lowQualScore : 1111 111111
lowQualScore : 2 1111 33 555555 11 1 1 333333 4444 222222 1 11 2222 1 2 1 666 3 1 22 22 2 2 2 4
lowQualScore : . .... .. ...... .. . . ...... .... ...... . .. .... . . . ... . . .. .. . . . .
lowQualScore : 4 5555 33 333333 99 4 3 888888 2222 777777 4 88 8888 4 9 5 777 8 9 88 88 0 1 1 7
consensus : AAAAGTAA-A--TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----T--NTN-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
Reference ( gi|69867 ) : AAAAATAA-A--TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----T--GTT-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69872 : AAAAATAA-A--TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CAGATCGTAAGAATGC----T--GTT-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CA
gi|69868 : AAAAGTAA-A--TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC----T--CTG-T-GAATTAAT----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69869 : AAAAGTAA----TAATAAA------CA--GAATCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC----T--GTT-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69870 : AAAAGTAA-A--TAA--AA------CA--GA-ATAC-CAA------CACAT-ATAAGAATGC----T--GTT-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAGAAACAAATTA
gi|69873 : AAAAGTAA-A--TAGG-AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----T--GTT-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GACCCAGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AAC
gi|69871 : AAAAGTAA-A--TAA--AA------CA--GA-TTAC-CAA------CACATCATAAGAATGC----T--CTG-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTACGACCT---T-A-GT--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAGTTAcat
gi|69876 : AAAAGTAA-A--TAA--A-------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----T--GTT-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTTGACCG---T-A-
gi|69874 : AAAAGTAA----TAA--AA------CA--AA-TCAC-CAA------CACATCGTA-GAATGC----TC-ATG-T-GAATT-------ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTCAGACTC---T-T-GG--CGG--T-CG-TCAA-CAG-AACAAATTA
gi|69875 : AAAAATAA-A-------AA------CATTGA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGATTGC----T--CAA-T-AGGTT--T----ATTT-GG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-G-GG--CAG--T-CG-TCAT-CAA-AACAATTT
gi|69877 : AAAAGTAA-A--TGA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----T--CTG-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-C
gi|69879 : AAAAATAA-AA-TAA--AAA-----CA--G--TCACACAA------CACATCATAAGAATGCG---T--GTT-TGGAATT--------TTTTGA-TTGGA-CCGGTTTCGA-CT---T-A-GA----G--T-CC-TAAT-CGA-AACAA
gi|69878 : AAAAGTCA-A--TAA--AA------CC--GA-TCAC-CAG------CACATGGTAAGAACGC----T--CGG-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCAGTTTTGA
gi|69880 : AAAAATAA-A-------AA------CA--GA-TCAC-CCA------CACATCGTGAGAATGCTCGAT--GCA-T-GGGTT--T----A-TTTGG-TT-GA-CCGGTTT
gi|69881 : AAAAGTAA-A--TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAACACTGTCACATCGTAAGAATGC----T--
gi|69882 : AAAGTAATA--TGA--AA------TA--GA-TCAC-CTA------CACATAGTAAGAATGC----C--CTG-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCC---T-A-GA--CAG--T-CG-TCTT-CAG-AACAAGTTA
gi|69883 : AAAGTAA----TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAAAATGC----T--CTG-T-GAATT--T----A-TTTGG-TT-GA-CTGGATTGGACTT---T-T-GA--TGA--T-CA-TTAT-CAG-AAC
gi|69884 : AAAGTAA-A--TAA--AA------CA--GA-TCAC--AA------CAACTCATAAGAATGC----TCTGCC-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CC-GTTTCGACCT---T-G-GGACCGG--TCCG-GCATGCAG-AACA
gi|69885 : AAAGTAA----TAA--AA------TA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----T--CTG-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-ACGGT
gi|69886 : AAAGTAA----TAA--AA------CA--GA-TCAT-CAA------CACATTGTAAGAATGC----T--CTG-T-GAATT--T----ATCTTGA-TT-GA-CCG
gi|69887 : AAAGTAA----TAA--AA------TA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----T--CTG-T-GAATT--T----ATTTTG
gi|69889 : AAAGTAA----TAA--AA------CA--GA-TCAT-CAA------CACATTGTA--AATGC----T--ATG-T-GGATT--T----ATTTTGG-TT-G
gi|69891 : AAAGTAA-A--TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------TACATCGTAAGAATGC----T--
gi|69890 : AAAGTAA----TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGTTTAT----T---TT-T-G--TT--T----ATGTTAA-TT-
gi|69893 : AAGAA-T--TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGAATGC----C--CCC-T-AAGTT--T----ATTTTG
gi|69888 : ATAA-ACTTAA--AA----------GA-TCGC-CAA------CGCATCGTGAAAGTGC----T--GGA-T-AGGTT--T----ATTGTG--TT-GA-CCGGTTTTGACCA---T-ATGG--CGG--T-CA-TCAT-CAG-AACttaattacatcatcaaaacaattt
gi|69894 : aaagtTAA-T--TAA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----T--GTT-T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-C-TA--AGG--T-Ccat
gi|69895 : AA-A---AA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------CACATCATGAGAATGC----A--ATTCC-CAATT--T----A-TTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69896 : AA-A---AA--AA------CA--GA-TCAC-CAA------AACATCAT--TAATGC--------------AATT--CCCAAATTTTTG-TTGGA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TGTTCAT-CAGAAACAA
gi|69892 : AA-G--TAA--AAAACTTTCA--GA-ATAA-AAA------CACATGGTGAGAATGC----T--CGA-T-AGGTT--T----GTTTT-G-TC-GG--CGGTTTCAACCT---T-A-AG--CGGAAT-TG-TCAT-TGG-AA
gi|69897 : C-CAA------CAAATCGTAAGAATGC----T--GTT-T-GAATT--T----ATTTTAAATT-GA-CCGATTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAA
gi|69898 : TT--T----ATTT-GG-TT-GA-CCAGTTTCGACCG---T-T-G----GG--T-CG-TCAT-CGG-TACAA
gi|69899 : T--T----ATTTTGG-TT-GA-CCAGTCTCGACCT---C-A-GG--CGG--T-CG-TCAT-t
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 11 00000 1 1 2222 11 1 1 333333 7777 22 222 1 11 1 1 1 666 3 1 22 22 1 2 2 4 1
lowQualScore : .. ..... . . .... .. . . ...... .... .. ... . .. . . . ... . . .. .. . . . . .
lowQualScore : 88 55555 3 3 8888 88 3 3 777777 1111 44 999 4 88 4 4 5 444 6 8 66 66 9 0 0 4 7
consensus : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----TC-TN--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
Reference ( family-567 ) : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----TN-TN--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69867 : AAAAATA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----TG-TT--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69868 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC----TC-TG--T-GAATTAATATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69869 : AAAAGTA--ATAA--TAA-A--C----A--GAATCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC----TG-TT--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69870 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-ATAC-CAA------CACAT-ATAAGAATGC----TG-TT--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAGAAACAAATTA
gi|69871 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TTAC-CAA------CACATCATAAGAATGC----TC-TG--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTACGACCT---T-A-GT--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69872 : AAAAATA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CAGATCGTAAGAATGC----TG-TT--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CA
gi|69873 : AAAAGTA--A--A--TAGGAA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----TG-TT--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GACCCAGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AAC
gi|69874 : AAAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--AA-TCAC-CAA------CACATCGTA-GAATGC----TCATG--T-GAATT---ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTCAGACTC---T-T-GG--CGG--T-CG-TCAA-CAG-AACAAATTAcat
gi|69875 : AAAAATA--A--A------AA-C----ATTGA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGATTGC----TC-AA--T-AGGTT--TATTT-GG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-G-GG--CAG--T-CG-TCAT-CAA-AACAATTT
gi|69876 : AAAAGTA--A--A--TAA-A--C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----TG-TT--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTTGACCG---T-A-
gi|69877 : AAAAGTA--A--A--TGA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----TC-TG--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-C
gi|69878 : AAAAGTC--A--A--TAA-AA-C----C--GA-TCAC-CAG------CACATGGTAAGAACGC----TC-GG--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCAGTTTTGA
gi|69879 : AAAAATA--A--AA-TAA-AAAC----A--G--TCACACAA------CACATCATAAGAATGCG---TG-TT--TGGAATT----TTTTGA-TTGGA-CCGGTTTCGA-CT---T-A-GA----G--T-CC-TAAT-CGA-AACAA
gi|69880 : AAAAATA--A--A------AA-C----A--GA-TCAC-CCA------CACATCGTGAGAATGCTCGATG-CA--T-GGGTT--TA-TTTGG-TT-GA-CCGGTTT
gi|69881 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAACACTGTCACATCGTAAGAATGC----T
gi|69882 : AAAGTA--AT-A--TGA-AA-T----A--GA-TCAC-CTA------CACATAGTAAGAATGC----CC-TG--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCC---T-A-GA--CAG--T-CG-TCTT-CAG-AACAAGTTA
gi|69883 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAAAATGC----TC-TG--T-GAATT--TA-TTTGG-TT-GA-CTGGATTGGACTT---T-T-GA--TGA--T-CA-TTAT-CAG-AAC
gi|69884 : AAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC--AA------CAACTCATAAGAATGC----TC-TGCCT-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CC-GTTTCGACCT---T-G-GGACCGG--TCCG-GCATGCAG-AACA
gi|69885 : AAAGTA--A-----TAA-AA-T----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----TC-TG--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-ACGGT
gi|69886 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAT-CAA------CACATTGTAAGAATGC----TC-TG--T-GAATT--TATCTTGA-TT-GA-CCG
gi|69887 : AAAGTA--A-----TAA-AA-T----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----TC-TG--T-GAATT--TATTTTG
gi|69888 : AAAGTATAA--ACTTAA-AA---------GA-TCGC-CAA------CGCATCGTGAAAGTGC----TG-GA--T-AGGTT--TATTGTG--TT-GA-CCGGTTTTGACCA---T-ATGG--CGG--T-CA-TCAT-CAG-AAC
gi|69889 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAT-CAA------CACATTGTA--AATGC----TA-TG--T-GGATT--TATTTTGG-TT-Gcat
gi|69890 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGTTTA-----TT-TT--T-G--TT--TATGTTAA-TT-
gi|69891 : AAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------TACATCGTAAGAATGC----T
gi|69892 : AAGTA--A--A----A-AA-CTTTCA--GA-ATAA-AAA------CACATGGTGAGAATGC----TC-GA--T-AGGTT--TGTTTT-G-TC-GG--CGGTTTCAACCT---T-A-AG--CGGAAT-TG-TCAT-TGG-AA
gi|69893 : AAG-A--A--T--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGAATGC----CC-CC--T-AAGTT--TATTTTG
gi|69894 : TA--A--T--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC----TG-TT--T-GAATT--TATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-C-TA--AGG--T-Cttaattacatcatcaaaacaattt
gi|69895 : A--A--A---AA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCATGAGAATGCA---AT-TC--C-CAATT--TA-TTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69896 : A--A--A---AA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------AACATCAT--TAATGCAA--TT-CC--C-AAAT-----TTTTGT-TG-GA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TGTTCAT-CAGAAACAA
gi|69897 : C-CAA------CAAATCGTAAGAATGC----TG-TT--T-GAATT--TATTTTAAATT-GA-CCGATTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAA
gi|69898 : TT--TATTT-GG-TT-GA-CCAGTTTCGACCG---T-T-G----GG--T-CG-TCAT-CGG-TACAA
gi|69899 : T--TATTTTGG-TT-GA-CCAGTCTCGACCT---C-A-GG--CGG--T-CG-TCAT-t
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 11 00000 1 1 2222 11 1 1 333333 333 555555555 1 11 2222 1 2 1 666 3 1 22 22 1 2 2 4
lowQualScore : .. ..... . . .... .. . . ...... ... ......... . .. .... . . . ... . . .. .. . . . .
lowQualScore : 88 55555 3 3 8888 88 3 3 777777 777 666666666 4 88 8888 4 9 5 444 6 8 66 66 9 0 0 4
consensus : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TN--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
Reference ( family-567 ) : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TN--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69867 : AAAAATA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69868 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC---TC----TG--T-GAATTAAT----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69869 : AAAAGTA--ATAA--TAA-A--C----A--GAATCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69870 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-ATAC-CAA------CACAT-ATAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAGAAACAAATTA
gi|69871 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TTAC-CAA------CACATCATAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTACGACCT---T-A-GT--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69872 : AAAAATA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CAGATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CA
gi|69873 : AAAAGTA--A--A--TAGGAA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GACCCAGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AAC
gi|69874 : AAAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--AA-TCAC-CAA------CACATCGTA-GAATGC---TCA---TG--T-GAATT-------ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTCAGACTC---T-T-GG--CGG--T-CG-TCAA-CAG-AACAAATTAcat
gi|69875 : AAAAATA--A--A------AA-C----ATTGA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGATTGC---TC----AA--T-AGGTT--T----ATTT-GG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-G-GG--CAG--T-CG-TCAT-CAA-AACAATTT
gi|69876 : AAAAGTA--A--A--TAA-A--C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTTGACCG---T-A-
gi|69877 : AAAAGTA--A--A--TGA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-C
gi|69878 : AAAAGTC--A--A--TAA-AA-C----C--GA-TCAC-CAG------CACATGGTAAGAACGC---TC----GG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCAGTTTTGA
gi|69879 : AAAAATA--A--AA-TAA-AAAC----A--G--TCACACAA------CACATCATAAGAATGCG--TG----TT--TGGAATT--------TTTTGA-TTGGA-CCGGTTTCGA-CT---T-A-GA----G--T-CC-TAAT-CGA-AACAA
gi|69880 : AAAAATA--A--A------AA-C----A--GA-TCAC-CCA------CACATCGTGAGAATGC---TCGATGCA--T-GGGTT--T----A-TTTGG-TT-GA-CCGGTTT
gi|69881 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAACACTGTCACATCGTAAGAATGC---T
gi|69882 : AAAGTA--AT-A--TGA-AA-T----A--GA-TCAC-CTA------CACATAGTAAGAATGC---CC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCC---T-A-GA--CAG--T-CG-TCTT-CAG-AACAAGTTA
gi|69883 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAAAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----A-TTTGG-TT-GA-CTGGATTGGACTT---T-T-GA--TGA--T-CA-TTAT-CAG-AAC
gi|69884 : AAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC--AA------CAACTCATAAGAATGC---TC----TGCCT-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CC-GTTTCGACCT---T-G-GGACCGG--TCCG-GCATGCAG-AACA
gi|69885 : AAAGTA--A-----TAA-AA-T----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-ACGGT
gi|69886 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAT-CAA------CACATTGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATCTTGA-TT-GA-CCG
gi|69887 : AAAGTA--A-----TAA-AA-T----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTG
gi|69888 : AAAGTATAA--ACTTAA-AA---------GA-TCGC-CAA------CGCATCGTGAAAGTGC---TG----GA--T-AGGTT--T----ATTGTG--TT-GA-CCGGTTTTGACCA---T-ATGG--CGG--T-CA-TCAT-CAG-AAC
gi|69889 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAT-CAA------CACATTGTA--AATGC---TA----TG--T-GGATT--T----ATTTTGG-TT-Gcat
gi|69890 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAG
gi|69891 : AAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------TACATCGTAAGAATGC---Ttttatttttgtttatgttaatt
gi|69892 : AAGTA--A--A----A-AA-CTTTCA--GA-ATAA-AAA------CACATGGTGAGAATGC---TC----GA--T-AGGTT--T----GTTTT-G-TC-GG--CGGTTTCAACCT---T-A-AG--CGGAAT-TG-TCAT-TGG-AA
gi|69893 : AAG-A--A--T--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGAATGC---CC----CC--T-AAGTT--T----ATTTTG
gi|69894 : TA--A--T--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-C-TA--AGG--T-Cttaattacatcatcaaaacaattt
gi|69895 : A--A--A---AA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCATGAGAATGCAATTC----CC-----AATT--T----A-TTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69896 : A--A--A---AA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------AACATCAT--TAATGC----------------AATT--CCCAAATTTTTG-TTGGA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TGTTCAT-CAGAAACAA
gi|69897 : C-CAA------CAAATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTAAATT-GA-CCGATTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAA
gi|69898 : TT--T----ATTT-GG-TT-GA-CCAGTTTCGACCG---T-T-G----GG--T-CG-TCAT-CGG-TACAA
gi|69899 : T--T----ATTTTGG-TT-GA-CCAGTCTCGACCT---C-A-GG--CGG--T-CG-TCAT-t
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 11 00000 1 1 2222 11 1 1 333333 333 555555555 1 11 2222 1 2 1 666 3 1 22 22 1 2 2 4
lowQualScore : .. ..... . . .... .. . . ...... ... ......... . .. .... . . . ... . . .. .. . . . .
lowQualScore : 88 55555 3 3 8888 88 3 3 777777 777 666666666 4 88 8888 4 9 5 444 6 8 66 66 9 0 0 4
consensus : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TN--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
Reference ( family-567 ) : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TN--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69867 : AAAAATA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69868 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC---TC----TG--T-GAATTAAT----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69869 : AAAAGTA--ATAA--TAA-A--C----A--GAATCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69870 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-ATAC-CAA------CACAT-ATAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAGAAACAAATTA
gi|69871 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TTAC-CAA------CACATCATAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTACGACCT---T-A-GT--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69872 : AAAAATA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CAGATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CA
gi|69873 : AAAAGTA--A--A--TAGGAA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GACCCAGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AAC
gi|69874 : AAAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--AA-TCAC-CAA------CACATCGTA-GAATGC---TCA---TG--T-GAATT-------ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTCAGACTC---T-T-GG--CGG--T-CG-TCAA-CAG-AACAAATTAcat
gi|69875 : AAAAATA--A--A------AA-C----ATTGA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGATTGC---TC----AA--T-AGGTT--T----ATTT-GG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-G-GG--CAG--T-CG-TCAT-CAA-AACAATTT
gi|69876 : AAAAGTA--A--A--TAA-A--C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTTGACCG---T-A-
gi|69877 : AAAAGTA--A--A--TGA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-C
gi|69878 : AAAAGTC--A--A--TAA-AA-C----C--GA-TCAC-CAG------CACATGGTAAGAACGC---TC----GG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCAGTTTTGA
gi|69879 : AAAAATA--A--AA-TAA-AAAC----A--G--TCACACAA------CACATCATAAGAATGCG--TG----TT--TGGAATT--------TTTTGA-TTGGA-CCGGTTTCGA-CT---T-A-GA----G--T-CC-TAAT-CGA-AACAA
gi|69880 : AAAAATA--A--A------AA-C----A--GA-TCAC-CCA------CACATCGTGAGAATGC---TCGATGCA--T-GGGTT--T----A-TTTGG-TT-GA-CCGGTTT
gi|69881 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAACACTGTCACATCGTAAGAATGC---T
gi|69882 : AAAGTA--AT-A--TGA-AA-T----A--GA-TCAC-CTA------CACATAGTAAGAATGC---CC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCC---T-A-GA--CAG--T-CG-TCTT-CAG-AACAAGTTA
gi|69883 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAAAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----A-TTTGG-TT-GA-CTGGATTGGACTT---T-T-GA--TGA--T-CA-TTAT-CAG-AAC
gi|69884 : AAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC--AA------CAACTCATAAGAATGC---TC----TGCCT-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CC-GTTTCGACCT---T-G-GGACCGG--TCCG-GCATGCAG-AACA
gi|69885 : AAAGTA--A-----TAA-AA-T----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-ACGGT
gi|69886 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAT-CAA------CACATTGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATCTTGA-TT-GA-CCG
gi|69887 : AAAGTA--A-----TAA-AA-T----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTG
gi|69888 : AAAGTATAA--ACTTAA-AA---------GA-TCGC-CAA------CGCATCGTGAAAGTGC---TG----GA--T-AGGTT--T----ATTGTG--TT-GA-CCGGTTTTGACCA---T-ATGG--CGG--T-CA-TCAT-CAG-AAC
gi|69889 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAT-CAA------CACATTGTA--AATGC---TA----TG--T-GGATT--T----ATTTTGG-TT-Gcat
gi|69890 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAG
gi|69891 : AAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------TACATCGTAAGAATGC---Ttttatttttgtttatgttaatt
gi|69892 : AAGTA--A--A----A-AA-CTTTCA--GA-ATAA-AAA------CACATGGTGAGAATGC---TC----GA--T-AGGTT--T----GTTTT-G-TC-GG--CGGTTTCAACCT---T-A-AG--CGGAAT-TG-TCAT-TGG-AA
gi|69893 : AAG-A--A--T--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGAATGC---CC----CC--T-AAGTT--T----ATTTTG
gi|69894 : TA--A--T--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-C-TA--AGG--T-Cttaattacatcatcaaaacaattt
gi|69895 : A--A--A---AA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCATGAGAATGCAATTC----CC-----AATT--T----A-TTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69896 : A--A--A---AA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------AACATCAT--TAATGC----------------AATT--CCCAAATTTTTG-TTGGA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TGTTCAT-CAGAAACAA
gi|69897 : C-CAA------CAAATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTAAATT-GA-CCGATTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAA
gi|69898 : TT--T----ATTT-GG-TT-GA-CCAGTTTCGACCG---T-T-G----GG--T-CG-TCAT-CGG-TACAA
gi|69899 : T--T----ATTTTGG-TT-GA-CCAGTCTCGACCT---C-A-GG--CGG--T-CG-TCAT-t
blockSeqs : TA TAA G A TTTC TT A A CACTGT AAT CGATGCA G AA CCAA A G C AAG A T AC AA C T G A
blockSeqs : . ACT . . . . . . . G CTGCC . . . . G . AAG A . . . . . . A
blockSeqs : . AA . . . . . . . . CATG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TA . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . GTT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . GTT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . GTT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . GTT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . GTT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CGG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . GTT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . GGA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . ATG . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . CGA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . CCC . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GTT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . CCC . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GTT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TN--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
finalCons : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TN--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
Alignments
lowQualScore : 11111
lowQualScore : 11 00000 1 1 2222 11 1 1 333333 333 555555555 1 11 2222 1 2 1 666 3 1 22 22 1 2 2 4
lowQualScore : .. ..... . . .... .. . . ...... ... ......... . .. .... . . . ... . . .. .. . . . .
lowQualScore : 88 55555 3 3 8888 88 3 3 777777 777 666666666 4 88 8888 4 9 5 444 6 8 66 66 9 0 0 4
consensus : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TN--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
Reference ( family-567 ) : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TN--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69867 : AAAAATA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69868 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC---TC----TG--T-GAATTAAT----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69869 : AAAAGTA--ATAA--TAA-A--C----A--GAATCAC-CAA------CACATCATAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAATTA
gi|69870 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-ATAC-CAA------CACAT-ATAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAGAAACAAATTA
gi|69871 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TTAC-CAA------CACATCATAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTACGACCT---T-A-GT--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69872 : AAAAATA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CAGATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CA
gi|69873 : AAAAGTA--A--A--TAGGAA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GACCCAGTTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-CG-TCAT-CAG-AAC
gi|69874 : AAAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--AA-TCAC-CAA------CACATCGTA-GAATGC---TCA---TG--T-GAATT-------ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTCAGACTC---T-T-GG--CGG--T-CG-TCAA-CAG-AACAAATTAcat
gi|69875 : AAAAATA--A--A------AA-C----ATTGA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGATTGC---TC----AA--T-AGGTT--T----ATTT-GG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-G-GG--CAG--T-CG-TCAT-CAA-AACAATTT
gi|69876 : AAAAGTA--A--A--TAA-A--C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTTGACCG---T-A-
gi|69877 : AAAAGTA--A--A--TGA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-C
gi|69878 : AAAAGTC--A--A--TAA-AA-C----C--GA-TCAC-CAG------CACATGGTAAGAACGC---TC----GG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCAGTTTTGA
gi|69879 : AAAAATA--A--AA-TAA-AAAC----A--G--TCACACAA------CACATCATAAGAATGCG--TG----TT--TGGAATT--------TTTTGA-TTGGA-CCGGTTTCGA-CT---T-A-GA----G--T-CC-TAAT-CGA-AACAA
gi|69880 : AAAAATA--A--A------AA-C----A--GA-TCAC-CCA------CACATCGTGAGAATGC---TCGATGCA--T-GGGTT--T----A-TTTGG-TT-GA-CCGGTTT
gi|69881 : AAAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAACACTGTCACATCGTAAGAATGC---T
gi|69882 : AAAGTA--AT-A--TGA-AA-T----A--GA-TCAC-CTA------CACATAGTAAGAATGC---CC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCC---T-A-GA--CAG--T-CG-TCTT-CAG-AACAAGTTA
gi|69883 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAAAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----A-TTTGG-TT-GA-CTGGATTGGACTT---T-T-GA--TGA--T-CA-TTAT-CAG-AAC
gi|69884 : AAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC--AA------CAACTCATAAGAATGC---TC----TGCCT-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CC-GTTTCGACCT---T-G-GGACCGG--TCCG-GCATGCAG-AACA
gi|69885 : AAAGTA--A-----TAA-AA-T----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-ACGGT
gi|69886 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAT-CAA------CACATTGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATCTTGA-TT-GA-CCG
gi|69887 : AAAGTA--A-----TAA-AA-T----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TC----TG--T-GAATT--T----ATTTTG
gi|69888 : AAAGTATAA--ACTTAA-AA---------GA-TCGC-CAA------CGCATCGTGAAAGTGC---TG----GA--T-AGGTT--T----ATTGTG--TT-GA-CCGGTTTTGACCA---T-ATGG--CGG--T-CA-TCAT-CAG-AAC
gi|69889 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAT-CAA------CACATTGTA--AATGC---TA----TG--T-GGATT--T----ATTTTGG-TT-Gcat
gi|69890 : AAAGTA--A-----TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAG
gi|69891 : AAAGTA--A--A--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------TACATCGTAAGAATGC---Ttttatttttgtttatgttaatt
gi|69892 : AAGTA--A--A----A-AA-CTTTCA--GA-ATAA-AAA------CACATGGTGAGAATGC---TC----GA--T-AGGTT--T----GTTTT-G-TC-GG--CGGTTTCAACCT---T-A-AG--CGGAAT-TG-TCAT-TGG-AA
gi|69893 : AAG-A--A--T--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTGAGAATGC---CC----CC--T-AAGTT--T----ATTTTG
gi|69894 : TA--A--T--TAA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACCT---T-C-TA--AGG--T-Cttaattacatcatcaaaacaattt
gi|69895 : A--A--A---AA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------CACATCATGAGAATGCAATTC----CC-----AATT--T----A-TTTGG-TT-GA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAAGTTA
gi|69896 : A--A--A---AA-AA-C----A--GA-TCAC-CAA------AACATCAT--TAATGC----------------AATT--CCCAAATTTTTG-TTGGA-CCGGTTTCGACTTAAGTAA-GA--CGG--T-TGTTCAT-CAGAAACAA
gi|69897 : C-CAA------CAAATCGTAAGAATGC---TG----TT--T-GAATT--T----ATTTTAAATT-GA-CCGATTTCGACCT---T-A-GA--CGG--T-TG-TCAT-CAG-AACAA
gi|69898 : TT--T----ATTT-GG-TT-GA-CCAGTTTCGACCG---T-T-G----GG--T-CG-TCAT-CGG-TACAA
gi|69899 : T--T----ATTTTGG-TT-GA-CCAGTCTCGACCT---C-A-GG--CGG--T-CG-TCAT-t