lowQualScore : 111
lowQualScore : 5 11 1 1 2 2 1 2 2 1 9999999 1 666666 1 2 11 3 11 3 6 2 1 1 1 11 777777777777777 6666666 1 1 22 1 1 2 2 55555555 3 1 3 1 222 22 333 55555 1 11 1 1 33 6
lowQualScore : . .. . . . . . . . . ....... . ...... . . .. . .. . . . . . . .. ............... ....... . . .. . . . . ........ . . . . ... .. ... ..... . .. . . .. .
lowQualScore : 1 99 4 3 7 7 3 9 6 3 7777777 3 999999 2 4 77 6 77 6 1 4 2 2 2 77 666666666666666 2222222 2 2 99 2 2 4 4 66666666 5 2 5 2 222 88 222 00000 2 77 2 2 22 1
consensus : TATACA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--GACCGAGGAC
Reference ( gi|95939 ) : TATGCA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--GACCGGGGAC
gi|95923 : TATACA--A-T-TA-T-AG-AATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--GACCGAGGAC
gi|95924 : tTATACA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCC-G-A-C---T--A---C-----AA-T--A-T-T--GACCGAGGAC
gi|95925 : tTATACA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-GTT--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-AGT-T--A---C------A-T--A-T-T--GA-CGAGAAC
gi|95926 : tTATACA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T----T-T-G--C-A---C-AA--------C-CCG-A-A-GT--T--A---A-----AC-T--A-T-T--GA-CGAGAAC
gi|95930 : tTATG-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-TGTGG-A-T-G-A----G-G-TC--AGA--T-TC-A-T-G-G-C--T---------------T--T-A--TCA-G--C-A-CTC-AA--------CGCCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T----T-T--GAC
gi|95941 : tTATACA--A-T--A-T-AG-CATG-T-T---GTA-T-G-A----G-GGTC--AGA--T-CG-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CTG-G-A-GC--T--A---------AA-T--A-T-T--GACCGAGAACaga
gi|95931 : TATACA--AAT-TA-T-AGTCATG-T-T---G-----G-ATTTCG-G-TC--A-A--T-TC-A-TTG-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-A-AT--------C-CCT-GAA-G---T--A---C-----AA-T--ACT-T--GAC
gi|95942 : tTATACA--A-T-TA-TCAG-CATG-T-T-------T-G-C----T-G-TC-------T-TCCA-T-G-G-T--T---------------TCTT-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-GCA-G---T--A---CTAT--AA-T--A-T-T--GACgaagaac
gi|95944 : TATACATAG-T-TA-TTAG--ATG-TAT---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-ATTT-TC-A-T-G-G-T--TTAGCGACTTCTTTTAT--T-A--T-A-G--C-AGC-C-AA--------C-CTG-G-A-G---T--ATTCC-----AA-TCCA-T-T--GACCGgag
gi|95934 : TATACA--A-TCTA-T-AG-CAT-------------------------TT--A------TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-ACCT-A-G--C-A-C-C-AAA-------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AACT--A-T-atga
gi|95945 : tTATACA--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G---C--T---------------T--T-A--G-A----C-A-C-C-----------T-TCG-A-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--CACCGA
gi|95933 : TATACA--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TT--A-A--T----A-T-G-A-TGAT---------------T--T-A--T-A-G-----------A--------CACCT-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--CACTGA
gi|95935 : tTATACA--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C-CTAA--------------G-AAG---T--A---C-----AA-T--A-T-T--CACCG
gi|95936 : tTATACA--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-CCGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-G----A-CAC-A-------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--CACCGAa
gi|95938 : tTATACA--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-AC-AAT-G-A-T--T---------------T---------A-G-----------A--------CACCT-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--CACTGA
gi|95937 : tTATACA--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----A-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-G-----------A--------C-ACT-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--CACCGA
gi|95946 : tATACA--A-T-TA-T-AG-CATGTT-T---G-A-T-C-A----GCG-TC--A-A--TGTC-G-T-G-G-T--T---------------TA-A-A--C-A-G--C-A-A-C-AA--------C-CCT-T-A-G---TG-A---C------A-T--A-T-T--GAC
gi|95929 : TACA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AGT-G-A----G-G-T---A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--TAA--T-A-G--C-A---C-AA--------C-CCTCG-A-G---T--A---C-----AT-T--A-T-TGAGACCGAGGgag
gi|95947 : ttacCA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AAT-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-G--T-A-G--C-A-C-C-A-----------CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--GACCGA
gi|95949 : aCA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-C---G-AAT-T-C----G-G-TC--T-T--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-T---T--A---T-----AA-T--A-T-A--GACCTCGGAC
gi|95950 : aCA--A-T-TA-T-AG--ATG-T-T---G-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--T-TC-AAT-G-G-T--T---------------T--T-T--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT---A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-A--GACC
gi|95951 : aCA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AAT-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G---T--T---------------T--T-C--C---G--C-A-C-C-AA--------C-CGT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-A-A--GACCTCGGAC
gi|95927 : aCA--A-T-TAAT-AG-CATG-T-T---A-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--TATC-A-T-G-G-T--T---------------T----A--T-A-G--C-A-C-CTAA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-
gi|95928 : ttaaaCA--A-T-TAAT-AG-CATG-T-T---A-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--TATC-A-T-G---T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-GAA-G---T--AT--C-----AA-T--A-T-
gi|95943 : ttaaaCA--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---A-A-A-G-ATT--G-G-T---A-A--T-TC-G---A-G-T--T---------------C--T-A--T-AAG--C-A-C-C-AA--------G-CCC-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-G-TA-GACC
gi|95948 : taaaCA--A-T-TA---AC-CATG-T-G---A-A-T-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-GCG-T--T---------------T--T-A--T-A-C--C-A-C-C-AA--------A-CCT-G---G---TTGA---C------A-T--A-T-A--GACC
gi|95952 : aCA--A-A-TA-T-AG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-AC---T-A-G-A--T---------------T--T----T-A-G--A-A-C----A--------C-CTG-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--CACCGA
gi|95953 : a--A-T-TA-T-AG-CATAAT-T---G-A-TTG-T----G-G-TC--A-A--T-T--A-T-G-G-T--T---------------TC-T-A--T-A-G--CCA-C-C-AA--------C-CCT---A-G---T--A---C-----AA-T--A-TAC--GACC
gi|95932 : --A-T-AA-T-AG-CA-G-T-T---G-T-T-G-A----G-GGTCTGATA--T-CC-A-T-G-T-T--T---------------G--T-A--T-A-AGCC-A-C-C-AA--------C-C-T-G-A-G---T--A---CTATAAAA-T--A-T-T--GACCGAGGAC
gi|95940 : ttatactac-TG-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-A-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-T-AG--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----A
gi|95954 : tgtacaG-CTTG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TA--T-A--C-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--TTA--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCC-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--GACCGAGGAC
gi|95956 : ----G-G-TC--C-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-C-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-A--GATC
gi|95955 : ----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-A-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AACACTTCGTC-CCC-G---G---T------C-----AA-T--A-T-T--G
gi|95955 : -CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--GACCGGGGACtactcagg
Alignments
lowQualScore : 111
lowQualScore : 1 33 1 1 2 2 1 2 2 1 8888888 1 666666 1 2 11 3 11 3 5 2 1 1 1 11 777777777777777 5555555 1 1 66 1 1 1 2 55555555 1 1 3 1 222 22 333 55555 1 11 1 1 33 1
lowQualScore : . .. . . . . . . . . ....... . ...... . . .. . .. . . . . . . .. ............... ....... . . .. . . . . ........ . . . . ... .. ... ..... . .. . . .. .
lowQualScore : 3 11 3 3 6 6 2 5 5 2 8888888 2 444444 2 4 66 5 66 5 9 4 2 2 2 66 444444444444444 5555555 2 2 33 2 2 2 4 44444444 2 2 5 2 222 88 222 00000 2 77 2 2 22 3
consensus : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
Reference ( family-559 ) : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95923 : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-AATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95924 : tTATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCC-G-A-C---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95925 : tTATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-GTT--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-AGT-T--A---C------A-T--A-T-T--G-A-CGAGAAC
gi|95926 : tTATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T----T-T-G--C-A---C-AA--------C-CCG-A-A-GT--T--A---A-----AC-T--A-T-T--G-A-CGAGAAC
gi|95927 : tTAAAC-A--A-T-TAAT-AG-CATG-T-T---A-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--TATC-A-T-G-G-T--T---------------T----A--T-A-G--C-A-C-CTAA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-
gi|95928 : tTAAAC-A--A-T-TAAT-AG-CATG-T-T---A-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--TATC-A-T-G---T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-GAA-G---T--AT--C-----AA-T--A-T-
gi|95929 : tTAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AGT-G-A----G-G-T---A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--TAA--T-A-G--C-A---C-AA--------C-CCTCG-A-G---T--A---C-----AT-T--A-T-TGAG-ACCGAGG
gi|95930 : ttac-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-TGTGG-A-T-G-A----G-G-TC--AGA--T-TC-A-T-G-G-C--T---------------T--T-A--TCA-G--C-A-CTC-AA--------CGCCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T----T-T--G-ACAGA
gi|95931 : ttatgTATAC-A--AAT-TA-T-AGTCATG-T-T---G-----G-ATTTCG-G-TC--A-A--T-TC-A-TTG-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-A-AT--------C-CCT-GAA-G---T--A---C-----AA-T--ACT-T--G-ACGAAGAAC
gi|95932 : tTATACTAC-A-T-AA-T-AG-CA-G-T-T---G-T-T-G-A----G-GGTCTGATA--T-CC-A-T-G-T-T--T---------------G--T-A--T-A-AGCC-A-C-C-AA--------C-C-T-G-A-G---T--A---CTATAAAA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95933 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TT--A-A--T----A-T-G-A-TGAT---------------T--T-A--T-A-GA-C-A-C-C---------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACTGAG
gi|95934 : tTATAC-A--A-TCTA-T-AG-CAT-------------------------TT--A------TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-ACCT-A-G--C-A-C-C-AAA-------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AACT--A-T-
gi|95935 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C-CTAA--------------G-AAG---T--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGA
gi|95936 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-CCGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C----A------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95937 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----A-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-G-----------A--------C-ACT-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95938 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-AC-AAT-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C-C---------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACTGAG
gi|95939 : tTATGC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGGGGAC
gi|95940 : TGTAC-A------TG-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-A-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-T-AG--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----A
gi|95941 : TATAC-A--A-T--A-T-AG-CATG-T-T---GTA-T-G-A----G-GGTC--AGA--T-CG-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CTG-G-A-GC--T--A---------AA-T--A-T-T--G-ACCGAGAAC
gi|95942 : TATAC-A--A-T-TA-TCAG-CATG-T-T-------T-G-C----T-G-TC-------T-TCCA-T-G-G-T--T---------------TCTT-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-GCA-G---T--A---CTAT--AA-T--A-T-T--G-A-CGAG
gi|95943 : TAAAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---A-A-A-G-ATT--G-G-T---A-A--T-TC-G---A-G-T--T---------------C--T-A--T-AAG--C-A-C-C-AA--------G-CCC-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-G-TA-G-ACC
gi|95944 : TATAC-ATAG-T-TA-TTAG--ATG-TAT---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-ATTT-TC-A-T-G-G-T--TTAGCGACTTCTTTTAT--T-A--T-A-G--C-AGC-C-AA--------C-CTG-G-A-G---T--ATTCC-----AA-TCCA-T-T--G-ACCGATGA
gi|95945 : TATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G---C--T---------------T--T-A--G-A----C-A-C-C-----------T-TCG-A-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95946 : ATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATGTT-T---G-A-T-C-A----GCG-TC--A-A--TGTC-G-T-G-G-T--T---------------TA-A-A--C-A-G--C-A-A-C-AA--------C-CCT-T-A-G---TG-A---C------A-T--A-T-T--G-A-CGAG
gi|95947 : AC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AAT-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-G--T-A-G--C-A-C-C-A-----------CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAG
gi|95948 : AC-A--A-T-TA---AC-CATG-T-G---A-A-T-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-GCG-T--T---------------T--T-A--T-A-C--C-A-C-C-AA--------A-CCT-G---G---TTGA---C------A-T--A-T-A--G-ACC
gi|95949 : AC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-C---G-AAT-T-C----G-G-TC--T-T--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-T---T--A---T-----AA-T--A-T-A--G-ACCTCGGAC
gi|95950 : AC-A--A-T-TA-T-AG--ATG-T-T---G-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--T-TC-AAT-G-G-T--T---------------T--T-T--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT---A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-A--G-ACC
gi|95951 : AC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AAT-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G---T--T---------------T--T-C--C---G--C-A-C-C-AA--------C-CGT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-A-A--G-ACCTCGGAC
gi|95952 : AC-A--A-A-TA-T-AG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-AC---T-A-G-A--T---------------T--T----T-A-G--A-A-C----A--------C-CTG-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95953 : --A-T-TA-T-AG-CATAAT-T---G-A-TTG-T----G-G-TC--A-A--T-T--A-T-G-G-T--T---------------TC-T-A--T-A-G--CCA-C-C-AA--------C-CCT---A-G---T--A---C-----AA-T--A-TAC--G-ACC
gi|95954 : G-CTTG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TA--T-A--C-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--TTA--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCC-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95955 : ----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-A-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AACACTTCGTC-CCC-G---G---T------C-----AA-T--A-T-T--GTACTCAGG
gi|95956 : ----G-G-TC--C-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-C-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-A--G-ATC
Alignments
lowQualScore : 111
lowQualScore : 1 33 1 1 2 2 1 2 2 1 8888888 1 666666 1 2 11 3 11 3 5 2 1 1 1 11 777777777777777 5555555 1 1 66 1 1 1 2 55555555 1 1 3 1 222 22 333 55555 1 11 1 1 33 1
lowQualScore : . .. . . . . . . . . ....... . ...... . . .. . .. . . . . . . .. ............... ....... . . .. . . . . ........ . . . . ... .. ... ..... . .. . . .. .
lowQualScore : 3 11 3 3 6 6 2 5 5 2 8888888 2 444444 2 4 66 5 66 5 9 4 2 2 2 66 444444444444444 5555555 2 2 33 2 2 2 4 44444444 2 2 5 2 222 88 222 00000 2 77 2 2 22 3
consensus : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
Reference ( family-559 ) : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95923 : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-AATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95924 : tTATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCC-G-A-C---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95925 : tTATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-GTT--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-AGT-T--A---C------A-T--A-T-T--G-A-CGAGAAC
gi|95926 : tTATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T----T-T-G--C-A---C-AA--------C-CCG-A-A-GT--T--A---A-----AC-T--A-T-T--G-A-CGAGAAC
gi|95927 : tTAAAC-A--A-T-TAAT-AG-CATG-T-T---A-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--TATC-A-T-G-G-T--T---------------T----A--T-A-G--C-A-C-CTAA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-
gi|95928 : tTAAAC-A--A-T-TAAT-AG-CATG-T-T---A-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--TATC-A-T-G---T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-GAA-G---T--AT--C-----AA-T--A-T-
gi|95929 : tTAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AGT-G-A----G-G-T---A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--TAA--T-A-G--C-A---C-AA--------C-CCTCG-A-G---T--A---C-----AT-T--A-T-TGAG-ACCGAGG
gi|95930 : ttac-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-TGTGG-A-T-G-A----G-G-TC--AGA--T-TC-A-T-G-G-C--T---------------T--T-A--TCA-G--C-A-CTC-AA--------CGCCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T----T-T--G-ACAGA
gi|95931 : ttatgTATAC-A--AAT-TA-T-AGTCATG-T-T---G-----G-ATTTCG-G-TC--A-A--T-TC-A-TTG-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-A-AT--------C-CCT-GAA-G---T--A---C-----AA-T--ACT-T--G-ACGAAGAAC
gi|95932 : tTATACTAC-A-T-AA-T-AG-CA-G-T-T---G-T-T-G-A----G-GGTCTGATA--T-CC-A-T-G-T-T--T---------------G--T-A--T-A-AGCC-A-C-C-AA--------C-C-T-G-A-G---T--A---CTATAAAA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95933 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TT--A-A--T----A-T-G-A-TGAT---------------T--T-A--T-A-GA-C-A-C-C---------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACTGAG
gi|95934 : tTATAC-A--A-TCTA-T-AG-CAT-------------------------TT--A------TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-ACCT-A-G--C-A-C-C-AAA-------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AACT--A-T-
gi|95935 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C-CTAA--------------G-AAG---T--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGA
gi|95936 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-CCGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C----A------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95937 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----A-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-G-----------A--------C-ACT-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95938 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-AC-AAT-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C-C---------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACTGAG
gi|95939 : tTATGC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGGGGAC
gi|95940 : TGTAC-A------TG-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-A-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-T-AG--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----A
gi|95941 : TATAC-A--A-T--A-T-AG-CATG-T-T---GTA-T-G-A----G-GGTC--AGA--T-CG-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CTG-G-A-GC--T--A---------AA-T--A-T-T--G-ACCGAGAAC
gi|95942 : TATAC-A--A-T-TA-TCAG-CATG-T-T-------T-G-C----T-G-TC-------T-TCCA-T-G-G-T--T---------------TCTT-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-GCA-G---T--A---CTAT--AA-T--A-T-T--G-A-CGAG
gi|95943 : TAAAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---A-A-A-G-ATT--G-G-T---A-A--T-TC-G---A-G-T--T---------------C--T-A--T-AAG--C-A-C-C-AA--------G-CCC-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-G-TA-G-ACC
gi|95944 : TATAC-ATAG-T-TA-TTAG--ATG-TAT---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-ATTT-TC-A-T-G-G-T--TTAGCGACTTCTTTTAT--T-A--T-A-G--C-AGC-C-AA--------C-CTG-G-A-G---T--ATTCC-----AA-TCCA-T-T--G-ACCGATGA
gi|95945 : TATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G---C--T---------------T--T-A--G-A----C-A-C-C-----------T-TCG-A-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95946 : ATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATGTT-T---G-A-T-C-A----GCG-TC--A-A--TGTC-G-T-G-G-T--T---------------TA-A-A--C-A-G--C-A-A-C-AA--------C-CCT-T-A-G---TG-A---C------A-T--A-T-T--G-A-CGAG
gi|95947 : AC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AAT-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-G--T-A-G--C-A-C-C-A-----------CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAG
gi|95948 : AC-A--A-T-TA---AC-CATG-T-G---A-A-T-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-GCG-T--T---------------T--T-A--T-A-C--C-A-C-C-AA--------A-CCT-G---G---TTGA---C------A-T--A-T-A--G-ACC
gi|95949 : AC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-C---G-AAT-T-C----G-G-TC--T-T--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-T---T--A---T-----AA-T--A-T-A--G-ACCTCGGAC
gi|95950 : AC-A--A-T-TA-T-AG--ATG-T-T---G-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--T-TC-AAT-G-G-T--T---------------T--T-T--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT---A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-A--G-ACC
gi|95951 : AC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AAT-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G---T--T---------------T--T-C--C---G--C-A-C-C-AA--------C-CGT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-A-A--G-ACCTCGGAC
gi|95952 : AC-A--A-A-TA-T-AG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-AC---T-A-G-A--T---------------T--T----T-A-G--A-A-C----A--------C-CTG-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95953 : --A-T-TA-T-AG-CATAAT-T---G-A-TTG-T----G-G-TC--A-A--T-T--A-T-G-G-T--T---------------TC-T-A--T-A-G--CCA-C-C-AA--------C-CCT---A-G---T--A---C-----AA-T--A-TAC--G-ACC
gi|95954 : G-CTTG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TA--T-A--C-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--TTA--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCC-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95955 : ----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-A-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AACACTTCGTC-CCC-G---G---T------C-----AA-T--A-T-T--GTACTCAGG
gi|95956 : ----G-G-TC--C-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-C-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-A--G-ATC
blockSeqs : T TA A C A C T A T A GTGGA T ATTTC C G TG G TT A G A T C T GA TAGCGACTTCTTTTA TACC C A GC C G T T CACTTCGT G C A A AAG TG TTC TATAA C CC C A GA T
blockSeqs : . C . . A T . A A . GAG . ATT . G . T . A G A . . . . . CTTA . . A . . . T A . . A . AAG G T TAT . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GTA . TC . . . G . G G . . . . . . TAA . . A . . . . . . . C . AAG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GAA . TC . . . . . . C . . . . . . AAA . . A . . . . . . . . . AAG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GAA . TC . . . . . . G . . . . . . CTA . . A . . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GAA . A . . . . . . . . . . . . . TTA . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GA . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GA . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GA . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . AA . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . AA . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GT . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . TT . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . TT . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . TT . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . TT . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . TT . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GA . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GA . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . AA . C . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GA . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . TT . A . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . GA . A . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . AA . C . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GA . C . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . C . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GA . C . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GA . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
finalCons : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
Alignments
lowQualScore : 111
lowQualScore : 1 33 1 1 2 2 1 2 2 1 8888888 1 666666 1 2 11 3 11 3 5 2 1 1 1 11 777777777777777 5555555 1 1 66 1 1 1 2 55555555 1 1 3 1 222 22 333 55555 1 11 1 1 33 1
lowQualScore : . .. . . . . . . . . ....... . ...... . . .. . .. . . . . . . .. ............... ....... . . .. . . . . ........ . . . . ... .. ... ..... . .. . . .. .
lowQualScore : 3 11 3 3 6 6 2 5 5 2 8888888 2 444444 2 4 66 5 66 5 9 4 2 2 2 66 444444444444444 5555555 2 2 33 2 2 2 4 44444444 2 2 5 2 222 88 222 00000 2 77 2 2 22 3
consensus : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
Reference ( family-559 ) : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95923 : TATAC-A--A-T-TA-T-AG-AATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95924 : tTATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCC-G-A-C---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95925 : tTATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-GTT--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-AGT-T--A---C------A-T--A-T-T--G-A-CGAGAAC
gi|95926 : tTATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T----T-T-G--C-A---C-AA--------C-CCG-A-A-GT--T--A---A-----AC-T--A-T-T--G-A-CGAGAAC
gi|95927 : tTAAAC-A--A-T-TAAT-AG-CATG-T-T---A-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--TATC-A-T-G-G-T--T---------------T----A--T-A-G--C-A-C-CTAA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-
gi|95928 : tTAAAC-A--A-T-TAAT-AG-CATG-T-T---A-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--TATC-A-T-G---T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-GAA-G---T--AT--C-----AA-T--A-T-
gi|95929 : tTAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AGT-G-A----G-G-T---A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--TAA--T-A-G--C-A---C-AA--------C-CCTCG-A-G---T--A---C-----AT-T--A-T-TGAG-ACCGAGG
gi|95930 : ttac-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-TGTGG-A-T-G-A----G-G-TC--AGA--T-TC-A-T-G-G-C--T---------------T--T-A--TCA-G--C-A-CTC-AA--------CGCCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T----T-T--G-ACAGA
gi|95931 : ttatgTATAC-A--AAT-TA-T-AGTCATG-T-T---G-----G-ATTTCG-G-TC--A-A--T-TC-A-TTG-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-A-AT--------C-CCT-GAA-G---T--A---C-----AA-T--ACT-T--G-ACGAAGAAC
gi|95932 : tTATACTAC-A-T-AA-T-AG-CA-G-T-T---G-T-T-G-A----G-GGTCTGATA--T-CC-A-T-G-T-T--T---------------G--T-A--T-A-AGCC-A-C-C-AA--------C-C-T-G-A-G---T--A---CTATAAAA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95933 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TT--A-A--T----A-T-G-A-TGAT---------------T--T-A--T-A-GA-C-A-C-C---------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACTGAG
gi|95934 : tTATAC-A--A-TCTA-T-AG-CAT-------------------------TT--A------TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-ACCT-A-G--C-A-C-C-AAA-------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AACT--A-T-
gi|95935 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C-CTAA--------------G-AAG---T--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGA
gi|95936 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-CCGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C----A------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95937 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----A-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G-A-T--T---------------T---------A-G-----------A--------C-ACT-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95938 : tTATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-AC-AAT-G-A-T--T---------------T---------A-GA-C-A-C-C---------------T-G-A-GAAGT--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACTGAG
gi|95939 : tTATGC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGGGGAC
gi|95940 : TGTAC-A------TG-T-AG-CATG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-A-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-T-AG--------C-CCT-G-A-G---T--A---C-----A
gi|95941 : TATAC-A--A-T--A-T-AG-CATG-T-T---GTA-T-G-A----G-GGTC--AGA--T-CG-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CTG-G-A-GC--T--A---------AA-T--A-T-T--G-ACCGAGAAC
gi|95942 : TATAC-A--A-T-TA-TCAG-CATG-T-T-------T-G-C----T-G-TC-------T-TCCA-T-G-G-T--T---------------TCTT-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-GCA-G---T--A---CTAT--AA-T--A-T-T--G-A-CGAG
gi|95943 : TAAAC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---A-A-A-G-ATT--G-G-T---A-A--T-TC-G---A-G-T--T---------------C--T-A--T-AAG--C-A-C-C-AA--------G-CCC-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-G-TA-G-ACC
gi|95944 : TATAC-ATAG-T-TA-TTAG--ATG-TAT---G-A-T-G-A----G-G-TC--A-ATTT-TC-A-T-G-G-T--TTAGCGACTTCTTTTAT--T-A--T-A-G--C-AGC-C-AA--------C-CTG-G-A-G---T--ATTCC-----AA-TCCA-T-T--G-ACCGATGA
gi|95945 : TATAC-A--A-T-TA-T-TG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-ACGA-T-G---C--T---------------T--T-A--G-A----C-A-C-C-----------T-TCG-A-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95946 : ATAC-A--A-T-TA-T-AG-CATGTT-T---G-A-T-C-A----GCG-TC--A-A--TGTC-G-T-G-G-T--T---------------TA-A-A--C-A-G--C-A-A-C-AA--------C-CCT-T-A-G---TG-A---C------A-T--A-T-T--G-A-CGAG
gi|95947 : AC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AAT-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-G--T-A-G--C-A-C-C-A-----------CCT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAG
gi|95948 : AC-A--A-T-TA---AC-CATG-T-G---A-A-T-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-GCG-T--T---------------T--T-A--T-A-C--C-A-C-C-AA--------A-CCT-G---G---TTGA---C------A-T--A-T-A--G-ACC
gi|95949 : AC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-C---G-AAT-T-C----G-G-TC--T-T--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-G-A-T---T--A---T-----AA-T--A-T-A--G-ACCTCGGAC
gi|95950 : AC-A--A-T-TA-T-AG--ATG-T-T---G-A-T-TTC----G-G-TC--A-A--T-TC-AAT-G-G-T--T---------------T--T-T--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT---A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-A--G-ACC
gi|95951 : AC-A--A-T-TA-T-AG-CATG-T-T---G-AAT-T-C----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G---T--T---------------T--T-C--C---G--C-A-C-C-AA--------C-CGT-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-A-A--G-ACCTCGGAC
gi|95952 : AC-A--A-A-TA-T-AG-C-TG-T-T---T-T-T-G-A----G-G-TC--A-A--T-AC---T-A-G-A--T---------------T--T----T-A-G--A-A-C----A--------C-CTG-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--C-ACCGAG
gi|95953 : --A-T-TA-T-AG-CATAAT-T---G-A-TTG-T----G-G-TC--A-A--T-T--A-T-G-G-T--T---------------TC-T-A--T-A-G--CCA-C-C-AA--------C-CCT---A-G---T--A---C-----AA-T--A-TAC--G-ACC
gi|95954 : G-CTTG-T-T---G-A-T-G-A----G-G-TA--T-A--C-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--TTA--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCC-G-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-T--G-ACCGAGGAC
gi|95955 : ----G-G-TC--A-A--T-TC-A-T-G-A-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AACACTTCGTC-CCC-G---G---T------C-----AA-T--A-T-T--GTACTCAGG
gi|95956 : ----G-G-TC--C-A--T-TC-A-T-G-G-T--T---------------T--T-A--T-A-G--C-A-C-C-AA--------C-CCT-C-A-G---T--A---C-----AA-T--A-T-A--G-ATC