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Reference ( gi|104653 )       : CAGGGTTCAA--C-ATT--A------A-CTT--CATT-T----T-----CCA-CTTGTC-CA-T--T-G-GACAA---GC-TG-CC-ACC-A-A-A-TG----T--T--A-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATA--TTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
gi|104652                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-CTT--AAAT-T----T-----CCA-CTTGTC-CA-T--A-G-GACAA---GC-TG-CT-ACC-A-A-A-TG----T--T--A-C-TT-G-T----C--C----------A-A--------ATG--TATA--TTTTA-CT---T-G-TCCA-ACTCTGAACAAAAA
gi|104655                     : CAGTGCTCAA--C-ATT--A------A-CTT--AAAT-T----T-----CCA-CTTGTC-CA-T--C-G-GACAA---GC-TG-CC-ACC-G-A-A-CA----T--T--A-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATA--TTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGTACAAAAA
gi|104654                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------G-CTT--AAAT-T----T-----CCA-CTTGTC-CA-T--T-G-GACAA---GC-TT-CC-ATC-A-A-A-TG----T--T--A-C-TT-G-T----C--C----------A-A--------ATA--TATA--TTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACA
gi|104656                     : CAGGACTCAA--C-ATT--ATTAA--A-CTT--AAAT-T----T-----CCA-CTTGTC-CA-T--A-G-GACAA---GC-TG-AC-ATC-A-A-A-TG----T--T--A-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATA--TTTTA-CT---T-G-TCCG-AATCTGAACAAAAA
gi|104657                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-CTT--AAAT-T----T-----CCA-CTTGTC-CA-T--C-G-GATAA---GT-TGCCC-ACC---A-A-TA----A--T--A-C-TT-GTT----T--C----------G-A--------ATG--TATA--TTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAGAA
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gi|104669                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-CTT----TT-T----TAC---CCA-CTTGTC-CA-T--TCA-GACAA---GT-GA-CT-ATG-A-T-A-T-----T--T--A-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAA--TTTTG-CT---T-G-TCCA-
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gi|104676                     :  AGGGCTCGA--C-ATT--A------A-CTT----TT-T----TAC---CCA-CTTGTC-CATT--T-G-GACAA---GT-GA-CT-ATG-A-T-A-T-----T--T--A-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAA--TTTTaaaagtggttattt
gi|104677                     :  AGGGATAGA--C-ATT--A------A-CTT--TTTTAT----T-----TCA-CTTGTC-CA-T--C-G-GGCAA---GT-TA-AC-TCC-A-A-A-CT----T--C--A---TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--AAAA--ACTTA-CT---TGG-TCCA-
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Alignments
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Reference ( family-565 )      : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
gi|104652                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--AG-GAC---AAGC-TG-C-TACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------A-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCA-ACTCTGAACAAAAA
gi|104653                     : CAGGGTTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--CA----TT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--TG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
gi|104654                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------G-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--TG-GAC---AAGC-TT-C-CATC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------A-A--------ATA--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACA
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gi|104656                     : CAGGACTCAA--C-ATT--ATTAA--A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--AG-GAC---AAGC-TG-A-CATC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-AATCTGAACAAAAA
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gi|104661                     : CAAGGTTCAA--CCATT--AGGCCTAA-C---TT--AA----AT-TT---C---A-CTTGTC-CA-T--AG-GAC---AAGC-TG-C-CA-C-A-A-A-TG----T--T--C-TT-A-TA---C--C----------G-A--------ATG--TATA-TTTA-CT---T-G-TCC--ACTCCGAACAAGAA
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gi|104669                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CATT--CA-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104670                     : CAGGGCTCGA--C-ATA--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-TATT--CG-GAC---AAG--TG----ACT-ATG-A-TA----TC-TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104671                     : CAGGGATAGA--C-ATT--A------C-C---TT-----------TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GGC---AAGCATA-C---TC-A-A-ACTT----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--AAAGACTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104672                     : CAGGCCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AAT---ATGTT---C--CA-CTTTTT-C--T--CA-GAC---AAGC-TG-C-CACC-
gi|104673                     : CAGGGATAAA--C-ATT--A------A-C---TTTTAA--------T---C--TG-CTTGTC-CT-T--CG-GGC---AAGT-AA-A-CTCA-A-A-C-TT----T--CA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--AAAAATTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104674                     : CAGGGTTAGA--C-ATTTTA------A-C---TT---------T-TT---CTTCA-CTTGCC-CT-T--CG-GGC---AAGC-AA-A-CTCA-A-A-C-TT----T--CA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATT--TAAAAATTA-GT---T-G-TCCG-
gi|104675                     :  AGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--TA----AG-TT---C--TAACTTGTCGCA----CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TG-G-T----
gi|104676                     :  AGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CATT--TG-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTaaaagtggttattt
gi|104677                     :  AGGGATAGA--C-ATT--A------A-C---TT--TTTT--AT-TT---C---A-CTTGTC-CA-T--CG-GGC---AAGT-TA-A-CTCC-A-A-A-CT----T--CA---TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--AAAAACTTA-CT---TGG-TCCA-
gi|104678                     :   GGGCT-AA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---A--CA-CTTG------------GAC---AAGC-TG-C-TACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----T--T----------------------C---TGTATCTTA-CT---T-G-TCCG-AATCTGAACAAAAA
gi|104679                     :   GGGCTCAA--C-ATT--A--------C---TT--AA----AT-TT---T--CA-----TC-TA-------GAC---AAGC-TG-C-TAC----A-A-TG----T--TAGC-TT-G-T----T--CTGTATCTATTG-T--------ATG--TATTTTTTAGCT---T-G-TCCGAATTCTGAACAAAAA
gi|104680                     :   GGGCTCAATCC-ATT--A------AAC---TT--AA----AT------C--CA-CTTGTT-CA-T--CG-GACAAAAAGC-TG-C-CACC-A-A-A-CG----T--TA-CATT-G-T----C--C----------G-A--------ATGTATATATCTTA-CTAAAT-G-CCCG-ACTCTGAAAAA
gi|104681                     :    GGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AA---TG-A-CTTT-G-ATA-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CA-ATTTTG-CT---T-G-TC
gi|104682                     :     GCTCAA--CGATT--A--------C---TT--AA----AT-TT---C--CC-ATTATC-CA-C--TC-GAC---AAGC-TG-CAGACC-AGA-A-TG----TTGTA-C-TTCG-T----C--C----------G-A--------ATGTATATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACT-TGAACCAAAA
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gi|104684                     :                                                                                                           --TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TTTATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAA





Alignments
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lowQualScore                  :         . .. .   .. ...... . ...  ......... .  ... ..  .      .  ....  .   ...    .  . .    . . . . ..... ..  . .  . . .... .. .......... . ........ . ..  .      .  ... . .    .              
lowQualScore                  :         4 88 6   88 555555 3 333  444444444 3  555 88  3      3  5555  3   333    3  3 3    3 7 7 3 99999 77  2 5  3 6 0000 88 8888888888 3 77777777 0 55  7      9  555 4 4    5              
consensus                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
Reference ( family-565 )      : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
gi|104652                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--AG-GAC---AAGC-TG-C-TACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------A-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCA-ACTCTGAACAAAAA
gi|104653                     : CAGGGTTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--CA----TT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--TG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
gi|104654                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------G-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--TG-GAC---AAGC-TT-C-CATC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------A-A--------ATA--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACA
gi|104655                     : CAGTGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-G-A-A-CA----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGTACAAAAA
gi|104656                     : CAGGACTCAA--C-ATT--ATTAA--A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--AG-GAC---AAGC-TG-A-CATC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-AATCTGAACAAAAA
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gi|104662                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CA-TT-CG-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104663                     : CAGGGTTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--CA----AT-TT---T--CA-CTTGTC-CA-TGCCGTGAC---AAAC-TG-C-CACC--------G----T--TA-T-TT-G-T----C--C----------A-A--------AGG--TATATTTTA-CT---T-A-TC
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gi|104666                     : CAGGGCTAAT--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-TCT-------T--TA-GAC----AGC-TG-C-TACCGA-A-A-TG----TTCTA-CTTT-G-TTGTAT--C----------A-ATTGT----ATGTATATATTTTACCT---T-GTTCCG-AATCTGAACAAAAAgtaaaagtggtattt
gi|104667                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CATT--CG-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
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gi|104669                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CATT--CA-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
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gi|104675                     :  AGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--TA----AG-TT---C--TAACTTGTCGCA----CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TG-G-T----
gi|104676                     :  AGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CATT--TG-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTaaaagtggttattt
gi|104677                     :  AGGGATAGA--C-ATT--A------A-C---TT--TTTT--AT-TT---C---A-CTTGTC-CA-T--CG-GGC---AAGT-TA-A-CTCC-A-A-A-CT----T--CA---TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--AAAAACTTA-CT---TGG-TCCA-
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gi|104680                     :   GGGCTCAATCC-ATT--A------AAC---TT--AA----AT------C--CA-CTTGTT-CA-T--CG-GACAAAAAGC-TG-C-CACC-A-A-A-CG----T--TA-CATT-G-T----C--C----------G-A--------ATGTATATATCTTA-CTAAAT-G-CCCG-ACTCTGAAAAA
gi|104681                     :    GGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AA---TG-A-CTTT-G-ATA-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CA-ATTTTG-CT---T-G-TC
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gi|104684                     :                                                                                                           --TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TTTATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAA


blockSeqs                     :         A TC C   TT GGCCTA A TTT  AATTTCA   G  TAC TT  A      G  TGC   T   AAA    A  C A    G T T C GATAT TC  G T  C T TGTA CG TGTATCTATT T TCATTGTT T TA  T      C  AAA G T    A
blockSeqs                     :         A .  G   .  TTAA   . .    TTTTA     .  TAC .   .      .  TT    .   .      .  . .    . G T . G     TG  . A  . T A    .  .          . TTGT     T TA  T      G  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AATA      .  TAC .   .      .  TT    .   .      .  . .    . . . . G     C   . .  . . .    .  .          . .        T TA  T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    TTAA      .  TAC .   .      .  TT    .   .      .  . .    . . . . A     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    CAT       .  TAC .   .      .  TT    .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AAA       .  TAC .   .      .  TT    .   .      .  . .    . . . . A     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  TT    .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        C .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        G .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         G .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        C .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    CAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    TAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . A     .   . .  . . .    .  .          . .        C .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         G .  .   .  .      . .    TAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . T     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  A     .   .      .  . .    . . . . T     .   . .  . . .    .  .          . .        C .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         G .  .   .  .      . .    TAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . T     .   . .  . . .    .  .          . .        C .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         G .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         G .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . T     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    AAA       .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        C .   A      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         G .  .   .  .      . .    AA        .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    .         .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . G     .   . .  . . .    .  .          . .        C .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         G .  .   .  .      . .    .         .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . .     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         G .  .   .  .      . .    .         .  .   .   .      .  T     .   .      .  . .    . . . . .     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .    .
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    .         .  .   .   .      .  C     .   .      .  . .    . . . . .     .   . .  . . .    .  .          . .        C .   T      .  .   . .     
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    .         .  .   .   .      .  .     .   .      .  . .    . . . . .     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   T      .  .   . .     
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    .         .  .   .   .      .  .     .   .      .  . .    . . . . .     .   . .  . . .    .  .          . .        T .   .                     
blockSeqs                     :         G .  .   .  .      . .    .         .  .   .   .      .  .     .   .      .  . .    . . . . .     .   . .  . . .    .  .          . .        T .                         
blockSeqs                     :         A .  .   .  .      . .    .         .  .   .   .      .  .     .   .      .  . .    .             .   . .  . . .                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                           .   . .                                                                


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
finalCons                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA





Alignments
lowQualScore                  :                                   111111111    111                                                                                                                                             
lowQualScore                  :         1 11 2   11 666666 1 222  555555555 1  333 11  1      1  6666  1   222    1  1 1    1 2 2 1 66666 44  1 2  1 2 4444 11 5555555555 1 77777777 2 55  1      2  222 1 1    1              
lowQualScore                  :         . .. .   .. ...... . ...  ......... .  ... ..  .      .  ....  .   ...    .  . .    . . . . ..... ..  . .  . . .... .. .......... . ........ . ..  .      .  ... . .    .              
lowQualScore                  :         4 88 6   88 555555 3 333  444444444 3  555 88  3      3  5555  3   333    3  3 3    3 7 7 3 99999 77  2 5  3 6 0000 88 8888888888 3 77777777 0 55  7      9  555 4 4    5              
consensus                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
Reference ( family-565 )      : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
gi|104652                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--AG-GAC---AAGC-TG-C-TACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------A-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCA-ACTCTGAACAAAAA
gi|104653                     : CAGGGTTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--CA----TT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--TG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAAA
gi|104654                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------G-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--TG-GAC---AAGC-TT-C-CATC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------A-A--------ATA--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACA
gi|104655                     : CAGTGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-G-A-A-CA----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGTACAAAAA
gi|104656                     : CAGGACTCAA--C-ATT--ATTAA--A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--AG-GAC---AAGC-TG-A-CATC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-AATCTGAACAAAAA
gi|104657                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAT---AAGT-TGCC-CACC---A-A-TA----A--TA-C-TT-GTT----T--C----------G-A--------ATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAGAA
gi|104658                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---GT--AA----AT-GT---C--CA-CTTGTC-CA-T--AG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A---------T--TA-C-TT-GTT----T--C----------G-A--------ATG--TATAATTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTG-ACAAAAA
gi|104659                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-TT------------G-GAC---AAGC-TG-C-TACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----C--T----------GTATCATTGTTATG--TATATTTTA-CT---T-G-TCCG-AATCTGAACAAAAA
gi|104660                     : CAAGGCTCAA--T-ATT--A------A-C---TT--AATTTCAT-TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AAGC-TG-C-TATC-G-A-A-TG----T--TG-C-AT-G-G----C--C----------G-A--------ATG--TATAAATTG-CT---T-G-TCCG-GATCTGAACAAAAA
gi|104661                     : CAAGGTTCAA--CCATT--AGGCCTAA-C---TT--AA----AT-TT---C---A-CTTGTC-CA-T--AG-GAC---AAGC-TG-C-CA-C-A-A-A-TG----T--T--C-TT-A-TA---C--C----------G-A--------ATG--TATA-TTTA-CT---T-G-TCC--ACTCCGAACAAGAA
gi|104662                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CA-TT-CG-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104663                     : CAGGGTTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--CA----AT-TT---T--CA-CTTGTC-CA-TGCCGTGAC---AAAC-TG-C-CACC--------G----T--TA-T-TT-G-T----C--C----------A-A--------AGG--TATATTTTA-CT---T-A-TC
gi|104664                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-CTTTTT--TA----AT-AC---C--CA-CTTGTC-CATT--CG-GAC---AAG--TG----ACT-A-GTA-TGATATT--TA-C-TT-G-A----CCGC----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104665                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--TA----AG-TT---C--TA-CTTGTC-CA-A--CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-T
gi|104666                     : CAGGGCTAAT--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---C--CA-TCT-------T--TA-GAC----AGC-TG-C-TACCGA-A-A-TG----TTCTA-CTTT-G-TTGTAT--C----------A-ATTGT----ATGTATATATTTTACCT---T-GTTCCG-AATCTGAACAAAAAgtaaaagtggtattt
gi|104667                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CATT--CG-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104668                     : CAGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AA-------TT---C--CA--TTGTC-CA-T--TG-AAC----AGT----C-CCCC-A-A-A-TG----T--TA-C--T-G-C----C--C----------G-A--------ATG--T
gi|104669                     : CAGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CATT--CA-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104670                     : CAGGGCTCGA--C-ATA--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-TATT--CG-GAC---AAG--TG----ACT-ATG-A-TA----TC-TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104671                     : CAGGGATAGA--C-ATT--A------C-C---TT-----------TT---C--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GGC---AAGCATA-C---TC-A-A-ACTT----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--AAAGACTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104672                     : CAGGCCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--AAT---ATGTT---C--CA-CTTTTT-C--T--CA-GAC---AAGC-TG-C-CACC-
gi|104673                     : CAGGGATAAA--C-ATT--A------A-C---TTTTAA--------T---C--TG-CTTGTC-CT-T--CG-GGC---AAGT-AA-A-CTCA-A-A-C-TT----T--CA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--AAAAATTTG-CT---T-G-TCCA-
gi|104674                     : CAGGGTTAGA--C-ATTTTA------A-C---TT---------T-TT---CTTCA-CTTGCC-CT-T--CG-GGC---AAGC-AA-A-CTCA-A-A-C-TT----T--CA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATT--TAAAAATTA-GT---T-G-TCCG-
gi|104675                     :  AGGGCTCAA--C-ATT--A------A-C---TT--TA----AG-TT---C--TAACTTGTCGCA----CG-GAC---AAGC-TG-C-CACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TG-G-T----
gi|104676                     :  AGGGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CATT--TG-GAC---AAGT-GA-C-TATG-A-T-A-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CAAATTTTaaaagtggttattt
gi|104677                     :  AGGGATAGA--C-ATT--A------A-C---TT--TTTT--AT-TT---C---A-CTTGTC-CA-T--CG-GGC---AAGT-TA-A-CTCC-A-A-A-CT----T--CA---TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--AAAAACTTA-CT---TGG-TCCA-
gi|104678                     :   GGGCT-AA--C-ATT--A------A-C---TT--AA----AT-TT---A--CA-CTTG------------GAC---AAGC-TG-C-TACC-A-A-A-TG----T--TA-C-TT-G-T----T--T----------------------C---TGTATCTTA-CT---T-G-TCCG-AATCTGAACAAAAA
gi|104679                     :   GGGCTCAA--C-ATT--A--------C---TT--AA----AT-TT---T--CA-----TC-TA-------GAC---AAGC-TG-C-TAC----A-A-TG----T--TAGC-TT-G-T----T--CTGTATCTATTG-T--------ATG--TATTTTTTAGCT---T-G-TCCGAATTCTGAACAAAAA
gi|104680                     :   GGGCTCAATCC-ATT--A------AAC---TT--AA----AT------C--CA-CTTGTT-CA-T--CG-GACAAAAAGC-TG-C-CACC-A-A-A-CG----T--TA-CATT-G-T----C--C----------G-A--------ATGTATATATCTTA-CTAAAT-G-CCCG-ACTCTGAAAAA
gi|104681                     :    GGCTCGA--C-ATT--A------A-C---TT---------T-TTTACC--CA-CTTGTC-CA-T--CG-GAC---AA---TG-A-CTTT-G-ATA-T-----T--TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ACA--CA-ATTTTG-CT---T-G-TC
gi|104682                     :     GCTCAA--CGATT--A--------C---TT--AA----AT-TT---C--CC-ATTATC-CA-C--TC-GAC---AAGC-TG-CAGACC-AGA-A-TG----TTGTA-C-TTCG-T----C--C----------G-A--------ATGTATATATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACT-TGAACCAAAA
gi|104683                     :                                                                                                           --TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TTTATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAA
gi|104684                     :                                                                                                           --TA-C-TT-G-T----C--C----------G-A--------ATG--TTTATTTTA-CT---T-G-TCCG-ACTCTGAACAAAA