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lowQualScore                  :   .     .   . . ..    ..       .........     . .  . . ...  .  ..    .  . . ......  .  . .. .  .. ..  . . ..  ...... .  ...............     .... . . . ..  . ... . .. . ..    .  .... .   ... . .  . ...  . . .  .... ... . . ..... .   . ..   . ... ... . .  ..  .......... ..  ...  .. . .. .. .  . .    .....  ..... ...... . . . . .   ... .. ...... ... .. .. .. ....  .  .... ...     ...  ..  ..        
lowQualScore                  :   3     6   6 2 22    11       222222222     0 5  5 2 444  4  99    4  4 4 555555  9  2 22 9  00 44  5 5 00  000000 5  777777777777777     1111 5 5 5 11  5 555 0 00 5 00    5  3333 4   999 1 4  4 555  4 0 5  6666 666 6 5 55555 5   5 11   5 666 111 5 5  55  3333333333 44  999  44 9 00 44 4  4 4    11111  00000 111111 9 4 4 9 4   555 44 666666 555 00 44 00 0000  9  3333 111     666  99  00        
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Reference ( gi|83988 )        : GAGGTGCT-CCG-T-G--ACCCT-ATTTTCA---CG----GTTTT-A-AA-TAT---GA-AAC-AACT-TT-T-A------GA-TACA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GG-----A---TG----TTTTT----A-A-T-T--AA-A--AT-T--A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---AA-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G---T-T-AT-AAT----------A--TG---AC--G-T--T--A-AA-T-AAAA--G--AG-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAT-GG--CCCTCGTA
gi|83989                      : GACGTGCT-CCG-T-A--ACTCC-ATTTTCA---TA----GTTTT-A-AA-TCT---GA-AAT-AACT-TT-T-A------GA-TGTA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GG-----A---AG----TTTTT----A-A-T-T--AA-G--AT-T--A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---AA-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G---T-T-AT-AAT----------A--TG---AC--G-T--T--A-AA-T----------AG-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAA-GG--CCCTCATA
gi|83990                      : GACGTTCT-CCG-T-G--ACCTC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-AA-TCT---GA-AAT-AACT-TT-T-A------GA-TATA--T-CG--G--AC-T-A--TA----T-T-GG-----A---AG----TTTTT----T-A-T-T--TA-A--AT-T--A-C--TTGG-AT----T-TAT---TGT-TA-A---AA-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G---T-T-GT-AAT----------A--TG---AC--G-T--T--A-AA-T-AAAA--T--AG-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAT-GG--TCCTCGTA
gi|83993                      : GAAGTGCT-CCG-T-G--ACCCC-ATGTTCA---TA----GTTTT-A-AA-TCT---GA-AGC-AACT-TT-T--------GA-TATA--T-CG--A--AA-T-A--TA----T-T-GG-----A---AG----TTTTT----A-A-T-T--AA-A--AT-T--A-G--TTGG-AT----T-TAT---GCT-TA-T---AA-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G---T-T-AC-G------------A--TG---AC--G-T--T--A-GA-T-AAAA--T--AG-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|83992                      : GACGTGCT-CCG-T-G--ACCCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-AA-TCT---GA-AAT-AACT-TT-T-A------GA-TATA--T-CG--GA-AA-T-A--TA----T-T-GA-----A---AA----TTTTT----A-A-T-T--AG-A--TT-T--A-G--TTGG-AT----T-TATG--GGT-TATA---AA-CAA-TA----T---G-T-A-----C-CAA-A--TTTAG---G---T-T-AT-AAT----------A--TG---AC--G-T--T--A-AA-T-AAAA--T--AG-----T------TAA-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GG--CCTTCGTA
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gi|83999                      : GACGTGAT-CCG-T-G---CCCC-ATTTTAA---CA----GTTTT-A-AA-TCT---GA-AAT-AACT-TT-C-A------GA-TACA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GA-----A---AT----TTTTC----A-A-T-TAGAG-A--ATCT--A-T--TTGG--C----T-TAT---GGT-TA-A---AA-T-A-TA----T---C-T-A-----C-CAATT--TTT-G---G---T-T-AT-GAT----------A---G---AT--GTT--T--A-AA-T-AAAA--AT-AG-----T------T-A-T-G-A-CAA---AACA------G---T--C--T--A----CG-
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gi|84001                      : GACGTG-T-CCG-T----ACCCC-ATTTTC----CA----GTTTT-A-AA-T--------------------T-A------GA-TATAC-T-CA--G--AA-T-A--TAA---T-T-GG-----A---AG----TTTTT----A-A-T-T--TG-A--AT-A--A-G--T-GG-AA----T-TAT---GGT-TA-A---A--T-A-TAA---T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G---T-T-AT--AT----------A--T----AC--G-T--T----AA-T-AAAA-----CG-----T------T-A-T---A-CAA---A--A------G---TTCT--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAT-GG--CCCTCATA
gi|84002                      : GACGTGCT-CCG-T-G--ACCCCCATTTTCA---CA----GTTTT-A-AA-TCT---GA-AAG-AACT-TC-T-A------GA-TATA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GG-----A---AG----TTTTT----A-
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gi|84007                      : ggcGTGCT-CCGAT-G--ACCCC-ATTT-CA---CA----GTTTT-A-GA-TCT---GA-AAC-AACT-TT-T-A------GA-TATA--T--G--G--AA-T-A--TA----A-T-GGA----A---AG----TTTTT----A-A-T-T--AA-A--AT-T--A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-AGAGAA-C-A-TA----T---CTT-A-----C-CAA-A--ATT-T---G---T-T-AC---T----------A--TG---AC--G-T--T--A-AA-T-AAAA--AATAG-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--AAGTC--G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
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gi|84009                      :  acGTGCT-CCG-T-G--ACCAT--TTTTCA---CAACAAGTTTT-A-AA-TCT---TA-ATTTAACT-TT-T-A------AAATATAC-T-CG--G--AAAT-A--TA----T-T-GA-----A---AT----TTTTT----A-A-T-T--A------T-T--A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---AAAC-AATA----T---C-T-A-----C-C-A-A--TTT-G---G---T-T-ATAAAT----------A--TG---AC--G-T--T--A-AA-T-AAAA--T--AG-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--TA--TTTTG---AAC-GG--CC
gi|84008                      :   cGTGCT-CCG-T-G--ACTCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-AAATCT---GA-AAT-AACT-TT-T-A------GA-TATA--TGTG--G--AA-T-------------------------TG----TTTAA----ACA-T-T--CA-A--TT-T-------TGGG-AT----T-TATCATGAT-TA-A---AA---A-TA----T---C-T-A-----C-CA-----TTT-G---GG--T-T-AT-GATTTAAACCGGTA--TGGGTAT--G-T--A--A-AT-T-AAAT--A--AG-----T------T-T-T-G-A--AA---A--A------G---T--C--T--A----CG--A-T--T---TTTTT---AAC-AA---CCTCGTA
gi|84010                      :  acGTGCT-CCG-T-A--CCCCC-ATTTTAA---CA----GTTTT-A-AA-TCT---AAGAAT-AACT-TT-T-A------G--TATA--G-AG--G--AG-TAA--TA----T-T-GG-----AACTTT----TTTTT--------T-T--AA-G--ATATTGA-G--TTGA-AT----T-TAC---GGT-TA-A---AA-CTA-TACTATT---CTT-A-----C-CAA-A--TTT-G---A---T-TAAT-GAT----------T--AG---GCGAG-TTAT--A-AA-T-AATA-----AG-----T------TCA-TGG-A-CAC---A--ATATATTG---T--C--T--A-----G-TA-T--T---TTTGA---AAC-GGCACCCTCGTA
gi|84011                      :   cGTGCT-ACG-T-G--ACCC--ATTTTAAAATCA----GTTTA-A-AT-TCTTA-AA-AAT-AACTATTAT-A------GA-TATAG-T-AG--GTGAT-T-A--TA----T-T-TGTTGTAA---TT----TTTTT----T-A-TAT--AG-A--AT-T--AAG--TTGA-AT----T-TAC---GGT-TA-A---AA-T-A-TA----T---C-T-AT----C-CGA-AATTTT-G---A---T-T-ATCGAT----------AACTG---GC--G-T--TA-A-AA-T-AATA--T--AG-----T------T---T-GAA-CAA---A--AAAAG--A---T--CT-T--A----CG-TA-TTAT---TTTTGTTTAACGGG--CCCTCGTA
gi|84012                      :   cGTGAT-CCG-T-G--ACCCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-AT-TTT---GA-AAC-AACT-TT-T-A------GA-CATA--T-CA--G--A
gi|84003                      :     TGCTTCCG-TTGTTACCC--ATTTTAAA--CA----GTTTT-G-A--TCT---TA-ATC---TC-TT-T-A------GA-TATAATT-CGCGG--AA-T-AAATA----T-TTGG-----ACA-TC----TTTTT----A-AAT-T--AA-A-----T--A-G--TTGG-AC----T-TAT---G-T-TA-A---AA-T-A-CA----TACGC-T-AGGTATCGCAA-AATTTT-G---G---T-T-AT-GAT----------A--TGC--AC--G-T--TCTA-AA-T-AATA--G--A------T------T-A-T-GGA-CAA-------------G---T--C----------CC-TA-C--TAA-TTTTG---AAT-GG--CCCTCATA
gi|84013                      : gacgtGCT-CCG-T-G--ACCCT-ATTTTCA---CG----GTTTT-A-AA-TCT---GA-AAC-AACT-TT-T-A------GA-TACA--T-CG--G--AA-T-A--TA----TCT-GG-----A---TG----TTTTT----A-A-T-T--AA-A--AT-T--A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---AA-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---T---T-T-AT-GAT----------A--TG---AC--G-T--T--A-AA-T-AAAA--T--AG-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTGTG---AAT-GA--CCCTCGTA
gi|84004                      :      GCT-CCG-T-G--ACCCC-ATTTTCA---CA----GTTTGAA-AA-TCT---GA-AAC-AAC--TT-T-A------GA-TATG--T-CG--C--AA-T-A--T
gi|83998                      : gacgtgCT-CCG-T-G--ATCCC-ATTTTCA---------GTTTT-A-AA-TCT---GA-AAG-AATT-TT-T-ACATGTAGA-TATA--T-TG--T--AA-T-A--TA----C-T-GG-----A---TT----TTTTTTTAAA-A-T-T--AA-G---T-T--A-G--TTCG-AT----T-TGT---GGT-TA-A---AA-C-G-TA----T---G-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G---T-T-AT-AAT----------A--TT---AC--A-T--T--A-AA-T-AAAA--T--AG-----TTACATGT-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--T--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GA--TCCTCGT
gi|84015                      :                               gacatc----GTTTT-A-AA-TCT---AA-AAT-AACT-TT-T-A------GA-TATA--G-AG--G--GA-T-A--TA----T-T-GG-----A---AT----TTTTT----T-A-T-T--AG-A--AT-T--A-G--TT
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Reference ( family-545 )      : GACGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------GA-TATA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GG----AA-GTT---TTT----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
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gi|84004                      : GACGT-GGCT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTGAA-A-A------TCT--GA-AA-C-AA-C--TT-T-A------GA-TATG--T-CG--C--AA-T-A--T
gi|84005                      : GACGT-G-GA-CCA-T-GAC--CCC-AATTTCA---CA----GCTT------------------------T-AA-CT-CT-T-A------GA-TATA--T-CG--G--AA-T-A--TA------------------------TT----A-A---T-T--AA-A---AC-G-A-A--ATGG-GT----T-TAT---GTT-TA-A---A-A-
gi|84006                      :  ACGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-T-AA-TT-TT-T-A------GA-TGCA--T-TG--G--A---------------------------------------------T-T--AA-A----T-T-A-G--T-GG-AT----T-TAA---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTA-G---G-T-T-AT---TAT----------A--TG-AC--G-T---T--G-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-C-CAA---A--AT-----G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|84007                      :  ACGT-G-CT-CCGAT-GAC--CCC-ATTT-CA---CA----GTTTT-A-G-A------TCT--GA-AA-C-AA-CT-TT-T-A------GA-TATA--T--G--G--AA-T-A--TA----A-T-GG----AAAGTT---TTT----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-AGAGA-A-C-A-TA----T---CTT-A-----C-CAA-A--ATT-T---G-T-T-AC-----T----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-TAAAAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--AAGTC--G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|84008                      :  ACGT-G-CT-CCG-T-GAC--TCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-AA-----TCT--GA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------GA-TATA--T-----G------------------T-GG----AA-TTG---TTT----A-AACAT-T--CA-A---TT-T------TGGG-AT----T-TATCATGAT-TA-A---A-A---A-TA----T---C-T-A-----C-CA-----TTT-G---GGT-T-AT---GATTTAAACCGGTA--TG-G---G-TATGT--A-AA-T--TAAATAAG-----T------T-T-T-G-A--AA---A--A------G---T--C--T--A----CG--A-T--T---TTTTT---AAC-AA---CCTCGTA
gi|84009                      :   CGT-G-CT-CCG-T-GAC--CAT--TTTTCA---CAACAAGTTTT-A-A-A------TCT--TA-AT-TTAA-CT-TT-T-A------AAATATAC-T-CG--G--AAAT-A--TA----T-T-GA----AA-TTT---TTT----A-A---T-T--A-------T-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-AAC-AATA----T---C-T-A-----C-C-A-A--TTT-G---G-T-T-ATA--AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--TA--TTTTG---AAC-GG--CC
gi|84010                      :   CGT-G-CT-CCG-T-ACC--CCC-ATTTTAA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--AAGAA-T-AA-CT-TT-T-A------G--TATA--G-AG--G--AG-TAA--TA----T-T-GG----AA-CTT---TTT----T-T---T-T--TA-AGATAT-TGA-G--TTGA-AT----T-TAC---GGT-TA-A---A-A-CTA-TACTATT---CTT-A-----C-CAA-A--TTT-G---A-T-TAAT---GAT----------T--AG-GCGAG-TTA-T--A-AA-T--AATA-A-G-----T------TCA-TGG-A-CAC---A--ATATATTG---T--C--T--A-----G-TA-T--T---TTTGA---AAC-GGCACCCTCGTA
gi|84011                      :   CGT-G-CT-ACG-T-GAC--CC--ATTTTAAAATCA----GTTTA-A-A-T------TCTTAAA-AA-T-AA-CTATTAT-A------GA-TATAG-T-AG--GTGAT-T-A--TA----T-T-TGTTGTAA-TTT---TTT----TTA---TAT--AG-A---AT-T-AAG--TTGA-AT----T-TAC---GGT-TA-A---A-A-T-A-TA----T---C-T-AT----C-CGA-AATTTT-G---A-T-T-ATC--GAT----------AACTG-GC--G-T---TA-A-AA-T--AATATA-G-----T------T---T-GAA-CAA---A--AAAAG--A---T--CT-T--A----CG-TA-TTAT---TTTTGTTTAACGGG--CCCTCGTA
gi|84012                      :    GT-G-AT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-T------TTT--GA-AA-C-AA-CT-TT-T-A------GA-CATA--T-CA--G--A
gi|84013                      :      -G-CT-CCG-T-GAC--CCT-ATTTTCA---CG----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-C-AA-CT-TT-T-A------GA-TACA--T-CG--G--AA-T-A--TA----TCT-GG----AT-GTT---TTT----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---T-T-T-AT---GAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTGTG---AAT-GA--CCCTCGTA
gi|84014                      :                                 A---CA----GTATT-G-A-AAAAATATCT--GA-AAAT-AA-CT-TT-TTA------GACTAAA--T-CG--A--AA---A--TAATAGT-T-GG----AA-TTTGTATTT----A-A---T-T--AG-ATT-CT-T-A-G--TTGA-AT----T-GAT---GATATA-A---A-A---A-TAA---T---C-T-A-----C-CAA-A--CTA-G---G-T-T-ATTATAAT----------A--TG-AC--G-----T--A-AA-TA-AAAATA-G-----G------TAA-T-G-ACCAA---A--A------GAGTT--C--TAAA----CGATA-T--CATATTTTG---AACAGG--CCCT
gi|84015                      :                                      A----GTTTT-A-A-A------TCT--AA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------GA-TATA--G-AG--G--GA-T-A--TA----T-T-GG----AA-TTT---TTT----T-A---T-T--AG-A---AT-T-A-G--TT
gi|84016                      :                                                      ------TCT--GA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------TA-TGTG--T-CG--G--AA-T-A---------------------GTT---TTT----A-A---T-C--AA-A---AT-T-A-G--CTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-G-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--A--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--TCCTCGTA
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Reference ( family-545 )      : GACGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------GA-TATA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GG----AA-GTT---TTT----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|83988                      : GAGGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCT-ATTTTCA---CG----GTTTT-A-A-A------TAT--GA-AA-C-AA-CT-TT-T-A------GA-TACA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GG----AT-GTT---TTT----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAAGA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAT-GG--CCCTCGTA
gi|83989                      : GACGT-G-CT-CCG-T-AAC--TCC-ATTTTCA---TA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------GA-TGTA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GG----AA-GTT---TTT----A-A---T-T--AA-G---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T-----------AAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAA-GG--CCCTCATA
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gi|83991                      : GACGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTTAAAACA----GTTTTTACA-A------TCT--GA-CA-T-AA-CT-AT-T-A------AT-TAGA--T-CG-----AA-T-A--TA----GAT-GC----GA-ATT---TTT----A-A---T-T--AA-AT--AA-T-A-GCCTTGA-AT----T-TAT---G-T-TA-A---A-A-T-A-TAA---T---C-T-A-----C-CAA-A--GTT-T---G-TAT-GT---AAT----------AC-TG-ACA-G-T---T--ATAA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A---------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|83992                      : GACGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------GA-TATA--T-CG--GA-AA-T-A--TA----T-T-GA----AA-ATT---TTT----A-A---T-T--AG-A---TT-T-A-G--TTGG-AT----T-TATG--GGT-TATA---A-A-CAA-TA----T---G-T-A-----C-CAA-A--TTTAG---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------TAA-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GG--CCTTCGTA
gi|83993                      : GAAGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATGTTCA---TA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AG-C-AA-CT-TT-T--------GA-TATA--T-CG--A--AA-T-A--TA----T-T-GG----AA-GTT---TTT----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GCT-TA-T---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AC---G------------A--TG-AC--G-T---T--A-GA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|83994                      : GGCGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---GA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-T-AA-CT-TC-T-A------GA-TGTA--T-CG--G--AA-A-A--TA----T-T-GG----AA-GTT---TTT----T-A---T-----G-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---T-T-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T--G-AATT--AAAATA-GTTATTT------T-A-T-G-C-CAA---A--G------T---T--C--T--G----CGATA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|83995                      : GACGT-G-CA-TCG-T-AAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A--------TCC--GA-AA-T-AA-CT-TC-A-A------GA-TGTA--T-CA--G--GA-T-A--TA----T-T-GA----AA-GTT---TTA----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGA-AT----T-TAT---AGC-TA-A---A-A-C-A-TA----T---G-T-A-----C-CAA-A--CTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAATTA-G-----T------T-A-T-A-A-CAA---A--A------G---T--C--C--A----CC-TA-T--T---TTTTG---AGC-AG--CCCTCGTA
gi|83996                      : GACGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-T-AA-TT-TT-T-A------GA-TGCA--T-CG--G--AA-T--------------------------------------------T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAA---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTA-G---G-T-T-AT---TAT----------A--TG-AC--G-T---T--G-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-C-CAA---A--T------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|83997                      : GACGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CG----GTTTTTA-ACA------TCT--GA-AA-C-AA-CT-TT-T-CT-----GA-TACA--TTCG--G--AA-T-A---A----T-T-GG----AT-GTT---TTT----A-A---T-C--AAGA---AT-T-A-G--TTGGGAT----T-TAT---G-T-TC-A---A-A-C-A-TA----T---C-TTAGC---C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-TC---AAT----------A--TT-AC--GAT---T--A-AA-TG-AAAAGA-G-----T------T-AAT-G-A-CAACAAA--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAT-GG--CCCTGGTA
gi|83998                      : GACAT-C-CT-CCG-T-GAT--CCC-ATTTTCA---------GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-G-AA-TT-TT-T-ACATGTAGA-TATA--T-TG--T--AA-T-A--TA----C-T-GG----AT-TTT---TTTTTAAA-A---T-T--AA-G----T-T-A-G--TTCG-AT----T-TGT---GGT-TA-A---A-A-C-G-TA----T---G-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TT-AC--A-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----TTACATGT-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--T--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GA--TCCTCGT
gi|83999                      : GACGT-G-AT-CCG-T-G-C--CCC-ATTTTAA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-T-AA-CT-TT-C-A------GA-TACA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GA----AA-TTT---TTC----A-A---T-TAGAG-A---ATCT-A-T--TTGG--C----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-T-A-TA----T---C-T-A-----C-CAATT--TTT-G---G-T-T-AT---GAT----------A---G-AT--GTT---T--A-AA-TA-AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---AACA------G---T--C--T--A----CG-
gi|84000                      : GACGT-G-CT-CCG-TTGAC--CCC-ATTTTCA---CG----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA---AA-CT-TT-A-A------GA-TACA--T--G--G--AA-T-A--TA----C-T-GA----A----T---TTT----A-A---T-T--AA-G------C-A-G--TTGG-AG----TATAT---GGT-TA-A---C-A-C-A-T-----------T-A-----C---A-A--TTT-GAGTG-T-T-A----AAT----------A---G-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-GT----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--CCAT--A----CG-TATT--T---TTTTG---AA--GG--CCCCC
gi|84001                      : GACGT-G--T-CCG-T--AC--CCC-ATTTTC----CA----GTTTT-A-A-A------T---------------------T-A------GA-TATAC-T-CA--G--AA-T-A--TAA---T-T-GG----AA-GTT---TTT----A-A---T-T--TG-A---AT-A-A-G--T-GG-AA----T-TAT---GGT-TA-A---ATA-T-A--A----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT----AT----------A--T--AC--G-T---T----AA-T--AAAAC--G-----T------T-A-T---A-CAA---A--A------G---TTCT--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAT-GG--CCCTCATA
gi|84002                      : GACGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCCCATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-G-AA-CT-TC-T-A------GA-TATA--T-CG--G--AA-T-A--TA----T-T-GG----AA-GTT---TTT----A-
gi|84003                      : GACGTTG-CTTCCG-T-TGTTACCC-ATTTTAAA--CA----GTTTT-G-A--------TCT--------T-AATCTCTT-T-A------GA-TATAATT-CGCGG--AA-T-AAATA----T-TTGG----AC-ATC---TTTTTA-A-A---T-T--AA-A------T-A-G--TTGG-AC----T-TAT---G-T-TA-A---A-A-T-A-CA----TACGC-T-AGGTATCGCAA-AATTTT-G---G-T-T-AT---GAT----------A--TGCAC--G-T---TCTA-AA-T--AA--TA-GA----T------T-A-T-GGA-CAA-------------G---T--C----------CC-TA-C--TAA-TTTTG---AAT-GG--CCCTCATA
gi|84004                      : GACGT-GGCT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTGAA-A-A------TCT--GA-AA-C-AA-C--TT-T-A------GA-TATG--T-CG--C--AA-T-A--T
gi|84005                      : GACGT-G-GA-CCA-T-GAC--CCC-AATTTCA---CA----GCTT------------------------T-AA-CT-CT-T-A------GA-TATA--T-CG--G--AA-T-A--TA------------------------TT----A-A---T-T--AA-A---AC-G-A-A--ATGG-GT----T-TAT---GTT-TA-A---A-A-
gi|84006                      :  ACGT-G-CT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-T-AA-TT-TT-T-A------GA-TGCA--T-TG--G--A---------------------------------------------T-T--AA-A----T-T-A-G--T-GG-AT----T-TAA---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTA-G---G-T-T-AT---TAT----------A--TG-AC--G-T---T--G-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-C-CAA---A--AT-----G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|84007                      :  ACGT-G-CT-CCGAT-GAC--CCC-ATTT-CA---CA----GTTTT-A-G-A------TCT--GA-AA-C-AA-CT-TT-T-A------GA-TATA--T--G--G--AA-T-A--TA----A-T-GG----AAAGTT---TTT----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-AGAGA-A-C-A-TA----T---CTT-A-----C-CAA-A--ATT-T---G-T-T-AC-----T----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-TAAAAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--AAGTC--G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|84008                      :  ACGT-G-CT-CCG-T-GAC--TCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-AA-----TCT--GA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------GA-TATA--T-----G------------------T-GG----AA-TTG---TTT----A-AACAT-T--CA-A---TT-T------TGGG-AT----T-TATCATGAT-TA-A---A-A---A-TA----T---C-T-A-----C-CA-----TTT-G---GGT-T-AT---GATTTAAACCGGTA--TG-G---G-TATGT--A-AA-T--TAAATAAG-----T------T-T-T-G-A--AA---A--A------G---T--C--T--A----CG--A-T--T---TTTTT---AAC-AA---CCTCGTA
gi|84009                      :   CGT-G-CT-CCG-T-GAC--CAT--TTTTCA---CAACAAGTTTT-A-A-A------TCT--TA-AT-TTAA-CT-TT-T-A------AAATATAC-T-CG--G--AAAT-A--TA----T-T-GA----AA-TTT---TTT----A-A---T-T--A-------T-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-AAC-AATA----T---C-T-A-----C-C-A-A--TTT-G---G-T-T-ATA--AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--TA--TTTTG---AAC-GG--CC
gi|84010                      :   CGT-G-CT-CCG-T-ACC--CCC-ATTTTAA---CA----GTTTT-A-A-A------TCT--AAGAA-T-AA-CT-TT-T-A------G--TATA--G-AG--G--AG-TAA--TA----T-T-GG----AA-CTT---TTT----T-T---T-T--TA-AGATAT-TGA-G--TTGA-AT----T-TAC---GGT-TA-A---A-A-CTA-TACTATT---CTT-A-----C-CAA-A--TTT-G---A-T-TAAT---GAT----------T--AG-GCGAG-TTA-T--A-AA-T--AATA-A-G-----T------TCA-TGG-A-CAC---A--ATATATTG---T--C--T--A-----G-TA-T--T---TTTGA---AAC-GGCACCCTCGTA
gi|84011                      :   CGT-G-CT-ACG-T-GAC--CC--ATTTTAAAATCA----GTTTA-A-A-T------TCTTAAA-AA-T-AA-CTATTAT-A------GA-TATAG-T-AG--GTGAT-T-A--TA----T-T-TGTTGTAA-TTT---TTT----TTA---TAT--AG-A---AT-T-AAG--TTGA-AT----T-TAC---GGT-TA-A---A-A-T-A-TA----T---C-T-AT----C-CGA-AATTTT-G---A-T-T-ATC--GAT----------AACTG-GC--G-T---TA-A-AA-T--AATATA-G-----T------T---T-GAA-CAA---A--AAAAG--A---T--CT-T--A----CG-TA-TTAT---TTTTGTTTAACGGG--CCCTCGTA
gi|84012                      :    GT-G-AT-CCG-T-GAC--CCC-ATTTTCA---CA----GTTTT-A-A-T------TTT--GA-AA-C-AA-CT-TT-T-A------GA-CATA--T-CA--G--A
gi|84013                      :      -G-CT-CCG-T-GAC--CCT-ATTTTCA---CG----GTTTT-A-A-A------TCT--GA-AA-C-AA-CT-TT-T-A------GA-TACA--T-CG--G--AA-T-A--TA----TCT-GG----AT-GTT---TTT----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---T-T-T-AT---GAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTGTG---AAT-GA--CCCTCGTA
gi|84014                      :                                 A---CA----GTATT-G-A-AAAAATATCT--GA-AAAT-AA-CT-TT-TTA------GACTAAA--T-CG--A--AA---A--TAATAGT-T-GG----AA-TTTGTATTT----A-A---T-T--AG-ATT-CT-T-A-G--TTGA-AT----T-GAT---GATATA-A---A-A---A-TAA---T---C-T-A-----C-CAA-A--CTA-G---G-T-T-ATTATAAT----------A--TG-AC--G-----T--A-AA-TA-AAAATA-G-----G------TAA-T-G-ACCAA---A--A------GAGTT--C--TAAA----CGATA-T--CATATTTTG---AACAGG--CCCT
gi|84015                      :                                      A----GTTTT-A-A-A------TCT--AA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------GA-TATA--G-AG--G--GA-T-A--TA----T-T-GG----AA-TTT---TTT----T-A---T-T--AG-A---AT-T-A-G--TT
gi|84016                      :                                                      ------TCT--GA-AA-T-AA-CT-TT-T-A------TA-TGTG--T-CG--G--AA-T-A---------------------GTT---TTT----A-A---T-C--AA-A---AT-T-A-G--CTGG-AT----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-G-A-TA----T---C-T-A-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--A--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--TCCTCGTA
gi|84017                      :                                                                                                                              -GG----AA-GTT---TTT----A-A---T-T--AA-A---AT-T-A-G--TTGG-ATTTAAT-TAT---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---
gi|84018                      :                                                                                                                                                                    ---AT-T-A-G--TCAG-GT----T-TAT---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-G-----C-CAA-A--TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGCA
gi|84019                      :                                                                                                                                                                                             -TAT---GGT-TA-A---A-A-C-A-TA----T---CCT-A-----C-C------TTT-G---G-T-T-AT---AAT----------A--TG-AT--G-T---T--A-AA-T--A-----------------------T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--A----CG-TA----T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|84020                      :                                                                                                                                                                                             -TAT---G-T-TA-A---A-A-C-A-TA----T---C-T-A-----C--------TTT-G-----T-T-AT---AAC----------A--TA-AT--G-T---T--A-A-------------------------T-A-T-G---CAA---AT-A------G---T--C--T--AACCTCG-TAAT--T---TTTCG---AAC-GG--CCCTCGTA
gi|84021                      :                                                                                                                                                                                                                                                  --TTT-G---G-T-T-AT---GAT----------A--TG-AC--G-T---T--A-AA-T--GAAATA-G-----C------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--C--T--G----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CCCTCATA
gi|84022                      :                                                                                                                                                                                                                                                                   T---AAT----------A--CG-AC--G-T---T--A-AA-T--AAAATA-G-----T------T-A-T-G-A-CAA---A--A------G---T--A--T--A----CG-TA-T--T---TTTTG---AAC-GG--CTCTCGTA


blockSeqs                     :      T G  T   A T   TA   C       AAA  ACAA     T C C AAAATA   TA  G  TT   T  C  A T CATGTA  A    AT T  CG TG  A A AA  ATAGT  T  TTGT AAG  GTA   TTAA T ACA A AG  G GATA C G A CC    G  TTAA A   CAT   A  T GAG T A A A  CTAT ACG T T GGTAT G   T AT   A AGT G A A  TATA  TTAAACCGGT AC  C  GA A ATG CT T  T AA      A TTATT TACATG A A G G C   CAA AC TATATT AGT TC CA AA ACCT  A  TTA  ATA     TTT   G  CA
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       AAT  .        T . . A        .   .  AT   .  A  . . T       C    C  .  .  A   . . .   GA     .  .    AG   .     TTA  . .   . .   . TTC  . . . .     .  .    .   G     .  . .   . . T .  A    .   T . GC    .   . AT   . .   . . .  AA    .          C   .  A  T TA  A  .  . G       . T     .      C . . A .   .   T  AGTC   .   .  T  .  .     A  TT   AA      .     A  . 
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blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    G  .  .  .   . . .   TC     .  .    AA   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . A       . .     .      . . . . .   .   .  T      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AA   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AG   .     .    . .   . .   . T    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  C    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AG   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AG   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  G     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    TG   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    TT   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  C    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  C    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AT   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  T     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  G    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   C      .  .    AG   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AG   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  G    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   C      .  .    CA   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  G     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AT   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  C    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AT   .     .    . .   . .   . T    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  G     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   A      .  .    AC   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  T     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AT   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  G     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  C    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    TG   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  G     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AT   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  G     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  T    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   T      .  .    AT   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  .    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  T    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   .      .  .    AG   .     .    . .   . .   . A    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  .    .       .     .  . 
blockSeqs                     :      . .  .   . .   .    .       .    .        . . . .        .   .  C    .  .  . . .       .    .  .  .  .   . . .   .      .  .    G    .     .    . .   . .   . .    . . . .     .  .    .   .     .  . .   . . . .  .    .   . . .     .   . .    . .   . . .  A     .          .   .  .  . .   .  .  . .       . .     .      . . . . .   .   .  .      .   .  .  .  .     .  .    .       .     .  . 
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