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lowQualScore                  :           .      .   .   .  .. . . .  . ..   .  ..  .. .  .  . . ..... .   . ..  .    ....  . . ...   ....  . . ..     .. .   . ........ ..... . .  . .  ..    .   . .  ......... ......  . ..  . ...  .... ........ .. .. . .... ..     ... . .....  . ... ..  ..   .. .  .  .....  .    . .  ..   . .  .    .  ...  . .    . ... .  .    
lowQualScore                  :           4      4   4   2  77 2 2 2  2 00   2  00  77 2  2  2 2 44444 2   2 00  2    4444  3 6 333   7777  3 9 88     11 6   6 55555555 55555 2 2  2 2  00    5   2 0  222222222 666666  2 77  2 222  0000 88888888 22 77 2 5555 22     888 7 11111  7 333 00  33   88 8  8  77777  0    1 1  55   5 5  5    5  444  0 5    5 111 7  7    
consensus                     :        CAGGGTTCGA-CAC-TAA-CG--C-T-A-GT-C--CGG-TA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--T-T----A--AAACC---C-T-----AT-A-N-A--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-A-TG--ATG-A-AC-TTTA-TC---AA-A-TGAA-A-G-A-TA-TTCA
Reference ( gi|80962 )        :        CAGCGTTCGA-CAC-TAA-CG--C-T-A-GT-C--CGG-TA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--T-T----A--AAACC---C-T-----AT-A-A-A--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-A-TG--ATG-A-AC-TTTA-TC---AA-A-TGAA-A-T-A-TA-TTCA
gi|80963                      :        CAGCGTTCGA-CAC-TAA-CG--C-T-A-GT-C--CGG-TA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--T-T----A--AAACC---C-T-----AT-A-A-A--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-A-TG--ATG-A-AC-TTTA-TC---AA-A-TGAA-A-T-A-TA-TTC
gi|80964                      :        CAGCGTTCGA-CAC-TAA-CG--C-T-A-GT-C--CGG-TA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T----CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--T-T----A--AAACC---C-T-----AT-A-A-A--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-A-TG--ATG-A-AC-TTTA-TC---AA-A-TGAA-A-T-A-TA-TTCA
gi|80965                      :        CAGGGTTTGA-CAC-TAA-TG--C-T-A-GT-T--AGG-TA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--T-T----A--AAACC---C-T-----AT-A-C-A--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-A-TG--ATG-A-AC-TTTA-TC---AA-A-TGAA-A-G-A-TA-TTCA
gi|80966                      :        CAGGGTTCGA-CAC-TAA-CG--C-T-A-GT-C--CGG-TA--GC--C-CG-AG-GGC-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-T---CGG----AC-T-A--CCAAA--G-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--T-T----A--AAACC---C-T-----AT-A-C-A--TG--ATG--C-TC-AT-----AA-AATG-A-TA--ATG-A-AC-TT---TC---AA-A-TGAA-A-G-A-TA-TTCA
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gi|80969                      :        agggttTCGA-CAC-TAA-CG--G-T-A-GT-C--CGG-TA--GC--C-TG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTA----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--ATTAT-C--------------T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-A-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--T-C----A--AAACC---CTT-----AT-A-C-A--TG--ATG--C-TG-AT---A-AA-AATG-A-TG--ATG-A-AC--TTA-TC---AA-A-TGAA-A-G-A-TA-TTCA
gi|80967                      :         cagggTCGA-CAC-TAA-CG--C-T-A--T-C--CG---A--GC--C-C--AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTT-----GT-C-C---CG-----AC-T-A--CAAAA--T-TAT-A--------A--T--T-T-AT-A-AG--T-GT-CCA-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--T-T----A--AAACT---C-TTG---GT-A-C-AT-TG--ATG--CTTG-AT---G--A-AATG-A-TGGCATG-A-AC-TTCA-TC---AA-A-TGAA-AGC-A-TA-GTCA
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gi|80975                      :        caggtgTCAA-CAC-TAA-TG--T-T-A-GT-C--AGG-TA--GC--C-TG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-T---TGG----AC-T-G--TCACA--A-TTT-C--------A--G--T-T-AC-G-AG--TAGT-CCG-G-CG---------A------AC-T--AC-T---GAGGCCA-------CA--A--T-T----A--AAA
gi|80991                      : cagggttcgacagTCAA-CAC-TAA-TG--T-T-A-AT-C--AGG-TA--GC--C-TG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-CGT---TGG----AC-T-G--TC-AC--A-TTT-C--------A--G--T-T-AC-G-AG--TAGT-CCG-G-CG---------A------AC-T--AC-T---GAGGCCA-------CA--A--T-T----A--AAA
gi|80984                      :               CGA-CAC-TAAACG--C-TTA-GT-CG-CGG-TATTGC--C--G-AG-G-C-----T-AGTTA--AA-TGTT----GT-C-CTGCCGG----AC-TTA--CCAAATTA-TAT-C--------GATT--T-T-AT-A-AG--T-GT-CCG-GGTG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TATTA--T-T----AGGAAACC---C-T-----AT-A-A-A--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-GAT--A-TG--ATG-AGAC-TTTA-TCGGGAA-A-TGAAGA-T---TA-TT
gi|80987                      :           gggttcg-CAC-TAA-CG--C-T-A-GT-C--CGA-TA--GC--C-CA------C-----T-AGT-A--AA-ATTT-------C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-A--------A--T--T-T-AT-A-AA--TAGT-CC--G-TG---------G------AC-T--AC-T----A----A-------TA--A--T-T-------AAACC---C-T------T-A-C-A--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AAAT-A-TGT-ATG-A-AA-TCAA-AC---AA-A-TGAA-A-A-ACCA-TTCA
gi|80992                      :                ggttcaccAA-CA--C-T-A-CT-C--CGT-TA--AC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----AC-C-C---CAG----AC-T-C--TTA-------GT-T--------A--C--T-T-------G--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---GA----AAAAAATCTA--A--T-A----AC-AAACC---G-C-----GT-C-A-A--TG--CTGCCC-TT-AG---A-AA-AAT--A-TG--GT
gi|80993                      :                         A-CA--C-T-G-GT-TTACGG-GG--GC--C-CGTAG-G-CC----T-AGT-TT-AG-TTTTATATGT-C-C---AAGGTTTAC-T-AGGCCAAA--A-TATAT--------A--T--T-T-AA-A-AG--TAGT-GCC-G-TGATAGGATGGG------AC-TTAAG-T---AA----A-------TA--A--T-T----A--AAACCTGTC-TG----AT-A-C-ATTTG--ATGA-C-TG-ATAGGG-AA-AATG-A-
gi|80994                      :                          -CA--C-T-A-GT-C--CGA-T---GC--C-CG-AG-G-C-----T-ACT-A--GA-TTTC----AC-A-C---TGG----GC-T-A--GT-AA--A-TTT-C--------A--A--A-T-AT-GCAC--TGGC-CCG-A-TG---------G------GC-T--AG-T---AG----A-------AA--A--TGT----G--ATA-------T-----GT-A-A-G--TG--AT
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Reference ( family-547 )      : CAGGGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GGTA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--TT----A--AAACC---C--T-----ATA-NA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-AT-G--ATGA-A-C-TTTA-TC---AA-A-TGAAAG-A-TA-TTCA
gi|80962                      : CAGCGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GGTA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--TT----A--AAACC---C--T-----ATA-AA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-AT-G--ATGA-A-C-TTTA-TC---AA-A-TGAAAT-A-TA-TTCA
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gi|80964                      : CAGCGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GGTA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T----CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--TT----A--AAACC---C--T-----ATA-AA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-AT-G--ATGA-A-C-TTTA-TC---AA-A-TGAAAT-A-TA-TTCA
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gi|80975                      : CAGGGTT--CG--A-C-AGTCAACAC-TAA-TG--T-T-A-GT-C--A-GGTA--GC--C-TG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-T---TGG----AC-T-G--TCACA--A-TTT-C--------A--G--T-T-AC-G-AG--TAGT-CCG-G-CG---------A------AC-T--AC-T---GAGGCCA-------CA--A--TT----A--AAA
gi|80976                      : CAGGGTT--CA--A-C-A-------T-TAA-CG--C-T-A-GT-C--T-GGTA--GC--C-CG-AA-G-C-----T-AGT-C--AG-TTTT----GC-C-T---TGG----AC-T-A--TCAGA--A-TAT-C--------A--G--T-T-AC-A-AG--TAGT-CTG-G-CGA--------G------A-----AC-A---AG----A-------TGT-G--TTTGTGA--AAACA---C--T-----GTC-CA--C---ATG--C-CA-GT---G-AA-AA
gi|80977                      : CAGAGAT--TG--A-C-G-------A-TAA-CG--G-T-A-GT-C--T-GATA--GC--T-TG-AG-G-A-----T-AGT-A--AA-TATT----GC-C-C---CAG----AT-T-A--TCAGA--A-TAT-C--------A--T--T-C------------GT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------AA--A--TC----A--AAA
gi|80978                      : CAAGGTT--CA--A-C-A-------C-TAA--G----T-A-G-----C-GGTA--GT--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--GA-TTTT----GT-C-C---TGG----AA-T-A--TCAGA--G-TAT-CGGTTATGAA--C--T-T-AT-G-AG--TAGT-CCA-G-CA---------G------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--A--AT----A--AGA
gi|80979                      : CAGGGTT--TT--A-A-A-------T-TAT-CA--C-A-A-GT-C--C-GTAA--GT--C-CG-AG-A-C-----T-AGT-A--AA-AATC----AT-A-T---CGG----AC-T-A--GC-AA--A-CGT-C--------C--T--T-C-AT-C-AC--TAGT-CCGTA-TT---------G------AC-T--AG-T---AA----A--------A--A--T
gi|80980                      : CAGGGCT--CG--A-A-A-------T-AAA-CG--A-T-G-GC-C--C-GATG--GT--C-CG-GG-G-C-----C-AGT-A--AA-TTTT----G
gi|80981                      : CAGGGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GG
gi|80982                      :  AGGGTTTTCG--A-C-A-------C-TAA-CGTGC-T-A-GT-C--C-GGTAC-GC--C-CG-AGAG-C-----TGAGT-ATTAG-TTTTTG--GTTC-C---CGG----ACAT-A--CCAAAT-A-TAT----------A--T--TCT-ATGA-AG--TAGT-CCG-GATG---------GGGACTGAC-T--AT-T---AATGGCA-------TA--A--TT----A--AA-TC---C--T-----ATA-AA--TG--ATA--C-TG-AT------A-AATG-ATTG--ATGA-AAC-TTTACTC---AATACTGAAAG-A-TA-TTC
gi|80983                      :  AGGGTT--CA--A-C-A-------C-CAA-AT--C-T-A-GT-C--C-AGTA--GC--C-TG----------------T-A--AA-TTTT----GC-C-C---AGT----AC-T-A--TCAGA--A-TA--------------------------------GA-CCA-A-TG---------G------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--A--TT----A--AAAAC------------ATA--A--TGGAATGGAC-TA-AT---G-
gi|80984                      :   GGGTT--CGCGA-C-A-------C-TAAACG--C-TTA-GT-CG-C-GGTATTGC--C--G-AG-G-C-----T-AGTTA--AA-TGTT----GT-C-CTGCCGG----AC-TTA--CCAAATTA-TAT-C--------GATT--T-T-AT-A-AG--T-GT-CCG-GGTG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TATTA--TT----AGGAAACC---C--T-----ATA-AA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-GAT--AT-G--ATGAGA-C-TTTA-TCGGGAA-A-TGAAGA-T-TA-TT
gi|80985                      :   GGGTT--CA--A-C-A-------T-TAA-CG--C-T-A-GT-C--T-GGTA--GC--C-CG-AA-G-CTACCGT-AGT-A--AA-TTTT----GA-C-T---CGG----AC-T---------------T-G--------A--G--T-C-AC-G-AGT-TAGT-CCC-G-CA---------G------AT-T--AC-TTAGAA----A-------TA--A--------G--AAAC-------------A-A-GA--TG---TG--T-TT-GT---G-AACACTG-AT-G--
gi|80986                      :    GGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--G-T-A-GT-C--T-GGTA--GC--C-TG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTA----GT-T-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-TAAT-A-AG--TAGT-CCG-A-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--TC----A--AAACC---CTAT-----ATA-CA--TG--ATG--C-TG-AT---A-AA-AATGAAT-GA-ATGA-A-C-TTGA-TC---AATA-TGAAAG-A-TAGTTCA
gi|80987                      :    GGTT--CA--C-CCA-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GATA--GC--C-CA------C-----T-AGT-A--AA-ATTT-------C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-A--------A--T--T-T-AT-A-AA--TAGT-CC--G-TG---------G------AC-T--AC-T----A----A-------TA--A--TT-------AAACC---C--T------TA-CA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AAAT-AT-GT-ATGA-A-A-TCAA-AC---AA-A-TGAAAA-ACCA-TTCA
gi|80988                      :    GGTC--TG--A-C-A-------CCTAA-TG--C-T-A-GT-C--C-AGTA--GC--CATG-GG-G-C-----T-A-T-A--AA------------------------------A--TCAGA--G-TAT-C--------A--G--T-A-A--G-AG--TAGT-CCT-G-TG---------G------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--ATTTT----A--CAACC---T--T-----ATG-GA--
gi|80989                      :     GTT--CG--AAC-A-------C-TAT-CG--C-T-A-GTTC--C-AGTA--GC--C-CT-GA-G-C-----T-GGT-C--AA-TTTT----GC-C-C---TGG----AC-T-A--TCAGA--A-TAT-C--------A--G--T-T-TT-G-A----------G-G-TG---------C------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--A--TG----A--AAACC---atg
gi|80990                      :      TT--TG--A-T-G-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-AGTA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGC-A--AA-TTTT----GC-C-A---TGG----AC-T-A--TCAGA--A-TAT-C--------A--T--C-T-TT-G-GG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--A--TT----A--AAACC---C--T-----
gi|80991                      :       T--CA--A-C-A-------C-TAA-TG--T-T-A-AT-C--A-GGTA--GC--C-TG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-CGT---TGG----AC-T-G--TC-AC--A-TTT-C--------A--G--T-T-AC-G-AG--TAGT-CCG-G-CG---------A------AC-T--AC-T---GAGGCCA-------CA--A--TT----A--AAA
gi|80992                      :                             AA-CA--C-T-A-CT-C--C-GTTA--AC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----AC-C-C---CAG----AC-T-C--TTA-------GT-T--------A--C--T-T-------G--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---GA----AAAAAATCTA--A--TA----AC-AAACC---G--C-----GTC-AA--TG--CTGCCC-TT-AG---A-AA-AAT--AT-G--GT
gi|80993                      :                              A-CA--C-T-G-GT-TTAC-GGGG--GC--C-CGTAG-G-CC----T-AGT-TT-AG-TTTTATATGT-C-C---AAGGTTTAC-T-AGGCCAAA--A-TATAT--------A--T--T-T-AA-A-AG--TAGT-GCC-G-TGATAGGATGGG------AC-TTAAG-T---AA----A-------TA--A--TT----A--AAACCTGTC--TG----ATA-CATTTG--ATGA-C-TG-ATAGGG-AA-AATG-A
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gi|80995                      :                                                 -GGTA--AT--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-C--AA-TTTT----GA-C-C---CGG----GC-T-A--TCAGA--A-TAT-T--------A--G--T-T-AC-A-AG--TATT-CTG-G-TG---------G------AA-T--AT-T---AA----A-------AA--A--TT----A--Agtgatatgtaagtgat
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lowQualScore                  :        ..  .. . . ....... .   .  .. . . .  . .. .    ..  .. .  .  . . ..... .   . ..  .    ....  . . ...   ....  . . ..     .. .   . ........ ..... . .  . .  ..    .   . .  ......... ......  . ..  . ...  .... ........ .. ..  .... ..     ... .. .....   .. ..  ..   .. .  .  .....  .    .  . ..    . . .    .  ...  . .      . .  .    
lowQualScore                  :        88  88 3 3 3333333 3   2  77 2 2 2  2 99 2    99  77 2  2  2 2 22222 2   2 99  2    2222  2 5 222   7777  2 8 77     00 5   5 55555555 55555 2 2  2 2  00    5   2 8  222222222 666666  2 77  2 222  0000 88888888 22 77  5555 22     888 00 11111   44 00  44   55 7  7  00000  9    0  1 11    4 4 4    4  111  7 4      7 5  5    
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Reference ( family-547 )      : CAGGGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GGTA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--TT----A--AAACC---C--T-----ATA-NA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-AT-G--ATGA-A-C-TTTA-TC---AA-A-TGAAAG-A-TA-TTCA
gi|80962                      : CAGCGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GGTA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--TT----A--AAACC---C--T-----ATA-AA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-AT-G--ATGA-A-C-TTTA-TC---AA-A-TGAAAT-A-TA-TTCA
gi|80963                      : CAGCGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GGTA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--TT----A--AAACC---C--T-----ATA-AA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-AT-G--ATGA-A-C-TTTA-TC---AA-A-TGAAAT-A-TA-TTC
gi|80964                      : CAGCGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GGTA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-C---CGG----AC-T----CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--TT----A--AAACC---C--T-----ATA-AA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AATG-AT-G--ATGA-A-C-TTTA-TC---AA-A-TGAAAT-A-TA-TTCA
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gi|80973                      : CAGGGTT--CG--A-C-A-------C-TAA--G--C-T-A-GT-C----GGTA--GC--C-CG-AG-G-A-----T-AGT----AA-TTTT----GT-CGG---CGG----AC-T-A---CAAA--A-TATAC--------A--T--T-T--T-A-----TAGTGTCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------T---A--TT----G--AAACG---C--T-----GTA-CA--TG--ATG--C-TG-AT---G--A-AATG-AT-G--ATGA-A-T-TTCA-TC----A-A-TGAAGG-
gi|80974                      : CAGGTGT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C---A-GT-C--C-GG-G--GCTAC-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AAATTTT----GT-C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--ACTAT-C--------A--T--T-T-AT-A-AGTATAGTCCCG-G-TG---------G------ACGT--ACGT---AA----A-------TAT-A--TT-------AAACC---C--TGCACAAAA-AA--TA--ATG--C-CG-A
gi|80975                      : CAGGGTT--CG--A-C-AGTCAACAC-TAA-TG--T-T-A-GT-C--A-GGTA--GC--C-TG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-C-T---TGG----AC-T-G--TCACA--A-TTT-C--------A--G--T-T-AC-G-AG--TAGT-CCG-G-CG---------A------AC-T--AC-T---GAGGCCA-------CA--A--TT----A--AAA
gi|80976                      : CAGGGTT--CA--A-C-A-------T-TAA-CG--C-T-A-GT-C--T-GGTA--GC--C-CG-AA-G-C-----T-AGT-C--AG-TTTT----GC-C-T---TGG----AC-T-A--TCAGA--A-TAT-C--------A--G--T-T-AC-A-AG--TAGT-CTG-G-CGA--------G------A-----AC-A---AG----A-------TGT-G--TTTGTGA--AAACA---C--T-----GTC-CA--C---ATG--C-CA-GT---G-AA-AA
gi|80977                      : CAGAGAT--TG--A-C-G-------A-TAA-CG--G-T-A-GT-C--T-GATA--GC--T-TG-AG-G-A-----T-AGT-A--AA-TATT----GC-C-C---CAG----AT-T-A--TCAGA--A-TAT-C--------A--T--T-C------------GT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------AA--A--TC----A--AAA
gi|80978                      : CAAGGTT--CA--A-C-A-------C-TAA--G----T-A-G-----C-GGTA--GT--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--GA-TTTT----GT-C-C---TGG----AA-T-A--TCAGA--G-TAT-CGGTTATGAA--C--T-T-AT-G-AG--TAGT-CCA-G-CA---------G------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--A--AT----A--AGA
gi|80979                      : CAGGGTT--TT--A-A-A-------T-TAT-CA--C-A-A-GT-C--C-GTAA--GT--C-CG-AG-A-C-----T-AGT-A--AA-AATC----AT-A-T---CGG----AC-T-A--GC-AA--A-CGT-C--------C--T--T-C-AT-C-AC--TAGT-CCGTA-TT---------G------AC-T--AG-T---AA----A--------A--A--T
gi|80980                      : CAGGGCT--CG--A-A-A-------T-AAA-CG--A-T-G-GC-C--C-GATG--GT--C-CG-GG-G-C-----C-AGT-A--AA-TTTT----G
gi|80981                      : CAGGGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GG
gi|80982                      :  AGGGTTTTCG--A-C-A-------C-TAA-CGTGC-T-A-GT-C--C-GGTAC-GC--C-CG-AGAG-C-----TGAGT-ATTAG-TTTTTG--GTTC-C---CGG----ACAT-A--CCAAAT-A-TAT----------A--T--TCT-ATGA-AG--TAGT-CCG-GATG---------GGGACTGAC-T--AT-T---AATGGCA-------TA--A--TT----A--AA-TC---C--T-----ATA-AA--TG--ATA--C-TG-AT------A-AATG-ATTG--ATGA-AAC-TTTACTC---AATACTGAAAG-A-TA-TTC
gi|80983                      :  AGGGTT--CA--A-C-A-------C-CAA-AT--C-T-A-GT-C--C-AGTA--GC--C-TG----------------T-A--AA-TTTT----GC-C-C---AGT----AC-T-A--TCAGA--A-TA--------------------------------GA-CCA-A-TG---------G------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--A--TT----A--AAAAC------------ATA--A--TGGAATGGAC-TA-AT---G-
gi|80984                      :   GGGTT--CGCGA-C-A-------C-TAAACG--C-TTA-GT-CG-C-GGTATTGC--C--G-AG-G-C-----T-AGTTA--AA-TGTT----GT-C-CTGCCGG----AC-TTA--CCAAATTA-TAT-C--------GATT--T-T-AT-A-AG--T-GT-CCG-GGTG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TATTA--TT----AGGAAACC---C--T-----ATA-AA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-GAT--AT-G--ATGAGA-C-TTTA-TCGGGAA-A-TGAAGA-T-TA-TT
gi|80985                      :   GGGTT--CA--A-C-A-------T-TAA-CG--C-T-A-GT-C--T-GGTA--GC--C-CG-AA-G-CTACCGT-AGT-A--AA-TTTT----GA-C-T---CGG----AC-T---------------T-G--------A--G--T-C-AC-G-AGT-TAGT-CCC-G-CA---------G------AT-T--AC-TTAGAA----A-------TA--A--------G--AAAC-------------A-A-GA--TG---TG--T-TT-GT---G-AACACTG-AT-G--
gi|80986                      :    GGTT--CG--A-C-A-------C-TAA-CG--G-T-A-GT-C--T-GGTA--GC--C-TG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTA----GT-T-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-C--------A--T--T-TAAT-A-AG--TAGT-CCG-A-TG---------G------AC-T--AC-T---AA----A-------TA--A--TC----A--AAACC---CTAT-----ATA-CA--TG--ATG--C-TG-AT---A-AA-AATGAAT-GA-ATGA-A-C-TTGA-TC---AATA-TGAAAG-A-TAGTTCA
gi|80987                      :    GGTT--CA--C-CCA-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-GATA--GC--C-CA------C-----T-AGT-A--AA-ATTT-------C-C---CGG----AC-T-A--CCAAA--A-TAT-A--------A--T--T-T-AT-A-AA--TAGT-CC--G-TG---------G------AC-T--AC-T----A----A-------TA--A--TT-------AAACC---C--T------TA-CA--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-AAAT-AT-GT-ATGA-A-A-TCAA-AC---AA-A-TGAAAA-ACCA-TTCA
gi|80988                      :    GGTC--TG--A-C-A-------CCTAA-TG--C-T-A-GT-C--C-AGTA--GC--CATG-GG-G-C-----T-A-T-A--AA------------------------------A--TCAGA--G-TAT-C--------A--G--T-A-A--G-AG--TAGT-CCT-G-TG---------G------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--ATTTT----A--CAACC---T--T-----ATG-GA--
gi|80989                      :     GTT--CG--AAC-A-------C-TAT-CG--C-T-A-GTTC--C-AGTA--GC--C-CT-GA-G-C-----T-GGT-C--AA-TTTT----GC-C-C---TGG----AC-T-A--TCAGA--A-TAT-C--------A--G--T-T-TT-G-A----------G-G-TG---------C------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--A--TG----A--AAACC---atg
gi|80990                      :      TT--TG--A-T-G-------C-TAA-CG--C-T-A-GT-C--C-AGTA--GC--C-CG-AG-G-C-----T-AGC-A--AA-TTTT----GC-C-A---TGG----AC-T-A--TCAGA--A-TAT-C--------A--T--C-T-TT-G-GG--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---GA----A-------AA--A--TT----A--AAACC---C--T-----
gi|80991                      :       T--CA--A-C-A-------C-TAA-TG--T-T-A-AT-C--A-GGTA--GC--C-TG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----GT-CGT---TGG----AC-T-G--TC-AC--A-TTT-C--------A--G--T-T-AC-G-AG--TAGT-CCG-G-CG---------A------AC-T--AC-T---GAGGCCA-------CA--A--TT----A--AAA
gi|80992                      :                             AA-CA--C-T-A-CT-C--C-GTTA--AC--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-A--AA-TTTT----AC-C-C---CAG----AC-T-C--TTA-------GT-T--------A--C--T-T-------G--TAGT-CCG-G-TG---------G------AC-T--AC-T---GA----AAAAAATCTA--A--TA----AC-AAACC---G--C-----GTC-AA--TG--CTGCCC-TT-AG---A-AA-AAT--AT-G--GT
gi|80993                      :                              A-CA--C-T-G-GT-TTAC-GGGG--GC--C-CGTAG-G-CC----T-AGT-TT-AG-TTTTATATGT-C-C---AAGGTTTAC-T-AGGCCAAA--A-TATAT--------A--T--T-T-AA-A-AG--TAGT-GCC-G-TGATAGGATGGG------AC-TTAAG-T---AA----A-------TA--A--TT----A--AAACCTGTC--TG----ATA-CATTTG--ATGA-C-TG-ATAGGG-AA-AATG-A
gi|80994                      :                               -CA--C-T-A-GT-C--C-GAT---GC--C-CG-AG-G-C-----T-ACT-A--GA-TTTC----AC-A-C---TGG----GC-T-A--GT-AA--A-TTT-C--------A--A--A-T-AT-GCAC--TGGC-CCG-A-TG---------G------GC-T--AG-T---AG----A-------AA--A--T
gi|80995                      :                                                 -GGTA--AT--C-CG-AG-G-C-----T-AGT-C--AA-TTTT----GA-C-C---CGG----GC-T-A--TCAGA--A-TAT-T--------A--G--T-T-AC-A-AG--TATT-CTG-G-TG---------G------AA-T--AT-T---AA----A-------AA--A--TT----A--Agtgatatgtaagtgat
gi|80996                      :                                                                                                                                                                                                                                                               A--TG--ATG--C-TG-AT---G-AA-GATG-AT-----------C-TTTA-TC---AA-A-TGAAAG-A-CA-TTCA


blockSeqs                     :        TT  CG A C GTCAACA C   A  TG C T T  T TA G    TT  TA A  T  A G TACCG G   T TT  A    ATAT  T G TGC   GTTT  A A GG     TT T   A GGTTATGA TTA   C A  G C  TA    G   T C  ATAGGATGG GGACTG  G TA  G TAG  GGCC AAAAATCT TT TT  TGTG GG     TGT TA GCACA   CA TT  GA   GA T  A  AGGG   C    A  T GC    G A T    C  GGG  T C      C C  G
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . G  .    C   .  .  .  . . C     .   . T   .    TG    . G .     .     . A .      T  C   A .        ATT   . .  . .  T     C   . A  A         .       . .   . .    TGGC T        T  .   A    C      .   T  TG      A  T   .    CC .  .  GA     .    .  . A     . . .    .  .    T .      A .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . T .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . G  .         .       . .   . .    GGCC T        T  .   A    .      .   .  G       A  .   .    A  .  .  GA     .    .  . T     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       C  .   .    .  .  .  G      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       C  .   .    .  .  .  G      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       C  .   .    .  .  .  G      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       T  .   .    .  .  .  G      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       C  .   .    .  .  .  A      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       C  .   .    .  .  .  A      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    A        .  .   .    .      .   .  .       A  .   .    .  .  .  A      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       C  .   .    .  .  .  G      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        G     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       A  .   .    .  .  .  G      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        G     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       C  .   .    .  .  .  G      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    C        .  .   .    .      .   .  .       A  .   .    .  .  .  G      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        C     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       A  .   .    .  .  .  G      .    .  . .     . . .    .  .    . .      . .  .
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    A        .  .   .    .      .   .  .       G  .   .    .  .  .  A      .    .  . .     . . .    .  .    . .      .     
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    A        .  .   .    .      .   .  .       C  .   .    .  .  .  G      .    .  . .                                     
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blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        T     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       A  .   .    .  .  .  .      .                                               
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        G     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .      .   .  .       C  .   .    .  .  .  .                                                      
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blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        A     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    C        .  .   .    .                                                                                                 
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        G     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    T        .  .   .    .                                                                                                 
blockSeqs                     :        .   .  . . .       .   .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        .     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    A        .  .   .    .                                                                                                 
blockSeqs                     :                               .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        .     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    A        .  .                                                                                                          
blockSeqs                     :                               .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .     . . .     .     . . .      .  .   . .        .     . .  . .  .     .   . .  .         .       . .   . .    .    .        .  .                                                                                                          
blockSeqs                     :                               .  .  . . .  . .  .    .   .  .  .  . . .     .   . .   .    .                                                                                                                                                                                                                                            
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