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lowQualScore                  :      .       ..   .....     .............     ..  ................         ..  ...... .     .    . . ....  .    .    . .  .  ..  .....  .. .   .   ..  . ...   ... .....    .. ..    .      . .    ..   .            
lowQualScore                  :      7       77   99999     0000000000000     99  0000000000000000         22  333333 5     0    9 4 9999  8    3    2 2  2  88  55555  88 3   7   22  3 333   777 33333    33 00    0      1 5    33   3            
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Reference ( gi|105957 )       : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC---A-------A-CCCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAAT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105958                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC---A-------G-ACCTT--TA--G-A---------A-TTTGTGGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGT--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TCTA-TTTCCAGT-TCAT--CAT-GACGATGCGAG
gi|105959                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC---A-------G-CCCTT--TAA-G-A---------A-TGTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAA-AATT-G-A--GG--TT-----GA--T-TAT-AGC--CG-----------A-----TGAA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GAGGATGCGAGA
gi|105960                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCG-C---A-------G-CCCTT--TAAAG-A---------A-TGTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A-----A-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAT-AGC-----------------------AA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GAGGATGCGAGA
gi|105961                     : TTATT-ATGTCAT--CTT-----GCGTC---C-------A-CCCTT--TACCG-A-----------TTTTTCACT--TT------T-GAGAA-GAAG-T-A----GG-TGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GG--T-TAC-AGA--TG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTCA-TTTCTAGA-TTGT--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105962                     : TTATT-GTGTCAA--CTT-----CCGTC---C-------C-CCCTT--TAC-C-A---------A-TTTTTC-GC--TA------A-GAGAA-GC-----------------------G-AT-GG--TT-----GA--T-ACC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-ATTCCAAT-
gi|105963                     :  TATG-ATGTCAA--CTT-----CGGTC---A-------C-ACCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTT-ATTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105965                     :  TATTCATGTCAAACTTT-----CCGTC---A-------A-CCCTT--TA--GGA---------A-GTTGTCCGT--TA------T-GAGAA-GCAGCT-A----GAACGAT-AATC-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTATTTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105964                     :  TATT-ATTTCAA--CTT-----CCGTC---A-------A-CCCTT--TA--G-A---------AGTTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-AAGTAGA-CGAT-AATT-G--C-GGCGTT-----GA--T-TAC-AGC--CGAA---TAA---A-----TGGA--C---CTA-TTTCCAGT-TTAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105966                     :   ATT-ATGTGAA--CTT-----CCGTC---T-------C-CCCTT--TAC-G-G---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TTAC--CAT-GACAATGCAAGA
gi|105968                     :   ATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC---ACAGGATTA-CC-----------A---------A-TTGAACGAA--TT------T-GAGAA-G-AG-T-A----GA-CAAT-AATT-A-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---AATTAATGGA--C--GCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GACAATGCGAGA
gi|105967                     :   ATG-ATGTCAA--CTT-----CCGAC---T-------C-CCCTT--TA--C-AG--------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-----------------------------T-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---AAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTTCAGT-TCAC--CAT-GAC
gi|105970                     :   ATG-ATGTCAA--CTA-----CCCTC---C-------T-CCCTT--TACCG-A-----------TTTTTTGCT--TT------TTAAGAA-GTAT-TTA----AA-TAAT-AACT-G-AC-AG--TTT----GT--T-TAC-CGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TATA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105971                     :   ATG-ATGTAAA--CTT-----CCGTC---A-------G-ACCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----CA-CGAT-AATT-A-AT-G
gi|105972                     :   ATT-ATGTCAA--CTTAAATTCCGTC---C-------T-CCTTT--TCCCG-A-----------TTTTTCGCT--TT------T-GAGAA-GCAG-C-A----TA-CGAC-ATTT-G-AC-TG--TT-----GA--T------------------------------GGA--A--TTTAATTTCCAGT-GCAC--AAT-GACGATGCGAGA
gi|105973                     :   ATC-ATGTCAA--CAT-----TCGTC---A----------------CG--G-G---------A-TTGG-CAAT--GAACGAATT-GAGAA-GCAGCT-A----GA--GGT-AATG-A-AC-GG--TT-----AG--T-TAA-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--CGAGCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GA-GA-GCGAGA
gi|105974                     :                  T-----CCGTCC--A-------A-CCCTTGTCA--G-A---------G-TTTGTGGGT--TA------T-GAGAAAGCAG-T-A----GAACGAT-A-TC-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-T-AC--CATAGACGATGCGAGA
gi|105975                     :                   -----CCGTCTTGA-------ATCCCTT--TACTG-A-----------TTTGTCGGT--TA------T-CAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AGTT-T--C-AG--TT-----GG--T-TAC-AGC--CA-A----AA---A-----TGGA--C--TTTA-CTTCCAGT-TCAC--CAA-GACGATACGAGA
gi|105976                     :                                         -CCTTT--TA--G-ATTCAGTTG-A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GA--TT-----GA--T-TAC-AGC--C--A---TCATTCA-----TCCATTC--TTTA-TTTTC----TCATAACAT-GA-GAT
gi|105977                     :                                        c-CTCTT--TA--G-ATTCAGTTTGA-TATGTCGGTATTA------T-GAGA--GCAG-T-A----GA-CGATAAATT-G-ACAGA--TTCGCTGGA--T-TACTAGC--C--A---TCA---A-----T
gi|105978                     :                                                     c-A---------A-TTTG---GT--CA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GG-CGAT-AATT-G-AC-TG--TT-----GA--
gi|105979                     :                                                                    TTGTCACT--TT------T-GAGAAAGCAG-T-A----GA-CGAT-AATC-G-AA-CG--TA-----TA--T-TAT-AGC--CG-A---TAAG--A-----TAGA--
gi|105980                     :                                                                          GT--TA------A-CAGAA-GCAG-T-A----AA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TACAAGC--CG-A---TGA---A-----TG---------TA---TCCAAT-TCAC--CATGGACGGTGCGAGA
gi|105981                     :                                                                           T--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----AG-AGAT-AATT-ACAC-GA--TT-----GAAATATAC-AGCA-CG-A---TAA---A-----TGGA--A--GCTA--TTCCAATGTCAA--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105982                     :                                                                           T--TT------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATC-A-AC-GT--AT-----TA--T-TAT-AGC--CG-A---TAG---A-----TAGA--
gi|105983                     :                                                                            --TA------T-GTGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----AA--T-TGC-AGT--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--TAT-GACGATGCGAGA
gi|105984                     :                                                                                ------T-GAGAA-GCAG-G-A----GA-CGAT-AACT-G-AC-GG--CT-----GA--T----------CT-A---TAA---A-----TGAA--C--TTTA-GTTCCAGT-TCAT--CAT-GGCAATGAGAGA
gi|105985                     :                                                                                ------T-GAAGA-ACAG-T-A----GA-CGAT-AATA-A-AC-GC--TT-----GA--T-TAC-AACCTCA-AACTTAT---A-----TGGAT-C--GCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GGCGATGC
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gi|105987                     :                                                                                                    -A----GC-CAAG-AGTT-G-AT-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CA-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--GAT-GACGATGCAAGA
gi|105988                     :                                                                                                               AT-AATTTG-AC-AG--TT-----GA--T-AGT-GGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--GTTA-CTTCCAAT-T
gi|105989                     :                                                                                                                    TT-G-AT-GG--TT-----GA--T-TAT-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGG--C--TTTA-TTTCCAGT-TTA
gi|105990                     :                                                                                                                      -G-AC-GA--TT---------T-T-T-AGC--CG-C---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CGT-GACGATGCGAGA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|105969 ): ATTATGTCAACTTCGTCATAGGTTCACCGACTGAACGAATTAGAGAAGCAGTAGACGATAATTAACGATTTATTACAGCCGATAAATGGAAGCTATTTCCAATTCAACATGATGATGCGAGA






Alignments
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lowQualScore                  :      2       33   55555     777777     22  9999999999999999         22  444444 1     2    2 1 2222  2    1    1 1  1  11  44444  11 1   2   33  1 222   333 33333    33 22    2        1    22   3            
lowQualScore                  :      .       ..   .....     ......     ..  ................         ..  ...... .     .    . . ....  .    .    . .  .  ..  .....  .. .   .   ..  . ...   ... .....    .. ..    .        .    ..   .            
lowQualScore                  :      5       44   66666     222222     88  1111111111111111         11  111111 4     9    8 3 8888  7    3    2 2  2  77  44444  77 3   6   11  3 333   555 22222    22 00    9        4    22   2            
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Reference ( family-561 )      : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ANCCCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105957                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----AACCCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAAT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105958                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----AGACCTT--TA--G-A---------A-TTTGTGGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGT--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TCTA-TTTCCAGT-TCAT--CAT-GACGATGCGAG
gi|105959                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----AGCCCTT--TAA-G-A---------A-TGTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAA-AATT-G-A--GG--TT-----GA--T-TAT-AGC--CG-----------A-----TGAA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GAGGATGCGAGA
gi|105960                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCG-C----AGCCCTT--TAAAG-A---------A-TGTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A-----A-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAT-AGC-----------------------AA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GAGGATGCGAGA
gi|105961                     : TTATT-ATGTCAT--CTT-----GCGTC----CACCCTT--TACCG-A-----------TTTTTCACT--TT------T-GAGAA-GAAG-T-A----GG-TGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GG--T-TAC-AGA--TG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTCA-TTTCTAGA-TTGT--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105962                     : TTATT-GTGTCAA--CTT-----CCGTC----CCCCCTT--TAC-C-A---------A-TTTTTC-GC--TA------A-GAGAA-GC-----------------------G-AT-GG--TT-----GA--T-ACC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-ATTCCAAT-
gi|105963                     :  TATG-ATGTCAA--CTT-----CGGTC----ACACCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTT-ATTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105964                     :  TATT-ATTTCAA--CTT-----CCGTC----AACCCTT--TA--G-A---------AGTTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-AAGTAGA-CGAT-AATT-G--C-GGCGTT-----GA--T-TAC-AGC--CGAA---TAA---A-----TGGA--C---CTA-TTTCCAGT-TTAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105965                     :  TATTCATGTCAAACTTT-----CCGTC----AACCCTT--TA--GGA---------A-GTTGTCCGT--TA------T-GAGAA-GCAGCT-A----GAACGAT-AATC-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTATTTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105966                     :   ATT-ATGTGAA--CTT-----CCGTC----TCCCCTT--TAC-G-G---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TTAC--CAT-GACAATGCAAGA
gi|105967                     :   ATG-ATGTCAA--CTT-----CCGAC----TCCCCTT--TA--C-AG--------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-----------------------------T-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---AAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTTCAGT-TCAC--CAT-GAC
gi|105968                     :   ATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ACAGGAT--TA--CCA---------A-TTGAACGAA--TT------T-GAGAA-G-AG-T-A----GA-CAAT-AATT-A-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---AATTAATGGA--C--GCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GACAATGCGAGA
gi|105970                     :   ATG-ATGTCAA--CTA-----CCCTC----CTCCCTT--TACCG-A-----------TTTTTTGCT--TT------TTAAGAA-GTAT-TTA----AA-TAAT-AACT-G-AC-AG--TTT----GT--T-TAC-CGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TATA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105971                     :   ATG-ATGTAAA--CTT-----CCGTC----AGACCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----CA-CGAT-AATT-A-AT-G
gi|105972                     :   ATT-ATGTCAA--CTTAAATTCCGTC----CTCCTTT--TCCCG-A-----------TTTTTCGCT--TT------T-GAGAA-GCAG-C-A----TA-CGAC-ATTT-G-AC-TG--TT-----GA--T------------------------------GGA--A--TTTAATTTCCAGT-GCAC--AAT-GACGATGCGAGA
gi|105973                     :   ATC-ATGTCAA--CAT-----TCGTC----AC--------G--G-G---------A-TTGG-CAAT--GAACGAATT-GAGAA-GCAGCT-A----GA--GGT-AATG-A-AC-GG--TT-----AG--T-TAA-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--CGAGCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GA-GA-GCGAGA
gi|105974                     :                  T-----CCGTCC---AACCCTTGTCA--G-A---------G-TTTGTGGGT--TA------T-GAGAAAGCAG-T-A----GAACGAT-A-TC-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-T-AC--CATAGACGATGCGAGA
gi|105975                     :                   -----CCGTCTTGAATCCCTT--TACTG-A-----------TTTGTCGGT--TA------T-CAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AGTT-T--C-AG--TT-----GG--T-TAC-AGC--CA-A----AA---A-----TGGA--C--TTTA-CTTCCAGT-TCAC--CAA-GACGATACGAGA
gi|105976                     :                                   CCTTT--TA--G-ATTCAGTTG-A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GA--TT-----GA--T-TAC-AGC--C--A---TCATTCA-----TCCATTC--TTTA-TTTTC----TCATAACAT-GA-GAT
gi|105977                     :                                  cCTCTT--TA--G-ATTCAGTTTGA-TATGTCGGTATTA------T-GAGA--GCAG-T-A----GA-CGATAAATT-G-ACAGA--TTCGCTGGA--T-TACTAGC--C--A---TCA---A-----T
gi|105978                     :                                              c-A---------A-TTTG---GT--CA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GG-CGAT-AATT-G-AC-TG--TT-----GA--
gi|105979                     :                                                             TTGTCACT--TT------T-GAGAAAGCAG-T-A----GA-CGAT-AATC-G-AA-CG--TA-----TA--T-TAT-AGC--CG-A---TAAG--A-----TAGA--
gi|105980                     :                                                                   GT--TA------A-CAGAA-GCAG-T-A----AA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TACAAGC--CG-A---TGA---A-----TG---------TA---TCCAAT-TCAC--CATGGACGGTGCGAGA
gi|105981                     :                                                                    T--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----AG-AGAT-AATT-ACAC-GA--TT-----GAAATATAC-AGCA-CG-A---TAA---A-----TGGA--A--GCTA--TTCCAATGTCAA--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105982                     :                                                                    T--TT------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATC-A-AC-GT--AT-----TA--T-TAT-AGC--CG-A---TAG---A-----TAGA--
gi|105983                     :                                                                     --TA------T-GTGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----AA--T-TGC-AGT--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--TAT-GACGATGCGAGA
gi|105984                     :                                                                         ------T-GAGAA-GCAG-G-A----GA-CGAT-AACT-G-AC-GG--CT-----GA--T----------CT-A---TAA---A-----TGAA--C--TTTA-GTTCCAGT-TCAT--CAT-GGCAATGAGAGA
gi|105985                     :                                                                         ------T-GAAGA-ACAG-T-A----GA-CGAT-AATA-A-AC-GC--TT-----GA--T-TAC-AACCTCA-AACTTAT---A-----TGGAT-C--GCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GGCGATGC
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gi|105987                     :                                                                                             -A----GC-CAAG-AGTT-G-AT-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CA-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--GAT-GACGATGCAAGA
gi|105988                     :                                                                                                        AT-AATTTG-AC-AG--TT-----GA--T-AGT-GGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--GTTA-CTTCCAAT-T
gi|105989                     :                                                                                                             TT-G-AT-GG--TT-----GA--T-TAT-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGG--C--TTTA-TTTCCAGT-TTA
gi|105990                     :                                                                                                               -G-AC-GA--TT---------T-T-T-AGC--CG-C---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CGT-GACGATGCGAGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|105969 ): ATTATGTCAACTTCGTCATAGGTTCACCGACTGAACGAATTAGAGAAGCAGTAGACGATAATTAACGATTTATTACAGCCGATAAATGGAAGCTATTTCCAATTCAACATGATGATGCGAGA






Alignments
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lowQualScore                  :      .       ..   .....     ......     ..  ................         ..  ...... .     .    . . ....  .    .    . .  .  ..  .....  .. .   .   ..  . ...   ... .....    .. ..    .        .    ..   .            
lowQualScore                  :      5       44   66666     222222     88  1111111111111111         11  111111 4     9    8 3 8888  7    3    2 2  2  77  44444  77 3   6   11  3 333   555 22222    22 00    9        4    22   2            
consensus                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ANCCCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
Reference ( family-561 )      : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ANCCCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105957                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----AACCCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAAT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105958                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----AGACCTT--TA--G-A---------A-TTTGTGGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGT--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TCTA-TTTCCAGT-TCAT--CAT-GACGATGCGAG
gi|105959                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----AGCCCTT--TAA-G-A---------A-TGTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAA-AATT-G-A--GG--TT-----GA--T-TAT-AGC--CG-----------A-----TGAA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GAGGATGCGAGA
gi|105960                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCG-C----AGCCCTT--TAAAG-A---------A-TGTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A-----A-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAT-AGC-----------------------AA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GAGGATGCGAGA
gi|105961                     : TTATT-ATGTCAT--CTT-----GCGTC----CACCCTT--TACCG-A-----------TTTTTCACT--TT------T-GAGAA-GAAG-T-A----GG-TGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GG--T-TAC-AGA--TG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTCA-TTTCTAGA-TTGT--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105962                     : TTATT-GTGTCAA--CTT-----CCGTC----CCCCCTT--TAC-C-A---------A-TTTTTC-GC--TA------A-GAGAA-GC-----------------------G-AT-GG--TT-----GA--T-ACC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-ATTCCAAT-
gi|105963                     :  TATG-ATGTCAA--CTT-----CGGTC----ACACCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTT-ATTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105964                     :  TATT-ATTTCAA--CTT-----CCGTC----AACCCTT--TA--G-A---------AGTTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-AAGTAGA-CGAT-AATT-G--C-GGCGTT-----GA--T-TAC-AGC--CGAA---TAA---A-----TGGA--C---CTA-TTTCCAGT-TTAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105965                     :  TATTCATGTCAAACTTT-----CCGTC----AACCCTT--TA--GGA---------A-GTTGTCCGT--TA------T-GAGAA-GCAGCT-A----GAACGAT-AATC-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTATTTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105966                     :   ATT-ATGTGAA--CTT-----CCGTC----TCCCCTT--TAC-G-G---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TTAC--CAT-GACAATGCAAGA
gi|105967                     :   ATG-ATGTCAA--CTT-----CCGAC----TCCCCTT--TA--C-AG--------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-----------------------------T-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---AAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTTCAGT-TCAC--CAT-GAC
gi|105968                     :   ATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ACAGGAT--TA--CCA---------A-TTGAACGAA--TT------T-GAGAA-G-AG-T-A----GA-CAAT-AATT-A-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---AATTAATGGA--C--GCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GACAATGCGAGA
gi|105970                     :   ATG-ATGTCAA--CTA-----CCCTC----CTCCCTT--TACCG-A-----------TTTTTTGCT--TT------TTAAGAA-GTAT-TTA----AA-TAAT-AACT-G-AC-AG--TTT----GT--T-TAC-CGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TATA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105971                     :   ATG-ATGTAAA--CTT-----CCGTC----AGACCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----CA-CGAT-AATT-A-AT-G
gi|105972                     :   ATT-ATGTCAA--CTTAAATTCCGTC----CTCCTTT--TCCCG-A-----------TTTTTCGCT--TT------T-GAGAA-GCAG-C-A----TA-CGAC-ATTT-G-AC-TG--TT-----GA--T------------------------------GGA--A--TTTAATTTCCAGT-GCAC--AAT-GACGATGCGAGA
gi|105973                     :   ATC-ATGTCAA--CAT-----TCGTC----AC--------G--G-G---------A-TTGG-CAAT--GAACGAATT-GAGAA-GCAGCT-A----GA--GGT-AATG-A-AC-GG--TT-----AG--T-TAA-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--CGAGCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GA-GA-GCGAGA
gi|105974                     :                  T-----CCGTCC---AACCCTTGTCA--G-A---------G-TTTGTGGGT--TA------T-GAGAAAGCAG-T-A----GAACGAT-A-TC-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-T-AC--CATAGACGATGCGAGA
gi|105975                     :                   -----CCGTCTTGAATCCCTT--TACTG-A-----------TTTGTCGGT--TA------T-CAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AGTT-T--C-AG--TT-----GG--T-TAC-AGC--CA-A----AA---A-----TGGA--C--TTTA-CTTCCAGT-TCAC--CAA-GACGATACGAGA
gi|105976                     :                                   CCTTT--TA--G-ATTCAGTTG-A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GA--TT-----GA--T-TAC-AGC--C--A---TCATTCA-----TCCATTC--TTTA-TTTTC----TCATAACAT-GA-GAT
gi|105977                     :                                  cCTCTT--TA--G-ATTCAGTTTGA-TATGTCGGTATTA------T-GAGA--GCAG-T-A----GA-CGATAAATT-G-ACAGA--TTCGCTGGA--T-TACTAGC--C--A---TCA---A-----T
gi|105978                     :                                              c-A---------A-TTTG---GT--CA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GG-CGAT-AATT-G-AC-TG--TT-----GA--
gi|105979                     :                                                             TTGTCACT--TT------T-GAGAAAGCAG-T-A----GA-CGAT-AATC-G-AA-CG--TA-----TA--T-TAT-AGC--CG-A---TAAG--A-----TAGA--
gi|105980                     :                                                                   GT--TA------A-CAGAA-GCAG-T-A----AA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TACAAGC--CG-A---TGA---A-----TG---------TA---TCCAAT-TCAC--CATGGACGGTGCGAGA
gi|105981                     :                                                                    T--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----AG-AGAT-AATT-ACAC-GA--TT-----GAAATATAC-AGCA-CG-A---TAA---A-----TGGA--A--GCTA--TTCCAATGTCAA--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105982                     :                                                                    T--TT------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATC-A-AC-GT--AT-----TA--T-TAT-AGC--CG-A---TAG---A-----TAGA--
gi|105983                     :                                                                     --TA------T-GTGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----AA--T-TGC-AGT--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--TAT-GACGATGCGAGA
gi|105984                     :                                                                         ------T-GAGAA-GCAG-G-A----GA-CGAT-AACT-G-AC-GG--CT-----GA--T----------CT-A---TAA---A-----TGAA--C--TTTA-GTTCCAGT-TCAT--CAT-GGCAATGAGAGA
gi|105985                     :                                                                         ------T-GAAGA-ACAG-T-A----GA-CGAT-AATA-A-AC-GC--TT-----GA--T-TAC-AACCTCA-AACTTAT---A-----TGGAT-C--GCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GGCGATGC
gi|105986                     :                                                                                        CAT-T-A----GA-CAAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---CAA---A-----TGGA--C--TTT--TTTCCAGT-TCAC--CAT-GGCCATGCGAGA
gi|105987                     :                                                                                             -A----GC-CAAG-AGTT-G-AT-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CA-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--GAT-GACGATGCAAGA
gi|105988                     :                                                                                                        AT-AATTTG-AC-AG--TT-----GA--T-AGT-GGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--GTTA-CTTCCAAT-T
gi|105989                     :                                                                                                             TT-G-AT-GG--TT-----GA--T-TAT-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGG--C--TTTA-TTTCCAGT-TTA
gi|105990                     :                                                                                                               -G-AC-GA--TT---------T-T-T-AGC--CG-C---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CGT-GACGATGCGAGA


blockSeqs                     :      C       AC   AAATT     TTGAAT     GT  GATTCAGTTTGA             AT  ACGAAT T     A    C T AGTA  A    A    T C  A  CG  CGCTG  AA A   T   CT  A ACT   TTC ATTAA    TT GA    T        G    AA   A
blockSeqs                     :      .       .    .         CAA        .   GATTCAGTTGA              .   .      .     A    C . .     A    .    . .  .  .   T      .  .   A   A   . .     G   .        T  .     A        .    .    G
blockSeqs                     :      .       .    .         AG         .   AAGAA                    .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         AG         .   AGAA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         AG         .   CCGA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         CA         .   CCAA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         CC         .   GAAG                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         AC         .   GGAA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         AA         .   CGGA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         AA         .   CAGA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         TC         .   CCAA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         TC         .   CCGA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         AC         .   CCGA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         CT         .   CTGA                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :      .       .    .         AG         .   GAA                      .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                   .         CT         .   GAA                      .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                   .         AC         .   GAA                      .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                                        .   GGA                      .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                                        .   GAG                      .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                                                                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                                                                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                                                                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                                                                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                                                                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .    .    .
blockSeqs                     :                                                                     .   .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .          
blockSeqs                     :                                                                         .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .          
blockSeqs                     :                                                                         .      .     .    . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .  .     .        .          
blockSeqs                     :                                                                                           . . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .                            
blockSeqs                     :                                                                                             . .     .    .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .        .                            
blockSeqs                     :                                                                                                          .    . .  .  .   .      .  .   .   .   . .     .   .                                     
blockSeqs                     :                                                                                                               . .  .  .   .      .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                               . .  .                                                                              


blockSeqCons                  :                                            CCGA************
originalCons                  : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ANCCCTT--TA--G-A---------A-TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
finalCons                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ANCCCTT--TACCGA------------TTTGTCGGT--TA------T-GAGAA-GCAG-T-A----GA-CGAT-AATT-G-AC-GG--TT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAA---A-----TGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|105969 ): ATTATGTCAACTTCGTCATAGGTTCACCGACTGAACGAATTAGAGAAGCAGTAGACGATAATTAACGATTTATTACAGCCGATAAATGGAAGCTATTTCCAATTCAACATGATGATGCGAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                          11   11                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :      2       33   55555     888888       33 1 22        1 22  444444 1     2  2222  2 1   2    1    1 1  1 11   44444  11 1   2   33  1 222  33333 333     33 11    2        1    22   3            
lowQualScore                  :      .       ..   .....     ......       .. . ..        . ..  ...... .     .  ....  . .   .    .    . .  . ..   .....  .. .   .   ..  . ...  ..... ...     .. ..    .        .    ..   .            
lowQualScore                  :      4       22   33333     444444       77 9 11        5 00  000000 4     8  8888  7 3   6    2    2 2  2 66   22222  77 2   5   00  2 222  11111 444     11 99    8        4    11   1            
consensus                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ANCCCTTTACCG-A--TTTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
Reference ( family-561 )      : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ANCCCTTTACCG-A--TTTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105957                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----AACCCTTTA--G-AA-TTTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTA-TTTCCAAT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105958                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----AGACCTTTA--G-AA-TTTGTGGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGT--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TCTA-TTTCCAGT-TCAT--CAT-GACGATGCGAG
gi|105959                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----AGCCCTTTAAGA-A--TGTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAA-AATT-G-A--G--GTT-----GA--T-TAT-AGC--CG----------------ATGAA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GAGGATGCGAGA
gi|105960                     : TTATT-ATGTCAA--CTT-----CCG-C----AGCCCTTTAAAGAA--TGTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-A-A-CGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAT-AGC-----------------------AA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GAGGATGCGAGA
gi|105961                     : TTATT-ATGTCAT--CTT-----GCGTC----CACCCTTTACCG-A--TTTTTCAC-T--TT------T-GAGAA-GA----AG-T-AGG-TGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GG--T-TAC-AGA--TG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTCA-TTTCTAGA-TTGT--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105962                     : TTATT-GTGTCAA--CTT-----CCGTC----CCCCCTTTACCA-A--TTTTTC-G-C--TA------A-GAGAA-GC-----------------------G-AT-G--GTT-----GA--T-ACC-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTA-ATTCCAAT-
gi|105963                     :  TATG-ATGTCAA--CTT-----CGGTC----ACACCTTTA--G-AA-TTTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTT-ATTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105964                     :  TATT-ATTTCAA--CTT-----CCGTC----AACCCTTTA--G-AAGTTTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GCAGTAAG-T-AGA-CGAT-AATT-G--C-GGCGTT-----GA--T-TAC-AGC--CGAA---TA-----A---ATGGA--C---CTA-TTTCCAGT-TTAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105965                     :  TATTCATGTCAAACTTT-----CCGTC----AACCCTTTAGGA-A--GTTGTCCG-T--TA------T-GAGAA-GC----AGCT-AGAACGAT-AATC-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTATTTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105966                     :   ATT-ATGTGAA--CTT-----CCGTC----TCCCCTTTACGG-A--TTTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TTAC--CAT-GACAATGCAAGA
gi|105967                     :   ATG-ATGTCAA--CTT-----CCGAC----TCCCCTTTACAG-A--TTTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-------------------------T-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---AA-----A---ATGGA--C--TTTA-TTTTCAGT-TCAC--CAT-GAC
gi|105968                     :   ATT-ATGTCAA--CTT-----CCGTC----ACAGGATTACCA-A--TTGAACGA-A--TT------T-GAGAA-G-----AG-T-AGA-CAAT-AATT-A-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TAAAATTA---ATGGA--C--GCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GACAATGCGAGA
gi|105969                     :   ATT-ATGTCAA--CTT-----C-GTC----ATAGGTTCACCG-A--CTGAACGAAT--TA--------GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATT-A-AC-G--ATT-----TA--T-TAC-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--A--GCTA-TTTCCAAT-TCAA--CAT-GATGATGCGAGA
gi|105970                     :   ATG-ATGTCAA--CTA-----CCCTC----CTCCCTTTACCG-A--TTTTTTGC-T--TT------TTAAGAA-GT----AT-TTAAA-TAAT-AACT-G-AC-A--GTTT----GT--T-TAC-CGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TATA-TTTCCAGT-TCAC--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105971                     :   ATG-ATGTAAA--CTT-----CCGTC----AGACCTTTA--G-AA-TTTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-ACA-CGAT-AATT-A-AT-G--
gi|105972                     :   ATT-ATGTCAA--CTTAAATTCCGTC----CTCCTTTTCCCG-A--TTTTTCGC-T--TT------T-GAGAA-GC----AG-C-ATA-CGAC-ATTT-G-AC-T--GTT-----GA--T------------------------------GGA--A--TTTAATTTCCAGT-GCAC--AAT-GACGATGCGAGA
gi|105973                     :   ATC-ATGTCAA--CAT-----TCGTC----A--------CGG-G--ATTGGCAA-T--GAACGAATT-GAGAA-GC----AGCT-AGA--GGT-AATG-A-AC-G--GTT-----AG--T-TAA-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--CGAGCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GA-GA-GCGAGA
gi|105974                     :                  T-----CCGTCC---AACCCTTGTCAG-AG-TTTGTGGG-T--TA------T-GAGAAAGC----AG-T-AGAACGAT-A-TC-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-T-AC--CATAGACGATGCGAGA
gi|105975                     :                   -----CCGTCTTGAATCCCTTTACTG-A--TTTGTCGG-T--TA------T-CAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AGTT-T--C-A--GTT-----GG--T-TAC-AGC--CA-A----A-----A---ATGGA--C--TTTA-CTTCCAGT-TCAC--CAA-GACGATACGAGA
gi|105976                     :                                            G-A--TTTGTCGG-T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATT-G-AC-G--ATT-----GA--T-TAC-AGC--C--A---TC-----ATTCATCCATTC--TTTA-TTTTC----TCATAACAT-GA-GAT
gi|105977                     :                           cccttttagattcagttG-A--TATGTCGG-TATTA------T-GAGA--GC----AG-T-AGA-CGATAAATT-G-ACAG--ATTCGCTGGA--T-TACTAGC--C--A---TC-----A---AT
gi|105978                     :                                   cctctttagattcagtttTTGG-T--CA------T-GAGAA-GC----AG-T-AGG-CGAT-AATT-G-AC-T--GTT-----GA--
gi|105979                     :                                               aatTTGTCAC-T--TT------T-GAGAAAGC----AG-T-AGA-CGAT-AATC-G-AA-C--GTA-----TA--T-TAT-AGC--CG-A---TA-----AG--ATAGA--
gi|105980                     :                                                        G-T--TA------A-CAGAA-GC----AG-T-AAA-CGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GA--T-TACAAGC--CG-A---TG-----A---ATG---------TA---TCCAAT-TCAC--CATGGACGGTGCGAGA
gi|105981                     :                                                         -T--TA------T-GAGAA-GC----AG-T-AAG-AGAT-AATT-ACAC-G--ATT-----GAAATATAC-AGCA-CG-A---TA-----A---ATGGA--A--GCTA--TTCCAATGTCAA--CAT-GACGATGCGAGA
gi|105982                     :                                                         -T--TT------T-GAGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATC-A-AC-G--TAT-----TA--T-TAT-AGC--CG-A---TA-----G---ATAGA--
gi|105983                     :                                                           --TA------T-GTGAA-GC----AG-T-AGA-CGAT-AATT-G-AC-G--GTT-----AA--T-TGC-AGT--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--TAT-GACGATGCGAGA
gi|105984                     :                                                               ------T-GAGAA-GC----AG-G-AGA-CGAT-AACT-G-AC-G--GCT-----GA--T----------CT-A---TA-----A---ATGAA--C--TTTA-GTTCCAGT-TCAT--CAT-GGCAATGAGAGA
gi|105985                     :                                                               ------T-GAAGA-AC----AG-T-AGA-CGAT-AATA-A-AC-G--CTT-----GA--T-TAC-AACCTCA-AACTTA-----T---ATGGAT-C--GCTA-TTTCCAGT-TCAA--CAT-GGCGATGC
gi|105986                     :                                                                              C----AT-T-AGA-CAAT-AATT-G-AC-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CG-A---CA-----A---ATGGA--C--TTT--TTTCCAGT-TCAC--CAT-GGCCATGCGAGA
gi|105987                     :                                                                                       -AGC-CAAG-AGTT-G-AT-G--GTT-----GA--T-TAC-AGC--CA-A---TA-----A---ATGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--GAT-GACGATGCAAGA
gi|105988                     :                                                                                              AT-AATTTG-AC-A--GTT-----GA--T-AGT-GGC--CG-A---TA-----A---ATGGA--C--GTTA-CTTCCAAT-T
gi|105989                     :                                                                                                   TT-G-AT-G--GTT-----GA--T-TAT-AGC--CG-A---TA-----A---ATGGG--C--TTTA-TTTCCAGT-TTA
gi|105990                     :                                                                                                     -G-AC-G--ATT---------T-T-T-AGC--CG-C---TA-----A---ATGGA--C--TTTA-TTTCCAGT-TCAC--CGT-GACGATGCGAGA