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Reference ( gi|34943 )        : TGTTTGCAACCGTTAAATCAGCCATTAA----CG--CG----TCACAAATGAGAAGGTAG-T-A--CCCATTCTAATGCAATTTTGCTTTTATATTTACATTTGATTTTGCTACTTTTTTTTATGAAATGT-TAAATGC-TGACGCTTTATAGTTTTT--ATCACAAGGCATTATGACGGCCACAATCGAAAGC-TCCCATCCAAACTAGACACAGCATATAGACCTGTAAGCATAAAGATAGTTTAAAAATGTAATATTGGATAGCATA-CT-CAT-GC--CTAATTTTAACAATCTACAATAGGCCAACTGTAAAACAATATTGAGAATGAATGTATGAAAAGAATTTTAAAAATGTTAGGCCTATTTCTGCATGCATGCTCTTGTTTGATATGCCGTATA--------AACTC-TCG-AAAGATCTATGAAGTTTCGATAATTTGATTA-TTTTCTCTCAGTCT-GGT-AAT-TACTCAGTTAAGTTAAAAAATG--ATACAATCCCATAAATTAAATTGTTTTTTGAAAGTTT--ATAC--AATTGACAA-GTCAAGAATC-TG-ACATATTTGTATTA-C-GGAAAT-----------CTT-TCTATTACATCCCGGGGAGGGCGCTGCTGA-GC-GGGGAACATA-TTTCCC-GCCACAGAG-AGTCGGCGATCCCTTTGCTTAACGTCTATGCGACACAGGGCATTATGGGTAGGATGCTTTCCCAATCTTGTGATGTTTT-GCGGTCACGGCATTATGACGTCACAATCGAAAGCTTTCCCTTCTCGTTAACGCTCATTTAACCCACCAAACCTTCACGCAGAGGTGTTCCGCACGCAAAAACGGTAGGGTTGTTGCTAAGACACAGGGCATAAGGGTAGATGATTTAACCACCTTCAAATCTCAGTGTATCATCCCAATCAAAATACGTGTTACAAAACAATTGCCATTAGAATGAAAGA-ATCAGA----ATTTCTTTGGGAACTCAAACGTTGATATGTACTTGAAAAAAAATATTAAAAA---AATAA-----AGT-GATT---AGTTACC-T-AATTGG---AAGG-G--TT--TT--------G-TTGTT---TT--A-TTA-A---AT-TTA-AA-AAT---ATT-TTC-----TAG-C-T-A-CT-TTG--GT--G--TCT------T---AT----C------G-----CG--G---GTC-AATAG--T------TTT--G-----A-A--T-TT--G--CGAC-CGG-C---G-ATC---TAT-TG-ACCG----GCA-A--T-A--T-TGAGGGA-AA-C-TG-A-TGCATTG----CT--AAC--A-T--GACG-TT-C-GT-A-A-CGCAACGTAA-T-G--C-A--A-C--AGAC-TT----T----AAA----G---ACGT-CAT-A-G----------A--AG-TA-GCA-A--T--G-T---A-ATG-CG---GG-AAA---T--------------TT--T--A-CA--AGG--------A---T--------T--AA-AAA-----TGACAT--TT----TATA--A--T---AC----T--TTTCCAC--G-TT-----AAA--TTA--T--AAG--C--ACT-----AACAAC-ACA--T-AT-----TCATG-----A-----TA-AT-T--A--GG--T--A-ATAAAAACAG-T-AT-T---TTA-AT---GT--C--T-GATC----CAG----T--C--AA--TAG-A-C--C--G-A----A---T-A---T-------T------TT---T-CC-------CT-C----G----------G---------------------T-A---T--------G----GG--------------------------C----A-G---C-----T-------------------------G-C----------------------G-------------C------------C------TC------------G-------G-----G-------C-----------C---------------C---------A---A-----------T---AG--A--A--C--GT--C-AT-TTGA-G-----C-TG--TT----C--C---A-G-TA--CC-T---C-------G-G---GA--AA--AA-AT---A---T----CCGCGT-CTA-TTG---GATCTG-ATC-A--G--ACAT-TGA---AAT-AA-C-TG---T-A--TATA----GA---ATT--CATGA--GTAA-------TTAATGGG----ATTTTTT---TTTAAAAAATAAAAAAAGAATAAAAGGCTATAGATAGAGGATCTTGAATGAGCCGCTTATATGGCATATG---------AAATGAGTTACCGGATTTA---TATTTCCCGAAGCCTTGGCGGAGGGAAATATTTTAAA-CCGGTAACGAATTTAATAAATTGCAGATGCCATAAGCACC--AA-GTATAAG-AATTCTATTT--ATTCCCC-C------CCCGG--GGGGGG--GGG--G--T-T--C--TCAAC-CC--TA-TA---C---T--T----T---G-G------T-----A-----C-----A------G--A-C--GT-C-CCGC--GT---TG--AG-----A---------T-T--T-----C---A-A--C-CA-CC-C-C-----C----------------C----A----T----A----AA-TA-T--A-TT-C--AATG-AT-T-GTTTGAAAA------C---CA-T--A--CCC--A-T------T-C-A-T-A-TATT--T--CC---G---T-T----GAAA-AA--T-CTG-AT--C--C---CA--T-A-T-C--A--TA---T--A-TT--TT-A-T-A--C-C-C-AAA-----T------T-----TG---T--AC----CT-----AT-GC-T-A------T--GC--A-------T--AG-TT----G--C-C-G-CC-C------A-T--------T-C--A-A--G--TA-AG---T-G---C-A----------G-A----GTG-----A-TA-AT-T----A-T-A--C-C-C--G-G----T-T-T------T-A-GT-T--------------TAC-TTTA--T--AT-T----------A---TC----G-GTAAA-----A-A-TGT-C----C---A---G---A-TA---TT--T----C-A--T-G----A--T-------AC-----------A----A---CCT------T-AT-T---A----G---AGG--A---T---T-G-A-A-C-T--CC-------------AG--C----AA--------------------A-T----------------------T----A--A-----------AT-----------T---------T----------G----A-----------------G-----C-A--T-----AT------T----TA-A-----------A--------------AAT----T-G-TCT-TA-CC-C-A-T-TGA-ATATAAC-CA-A----G-A-TT--GA--T-G-A-A-A--A-TG-GCA--ACCCCA--TT--G-A--TA-T-----A--T-T-G-GA-CTTGTC-----------------AA-A--AAAGCG-AC-C---CAT-------A------A-CC-A---G-CGG--C--A--CG-T-----C----GTG-T---G---TA-T---A--AG--C-A-A--TA-CAT-A------GA-A-GA---G---G---------TCCC--C--C--CGG-G-ATATT-A-TA-TATCACACACCAGGTT-ATCATTAAACGC---ATAA-ATTTGATTTACTTTCTATTTCACAACCTTTTCAGGC-------CTTTTTTCATCATTTAGAATGATATTGATCAGAGAGAGAAGAGAGAGAGATGAGAATGAGAGAGAGAGAGAGAATAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGACGAATAT
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gi|34947                      : TGTTTGCAACCGTTAAATCAG-CATTAACGGTCG--CA----TCACAAATGAGAAGGTAGTT-ATTCCCATTCTAATGCAATTTTGC-TGTATGTTTACATTTG--TTTGCTA---TTTGTTATGAAATGTCT--ACGCTTGACG--TTATATTTTGC--GTCAC---GCATTATGAC-GTCACAATCGAAAGC-TTCCATC
gi|35018                      :                                                                                                                                                                                                                                          ATTAAAATATTTTAAAC-TGTAAATTTGAATGAC-TATCTACATTGCAACT--TTTTAACAATCTACAATAGGCCAACTGTAAAACAG-AT-GAGAATGAATGT-TAAAATG---TTTAAAA-TG--ACG---ATT-CTGCATGCATGGTCTTGTTTGATATGCCGTATA--------AACTCTTCGAAAAGATCTATGAAGTTTCGATAATT--GTTATTTTTCTC-CAGTCTGGGTAAAT-TACTCAGTTA--T--AAAAATGTCATACAAT-CCAT-AATT--ATTG-TTTTTGAAAGTTT--TTAC---ATTGACAA-GTCAAGAATCGTGTACATATTTGTATTACC-GGAAAT-----------CTTATCTA-TAGATCTCCGTGAGGGCG-TGCTGAGGCGGGGGAACATATTTTCCC-GCCACAGAGAAGTCGGCGATTCCCTTGCTT
gi|35019                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTTAACAATCTGCAATAGGCCAACTCAAAAACAGC-TTGAAAATGAA-------------TTTTAAAAATGATG----TATTTCTGCATGCATGGTCTTTTTTGGTGTGTCATATA--------AACTC-TCG-AAAGACCTATGAAGTTTCGATAATT--GTTA-ATTTCTC-CAGTCT-GGT-AATATACTCAGTTAA--TAAAAAATGTTATAC-ATGCCAT-AGTT-AATTG-TTTTTGAAAGTTT--ATTG--GATTGAC
gi|35020                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTATCAATCTACAATAGGCCAACTCAAAAACA
gi|35020                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTTCTGCATGCAT--------TTGATGTGCCATATACGAAATAAAACTC-TCG-AAGGACCTATGAAGATTCAATAATT--GTTA-TTTTCTC-CAGCCT-GGC-AAT-TTCTCA-----GTT-------------------CATAA------TTGTTTTT-GAAAGTTTTAATATTAGATTGACAAAGTCGAAAATCGTGTACATATTTGTATAACC-GGAAACCTTCCCGCTCGCTT-TCTA-TACATCCCGGTGAGGGCACTGCTGA-GT-GGGGAACATATTTTCCT-GCCACAGAG-AGTCGGCAATCCCTTTGCTTTACGTCTATGgctacatagtatttctgcatgcatttgatgtgccatatacgaaataaaactctcgaaggacctatgaagattcaataattgttattttctccagcctggcaatttctcagttcataattgtttttgaaagttttaatattagattgacaaagtcgaaaatcgtgtacatatttgtataaccggaaaccttcccgctcgctttctatacatcccggtgagggcactgctgagtggggaacatattttcctgccacagagagtcggcaatccctttgctttacgtctatg
gi|35024                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttatcaatctacaataggccaactcaaaaacagctacatagGTTTCGATAATTGG--TA-TTTTCT-TCAGTCT-GG------------GTTAA--TAAGAAATGTTATACAAGTC-ATAGTTTA--TTATTTTT-GAAAGTTT--ATTA--GATCCACAA-GTCAAGA------------TCTGTATTA-CCGGAAAT-----------CTT-TCTAT-ACATCCCGGTGAGGGCGCTGCTGA-GC-TGGGAACATA-TTTTCCAGCCACAGAG-AGTCGGCGATCCCT
gi|35025                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGATTGTTTTT-GAAAGTTT--ATTA--GATTGACAA-GTCAAGAATCGTGTACATATTTGTATTACC-GGAAAT-----------CTT-TCTA-TACATCCCGGTGAGGGCGCTGCTGA-GC-GGGGAACATATTTTCCC-GCCACAGAG-AGTCGGCGATCCCTTTGCTTTACGCCTATGC
gi|34944                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTTATGTTTTTGCG-TCACGGCATTATGACGTCACAATCGAAAGC--TCCCATC
gi|34947                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgtttgcaaccgttaaatcagcattaacggtcgcaaatcacaaatgagaaggtagttattcccattctaatgcaattttgctgtatgtttacatttgttttgctattttgttatgaaatgtttatgcttgacGTTATATTTT-GCG-TCACG-CATTATGACGTCACAATCGAAAGCTTCC
gi|35096                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtttgcaaccgttaaatcagcattaacggtcgcatcacaaatgagaaggtagttattcccattctaatgcaattttgctgtatgtttacatttgtttgctatttgttatgaaatgtctacgcttgacAACAATGGCTAT------GAAACATATCAGACAGCATTT------GGACTCAA----TGATAGGT-C----------ATATTGGTAA---ACTAA-----ATT-GTTT---TATTAC--T-AATTG-----AGG-G--TT--T---------G-TTGTT---T---A-TTA-C---ATATTA-AA---T---ATT-TTC------AG-C-T-A-TT-TTGT-GT--G--ACT----------ATTGGAC------G-----CC--G---GTC-AATAG--T------TTTT-G-----A-A--T-TT--T--GGAC-CGG-C---G-ATC---TAT--G-ACCG----GCA-A----A--T-TGAGGGA-AT-C-TG-A-TGCATTG----CT--AACT-A-T--GACG-TT-C-GT-A-A-C--AA-GTA--T-GACT-A--A-T--AGAC-TC----------AT----G---ACGT-CAT-A-G----------T--AG-T--GCA-A--T--G-T---A-ATG-----------A---T--------------TT---------------------------------------A-AAA-----TG-CAT--TA----CATA-----T----C----T--TTTCCAC--G-CTTAAAAAAA--TT---T--A-G--C--AC------ATCAA--AC---T-AC-----GTATG-----------TA-AT-T--A--GG--T--A-ATCA---CAG-T-TA-T---TTA-AT---GT--C--T-GATC-----AG----T--C--AA--TAG-A-C--C--G-A----A-----A---T-------T------TT---T--C-------CT-C----G----------G---------------------T-A---TTG------G----GA--------------------------C----A-G---CTCAA-T-------------------------G-CACGTTTATT-------------G-------------C------------C------TC------------GCT-----G-----G-------CG----------CTCGGG----------C---------A---A-----------T---AG--A--AC-C--GTG-C-A--TTGA-G-----C-TG--TT----CCGC---A-G-TA--CC-T---C-------G-G---GG--AA--AATAT-------T----CCG-GT-CT--TTG---A--CTG-ATC-A--G--ACAT-T-A---AAT-AA-C-TG---T-A--TAatc
gi|35099                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAATATTCGAAATGCAATAATTATAAAT-GTTT---A-TTACC-T-AATTG----AAGG-G--TT--TT--------G-TTGTT---TT--AATTA-G---ATATTA-A----T---ATT-TT------TAG---T-A--T-TTG--TTT-G--TCTATTGGAC---AC----C------G-----CC--G---GTC-AATAG--T------TTTTGA-----A-A--TATT--G---GAC-CGG-C---G-ATC---TAT-TG-ACCG----GCA-A--T-A--T-TGAGGAA-TA-T-TG-A-TGCATTG----CT--A----A-T--GACG-TT-C-GT-A-A-CGCAACGTAA-A-G--CAA--A-T--AGAC-TT----C----AAA----ATGCACGT-CAT-A-G----------T--GG-TACGCA-A--T--GAT---ATAT-------AG-AAA---T--------------TT--T--A-CA--A---------------------------------------------TT----TAC---A--T---AC----TACTTTCCACGAG-TT-----AAA--AAA--T--AAGACC--ACT-----AAGAA--ACA--T-AT-----ACATG-----------TA-A--T--A--GG--T--A-AT-AAAAC-G-T-AT-T---TTA-AT---GT--C--T-GAT-----CAG----T--C--AAT-TAG-A----C--G-G----A---T-A---T-------T------TT---T-TCGCCA---CT-C----A----------GT--------------------T-AT--T--------G----GGAA------------------------CATCAA-G---CCCG--T-------------------------T-CTATT------------------G-------------C------------C------CC------------GA------G-----G-------C-----------CTGGACGCCTCGGGA-C---------A---A-----------T---AG--G--AACC--GG--C-A--TTGA-G-----C-TG--TTC---C--C---A-G-TA--CC-T---C-------G-G---AA--AA--AA-GT---AATTT----CCG-GT-CTA-TTT---GA-CTG-ACC-A--G--ACAT-T-A---AAT-AA-C-TG---T-A--TA
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gi|35107                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttatttacctaattgaaaggtttttgttgtttattagatattaatatttctagctaatttgttgtgtctattggaccgtgccggtcaatagtttttgaattttggaccggcgatctattgaccggcaatattgagggaatctgatgcatgctaactatgcgttcgtaacgaacgtaatgcaatagacttcaaatgacgtcatagtagtagcaatgtaatggaaatttgacaatgattttaaaattaaaaatgcatttacatatattttacacttaagaaattaagcactagcgaactatcatgtaattaggtaataaaACAG-T-TA-T---TTA-AT---GT--C--T-GAT-----CAG----T--C--------------------A----A---T-A---T-------T------TT---T-CC-------CG-A----G----------G---------------------T-AC--T--------G----GGAA------------------------C----A-G---C-----T-------------------------aata
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gi|35115                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atttattacctaatttgaaggatttttgttgtttttattacattattaaatatttcatagctattttatgtgactattggaccgccggtcataagtatttaatttttggaccggcgatcctatattgcaccggcaatattgagggacaatctgactgcattgctaactagtgacgttgcgtaaacgcaacgtaatgcaacatagacttcaatgacgtcatagagtagcaatgcaatgattttgaaaaatgcatgtgtacattatacttttccacgc----------------------G-------------C------------C------TC------------G-------G-----------------------------------------C---------A---A-----------T---AG--A--A--C--GTA-C-A--TTGA-G-----C-TG--TTTTC-C--C---A-G-T---CC-T---C-------T-G---G---AA--AA-AT---A---T----TCCTGT-CTA-TT----GAT-TG-ATC-A--G--ACAT-T-A---AAT-AA-C-TG---T-A--TATcgtcgggaatagaacgttgcattgagcttgcttcccagacccccccctcgggggaaaaatattccggttatgactggcagacttgaataacttgtata
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