-A---AGA--GC-AGG--CGA-T-ACA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-GAAAA-T-A-T-C---------------A-CA-GA-CCACAT-GA-ATTT--C--TAT-ATA-GAG--T-C-CG---AA-A-C-A-TTGT-AG---------TG---T--G----G-G----CCG-TTCAC-T-GG-TG-TT-AAA-GCGA----TGTA-GAAGA-TTTT-GGACG
gi|110015                     :      TT-T--CAATA-T--C-A-A-G-CCTG--G-AAA---TT-TT-GAAC-G-TTTC-ATAA-G--TAT-TG--A-A--TA-G-C-A-G---AAGAGA-AGT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--T----T-A-GA---C-AGT-CGCT--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAATTA----CG-T-----TTT-CG---------G---------ATAAA-GG--T-GG-------G-C-A-GAAGAT-GC-A----CGA-TAAAC------------TC---TTTGTGTA--AG-AT--A-T-CG----G--AAAA-C-A-C-C------AC-------ATGATGA-AC-CAT-GA-A-AT--T--CGT-TAA-AAG--T-C-GGG-AAA-A-C-A-TTGT-AA---------TATCTT--G----G-------CG-TTCAT-T-AG-TG-TT-T---GCAG----TATA-GAAGATTTTT-GGACG
gi|110016                     :      TT-T--TAATG-CACC-ATA-A-CCTG--C-AA-----T-TT-GAAT-GGTT-C-A-AA-G--TTC-TG--A-A-ATG-G-C---G---A---GG-AA----------------------AC-CT-A--T----TAA-GAGTAC-GGT-C--T--C---T-CAATTAT-CG---AAACAAATGATGAACG-T-----ATT--G---------A---------A-AAA-AA--T-GG-----A-G---A-G-CAA--GC-A-AGATGAATAAAA------------ATAAGTTTGGGT---A--------------------AGA-C-A-C--------AC-------A-GA-GA-CC-TATAGA-C-TT--A--C-T-AAA-CAG--T-CTGAT-AAA-A-CAA-TTG--AA---------TA---T--G----GTGATACCTGTTTCATAA-AG-TG--T-TAA-GTG
gi|110017                     :        -T--CAGTG-A--C-A-A-A-CCTG--C-AAA---ATATT-GAACTG-TT-C-C-CA-GA-TATTCG--A-A-ATG-G-CTA-GGC-A---GA-AATGC--G-AAAGGT-TAT--GG-AT-CT-A--T----TTACGA---C-ATT-T--T--C--GTTCA-TTATT-G---AAA-AAATGA----CG-TGGTTTTTT-TGTTTTTTTTTG---------A-AAA-GG--T-GG-----C-G-C-A-G-AGA--GC-A-G--CGA-TAAAA-------------T---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CA----G-GAAAA-C-A-C-C------CACAGATCTA-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAA-CAG--T-C-GGA-AAA-A-C-A-CTGT-AA---------TA---T--G----G-G----CCA-TTAAT-T-AG-TG-TT-TAA-GTGA----TAGA-GAAGA
gi|110018                     :             AATG-T--A-A-ACA-CCTG--C-AAATGAAT-TTTGAAC-T-TT-C-A-AA-G--T-T-CG------ATA-G-C-A-GTCTA---GATATT-C--G-A--GGT-T-TCGGG-AT--T-A--T----TC--GA---C-AG
gi|110019                     :                                                                                                                                                                                                    -T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-T-AGA--GC-A-G--CGA-T-AAA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAACA-C-ACC-C------AC-------A-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGA-AAA-CAG--T-C-GGG-AAA-A-C-A-TTGT-AA---------TA---T--G----G-A----CCG-TTCAT-T-AG-TG-TT-CAA-GTGG----TATA-GAATATTGTT-
gi|110020                     :                                                                                                                                                                                                      -----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-T--CGA-TGAAA-------------T---TTTTTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAAAA-C-A-T-C------CA-------A-AA-AA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAA-CAG--T-C-GGG-
gi|110021                     :                                                                                                                                                                                                                                                  -----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-G--CGA-TAAAC------------TT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAAAA-C-ACC-C------AC-------A-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAG-CAG--T-CGGGG-AAA-A-C-A--TGTAAA---------TA---T--T----G-G----CCG-TTCAT-T-AG-TG--T-TAA-GCGA----TATA-GAAGATTTTT-GGACG
gi|110022                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---AN-AT--A-T-CG----G-AAAAAAC-A-C-C------CAC------A-GA-GA-CC-CAT-GG-A-TT--C--CCT-AAA-CAG--T-C-GGG-AAA-T-C-A-TTGT-AA---------TG---T--G----G-G----CCC-TTTAT-T-AG-TG-TT-AAA-GCGA----TATA-GAAGATTTTT-GGACG
gi|110023                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -AAAAA-C---C-C------AACA-----G-GA-GA-TA-TGT-GACA-TT--C--C-T-AAA-CAAGCT-CTGAA-AAA-A-C-AATTGT-AA---------TAA--T--G----A-G----CCGGTTCAT-T-AA-AG-TT-TAAAGCGA----TATA-GAAGATTTTT-GAACG
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Reference ( family-580 )      : AAGAGTT-T--CAATG-T--C-A-A-A-CCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-C-A-G---A---GA-AAT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--T----TTA-GA---C-AGT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAATGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-G--CGA-TAAAA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAAAA-C-A-C-C------AA-------A-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAA-CAG--T-C-GGG-AAA-A-C-A-TTGT-AA---------TG---T--G----G-G----CCG-TTCAT-T-AG-TG-TT-TAA-GCGA----TATA-GAAGATTTTT-GGACG
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gi|110010                     : AAGAGTT-T--CAATG-T--C-A-A-A-CCTG--C-AAA---AT-TT-GATC-G-TT-A-A-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-A-A-G---A---GA-AAT-T--G-A--GGT-T-
gi|110011                     : AAGAGTT-T--CAATG-C--C-A-C-A-CCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-TG--A-
gi|110012                     : AAGAATT-T--CATTA-T--C-A-A-A-CCTG--G-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-T-A-AA-G--TAT-TG--
gi|110013                     :  AGAGTT-T--CCATAAT--C-A-A---TCTG--C-CAA---AT-TT-GAAC-G-TT-CCACAA-G--TA--CG--A-AGATA-G-C-A-G---A---GA-AAT-TCTG-A--CGTGT-T--GG-AT-CT-AATC----TTA-AA---CCAGT-C--TTGC--GT-CA-TTGTTCGGATAAA-ATATGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GGTAT-GA-----G-G-CAA-G-AGACTGC-A-G--CGA-TAAAATGTGTGTTGGTCAT---CTTGTA----AC-AT--ATT-CGTGGTG-ATAAA-C-A-T-CCCA---AA-------A-GA-AA-CC-TAT-GA-A-TTCGC--TGT-AAC-CAG--T-C-GGG-GAA-ATC-C-TTGTAAA---------TA---T--G----G-G----CCG-CTCAT-TCAT-TG-TT-T-A-GCAAGAATTATG-AAATA-TTTT-GGACG
gi|110014                     :      TT-T--CAATA-T--C-A-A-A-CCTG--C-AAA---AT-TT-GAAC-G-TT-C-A-AA-G--TAT-CG--A-A-ATA-G-C-AGG---A---GA-AAT-C--G-A--CGT-T-TG-GG-AT-CTAA--T----TTA-GA---C-AAT-T--T--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAATGA----CG-T-----TTT-CG---------G---------A-AAATGG--TGGG-----A-G-C-A---AGA--GC-AGG--CGA-T-ACA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-GAAAA-T-A-T-C---------------A-CA-GA-CCACAT-GA-ATTT--C--TAT-ATA-GAG--T-C-CG---AA-A-C-A-TTGT-AG---------TG---T--G----G-G----CCG-TTCAC-T-GG-TG-TT-AAA-GCGA----TGTA-GAAGA-TTTT-GGACG
gi|110015                     :      TT-T--CAATA-T--C-A-A-G-CCTG--G-AAA---TT-TT-GAAC-G-TTTC-ATAA-G--TAT-TG--A-A--TA-G-C-A-G---AAGAGA-AGT-C--G-A--GGT-T-T--GG-AT-CT-A--T----T-A-GA---C-AGT-CGCT--C--GT-CA-TTGTTCG---AAA-AAATTA----CG-T-----TTT-CG---------G---------ATAAA-GG--T-GG-------G-C-A-GAAGAT-GC-A----CGA-TAAAC------------TC---TTTGTGTA--AG-AT--A-T-CG----G--AAAA-C-A-C-C------AC-------ATGATGA-AC-CAT-GA-A-AT--T--CGT-TAA-AAG--T-C-GGG-AAA-A-C-A-TTGT-AA---------TATCTT--G----G-------CG-TTCAT-T-AG-TG-TT-T---GCAG----TATA-GAAGATTTTT-GGACG
gi|110016                     :      TT-T--TAATG-CACC-ATA-A-CCTG--C-AA-----T-TT-GAAT-GGTT-C-A-AA-G--TTC-TG--A-A-ATG-G-C---G---A---GG-AA----------------------AC-CT-A--T----TAA-GAGTAC-GGT-C--T--C---T-CAATTAT-CG---AAACAAATGATGAACG-T-----ATT--G---------A---------A-AAA-AA--T-GG-----A-G---A-G-CAA--GC-A-AGATGAATAAAA------------ATAAGTTTGGGT---A--------------------AGA-C-A-C--------AC-------A-GA-GA-CC-TATAGA-C-TT--A--C-T-AAA-CAG--T-CTGAT-AAA-A-CAA-TTG--AA---------TA---T--G----GTGATACCTGTTTCATAA-AG-TG--T-TAA-GTG
gi|110017                     :        -T--CAGTG-A--C-A-A-A-CCTG--C-AAA---ATATT-GAACTG-TT-C-C-CA-GA-TATTCG--A-A-ATG-G-CTA-GGC-A---GA-AATGC--G-AAAGGT-TAT--GG-AT-CT-A--T----TTACGA---C-ATT-T--T--C--GTTCA-TTATT-G---AAA-AAATGA----CG-TGGTTTTTT-TGTTTTTTTTTG---------A-AAA-GG--T-GG-----C-G-C-A-G-AGA--GC-A-G--CGA-TAAAA-------------T---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CA----G-GAAAA-C-A-C-C------CACAGATCTA-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAA-CAG--T-C-GGA-AAA-A-C-A-CTGT-AA---------TA---T--G----G-G----CCA-TTAAT-T-AG-TG-TT-TAA-GTGA----TAGA-GAAGA
gi|110018                     :             AATG-T--A-A-ACA-CCTG--C-AAATGAAT-TTTGAAC-T-TT-C-A-AA-G--T-T-CG------ATA-G-C-A-GTCTA---GATATT-C--G-A--GGT-T-TCGGG-AT--T-A--T----TC--GA---C-AG
gi|110019                     :                                                                                                                                                                                                    -T-----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-T-AGA--GC-A-G--CGA-T-AAA------------AT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAACA-C-ACC-C------AC-------A-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGA-AAA-CAG--T-C-GGG-AAA-A-C-A-TTGT-AA---------TA---T--G----G-A----CCG-TTCAT-T-AG-TG-TT-CAA-GTGG----TATA-GAATATTGTT-
gi|110020                     :                                                                                                                                                                                                      -----TTT-CG---------G---------A-AAA-GG--T-GG-----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-T--CGA-TGAAA-------------T---TTTTTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAAAA-C-A-T-C------CA-------A-AA-AA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAA-CAG--T-C-GGG-
gi|110021                     :                                                                                                                                                                                                                                                  -----A-G-C-A-G-AGA--GC-A-G--CGA-TAAAC------------TT---TTTGTGT---AG-AT--A-T-CG----G-AAAAA-C-ACC-C------AC-------A-GA-GA-CC-CAT-GA-A-TT--C--CGT-AAG-CAG--T-CGGGG-AAA-A-C-A--TGTAAA---------TA---T--T----G-G----CCG-TTCAT-T-AG-TG--T-TAA-GCGA----TATA-GAAGATTTTT-GGACG
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blockSeqs                     :        C AT     A AC C T AA     AT T   TGAA A  T    T G  T C C  T GT   T  AC T G   C A T G TCT AGA  T   G CT G AA   G A CG  G  C  T AT TTAA   C  GTA T   C GC TG CG  T  A       GAT   C      TGAA  T GGTTT   G  GAAGAAAGGT          T   T  CT G  GCGGA T G A G C   CT  A G GA   A A   TGTGTGTTGGTCAT          ATA  T  TA T C  TGGT A     A T CCCACAGATCT         T  T  C  A   A  C T  CG CG   T   T   GC T T   C   C T A AT   A  TCCCGGGAT  TCT AT ATGT T ATAC   T     A C  C  T  G   A    GAAT    G     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . AA     .  .   A    .  .    T .  . . T  . T    .  .  . .   . . . . GC  .    .   . .  . .    . . G   .  .  A C  .      .  .   C   . .  .  .   .  .       AA    .      .     . .       .  TTTTTTTTTG          .   .  TA .  .     . . . . A   T   T . .    . A   ATAAG                   A    .  .  . .  CCG  .     . . CCCAAGAAAA          .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . G   .   . . . T    A  C          T   .  T    . .      G     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . AA     .  .   A    .  .    . .  . . .  . A    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       AA    .      .     . .       .  GA                  .   .  C  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   TGT                     .    .  .  . .  .    .     . . TCCCAAA             .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . T   .   . . . T    A  C          A   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . CA     .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       A     .      .     . .       .  CG                  .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   CT                      .    .  .  . .  .    .     . . CCAACA              .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   AT                      .    .  .  . .  .    .     . . CCCAC               .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . C    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   AT                      .    .  .  . .  .    .     . . CGTAA               .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   AT                      .    .  .  . .  .    .     . . CCCAA               .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   TT                      .    .  .  . .  .    .     . . CCCAA               .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   TT                      .    .  .  . .  .    .     . . CCCAC               .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     G    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . G      .  .   T    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  C                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   AT                      .    .  .  . .  .    .     . . CCCAC               .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . G      .  .   T    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   AT                      .    .  .  . .  .    .     . . CCCAC               .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . G   TC                      .    .  .  . .  .    .     . . CCCAC               .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   T    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . A   AT                      .    .  .  . .  .    .     . . CCCAC               .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . .   TT                      .    .  .  . .  .    .     . . CCAA                .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . C    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . .   A                       .    .  .  . .  .    .     . . CCAC                .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  A                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . .   T                       .    .  .  . .  .    .     . . CCCA                .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .   .  .       .     .      .     . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . .   T                       .    .  .  . .  .    .     . . CCAC                .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     T    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .   . .  .  .                                 . .       .  G                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . .   .                       .    .  .  . .  .    .     . . TCCA                .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     .    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . . .   .  .  . .  .      .  .   .                                               .       .  .                   .   .  .  .  .     . . . . .   .   . . .    . .   .                       .    .  .  . .  .    .     . . CAC                 .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . T    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     .    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . G      .  .   T    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .   . .  . .    . .                                                                                                                          .                                                            .    .  .  . .  .    .     . . TC                  .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . .    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     .    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   A    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .   . . . . .   .    .                                                                                                                                                                                                                              .     . . .                   .  .  .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . .    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .     .    .
blockSeqs                     :        . .      . .  . . A      .  .   .    .  .    . .  . . .  . .    .  .  . .                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .   .  . .  .  .    .   .   .  . .   .   . . . .    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .    .       .           
blockSeqs                     :        . .      . .  . . .      .  .   .    .  .    . .  . . .  . .    .  .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .  .    .   .   .  . .   .   . . . .    .  .          .   .  .    . .      .     . .  .  .  .   .                        
blockSeqs                     :                 . .  . . .      .  .   .    .  .    . .  . . .  . .    .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .   .   .  . .   .                                                                                               


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