lowQualScore                  :                                222222                                                111111111111111                                                                444444444444                                                            1111111111111111111     11111111111                                                                                                                           
lowQualScore                  :         22 4444444    7777777  111111  2   1  777777  2   11 2  555   5555 33 11 2   333333333333333  222     33 55      222 8888   3 1  22 1 1 1   3 6666666 222   222222222222 2222  55   222  3333 1 222  1   1 3  1 777   22  33   666  2222222222222222222  1  22222222222    3 22 1 1  1 11    22 22222  22222 33333 2     5 66666 444444 11 44444 11 8888 1 444444  1  2  2  1  11  1 2   1 22     
lowQualScore                  :         .. .......    .......  ......  .   .  ......  .   .. .  ...   .... .. .. .   ...............  ...     .. ..      ... ....   . .  .. . . .   . ....... ...   ............ ....  ..   ...  .... . ...  .   . .  . ...   ..  ..   ...  ...................  .  ...........    . .. . .  . ..    .. .....  ..... ..... .     . ..... ...... .. ..... .. .... . ......  .  .  .  .  ..  . .   . ..     
lowQualScore                  :         11 6666666    1111111  555555  8   4  000000  8   99 8  777   9999 33 99 8   888888888888888  555     99 44      555 3333   0 5  00 5 5 5   0 3333333 666   333333333333 4444  44   777  5555 5 777  6   6 2  6 222   22  88   000  4444444444444444444  6  00000000000    2 22 6 5  1 55    44 66666  66666 66666 1     1 00000 999999 44 99999 44 6666 1 555555  1  1  1  1  55  1 4   3 33     
consensus                     : TTAAGGGGG-A-------TATTA------AT----A-GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------N--AA---TTTTT--C--TCATTT---C----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---ATT----G-------AAG--TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AAG--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----T-G-A----AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
Reference ( gi|63372 )        : TTAAGGGGG-A-------TATTG------AT----T-GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------C--AA---TTTTT--C--TCATTT---C----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---ATT-T-AA-------AAG--TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AAG--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----T-G-A----AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63374                      : TTAAGGGGG-A-------TATTG------ATATCATAGA-CAA-GC---C--AA-AA---T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------C--AA---TTTTT--C--TCATTT--------TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---ATT----G-------AAG--TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AAG--TT--TCA---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----T-G-A----AT-TA-CC-T--CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63373                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------AT----A-GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------G--AA---TTTTT--C--TCATTT---C----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---ATT----G-------AAG--TG--TCT---TT-T--A-C---AC-TAT-G-TG-C---AAG--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GGTAA-T--C--A------G--T-----T--G----T-G-A----AT-TA-CC-TC-CG--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63376                      : TTAAGGGG--A-------TATTA------AT----A-GA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------G--AA---TTTTT-----TCATTT---C----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---ATT----G-------AAG--TG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AAG--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC----AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----T-G-A----AT-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTT-A--AAAAT
gi|63377                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------AT----A-GA-CAT-GC---C--AA-AA---T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------C--AA---TTTTT--C--TAATTC---C----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-ACTACTAGT---ATA-T-TG-------AAT--TG--TCC---TT-T--A-C---AT-TAT-G-TG-G---AAG--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----T-G-A----AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-TTT-A--AAAAT
gi|63378                      : TTAAGGGGA-A-------CATTG------AT----A-GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------C--AA---TTTTT--C--TCATTT---C----TTT-C-AC--A-T-A-TCT-A-------T---ATT----G-------AAG--TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-C---AAG--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----A-----A-GATAA-A--C--A------A--G-----A--C----C-G-A----AT-TG-CC-AC-CC--CT-A-CTT-A--ACAA
gi|63379                      : TTAAGGGG--A-------TATTA------AT----A-GA-CAA-GC---T--AA-AAA--A-TA---TCT----A--T--C-ATT------------G--AAATTTTTTC--C--TCATTT---C----TTT-C-TT--A-T-A-TCT-A-------T---AAT-T-GA-------AAG--TG--TCC----T-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G----AG--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------A--AAGC-T--A-G-AC-A--AATC--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----TGG-A----AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-C-T-A--AAAAT
gi|63380                      : TTAAGCGGA-A-------TATTG------AT----A-GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------C--AT---TTCTT--C--TCATTT---C----TTT-T-AT--A-T-A-TCT-A-------T---ATC-G-AA-------A----TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-C---AAG--AT--TCG---TA-------------------GT-GG--------G--AAGC-T-------------------------------------A-GATAA-T--T--A------G--G-----T--C----C-A-A----AT-TA-CC-TC-CC--TTAA-CTT-A--AAAAT
gi|63381                      : TTAAGGGGG-A-------TATTG------AT----A-GA-CAA-GC---C--AA-ACA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------C--AA----TTTT--C--TC-TTT---C----TTT-CAAT--A-T-A-TCT-A-------T---ATT-T-GA-------AA---TG--TCC---TTCC--A-C---AA-TA--G-TGCC---AAG---T--TCG---TC-------------------GT-TG--------GTAAAGA-T--A-G-AC-C--ATTA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--T--A------G--G-----T--C----C-G-A----AT-TA-CC-TC-TT--TT-A-ATA-A--GAAAT
gi|63382                      : TTAAGGGG--A-------TATTG------AT----A-GA-CAA-GT---C--AA-AAA--T-AAT--TCT----A--T--CAATT------------C---A---TTTTT--C--TCA-TT---C----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---AAT-T-GA-------AA---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-GTTG-C---AAG--TT--TTG---TC-------------------A--GG--------G--AAGG-T--A-GTAC-A--AATAATA-----AG-----G-----G-TATAA-T--T--A------G--G-----T--C----C-G-A-------TA-CC--C-CC--TT-A-CTG-A--
gi|63383                      : TTAAGGGGT-A-------TATTA------AT----A-GAACAA-GC---TT-AACAAA--TTAACGTTGT-------T--C-ATT------------G--AA---TTTTT--C--TCATTT---T----TTT-C-AT--A-T----CT-AA------T---ATT----G-------ATG--T---TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AAG--TT--TCA---TC-------------------AT-GG-----------AAGC-T--A-G-AT-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--AGGG---G--G-----C--T----T-T-A----AT-TA-CC-TC-CC---T-A-CTT-A--AAAA
gi|63384                      : TTAAGCAGG-A-------TATTG------AC----A-GA-CAA-GC---C--AA-AA---T-AA---TTC----A--T--C-ATT------------C--AA---TTTTC--C--TCATTC---C----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---ATT-G-AT-------A----TG--TCC---TT-T--A-C---AA-CAT-G-TG-C---ACG--TT--TTA---TA-------------------GA-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--
gi|63385                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------AT----A-GA-CAA-GCA--A--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------G--AA---TTTTT--TA-TCATTT---CCT--TTT-C-ATAAA-TAA-TCT-A-------T---ATT-T-TT-------GAG--TG--TCC---TT-TCAA-CCCAAA-GAT-G-TG-G---AAGTTTT--TCGT--TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-TTAG-G-AC-AATAATA--A-----GG-----A-----A-GAAAA-T--TCAA------G--G-----T--CGGG-G-G-A----AT-TA-CC-TC-CCCTTT-A-CTT-T--TAAAT
gi|63387                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------GT----A-GA-CAAAGC---T--AA-ATA--T-TA----------A--T--C-ATT------------GG-AA---ATTTT--C--TCATTT---C----TTTAC-AT--ACT-A-TCA-A-------T---A---------------AG--TA--TCC---TT-C--T-C---AAATAT-GATG-G---AAG--TTAATC----TC--------------------T-GG--------G--AAGCAT--A-G-AC-A--ATAA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----T-T-G----AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAA
gi|63388                      : TTAAGGGG--A-------TATTA------------T-AA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---TCT----AGTT--CGATT------------A--AA---TTTTC--C----ATTT---C----TTC-A-GT--A-T-A-TCTCA-------T---ATT----G-------AAG--TG--GTC---CT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G-------------CG---TC-------------------ATTGG--------A--AAGCCT--A-G-AC-A--A-TA--G-----CG-----G-----A-GATAA-T--C--A---------G-----T--C----T-G-AC---AT-TA-CC-TC-CC--TT-T-ATT-A--AAAAT
gi|63389                      : TTAAGG----A-------TAT-G------AT------AA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------G--AA----TTTT--C--TCATTT---C----TTT-C-AT--A-T-A-TC--A-------T---ATT---------------------------------------------------G---AAG--TT--T-----TC-------------------A------------G--AA-C-T--ATG-AC-A--AATA--A-----GG-------------AATAA-T--C--A---------G-----T--C----T-G-A----AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-C-T-A--AAAAT
gi|63375                      : TTAAGGGGGGA-------TATTG------ATATCATAGA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------C--AA---TTTTT--C--TCATTT---A----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---ATT----G-------AAG--TG--TCC---T
gi|63390                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------GT----A-GA-CAA-GT---C--CA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------C--AA---TGTTT--C--TCATTT---C----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---AT
gi|63386                      : TTAAGGGGG-AAAAAAATTAT-A------AT----A-GA-CAA-GCTTCC--TA-AAA--T-AAAT-CCT----A--T--C-ATTGAATTTTTCTTTC--AA---T-TTT--C--T--TTT---C----T-----AT--A-T-A-TCT-A-------TCTAATT-CGGA-------AAGGTTG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-A-GG-G---AGT--TT--TCGGATCC-------------------AT-GG--------GA-AAGC-T--A-G-ACAA--AATAC-A-----GG-----GATCGCA-AATAATT--C--A------G--GGTATTT--CCCCTT-GAA----AT-TA-CCTTC-CC--TT-A-CTT-AACAAAAT
gi|63391                      : TTAAGGGTG-A-------CATTG------AT----A-GA-CAA-GC---C--AA-AAA--C-AA---TTG----A--T--C-ATT------------G--AA---TTTTC--C--TTATTA---C----TTT-C-AT--T-C-A-TTT-A-------T---ATC-G-AA-------A----TA--TCC---TT-T--A-T---A
gi|63393                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------AT----A-GA-CAA-GC---T--CA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------G--AA---TTTTT--C--TCATTT---
gi|63394                      : TTAAGTGGG-G-------TATTT------AT----A-GA-CAT-ACTC-C--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------C--AA---TTTTTTCC--TCTTTTTTCT----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------T---AC-------------AGG--TGACTCTCGATT-T--ATC---CC-TGT-C-CG-A---AAG---T--TCA---T--------------------AT-GG--------G--A--C-C--A-A-GT-A--CATA--AACTTCGGAGTTCG-----A-GAGAA-T--C--GAAGGTCG--G-----T--C----T-T-A----AT-T--TC-TC-CC--
gi|63395                      : TTAAGGGGG-A-------TATTACCGGTAAT----A-GA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-A
gi|63396                      :   AAGGGGG-A--------ATTA------AT----A-G--CAA-GC---T--AA-AAT--T-AA----CT----A--T--C---T------------G--AA---TTTCT--C---CATTT---C----TTT-C-AT--A-T-ATTCT-A-------T---
gi|63398                      :    AGGGGG-A-------TATT-------AT----T-AG-AAA-GC---T--AT-AAA--T-AA---GCTGCTTA--T--C-GTT------------C--GA---TTCTT--CACTCATTT---TCTTTTTT-C-AT--------TTT-A-------C---ATTCT-AATTATAGTGAG--TGA-TCT---CT-G--A-C---AA-TAT-G-TG-GTGCAAG--AT--TAG---TC-------------------AT-AGTCAATGTGG--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-------GAGAA-T--CATA------G--G-----T--TCGTGT-G-A----AG-T--TC-TT-CT--TT-ACCTT-A--AAAA
gi|63397                      :    AGGGGG-A-------TATT-------AT----T-AG-AAA-GC---T--AT-AAA--T-AA---GCTGCTTA--T--C-GTT------------C--GA---TTCTT--CACTCATTT---TCTTTTTT-C-AT--------TTT-A-------C---ATTCT-AATTATAGTGAG--TGA-TCT---CT-G--A-C---AA-TAT-G-TG-GTGCAAG--AT--TAG---TC-------------------AT-AGTCAATGTGG--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-------GAGAA-T--CATA------G--G-----T--TCGTGT-G-A----AG-T--TC-TT-CT--TT-ACCTT-A--AAAA
gi|63399                      :      GGGG-A-------TATTA------AT----A-GAACAA-GC---TTAAACAAA--TTAA---TTT----T--T--C-ATT------------G--AA---TTTTT--C--TCATTT---T----TTT-C-AT--A---A-TCTTA-------T---ATT----G-------ATG--T---TCC---TT-C--A-C---A--TAT-G-TG-G---TAG--TT--TCAA--TC-------------------AT-GG-----------AAGC-T--A-G-AT-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----TGGC----T-GTA----AT-TA-CCTTC-CC--TT-A-CTT-A--AAAA
gi|63400                      :       GGA-A-------TATAA------AA----TAGA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---TCT----A--T--C-ATT------------G--AA---TTTTT--C--TCATTT---C----TTTTC-AT--A-T-A-TCT-A-------T---AT-----G-------AAG--TG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AAG--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----GA----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----T-G-A----AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63401                      :       GGG-A-------TATTG-------T----T--A-CAC-AT---T--AA-AAAATT-AA---TCT----AC-T--C-ATG------------TGGAA---TTTTTTCC--TCATTT---C----TTT-C-TT--A-T-A-TCT-A-------T---ATT---GA-------AAG--TG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT---TG-GA--AAG--TTA-TCG---TC-------------------AT-GG--------A--AAGC-T--A-G-AC-A--AA-A--T-----CG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----T-G-A----AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63392                      :                                     -GA-CAA-GC---C--AA-AA---T-AA---TCT----A--CTCC-ATT------------G--AA---TTTTC--C--TCATTT---C----TTT-C-AT--A-T-A-TCT-A-------A---ATT-T-GA-------AAA--T-----C---TA-G--A-C---AA-AATAA-TT-G---AAT--TT--TCC---TCATTTCTTTCATATATCTAAAT-TT--------G--AAAT-T--A-G-AC-A--AA-A--A-----GG-----G-----AGGATAA-T--T--C------G--G-----T--C----T-G-A----ATATA-CA-CC-CC--
gi|63402                      :                                                                                                                                                 ttaagggggatattaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AAG--TT--TCA---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------G--G-----T--C----T-G-A----AT-TA-CC-T--CC--TT-A--TT-A--AAAAT
gi|63403                      :                                                                                                                                                                                                  -T--A-T---AA-TAT-G-TA-C---AAA--TT--TCG---TC-------------------AT-GA--------A--AAGC-T--A-G-AC-G--AATA--A-----GG-----G-----C-GATAA-T--T--C------G--G-----C--C----T-G-A----AT-TATCC-TTGTC--TT-A-C
gi|63404                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           -AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T--C--A------A--G-----T--C----A-G-A----AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTTCA--AAAAT
gi|63374                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              -A--AGTA--A-----GG-----------A-GGTAA-TT-C--A------G--A-----C--C----T-G-A-----T-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTT-
gi|63373                      :                                                                                                                                                                ttaagggggatattgatatcatagacaagccaaaataatctatcattcaatttttctcattttttcatatatctatattgaagtgtcctttacaatatgtggaagtttcatcatgggaagctagac-A--AGTA--A-----CG-----G-----A-GGTAA-TT-C--A------C--A-----A--C----T-G-A-----T-TA-CC-TC-CC--TT-A-TTT-aaaaat
gi|63376                      :                                                                                                                                                                   ttaagggggatattaatagacaagccaaaaataatctatcattgaatttttctcatttctttcatatatctatattgaagtgtcttttacactatgtgcaagtttcgtcatgggaagctagac-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAATT--C--A------G--A-----C--C----T-G------AT-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTaaaaat
gi|63377                      :                                                                                                                                                                     ttaaggggatattaatagacaagctaaaaataatctatcattgaattttttcatttctttcatatatctatattgaagtgtccttcacaatatgtggaagtttcgtcatgggaagctagac-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GGTAATT--C--A------G--A-----C--C----T-G------AT-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTT-aaaaat
gi|63400                      :                                                                                                                                                           ttaagggggatattaatagacatgccaaaataatctatcattcaatttttctaattcctttcatatatctactactagtatattgaattgtcctttacattatgtggaagtttcgtcatgggaagctagac-A--AGTA--A-----GG-----G-----A-GGTAATT--C--A------G--A-----C--C----T-G------AT-TATCT-TC-CC--TT-A-TTT-aaaaat
gi|63401                      :                                                                                                                                                                        ggaatataaaatagacaagctaaaaataatctatcattgaatttttctcatttcttttcatatatctatatgaagtgtccttcacaatatgtggaagtttcgtcatgggaagctagac-A--AGTA--A-----GG-----G-----A-GGTAATT--C--A------G--A-----C--C----T-G------AT-TA-TC-TC-Caaaaat
gi|63399                      :                                                                                                                                                            gggatattgttacacattaaaaaattaatctactcatgtggaattttttcctcatttctttcttatatctatattgaaagtgtccttcacaatattggaaagttatcgtcatggaaagctagacaaaatc-A--AGTA--A-----GG-----G-----AAGGTAA-TTAC--A------GCCA-----C--C----T-G-A-----T-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTT-A--aaaaat
gi|63387                      :                                                                                                                                                                      ggggatattaatagaacaagcttaaacaaattaatttttcattgaatttttctcatttttttcataatcttatattgatgttccttcacatatgtggtagtttcaatcatggaagctaga-A--AGTA--A-----GG-----G-----A-GGTAA-T--CA-A------G--A-----C--C----T-G------AT-TA-TC-TC-CC--TT-aaaaa
gi|63404                      :                                                                                                                                                               ttaagggggatattagtagacaaagctaaatattaatcattggaaattttctcatttctttacatactatcaataagtatccttctcaaatatgatggaagttaatctctgggaagcatagacaata-A--AGTA--A-----GG-----G-----A-GGTAA-T---------------------T--C----T-G-ACTTGAT-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTT-aaaaa
gi|63379                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ac--AGTA--A-----GG-----G-----A-GGTAA-TTCC--A------G--A-----C--C----T-G------AT-TA-TC-TC-CC--TG-A-TTT-caaaaat
gi|63402                      :                                                                                                                                                                   ttaaggggatattaatagacaagctaaaaaatatctatcattgaaattttttcctcatttctttcttatatctataattgaaagtgtcctcacaatatgtggagtttcgtcatggaaagctagac--AATA--A-----GG-----------A-GGTAA-TT-C--A------G--A-----C--C----T-G-A-----T-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTT-aaaaat
gi|63381                      :                                                                                                                                                                                                                                                             ctttacaatatgtggaagtttcatcatgggaagctagacTA--A-----AA-----G-----A-GGTAA-T--T--C------G--G-----A--C----C-T-A----AT-TA-TC-TC-CC--TT-A-aaaaat
gi|63383                      :                                                                                                                                                                      ttaagggggatattgatagacaagccaaacataatctatcattcaattttctctttctttcaatatatctatatttgaaatgtccttccacaatagtgccaagttcgtcgttggtaaagatagaccat--A-----GG-----G-----A-GGTAA-T--T--A------A--AGCCC-C--C----T-G-A-----T-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTT-A--ataagaaat

lowQualScore                  :                        11111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                            1111111111111111111     11111111                                                                            1111                                       
lowQualScore                  :          1 4444444     44444444444444444444444444444444  66666  2   1  666666  2   11 2  444 1  5555 33 11 1  1 33  222     33 77   11   222 9999   33 1  777 1 1 1  77777 2 777777777 555 444  66 1  1 222  55   222  3333 1 222  1   1 3  1 555  1 22  33   555  1111111111111111111  1  11111111 33    3 22 1 1  1 22    33 33333  33333 55555 1     1  66 777777  33333 22 2222 1 3 1  1  1  3  1  22  1 3   1 22     
lowQualScore                  :          . .......     ................................  .....  .   .  ......  .   .. .  ... .  .... .. .. .  . ..  ...     .. ..   ..   ... ....   .. .  ... . . .  ..... . ......... ... ...  .. .  . ...  ..   ...  .... . ...  .   . .  . ...  . ..  ..   ...  ...................  .  ........ ..    . .. . .  . ..    .. .....  ..... ..... .     .  .. ......  ..... .. .... . . .  .  .  .  .  ..  . .   . ..     
lowQualScore                  :          3 3333333     77777777777777777777777777777777  77777  7   3  444444  7   88 7  222 3  7777 22 88 3  4 88  444     88 11   99   444 5555   44 4  000 4 4 4  11111 9 111111111 444 111  33 5  5 777  22   666  1111 5 666  5   5 1  5 444  5 11  77   888  9999999999999999999  5  22222222 77    1 11 5 5  5 00    55 77777  77777 22222 5     5  33 111111  88888 11 5555 5 1 5  5  5  1  5  11  7 3   7 44     
consensus                     : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
Reference ( family-577 )      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TN-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63372                      : TTAAGGGGG-A-------TATTG------A-------------------------TT-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TTTAA-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63373                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCT---TT-T--A-C---AC-TAT-G-TG-C---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GGTAA-TC--A------GT-----T--G----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CG--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63374                      : TTAAGGGGG-A-------TATTG------A-------------------------TATCATAGA-CAA-GC---C--AA-AA---T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TCA--TTT--------TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCA---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-T--CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63375                      : TTAAGGGGGGA-------TATTG------A-------------------------TATCATAGA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---A----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---T
gi|63376                      : TTAAGGGG--A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT-----TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC----AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTT-A--AAAAT
gi|63377                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAT-GC---C--AA-AA---T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TAA--TTC---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-ACTACTAGTAT---A---TT--G-AA-T---TG--TCC---TT-T--A-C---AT-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-TTT-A--AAAAT
gi|63378                      : TTAAGGGGA-A-------CATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AC---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-C---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----A-----A-GATAA-AC--A------AG-----A--C----C-G-A-AT-TG-CC-AC-CC--CT-A-CTT-A--ACAA
gi|63379                      : TTAAGGGG--A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--AA-AAA--A-TA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AAATTTTTTC--C--TCA--TTT---C----TTT--C-TT---A-T-A-TC-----T-A---------TA--A---TT--GAAA-G---TG--TCC----T-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G----A-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------A--AAGC-T--A-G-AC-A--AATC--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----TGG-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-C-T-A--AAAAT
gi|63380                      : TTAAGCGGA-A-------TATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AT---TTCTT--C--TCA--TTT---C----TTT--T-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TC--G-AA-A---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-C---AA-G--AT--TCG---TA-------------------GT-GG--------G--AAGC-T-------------------------------------A-GATAA-TT--A------GG-----T--C----C-A-A-AT-TA-CC-TC-CC--TTAA-CTT-A--AAAAT
gi|63381                      : TTAAGGGGG-A-------TATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-ACA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA----TTTT--C--TC---TTT---C----TTT--CAAT---A-T-A-TC-----T-A---------T---AT--TT--G-AA-A---TG--TCC---TTCC--A-C---AA-TA--G-TGCC---AA-G---T--TCG---TC-------------------GT-TG--------GTAAAGA-T--A-G-AC-C--ATTA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TT--A------GG-----T--C----C-G-A-AT-TA-CC-TC-TT--TT-A-ATA-A--GAAAT
gi|63382                      : TTAAGGGG--A-------TATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GT---C--AA-AAA--T-AA---TTCT----A--T--C-AA-TT-CA---TTTTT--C--TCA--TT----C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------TA--A---TT--G-AA-A---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-GTTG-C---AA-G--TT--TTG---TC-------------------A--GG--------G--AAGG-T--A-GTAC-A--AATAATA-----AG-----G-----G-TATAA-TT--A------GG-----T--C----C-G-A----TA-CC--C-CC--TT-A-CTG-A--
gi|63383                      : TTAAGGGGT-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GAACAA-GC---TT-AACAAA--TTAACGTT-GT-------T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---T----TTT--C-AT---A-T----C-----T-AA--------T---A---TT--G-AT-G---T---TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCA---TC-------------------AT-GG-----------AAGC-T--A-G-AT-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--AGGG---GG-----C--T----T-T-A-AT-TA-CC-TC-CC---T-A-CTT-A--AAAA
gi|63384                      : TTAAGCAGG-A-------TATTG------A-------------------------CA-----GA-CAA-GC---C--AA-AA---T-AA---T-TC----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTC--C--TCA--TTC---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AT-A---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-CAT-G-TG-C---AC-G--TT--TTA---TA-------------------GA-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T
gi|63385                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GCA--A--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--TA-TCA--TTT---CCT--TTT--C-ATAA-A-TAA-TC-----T-A---------T---ATTTTT--G--A-G---TG--TCC---TT-TCAA-CCCAAA-GAT-G-TG-G---AA-GTTTT--TCGT--TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-TTAG-G-AC-AATAATA--A-----GG-----A-----A-GAAAA-TTCAA------GG-----T--CGGG-G-G-A-AT-TA-CC-TC-CCCTTT-A-CTT-T--TAAAT
gi|63386                      : TTAAGGGGG-AAAAAAATTAT-A------A-------------------------TA-----GA-CAA-GCTTCC--TA-AAA--T-AAAT-C-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--CTTTCAATTTT---C----TTTTCT-AT---A-T-A-TC-----T-A---------TCTAA---TTCGG-AA-AGGTTG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-A-GG-G---AG-T--TT--TCGGATCC-------------------AT-GG--------GA-AAGC-T--A-G-ACAA--AATAC-A-----GG-----GATCGCA-AATAATTC--A------GGGTATTT--CCCCTT-GAA-AT-TA-CCTTC-CC--TT-A-CTT-AACAAAAT
gi|63387                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------G-------------------------TA-----GA-CAAAGC---T--AA-ATA--T-TA-----------A--T--C-AT-TGGAA---ATTTT--C--TCA--TTT---C----TTTA-C-AT---ACT-A-TC-----A-A---------T---A----------A-G---TA--TCC---TT-C--T-C---AAATAT-GATG-G---AA-G--TTAATC----TC--------------------T-GG--------G--AAGCAT--A-G-AC-A--ATAA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-T-G-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAA
gi|63388                      : TTAAGGGG--A-------TATTA--------------------------------TA------A-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----AGTT--CGAT-TA-AA---TTTTC--C----A--TTT---C----TTC--A-GT---A-T-A-TC-----TCA---------T---A---TT--G-AA-G---TG--GTC---CT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G--------------CG---TC-------------------ATTGG--------A--AAGCCT--A-G-AC-A--A-TA--G-----CG-----G-----A-GATAA-TC--A-------G-----T--C----T-G-ACAT-TA-CC-TC-CC--TT-T-ATT-A--AAAAT
gi|63389                      : TTAAGG----A-------TAT-G------A-------------------------TA------A-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA----TTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-------A---------T---A---TT--G-AA-G---T-------------------------------------------TT--TC-----------------------------A--------G--AA-C-T--ATG-AC-A--AATA--A-----GG-------------AATAA-TC--A-------G-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-C-T-A--AAAAT
gi|63390                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------G-------------------------TA-----GA-CAA-GT---C--CA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TGTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---T
gi|63391                      : TTAAGGGTG-A-------CATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--C-AA---T-TG----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTC--C--TTA--TTA---C----TTT--C-AT---T-C-A-TT-----T-A---------T---A---TC--G-AA-A---TA--TCC---TT-T--A-T---A
gi|63392                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-----GA-CAA-GC---C--AA-AA---T-AA---T-CT----A--CTCC-AT-TG-AA---TTTTC--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------A---A---TTTGA-AA-A---T-----C---TA-G--A-C---AA-AATAA-TT-G---AA-T--TT--TCC---TCATTTCTTTCATATATCTAAAT-TT--------G--AAAT-T--A-G-AC-A--AA-A--A-----GG-----G-----AGGATAA-TT--C------GG-----T--C----T-G-A-ATATA-CA-CC-CC--
gi|63393                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--CA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---
gi|63394                      : TTAAGTGGG-G-------TATTT------A-------------------------TA-----GA-CAT-ACTC-C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTTTCC--TCT--TTTTTCT----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---C-----AG-G---TGACTCTCGATT-T--ATC---CC-TGT-C-CG-A---AA-G---T--TCA---T--------------------AT-GG--------G--A--C-C--A-A-GT-A--CATA--AACTTCGGAGTTCG-----A-GAGAA-TC--GAAGGTCGG-----T--C----T-T-A-AT-T--TC-TC-CC--
gi|63395                      : TTAAGGGGG-A-------TATTACCGGTAA-------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-A
gi|63396                      :   AAGGGGG-A--------ATTA------A-------------------------TA-----G--CAA-GC---T--AA-AAT--T-AA-----CT----A--T--C----TG-AA---TTTCT--C---CA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-ATTC-----T-A---------T---
gi|63397                      :    AGGGGG-A-------TATTA------T-------------------------TA-----GA--AA-GC---T--AT-AAA--T-AA---G-CTGCTTA--T--C-GT-TC-GA---TTCTT--CACTCA--TTT---TCTTTTTT--C-ATTTTA-C-A-TTCTAATT-A---------T---A---GT--G-A--G---TGA-TCT---CT-G--A-C---AA-TAT-G-TG-GTGCAA-G--AT--TAG---TC-------------------AT-AGTCAATGTGG--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-------GAGAA-TCATA------GG-----T--TCGTGT-G-A-AG-T--TC-TT-CT--TT-ACCTT-A--AAAA
gi|63398                      :    AGGGGG-A-------TATTA------T-------------------------TA-----GA--AA-GC---T--AT-AAA--T-AA---G-CTGCTTA--T--C-GT-TC-GA---TTCTT--CACTCA--TTT---TCTTTTTT--C-ATTTTA-C-A-TTCTAATT-A---------T---A---GT--G-A--G---TGA-TCT---CT-G--A-C---AA-TAT-G-TG-GTGCAA-G--AT--TAG---TC-------------------AT-AGTCAATGTGG--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-------GAGAA-TCATA------GG-----T--TCGTGT-G-A-AG-T--TC-TT-CT--TT-ACCTT-A--AAAA
gi|63399                      :      GGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GAACAA-GC---TTAAACAAA--TTAA---T-TT----T--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---T----TTT--C-AT---A---A-TC-----TTA---------T---A---TT--G-AT-G---T---TCC---TT-C--A-C---A--TAT-G-TG-G---TA-G--TT--TCAA--TC-------------------AT-GG-----------AAGC-T--A-G-AT-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----TGGC----T-GTA-AT-TA-CCTTC-CC--TT-A-CTT-A--AAAA
gi|63400                      :       GGA-A-------TATAA------AA------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---CT---TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A----T--G-AA-G---TG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----GA----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63401                      :       GGG-A-------TATTG------T-------------------------TA-----CA-CA---T---T--AA-AAAATT-AA---T-CT----AC-T--C-ATGTGGAA---TTTTTTCC--TCA--TTT---C----TTT--C-TT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AAAG---TG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT---TG-G---AAAG--TTA-TCG---TC-------------------AT-GG--------A--AAGC-T--A-G-AC-A--AA-A--T-----CG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63402                      :                                                                                                                                                                                                                  C---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCA---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-T--CC--TT-A--TT-A--AAAAT
gi|63403                      :                                                                                                                                                                                                                        -T--A-T---AA-TAT-G-TA-C---AA-A--TT--TCG---TC-------------------AT-GA--------A--AAGC-T--A-G-AC-G--AATA--A-----GG-----G-----C-GATAA-TT--C------GG-----C--C----T-G-A-AT-TATCC-TTGTC--TT-A-C
gi|63404                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------AG-----T--C----A-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTTCA--AAAAT

lowQualScore                  :                        11111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                            1111111111111111111     11111111                                                                            1111                                       
lowQualScore                  :          1 4444444     44444444444444444444444444444444  66666  2   1  666666  2   11 2  444 1  5555 33 11 1  1 44  222     33 77   11   222 9999   33 1  777 1 1 1  77777 2 777777777 555 444  66 1  1 222  55   222  3333 1 222  1   1 3  1 555  1 22  33   555  1111111111111111111  1  11111111 33    3 22 1 1  1 22    33 33333  33333 55555 1     1  66 777777  33333 22 2222 1 3 1  1  1  3  1  22  1 3   1 22     
lowQualScore                  :          . .......     ................................  .....  .   .  ......  .   .. .  ... .  .... .. .. .  . ..  ...     .. ..   ..   ... ....   .. .  ... . . .  ..... . ......... ... ...  .. .  . ...  ..   ...  .... . ...  .   . .  . ...  . ..  ..   ...  ...................  .  ........ ..    . .. . .  . ..    .. .....  ..... ..... .     .  .. ......  ..... .. .... . . .  .  .  .  .  ..  . .   . ..     
lowQualScore                  :          3 3333333     77777777777777777777777777777777  77777  7   3  444444  7   88 7  222 3  7777 22 88 3  4 55  444     88 11   99   444 5555   44 4  000 4 4 4  11111 9 111111111 444 111  33 5  5 777  22   666  1111 5 666  5   5 1  5 444  5 11  77   888  9999999999999999999  5  22222222 77    1 11 5 5  5 00    55 77777  77777 22222 5     5  33 111111  88888 11 5555 5 1 5  5  5  1  5  11  7 3   7 44     
consensus                     : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
Reference ( family-577 )      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63372                      : TTAAGGGGG-A-------TATTG------A-------------------------TT-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TTTAA-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63373                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCT---TT-T--A-C---AC-TAT-G-TG-C---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GGTAA-TC--A------GT-----T--G----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CG--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63374                      : TTAAGGGGG-A-------TATTG------A-------------------------TATCATAGA-CAA-GC---C--AA-AA---T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TCA--TTT--------TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCA---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-T--CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63375                      : TTAAGGGGGGA-------TATTG------A-------------------------TATCATAGA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---A----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---T
gi|63376                      : TTAAGGGG--A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT-----TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC----AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-TC-TC-CC--TT-A-TTT-A--AAAAT
gi|63377                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAT-GC---C--AA-AA---T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TAA--TTC---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-ACTACTAGTAT---A---TT--G-AA-T---TG--TCC---TT-T--A-C---AT-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-TTT-A--AAAAT
gi|63378                      : TTAAGGGGA-A-------CATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AC---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-C---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----A-----A-GATAA-AC--A------AG-----A--C----C-G-A-AT-TG-CC-AC-CC--CT-A-CTT-A--ACAA
gi|63379                      : TTAAGGGG--A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--AA-AAA--A-TA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AAATTTTTTC--C--TCA--TTT---C----TTT--C-TT---A-T-A-TC-----T-A---------TA--A---TT--GAAA-G---TG--TCC----T-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G----A-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------A--AAGC-T--A-G-AC-A--AATC--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----TGG-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-C-T-A--AAAAT
gi|63380                      : TTAAGCGGA-A-------TATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AT---TTCTT--C--TCA--TTT---C----TTT--T-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TC--G-AA-A---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-C---AA-G--AT--TCG---TA-------------------GT-GG--------G--AAGC-T-------------------------------------A-GATAA-TT--A------GG-----T--C----C-A-A-AT-TA-CC-TC-CC--TTAA-CTT-A--AAAAT
gi|63381                      : TTAAGGGGG-A-------TATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-ACA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA----TTTT--C--TC---TTT---C----TTT--CAAT---A-T-A-TC-----T-A---------T---AT--TT--G-AA-A---TG--TCC---TTCC--A-C---AA-TA--G-TGCC---AA-G---T--TCG---TC-------------------GT-TG--------GTAAAGA-T--A-G-AC-C--ATTA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TT--A------GG-----T--C----C-G-A-AT-TA-CC-TC-TT--TT-A-ATA-A--GAAAT
gi|63382                      : TTAAGGGG--A-------TATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GT---C--AA-AAA--T-AA---TTCT----A--T--C-AA-TT-CA---TTTTT--C--TCA--TT----C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------TA--A---TT--G-AA-A---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-GTTG-C---AA-G--TT--TTG---TC-------------------A--GG--------G--AAGG-T--A-GTAC-A--AATAATA-----AG-----G-----G-TATAA-TT--A------GG-----T--C----C-G-A----TA-CC--C-CC--TT-A-CTG-A--
gi|63383                      : TTAAGGGGT-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GAACAA-GC---TT-AACAAA--TTAACGTT-GT-------T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---T----TTT--C-AT---A-T----C-----T-AA--------T---A---TT--G-AT-G---T---TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCA---TC-------------------AT-GG-----------AAGC-T--A-G-AT-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--AGGG---GG-----C--T----T-T-A-AT-TA-CC-TC-CC---T-A-CTT-A--AAAA
gi|63384                      : TTAAGCAGG-A-------TATTG------A-------------------------CA-----GA-CAA-GC---C--AA-AA---T-AA---T-TC----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTC--C--TCA--TTC---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AT-A---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-CAT-G-TG-C---AC-G--TT--TTA---TA-------------------GA-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-T
gi|63385                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GCA--A--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--TA-TCA--TTT---CCT--TTT--C-ATAA-A-TAA-TC-----T-A---------T---ATTTTT--G--A-G---TG--TCC---TT-TCAA-CCCAAA-GAT-G-TG-G---AA-GTTTT--TCGT--TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-TTAG-G-AC-AATAATA--A-----GG-----A-----A-GAAAA-TTCAA------GG-----T--CGGG-G-G-A-AT-TA-CC-TC-CCCTTT-A-CTT-T--TAAAT
gi|63386                      : TTAAGGGGG-AAAAAAATTAT-A------A-------------------------TA-----GA-CAA-GCTTCC--TA-AAA--T-AAAT-C-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--CTTTCAATTTT---C----TTTTCT-AT---A-T-A-TC-----T-A---------TCTAA---TTCGG-AA-AGGTTG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-A-GG-G---AG-T--TT--TCGGATCC-------------------AT-GG--------GA-AAGC-T--A-G-ACAA--AATAC-A-----GG-----GATCGCA-AATAATTC--A------GGGTATTT--CCCCTT-GAA-AT-TA-CCTTC-CC--TT-A-CTT-AACAAAAT
gi|63387                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------G-------------------------TA-----GA-CAAAGC---T--AA-ATA--T-TA-----------A--T--C-AT-TGGAA---ATTTT--C--TCA--TTT---C----TTTA-C-AT---ACT-A-TC-----A-A---------T---A----------A-G---TA--TCC---TT-C--T-C---AAATAT-GATG-G---AA-G--TTAATC----TC--------------------T-GG--------G--AAGCAT--A-G-AC-A--ATAA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-T-G-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAA
gi|63388                      : TTAAGGGG--A-------TATTA--------------------------------TA------A-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----AGTT--CGAT-TA-AA---TTTTC--C----A--TTT---C----TTC--A-GT---A-T-A-TC-----TCA---------T---A---TT--G-AA-G---TG--GTC---CT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G--------------CG---TC-------------------ATTGG--------A--AAGCCT--A-G-AC-A--A-TA--G-----CG-----G-----A-GATAA-TC--A-------G-----T--C----T-G-ACAT-TA-CC-TC-CC--TT-T-ATT-A--AAAAT
gi|63389                      : TTAAGG----A-------TAT-G------A-------------------------TA------A-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA----TTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-------A---------T---A---TT--G-AA-G---T-------------------------------------------TT--TC-----------------------------A--------G--AA-C-T--ATG-AC-A--AATA--A-----GG-------------AATAA-TC--A-------G-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-C-T-A--AAAAT
gi|63390                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------G-------------------------TA-----GA-CAA-GT---C--CA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TGTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---T
gi|63391                      : TTAAGGGTG-A-------CATTG------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--C-AA---T-TG----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTC--C--TTA--TTA---C----TTT--C-AT---T-C-A-TT-----T-A---------T---A---TC--G-AA-A---TA--TCC---TT-T--A-T---A
gi|63392                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-----GA-CAA-GC---C--AA-AA---T-AA---T-CT----A--CTCC-AT-TG-AA---TTTTC--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------A---A---TTTGA-AA-A---T-----C---TA-G--A-C---AA-AATAA-TT-G---AA-T--TT--TCC---TCATTTCTTTCATATATCTAAAT-TT--------G--AAAT-T--A-G-AC-A--AA-A--A-----GG-----G-----AGGATAA-TT--C------GG-----T--C----T-G-A-ATATA-CA-CC-CC--
gi|63393                      : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--CA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---
gi|63394                      : TTAAGTGGG-G-------TATTT------A-------------------------TA-----GA-CAT-ACTC-C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TC-AA---TTTTTTCC--TCT--TTTTTCT----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---C-----AG-G---TGACTCTCGATT-T--ATC---CC-TGT-C-CG-A---AA-G---T--TCA---T--------------------AT-GG--------G--A--C-C--A-A-GT-A--CATA--AACTTCGGAGTTCG-----A-GAGAA-TC--GAAGGTCGG-----T--C----T-T-A-AT-T--TC-TC-CC--
gi|63395                      : TTAAGGGGG-A-------TATTACCGGTAA-------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-A
gi|63396                      :   AAGGGGG-A--------ATTA------A-------------------------TA-----G--CAA-GC---T--AA-AAT--T-AA-----CT----A--T--C----TG-AA---TTTCT--C---CA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-ATTC-----T-A---------T---
gi|63397                      :    AGGGGG-A-------TATTA------T-------------------------TA-----GA--AA-GC---T--AT-AAA--T-AA---G-CTGCTTA--T--C-GT-TC-GA---TTCTT--CACTCA--TTT---TCTTTTTT--C-ATTTTA-C-A-TTCTAATT-A---------T---A---GT--G-A--G---TGA-TCT---CT-G--A-C---AA-TAT-G-TG-GTGCAA-G--AT--TAG---TC-------------------AT-AGTCAATGTGG--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-------GAGAA-TCATA------GG-----T--TCGTGT-G-A-AG-T--TC-TT-CT--TT-ACCTT-A--AAAA
gi|63398                      :    AGGGGG-A-------TATTA------T-------------------------TA-----GA--AA-GC---T--AT-AAA--T-AA---G-CTGCTTA--T--C-GT-TC-GA---TTCTT--CACTCA--TTT---TCTTTTTT--C-ATTTTA-C-A-TTCTAATT-A---------T---A---GT--G-A--G---TGA-TCT---CT-G--A-C---AA-TAT-G-TG-GTGCAA-G--AT--TAG---TC-------------------AT-AGTCAATGTGG--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-------GAGAA-TCATA------GG-----T--TCGTGT-G-A-AG-T--TC-TT-CT--TT-ACCTT-A--AAAA
gi|63399                      :      GGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GAACAA-GC---TTAAACAAA--TTAA---T-TT----T--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---T----TTT--C-AT---A---A-TC-----TTA---------T---A---TT--G-AT-G---T---TCC---TT-C--A-C---A--TAT-G-TG-G---TA-G--TT--TCAA--TC-------------------AT-GG-----------AAGC-T--A-G-AT-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----TGGC----T-GTA-AT-TA-CCTTC-CC--TT-A-CTT-A--AAAA
gi|63400                      :       GGA-A-------TATAA------AA------------------------TA-----GA-CAA-GC---T--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---CT---TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A----T--G-AA-G---TG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----GA----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63401                      :       GGG-A-------TATTG------T-------------------------TA-----CA-CA---T---T--AA-AAAATT-AA---T-CT----AC-T--C-ATGTGGAA---TTTTTTCC--TCA--TTT---C----TTT--C-TT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AAAG---TG--TCC---TT-C--A-C---AA-TAT---TG-G---AAAG--TTA-TCG---TC-------------------AT-GG--------A--AAGC-T--A-G-AC-A--AA-A--T-----CG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
gi|63402                      :                                                                                                                                                                                                                  C---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCA---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-T--CC--TT-A--TT-A--AAAAT
gi|63403                      :                                                                                                                                                                                                                        -T--A-T---AA-TAT-G-TA-C---AA-A--TT--TCG---TC-------------------AT-GA--------A--AAGC-T--A-G-AC-G--AATA--A-----GG-----G-----C-GATAA-TT--C------GG-----C--C----T-G-A-AT-TATCC-TTGTC--TT-A-C
gi|63404                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------AG-----T--C----A-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTTCA--AAAAT


blockSeqs                     :          G AAAAAAT     ACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN        TCATA  A   A  TTCC    C   AT T  CGT T  GCTT GT TC G  G GG  ATT     TC TT   AT   TTC CTTT   TC A  TTT C A T  CTAAT C CTACTAGTA CTA TTT  CG A  A GGT  AC   CGA  TCA  T CCA  A   A T  C TGC  A TT  AA   GAT  ATTTCTTTCATATATCTAA  T  TCAATGTG TA    A TA T T  A AT    AT ACTTC  AGTTC ATCGC G     T  CA AAGGTC  GTATT GG CCCT G A C  A  T  T  G  CT  A C   C AC
blockSeqs                     :          . .           CCGGTAA                           TCATA  A   .  TCC     C   .  T  AT  .  GCTT C  .  .  . GG  .       TC AC   .    .   CTTT   A  .  TTT . . .  CTAAT T A         A   T    TG .  . .    A    .    CC   . .    .   . A  . TGC  . .   A    T    .                    .  TCAATGTG A     C .  . .  . .     C  .      .     A     .     .  AT GGG     .     .  CGTG . T .  .  .  T  .  .   . C   . . 
blockSeqs                     :          . .           AA                                .      .   .  TTA     .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  AC   .    .   CT     .  .  AA  . . .  .     . .         A   .    .  .  . .    A    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    A    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  AT .       .     .  CGTG . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  TT      .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  A    .    .   T      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  GGG  . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  AA      .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    C    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    C    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    C    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . T   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    C    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    C    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . A   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    G    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           G                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    G    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           G                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    G    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    C    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  C       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    C    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .   . . 
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    C    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .   . .       
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .             
blockSeqs                     :          . .           T                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .    .  .  . .    .    .    T    . .    .   . .  . .    . .   .    .    .                    .  .        .     . .  . .  . .     .  .      .     .     .     .  .  .       .     .  .    . . .  .  .  .  .  .             
blockSeqs                     :          . .           T                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . C   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .   .                      .    .    . .                                                                                  .  . .     .  .      .     .     .     .                                                            
blockSeqs                     :          . .           A                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .   .      .  .  .   . . .  .     . .         .                                                                                                                                                                                                                             
blockSeqs                     :          . .           T                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .  . G   .       .  .    .    .                                                                                                                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :          . .           .                                 .      .   .  T       .   .  .  .   .  .    .  .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                         


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                 **
originalCons                  : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT
finalCons                     : TTAAGGGGG-A-------TATTA------A-------------------------TA-----GA-CAA-GC---C--AA-AAA--T-AA---T-CT----A--T--C-AT-TG-AA---TTTTT--C--TCA--TTT---C----TTT--C-AT---A-T-A-TC-----T-A---------T---A---TT--G-AA-G---TG--TCC---TT-T--A-C---AA-TAT-G-TG-G---AA-G--TT--TCG---TC-------------------AT-GG--------G--AAGC-T--A-G-AC-A--AATA--A-----GG-----G-----A-GATAA-TC--A------GG-----T--C----T-G-A-AT-TA-CC-TC-CC--TT-A-CTT-A--AAAAT