lowQualScore : 1111111 1 1 222222222222 1111111111 11111111 1111111111 3333333333333333333333333333333333333333 11111111111111111111111111111 11
lowQualScore : 2 1 3 5555 1 33 3 22 444 6 1 1 2222222 1 44 6 1 1 22 1 1 3 3 3333 222 222 1 5 8 1 3 1 1 1 1 111111111111 5 444444 3 4 3333333333 777 33 1 3 1 99999 22 3 1 22 3 1 66 444 1 3 33 33 3 6 99999999 3 1 33 55555 55 3 5555555555 6666 6666666666666666666666666666666666666666 22 22 55555555 1 1 3 3 1 22 66666666666666666666666666666 1 1 444 00 1 3 3 22 1 1 444 55 22 22 22 33 4 1 666 555 22 99999 222 1 1 222 222 1 1 22 1 1
lowQualScore : . . . .... . .. . .. ... . . . ....... . .. . . . .. . . . . .... ... ... . . . . . . . . . ............ . ...... . . .......... ... .. . . . ..... .. . . .. . . .. ... . . .. .. . . ........ . . .. ..... .. . .......... .... ........................................ .. .. ........ . . . . . .. ............................. . . ... .. . . . .. . . ... .. .. .. .. .. . . ... ... .. ..... ... . . ... ... . . .. . .
lowQualScore : 4 9 6 7777 7 88 1 11 222 2 5 5 8888888 5 22 0 5 5 11 5 5 1 1 3333 888 888 6 0 5 5 1 5 5 6 7 222222222222 4 444444 1 6 9999999999 333 77 5 1 5 00000 11 1 5 22 2 6 00 222 5 1 77 77 1 5 77777777 1 5 77 44444 88 1 5555555555 3333 9999999999999999999999999999999999999999 11 11 66666666 5 5 1 1 5 00 55555555555555555555555555555 5 5 222 77 5 1 1 00 5 5 666 00 00 00 00 55 4 5 111 222 00 44444 666 5 5 666 666 5 5 00 5 6
consensus : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATCT-A------AA-A--GTTAT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAATGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGA----A--TT-TGGTAC------T-AT-A------C-A-AA---C--A-A-T-ACACT-A---T--A-T-AA--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACAAA-----T--T-G-C--ACTA-----A--A-A---C----G-AAAA----AN-------------------AA----A---T---AG----A--TGCTT--A--------A-ATC-A-AG-AAT-TG--TT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACGAG-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCT--T-C-G-T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
Reference ( gi|77700 ) : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATCT-A------GA-A--GTTCT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAATGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGA----T--TT-TTGTGC------T-AT-A------C-C-AA---C--A-A-T-ACACT-G---T--A-T-AA--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACAGA-----G--T-G-C--ACTA-----A--A-A---T----A-AAAA----AT-------------------AA----A---T---AA----A--TGCTT--A--------A-ATC-A-AG-AAT-TG--TG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACGAA-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCT--T-T-G-T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77682 : TAAAAACAT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATCT-A------AA-A--GTTGT-T-TC--ATAT-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAATAGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CCTC-CGA----A--TT-TGGTAC------T-AA-A------C-A-AA---C--A-A-T-ACACT-A---T--A-T-AA--TG-CT-T--AAAG---TC-A-T--AAC--TCTG-ACAAA-----T--T-G-C--ACTA-----A--A-A---C----G-AAAA----AA-------------------AA----AAT-T---AA----A--TGCTT--A--------A-ATC-A-AG-AAT-TG--TT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACGAG-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTTCT--T-C-G-T---T-GA-ACGGA---AA---T-A-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77684 : ttaatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-T--CG---A-T-ATATC--A------AA-A--GTTGC-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AACATGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CTTC-GGA----G--TT-TGGTAC------T-AT-A------C-A-AA---C--A-A-T-ACACT-A---T--A-T-AA--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACTAA-----G--T-G-C--ACTA-----A--A-A---C----G-AAAA----ACAAAAAAAAAAAAACCAAAAAA----A---A---AA----A--CACTT--AGATCTTTAA-ATC-A-A--AAT-TG--TT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CAGGAA-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTCCT--T-C-G-T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-ATGT
gi|77699 : ttaatTAAAAACTT-CCA-A----TTAT--ATT-C--TG---AGT-ATATCT-A--------------------------AT-T-T-AAAA-CT----G-------G-AAAATGGGG--T-A-CGGA--C-A-CGTC-GAA----T--TT-G-GTAC------TGAT-A------C-A-AA---C--A-A-T-ACCGT-G---T--A-T-AA--TG-TT-T--ACAG---TC-AAT--ATT--CCTA-AAAAA-----T--T-G-C--ACTA-----C--A-A---T----G-AAAA----AT-------------------AA----A---TT--AG----A--TGCTT--A--------A-ATC-A-GG-AAT-TG--TT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACGAT-T-T-A-AA--TT-T-C---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCT--T-C-G-T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77694 : aatTGAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATCT-G------AA-A--GTTAT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAATGGGG--C-A-CGGA-TC-A-CGTC-GGA-------AT-TGGTAC------T-AT-A--------C-AC---C--A-ATT-AGGCT-AT--T--A-C-AA--TG-TT-TTAAAAG---TA-A-T--ATC--TCTG-ACAAA-----T--T-G-C--ACTT-----A--A-A---T----ATGAAA----AT-------------------AA----A---T----G----G--TGCTT--A--------T-ATC---AG-GAT-TG--TT--ACC-----------------------TA-A-T-T---CACGAG-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCT--T-TCG-T---T-GG-ACGGA---AA---T-C-T--CT-TGTAG-TGGT
gi|77688 : taatTAAAAACAT-CCA-A----T--T--ATT-C--CG---AAT-GTATC--A------GA-AAAGTTGT-T-TC--AGATGT-T-AAAAACC----G---T---G-AAAATGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-CGAAAAAT--TT-TGGTGC------T-AA-A------CAT-AA---C--A-A-TTACACG-A---T--A-T-A----G-CT-T--AA-G---TC-A-T--AAC--TCTGGACAAA-----T--T-T-C--ACTA-----A--A-ACGAT----A-AAAA----A--------------------AA----A---T---TA----ACCTGCTT--A--------A-ATC-A-AGAAAT-TG--TT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACGAG-T-T-A-AA--TT-T-T---GA-A--A--G--C--AAGT-ATT-A---TTGCT--T-TCG-T---T-GA-ACAGA---AA---T-C-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77695 : ttgatTAAAAATTT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---A-T-ATATCT-A------AA-A--GTTAT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAATGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTCCGGA----A--TT-TGGTAC------T-AT-A------C-A-AA---CC-A-A-T-ACACT-G---T--A-T-AA--TG-TT-A--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACAAA-----T--T-G-C--ACTA-----A--A-A---T----G-AAAA----AA-------------------AA----A---TC--AG----A--TGGTT--A--------A-TTCAA-AG-AAT-TG--T
gi|77696 : taatTAAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---AGT-ATATTTTA------AA-A--GTTAAAT-TA--AGAT-T-T-AAAA-CTTGTTG---T---G-AAAA--ATGGTC-A-CGGA-GC-A-CGGC-GGA----A--TT-G-GTAC------C-AT-A------C-A-AA---T--A-A-T-ACACT-A---T--A-TTAA--TG-TT-TTTAAAG---TC-A-TTTATC--TTTG-ACAAA-----T--TTG-C--ACTA-----A--A-A---CGGA-A-AAAA----AA-------------------AA----A---TT--AG----A--TACTT--A--------A-ATC-A-AG-AAT-GT--TT--ACC-----------------------TC-A-------CACGAG-TAT-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-TAA---TTGCT--T-TCGTT---T-GA-ACGGA---AA---T---G--CT-CATTG-AGGTG
gi|77686 : taatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ACATCT-A------AA-A--GTTAT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AAAAT-GGAGTT-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGT----T--TT-TGGTACTACATGT-AT-A------T-A-AA---C--ATT-T-ACACT-G---T--A-C-AA--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACAAA-----T--T-G-C--ACTA-----A--ACA---T---------------T-------------------TG----T---T---AC----C--TGATT--------------TC-A-CG-AGT-----TA--A----------------------------ATT-TTGACACAA----T-A-AA--T-----------A--C--G--------T-A-C-A---TTGCT--T-C-A-T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TA
gi|77690 : ttaatTAAAA---T-TCA-G----T-AT--ATT-C--C----A-T-GTATCT-T------AA-A--GTT-T-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAAT-GGGGTCAA-CGGA-GC-A-CGTC-GGC----A--TT-TGGCAC------T-AT-A--------C-AA---C--A-----ACACT-A---T--ACT-AA--TG-TTAT--A------TC-ATT--ATC--TCTG-TCA-A-----A--T-G-C--ACTAG----A--A-A---C----G-ACCA----GTGACA---------------AA----A---T---AG----A--TGCTTTGA--------A-ATC-A-AG-AATGTACCTG--GCT-----------------------TC-ATT-T---CACGAG-T-T-A-AG--AT-T-T---G--A--T--G--CA-AA-T-A-T-GGTTTTGCT--T-C-G-T---T--A-ACGGA---AA---T-C-G--CG-TATAG-AG
gi|77689 : ttaatTAAAAACTTTCCA-T----T-AT--ATT-C--C----A-T-ATATCT-A------AA-A--GTTGT-T-TC--AGAT-C-T-AAAA-CT----G---T---G--AAAT-GGGGTC-ATCGGA-GC-A-CGTA-CGA--------T-TGGTAC------T-A--A------C-T-AAAACC--A-ATT-ACACT-A---T--G-T-AA--TGTTT-T--GAAG---TC-G-T--ATCT-TCTGTTCAAAT----T--T-G-C--ACTA-----A--A-A---C----G-AAAA----AA-------------------AA----A---TTG-GG----A--TGCTT-----------A-TTT-A-AG-AAT-TT--TG--TCC-----------------------TC-ATTGT---CACGAT-T-T-ACAA--TT-T-TTTGA--A--CCGG--C--AACT-A-T-A---TTGCT--T-C-A-T---T-GA-ACGGA---AT---T-C-G--CA-AATAG-
gi|77683 : ttaatTAAAAATTC-GCATC----T-AT--ATT-C---G---A-T-CTAATT-A------AT-A--GTTAT-G-TC--AGAT-TGT-AAAAACT----G---TTTTA-AAAATGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGA----A--TT-TTGTAC------TCAT-A------T-CAAA---C--A-A-T-ACAATGG---T--ACT-AG--TGTTT-T--ACAG---TC-A-T--ATA--TCTG-A-AAA-----A--T-G-C--ACTA-----AC-A-A---T----G-AAAA----A--------------------AG----A---C---TT----G--TGCTT--A--------A-GTG-A-AG--AT-TG--CT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACGAT-T-TGG-AA--TT-T-T---GAAA--C--G--C--AA-T-ATC-A---CTGCT--TGT-T-T---T-GA-CCGGA---GA---T-C-G--GT-TTTAA-AGGTG
gi|77692 : ttaatTAAAAACAT-CCAGA----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATCT-A------AA-A--GTTGT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAAT-AGGGTC-A-CGGA-GC-
gi|77693 : ttaatAAAAACTT-CCA-A----T-AT--TTT-C--CG---A-T-ACATCT-A------GA-A--GTTAT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----C---T---G-AAAATGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGCC-GGA----T--TT-TGGTGC------T-AT-A------T-C-AAA--C--A-A-T-ACAAT-G---T--A-C-AA--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCCG-ACAAA-----T--T-G-C--ACTATATATG--A-A---C----A-AAAA----AT-----------------------------T---AG----A--TGCTT--A--------A-ATC-A-AG-AAT-TG--TT--ACT-----------------------CC-ATT-T---CACGAG-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TAGCT--T-C-A-T---T-GA-TCGGA---AA---T-C-G--CT-TCTAG-AGGTG
gi|77698 : taattcataAAAAACTT-CCA-A----T-AT--AGT-C--CG---A-T-ATATCT-A------AA-A--GTTAT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAATGAGG-TC-A-CGGA-GA-A-CGTC-GGA----A--TT-TGGTAC------T-GT-AAATGTAC-A-AG---C--A-A-T-ACACT-A---T--A-T-AA--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TTTA-ACAAA-----T--T-G-C--ACTG-----A--A-G---C----G-AAAA----A--------------------AA----ACATT---AG----A--TGCTT--C--------A-ATC-G-AGGAAT-TG--TG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACGAA-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--G--G--C--AA-T-A-T-T---TTGCT--T-C-G-T---T-AA-ATGGA---AA---T-C-T--CT-TATAG-AGGCG
gi|77687 : aataAAAAA--T-CCA-G----T-AT--ATT-A--CA---A-T-ATATCT-ACATGTAAA-A--ATTCT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----G---------AAAATGGGA-TC-A-CGGA-GG-A-TGTC-GGA----A--TT-TGGTTC------T-AT-A------C-A-AA---C--A-A-T-ACACA-A---T--A-T-AA--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACGAAGTACGG--T-A-C--ACTA-----A--A-A---C----G-AGGA----AA-------------------AA----A---T---AG----A--TGCTT--A--------A-ATC-A-AG-ATT-TG--TT--ACC-----------------------TC-AAT-T---TATGTG-T-C-A-AA---T-T-T---G--A--A--G--C--AA-T-A-C-A---TTACT--T-T-G-T---T-GA-ACGGA---AT---A-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77701 : ttaattttaaaaAAAAAATT-ACA-ACAAAT-AT--AAT-CACCT---ACT-ATATCT-A------TA-ATAGTTAT-T-TTTAAGAA-T-T-TAAA-CT----GATTT---T-AAAATGGG--TC-A-CGTA-GC-A-CGAC-GGA----A--TTATGGTAC------A-ATTA------C-A-AAA--C--T-A-T-ACGCC-G---TTTA-T-AA--TG-TT-T--AAAG---TCCA-TT-ATC--TCTG-ATACA-----A--TTG-CC-ACTA-----A--AGA---T----G-AAAA----AA-------------------AA----T---T---AA----G--AGCTT--A--------A--TC-A-GG-AAT-TG--TTTTACC-----------------------TC-ATT-----CACGAAGT-T-AGAA--TC-TAT---G--A--C--G--CGTAA-T-AGC-A---TTGCT--T-C-G-T---TTGA-ACGAA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77702 : AAAAAGTT-CCA-A----T-ATT-ACT-C--CT---C-T-ATA-CT-A------AA-A--GTTAT-TCTT--AGAT-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAATGGGGGT--A-CGGA-GC-A-CGAC-GAA--------T-TGGTAC------T-AT-A------C-A-AA---CTAA-A-T-ACGCC-GT--T--A-T-AAGTTG--T-T--AAGGATATT-A-T--CTC--TTTG-ATA-A-----GTTT-G-CAAACTA-----A--A-A---A----T-GAAA----AC-------------------AA----A-------AATTTGA--TGCTT--A--------AGATC-A-GG-AAT-TG--TT--ACCATTAATCTTTTGAGATTAATGCATC-ATT-T---CACGAAGT-T-A-AA--TC-T-TTA-G--A--C--GGCC--AA-T-A-C-ATTTTTGCT--C-T---T---C-GA-ACGAA---AAGGGT-C-G--CT-TATAGAAGGTG
gi|77691 : AAAGATGT-CCA-AA---T-ATTTATT-C--CGCGAA-TTATATCT-A------AAGA--GAT-----TA--AGAT-C---AAAA-CT----G---T---TTAAAATGGGTAAC-AACGGAAGC-AACGTC-AGA----A--TT-TAAGAC------T-AT-A------C-----------A-A-C-ACACTTGAATT--A-T-AA--TG-TT-T--AAAGG--TC-A-T--ATTCGTCCG-ACAAA-----T--T-GGC--ACTA-----A--A-A--------A-CGGA----AC-------------------AA----AAATT---AG----A---GTTT--A--------A-ATC-ATAG-AAT-TG--C---ACC-----------------------TC-ATT-T---CACGTT-T-TCA-AA--TTAT-G---G--A--C--T--C--AA-T-A-T-A---TTGCT--C-C-G-TTTAT-AA-ACGGA---AA---T-C-G--CTCTATAG-AGATG
gi|77697 : ttaatttaaAAAAAATT-CCA-A----T-AT--ATC-C--CT---C-T-ATATCT-A------AA-A--GTTAT-T-TT--AGAT-T-T-AAAA-CT----
gi|77685 : taataAAAACTT-TCA-A----T-AT--ATC-C--TG---A-T-ACATCT-T------GA-A--GTTAT-T-TC--GGAT-T---AAAA-CT----G---T---G-AAAATGGGG-TT-A-CGAT-GC-A-CGTC-AGA----T--TT-TGGTAC------T-AT-A------C-A-GA---C--A-A-T-ACACT-G---G--A-A-AT--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACAAA-----T--T-G-C--ATCA-----A--A-A---T----A-AAAA----AA-------------------AAGCGAA---T---TG----A--TGTTT--A--------A-ATC-A-AG-AAT-TG--TT--ATC-----------------------TC-ATT-T---CATGAG-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCT--T-C-A-G---T-AG-ACGAA---AA---T-T-G--AT-TATAA-AGCTG
gi|77681 : ttaattt-CTA-A----T-TT--AAT-C--CA---A-T-GCATCT-A------AA-A--ATTAT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAATGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGT--GGA----G--TT-TGGTAC------T-ATTA------C-C-AA---C--A-A-T-ACAC--A---T--A-T-AA--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACGAA-----T--T-G-C--ATTA-----A--A-A---T----G-AAAAC---AT-------------------AA----T---T---AG----A--TGCTT--A--------A-ATA-A-AG--AT-TG--CT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACGAG-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-TAA-C-A---TCGCT--C-C-A-T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77703 : ttaaccttaaatccaA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATCT-A------------------------AGAG-T-T-AAAG-CT----G---T---G-AAA-TTGGGGTC-A-TGGT-CC-A-CGTC-GAA----------------------------------C-T-AA---C--A-A-T-ACTCT-A---T--A-T-AA--TG-TT-C--GACA---AC-A-T--ATC--T-------AA-----T--T-G-C--ACTG-----A--A-A---C----G-AAAACAAAAA-------------------AA----A---T---AG----A--TGCTT--A--------A-ATC-G-AA-AAT-TA--TC--ACC-----------------------TT-ATT-T---AACGTT-T-C-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTGCT--T-C-A-T---T-GA-ATGGA---AA---T-C-GCTCT-TATA
gi|77704 : -AT--ATT-G--CG---A-C-ATATCT-A-------A-A--GTTGT-T-TC--AGAT-T-TTCAAA-CT----G---T---G-AAAATGGGG-TC-A-CGGA-GCCA-CGTC-GGA----AAATT-TGGTAC------T-ATCA------C-A-AAA--C--A-A-T-ACACT-A---T--A-T-AA--------------G-------------C--TCTG-ACAGA-----T--T-G----ACTA-----A--A-A---CCCGGA-AAAA----A--------------------AA----A---T---AT----A--TGCTT--A--------A-ATC-A-AG-AAT-TG--TT--ACCT----------------------TC-ATT-TC--CACGAA-T-T-A-AACTTT-C-T---G--A--C--G--C--AACT-A-T-A---TT-CT--T-C-G-T---T--A-ACAGA---AA---TCC-G--CT-TATAG-AG
gi|77680 : --ATT-C--CG---A-T-GCATCT-A------AA-A--ATTAT-T-TC--AGAT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAAT-GGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGA----G--TT-TGGTAC------T-AT-A------C-C-AA---C--A-A-T-ACACT-A---T--A-T-AA--TG-TT-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACGAA-----T--T-G-C--ATTA-----A--A-A---T----G-AAAAC---AT-------------------AA----T---T---AG----A--TGCTT--A--------A-ATA-A-AG-AAT-TG--CT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACGAG-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TCGCT--C-C-A-T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77705 : ttaaccttaaatccaactaatttta--ATT-C--CAC--A-T-ATATCT-A------AA-A--GTTAT-T-TC--AGAT-T-TTAAAA-CT----G---T---G-AAAATGGAG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTA-GGA----A--TT-AAGTAC------T-AT-A------G-A-AA---C--A-A-T-ACATT-A---T--A-T-GA--TG-TT-TA-AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-GCAAA-----T--T-G-C--ACTA-----A--T-A---C----G-GAAA----AA-------------------AA----AT--T---AT----A--TGCTT--A--------A-ATC---AG-AAT-TG--TT--TCC-----------------------TC-ATC-T---CATG---T-T-A-AA---T-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-T-T-A---TTGCT--T-C-G-T---T-GA-ATAGA---AA---T-C-A--CT-TGTAA-AGGTG
gi|77706 : T-C--TG---A-T-ATGTCT-A------AA-A--GTTGT-T-TC--AAAA-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAAT-GGGGTC-A-CGGA-TC-A-C
gi|77707 : ATTGAGGTC-A-TGAA-GA-A-TATC-GGA----A--TT-TAGAAC------T-AC-A------C-A-AA---C--A---T-ACACT-G---T--C-T-A
gi|77708 : taaaagtgatgtcagtgatC------T-AT-A------C-A-AT---C--A-A-T-ACACT-A---T--A-T-AA--TG-T--------------------------CTG-AGAGA-----T--T-G-C--ACTA-----ACGA-A---A----A-AAAA----AT-----------------------------T---AG----A--TGCTT--A--------A-ATC-A-AG-AAT-AG--TT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATATG-T-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGCT--T-C-C-T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTGtacaatg
gi|77709 : tggcaC------T-AT-A------T-A-AT---C--A-A-T-ACACT-T---T--A-T-AA--TG-T--------------------------CTG-AGAGA-----T--T-G-C--ACTA-----ACGA-A---A----A-AAAA----AT-----------------------------T---AG----A--TGCTT--A--------A-ATC-A-AG-AAT-AG--TT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATATG-T-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGCT--T-C-C-T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTG
gi|77710 : tgaca---TT-A-T--ATG--TCTG-AGAGA-----GATT-G-C--ACT---------A-A---C----G-AAAA----AA-------------------AA----A---TTTGAT----A--TGCTT--A--------A-ATC-ATAG-AAT-AG--TT--ACT-----------------------TCTATT-A---TATG-----T-C-AA--TA-G-T---GC-A--T--G--C--AA-T-A---A---TTGCTTGT-C-G-T---T-GAGATGGGCACAA---T-C-G---T-TGTAG-AGGT
gi|77711 : ataaaatacaatacgcT-TA--TT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACAAC-T-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCT--T-C-A-T---T-GA-A-GG-----A---T-C-G--CT-CATAG-GG
gi|77712 : --TT-T-T---A--AAGT--G--T--AA-T-A-T-A---TTGCT--T-C-G-T---T-GA-ACGGA---AA---T-CAA--TT-TATAG-AGG
Alignments
lowQualScore : 1 1111111111111111111 1111111111111 11111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 3 5555 1 33 3 22 444 5 1 1 1 555555 2 1 1 1 22 1 1 1 1 2 3333 222 222 1 1 7 4 1 3 1 1 1 1 77777 1 888888 2 33 2 2 1 1 4 22 1 2 1 3333 22 55555 1 2 1 2 22 1 55 444 1 3 33 33 3 1 1 3 3333 1 1 33 1 1 1 3 1 222 1 7777 22 5555555555555555555 1 5555555555555 22 22 3 66666666 1 22 88888888888888888888888 1 1 444 1 22 1 3 3 22 1 1 444 44 22 22 22 33 4 1 555 555 4 22 33 222 1 1 222 222 1 1 22 1 1
lowQualScore : . . . .... . .. . .. ... . . . . ...... . . . . .. . . . . . .... ... ... . . . . . . . . . . ..... . ...... . .. . . . . . .. . . . .... .. ..... . . . . .. . .. ... . . .. .. . . . . .... . . .. . . . . . ... . .... .. ................... . ............. .. .. . ........ . .. ....................... . . ... . .. . . . .. . . ... .. .. .. .. .. . . ... ... . .. .. ... . . ... ... . . .. . .
lowQualScore : 8 8 5 4444 7 77 0 00 111 9 5 4 4 555555 9 4 4 4 00 4 4 4 4 9 0000 666 666 5 5 3 7 5 0 5 5 5 6 44444 5 555555 9 44 9 9 4 4 3 00 4 9 4 0000 00 77777 4 9 4 9 00 5 66 111 5 0 55 55 0 5 5 0 1111 5 5 55 5 5 5 0 5 666 5 2222 00 9999999999999999999 5 5555555555555 00 00 0 99999999 5 00 99999999999999999999999 5 5 111 5 22 5 0 0 00 4 4 555 88 00 00 00 44 3 4 555 000 3 00 44 555 4 4 555 555 4 4 00 4 5
consensus : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGT-CGGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-------------------AAAA----A----T---AGA--TGCTT--AA-ATC---A----AG-AATTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
Reference ( family-575 ) : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGT-CGGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-------------------ANAA----A----T---AGA--TGCTT--AA-ATC---A----AG-AATTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77680 : --ATT-C--CG---A-T-GCATC-T-A------AA-AA-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGT-CGGAG----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-G-AA-T----T-G-C--ATT-A-A-A-A-T---G-A----A--AAC------------------ATAA----T----T---AGA--TGCTT--AA-ATA---A----AG-AATTGCT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TCGC-T--CCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77681 : ttaaccttaaatccaactaatttta-CTA-A----T-TT--AAT-C--CA---A-T-GCATC-T-A------AA-AA-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGT--GGAG----TT-TGGTAC------T-AT-T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C------A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-G-AA-T----T-G-C--ATT-A-A-A-A-T---G-A----A--AAC------------------ATAA----T----T---AGA--TGCTT--AA-ATA---A----AG--ATTGCT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-TAA-C-A---TCGC-T--CCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77682 : ttaaccttaaatccaTAAAAACAT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--ATA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-TAGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CCT-CCGAA----TT-TGGTAC------T-A--A-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-C--T-T--AAAG---TC-A-T--AAC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-------------------AAAA----AAT--T---AAA--TGCTT--AA-ATC---A----AG-AATTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTTC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-A-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77683 : ttaatTAAAAATTC-GCATC----T-AT--ATT-C---G---A-T-CTAAT-T-A------AT-AG-TTAT-G-TC--AGA-T-TGT-AAAAACT----G---TTTTA-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGT-CGGAA----TT-TTGTAC------TCA--T-ATCA-A-A-C--A-A-T-ACA----A--TG--G-T-ACT-AGTGTT--T-T--ACAG---TC-A-T--ATA--TCTG-AA-A-AA------T-G-C--ACT-A-ACA-A-T---G-A----A--AA-------------------AAGA----C----T---TG---TGCTT--AA-GTG---A----AG--ATTGCT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-TT-TGG-AA--TT-T-T---GAAA--C--G--C--AA-T-ATC-A---CTGC-T--T-GTTT---T-GA-CCGGA---GA---T-C-G--GT-TTTAA-AGGTG
gi|77684 : ttaatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-T--CG---A-T-ATATC---A------AA-AG-TTGC-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AACA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CTT-CGGAG----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-T-AA-G----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AAACAAAAAAAAAAAAACCAAAAAA----A----A---AAA--CACTT--AG-ATCTTTAAATCAA-AATTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CAGG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTCC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-ATGT
gi|77685 : ttaatAAAACTT-TCA-A----T-AT--ATC-C--TG---A-T-ACATC-T-T------GA-AG-TTAT-T-TC--GGA-T-T---AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TT-A-CGAT-GC-A-CGT-CAGAT----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-G-A-C--A-A-T-ACA----C--T---G-G-A-A-ATTG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ATC-A-A-A-A-T---A-A----A--AA-------------------AAAAGCGAA----T---TGA--TGTTT--AA-ATC---A----AG-AATTGTT--ATC-----------------------TC-ATT-T---CATG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCA--G---T-AG-ACGAA---AA---T-T-G--AT-TATAA-AGCTG
gi|77686 : ttaatttTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ACATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AAAA-T-GGAGTT-A-CGGA-GC-A-CGT-CGGTT----TT-TGGTACTACATGT-A--T-A-TA-A-A-C--ATT-T-ACA----C--T---G-T-A-C-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT---A-A-A-C-------------------------------------A----T----T---TGT--TACCT--GATTTC---A----CG-A---GTT--A--------------------------A-ATT-TTGACACA-A----T-A-AA--T-----------A--C--G--------T-A-C-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TA
gi|77687 : ttaatAAAAA--T-CCA-G----T-AT--ATT-A--CA---A-T-ATATC-T-ACATGTAAA-AA-TTCT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---------AAAA-TGGGA-TC-A-CGGA-GG-A-TGT-CGGAA----TT-TGGTTC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--A---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACGA-AG-TACGGT-A-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----G--GA-------------------AAAA----A----T---AGA--TGCTT--AA-ATC---A----AG-ATTTGTT--ACC-----------------------TC-AAT-T---TATG-T-GT-C-A-AA---T-T-T---G--A--A--G--C--AA-T-A-C-A---TTAC-T--TTG--T---T-GA-ACGGA---AT---A-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77688 : ttaattttaaaaTAAAAACAT-CCA-A----T--T--ATT-C--CG---AAT-GTATCAG-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-TGT-T-AAAAACC----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGT-CCGAAAAATTT-TGGTGC------T-A--A-A-CATA-A-C--A-A-TTACA----C--G---A-T-A-T-A--G-C--T-T--AA-G---TC-A-T--AAC--TCTGGAC-A-AA-T----T-T-C--ACT-A-A-A-A-C---G-ATA--A--AA-------------------AAAA----A----T---TAACCTGCTT--AA-ATC---A----AGAAATTGTT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---GA-A--A--G--C--AAGT-ATT-A---TTGCTT--TCG--T---T-GA-ACAGA---AA---T-C-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77689 : ttgatTAAAAACTTTCCA-T----T-AT--ATT-C--C----A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-T-C-T-AAAA-CT----G---T---G--AAA-T-GGGGTC-ATCGGA-GC-A-CGT-ACGA------T-TGGTAC------T-AACT-A-AA-A-C-C--A-ATT-ACA----C--T---A-T-G-T-AATGTT--T-T--GAAG---TC-G-T--ATCT-TCTGTTC-A-AATT----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-------------------AAAA----A----TTG-GGA--TGCTT---A-TTT---A----AG-AATTTTG--TCC-----------------------TC-ATTGT---CACG-A-TT-T-ACAA--TT-T-TTTGA--A--CCGG--C--AACT-A-T-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ACGGA---AT---T-C-G--CA-AATAG-
gi|77690 : ttaatTAAAA---T-TCA-G----T-AT--ATT-C--C----A-T-GTATC-T-T------AA-AG-TT-T-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-T-GGGGTCAA-CGGA-GC-A-CGT-CGGCA----TT-TGGCAC------T-A--T-A-C--A-A-C--A-----ACA----C--T---A-T-ACT-AATG-T--TAT--A------TC-ATT--ATC--TCTG-TC-A-AA------T-G-C--ACT-AGA-A-A-C---G-ACC--AGTGA-------------------CAAA----A----T---AGA--TGCTTTGAA-ATC---A----AG-AA-TG-T--ACCTGGCT------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AG--AT-T-T---G--A--T--G--CA-AA-T-A-T-GGTTTTGC-T--TCG--T---T--A-ACGGA---AA---T-C-G--CG-TATAG-AG
gi|77691 : ttaatAAAGATGT-CCA-AA---T-ATTTATT-C--CGCGAA-TTATATC-T-A------AAGAGATTA--------AGA-T-C---AAAA-CT----G---T---TTAAAA-TGGGTAAC-AACGGAAGC-AACGT-CAGAA----TT-TAAGAC------T-A--T-A-CA-A----------C-ACA----C--TTGAA-TTA-T-AATG-T--T-T--AAAGG--TC-A-T--ATTCGTCCG-AC-A-AA-T----T-GGC--ACT-A-A-A-AAC---G-G----A--AC-------------------AAAA----A----TT--AGA---GTTT--AA-ATC---AT---AG-AATTGC---ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-T-TT-TCA-AA--TTAT-G---G--A--C--T--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--CCG--TTTAT-AA-ACGGA---AA---T-C-G--CTCTATAG-AGATG
gi|77692 : ttaatttaaTAAAAACAT-CCAGA----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-T-AGGGTC-A-CGGA-GC-
gi|77693 : ttaatAAAAACTT-CCA-A----T-AT--TTT-C--CG---A-T-ACATC-T-A------GA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----C---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGC-CGGAT----TT-TGGTGC------T-A--T-ATCA-A-A-C--A-A-T-ACA----A--T---G-T-A-C-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCCG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-T-ATA-T---G-A----A--CA-------------------AAAA----A----TT--AGA--TGCTT--AA-ATC---A----AG-AATTGTT--ACT-----------------------CC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TAGC-T--TCA--T---T-GA-TCGGA---AA---T-C-G--CT-TCTAG-AGGTG
gi|77694 : taattcataTGAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-G------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAA-TGGGG--C-A-CGGA-TC-A-CGT-CGGAA-----T-TGGTAC------T-A--T-A-C--A-C-C--A-ATT-AGG----C--T---ATT-A-C-AATG-T--T-TTAAAAG---TA-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-T-A-A-A-T---ATG----A--AA-------------------ATAA----A----T----GG--TGCTT--AT-ATC--------AG-GATTGTT--ACC-----------------------TA-A-T-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCTT--TCG--T---T-GG-ACGGA---AA---T-C-T--CT-TGTAG-TGGT
gi|77695 : taatTAAAAATTT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTCCGGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-ACC--A-A-T-ACA----C--T---G-T-A-T-AATG-T--T-A--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-------------------AAAA----A----TC--AGA--TGGTT--AA-TTCA--A----AG-AATTGT
gi|77696 : taatTAAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---AGT-ATATT-TTA------AA-AG-TTAAAT-TA--AGA-T-T-T-AAAA-CTTGTTG---T---G-AAAAATGG---TC-A-CGGA-GC-A-CGG-CGGAA----TT--GGTAC------C-A--T-A-CA-A-A-T--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-TTAATG-T--T-TTTAAAG---TC-A-TTTATC--TTTG-AC-A-AA-T----TTG-C--ACT-A-A-A-A-C---G-G----A--AA-------------------AAAA----AAAATT---AGA--TACTT--AA-ATC---A----AG-AATGTTT--ACC-----------------------TC-A-------CACG-A-GTAT-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-TAA---TTGCTT--TCGT-T---T-GA-ACGGA---AA---T---G--CT-CATTG-AGGTG
gi|77697 : taatAAAAAATT-CCA-A----T-AT--ATC-C--CT---C-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TT--AGA-T-T-T-AAAA-CT----
gi|77698 : taataAAAAACTT-CCA-A----T-AT--AGT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GAGGTC-A-CGGA-GA-A-CGT-CGGAA----TT-TGGTACTGTAAAT-G--T-A-CA-A-G-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TTTA-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-G-A-A-G-C---G-A----A--AA-------------------AAAAC---AT---T---AGA--TGCTT--CA-ATCG--A----GG-AATTGTG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--G--G--C--AA-T-A-T-T---TTGC-T--TCG--T---T-AA-ATGGA---AA---T-C-T--CT-TATAG-AGGCG
gi|77699 : aataTAAAAACTT-CCA-A----TTAT--ATT-C--TG---AGT-ATATC-T-A------A--------------------T-T-T-AAAA-CT----G-------G-AAAA-TGGGG--T-A-CGGA--C-A-CGT-CG-AA----TT-TGGTAC------TGA--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACC----G--T---G-T-A-T-AATG-T--T-T--ACAG---TC-AAT--ATT--CCTA-AA-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-C-A-A-T---G-A----A--AA-------------------ATAA----A----TT--AGA--TGCTT--AA-ATC---A----GG-AATTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-TT-T-A-AA--TT-T-C---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77700 : aatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------GA-AG-TTCT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGT-CGGAT----TT-TTGTGC------T-A--T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---G-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-GA-G----T-G-C--ACT-A-A-A-A-T---A-A----A--AA-------------------ATAA----A----T---AAA--TGCTT--AA-ATC---A----AG-AATTGTG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TTG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77701 : AAAAAATT-ACA-ACAAAT-AT--AAT-CACCT---ACT-ATATC-T-AT-----AATAG-TTAT-T-TTTAAGA-A-T-T-TAAA-CT----GATTT---T-AAAA-TGGG--TC-A-CGTA-GC-A-CGA-CGGAA----TTATGGTAC------A-A--TTA-CA-A-AAC--T-A-T-ACG----CCGT---T-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TCCA-TT-ATC--TCTG-AT-ACAA-T----T-G-CC-ACT-A-A-AGA-T---G-A----A--AA-------------------AAAA----T----T---AAG--AGCTT--AA--TC---A----GG-AATTGTTTTACC-----------------------TC-ATT-----CACG-AAGT-T-AGAA--TC-TAT---G--A--C--G--CGTAA-T-AGC-A---TTGC-T--TCG--T---TTGA-ACGAA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77702 : AAAAAGTT-CCA-A----T-ATT-ACT-C--CT---C-T-ATA-C-T-A------AA-AG-TTAT-TCTT--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAA-TGGGGGT--A-CGGA-GC-A-CGA-CGAA------T-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-CTAA-A-T-ACG----C--C---GTT-A-T-AA-G-TTGT-T--AAGGATATT-A-T--CTC--TTTG-AT-A-AGTT----T-G-CAAACTAA-A-A-A-T---G-A----A--AAC------------------AAAA----AT---T---TGA--TGCTT--AAGATC---A----GG-AATTGTT--ACCATTAATCTTTTGAGATTAATGCATC-ATT-T---CACGAA-GT-T-A-AA--TC-T-TTA-G--A--C--GGCC--AA-T-A-C-ATTTTTGC----TCT--T---C-GA-ACGAA---AAGGGT-C-G--CT-TATAGAAGGTG
gi|77703 : A-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AG-AG------------------T-T-AAAG-CT----G---T---G--AAA-TTGGGGTC-A-TGGT-CC-A-CGT-CGA-------------AC------T-----------A-A-C--A-A-T-ACT----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-C--GACA---AC-A-T--ATC--T---------AA-T----T-G-C--ACT-G-A-A-A-C---G-AAAACA--AA-------------------AAAA----A----T---AGA--TGCTT--AA-ATC---G----AA-AATTATC--ACC-----------------------TT-ATT-T---AACG-T-TT-C-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ATGGA---AA---T-C-GCTCT-TATA
gi|77704 : -AT--ATT-G--CG---A-C-ATATC-T-A------AA--G-TTGT-T-TC--AGA-T-T-TTCAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GCCA-CGT-CGGAAAA--TT-TGGTAC------T-A--TCA-CA-A-AAC--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AA--------------G-------------C--TCTG-AC-A-GA-T----T-G----ACT-A-A-A-A-CCCGG-A----A--AA-------------------AAAA----A----T---ATA--TGCTT--AA-ATC---A----AG-AATTGTT--ACCT----------------------TC-ATT-TC--CACG-A-AT-T-A-AACTTT-C-T---G--A--C--G--C--AACT-A-T-A---TT-C-T--TCG--T---T--A-ACAGA---AA---TCC-G--CT-TATAG-AG
gi|77705 : --ATT-C--CAC--A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGATT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GGAGTC-A-CGGA-GC-A-CGT-AGGAA----TT-AAGTAC------T-A--T-A-GA-A-A-C--A-A-T-ACA----T--T---A-T-A-T-GATG-T--T-TA-AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-GC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-T-A-C---G-G----A--AA-------------------AAAA----AT---T---ATA--TGCTT--AA-ATC--------AG-AATTGTT--TCC-----------------------TC-ATC-T---CAT----GT-T-A-AA---T-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-T-T-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ATAGA---AA---T-C-A--CT-TGTAA-AGGTG
gi|77706 : T-C--TG---A-T-ATGTC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AAA-A-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GGGGTC-A-CGGA-TC-A-C
gi|77707 : -T-A------AA-AG-TGAT-G-TC--AG-----------------------T---G-ATA--TTGAGGTC-A-TGAA-GA-A-TAT-CGGAA----TT-TAGAAC------T-A--C-A-CA-A-A-C----A-T-ACACTGTC--T---A-T-A-C-AATG-
gi|77708 : -TGGCAC------T-A--T-A-CA-A-T-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T----------------------------CTG-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-A-A-----C---G-A----A--AA-------------------AAAA----A----TT--AGA--TGCTT--AA-ATC---A----AG-AATAGTT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATA-T-GT-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCC--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTG
gi|77709 : -TGACAC------T-A--T-A-TA-A-T-C--A-A-T-ACA----C--T---T-T-A-T-AATG-T----------------------------CTG-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-A-A-----C---G-A----A--AA-------------------AAAA----A----TT--AGA--TGCTT--AA-ATC---A----AG-AATAGTT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATA-T-GT-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCC--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTG
gi|77710 : -A--T-A-AA-ATA-C--A-A-T-ACG----C--T-----T-A-T-A-TG-T--C-T--GA---------------------G-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-----A-A-C---G-A----A--AA-------------------AAAA----A----TTTGATA--TGCTT--AA-ATC---AT---AG-AATAGTT--ACT-----------------------TCTATT-A---TATG------T-C-AA--TA-G-T---GC-A--T--G--C--AA-T-A---A---TTGC-TTGTCG--T---T-GAGATGGGCACAA---T-C-G---T-TGTAG-AGGT
gi|77711 : TTATT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACA-A-CT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-A-GG-----A---T-C-G--CT-CATAG-GG
gi|77712 : --TT-T-T---A--AAGT--G--T--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-CAA--TT-TATAG-AGG
Alignments
lowQualScore : 1 22222222222222222222222222 11111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 3 5555 1 33 3 22 444 5 1 1 1 555555 2 1 1 1 22 1 1 1 1 2 3333 222 222 1 1 5 6 1 3 1 1 1 1 77777 1 888888 2 33 2 2 1 1 2 33 1 2 1 3333 22 55555 1 2 1 2 22 1 55 444 1 3 33 33 3 1 1 3 3333 1 1 33 1 1 1 3 1 222 1 7777 22 1 6666666666 3 44444444444444444444444444 22 22 3 3 3 1 22 88888888888888888888888 1 1 444 1 22 1 3 3 22 1 1 444 44 22 22 22 33 4 1 555 555 4 22 33 222 1 1 222 222 1 1 22 1 1
lowQualScore : . . . .... . .. . .. ... . . . . ...... . . . . .. . . . . . .... ... ... . . . . . . . . . . ..... . ...... . .. . . . . . .. . . . .... .. ..... . . . . .. . .. ... . . .. .. . . . . .... . . .. . . . . . ... . .... .. . .......... . .......................... .. .. . . . . .. ....................... . . ... . .. . . . .. . . ... .. .. .. .. .. . . ... ... . .. .. ... . . ... ... . . .. . .
lowQualScore : 8 8 5 4444 7 77 0 00 111 9 5 4 4 555555 9 4 4 4 00 4 4 4 4 9 0000 666 666 5 5 4 5 5 0 5 5 5 6 44444 5 555555 9 44 9 9 4 4 9 44 4 9 4 0000 00 77777 4 9 4 9 00 5 66 111 5 0 55 55 0 5 5 0 1111 5 5 55 5 5 5 0 5 666 5 2222 00 5 5555555555 0 99999999999999999999999999 00 00 0 0 0 4 00 99999999999999999999999 5 5 111 5 22 5 0 0 00 4 4 555 88 00 00 00 44 3 4 555 000 3 00 44 555 4 4 555 555 4 4 00 4 5
consensus : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
Reference ( family-575 ) : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77680 : --ATT-C--CG---A-T-GCATC-T-A------AA-AA-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAG----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-G-AA-T----T-G-C--ATT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-C----------ATAA----T-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATA-A-AGAA-TTGCT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TCGC-T--CCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77681 : ttaaccttaaatccaactaatttta-CTA-A----T-TT--AAT-C--CA---A-T-GCATC-T-A------AA-AA-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGT--GGAG----TT-TGGTAC------T-AT-T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C------A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-G-AA-T----T-G-C--ATT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-C----------ATAA----T-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATA-A-AG-A-TTGCT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-TAA-C-A---TCGC-T--CCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77682 : ttaaccttaaatccaTAAAAACAT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--ATA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-TAGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CCTC-CGAA----TT-TGGTAC------T-A--A-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-C--T-T--AAAG---TC-A-T--AAC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----AAT---------------T---AAA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTTC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-A-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77683 : ttaatTAAAAATTC-GCATC----T-AT--ATT-C---G---A-T-CTAAT-T-A------AT-AG-TTAT-G-TC--AGA-T-TGT-AAAAACT----G---TTTTA-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TTGTAC------TCA--T-ATCA-A-A-C--A-A-T-ACA----A--TG--G-T-ACT-AGTGTT--T-T--ACAG---TC-A-T--ATA--TCTG-AA-A-AA------T-G-C--ACT-A-ACA-A-T---G-A----A--AA-A----------A-GA----C-----------------T---TG---TGCTT--AA-GTG-A-AG-A-TTGCT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-TT-TGG-AA--TT-T-T---GAAA--C--G--C--AA-T-ATC-A---CTGC-T--T-GTTT---T-GA-CCGGA---GA---T-C-G--GT-TTTAA-AGGTG
gi|77684 : ttaatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-T--CG---A-T-ATATC---A------AA-AG-TTGC-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AACA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CTTC-GGAG----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-T-AA-G----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-ACAAAAAAAAAA-AA----ACCAAAAAAAAAAACACTT---AGA--TCTTT--AA-ATC-A-A-AA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CAGG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTCC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-ATGT
gi|77685 : ttaatAAAACTT-TCA-A----T-AT--ATC-C--TG---A-T-ACATC-T-T------GA-AG-TTAT-T-TC--GGA-T-T---AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TT-A-CGAT-GC-A-CGTC-AGAT----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-G-A-C--A-A-T-ACA----C--T---G-G-A-A-ATTG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ATC-A-A-A-A-T---A-A----A--AA-A----------A-AAGCGAA-----------------T---TGA--TGTTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ATC-----------------------TC-ATT-T---CATG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCA--G---T-AG-ACGAA---AA---T-T-G--AT-TATAA-AGCTG
gi|77686 : ttaatttTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ACATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AAAA-T-GGAGTT-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGTT----TT-TGGTACTACATGT-A--T-A-TA-A-A-C--ATT-T-ACA----C--T---G-T-A-C-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT---A-A-A-C------------------------------A----T-----------------T---TGT--TACCT--GATTTC-A-CGA----GTT--A--------------------------A-ATT-TTGACACA-A----T-A-AA--T-----------A--C--G--------T-A-C-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TA
gi|77687 : ttaatAAAAA--T-CCA-G----T-AT--ATT-A--CA---A-T-ATATC-T-ACATGTAAA-AA-TTCT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---------AAAA-TGGGA-TC-A-CGGA-GG-A-TGTC-GGAA----TT-TGGTTC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--A---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACGA-AG-TACGGT-A-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----G--GA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAT-TTGTT--ACC-----------------------TC-AAT-T---TATG-T-GT-C-A-AA---T-T-T---G--A--A--G--C--AA-T-A-C-A---TTAC-T--TTG--T---T-GA-ACGGA---AT---A-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77688 : ttaattttaaaaTAAAAACAT-CCA-A----T--T--ATT-C--CG---AAT-GTATCAG-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-TGT-T-AAAAACC----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-CGAAAAATTT-TGGTGC------T-A--A-A-CATA-A-C--A-A-TTACA----C--G---A-T-A-T-A--G-C--T-T--AA-G---TC-A-T--AAC--TCTGGAC-A-AA-T----T-T-C--ACT-A-A-A-A-C---G-ATA--A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---TAACCTGCTT--AA-ATC-A-AGAAATTGTT--AC------------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---GA-A--A--G--C--AAGT-ATT-A---TTGCTT--TCG--T---T-GA-ACAGA---AA---T-C-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77689 : ttgatTAAAAACTTTCCA-T----T-AT--ATT-C--C----A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-T-C-T-AAAA-CT----G---T---G--AAA-T-GGGGTC-ATCGGA-GC-A-CGTA-CGA------T-TGGTAC------T-AACT-A-AA-A-C-C--A-ATT-ACA----C--T---A-T-G-T-AATGTT--T-T--GAAG---TC-G-T--ATCT-TCTGTTC-A-AATT----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TTG-GGA--TGCTT---A-TTT-A-AGAA-TTTTG--TCC-----------------------TC-ATTGT---CACG-A-TT-T-ACAA--TT-T-TTTGA--A--CCGG--C--AACT-A-T-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ACGGA---AT---T-C-G--CA-AATAG-
gi|77690 : ttaatTAAAA---T-TCA-G----T-AT--ATT-C--C----A-T-GTATC-T-T------AA-AG-TT-T-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-T-GGGGTCAA-CGGA-GC-A-CGTC-GGCA----TT-TGGCAC------T-A--T-A-C--A-A-C--A-----ACA----C--T---A-T-ACT-AATG-T--TAT--A------TC-ATT--ATC--TCTG-TC-A-AA------T-G-C--ACT-AGA-A-A-C---G-ACC--AGTGA-C----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTTTGAA-ATC-A-AGAA--TG-T--ACCTGGCT------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AG--AT-T-T---G--A--T--G--CA-AA-T-A-T-GGTTTTGC-T--TCG--T---T--A-ACGGA---AA---T-C-G--CG-TATAG-AG
gi|77691 : ttaatAAAGATGT-CCA-AA---T-ATTTATT-C--CGCGAA-TTATATC-T-A------AAGAGATTA--------AGA-T-C---AAAA-CT----G---T---TTAAAA-TGGGTAAC-AACGGAAGC-AACGTC-AGAA----TT-TAAGAC------T-A--T-A-CA-A----------C-ACA----C--TTGAA-TTA-T-AATG-T--T-T--AAAGG--TC-A-T--ATTCGTCCG-AC-A-AA-T----T-GGC--ACT-A-A-A-AAC---G-G----A--AC-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA---GTTT--AA-ATC-ATAGAA-TTGC---ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-T-TT-TCA-AA--TTAT-G---G--A--C--T--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--CCG--TTTAT-AA-ACGGA---AA---T-C-G--CTCTATAG-AGATG
gi|77692 : ttaatttaaTAAAAACAT-CCAGA----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-T-AGGGTC-A-CGGA-GC-
gi|77693 : ttaatAAAAACTT-CCA-A----T-AT--TTT-C--CG---A-T-ACATC-T-A------GA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----C---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGCC-GGAT----TT-TGGTGC------T-A--T-ATCA-A-A-C--A-A-T-ACA----A--T---G-T-A-C-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCCG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-T-ATA-T---G-A----A--CA-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACT-----------------------CC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TAGC-T--TCA--T---T-GA-TCGGA---AA---T-C-G--CT-TCTAG-AGGTG
gi|77694 : taattcataTGAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-G------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAA-TGGGG--C-A-CGGA-TC-A-CGTC-GGAA-----T-TGGTAC------T-A--T-A-C--A-C-C--A-ATT-AGG----C--T---ATT-A-C-AATG-T--T-TTAAAAG---TA-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-T-A-A-A-T---ATG----A--AA-A----------T-AA----A-----------------T----GG--TGCTT--AT-ATC---AGGA-TTGTT--ACC-----------------------TA-A-T-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCTT--TCG--T---T-GG-ACGGA---AA---T-C-T--CT-TGTAG-TGGT
gi|77695 : taatTAAAAATTT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTCCGGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-CC-A-A-T-ACA----C--T---G-T-A-T-AATG-T--T-A--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TC--AGA--TGGTT--AA-TTCAA-AGAA-TTGT
gi|77696 : taatTAAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---AGT-ATATT-TTA------AA-AG-TTAAAT-TA--AGA-T-T-T-AAAA-CTTGTTG---T---G-AAAAATGG---TC-A-CGGA-GC-A-CGGC-GGAA----TT--GGTAC------C-A--T-A-CA-A-A-T--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-TTAATG-T--T-TTTAAAG---TC-A-TTTATC--TTTG-AC-A-AA-T----TTG-C--ACT-A-A-A-A-C---G-G----A--AA-A----------A-AA----AAAAT-------------T---AGA--TACTT--AA-ATC-A-AGAA-TGTTT--ACC-----------------------TC-A-------CACG-A-GTAT-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-TAA---TTGCTT--TCGT-T---T-GA-ACGGA---AA---T---G--CT-CATTG-AGGTG
gi|77697 : taatAAAAAATT-CCA-A----T-AT--ATC-C--CT---C-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TT--AGA-T-T-T-AAAA-CT----
gi|77698 : taataAAAAACTT-CCA-A----T-AT--AGT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GAGGTC-A-CGGA-GA-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTACTGTAAAT-G--T-A-CA-A-G-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TTTA-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-G-A-A-G-C---G-A----A--AA-A----------A-AAC---AT----------------T---AGA--TGCTT--CA-ATCGA-GGAA-TTGTG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--G--G--C--AA-T-A-T-T---TTGC-T--TCG--T---T-AA-ATGGA---AA---T-C-T--CT-TATAG-AGGCG
gi|77699 : aataTAAAAACTT-CCA-A----TTAT--ATT-C--TG---AGT-ATATC-T-A------A--------------------T-T-T-AAAA-CT----G-------G-AAAA-TGGGG--T-A-CGGA--C-A-CGTC-G-AA----TT-TGGTAC------TGA--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACC----G--T---G-T-A-T-AATG-T--T-T--ACAG---TC-AAT--ATT--CCTA-AA-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-C-A-A-T---G-A----A--AA-A----------T-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-GGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-TT-T-A-AA--TT-T-C---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77700 : aatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------GA-AG-TTCT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAT----TT-TTGTGC------T-A--T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---G-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-GA-G----T-G-C--ACT-A-A-A-A-T---A-A----A--AA-A----------T-AA----A-----------------T---AAA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TTG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77701 : AAAAAATT-ACA-ACAAAT-AT--AAT-CACCT---ACT-ATATC-T-AT-----AATAG-TTAT-T-TTTAAGA-A-T-T-TAAA-CT----GATTT---T-AAAA-TGGG--TC-A-CGTA-GC-A-CGAC-GGAA----TTATGGTAC------A-A--TTA-CA-A-AAC--T-A-T-ACG----CCGT---T-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TCCA-TT-ATC--TCTG-AT-ACAA-T----T-G-CC-ACT-A-A-AGA-T---G-A----A--AA-A----------A-AA----T-----------------T---AAG--AGCTT--AA--TC-A-GGAA-TTGTTTTACC-----------------------TC-ATT-----CACG-AAGT-T-AGAA--TC-TAT---G--A--C--G--CGTAA-T-AGC-A---TTGC-T--TCG--T---TTGA-ACGAA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77702 : AAAAAGTT-CCA-A----T-ATT-ACT-C--CT---C-T-ATA-C-T-A------AA-AG-TTAT-TCTT--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAA-TGGGGGT--A-CGGA-GC-A-CGAC-GAA------T-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-CTAA-A-T-ACG----C--C---GTT-A-T-AA-G-TTGT-T--AAGGATATT-A-T--CTC--TTTG-AT-A-AGTT----T-G-CAAACTAA-A-A-A-T---G-A----A--AACA----------A-AA----AT----------------T---TGA--TGCTT--AAGATC-A-GGAA-TTGTT--ACCATTAATCTTTTGAGATTAATGCATC-ATT-T---CACGAA-GT-T-A-AA--TC-T-TTA-G--A--C--GGCC--AA-T-A-C-ATTTTTGC----TCT--T---C-GA-ACGAA---AAGGGT-C-G--CT-TATAGAAGGTG
gi|77703 : A-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AG-AG------------------T-T-AAAG-CT----G---T---G--AAA-TTGGGGTC-A-TGGT-CC-A-CGTC-GA-------------AC------T-----------A-A-C--A-A-T-ACT----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-C--GACA---AC-A-T--ATC--T---------AA-T----T-G-C--ACT-G-A-A-A-C---G-AAAACA--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-G-AAAA-TTATC--ACC-----------------------TT-ATT-T---AACG-T-TT-C-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ATGGA---AA---T-C-GCTCT-TATA
gi|77704 : -AT--ATT-G--CG---A-C-ATATC-T-A------AA--G-TTGT-T-TC--AGA-T-T-TTCAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GCCA-CGTC-GGAAAA--TT-TGGTAC------T-A--TCA-CA-A-AAC--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AA--------------G-------------C--TCTG-AC-A-GA-T----T-G----ACT-A-A-A-A-CCCGG-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---ATA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACCT----------------------TC-ATT-TC--CACG-A-AT-T-A-AACTTT-C-T---G--A--C--G--C--AACT-A-T-A---TT-C-T--TCG--T---T--A-ACAGA---AA---TCC-G--CT-TATAG-AG
gi|77705 : --ATT-C--CAC--A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGATT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GGAGTC-A-CGGA-GC-A-CGTA-GGAA----TT-AAGTAC------T-A--T-A-GA-A-A-C--A-A-T-ACA----T--T---A-T-A-T-GATG-T--T-TA-AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-GC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-T-A-C---G-G----A--AA-A----------A-AA----AT----------------T---ATA--TGCTT--AA-ATC---AGAA-TTGTT--TCC-----------------------TC-ATC-T---CAT----GT-T-A-AA---T-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-T-T-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ATAGA---AA---T-C-A--CT-TGTAA-AGGTG
gi|77706 : T-C--TG---A-T-ATGTC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AAA-A-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GGGGTC-A-CGGA-TC-A-C
gi|77707 : -T-A------AA-AG-TGAT-G-TC--AG-----------------------T---G-ATA--TTGAGGTC-A-TGAA-GA-A-TATC-GGAA----TT-TAGAAC------T-A--C-A-CA-A-A-C----A-T-ACACTGTC--T---A-T-A-C-AATG-
gi|77708 : -TGGCAC------T-A--T-A-CA-A-T-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T----------------------------CTG-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-A-A-----C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TAGTT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATA-T-GT-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCC--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTG
gi|77709 : -TGACAC------T-A--T-A-TA-A-T-C--A-A-T-ACA----C--T---T-T-A-T-AATG-T----------------------------CTG-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-A-A-----C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TAGTT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATA-T-GT-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCC--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTG
gi|77710 : -A--T-A-AA-ATA-C--A-A-T-ACG----C--T-----T-A-T-A-TG-T--C-T--GA---------------------G-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-----A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TTTGATA--TGCTT--AA-ATC-ATAGAA-TAGTT--ACT-----------------------TCTATT-A---TATG------T-C-AA--TA-G-T---GC-A--T--G--C--AA-T-A---A---TTGC-TTGTCG--T---T-GAGATGGGCACAA---T-C-G---T-TGTAG-AGGT
gi|77711 : -TTATT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACA-A-CT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-A-GG-----A---T-C-G--CT-CATAG-GG
gi|77712 : --TT-T-T---A--AAGT--G--T--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-CAA--TT-TATAG-AGG
Alignments
lowQualScore : 1 22222222222222222222222222 11111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 3 5555 1 33 3 22 444 5 1 1 1 555555 2 1 1 1 22 1 1 1 1 2 3333 222 222 1 1 5 6 1 3 1 1 1 1 77777 1 888888 2 33 2 2 1 1 2 33 1 2 1 3333 22 55555 1 2 1 2 22 1 55 444 1 3 33 33 3 1 1 3 3333 1 1 33 1 1 1 3 1 222 1 7777 22 1 6666666666 3 44444444444444444444444444 22 22 3 3 3 1 22 88888888888888888888888 1 1 444 1 22 1 3 3 22 1 1 444 44 22 22 22 33 4 1 555 555 4 22 33 222 1 1 222 222 1 1 22 1 1
lowQualScore : . . . .... . .. . .. ... . . . . ...... . . . . .. . . . . . .... ... ... . . . . . . . . . . ..... . ...... . .. . . . . . .. . . . .... .. ..... . . . . .. . .. ... . . .. .. . . . . .... . . .. . . . . . ... . .... .. . .......... . .......................... .. .. . . . . .. ....................... . . ... . .. . . . .. . . ... .. .. .. .. .. . . ... ... . .. .. ... . . ... ... . . .. . .
lowQualScore : 8 8 5 4444 7 77 0 00 111 9 5 4 4 555555 9 4 4 4 00 4 4 4 4 9 0000 666 666 5 5 4 5 5 0 5 5 5 6 44444 5 555555 9 44 9 9 4 4 9 44 4 9 4 0000 00 77777 4 9 4 9 00 5 66 111 5 0 55 55 0 5 5 0 1111 5 5 55 5 5 5 0 5 666 5 2222 00 5 5555555555 0 99999999999999999999999999 00 00 0 0 0 4 00 99999999999999999999999 5 5 111 5 22 5 0 0 00 4 4 555 88 00 00 00 44 3 4 555 000 3 00 44 555 4 4 555 555 4 4 00 4 5
consensus : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
Reference ( family-575 ) : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77680 : --ATT-C--CG---A-T-GCATC-T-A------AA-AA-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAG----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-G-AA-T----T-G-C--ATT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-C----------ATAA----T-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATA-A-AGAA-TTGCT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TCGC-T--CCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77681 : ttaaccttaaatccaactaatttta-CTA-A----T-TT--AAT-C--CA---A-T-GCATC-T-A------AA-AA-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGT--GGAG----TT-TGGTAC------T-AT-T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C------A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-G-AA-T----T-G-C--ATT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-C----------ATAA----T-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATA-A-AG-A-TTGCT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-TAA-C-A---TCGC-T--CCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77682 : ttaaccttaaatccaTAAAAACAT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--ATA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-TAGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CCTC-CGAA----TT-TGGTAC------T-A--A-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-C--T-T--AAAG---TC-A-T--AAC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----AAT---------------T---AAA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTTC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-A-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77683 : ttaatTAAAAATTC-GCATC----T-AT--ATT-C---G---A-T-CTAAT-T-A------AT-AG-TTAT-G-TC--AGA-T-TGT-AAAAACT----G---TTTTA-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TTGTAC------TCA--T-ATCA-A-A-C--A-A-T-ACA----A--TG--G-T-ACT-AGTGTT--T-T--ACAG---TC-A-T--ATA--TCTG-AA-A-AA------T-G-C--ACT-A-ACA-A-T---G-A----A--AA-A----------A-GA----C-----------------T---TG---TGCTT--AA-GTG-A-AG-A-TTGCT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-TT-TGG-AA--TT-T-T---GAAA--C--G--C--AA-T-ATC-A---CTGC-T--T-GTTT---T-GA-CCGGA---GA---T-C-G--GT-TTTAA-AGGTG
gi|77684 : ttaatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-T--CG---A-T-ATATC---A------AA-AG-TTGC-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AACA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CTTC-GGAG----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-T-AA-G----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-ACAAAAAAAAAA-AA----ACCAAAAAAAAAAACACTT---AGA--TCTTT--AA-ATC-A-A-AA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CAGG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTCC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-ATGT
gi|77685 : ttaatAAAACTT-TCA-A----T-AT--ATC-C--TG---A-T-ACATC-T-T------GA-AG-TTAT-T-TC--GGA-T-T---AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TT-A-CGAT-GC-A-CGTC-AGAT----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-G-A-C--A-A-T-ACA----C--T---G-G-A-A-ATTG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ATC-A-A-A-A-T---A-A----A--AA-A----------A-AAGCGAA-----------------T---TGA--TGTTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ATC-----------------------TC-ATT-T---CATG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCA--G---T-AG-ACGAA---AA---T-T-G--AT-TATAA-AGCTG
gi|77686 : ttaatttTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ACATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AAAA-T-GGAGTT-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGTT----TT-TGGTACTACATGT-A--T-A-TA-A-A-C--ATT-T-ACA----C--T---G-T-A-C-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT---A-A-A-C------------------------------A----T-----------------T---TGT--TACCT--GATTTC-A-CGA----GTT--A--------------------------A-ATT-TTGACACA-A----T-A-AA--T-----------A--C--G--------T-A-C-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TA
gi|77687 : ttaatAAAAA--T-CCA-G----T-AT--ATT-A--CA---A-T-ATATC-T-ACATGTAAA-AA-TTCT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---------AAAA-TGGGA-TC-A-CGGA-GG-A-TGTC-GGAA----TT-TGGTTC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--A---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACGA-AG-TACGGT-A-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----G--GA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAT-TTGTT--ACC-----------------------TC-AAT-T---TATG-T-GT-C-A-AA---T-T-T---G--A--A--G--C--AA-T-A-C-A---TTAC-T--TTG--T---T-GA-ACGGA---AT---A-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77688 : ttaattttaaaaTAAAAACAT-CCA-A----T--T--ATT-C--CG---AAT-GTATCAG-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-TGT-T-AAAAACC----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-CGAAAAATTT-TGGTGC------T-A--A-A-CATA-A-C--A-A-TTACA----C--G---A-T-A-T-A--G-C--T-T--AA-G---TC-A-T--AAC--TCTGGAC-A-AA-T----T-T-C--ACT-A-A-A-A-C---G-ATA--A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---TAACCTGCTT--AA-ATC-A-AGAAATTGTT--AC------------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---GA-A--A--G--C--AAGT-ATT-A---TTGCTT--TCG--T---T-GA-ACAGA---AA---T-C-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77689 : ttgatTAAAAACTTTCCA-T----T-AT--ATT-C--C----A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-T-C-T-AAAA-CT----G---T---G--AAA-T-GGGGTC-ATCGGA-GC-A-CGTA-CGA------T-TGGTAC------T-AACT-A-AA-A-C-C--A-ATT-ACA----C--T---A-T-G-T-AATGTT--T-T--GAAG---TC-G-T--ATCT-TCTGTTC-A-AATT----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TTG-GGA--TGCTT---A-TTT-A-AGAA-TTTTG--TCC-----------------------TC-ATTGT---CACG-A-TT-T-ACAA--TT-T-TTTGA--A--CCGG--C--AACT-A-T-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ACGGA---AT---T-C-G--CA-AATAG-
gi|77690 : ttaatTAAAA---T-TCA-G----T-AT--ATT-C--C----A-T-GTATC-T-T------AA-AG-TT-T-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-T-GGGGTCAA-CGGA-GC-A-CGTC-GGCA----TT-TGGCAC------T-A--T-A-C--A-A-C--A-----ACA----C--T---A-T-ACT-AATG-T--TAT--A------TC-ATT--ATC--TCTG-TC-A-AA------T-G-C--ACT-AGA-A-A-C---G-ACC--AGTGA-C----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTTTGAA-ATC-A-AGAA--TG-T--ACCTGGCT------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AG--AT-T-T---G--A--T--G--CA-AA-T-A-T-GGTTTTGC-T--TCG--T---T--A-ACGGA---AA---T-C-G--CG-TATAG-AG
gi|77691 : ttaatAAAGATGT-CCA-AA---T-ATTTATT-C--CGCGAA-TTATATC-T-A------AAGAGATTA--------AGA-T-C---AAAA-CT----G---T---TTAAAA-TGGGTAAC-AACGGAAGC-AACGTC-AGAA----TT-TAAGAC------T-A--T-A-CA-A----------C-ACA----C--TTGAA-TTA-T-AATG-T--T-T--AAAGG--TC-A-T--ATTCGTCCG-AC-A-AA-T----T-GGC--ACT-A-A-A-AAC---G-G----A--AC-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA---GTTT--AA-ATC-ATAGAA-TTGC---ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-T-TT-TCA-AA--TTAT-G---G--A--C--T--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--CCG--TTTAT-AA-ACGGA---AA---T-C-G--CTCTATAG-AGATG
gi|77692 : ttaatttaaTAAAAACAT-CCAGA----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-T-AGGGTC-A-CGGA-GC-
gi|77693 : ttaatAAAAACTT-CCA-A----T-AT--TTT-C--CG---A-T-ACATC-T-A------GA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----C---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGCC-GGAT----TT-TGGTGC------T-A--T-ATCA-A-A-C--A-A-T-ACA----A--T---G-T-A-C-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCCG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-T-ATA-T---G-A----A--CA-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACT-----------------------CC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TAGC-T--TCA--T---T-GA-TCGGA---AA---T-C-G--CT-TCTAG-AGGTG
gi|77694 : taattcataTGAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-G------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAA-TGGGG--C-A-CGGA-TC-A-CGTC-GGAA-----T-TGGTAC------T-A--T-A-C--A-C-C--A-ATT-AGG----C--T---ATT-A-C-AATG-T--T-TTAAAAG---TA-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-T-A-A-A-T---ATG----A--AA-A----------T-AA----A-----------------T----GG--TGCTT--AT-ATC---AGGA-TTGTT--ACC-----------------------TA-A-T-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCTT--TCG--T---T-GG-ACGGA---AA---T-C-T--CT-TGTAG-TGGT
gi|77695 : taatTAAAAATTT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTCCGGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-CC-A-A-T-ACA----C--T---G-T-A-T-AATG-T--T-A--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TC--AGA--TGGTT--AA-TTCAA-AGAA-TTGT
gi|77696 : taatTAAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---AGT-ATATT-TTA------AA-AG-TTAAAT-TA--AGA-T-T-T-AAAA-CTTGTTG---T---G-AAAAATGG---TC-A-CGGA-GC-A-CGGC-GGAA----TT--GGTAC------C-A--T-A-CA-A-A-T--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-TTAATG-T--T-TTTAAAG---TC-A-TTTATC--TTTG-AC-A-AA-T----TTG-C--ACT-A-A-A-A-C---G-G----A--AA-A----------A-AA----AAAAT-------------T---AGA--TACTT--AA-ATC-A-AGAA-TGTTT--ACC-----------------------TC-A-------CACG-A-GTAT-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-TAA---TTGCTT--TCGT-T---T-GA-ACGGA---AA---T---G--CT-CATTG-AGGTG
gi|77697 : taatAAAAAATT-CCA-A----T-AT--ATC-C--CT---C-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TT--AGA-T-T-T-AAAA-CT----
gi|77698 : taataAAAAACTT-CCA-A----T-AT--AGT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GAGGTC-A-CGGA-GA-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTACTGTAAAT-G--T-A-CA-A-G-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TTTA-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-G-A-A-G-C---G-A----A--AA-A----------A-AAC---AT----------------T---AGA--TGCTT--CA-ATCGA-GGAA-TTGTG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--G--G--C--AA-T-A-T-T---TTGC-T--TCG--T---T-AA-ATGGA---AA---T-C-T--CT-TATAG-AGGCG
gi|77699 : aataTAAAAACTT-CCA-A----TTAT--ATT-C--TG---AGT-ATATC-T-A------A--------------------T-T-T-AAAA-CT----G-------G-AAAA-TGGGG--T-A-CGGA--C-A-CGTC-G-AA----TT-TGGTAC------TGA--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACC----G--T---G-T-A-T-AATG-T--T-T--ACAG---TC-AAT--ATT--CCTA-AA-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-C-A-A-T---G-A----A--AA-A----------T-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-GGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-TT-T-A-AA--TT-T-C---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77700 : aatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------GA-AG-TTCT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAT----TT-TTGTGC------T-A--T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---G-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-GA-G----T-G-C--ACT-A-A-A-A-T---A-A----A--AA-A----------T-AA----A-----------------T---AAA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TTG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77701 : AAAAAATT-ACA-ACAAAT-AT--AAT-CACCT---ACT-ATATC-T-AT-----AATAG-TTAT-T-TTTAAGA-A-T-T-TAAA-CT----GATTT---T-AAAA-TGGG--TC-A-CGTA-GC-A-CGAC-GGAA----TTATGGTAC------A-A--TTA-CA-A-AAC--T-A-T-ACG----CCGT---T-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TCCA-TT-ATC--TCTG-AT-ACAA-T----T-G-CC-ACT-A-A-AGA-T---G-A----A--AA-A----------A-AA----T-----------------T---AAG--AGCTT--AA--TC-A-GGAA-TTGTTTTACC-----------------------TC-ATT-----CACG-AAGT-T-AGAA--TC-TAT---G--A--C--G--CGTAA-T-AGC-A---TTGC-T--TCG--T---TTGA-ACGAA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77702 : AAAAAGTT-CCA-A----T-ATT-ACT-C--CT---C-T-ATA-C-T-A------AA-AG-TTAT-TCTT--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAA-TGGGGGT--A-CGGA-GC-A-CGAC-GAA------T-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-CTAA-A-T-ACG----C--C---GTT-A-T-AA-G-TTGT-T--AAGGATATT-A-T--CTC--TTTG-AT-A-AGTT----T-G-CAAACTAA-A-A-A-T---G-A----A--AACA----------A-AA----AT----------------T---TGA--TGCTT--AAGATC-A-GGAA-TTGTT--ACCATTAATCTTTTGAGATTAATGCATC-ATT-T---CACGAA-GT-T-A-AA--TC-T-TTA-G--A--C--GGCC--AA-T-A-C-ATTTTTGC----TCT--T---C-GA-ACGAA---AAGGGT-C-G--CT-TATAGAAGGTG
gi|77703 : A-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AG-AG------------------T-T-AAAG-CT----G---T---G--AAA-TTGGGGTC-A-TGGT-CC-A-CGTC-GA-------------AC------T-----------A-A-C--A-A-T-ACT----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-C--GACA---AC-A-T--ATC--T---------AA-T----T-G-C--ACT-G-A-A-A-C---G-AAAACA--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-G-AAAA-TTATC--ACC-----------------------TT-ATT-T---AACG-T-TT-C-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ATGGA---AA---T-C-GCTCT-TATA
gi|77704 : -AT--ATT-G--CG---A-C-ATATC-T-A------AA--G-TTGT-T-TC--AGA-T-T-TTCAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GCCA-CGTC-GGAAAA--TT-TGGTAC------T-A--TCA-CA-A-AAC--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AA--------------G-------------C--TCTG-AC-A-GA-T----T-G----ACT-A-A-A-A-CCCGG-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---ATA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACCT----------------------TC-ATT-TC--CACG-A-AT-T-A-AACTTT-C-T---G--A--C--G--C--AACT-A-T-A---TT-C-T--TCG--T---T--A-ACAGA---AA---TCC-G--CT-TATAG-AG
gi|77705 : --ATT-C--CAC--A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGATT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GGAGTC-A-CGGA-GC-A-CGTA-GGAA----TT-AAGTAC------T-A--T-A-GA-A-A-C--A-A-T-ACA----T--T---A-T-A-T-GATG-T--T-TA-AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-GC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-T-A-C---G-G----A--AA-A----------A-AA----AT----------------T---ATA--TGCTT--AA-ATC---AGAA-TTGTT--TCC-----------------------TC-ATC-T---CAT----GT-T-A-AA---T-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-T-T-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ATAGA---AA---T-C-A--CT-TGTAA-AGGTG
gi|77706 : T-C--TG---A-T-ATGTC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AAA-A-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GGGGTC-A-CGGA-TC-A-C
gi|77707 : -T-A------AA-AG-TGAT-G-TC--AG-----------------------T---G-ATA--TTGAGGTC-A-TGAA-GA-A-TATC-GGAA----TT-TAGAAC------T-A--C-A-CA-A-A-C----A-T-ACACTGTC--T---A-T-A-C-AATG-
gi|77708 : -TGGCAC------T-A--T-A-CA-A-T-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T----------------------------CTG-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-A-A-----C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TAGTT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATA-T-GT-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCC--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTG
gi|77709 : -TGACAC------T-A--T-A-TA-A-T-C--A-A-T-ACA----C--T---T-T-A-T-AATG-T----------------------------CTG-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-A-A-----C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TAGTT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATA-T-GT-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCC--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTG
gi|77710 : -A--T-A-AA-ATA-C--A-A-T-ACG----C--T-----T-A-T-A-TG-T--C-T--GA---------------------G-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-----A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TTTGATA--TGCTT--AA-ATC-ATAGAA-TAGTT--ACT-----------------------TCTATT-A---TATG------T-C-AA--TA-G-T---GC-A--T--G--C--AA-T-A---A---TTGC-TTGTCG--T---T-GAGATGGGCACAA---T-C-G---T-TGTAG-AGGT
gi|77711 : -TTATT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACA-A-CT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-A-GG-----A---T-C-G--CT-CATAG-GG
gi|77712 : --TT-T-T---A--AAGT--G--T--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-CAA--TT-TATAG-AGG
blockSeqs : T T T CAAA T TT T AC CGA A T A T CATGTA G A A C TA T G G T A TGTT ATT TTT T A G G A T A C A C AAAAT A TACATG C AC T T T T A TA T T T CTGT CG TGAA T C T T TG A TA ATA C T TT CG G G C T ACGG T G AA A G C T A CCG T AAAC GT C CAAAAAAAAA T ACCAAAAAAAAAAACACTT CC TG T A T A TT ATTAATCTTTTGAGATTAATGCA T G TGA A AG A G C CT A A TTG AA AG CG GC GT G A TC GTT T TG TT TTA T G CAC GGG C A CT C A
blockSeqs : C . G A . T T . C G . . . T T . . . . . . . . A . . . . . A G . A . . . . AAA . TGTAAA G T C T . . A C . T . . . GG . C . T . . TT G . A T T T . . T . . . C . . . G . . . TA . . . . GCGAAT . . G G T . . TGGCT . . C . G . C G . . . TA A . . . A C . TT TTT T . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . AAAATT . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . C . . . . C . TA . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTTG . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AATT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATTG . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATC . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
finalCons : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
Alignments
lowQualScore : 1 22222222222222222222222222 11111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 3 5555 1 33 3 22 444 5 1 1 1 555555 2 1 1 1 22 1 1 1 1 2 3333 222 222 1 1 5 6 1 3 1 1 1 1 77777 1 888888 2 33 2 2 1 1 2 33 1 2 1 3333 22 55555 1 2 1 2 22 1 55 444 1 3 33 33 3 1 1 3 3333 1 1 33 1 1 1 3 1 222 1 7777 22 1 6666666666 3 44444444444444444444444444 22 22 3 3 3 1 22 88888888888888888888888 1 1 444 1 22 1 3 3 22 1 1 444 44 22 22 22 33 4 1 555 555 4 22 33 222 1 1 222 222 1 1 22 1 1
lowQualScore : . . . .... . .. . .. ... . . . . ...... . . . . .. . . . . . .... ... ... . . . . . . . . . . ..... . ...... . .. . . . . . .. . . . .... .. ..... . . . . .. . .. ... . . .. .. . . . . .... . . .. . . . . . ... . .... .. . .......... . .......................... .. .. . . . . .. ....................... . . ... . .. . . . .. . . ... .. .. .. .. .. . . ... ... . .. .. ... . . ... ... . . .. . .
lowQualScore : 8 8 5 4444 7 77 0 00 111 9 5 4 4 555555 9 4 4 4 00 4 4 4 4 9 0000 666 666 5 5 4 5 5 0 5 5 5 6 44444 5 555555 9 44 9 9 4 4 9 44 4 9 4 0000 00 77777 4 9 4 9 00 5 66 111 5 0 55 55 0 5 5 0 1111 5 5 55 5 5 5 0 5 666 5 2222 00 5 5555555555 0 99999999999999999999999999 00 00 0 0 0 4 00 99999999999999999999999 5 5 111 5 22 5 0 0 00 4 4 555 88 00 00 00 44 3 4 555 000 3 00 44 555 4 4 555 555 4 4 00 4 5
consensus : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
Reference ( family-575 ) : TAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77680 : --ATT-C--CG---A-T-GCATC-T-A------AA-AA-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAG----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-G-AA-T----T-G-C--ATT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-C----------ATAA----T-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATA-A-AGAA-TTGCT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TCGC-T--CCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77681 : ttaaccttaaatccaactaatttta-CTA-A----T-TT--AAT-C--CA---A-T-GCATC-T-A------AA-AA-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGT--GGAG----TT-TGGTAC------T-AT-T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C------A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-G-AA-T----T-G-C--ATT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-C----------ATAA----T-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATA-A-AG-A-TTGCT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-TAA-C-A---TCGC-T--CCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77682 : ttaaccttaaatccaTAAAAACAT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--ATA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-TAGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CCTC-CGAA----TT-TGGTAC------T-A--A-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-C--T-T--AAAG---TC-A-T--AAC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----AAT---------------T---AAA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTTC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-A-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77683 : ttaatTAAAAATTC-GCATC----T-AT--ATT-C---G---A-T-CTAAT-T-A------AT-AG-TTAT-G-TC--AGA-T-TGT-AAAAACT----G---TTTTA-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAA----TT-TTGTAC------TCA--T-ATCA-A-A-C--A-A-T-ACA----A--TG--G-T-ACT-AGTGTT--T-T--ACAG---TC-A-T--ATA--TCTG-AA-A-AA------T-G-C--ACT-A-ACA-A-T---G-A----A--AA-A----------A-GA----C-----------------T---TG---TGCTT--AA-GTG-A-AG-A-TTGCT--A-C-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-TT-TGG-AA--TT-T-T---GAAA--C--G--C--AA-T-ATC-A---CTGC-T--T-GTTT---T-GA-CCGGA---GA---T-C-G--GT-TTTAA-AGGTG
gi|77684 : ttaatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-T--CG---A-T-ATATC---A------AA-AG-TTGC-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AACA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CTTC-GGAG----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-T-AA-G----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-ACAAAAAAAAAA-AA----ACCAAAAAAAAAAACACTT---AGA--TCTTT--AA-ATC-A-A-AA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CAGG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTCC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-ATGT
gi|77685 : ttaatAAAACTT-TCA-A----T-AT--ATC-C--TG---A-T-ACATC-T-T------GA-AG-TTAT-T-TC--GGA-T-T---AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TT-A-CGAT-GC-A-CGTC-AGAT----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-G-A-C--A-A-T-ACA----C--T---G-G-A-A-ATTG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ATC-A-A-A-A-T---A-A----A--AA-A----------A-AAGCGAA-----------------T---TGA--TGTTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ATC-----------------------TC-ATT-T---CATG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCA--G---T-AG-ACGAA---AA---T-T-G--AT-TATAA-AGCTG
gi|77686 : ttaatttTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ACATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----A---T---G-AAAA-T-GGAGTT-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGTT----TT-TGGTACTACATGT-A--T-A-TA-A-A-C--ATT-T-ACA----C--T---G-T-A-C-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT---A-A-A-C------------------------------A----T-----------------T---TGT--TACCT--GATTTC-A-CGA----GTT--A--------------------------A-ATT-TTGACACA-A----T-A-AA--T-----------A--C--G--------T-A-C-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TA
gi|77687 : ttaatAAAAA--T-CCA-G----T-AT--ATT-A--CA---A-T-ATATC-T-ACATGTAAA-AA-TTCT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---------AAAA-TGGGA-TC-A-CGGA-GG-A-TGTC-GGAA----TT-TGGTTC------T-A--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACA----C--A---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-ACGA-AG-TACGGT-A-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----G--GA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAT-TTGTT--ACC-----------------------TC-AAT-T---TATG-T-GT-C-A-AA---T-T-T---G--A--A--G--C--AA-T-A-C-A---TTAC-T--TTG--T---T-GA-ACGGA---AT---A-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77688 : ttaattttaaaaTAAAAACAT-CCA-A----T--T--ATT-C--CG---AAT-GTATCAG-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-TGT-T-AAAAACC----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTC-CGAAAAATTT-TGGTGC------T-A--A-A-CATA-A-C--A-A-TTACA----C--G---A-T-A-T-A--G-C--T-T--AA-G---TC-A-T--AAC--TCTGGAC-A-AA-T----T-T-C--ACT-A-A-A-A-C---G-ATA--A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---TAACCTGCTT--AA-ATC-A-AGAAATTGTT--AC------------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---GA-A--A--G--C--AAGT-ATT-A---TTGCTT--TCG--T---T-GA-ACAGA---AA---T-C-A--TT-TATAG-AGGTG
gi|77689 : ttgatTAAAAACTTTCCA-T----T-AT--ATT-C--C----A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-T-C-T-AAAA-CT----G---T---G--AAA-T-GGGGTC-ATCGGA-GC-A-CGTA-CGA------T-TGGTAC------T-AACT-A-AA-A-C-C--A-ATT-ACA----C--T---A-T-G-T-AATGTT--T-T--GAAG---TC-G-T--ATCT-TCTGTTC-A-AATT----T-G-C--ACT-A-A-A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TTG-GGA--TGCTT---A-TTT-A-AGAA-TTTTG--TCC-----------------------TC-ATTGT---CACG-A-TT-T-ACAA--TT-T-TTTGA--A--CCGG--C--AACT-A-T-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ACGGA---AT---T-C-G--CA-AATAG-
gi|77690 : ttaatTAAAA---T-TCA-G----T-AT--ATT-C--C----A-T-GTATC-T-T------AA-AG-TT-T-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-T-GGGGTCAA-CGGA-GC-A-CGTC-GGCA----TT-TGGCAC------T-A--T-A-C--A-A-C--A-----ACA----C--T---A-T-ACT-AATG-T--TAT--A------TC-ATT--ATC--TCTG-TC-A-AA------T-G-C--ACT-AGA-A-A-C---G-ACC--AGTGA-C----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTTTGAA-ATC-A-AGAA--TG-T--ACCTGGCT------------------TC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AG--AT-T-T---G--A--T--G--CA-AA-T-A-T-GGTTTTGC-T--TCG--T---T--A-ACGGA---AA---T-C-G--CG-TATAG-AG
gi|77691 : ttaatAAAGATGT-CCA-AA---T-ATTTATT-C--CGCGAA-TTATATC-T-A------AAGAGATTA--------AGA-T-C---AAAA-CT----G---T---TTAAAA-TGGGTAAC-AACGGAAGC-AACGTC-AGAA----TT-TAAGAC------T-A--T-A-CA-A----------C-ACA----C--TTGAA-TTA-T-AATG-T--T-T--AAAGG--TC-A-T--ATTCGTCCG-AC-A-AA-T----T-GGC--ACT-A-A-A-AAC---G-G----A--AC-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA---GTTT--AA-ATC-ATAGAA-TTGC---ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-T-TT-TCA-AA--TTAT-G---G--A--C--T--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--CCG--TTTAT-AA-ACGGA---AA---T-C-G--CTCTATAG-AGATG
gi|77692 : ttaatttaaTAAAAACAT-CCAGA----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CC----G---T---G-AAAA-T-AGGGTC-A-CGGA-GC-
gi|77693 : ttaatAAAAACTT-CCA-A----T-AT--TTT-C--CG---A-T-ACATC-T-A------GA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----C---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGCC-GGAT----TT-TGGTGC------T-A--T-ATCA-A-A-C--A-A-T-ACA----A--T---G-T-A-C-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCCG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-T-ATA-T---G-A----A--CA-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACT-----------------------CC-ATT-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TAGC-T--TCA--T---T-GA-TCGGA---AA---T-C-G--CT-TCTAG-AGGTG
gi|77694 : taattcataTGAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-GTATC-T-G------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAA-TGGGG--C-A-CGGA-TC-A-CGTC-GGAA-----T-TGGTAC------T-A--T-A-C--A-C-C--A-ATT-AGG----C--T---ATT-A-C-AATG-T--T-TTAAAAG---TA-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-T-A-A-A-T---ATG----A--AA-A----------T-AA----A-----------------T----GG--TGCTT--AT-ATC---AGGA-TTGTT--ACC-----------------------TA-A-T-T---CACG-A-GT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGCTT--TCG--T---T-GG-ACGGA---AA---T-C-T--CT-TGTAG-TGGT
gi|77695 : taatTAAAAATTT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GC-A-CGTCCGGAA----TT-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-CC-A-A-T-ACA----C--T---G-T-A-T-AATG-T--T-A--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-A-A-T---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TC--AGA--TGGTT--AA-TTCAA-AGAA-TTGT
gi|77696 : taatTAAAAAATT-TCA-A----T-AT--ATTTC--CG---AGT-ATATT-TTA------AA-AG-TTAAAT-TA--AGA-T-T-T-AAAA-CTTGTTG---T---G-AAAAATGG---TC-A-CGGA-GC-A-CGGC-GGAA----TT--GGTAC------C-A--T-A-CA-A-A-T--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-TTAATG-T--T-TTTAAAG---TC-A-TTTATC--TTTG-AC-A-AA-T----TTG-C--ACT-A-A-A-A-C---G-G----A--AA-A----------A-AA----AAAAT-------------T---AGA--TACTT--AA-ATC-A-AGAA-TGTTT--ACC-----------------------TC-A-------CACG-A-GTAT-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-TAA---TTGCTT--TCGT-T---T-GA-ACGGA---AA---T---G--CT-CATTG-AGGTG
gi|77697 : taatAAAAAATT-CCA-A----T-AT--ATC-C--CT---C-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TT--AGA-T-T-T-AAAA-CT----
gi|77698 : taataAAAAACTT-CCA-A----T-AT--AGT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GAGGTC-A-CGGA-GA-A-CGTC-GGAA----TT-TGGTACTGTAAAT-G--T-A-CA-A-G-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TTTA-AC-A-AA-T----T-G-C--ACT-G-A-A-G-C---G-A----A--AA-A----------A-AAC---AT----------------T---AGA--TGCTT--CA-ATCGA-GGAA-TTGTG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--G--G--C--AA-T-A-T-T---TTGC-T--TCG--T---T-AA-ATGGA---AA---T-C-T--CT-TATAG-AGGCG
gi|77699 : aataTAAAAACTT-CCA-A----TTAT--ATT-C--TG---AGT-ATATC-T-A------A--------------------T-T-T-AAAA-CT----G-------G-AAAA-TGGGG--T-A-CGGA--C-A-CGTC-G-AA----TT-TGGTAC------TGA--T-A-CA-A-A-C--A-A-T-ACC----G--T---G-T-A-T-AATG-T--T-T--ACAG---TC-AAT--ATT--CCTA-AA-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-C-A-A-T---G-A----A--AA-A----------T-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-GGAA-TTGTT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-TT-T-A-AA--TT-T-C---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77700 : aatTAAAAACTT-CCA-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------GA-AG-TTCT-T-TC--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGGGTC-A-CGGA-GC-A-CGTC-GGAT----TT-TTGTGC------T-A--T-A-CC-A-A-C--A-A-T-ACA----C--T---G-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-AC-A-GA-G----T-G-C--ACT-A-A-A-A-T---A-A----A--AA-A----------T-AA----A-----------------T---AAA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTG--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACG-A-AT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TTG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77701 : AAAAAATT-ACA-ACAAAT-AT--AAT-CACCT---ACT-ATATC-T-AT-----AATAG-TTAT-T-TTTAAGA-A-T-T-TAAA-CT----GATTT---T-AAAA-TGGG--TC-A-CGTA-GC-A-CGAC-GGAA----TTATGGTAC------A-A--TTA-CA-A-AAC--T-A-T-ACG----CCGT---T-T-A-T-AATG-T--T-T--AAAG---TCCA-TT-ATC--TCTG-AT-ACAA-T----T-G-CC-ACT-A-A-AGA-T---G-A----A--AA-A----------A-AA----T-----------------T---AAG--AGCTT--AA--TC-A-GGAA-TTGTTTTACC-----------------------TC-ATT-----CACG-AAGT-T-AGAA--TC-TAT---G--A--C--G--CGTAA-T-AGC-A---TTGC-T--TCG--T---TTGA-ACGAA---AA---T-C-G--CT-TATAG-AGGTG
gi|77702 : AAAAAGTT-CCA-A----T-ATT-ACT-C--CT---C-T-ATA-C-T-A------AA-AG-TTAT-TCTT--AGA-T-T-T-AAAA-CT----G---T---T-AAAA-TGGGGGT--A-CGGA-GC-A-CGAC-GAA------T-TGGTAC------T-A--T-A-CA-A-A-CTAA-A-T-ACG----C--C---GTT-A-T-AA-G-TTGT-T--AAGGATATT-A-T--CTC--TTTG-AT-A-AGTT----T-G-CAAACTAA-A-A-A-T---G-A----A--AACA----------A-AA----AT----------------T---TGA--TGCTT--AAGATC-A-GGAA-TTGTT--ACCATTAATCTTTTGAGATTAATGCATC-ATT-T---CACGAA-GT-T-A-AA--TC-T-TTA-G--A--C--GGCC--AA-T-A-C-ATTTTTGC----TCT--T---C-GA-ACGAA---AAGGGT-C-G--CT-TATAGAAGGTG
gi|77703 : A-A----T-AT--ATT-C--CG---A-T-ATATC-T-A------AG-AG------------------T-T-AAAG-CT----G---T---G--AAA-TTGGGGTC-A-TGGT-CC-A-CGTC-GA-------------AC------T-----------A-A-C--A-A-T-ACT----C--T---A-T-A-T-AATG-T--T-C--GACA---AC-A-T--ATC--T---------AA-T----T-G-C--ACT-G-A-A-A-C---G-AAAACA--AA-A----------A-AA----A-----------------T---AGA--TGCTT--AA-ATC-G-AAAA-TTATC--ACC-----------------------TT-ATT-T---AACG-T-TT-C-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-ATGGA---AA---T-C-GCTCT-TATA
gi|77704 : -AT--ATT-G--CG---A-C-ATATC-T-A------AA--G-TTGT-T-TC--AGA-T-T-TTCAAA-CT----G---T---G-AAAA-TGGGG-TC-A-CGGA-GCCA-CGTC-GGAAAA--TT-TGGTAC------T-A--TCA-CA-A-AAC--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AA--------------G-------------C--TCTG-AC-A-GA-T----T-G----ACT-A-A-A-A-CCCGG-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------T---ATA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TTGTT--ACCT----------------------TC-ATT-TC--CACG-A-AT-T-A-AACTTT-C-T---G--A--C--G--C--AACT-A-T-A---TT-C-T--TCG--T---T--A-ACAGA---AA---TCC-G--CT-TATAG-AG
gi|77705 : --ATT-C--CAC--A-T-ATATC-T-A------AA-AG-TTAT-T-TC--AGATT-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GGAGTC-A-CGGA-GC-A-CGTA-GGAA----TT-AAGTAC------T-A--T-A-GA-A-A-C--A-A-T-ACA----T--T---A-T-A-T-GATG-T--T-TA-AAAG---TC-A-T--ATC--TCTG-GC-A-AA-T----T-G-C--ACT-A-A-T-A-C---G-G----A--AA-A----------A-AA----AT----------------T---ATA--TGCTT--AA-ATC---AGAA-TTGTT--TCC-----------------------TC-ATC-T---CAT----GT-T-A-AA---T-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-T-T-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ATAGA---AA---T-C-A--CT-TGTAA-AGGTG
gi|77706 : T-C--TG---A-T-ATGTC-T-A------AA-AG-TTGT-T-TC--AAA-A-T-T-AAAA-CT----G---T---G-AAAA-T-GGGGTC-A-CGGA-TC-A-C
gi|77707 : -T-A------AA-AG-TGAT-G-TC--AG-----------------------T---G-ATA--TTGAGGTC-A-TGAA-GA-A-TATC-GGAA----TT-TAGAAC------T-A--C-A-CA-A-A-C----A-T-ACACTGTC--T---A-T-A-C-AATG-
gi|77708 : -TGGCAC------T-A--T-A-CA-A-T-C--A-A-T-ACA----C--T---A-T-A-T-AATG-T----------------------------CTG-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-A-A-----C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TAGTT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATA-T-GT-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCC--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTG
gi|77709 : -TGACAC------T-A--T-A-TA-A-T-C--A-A-T-ACA----C--T---T-T-A-T-AATG-T----------------------------CTG-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-A-A-----C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TT--AGA--TGCTT--AA-ATC-A-AGAA-TAGTT--ACT-----------------------TC-ATT-T---TATA-T-GT-C-A-AG--T--------G--A--T--G--C--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCC--T---T-GA-ACGGA---AA---T-C-G--CT-TGTAG-AGGTG
gi|77710 : -A--T-A-AA-ATA-C--A-A-T-ACG----C--T-----T-A-T-A-TG-T--C-T--GA---------------------G-AG-A-GA-T----T-G-C--ACT-----A-A-C---G-A----A--AA-A----------A-AA----A-----------------TTTGATA--TGCTT--AA-ATC-ATAGAA-TAGTT--ACT-----------------------TCTATT-A---TATG------T-C-AA--TA-G-T---GC-A--T--G--C--AA-T-A---A---TTGC-TTGTCG--T---T-GAGATGGGCACAA---T-C-G---T-TGTAG-AGGT
gi|77711 : -TTATT--ACC-----------------------TC-ATT-T---CACA-A-CT-T-A-AA--TT-T-T---G--A--C--G--C--AA-T-A-C-A---TTGC-T--TCA--T---T-GA-A-GG-----A---T-C-G--CT-CATAG-GG
gi|77712 : --TT-T-T---A--AAGT--G--T--AA-T-A-T-A---TTGC-T--TCG--T---T-GA-ACGGA---AA---T-CAA--TT-TATAG-AGG