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Reference ( gi|87396 ) : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-AA------T----A-T-AA--T--A-----A---AAAAAAAA-A-TT-A-TT----C-CT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTATT
gi|87397 : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-AA------T----A-T-AA--T--A-----A---AAAAAAAA-A-TT-T-TA----C-CT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTATT
gi|87400 : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-GTC-AA------T----A-T-AA--T--------A---AAAAAAAA-A-TT-A-TT----C-CT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTAT
gi|87398 : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-AA------T----A-T-AA--T--A-----A---AAAAAAA-----T-A-TT----C-CT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTATT
gi|87399 : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-AA------T----A-T-AA--T--A-----A---AAAAAA------T-A-TT----C-CT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTA
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gi|87405 : CACAG-G-AGCTT-G-ACG-TT-CA-T-ATC-AA------T----A-G-AA--T--A-----G---AAAAAAAA-A--T-A-TT----C-CT-GTG-T---A--C-TA--A-A--CTTATT
gi|87411 : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-A-ATA-AA------T----A-T-AACTT--T-----A---AGAAAAAA-A-TT-AGTT----C-CT-GTG-C---A--C-T---A-A--CTTATT
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gi|87403 : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-GATAGGCCT----A-T-AA--T--A-----A---GAAAAAAA-A--T-A-TT----C-AT-GTG-T---A--C-T---G-A--
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gi|87424 : CACAA-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-AA------T----A-T-
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Alignments
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Alignments
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blockSeqs : C G T G T AT CA TAGGCC TGTA A A CT TG TTAATA ATT T G A C A GCA AT G AAA T AC
blockSeqs : . . . . . TT CT AC . . G . . AGGG TTT A . . . . A . . A . .
blockSeqs : . . . . . TA CG . . . T . . TTTT AT . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . AGG AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . CAT AA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . AG AA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . AT AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T T . . . . . . AG AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . A AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . A AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . A AA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . A AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . A GT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A A . . . . . . A AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A C . . . . . . A AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A A . . . . . . G AA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A A . . . . . . A AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A C . . . . . . A AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A A . . . . . . A A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C C . . . . . . A A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A A . . . . . . A A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T A . . . . . . A A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A C . . . . . . A A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . A G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C . . . . . . A T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-AA------T----A-T-AA--T--A-----A---AAAAAAAA-A-TT-A-TTC-CT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTATT
finalCons : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-AA------T----A-T-AA--T--A-----A---AAAAAAAA-A-TT-A-TTC-CT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTATT
Alignments
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Reference ( family-552 ) : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-AA------T----A-T-AA--T--A-----A---AAAAAAAA-A-TT-A-TTC-CT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTATT
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gi|87419 : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-A-ATA-AA------T------T-AA--T--ATTAATA---AAAAAAAA-A-TT-A-TTC-CT-GT--T---A--T-T---A-A--CATA
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gi|87422 : CACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-A-ATA-AA------T----A-T-AA--T--ATTTT----------------TT-T-TTC-CT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTATT
gi|87423 : CACAGCG-CGCTT-G-ACG-T-----------AA------T-------------------------AAAAAAAA-A-TT-A-TTC-CT-G-G-T---A--C-T---A-A--CTTATT
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gi|87426 : ACAG-G-CGCTT-G-ACG-TTTCA-T-ATC-AA------T----A-T-AA--T--A-----A---AAAAAAA-------A-TTC-TT-GTG-T---A--C-T---A-A--CTTATT
gi|87427 : CAA-G-CGCTTTG-ACG-TT-CA-T-ATC-AA------T----AAT-AA--T--A-----G---AAAAAAAA-A-AT-A-TTC-CT-GTG-TA--A--C-T---A-A--CTTATT
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