lowQualScore : 33333333 333333333333333333333333333 111111111111111 11111111111111111111 111111111111 1
lowQualScore : 00000000 44 2 2 33 222222222222222222222222222 33 666666666666666 2 88888888888888888888 2 2 2 333333333333 33 1 1 1 11 11 1 11 6666666 222 2 11 22 1 1 1 1 1 3
lowQualScore : ........ .. . . .. ........................... .. ............... . .................... . . . ............ .. . . . .. .. . .. ....... ... . .. .. . . . . . .
lowQualScore : 88888888 22 9 7 77 444444444444444444444444444 77 777777777777777 7 22222222222222222222 7 7 7 777777777777 77 2 2 2 66 66 2 66 3333333 111 4 66 88 2 2 2 2 3 8
consensus : AGCATCCTACAT-T-TATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTT
Reference ( gi|104688 ) : AGCATCCTACATTTGTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AC-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTGTT
gi|104689 : AGCATCCTACATTTGTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTT-G--TGA------------------------AC--TTTATTACT---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--AT-TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTGTT
gi|104685 : AGCATCCT-----TG---AAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-C--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GA-ATT
gi|104686 : AGCATCCTA--------TAAG--GACAATA-AACC-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTTtt
gi|104687 : AGCATCCTACA--------AG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------G---------AC-TTCATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCT--A--TTTC-TGTC-TCT-TGC-GA-ATTTTT
gi|104693 : AGCATCCTATAT--------G--GCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------A----------------------------------GAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC-ATTTTT
gi|104695 : CATCT-TATAAG--GCCAATA-AACA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--CTGATTTCATGTTATGGT-G----------T---------GC-TTCATTCAACA-AA-AAAATAATTTAAAT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC-ATTTTT
gi|104694 : agCATCTATAT--G--GCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGG------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G--------------------------------------G------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC-ATT
gi|104698 : agTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGT--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------TACATTATGTAC-TTCATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--G-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTA-GAC-AA-ATTTTTtt
gi|104690 : cTATAAT--GCTAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA-TA-A------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTC-TTTC-TTT-GCC-G--ATTTTT
gi|104692 : agcacccTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTGTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-GCATGTACATGT---------AC-TTCATTCAACA-AA-A------------C--AAAAAAC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--ATTC-TTTC-TTT-GAG-GC-ATTTTTt
gi|104697 : agtatccTATAAG---CCAATA-GAAA-GTTTGG--TGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CTTTATT--C---------------AC-G----------T---------AC-TTCATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AATAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AA-ATT
gi|104691 : ccTATAAT--GCTAATAAGAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTAT---C---------------AT-G----------T---------ACCTTCATTCAACATAATA------------T--AGAAATC-AACAT-TTT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTCTTTTC-TTT-Gtt
gi|104696 : agcaccTATAAGTGGCCAATA-GAAAAGTTTGAGTTGA------------------------AAATTTTATT--C---------------ATTG----------T---------AT-ATCATTCAACC-AA-A------------TAGAGAAAT--AACATAATTAT--ACAAGGC-G--ATACC---CC---C-GGCC--ATTTTTC-TGTCATTTGGAC-AC-ATcgatttttt
gi|104699 : agtattaccATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TGTATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GCTATTA-------TC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAT-GC-ATTcttt
gi|104700 : AA-ATTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA-AA-A------------T--AGAAATC-AAAAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-At
gi|104701 : AATG-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-CGC---A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTTatttt
gi|104702 : ATCGAACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTT
gi|104703 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTT
gi|104704 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATT
gi|104706 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTTtt
gi|104705 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTT
gi|104707 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---CCGGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTT
gi|104708 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-G-CC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTT
gi|104710 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A----------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAT-GC-ATTTTT
gi|104709 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A---TTC-TGTC-TTT-GAC-GCGATTTTT
gi|104711 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--ACCCGCAACC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATT
gi|104713 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------GC---C-GGCC--A--TTCT-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTtt
gi|104712 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CT---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-CC-ATTTTTtt
gi|104716 : -AACAT-ATT----ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCCATA--TTTC-TGTC-TTT-GACTGC-ATTTTT
gi|104717 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-T--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAC-AC-ATTTTT
gi|104715 : -AACCT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC--TT-GAC-G
gi|104714 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------TCGCGCAGGCC--A--TTTC-TGTC-ATT-GAC-GC-ATTtccaattttt
gi|104718 : ACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TGTC-TGTC-TTT-GAC-GC-ATTTTTtt
gi|104719 : ACAT-ATT-TTTACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GGC-
Alignments
lowQualScore : 33333333 222222222222222222222222 111111111111111 11111111111111111111 111111111111
lowQualScore : 66666666 33 2 2 33 444444444444444444444444 2 33 555555555555555 2 66666666666666666666 2 555555555555 2 33 1 1 1 11 11 1 11 6666666 222 2 11 22 1 1 1 1 333
lowQualScore : ........ .. . . .. ........................ . .. ............... . .................... . ............ . .. . . . .. .. . .. ....... ... . .. .. . . . . ...
lowQualScore : 44444444 99 7 5 44 111111111111111111111111 5 44 666666666666666 5 55555555555555555555 5 333333333333 5 44 2 1 1 66 66 1 66 1111111 000 3 66 77 1 1 1 1 111
consensus : AGCATCCTACAT-T--ATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
Reference ( family-546 ) : AGCATCCTACATTT--ATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104685 : AGCATCCT-----T--G-AAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-C--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GA---ATTTT
gi|104686 : AGCATCCTA--------TAAG--GACAATA-AACC-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104687 : AGCATCCTACA--------AG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------G---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCT--A--TTTC-TGTC-TCT-TGC-GA---ATTTTT
gi|104688 : AGCATCCTACATTTGTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AC-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104689 : AGCATCCTACATTTGTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTT-G--TG-------------------------AA-CTTTATTACT---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--AT-TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104690 : AGCACCCTA--------TAAT--GCTAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------TA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTC-TTTC-TTT-GCC-G----ATTTTT
gi|104691 : CACCT--ATAAT--GCTAATAAGAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTAT---C---------------AT-G----------T---------ACCTTCATTCAACAT-----------AATAT--AGAAATC-AACAT-TTT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTCTTTTC-TTT-G-C-G----ATTTTTt
gi|104692 : agAGTATCCTA--------TAAG--GCCAATA-GAAA-GTGTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-GCATGTACATGT---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AC--AAAAAAC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--ATTC-TTTC-TTT-GAG-GC---ATTTTTt
gi|104693 : AGCATCCTATAT--------G--GCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------A---------------------------------GAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104694 : CATCT--ATATG--GCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGG------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G-------------------------------------------------GT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTT
gi|104695 : agAGCATC------TT--ATAAG--GCCAATA-AACA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--CTGATTTCATGTTATGGT-G----------T---------GC-TTCATTCAACAAAAAAATAATTTAA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104696 : T--ATAAGTGGCCAATA-GAAAAGTTTGAGTTGA------------------------AAATTTTATT--C---------------ATTG----------T---------AT-ATCATTCAACC------------AA-ATAGAGAAAT--AACATAATTAT--ACAAGGC-G--ATACC---CC---C-GGCC--ATTTTTC-TGTCATTTGGAC-AC---ATCTTT
gi|104697 : agtattaccT--ATAAG---CCAATA-GAAA-GTTTGG--TGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CTTTATT--C---------------AC-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AATAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AA---ATTTT
gi|104698 : ccT--ATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGT--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------TACATTATGTAC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--G-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTA-GAC-AA---ATTTTT
gi|104699 : cATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TGTATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GCTATTA-------TC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAT-GC---ATTT
gi|104700 : AA-ATTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AAAAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---AATTTT
gi|104701 : AATG-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-CGC---A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104702 : ATCGAACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104703 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104704 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104705 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104706 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104707 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---CCGGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104708 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-G-CC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104709 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A---TTC-TGTC-TTT-GAC-GCG--ATTTTT
gi|104710 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A----------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAT-GC---ATTTTT
gi|104711 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--ACCCGCAACC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104712 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CT---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-CC---ATTTTT
gi|104713 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------GC---C-GGCC--A--TTCT-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104714 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------TCGCGCAGGCC--A--TTTC-TGTC-ATT-GAC-GC---ATTTT
gi|104715 : -AACCT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC--TT-GAC-GTCCAATTTTT
gi|104716 : -AACAT-ATT----ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCCATA--TTTC-TGTC-TTT-GACTGC---ATTTTT
gi|104717 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-T--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAC-AC---ATTTTT
gi|104718 : ACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TGTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104719 : ACAT-ATT-TTTACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GGC-------TTTTT
Alignments
lowQualScore : 444444444 222222222222222222222222 111111111111111 11111111111111111111 111111111111
lowQualScore : 000000000 33 2 2 33 444444444444444444444444 2 33 555555555555555 2 66666666666666666666 2 555555555555 2 33 1 1 1 11 11 1 11 6666666 222 2 11 22 1 1 1 1 333
lowQualScore : ......... .. . . .. ........................ . .. ............... . .................... . ............ . .. . . . .. .. . .. ....... ... . .. .. . . . . ...
lowQualScore : 111111111 99 7 5 44 111111111111111111111111 5 44 666666666666666 5 55555555555555555555 5 333333333333 5 44 2 1 1 66 66 1 66 1111111 000 3 66 77 1 1 1 1 111
consensus : AGCATCCTA-ATT---ATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
Reference ( family-546 ) : AGCATCCTACATT---ATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104685 : AGCATCCT----T---G-AAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-C--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GA---ATTTT
gi|104686 : AGCATCCTA--------TAAG--GACAATA-AACC-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104687 : AGCATCCTACA--------AG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------G---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCT--A--TTTC-TGTC-TCT-TGC-GA---ATTTTT
gi|104688 : AGCATCCTACATTTGTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AC-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104689 : AGCATCCTACATTTGTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTT-G--TG-------------------------AA-CTTTATTACT---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--AT-TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104690 : AGCACCCTA--------TAAT--GCTAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------TA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTC-TTTC-TTT-GCC-G----ATTTTT
gi|104691 : T---ATAAT--GCTAATAAGAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTAT---C---------------AT-G----------T---------ACCTTCATTCAACAT-----------AATAT--AGAAATC-AACAT-TTT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTCTTTTC-TTT-G-C-G----ATTTTTt
gi|104692 : agcaccAGTATCCTA--------TAAG--GCCAATA-GAAA-GTGTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-GCATGTACATGT---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AC--AAAAAAC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--ATTC-TTTC-TTT-GAG-GC---ATTTTTt
gi|104693 : AGCATCCTATAT--------G--GCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------A---------------------------------GAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104694 : AGCATC------T---ATATG--GCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGG------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G-------------------------------------------------GT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTT
gi|104695 : AGCATC-----TT---ATAAG--GCCAATA-AACA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--CTGATTTCATGTTATGGT-G----------T---------GC-TTCATTCAACAAAAAAATAATTTAA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104696 : T---ATAAGTGGCCAATA-GAAAAGTTTGAGTTGA------------------------AAATTTTATT--C---------------ATTG----------T---------AT-ATCATTCAACC------------AA-ATAGAGAAAT--AACATAATTAT--ACAAGGC-G--ATACC---CC---C-GGCC--ATTTTTC-TGTCATTTGGAC-AC---ATCTTT
gi|104697 : agtattaccT---ATAAG---CCAATA-GAAA-GTTTGG--TGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CTTTATT--C---------------AC-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AATAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AA---ATTTT
gi|104698 : ccT---ATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGT--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------TACATTATGTAC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--G-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTA-GAC-AA---ATTTTT
gi|104699 : cATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TGTATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GCTATTA-------TC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAT-GC---ATTT
gi|104700 : AA-ATTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AAAAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---AATTTT
gi|104701 : AATG-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-CGC---A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104702 : ATCGAACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104703 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104704 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104705 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104706 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104707 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---CCGGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104708 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-G-CC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104709 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A---TTC-TGTC-TTT-GAC-GCG--ATTTTT
gi|104710 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A----------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAT-GC---ATTTTT
gi|104711 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--ACCCGCAACC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104712 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CT---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-CC---ATTTTT
gi|104713 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------GC---C-GGCC--A--TTCT-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104714 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------TCGCGCAGGCC--A--TTTC-TGTC-ATT-GAC-GC---ATTTT
gi|104715 : -AACCT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC--TT-GAC-GTCCAATTTTT
gi|104716 : -AACAT-ATT----ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCCATA--TTTC-TGTC-TTT-GACTGC---ATTTTT
gi|104717 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-T--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAC-AC---ATTTTT
gi|104718 : ACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TGTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104719 : ACAT-ATT-TTTACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GGC-------TTTTT
Alignments
lowQualScore : 44444444 222222222222222222222222 111111111111111 11111111111111111111 111111111111
lowQualScore : 77777777 33 2 2 33 444444444444444444444444 2 33 555555555555555 2 66666666666666666666 2 555555555555 2 33 1 1 1 11 11 1 11 6666666 222 2 11 22 1 1 1 1 333
lowQualScore : ........ .. . . .. ........................ . .. ............... . .................... . ............ . .. . . . .. .. . .. ....... ... . .. .. . . . . ...
lowQualScore : 11111111 99 7 5 44 111111111111111111111111 5 44 666666666666666 5 55555555555555555555 5 333333333333 5 44 2 1 1 66 66 1 66 1111111 000 3 66 77 1 1 1 1 111
consensus : AGCATCCTA---T---ATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
Reference ( family-546 ) : AGCATCCTA-ATT---ATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104685 : AGCATCCT----T---G-AAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-C--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GA---ATTTT
gi|104686 : AGCATCCTA--------TAAG--GACAATA-AACC-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104687 : AGCATCCTA--------CAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------G---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCT--A--TTTC-TGTC-TCT-TGC-GA---ATTTTT
gi|104688 : AGCATCCTACATTTGTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AC-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104689 : AGCATCCTACATTTGTATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTT-G--TG-------------------------AA-CTTTATTACT---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--AT-TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104690 : AGCACCCTA--------TAAT--GCTAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------TA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTC-TTTC-TTT-GCC-G----ATTTTT
gi|104691 : T---ATAAT--GCTAATAAGAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTAT---C---------------AT-G----------T---------ACCTTCATTCAACAT-----------AATAT--AGAAATC-AACAT-TTT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTCTTTTC-TTT-G-C-G----ATTTTTt
gi|104692 : agcaccAGTATCCTA--------TAAG--GCCAATA-GAAA-GTGTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-GCATGTACATGT---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AC--AAAAAAC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--ATTC-TTTC-TTT-GAG-GC---ATTTTTt
gi|104693 : AGCATCCTA---T---AT--G--GCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------A---------------------------------GAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104694 : AGCATC------T---ATATG--GCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGG------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G-------------------------------------------------GT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTT
gi|104695 : AGCATC-----TT---ATAAG--GCCAATA-AACA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--CTGATTTCATGTTATGGT-G----------T---------GC-TTCATTCAACAAAAAAATAATTTAA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104696 : T---ATAAGTGGCCAATA-GAAAAGTTTGAGTTGA------------------------AAATTTTATT--C---------------ATTG----------T---------AT-ATCATTCAACC------------AA-ATAGAGAAAT--AACATAATTAT--ACAAGGC-G--ATACC---CC---C-GGCC--ATTTTTC-TGTCATTTGGAC-AC---ATCTTT
gi|104697 : agtattaccT---ATAAG---CCAATA-GAAA-GTTTGG--TGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CTTTATT--C---------------AC-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AATAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AA---ATTTT
gi|104698 : ccT---ATAAG--GCCAATA-GAAA-GTTTGT--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------TACATTATGTAC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--G-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTA-GAC-AA---ATTTTT
gi|104699 : cATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TGTATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GCTATTA-------TC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAT-GC---ATTT
gi|104700 : AA-ATTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AAAAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---AATTTT
gi|104701 : AATG-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-CGC---A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104702 : ATCGAACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104703 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104704 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104705 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104706 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104707 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---CCGGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104708 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-G-CC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104709 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A---TTC-TGTC-TTT-GAC-GCG--ATTTTT
gi|104710 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A----------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAT-GC---ATTTTT
gi|104711 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--ACCCGCAACC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104712 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CT---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-CC---ATTTTT
gi|104713 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------GC---C-GGCC--A--TTCT-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104714 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------TCGCGCAGGCC--A--TTTC-TGTC-ATT-GAC-GC---ATTTT
gi|104715 : -AACCT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC--TT-GAC-GTCCAATTTTT
gi|104716 : -AACAT-ATT----ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCCATA--TTTC-TGTC-TTT-GACTGC---ATTTTT
gi|104717 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-T--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAC-AC---ATTTTT
gi|104718 : ACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TGTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104719 : ACAT-ATT-TTTACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GGC-------TTTTT
Alignments
lowQualScore : 2222222222 222222222222222222222222 111111111111111 11111111111111111111 111111111111
lowQualScore : 44 2222222222 2 2 33 444444444444444444444444 2 33 555555555555555 2 66666666666666666666 2 555555555555 2 33 1 1 1 11 11 1 11 6666666 222 2 11 22 1 1 1 1 333
lowQualScore : .. .......... . . .. ........................ . .. ............... . .................... . ............ . .. . . . .. .. . .. ....... ... . .. .. . . . . ...
lowQualScore : 66 1111111111 7 5 44 111111111111111111111111 5 44 666666666666666 5 55555555555555555555 5 333333333333 5 44 2 1 1 66 66 1 66 1111111 000 3 66 77 1 1 1 1 111
consensus : AGCAT--CCTA------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
Reference ( family-546 ) : AGCAT--CCTA------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104685 : AGCAT--CCT-------TG-AAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-C--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GA---ATTTT
gi|104686 : AGCAT--CCTA------TA--AGGACAATA-AACC-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104687 : AGCAT--CCTA------CA--AGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------G---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCT--A--TTTC-TGTC-TCT-TGC-GA---ATTTTT
gi|104688 : AGCAT--CCTACATTTGTATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AC-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104689 : AGCAT--CCTACATTTGTATAAGGCCAATA-GAAA-GTTT-G--TG-------------------------AA-CTTTATTACT---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--AT-TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104690 : AGCAC--CCTA------TA--ATGCTAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------TA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTC-TTTC-TTT-GCC-G----ATTTTT
gi|104691 : AGCAC--C---------TATAATGCTAATAAGAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTAT---C---------------AT-G----------T---------ACCTTCATTCAACAT-----------AATAT--AGAAATC-AACAT-TTT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTCTTTTC-TTT-G-C-G----ATTTTTt
gi|104692 : AGTAT--CCTA------TA--AGGCCAATA-GAAA-GTGTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-GCATGTACATGT---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AC--AAAAAAC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--ATTC-TTTC-TTT-GAG-GC---ATTTTTt
gi|104693 : AGCAT--CCTA------TAT--GGCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------A---------------------------------GAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104694 : AGCAT--C-TA------TAT--GGCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGG------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G-------------------------------------------------GT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTT
gi|104695 : AGCAT--CTTA------TA--AGGCCAATA-AACA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--CTGATTTCATGTTATGGT-G----------T---------GC-TTCATTCAACAAAAAAATAATTTAA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104696 : AGTATTACCTA------TAAGTGGCCAATA-GAAAAGTTTGAGTTGA------------------------AAATTTTATT--C---------------ATTG----------T---------AT-ATCATTCAACC------------AA-ATAGAGAAAT--AACATAATTAT--ACAAGGC-G--ATACC---CC---C-GGCC--ATTTTTC-TGTCATTTGGAC-AC---ATCTTT
gi|104697 : ------TATAAG-CCAATA-GAAA-GTTTGG--TGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CTTTATT--C---------------AC-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AATAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AA---ATTTT
gi|104698 : cc------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGT--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------TACATTATGTAC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--G-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTA-GAC-AA---ATTTTT
gi|104699 : cATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TGTATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GCTATTA-------TC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAT-GC---ATTT
gi|104700 : AA-ATTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AAAAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---AATTTT
gi|104701 : AATG-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-CGC---A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104702 : ATCGAACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104703 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104704 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104705 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104706 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104707 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---CCGGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104708 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-G-CC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104709 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A---TTC-TGTC-TTT-GAC-GCG--ATTTTT
gi|104710 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A----------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAT-GC---ATTTTT
gi|104711 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--ACCCGCAACC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104712 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CT---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-CC---ATTTTT
gi|104713 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------GC---C-GGCC--A--TTCT-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104714 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------TCGCGCAGGCC--A--TTTC-TGTC-ATT-GAC-GC---ATTTT
gi|104715 : -AACCT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC--TT-GAC-GTCCAATTTTT
gi|104716 : -AACAT-ATT----ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCCATA--TTTC-TGTC-TTT-GACTGC---ATTTTT
gi|104717 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-T--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAC-AC---ATTTTT
gi|104718 : ACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TGTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104719 : ACAT-ATT-TTTACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GGC-------TTTTT
Alignments
lowQualScore : 2222222222 222222222222222222222222 111111111111111 11111111111111111111 111111111111
lowQualScore : 44 2222222222 2 2 33 444444444444444444444444 2 33 555555555555555 2 66666666666666666666 2 555555555555 2 33 1 1 1 11 11 1 11 6666666 222 2 11 22 1 1 1 1 333
lowQualScore : .. .......... . . .. ........................ . .. ............... . .................... . ............ . .. . . . .. .. . .. ....... ... . .. .. . . . . ...
lowQualScore : 66 1111111111 7 5 44 111111111111111111111111 5 44 666666666666666 5 55555555555555555555 5 333333333333 5 44 2 1 1 66 66 1 66 1111111 000 3 66 77 1 1 1 1 111
consensus : AGCAT--CCTA------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
Reference ( family-546 ) : AGCAT--CCTA------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104685 : AGCAT--CCT-------TG-AAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-C--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GA---ATTTT
gi|104686 : AGCAT--CCTA------TA--AGGACAATA-AACC-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104687 : AGCAT--CCTA------CA--AGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------G---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCT--A--TTTC-TGTC-TCT-TGC-GA---ATTTTT
gi|104688 : AGCAT--CCTACATTTGTATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AC-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104689 : AGCAT--CCTACATTTGTATAAGGCCAATA-GAAA-GTTT-G--TG-------------------------AA-CTTTATTACT---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--AT-TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104690 : AGCAC--CCTA------TA--ATGCTAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------TA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTC-TTTC-TTT-GCC-G----ATTTTT
gi|104691 : AGCAC--C---------TATAATGCTAATAAGAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTAT---C---------------AT-G----------T---------ACCTTCATTCAACAT-----------AATAT--AGAAATC-AACAT-TTT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTCTTTTC-TTT-G-C-G----ATTTTTt
gi|104692 : AGTAT--CCTA------TA--AGGCCAATA-GAAA-GTGTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-GCATGTACATGT---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AC--AAAAAAC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--ATTC-TTTC-TTT-GAG-GC---ATTTTTt
gi|104693 : AGCAT--CCTA------TAT--GGCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------A---------------------------------GAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104694 : AGCAT--C-TA------TAT--GGCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGG------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G-------------------------------------------------GT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTT
gi|104695 : AGCAT--CTTA------TA--AGGCCAATA-AACA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--CTGATTTCATGTTATGGT-G----------T---------GC-TTCATTCAACAAAAAAATAATTTAA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104696 : AGTATTACCTA------TAAGTGGCCAATA-GAAAAGTTTGAGTTGA------------------------AAATTTTATT--C---------------ATTG----------T---------AT-ATCATTCAACC------------AA-ATAGAGAAAT--AACATAATTAT--ACAAGGC-G--ATACC---CC---C-GGCC--ATTTTTC-TGTCATTTGGAC-AC---ATCTTT
gi|104697 : ------TATAAG-CCAATA-GAAA-GTTTGG--TGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CTTTATT--C---------------AC-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AATAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AA---ATTTT
gi|104698 : cc------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGT--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------TACATTATGTAC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--G-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTA-GAC-AA---ATTTTT
gi|104699 : cATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TGTATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GCTATTA-------TC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAT-GC---ATTT
gi|104700 : AA-ATTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AAAAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---AATTTT
gi|104701 : AATG-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-CGC---A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104702 : ATCGAACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104703 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104704 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104705 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104706 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104707 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---CCGGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104708 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-G-CC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104709 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A---TTC-TGTC-TTT-GAC-GCG--ATTTTT
gi|104710 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A----------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAT-GC---ATTTTT
gi|104711 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--ACCCGCAACC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104712 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CT---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-CC---ATTTTT
gi|104713 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------GC---C-GGCC--A--TTCT-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104714 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------TCGCGCAGGCC--A--TTTC-TGTC-ATT-GAC-GC---ATTTT
gi|104715 : -AACCT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC--TT-GAC-GTCCAATTTTT
gi|104716 : -AACAT-ATT----ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCCATA--TTTC-TGTC-TTT-GACTGC---ATTTTT
gi|104717 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-T--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAC-AC---ATTTTT
gi|104718 : ACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TGTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104719 : ACAT-ATT-TTTACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GGC-------TTTTT
blockSeqs : TA CATTTGTATA A A GT CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A AC TGATTTCATGTTATG T CATGTACATGT C AAAAAATAATTT T AG G A A TT AG T TT CCCGCAA GCG C AT TT T A G T CCA
blockSeqs : . CATTTGTATA . . . . . . . . TACATTATGT . T . . . . . . . . . TACC . A . T . . . . G
blockSeqs : . TATA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TAAG . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TATA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TATA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TAT . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TAT . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . CA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . TA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : TATA******
originalCons : AGCAT--CCTA------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
finalCons : AGCAT--CCTATATA------AGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
Alignments
lowQualScore : 2222222222 222222222222222222222222 111111111111111 11111111111111111111 111111111111
lowQualScore : 44 2222222222 2 2 33 444444444444444444444444 2 33 555555555555555 2 66666666666666666666 2 555555555555 2 33 1 1 1 11 11 1 11 6666666 222 2 11 22 1 1 1 1 333
lowQualScore : .. .......... . . .. ........................ . .. ............... . .................... . ............ . .. . . . .. .. . .. ....... ... . .. .. . . . . ...
lowQualScore : 66 1111111111 7 5 44 111111111111111111111111 5 44 666666666666666 5 55555555555555555555 5 333333333333 5 44 2 1 1 66 66 1 66 1111111 000 3 66 77 1 1 1 1 111
consensus : AGCAT--CCTA------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
Reference ( family-546 ) : AGCAT--CCTA------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104685 : AGCAT--CCT-------TG-AAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-C--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GA---ATTTT
gi|104686 : AGCAT--CCTA------TA--AGGACAATA-AACC-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104687 : AGCAT--CCTA------CA--AGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATC--C---------------AT-G----------G---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCT--A--TTTC-TGTC-TCT-TGC-GA---ATTTTT
gi|104688 : AGCAT--CCTACATTTGTATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AC-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104689 : AGCAT--CCTACATTTGTATAAGGCCAATA-GAAA-GTTT-G--TG-------------------------AA-CTTTATTACT---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--AT-TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTGTT
gi|104690 : AGCAC--CCTA------TA--ATGCTAATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------TA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTC-TTTC-TTT-GCC-G----ATTTTT
gi|104691 : AGCAC--C---------TATAATGCTAATAAGAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-ATTTAT---C---------------AT-G----------T---------ACCTTCATTCAACAT-----------AATAT--AGAAATC-AACAT-TTT-T--ATA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TTTCTTTTC-TTT-G-C-G----ATTTTTt
gi|104692 : AGTAT--CCTA------TA--AGGCCAATA-GAAA-GTGTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-GCATGTACATGT---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AC--AAAAAAC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--ATTC-TTTC-TTT-GAG-GC---ATTTTTt
gi|104693 : AGCAT--CCTA------TAT--GGCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------A---------------------------------GAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104694 : AGCAT--C-TA------TAT--GGCCAACA-GAAA-GTTTGG--TGG------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G-------------------------------------------------GT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTT
gi|104695 : AGCAT--CTTA------TA--AGGCCAATA-AACA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--CTGATTTCATGTTATGGT-G----------T---------GC-TTCATTCAACAAAAAAATAATTTAA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AC---ATTTTT
gi|104696 : AGTATTACCTA------TAAGTGGCCAATA-GAAAAGTTTGAGTTGA------------------------AAATTTTATT--C---------------ATTG----------T---------AT-ATCATTCAACC------------AA-ATAGAGAAAT--AACATAATTAT--ACAAGGC-G--ATACC---CC---C-GGCC--ATTTTTC-TGTCATTTGGAC-AC---ATCTTT
gi|104697 : ------TATAAG-CCAATA-GAAA-GTTTGG--TGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-CTTTATT--C---------------AC-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AATAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGTC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-AA---ATTTT
gi|104698 : cc------TATAAGGCCAATA-GAAA-GTTTGT--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------TACATTATGTAC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--G-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTA-GAC-AA---ATTTTT
gi|104699 : cATA-GAAA-GTTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TGTATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AACAT-ATT-T--ACA--GCTATTA-------TC---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAT-GC---ATTT
gi|104700 : AA-ATTTGG--TGA------------------------AA-TTTTATT--C---------------AT-G----------T---------AC-TTCATTCAACA------------AA-AT--AGAAATC-AAAAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---AATTTT
gi|104701 : AATG-AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-CGC---A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104702 : ATCGAACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104703 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104704 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104705 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GACC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104706 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104707 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---CCGGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104708 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-G-CC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104709 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A---TTC-TGTC-TTT-GAC-GCG--ATTTTT
gi|104710 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A----------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAT-GC---ATTTTT
gi|104711 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--ACCCGCAACC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104712 : -AACAT-ATT-T--ACA--GT-A--A-------CT---T-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GAC-CC---ATTTTT
gi|104713 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------GC---C-GGCC--A--TTCT-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTT
gi|104714 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------TCGCGCAGGCC--A--TTTC-TGTC-ATT-GAC-GC---ATTTT
gi|104715 : -AACCT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC--TT-GAC-GTCCAATTTTT
gi|104716 : -AACAT-ATT----ACA--GC-A--A-------CC---C-GGCCATA--TTTC-TGTC-TTT-GACTGC---ATTTTT
gi|104717 : -AACAT-ATT-T--ACA--GC-T--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TGA-GAC-AC---ATTTTT
gi|104718 : ACAT-ATT-T--ACA--GC-A--A-------CC---A-GGCC--A--TGTC-TGTC-TTT-GAC-GC---ATTTTT
gi|104719 : ACAT-ATT-TTTACA--GC-A--A-------CC---C-GGCC--A--TTTC-TGTC-TTT-GGC-------TTTTT