lowQualScore : 111111 111111 1 1111111111 222 1111111 11111111
lowQualScore : 1 1 22 1 3 1 3 7 1 1 1 3 1 1 6 3 55 44 5 1 333333 22 1 1 44 222 1 3 1 222 1 1 1 666 44444 1 1 1 22 555 1 66 33333 1 555 22 3333 333333 1 33 1 1 1 22 777 1 1 1 22 3 999999 1 1 1 5 22 1 1 2 1 1 33 1 11 33 333 1 1 4444 44444 2 222 1 1 2 1 333 4444 44444 1 1 333 4444 33333 11 4 33 1 2 44 555 0000000000 6666666666 33333 1 1 66 11 1 333333 1 44 222 33 1 1 1 333 1 999999999 1 1 888888 2 5555 2222 66 33 1 1 2222 11 11 1 11 2 1 1 5 1 1 2 1 33333 1 11 999 1 1 4 22 2 44 1 1 0000000 1 1 3333 1 3333 66666666
lowQualScore : . . .. . . . . . . . . . . . . . .. .. . . ...... .. . . .. ... . . . ... . . . ... ..... . . . .. ... . .. ..... . ... .. .... ...... . .. . . . .. ... . . . .. . ...... . . . . .. . . . . . .. . .. .. ... . . .... ..... . ... . . . . ... .... ..... . . ... .... ..... .. . .. . . .. ... .......... .......... ..... . . .. .. . ...... . .. ... .. . . . ... . ......... . . ...... . .... .... .. .. . . .... .. .. . .. . . . . . . . . ..... . .. ... . . . .. . .. . . ....... . . .... . .... ........
lowQualScore : 8 7 44 7 5 7 5 0 7 7 7 5 7 7 7 3 66 00 0 7 666666 33 7 7 00 999 7 3 7 999 7 7 6 000 00000 6 6 6 11 666 5 00 88888 5 111 11 3333 999999 5 77 5 5 5 11 000 5 5 5 00 0 333333 5 4 4 7 00 4 4 9 4 4 33 4 99 11 888 4 4 3333 77777 5 333 3 3 7 3 777 2222 77777 3 3 777 2222 33333 88 0 22 3 7 88 222 2222222222 0000000000 77777 4 4 00 99 4 888888 4 77 444 33 4 4 4 888 4 555555555 3 3 444444 7 2222 8888 33 22 3 4 9999 99 99 4 99 8 4 4 5 4 4 8 4 44444 4 99 666 4 4 3 00 9 44 4 5 4444444 5 5 3333 6 4444 99999999
consensus : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G--C-GC-T----N-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-A-T-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-A-A--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-TTGA--C-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A-----C--TTCTTT
Reference ( gi|78407 ) : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G--C-GC-T----T-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-A-C-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-C-A--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--G-CT--CTT-G---T-C-AT----AT-----GCCA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----AT-T----T----GAG--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGG---C-AG-TTAA--C-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A-----A--TTCTTT
gi|78409 : ACATAAC-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-T-A-CG-CA-T--G--C-GC-T----T-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-A-C-A--TT----T------C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-C-A--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--G-CT--CTT-G---T-C-AT----AT-----GCCA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--G--G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---TGTGAC---------T-GCAA-GG-----AT-T----T----GAG--TT--C-CA-A----G--T--G----A-A-T-C-AT-CAAAT-A-T-----T-T--GGGC---C-AG-TTAA--C-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACT-T----A-----C--TTCTTT
gi|78414 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G--C-GC-T----T-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA----T-TG-TG-----G-A-C-A--TT----TTCT---C-ATT--G-A-AA-ATGG------A-TT-T-T--T-GC-C-A--TT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--G-CT--CTT-G---T-C-AT----AT-----G-CA---C-AATA-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GT-G--CG-GTA--T---AT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC----T-A-----T-TGAC---------T-GC-A-GG-----AT-T----T----GAG--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-TT----C-T-AT--GAA-A-------CTT-G----TACC-T----A-----C--TTCTTT
gi|78410 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G--C-GC-T----G-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-A-T-A--TT----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-A-A--TT-TT-T-T-G--C-CC-AC-T-TCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AT----A--------CA-----------T-G---T----ATGA-----C-TG-ATCA---AA----C---------A-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-TTGA--C-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----CACC-T----A-----
gi|78408 : ACGTA-C-T--TGAAT-A-T-A-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G--C-GC-T----G-T--AT-G-TT--T---T-C-CG-A---A-GG-GAA-AA---C-----T-AC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-A-T-A--TT----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-GT-T-T--T-GC-A-A--TT-TT-T-T-G--C-AA-AT-T-TCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-CT----AG-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----A-T-G--C--C-A---T--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------G-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AA-TTGA--C-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----CACC-T----A-----C--TTCTTTct
gi|78416 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-ATAT-T-TG--TC-G-A-CG-CAAT--G--C-GC-T----T-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AAA--C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TGGTG-----G-A-C-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AA-ATGG--A---A-TT-T-T--T-GC-A-T--TT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--G-CT--CTT-G---T-C-AT----AT-----GCCA---C--A-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-AT-A---AA----C-----T--GGTG--CG-A-AATT---TT----------TTG----------GA----T-T-GC-C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAT-GG-----AT-T----T----GAGT-TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-CAAT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGC---C-AG-TTAA--C-T-AT-AGAA-AC------C-T-G----TACC-T----A-----C--TTC
gi|78415 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-ATAT-T-TG--TC-G-A-CG-CAAT--G--C-GC-T----T-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AAA--C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TGGTG-----G-A-C-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AA-ATGG--A---A-TT-T-T--T-GC-A-T--TT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--G-CT--CTT-G---T-C-AT----AT-----GCCA---C--A-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-AT-A---AA----C-----T--GGTG--CG-A-AATT---TT----------TTG----------GA----T-T-GC-C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAT-GG-----AT-T----T----GAGT-TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-CAAT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGC---C-AG-TTAA--C-T-AT-AGAA-AC------C-T-G----TACC-T----A-----C--TTC
gi|78412 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-A-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CA-CA-T--G--C-GC-T----G-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A-AAAGAA-AA---C-----C-AT-C-T--AAA---TT-TG-AG-----G-A-T-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-GT-T-T--T-GC-A-A--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC---TCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----T----ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A------TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-G---A--T-AT--A---T--C--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--AT--C-TA-A----G--T--G-A--ACA-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AGTTTGA--C-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A-----C--TTCTT
gi|78418 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G--T-GG-T----G-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-CA-----G-A-T-A--TT----T--T-----ATT--G-A-AA-ATGT--C---T-TT-T-T--T-GC-A-A--TT-TT-A-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AA-A-TA-A---T----TTTG-----C-TG-ATCA---AA----G-----T--GA-G--CA-G-A--T---TT----------TTG----------GC----T-T-G--C--T-A---A--T-CC--A---TTCC--T-T-A-T---T-TCAC---------T-GCAA-GG-----GA-A----T----GAG--CT--C-CA-A----T--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-GAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-AAGA--C-T-TC-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A-----C--TTCTTT
gi|78419 : ACATA-C-T--TAAAT-A-T-GGA-AT-T-TGC-TC-G-AACG-CA-T--G--C-GCAT----G-T--AT---TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----T-TC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-A-T-A--TA----T--T---C-ATT--C-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T----GC-A-A--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--G-CT--CTT-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AA-A-TC-AT--T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-T--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A----TCC--T-A-A-G---T-TGAT------------CAA-AG-----GG-T----T----GAG--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--T-GG---C-AG-TTGA--C-T-ATAAGAT-T-------C-T-G----TTCC-T----A-----C--TT
gi|78420 : ACATA-T-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-GA-T--G--C-GC-T----A-T--AT-G-TT--T---T-C-TG-A---A--G-GAA-AG---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-A-T-A--AT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-C--------------------A-AC-T-TCA-A--G-AT--TTC-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AA-A----A---T-------A-----C-TG-ATCA---AA----C-----A--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTT----------GA----T-TTG--C--T-A---A--T-AT--A---TTCT--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GGG--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-A-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-GG-TTGA--C-T-TT-AGAA-A-------
gi|78421 : ATATA-T-T--TGAAT-T-T-G-A-AT-G-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G--C-GC-T----G-T--AT-C-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-A-A-A--TG----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGA--C---A-TT-T-T--T-GC-A-A--TG-TT-A-T-G--C-CA-GC-T-TCA-A--G-CT--CTT-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTG-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--AA-G--CA-T-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-C--C--T-A---C--T-TT--A---TTCC--T-T-T-T---T-TGAT---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAA--CT--A-CA-A----A--T--A-A--A-A-T-C-CT-C-GAT-G-T-----T-T--TGGGC--C-AG-ATGG--C-A-TT-AGAA-------------------ACC-T----A-----G--TTCTT
gi|78423 : ACATA-T-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TTC-TT-G-A-CA-CA-T--G--C-GC-T----T-A--AT-GCTT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-TC-C-T--GAAA--TT-TG-TG-----G-A-C-A--TT----T--T---C-ATT--G---AA-ATGG--CA--A-TT-T-T--T-GC-C-A--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCATA--G-CT--C-T-G---T-CGAT----AT------CCA---C-AA-A-TC-A---T----TTT-------------------A----C-----T--GA-G--CG-G-AT-T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-ATA-A---TTCCT-T-T-A-T---T-TGAC-----------GCGA-GT-----ATATTCG-T----GAG--TT----CA-A----C--T--GAA--A-A-T-C-AT-C-AAT-ATT-----T-T--TGGGC--C-AG-TTAA--C-T-AT-AGAACA-------C-T-G----TACCGT----G-----ATCTTCTT
gi|78422 : ACATG-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G--CCGC-T----G-T--AT-G-TT--T---TTC-TG-T---A-GG-CAA-AAGGGC-----C-AC-C-A--AAA---TT-TG-TG-----G-A-T-A--TTAAGGT--G---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---A-TT-T-T--T-GG-C-AATTT-TT-T-T-G--CGCG-AC-T-TCA-AA-G-CT--CTC-G---T-C-AT----AT-----GACA---CCAA-A-TC-A---T----TT-A-----C-TA-ATCA---AAA---T-----T--GG-A--CG-G-A--T---TT----------T------------GT----T-T-G--A--T-G---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--CT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-T-CAAT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGGGCC-AG-TTGA--C-T-TT-AG---A-------C-T-G----TA-C-T----A-----G--TTCTTT
gi|78417 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGT-CT-G-A-CGACA-T--G--C-GC-T----T-TTAAT-G-TTGTT---T-C-TG-A---ACAG-GAA-AA---C-----C-ACAC-T--GAAATATT-GG-TG-----G-A-C-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AATATGGATT---A-TT-T-T--TTGC-C-A--TT-TT-T-TTG--C-TAGAC-T-TCA-A--G-CT--CTTTG---T-C-AT----ATT----GCCA---G-CA-A-TC-A---T----TTTA-----CATGGATAC---AA----C-----T--GGTA--CGAG-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--CGCT-A---A--T-AT--A---TTCA--C-T-A-T---T-TGACA--------T-GCAT-GG-----ATAT----T----GAG--TTTAC-CA------G--T--G-A--A-A-T-C-ACAT-AAT-A-T-----TAT--TGGG---CCAG-TTAA--C-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A-----C--TTCATT
gi|78425 : ACATA-C-T--TGAAT-AAT-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G--C-GC-TG---T-T--AT-G-TTC-T---T-C-TG-A---A-AG-GGA------C-----C-AC-C-T--GAA---TC-TT-TG-----GTA-T-A--TT----T--GGA-T-ATT--G-A-AA-ATGG--CTGGG-TTGT-C--T-GC-TTA--AT-TT-T-T-G--C-CA-ACGT-TCA-G--A-CT--CTG-GCGTT-G-AT----TT-----GG-A---C-AA-AATC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AAGGTTC-----T--GA-G---G-G-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--C--T-GGATA--T-AT--A---TTCC------A-TG--T-TGAC---------T-GCGA-TGC----AT-T----TTGTAGAGCGTT--CATA-G----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-T-AAT-A-T-----T-T--TGGC---C-A--TTGA--C-TAAT-AGAA-C-------C-T-G----TACC-T----ACATGTA--TTCTT
gi|78411 : ACATA-C-T--TGAAT-A-TTG-A-AT-T-TTC--C-G-A-CG-CA-TTTG--C-GC-T----TGT--AT-G-TG--T---T-C-TG-A---A-AG-G-A-AA---C-----C-AC-CTT--GAA---TT-TG-AG-----G-A-T-A--------T--T---C-ATT--GAA-AA-ATGG--C---ATTT-T-T--T-GC-A-A--TTGTT-T-T-GGCC-CA-AC-TGTCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AT----A---------A---C----A-TT-A---------TGA-----C-TG-ATCGT--AA----C---------A-G--CG-GAA--T---TT----------TTGTGGTGGTGGAGG----T-T-G--C--TCC---A--T-AT--ATGTTTCC--TATAA-T---T-TGACACGG-----T-GCTA-GGGCGGTGT-T----T----GAG--CT--C-CA-G----G--T--G-A--A-AGT-C-AT-C-AATAA-T-----T-T--TGGGC--C-AG-TTAGATC-T--T-AGAA-A-------C-TAG----T--C-T----A-----T--TTCCT
gi|78426 : ATATA-C-----GAATCA-T-GGA-AT-T-GGCGTC-GTA-TGGCA-T--GG-CAGC-TG---T-T--AT-G-TT--T---T-C-GG-A---A-AG-GAA-AA---ATTTTAC-GC-A-T--GAAC--TT-TG-TG-----G-A-T-ACTTT----T--T---C-ATC--T-G-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--TTGC-T-AA-TT-TT-T-T-G----CA-AC-T-TTA-A--GACT--TCG-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AA-C-TC-A---TG---TTTA-----C-TG-ATAATGCAA----C-----T--GA-G--TG-G-A--TAGATTAAATAAATAATAA----------GAGAATT-T-GAAC--T-A---A--T--T--A---GTCCTGT-C-A-TCCAT-TGACCTAGGAAGAT-TCAA-GG------T-T----T----GAG--AT--C-TA-A----GCTT--A-ACTA-A-TCC-AT-C-AAT-A-T-----T-TCCTGGGC--C-AG-CTGA--CAT-AT-AG-A-A-------C-T-G----TACC-T----
gi|78427 : ACATT-T-T--TGAAT-AGT-G-A-TT-A-TGC-TTAG-A-CA--A-T--G--CAG------------AT-G-TT--TAATT-C-TGTA---A-AG-GGA-TA---C-------AC-A-T--GAA---TGATG-TG-----G-ATC-T--TT----T--T---C-ATTTGA-A-AA-AAGG--CT--A-TT-TAT--T-GCAT-A--TT-TT-TATAG--C-CA-CCAT-TCA-A--G--T--CTC-G---TTC-ATT---AT-----GACAAAAC-AA-A-TA-A---CAAAATTTATATATC-TG-ATCG---AA----C-----T--GA----TG-T-A--T---T-------------G----------GA----T-T-G--C--T-A---A----ATG-A---TTTC--T-T-A-T---T-TAA----------T-GCAG-TG-----GT-T----T----GAA--GT--C-CAGA----G--T--G-A--ATA-T-C-A----AAT-A-T-----T-T--TGGT---C-AG-TTGA--C-T-AT-AGAG-A---------T-G----T
gi|78424 : ACATA-C-TATTGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGA-TCTG-A-CGCCA-T--GGTC--C-T----G-T--AC-G-TT--T---C-CTTG-A---A-AG-AAGTAA---C-----C-AC-C-TGAGAA---TG-TC-TGAGGGAG-A-T-A--CT----TCCT---C-ATT--G-AGAA-ATTA--CT--A-CT-T-TTAT-GC-C-A--AT-GT-T-G-C--C-CA-AC-T-TCA-ACCG-CTGACTC-GT--T-C-ACCAGGAT-----G------C-AA-ATTC-ATACT----CTTAC----C-TG-ATCC---AA----C-----TCCGA-GA-CT-G-A--T---AT----------T-------------A------T-G--C--G-C---ACTT-AT--C---TCCC--T-T-ACT---C-TGAC---------T--CAA-GG------T-CCTCGT----GAGTCTT--C-CA-ATGTGA--T--G-A--A-A-T-T-AT---GAT-A-T-----C-T--
gi|78413 : ACATA-C-T--TG--T-A-T-T-A-ATAT-TGC-TC-G-A-CATCA-TC-G--C-GC-T----G-T--AT-T-TT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----CTAT-C-T--AAA---TT-T
gi|78428 : ATA-CCT--TGAAT-A-T-G-ACAT-T-TGC-TT-G-A-CG-CA-TC-G--C-G---------T--AT---TC--T---T-CGTC-A---A-TG-GAA-AC---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-GG--A-----G-A-T-A--TT----T--TT--C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T----GC-A-A--TT-TTAT-TAG--C-CA-AC-T-GCA-A--G-CA--TTT-G-----C-AT----AT-----GACA---C-AA-A-TCCA---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----TGACTAT--AA-G--CG-G-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTGC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-CTGA--C-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TGCC-T----A-----C--TTCTTT
gi|78429 : -C-T--TAAGT---T-G-A-AT-A-TGC-TC-A-A--G-AA-A--G--C-GC-T----G-T--AT-G-TT--T---G-C-T--A---A-AG-GAA-A----C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG--------A-A-T-A--TT----T--T---T-GTT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-A-A--TT-TT-A-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AT----ATAATATGACA---C-AA-A-TC-A---T----TCTG-----C-TG-AATA---AA----C-----T--GA-GGCCG-G-C--T---TG----------TT-------------------T-G--C--T-A---G--T-CT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----AT-T----T----CAG--TT--C-CA-A----G--T--G-C--A-A-A-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-ATGA--C-T-TT-TACC-A-------C-T-G----TACC-T----A-----C--TTCTTT
gi|78430 : -T--TGAAT---T-A-AGAT-CATGC-TC-G-A-CG-CA-T--G--C-GC-TGTGAT-T--ATAG-TT--------C-TG-ACATA-AG-GAA-AA---C-----C-A----T--GAA---TT-TGGTG-----G-A-TTA--TT----T--T---CTATTA-G-A-AT-ATAG--C---A-TT-T-T--T-GC-C-A--TG-TT-T---G--C-CA-AC-T-TTA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTC-------------------A----C-----T--GA-G--TG-G-A--TG--TT----------TTG----------AG----TAT-GC-C--T-A---A--TCATGCA---TTCA----T-A-T---T-TGAC---------TGGCAAGGG-----GT-T----T----GAG--TCG-C-GA-A----G--TTCG-A--A-A-T-CAAT-C-AATAA-TATTTAT-T--TGGGC--C-AG-CTGA--CTT-AT-AGGA-ACAT----C-T-G----TACC-T----A-----G--TTCTTT
gi|78431 : G-CA-T--G--C-AC-T----G-T--AT-G-AT--T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---A-----C-AC-C-T--GAA---TG-TG-TG-----G-A-T-A--TT----T--C---T-ATT--G-A-AA-ATGA--T---A-CT-T-T--T-GC-
gi|78432 : AA-AA---C-----T----C-T--GGA---TT-TG-TG-----A-A-T-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-AC-A-G--TT-TT-T-TTG--C-AA-AC-T-TCA-A--G-CT--TCC-G---T-C-AT----AT-----GACA---T-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-GG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A----------------------------------GT-T----T----GAG--CT--C-CA-A----G--T--G------A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGA--C-AG-TTGA--C-A-TT-AAAA-A-------A-T-GTATATACC-T----A-----C--TTCTTTa
gi|78433 : --GAA---TT-TG-AG-----G-A-T-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGA--C---A-TT--------------------T-T-T-G--C--A-AT-T------------------------------------------A---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----A-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--
gi|78434 : AA---TT-TG-TG-----G-A-T-A--TT----T--G---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---A-TT-T-T--T-GC-A-A--TT-TT-T-T-G--C-CG-AC-T-TCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TA-ATCA---AA----T-----T--GG-A--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-G---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--CT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-TTGA--C-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A-----G--TTCTTT
gi|78435 : ---A-TA-T-T--T-GT-A-A--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-A----CC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----T-----T--GA-G--CG-G-A--TG--TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--C-G---C--T-A-----------------A-T------GAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--CT--C-CA-A----G--C--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-TTGA--C-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A-----C--TTCTTT
gi|78436 : T-TG-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--G-TT--CTC-G---T-C-AT----AT-----GATG---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-A--
gi|78437 : -T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--G-CT--CTC-G---T-C-AC----AG-----GATG---C-AA-A-TT-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C-------------AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-ACAA-GG-----GT-T----T----GAG--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----G-T--TGGC---C-AG-TTGA--C-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A-----C--TTNT
gi|78438 : CA-A--G-CT--CTT-G---T-C-AT----AT-----GACA---C-AT-A-TC-A---T----TTTA-----T-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A--T---T----------------------------------G--C--T-A---------T--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-C-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-TTGA--C-T-AT-AGAA-ACGCGTAGC-T-G----TACC-T----A-----C--TTCTTT
gi|78439 : T-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TCTG-----C-TG-AATA---AA----C-----T--GA-G--CC-G-G--C---TT----------T------------GT----T-T-G--C--T-A---GTCT-AG--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----AT-T----T----CAG--TT--C-
gi|78440 : --T---TG----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-A---G--T-CT--G---TCCT--T-T-A-T---T-TGAC---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-T-T-C-TT-C-GAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-----------AT-AGAA-A-------C-T-G----TACT-TTATAA-----A--TTCTTT
gi|78441 : C---------T-GCAA-GG-----GT-T----T----GAG--TT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-G-C-AT-A-AAT-A-T-----T-T--TGGGC--C-AG-TTGA--C-T-AT-AGA
Alignments
lowQualScore : 111111 1111111
lowQualScore : 1 1 22 1 3 1 3 6 1 1 1 3 1 1 6 3 33 1 3 22 1 444 33 1 7777 222 1 3 1 222 1 1 1 555 33333 1 1 1 22 555 1 55 33333 1 1 22 3333 444444 1 33 1 1 1 22 555 2 1 1 2 333 3333 1 1 1 6 33 1 1 2 1 1 33 11 11 1 2 1 2 1 1 55555 222 1 1 1 1 333 4444 44444 1 1 333 4444 33333 11 3 33 1 2 44 555 9999999999 5555555555 33333 1 1 55 11 1 222 33 1 44 222 33 1 1 1 333 1 4444 33 2 333333 33333 2 5555 2222 11 44 33 1 1 2222 11 11 1 11 2 1 1 5 1 2 1 44444 1 11 11 1 1 2 33 1 1 0000000 1 1 3333 1 3333 22 44444
lowQualScore : . . .. . . . . . . . . . . . . . .. . . .. . ... .. . .... ... . . . ... . . . ... ..... . . . .. ... . .. ..... . . .. .... ...... . .. . . . .. ... . . . . ... .... . . . . .. . . . . . .. .. .. . . . . . . ..... ... . . . . ... .... ..... . . ... .... ..... .. . .. . . .. ... .......... .......... ..... . . .. .. . ... .. . .. ... .. . . . ... . .... .. . ...... ..... . .... .... .. .. .. . . .... .. .. . .. . . . . . . . ..... . .. .. . . . .. . . ....... . . .... . .... .. .....
lowQualScore : 7 7 33 7 3 7 3 7 7 7 7 3 7 7 4 2 88 6 2 22 6 222 88 6 2222 888 6 2 6 888 6 6 5 888 88888 5 5 5 00 444 4 44 77777 5 5 00 1111 666666 5 55 5 5 5 00 444 9 4 4 9 999 6666 4 4 4 9 33 4 4 8 4 3 22 88 88 3 7 3 7 3 3 88888 333 3 3 3 3 555 0000 55555 3 3 555 0000 22222 88 9 11 3 6 77 000 8888888888 8888888888 33333 3 3 88 88 3 333 77 3 55 333 22 3 3 3 777 3 0000 11 6 777777 22222 6 0000 7777 88 44 11 3 3 8888 88 88 3 88 7 3 3 3 3 7 3 77777 3 88 99 4 4 8 11 4 4 0000000 5 5 1111 5 3333 22 00000
consensus : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
Reference ( family-542 ) : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-N-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78407 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AC-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGG-CAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--A-----TTCTTT
gi|78408 : ACGTA-C-T--TGAAT-A-T-A-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-CG-A---A-GG-GAA-AA---C-----T-AC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-GT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-AA-AT-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-C-T-AG-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----A-T-G--C--C-A---T--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----G--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAA-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----CACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78409 : ACATAAC-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-T-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AC-A--TT----T------C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--G--G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---TGTGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G----A-A-T-C-AT-CAA--A-TA----T-T--T--GGGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACT-T----A--C-----TTCTTT
gi|78410 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CC-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T---------ACA-----------T-G---T----ATGA-----C-TG-ATCA---AA----C---------A-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----CACC-T----A--C-----
gi|78411 : ACATA-C-T--TGAAT-A-TTG-A-AT-T-TTC--C-G-A-CG-CA-TTTG-C-G--C-T-TGT--ATG-TG----T---T-C-TG-A---A-AG-G-A-AA---C-----C-AC-CTT--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--------T--T---C-ATT--GAA-AA-ATGG--C---ATTT-T-TT-G---C--A-ATTGTT-T-T-GGCC-CA-AC-TGTCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-A-------AC---------A-TT-A---------TGA-----C-TG-ATCGT--AA----C---------A-G--CG-GAA--T---TT----------TTGTGGTGGTGGAGG----T-T-G--C--TCC---A--T-AT--ATGTTTCC--TATAA-T---T-TGACACGGT--GCTA-G------GGCGGTGT-T----T----GA--G--CT--C-CA-G----G--T--G-A--A-AGT-C-AT-CAATAA-T-----T-T--T--GGGCCAG-TTAGAT-C-TT-AGAA-A-------C-TAG----T--C-T----A--T-----TTCCT
gi|78412 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-A-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CA-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AAAGAA-AA---C-----C-AT-C-T--AAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-GT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC---TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----T----ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A------TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-G---A--T-AT--A---T--C--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--AT--C-TA-A----G--T--G-A--ACA-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAGTTT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTT
gi|78413 : ACATA-C-T--TG--T-A-T-T-A-ATAT-TGC-TC-G-A-CATCA-TC-G-C-G--C-T-G-T--ATT-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----CTAT-C-T--AAA---TT-T
gi|78414 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA----T-TG-TG-----G-AC-A--TT----TTCT---C-ATT--G-A-AA-ATGG------A-TT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----G-CA---C-AATA-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GT-G--CG-GTA--T---AT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC----T-A-----T-TGAC----T--GC-A-G------G-----AT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT---C-T-AT--GAA-A-------CTT-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78415 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-ATAT-T-TG--TC-G-A-CG-CAAT--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AAA--C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TGGTG-----G-AC-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AA-ATGG--A---A-TT-T-TT-G---C--A-TTT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C--A-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-AT-A---AA----C-----T--GGTG--CG-A-AATT---TT----------TTG----------GA----T-T-GC-C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAT-G------G-----AT-T----T----GA--GT-TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-CAAT-CAAT-A-T-----T-T--T---GGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-AC------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTC
gi|78416 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-ATAT-T-TG--TC-G-A-CG-CAAT--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AAA--C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TGGTG-----G-AC-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AA-ATGG--A---A-TT-T-TT-G---C--A-TTT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C--A-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-AT-A---AA----C-----T--GGTG--CG-A-AATT---TT----------TTG----------GA----T-T-GC-C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAT-G------G-----AT-T----T----GA--GT-TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-CAAT-CAAT-A-T-----T-T--T---GGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-AC------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTC
gi|78417 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGT-CT-G-A-CGACA-T--G-C-G--C-T-T-TTAATG-TTGT--T---T-C-TG-A---ACAG-GAA-AA---C-----C-ACAC-T--GAAATATT-GG-TG-----G-AC-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AATATGGATT---A-TT-T-TTTG---C--C-ATT-TT-T-TTG--C-TAGAC-T-TCA-A--GCT--CT--TTG-T-C-A-T-ATT----GCCA---G-CA-A-TC-A---T----TTTA-----CATGGATAC---AA----C-----T--GGTA--CGAG-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--CGCT-A---A--T-AT--A---TTCA--C-T-A-T---T-TGACA---T--GCAT-G------G-----ATAT----T----GA--G--TTTAC-CA------G--T--G-A--A-A-T-C-ACATAAT-A-T-----TAT--T--GGGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCATT
gi|78418 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G-T-G--G-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-CA-----G-AT-A--TT----T--T-----ATT--G-A-AA-ATGT--C---T-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-A-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TA-A---T----TTTG-----C-TG-ATCA---AA----G-----T--GA-G--CA-G-A--T---TT----------TTG----------GC----T-T-G--C--T-A---A--T-CC--A---TTCC--T-T-A-T---T-TCAC----T--GCAA-G------G-----GA-A----T----GA--G--CT--C-CA-A----T--T--G-A--A-A-T-C-AT-CGAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-AA-GAC-T-TC-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78419 : ACATA-C-T--TAAAT-A-T-GGA-AT-T-TGC-TC-G-AACG-CA-T--G-C-G--CAT-G-T--AT--TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----T-TC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TA----T--T---C-ATT--C-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-AT--T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-T--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A----TCC--T-A-A-G---T-TGAT--------CAA-A------G-----GG-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GG--CAG-TT-GAC-T-ATAAGAT-T-------C-T-G----TTCC-T----A--C-----TT
gi|78420 : ACATA-T-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-GA-T--G-C-G--C-T-A-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A--G-GAA-AG---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--AT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--------------------CA-AC-T-TCA-A--GAT--TT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A----A---T-------A-----C-TG-ATCA---AA----C-----A--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTT----------GA----T-TTG--C--T-A---A--T-AT--A---TTCT--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GG--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-AAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCGG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------
gi|78421 : ATATA-T-T--TGAAT-T-T-G-A-AT-G-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATC-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AA-A--TG----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGA--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATG-TT-A-T-G--C-CA-GC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTG-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--AA-G--CA-T-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-C--C--T-A---C--T-TT--A---TTCC--T-T-T-T---T-TGAT----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--A--CT--A-CA-A----A--T--A-A--A-A-T-C-CT-CGAT-G-T-----T-T--T--GGGCCAG-AT-GGC-A-TT-AGAA-------------------ACC-T----A--G-----TTCTT
gi|78422 : ACATG-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-CCG--C-T-G-T--ATG-TT----T---TTC-TG-T---A-GG-CAA-AAGGGC-----C-AC-C-A--AAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TTAAGGT--G---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---A-TT-T-TT-GG--C--A-ATT-TT-T-TTG--CGCG-AC-T-TCA-AA-GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---CCAA-A-TC-A---T----TT-A-----C-TA-ATCA---AAA---T-----T--GG-A--CG-G-A--T---TT----------T------------GT----T-T-G--A--T-G---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-T-CAAT-CAAT-A-T-----T-T--TGGGGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AG---A-------C-T-G----TA-C-T----A--G-----TTCTTT
gi|78423 : ACATA-T-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TTC-TT-G-A-CA-CA-T--G-C-G--C-T-T-A--ATGCTT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-TC-C-T--GAAA--TT-TG-TG-----G-AC-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---AATT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCATA--GCT--CT----G-T-CGA-T-AT------CCA---C-AA-A-TC-A---T----TTT-------------------A----C-----T--GA-G--CG-G-AT-T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-ATA-A---TTCCT-T-T-A-T---T-TGAC-------GCGA-G------T-----ATATTCG-T----GA--G--TT----CA-A----C--T--GAA--A-A-T-C-AT-CAAT-ATT-----T-T--T--GGGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAACA-------C-T-G----TACCGT----GATC-----TTCTT
gi|78424 : ACATA-C-TATTGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGA-TCTG-A-CGCCA-T--G---GTCC-T-G-T--ACG-TT----T---C-CTTG-A---A-AG-AAGTAA---C-----C-AC-C-TGAGAA---TG-TC-TGAGGGAG-AT-A--CT----TCCT---C-ATT--G-AGAA-ATTA--CT--A-CT-T-TT-ATGCC--A-A---TG-T-T-GC-C-CA-AC-T-TCA-ACCGCTGACT--C-GTT-C-ACC-AG-----GATG---C-AA-ATTC-ATACT----CTTAC----C-TG-ATCC---AA----C-----TCCGA-GA-CT-G-A--T---AT----------T-------------A------T-G--C--G-C---ACTT-AT--C---TCCC--T-T-ACT---C-TGAC----T---CAA--------G-----GT-CCTCGT----GA--GTCTT--C-CA-ATGTGA--T--G-A--A-A-T-T-AT--GAT-A-T-----C-T--
gi|78425 : ACATA-C-T--TGAAT-AAT-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G-C-G--C-TGT-T--ATG-TTC---T---T-C-TG-A---A-AG-G---GA---C-----C-AC-C-T--GAA---TC-TT-TG-----GTAT-A--TT----T--GGA-T-ATT--G-A-AA-ATGG--CTGGG-TTGT-CT-G---CTTA-A-T-TT-T-T-G--C-CA-ACGT-TCA-G--ACT--CTGGC-G-T-TGA-T-TTG----GACA-----AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AAGGTTC-----T--GA-G---G-G-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--C--T-GGATA--T-AT--A---TTCC------A-TG--T-TGAC----T--GCGATG------C-----AT-T----TTGTAGAGCG--TT--CATA-G----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-TAAT-A-T-----T-T--T---GGCCA--TT-GAC-TAAT-AGAA-C-------C-T-G----TACC-T----A--CATGTATTCTT
gi|78426 : ATATA-C-----GAATCA-T-GGA-AT-T-GGCGTC-GTA-TGGCA-T--GGCAG--C-T-G-TT-ATG-TT----T---T-C-GG-A---A-AG-GAA-AA---ATTTTAC-GC-A-T--GAAC--TT-TG-TG-----G-AT-ACTTT----T--T---C-ATC--T-G-AA-ATGG--C---A-TT-T-TTTG---CT-A-ATT-TT-T-T-G--C--A-AC-T-TTA-A--GAC--TT--C-GGT-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-C-TC-A---TG---TTTA-----C-TG-ATAATGCAA----C-----T--GA-G--TG-G-A--TAGATTAAATAAATAATAA----------GAGAATT-T-GAAC--T-A---A--T--T--A---GTCCTGT-C-A-TCCAT-TGAC----CTAGGAA-GATTCAAG-----GT-T----T----GA--G--AT--C-TA-A----GCTT--A-ACTA-A-TCC-AT-CAAT-A-T-----T-TCCT--GGGCCAG-CT-GACAT-AT-AG-A-A-------C-T-G----TACC-T----
gi|78427 : ACATT-T-T--TGAAT-AGT-G-A-TT-A-TGC-TTAG-A-CA--A-T--G-C--------A-G--ATG-TT----TAATT-C-TGTA---A-AG-GGA-TA---C-------AC-A-T--GAA---TGATG-TG-----G-AT-C--TT----T--TT--C-ATTTGA-A-AA-AAGG--CT--A-TT-TATT-G---C--ATATT-TT-TATAG--C-CA-CCAT-TCA-A--G-T--CT--C-G-TTC-A-TTAT-----GACAAAAC-AA-A-TA-A---CAAAATTTATATATC-TG-ATCG---AA----C-----T--GA----TG-T-A--T---T-------------G----------GA----T-T-G--C--T-A---A----ATG-A---TTTC--T-T-A-T---T-TAA-----T--GCAG-T------G-----GT-T----T----GA--A--GT--C-CAGA----G--T--G-A--ATA-T-C-A---AAT-A-T-----T-T--T--GG-TCAG-TT-GAC-T-AT-AGAG-A---------T-G----T
gi|78428 : ATA-CCT--TGAAT-A-T-G-ACAT-T-TGC-TT-G-A-CG-CA-T----C-G--C---G-T--AT--TC----T---T-CGTC-A---A-TG-GAA-AC---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-GG--A-----G-AT-A--TT----T--TT--C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--G---C--A-ATT-TTAT-TAG--C-CA-AC-T-GCA-A--GCA--TT--T-G---C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TCCA---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----TGACTAT--AA-G--CG-G-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTGC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-CT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TGCC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78429 : -C-T--TAAGT---T-G-A-AT-A-TGC-TC-A-A--G-AA-A--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---G-C-T--A---A-AG-GAA-A----C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG--------A-AT-A--TT----T--T---T-GTT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-A-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-ATAATATGACA---C-AA-A-TC-A---T----TCTG-----C-TG-AATA---AA----C-----T--GA-GGCCG-G-C--T---TG----------TT-------------------T-G--C--T-A---G--T-CT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----CA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-C--A-A-A-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-AT-GAC-T-TT-TACC-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78430 : -T--TGAAT---T-A-AGAT-CATGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--G-A-TTATAGT---T-C-TG-ACATA-AG-GAA-AA---C-----C-A----T--GAA---TT-TGGTG-----G-ATTA--TT----T--T---CTATTA-G-A-AT-ATAG--C---A-TT-T-TT-G---C--C-ATG-TT-T---G--C-CA-AC-T-TTA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTC-------------------A----C-----T--GA-G--TG-G-A--TG--TT----------TTG----------AG----TAT-GC-C--T-A---A--TCATGCA---TTCA----T-A-T---T-TGAC----TG-GCAAGG------G-----GT-T----T----GA--G--TCG-C-GA-A----G--TTCG-A--A-A-T-CAAT-CAATAA-TATTTAT-T--T--GGGCCAG-CT-GACTT-AT-AGGA-ACAT----C-T-G----TACC-T----A--G-----TTCTTT
gi|78431 : G-CA-T--G-C-A--C-T-G-T--ATG-AT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---A-----C-AC-C-T--GAA---TG-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--C---T-ATT--G-A-AA-ATGA--T---A-CT-T-TT-G---C--A-
gi|78432 : AA-AA---C-----T----C-T--GGA---TT-TG-TG-----A-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-A---C--A-GTT-TT-T-TTG--C-AA-AC-T-TCA-A--GCT--TC--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---T-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-GG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A------------------------------------GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G------A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGACAG-TT-GAC-A-TT-AAAA-A-------A-T-GTATATACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78433 : --GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGA--C---A-TT--------------------T-T-T-G--C--A-AT-T---------------------------------------A---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----A-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--
gi|78434 : AA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--G---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CG-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TA-ATCA---AA----T-----T--GG-A--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-G---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--G-----TTCTTT
gi|78435 : ---A-TA-T-TT-G---T--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-A----CC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----T-----T--GA-G--CG-G-A--TG--TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--C-G---C--T-A-----------------A-T------GAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--C--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78436 : T-TG-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GTT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GATG---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-A--
gi|78437 : -T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-C-AG-----GATG---C-AA-A-TT-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C-------------AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--ACAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----G-T--T---GGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTNT
gi|78438 : CA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AT-A-TC-A---T----TTTA-----T-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A--T---T----------------------------------G--C--T-A---------T--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-ACGCGTAGC-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78439 : T-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TCTG-----C-TG-AATA---AA----C-----T--GA-G--CC-G-G--C---TT----------T------------GT----T-T-G--C--T-A---GTCT-AG--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----CA--G--TT--C-
gi|78440 : --T---TG----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-A---G--T-CT--G---TCCT--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-T-T-C-TT-CGAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG----------AT-AGAA-A-------C-T-G----TACT-TTATAA--A-----TTCTTT
gi|78441 : C----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-G-C-AT-AAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGA
Alignments
lowQualScore : 111111 1111111
lowQualScore : 1 1 22 1 3 1 3 6 1 1 1 3 1 1 6 3 33 1 3 22 1 1 1 33 1 7777 222 1 3 1 222 1 1 1 555 33333 1 1 1 22 555 1 55 33333 1 1 22 3333 444444 1 33 1 1 1 22 555 2 1 1 2 333 3333 1 1 1 6 33 1 1 2 1 1 33 11 11 1 2 1 2 1 1 55555 222 1 1 1 1 333 4444 44444 1 1 333 4444 33333 11 3 33 1 2 44 555 9999999999 5555555555 33333 1 1 55 11 1 222 33 1 44 222 33 1 1 1 333 1 4444 33 2 333333 33333 2 5555 2222 11 44 33 1 1 2222 11 11 1 11 2 1 1 5 1 2 1 44444 1 11 11 1 1 2 33 1 1 0000000 1 1 3333 1 3333 22 44444
lowQualScore : . . .. . . . . . . . . . . . . . .. . . .. . . . .. . .... ... . . . ... . . . ... ..... . . . .. ... . .. ..... . . .. .... ...... . .. . . . .. ... . . . . ... .... . . . . .. . . . . . .. .. .. . . . . . . ..... ... . . . . ... .... ..... . . ... .... ..... .. . .. . . .. ... .......... .......... ..... . . .. .. . ... .. . .. ... .. . . . ... . .... .. . ...... ..... . .... .... .. .. .. . . .... .. .. . .. . . . . . . . ..... . .. .. . . . .. . . ....... . . .... . .... .. .....
lowQualScore : 7 7 33 7 3 7 3 7 7 7 7 3 7 7 4 2 88 6 2 22 6 6 6 88 6 2222 888 6 2 6 888 6 6 5 888 88888 5 5 5 00 444 4 44 77777 5 5 00 1111 666666 5 55 5 5 5 00 444 9 4 4 9 999 6666 4 4 4 9 33 4 4 8 4 3 22 88 88 3 7 3 7 3 3 88888 333 3 3 3 3 555 0000 55555 3 3 555 0000 22222 88 9 11 3 6 77 000 8888888888 8888888888 33333 3 3 88 88 3 333 77 3 55 333 22 3 3 3 777 3 0000 11 6 777777 22222 6 0000 7777 88 44 11 3 3 8888 88 88 3 88 7 3 3 3 3 7 3 77777 3 88 99 4 4 8 11 4 4 0000000 5 5 1111 5 3333 22 00000
consensus : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
Reference ( family-542 ) : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78407 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AC-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGG-CAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--A-----TTCTTT
gi|78408 : ACGTA-C-T--TGAAT-A-T-A-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-CG-A---A-GG-GAA-AA---C-----T-AC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-GT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-AA-AT-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-C-T-AG-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----A-T-G--C--C-A---T--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----G--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAA-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----CACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78409 : ACATAAC-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-T-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AC-A--TT----T------C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--G--G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---TGTGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G----A-A-T-C-AT-CAA--A-TA----T-T--T--GGGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACT-T----A--C-----TTCTTT
gi|78410 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CC-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T---------ACA-----------T-G---T----ATGA-----C-TG-ATCA---AA----C---------A-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----CACC-T----A--C-----
gi|78411 : ACATA-C-T--TGAAT-A-TTG-A-AT-T-TTC--C-G-A-CG-CA-TTTG-C-G--C-TTG-T--ATG-TG----T---T-C-TG-A---A-AG-G-A-AA---C-----C-AC-CTT--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--------T--T---C-ATT--GAA-AA-ATGG--C---ATTT-T-TT-G---C--A-ATTGTT-T-T-GGCC-CA-AC-TGTCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-A-------AC---------A-TT-A---------TGA-----C-TG-ATCGT--AA----C---------A-G--CG-GAA--T---TT----------TTGTGGTGGTGGAGG----T-T-G--C--TCC---A--T-AT--ATGTTTCC--TATAA-T---T-TGACACGGT--GCTA-G------GGCGGTGT-T----T----GA--G--CT--C-CA-G----G--T--G-A--A-AGT-C-AT-CAATAA-T-----T-T--T--GGGCCAG-TTAGAT-C-TT-AGAA-A-------C-TAG----T--C-T----A--T-----TTCCT
gi|78412 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-A-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CA-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AAAGAA-AA---C-----C-AT-C-T--AAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-GT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC---TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----T----ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A------TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-G---A--T-AT--A---T--C--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--AT--C-TA-A----G--T--G-A--ACA-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAGTTT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTT
gi|78413 : ACATA-C-T--TG--T-A-T-T-A-ATAT-TGC-TC-G-A-CATCA-TC-G-C-G--C-T-G-T--ATT-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----CTAT-C-T--AAA---TT-T
gi|78414 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA----T-TG-TG-----G-AC-A--TT----TTCT---C-ATT--G-A-AA-ATGG------A-TT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----G-CA---C-AATA-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GT-G--CG-GTA--T---AT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC----T-A-----T-TGAC----T--GC-A-G------G-----AT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT---C-T-AT--GAA-A-------CTT-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78415 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-ATAT-T-TG--TC-G-A-CG-CAAT--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AAA--C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TGGTG-----G-AC-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AA-ATGG--A---A-TT-T-TT-G---C--A-TTT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C--A-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-AT-A---AA----C-----T--GGTG--CG-A-AATT---TT----------TTG----------GA----T-T-GC-C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAT-G------G-----AT-T----T----GA--GT-TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-CAAT-CAAT-A-T-----T-T--T---GGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-AC------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTC
gi|78416 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-ATAT-T-TG--TC-G-A-CG-CAAT--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AAA--C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TGGTG-----G-AC-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AA-ATGG--A---A-TT-T-TT-G---C--A-TTT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C--A-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-AT-A---AA----C-----T--GGTG--CG-A-AATT---TT----------TTG----------GA----T-T-GC-C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAT-G------G-----AT-T----T----GA--GT-TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-CAAT-CAAT-A-T-----T-T--T---GGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-AC------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTC
gi|78417 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGT-CT-G-A-CGACA-T--G-C-G--C-T-T-TTAATG-TTGT--T---T-C-TG-A---ACAG-GAA-AA---C-----C-ACAC-T--GAAATATT-GG-TG-----G-AC-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AATATGGATT---A-TT-T-TTTG---C--C-ATT-TT-T-TTG--C-TAGAC-T-TCA-A--GCT--CT--TTG-T-C-A-T-ATT----GCCA---G-CA-A-TC-A---T----TTTA-----CATGGATAC---AA----C-----T--GGTA--CGAG-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--CGCT-A---A--T-AT--A---TTCA--C-T-A-T---T-TGACA---T--GCAT-G------G-----ATAT----T----GA--G--TTTAC-CA------G--T--G-A--A-A-T-C-ACATAAT-A-T-----TAT--T--GGGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCATT
gi|78418 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G-T-G--G-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-CA-----G-AT-A--TT----T--T-----ATT--G-A-AA-ATGT--C---T-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-A-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TA-A---T----TTTG-----C-TG-ATCA---AA----G-----T--GA-G--CA-G-A--T---TT----------TTG----------GC----T-T-G--C--T-A---A--T-CC--A---TTCC--T-T-A-T---T-TCAC----T--GCAA-G------G-----GA-A----T----GA--G--CT--C-CA-A----T--T--G-A--A-A-T-C-AT-CGAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-AA-GAC-T-TC-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78419 : ACATA-C-T--TAAAT-A-T-GGA-AT-T-TGC-TC-G-AACG-CA-T--G-C-G--CAT-G-T--AT--TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----T-TC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TA----T--T---C-ATT--C-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-AT--T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-T--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A----TCC--T-A-A-G---T-TGAT--------CAA-A------G-----GG-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GG--CAG-TT-GAC-T-ATAAGAT-T-------C-T-G----TTCC-T----A--C-----TT
gi|78420 : ACATA-T-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-GA-T--G-C-G--C-T-A-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A--G-GAA-AG---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--AT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--------------------CA-AC-T-TCA-A--GAT--TT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A----A---T-------A-----C-TG-ATCA---AA----C-----A--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTT----------GA----T-TTG--C--T-A---A--T-AT--A---TTCT--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GG--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-AAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCGG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------
gi|78421 : ATATA-T-T--TGAAT-T-T-G-A-AT-G-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATC-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AA-A--TG----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGA--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATG-TT-A-T-G--C-CA-GC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTG-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--AA-G--CA-T-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-C--C--T-A---C--T-TT--A---TTCC--T-T-T-T---T-TGAT----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--A--CT--A-CA-A----A--T--A-A--A-A-T-C-CT-CGAT-G-T-----T-T--T--GGGCCAG-AT-GGC-A-TT-AGAA-------------------ACC-T----A--G-----TTCTT
gi|78422 : ACATG-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-CCG--C-T-G-T--ATG-TT----T---TTC-TG-T---A-GG-CAA-AAGGGC-----C-AC-C-A--AAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TTAAGGT--G---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---A-TT-T-TT-GG--C--A-ATT-TT-T-TTG--CGCG-AC-T-TCA-AA-GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---CCAA-A-TC-A---T----TT-A-----C-TA-ATCA---AAA---T-----T--GG-A--CG-G-A--T---TT----------T------------GT----T-T-G--A--T-G---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-T-CAAT-CAAT-A-T-----T-T--TGGGGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AG---A-------C-T-G----TA-C-T----A--G-----TTCTTT
gi|78423 : ACATA-T-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TTC-TT-G-A-CA-CA-T--G-C-G--C-T-T-A--ATGCTT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-TC-C-T--GAAA--TT-TG-TG-----G-AC-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---AATT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCATA--GCT--CT----G-T-CGA-T-AT------CCA---C-AA-A-TC-A---T----TTT-------------------A----C-----T--GA-G--CG-G-AT-T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-ATA-A---TTCCT-T-T-A-T---T-TGAC-------GCGA-G------T-----ATATTCG-T----GA--G--TT----CA-A----C--T--GAA--A-A-T-C-AT-CAAT-ATT-----T-T--T--GGGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAACA-------C-T-G----TACCGT----GATC-----TTCTT
gi|78424 : ACATA-C-TATTGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGA-TCTG-A-CGCCA-T--G---GTCC-T-G-T--ACG-TT----T---C-CTTG-A---A-AG-AAGTAA---C-----C-AC-C-TGAGAA---TG-TC-TGAGGGAG-AT-A--CT----TCCT---C-ATT--G-AGAA-ATTA--CT--A-CT-T-TT-ATGCC--A-A---TG-T-T-GC-C-CA-AC-T-TCA-ACCGCTGACT--C-GTT-C-ACC-AG-----GATG---C-AA-ATTC-ATACT----CTTAC----C-TG-ATCC---AA----C-----TCCGA-GA-CT-G-A--T---AT----------T-------------A------T-G--C--G-C---ACTT-AT--C---TCCC--T-T-ACT---C-TGAC----T---CAA--------G-----GT-CCTCGT----GA--GTCTT--C-CA-ATGTGA--T--G-A--A-A-T-T-AT--GAT-A-T-----C-T--
gi|78425 : ACATA-C-T--TGAAT-AAT-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G-C-G--C-T-GTT--ATG-TTC---T---T-C-TG-A---A-AG-G---GA---C-----C-AC-C-T--GAA---TC-TT-TG-----GTAT-A--TT----T--GGA-T-ATT--G-A-AA-ATGG--CTGGG-TTGT-CT-G---CTTA-A-T-TT-T-T-G--C-CA-ACGT-TCA-G--ACT--CTGGC-G-T-TGA-T-TTG----GACA-----AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AAGGTTC-----T--GA-G---G-G-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--C--T-GGATA--T-AT--A---TTCC------A-TG--T-TGAC----T--GCGATG------C-----AT-T----TTGTAGAGCG--TT--CATA-G----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-TAAT-A-T-----T-T--T---GGCCA--TT-GAC-TAAT-AGAA-C-------C-T-G----TACC-T----A--CATGTATTCTT
gi|78426 : ATATA-C-----GAATCA-T-GGA-AT-T-GGCGTC-GTA-TGGCA-T--GGCAG--C-T-G-TT-ATG-TT----T---T-C-GG-A---A-AG-GAA-AA---ATTTTAC-GC-A-T--GAAC--TT-TG-TG-----G-AT-ACTTT----T--T---C-ATC--T-G-AA-ATGG--C---A-TT-T-TTTG---CT-A-ATT-TT-T-T-G--C--A-AC-T-TTA-A--GAC--TT--C-GGT-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-C-TC-A---TG---TTTA-----C-TG-ATAATGCAA----C-----T--GA-G--TG-G-A--TAGATTAAATAAATAATAA----------GAGAATT-T-GAAC--T-A---A--T--T--A---GTCCTGT-C-A-TCCAT-TGAC----CTAGGAA-GATTCAAG-----GT-T----T----GA--G--AT--C-TA-A----GCTT--A-ACTA-A-TCC-AT-CAAT-A-T-----T-TCCT--GGGCCAG-CT-GACAT-AT-AG-A-A-------C-T-G----TACC-T----
gi|78427 : ACATT-T-T--TGAAT-AGT-G-A-TT-A-TGC-TTAG-A-CA--A-T--G-C-A------G----ATG-TT----TAATT-C-TGTA---A-AG-GGA-TA---C-------AC-A-T--GAA---TGATG-TG-----G-AT-C--TT----T--TT--C-ATTTGA-A-AA-AAGG--CT--A-TT-TATT-G---C--ATATT-TT-TATAG--C-CA-CCAT-TCA-A--G-T--CT--C-G-TTC-A-TTAT-----GACAAAAC-AA-A-TA-A---CAAAATTTATATATC-TG-ATCG---AA----C-----T--GA----TG-T-A--T---T-------------G----------GA----T-T-G--C--T-A---A----ATG-A---TTTC--T-T-A-T---T-TAA-----T--GCAG-T------G-----GT-T----T----GA--A--GT--C-CAGA----G--T--G-A--ATA-T-C-A---AAT-A-T-----T-T--T--GG-TCAG-TT-GAC-T-AT-AGAG-A---------T-G----T
gi|78428 : ATA-CCT--TGAAT-A-T-G-ACAT-T-TGC-TT-G-A-CG-CA-T----C-G--C---G-T--AT--TC----T---T-CGTC-A---A-TG-GAA-AC---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-GG--A-----G-AT-A--TT----T--TT--C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--G---C--A-ATT-TTAT-TAG--C-CA-AC-T-GCA-A--GCA--TT--T-G---C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TCCA---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----TGACTAT--AA-G--CG-G-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTGC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-CT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TGCC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78429 : -C-T--TAAGT---T-G-A-AT-A-TGC-TC-A-A--G-AA-A--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---G-C-T--A---A-AG-GAA-A----C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG--------A-AT-A--TT----T--T---T-GTT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-A-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-ATAATATGACA---C-AA-A-TC-A---T----TCTG-----C-TG-AATA---AA----C-----T--GA-GGCCG-G-C--T---TG----------TT-------------------T-G--C--T-A---G--T-CT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----CA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-C--A-A-A-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-AT-GAC-T-TT-TACC-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78430 : -T--TGAAT---T-A-AGAT-CATGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--G-A-TTATAGT---T-C-TG-ACATA-AG-GAA-AA---C-----C-A----T--GAA---TT-TGGTG-----G-ATTA--TT----T--T---CTATTA-G-A-AT-ATAG--C---A-TT-T-TT-G---C--C-ATG-TT-T---G--C-CA-AC-T-TTA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTC-------------------A----C-----T--GA-G--TG-G-A--TG--TT----------TTG----------AG----TAT-GC-C--T-A---A--TCATGCA---TTCA----T-A-T---T-TGAC----TG-GCAAGG------G-----GT-T----T----GA--G--TCG-C-GA-A----G--TTCG-A--A-A-T-CAAT-CAATAA-TATTTAT-T--T--GGGCCAG-CT-GACTT-AT-AGGA-ACAT----C-T-G----TACC-T----A--G-----TTCTTT
gi|78431 : G-CA-T--G-C-A--C-T-G-T--ATG-AT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---A-----C-AC-C-T--GAA---TG-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--C---T-ATT--G-A-AA-ATGA--T---A-CT-T-TT-G---C--A-
gi|78432 : AA-AA---C-----T----C-T--GGA---TT-TG-TG-----A-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-A---C--A-GTT-TT-T-TTG--C-AA-AC-T-TCA-A--GCT--TC--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---T-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-GG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A------------------------------------GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G------A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGACAG-TT-GAC-A-TT-AAAA-A-------A-T-GTATATACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78433 : --GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGA--C---A-TT--------------------T-T-T-G--C--A-AT-T---------------------------------------A---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----A-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--
gi|78434 : AA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--G---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CG-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TA-ATCA---AA----T-----T--GG-A--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-G---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--G-----TTCTTT
gi|78435 : ---A-TA-T-TT-G---T--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-A----CC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----T-----T--GA-G--CG-G-A--TG--TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--C-G---C--T-A-----------------A-T------GAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--C--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78436 : T-TG-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GTT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GATG---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-A--
gi|78437 : -T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-C-AG-----GATG---C-AA-A-TT-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C-------------AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--ACAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----G-T--T---GGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTNT
gi|78438 : CA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AT-A-TC-A---T----TTTA-----T-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A--T---T----------------------------------G--C--T-A---------T--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-ACGCGTAGC-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78439 : T-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TCTG-----C-TG-AATA---AA----C-----T--GA-G--CC-G-G--C---TT----------T------------GT----T-T-G--C--T-A---GTCT-AG--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----CA--G--TT--C-
gi|78440 : --T---TG----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-A---G--T-CT--G---TCCT--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-T-T-C-TT-CGAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG----------AT-AGAA-A-------C-T-G----TACT-TTATAA--A-----TTCTTT
gi|78441 : C----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-G-C-AT-AAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGA
blockSeqs : A C AT C A T G T A A G T T A T A TT G C TC A T T TA C ATAG AAT T T T CAT C A T GGG TTTTA T A T GA ATA A GT AGGGA T T CT AAGG TTTT T TG A G T AT TGG T G A T TGC TTA G A A T GC G G G G T CC GA GG T T T G C T AATAT AAA C T T C TAC AAAA TATAT A G TGC GGTT GACTA CC T GC A A AT AGA AAATAAATAA TGGTGGTGGA AGAAT A T AA GC C GAT CT C GC TGT TG A A C CCA G ACGG TA T ATTCAA GCGGT A CTCG TGTA GC TC TA A G TGTG CT TC A CT C G C A A A T ATTTA A CC GG T A A AA A C CGCGTAG T A TATA G TATA AT ATGTA
blockSeqs : . . . . G . G T . . . A . . A A C . A . . . . T . GT . . G . . . . . A . . . . . A . GT . . . . . TTTT . A . . . . T A . . T G TA . . . T C . . A . . A . . . G . G . . T . . . . . T G C . . T A . . T A . T AT G G . A . . C . . . TC . A . T . . . G . A G G . . A TCG . . T G . . . . . . . T . . A . A . A . . . . . T T . . CAT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . . . C . GT . . . . . TTTT . . . . . . T . . . . . AT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . T G G . A . . C . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TCT . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . CCT . . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . GGA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TT . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
finalCons : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
Alignments
lowQualScore : 111111 1111111
lowQualScore : 1 1 22 1 3 1 3 6 1 1 1 3 1 1 6 3 33 1 3 22 1 1 1 33 1 7777 222 1 3 1 222 1 1 1 555 33333 1 1 1 22 555 1 55 33333 1 1 22 3333 444444 1 33 1 1 1 22 555 2 1 1 2 333 3333 1 1 1 6 33 1 1 2 1 1 33 11 11 1 2 1 2 1 1 55555 222 1 1 1 1 333 4444 44444 1 1 333 4444 33333 11 3 33 1 2 44 555 9999999999 5555555555 33333 1 1 55 11 1 222 33 1 44 222 33 1 1 1 333 1 4444 33 2 333333 33333 2 5555 2222 11 44 33 1 1 2222 11 11 1 11 2 1 1 5 1 2 1 44444 1 11 11 1 1 2 33 1 1 0000000 1 1 3333 1 3333 22 44444
lowQualScore : . . .. . . . . . . . . . . . . . .. . . .. . . . .. . .... ... . . . ... . . . ... ..... . . . .. ... . .. ..... . . .. .... ...... . .. . . . .. ... . . . . ... .... . . . . .. . . . . . .. .. .. . . . . . . ..... ... . . . . ... .... ..... . . ... .... ..... .. . .. . . .. ... .......... .......... ..... . . .. .. . ... .. . .. ... .. . . . ... . .... .. . ...... ..... . .... .... .. .. .. . . .... .. .. . .. . . . . . . . ..... . .. .. . . . .. . . ....... . . .... . .... .. .....
lowQualScore : 7 7 33 7 3 7 3 7 7 7 7 3 7 7 4 2 88 6 2 22 6 6 6 88 6 2222 888 6 2 6 888 6 6 5 888 88888 5 5 5 00 444 4 44 77777 5 5 00 1111 666666 5 55 5 5 5 00 444 9 4 4 9 999 6666 4 4 4 9 33 4 4 8 4 3 22 88 88 3 7 3 7 3 3 88888 333 3 3 3 3 555 0000 55555 3 3 555 0000 22222 88 9 11 3 6 77 000 8888888888 8888888888 33333 3 3 88 88 3 333 77 3 55 333 22 3 3 3 777 3 0000 11 6 777777 22222 6 0000 7777 88 44 11 3 3 8888 88 88 3 88 7 3 3 3 3 7 3 77777 3 88 99 4 4 8 11 4 4 0000000 5 5 1111 5 3333 22 00000
consensus : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
Reference ( family-542 ) : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78407 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AC-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGG-CAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--A-----TTCTTT
gi|78408 : ACGTA-C-T--TGAAT-A-T-A-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-CG-A---A-GG-GAA-AA---C-----T-AC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-GT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-AA-AT-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-C-T-AG-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----A-T-G--C--C-A---T--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----G--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAA-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----CACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78409 : ACATAAC-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-T-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AC-A--TT----T------C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--G--G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---TGTGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G----A-A-T-C-AT-CAA--A-TA----T-T--T--GGGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACT-T----A--C-----TTCTTT
gi|78410 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CC-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T---------ACA-----------T-G---T----ATGA-----C-TG-ATCA---AA----C---------A-G--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----CACC-T----A--C-----
gi|78411 : ACATA-C-T--TGAAT-A-TTG-A-AT-T-TTC--C-G-A-CG-CA-TTTG-C-G--C-TTG-T--ATG-TG----T---T-C-TG-A---A-AG-G-A-AA---C-----C-AC-CTT--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--------T--T---C-ATT--GAA-AA-ATGG--C---ATTT-T-TT-G---C--A-ATTGTT-T-T-GGCC-CA-AC-TGTCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-A-------AC---------A-TT-A---------TGA-----C-TG-ATCGT--AA----C---------A-G--CG-GAA--T---TT----------TTGTGGTGGTGGAGG----T-T-G--C--TCC---A--T-AT--ATGTTTCC--TATAA-T---T-TGACACGGT--GCTA-G------GGCGGTGT-T----T----GA--G--CT--C-CA-G----G--T--G-A--A-AGT-C-AT-CAATAA-T-----T-T--T--GGGCCAG-TTAGAT-C-TT-AGAA-A-------C-TAG----T--C-T----A--T-----TTCCT
gi|78412 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-A-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CA-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AAAGAA-AA---C-----C-AT-C-T--AAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-GT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC---TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----T----ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A------TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-G---A--T-AT--A---T--C--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--AT--C-TA-A----G--T--G-A--ACA-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAGTTT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTT
gi|78413 : ACATA-C-T--TG--T-A-T-T-A-ATAT-TGC-TC-G-A-CATCA-TC-G-C-G--C-T-G-T--ATT-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----CTAT-C-T--AAA---TT-T
gi|78414 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA----T-TG-TG-----G-AC-A--TT----TTCT---C-ATT--G-A-AA-ATGG------A-TT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----G-CA---C-AATA-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GT-G--CG-GTA--T---AT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC----T-A-----T-TGAC----T--GC-A-G------G-----AT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT---C-T-AT--GAA-A-------CTT-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78415 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-ATAT-T-TG--TC-G-A-CG-CAAT--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AAA--C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TGGTG-----G-AC-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AA-ATGG--A---A-TT-T-TT-G---C--A-TTT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C--A-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-AT-A---AA----C-----T--GGTG--CG-A-AATT---TT----------TTG----------GA----T-T-GC-C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAT-G------G-----AT-T----T----GA--GT-TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-CAAT-CAAT-A-T-----T-T--T---GGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-AC------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTC
gi|78416 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-ATAT-T-TG--TC-G-A-CG-CAAT--G-C-G--C-T-T-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AAA--C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TGGTG-----G-AC-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AA-ATGG--A---A-TT-T-TT-G---C--A-TTT-TT-T-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GCCA---C--A-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-AT-A---AA----C-----T--GGTG--CG-A-AATT---TT----------TTG----------GA----T-T-GC-C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAT-G------G-----AT-T----T----GA--GT-TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-CAAT-CAAT-A-T-----T-T--T---GGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-AC------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTC
gi|78417 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGT-CT-G-A-CGACA-T--G-C-G--C-T-T-TTAATG-TTGT--T---T-C-TG-A---ACAG-GAA-AA---C-----C-ACAC-T--GAAATATT-GG-TG-----G-AC-A--TT----T--TTTTC-ATT--G-A-AATATGGATT---A-TT-T-TTTG---C--C-ATT-TT-T-TTG--C-TAGAC-T-TCA-A--GCT--CT--TTG-T-C-A-T-ATT----GCCA---G-CA-A-TC-A---T----TTTA-----CATGGATAC---AA----C-----T--GGTA--CGAG-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--CGCT-A---A--T-AT--A---TTCA--C-T-A-T---T-TGACA---T--GCAT-G------G-----ATAT----T----GA--G--TTTAC-CA------G--T--G-A--A-A-T-C-ACATAAT-A-T-----TAT--T--GGGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCATT
gi|78418 : ACATA-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G-T-G--G-T-G-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-CA-----G-AT-A--TT----T--T-----ATT--G-A-AA-ATGT--C---T-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-A-T-G--C-CT-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TA-A---T----TTTG-----C-TG-ATCA---AA----G-----T--GA-G--CA-G-A--T---TT----------TTG----------GC----T-T-G--C--T-A---A--T-CC--A---TTCC--T-T-A-T---T-TCAC----T--GCAA-G------G-----GA-A----T----GA--G--CT--C-CA-A----T--T--G-A--A-A-T-C-AT-CGAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-AA-GAC-T-TC-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78419 : ACATA-C-T--TAAAT-A-T-GGA-AT-T-TGC-TC-G-AACG-CA-T--G-C-G--CAT-G-T--AT--TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----T-TC-C-T--GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TA----T--T---C-ATT--C-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-AT--T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-T--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A----TCC--T-A-A-G---T-TGAT--------CAA-A------G-----GG-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GG--CAG-TT-GAC-T-ATAAGAT-T-------C-T-G----TTCC-T----A--C-----TT
gi|78420 : ACATA-T-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-GA-T--G-C-G--C-T-A-T--ATG-TT----T---T-C-TG-A---A--G-GAA-AG---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--AT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--------------------CA-AC-T-TCA-A--GAT--TT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A----A---T-------A-----C-TG-ATCA---AA----C-----A--GA-G--CG-G-A--T---TT----------TTT----------GA----T-TTG--C--T-A---A--T-AT--A---TTCT--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GG--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-AAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCGG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------
gi|78421 : ATATA-T-T--TGAAT-T-T-G-A-AT-G-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--ATC-TT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG-TG-----G-AA-A--TG----T--C---C-ATT--G-A-AA-ATGA--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATG-TT-A-T-G--C-CA-GC-T-TCA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTG-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--AA-G--CA-T-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-C--C--T-A---C--T-TT--A---TTCC--T-T-T-T---T-TGAT----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--A--CT--A-CA-A----A--T--A-A--A-A-T-C-CT-CGAT-G-T-----T-T--T--GGGCCAG-AT-GGC-A-TT-AGAA-------------------ACC-T----A--G-----TTCTT
gi|78422 : ACATG-C-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-CCG--C-T-G-T--ATG-TT----T---TTC-TG-T---A-GG-CAA-AAGGGC-----C-AC-C-A--AAA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TTAAGGT--G---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---A-TT-T-TT-GG--C--A-ATT-TT-T-TTG--CGCG-AC-T-TCA-AA-GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---CCAA-A-TC-A---T----TT-A-----C-TA-ATCA---AAA---T-----T--GG-A--CG-G-A--T---TT----------T------------GT----T-T-G--A--T-G---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-T-CAAT-CAAT-A-T-----T-T--TGGGGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AG---A-------C-T-G----TA-C-T----A--G-----TTCTTT
gi|78423 : ACATA-T-T--TGAAT-A-T-G-A-AT-T-TTC-TT-G-A-CA-CA-T--G-C-G--C-T-T-A--ATGCTT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---C-----C-TC-C-T--GAAA--TT-TG-TG-----G-AC-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---AATT-T-TT-G---C--C-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCATA--GCT--CT----G-T-CGA-T-AT------CCA---C-AA-A-TC-A---T----TTT-------------------A----C-----T--GA-G--CG-G-AT-T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-ATA-A---TTCCT-T-T-A-T---T-TGAC-------GCGA-G------T-----ATATTCG-T----GA--G--TT----CA-A----C--T--GAA--A-A-T-C-AT-CAAT-ATT-----T-T--T--GGGCCAG-TT-AAC-T-AT-AGAACA-------C-T-G----TACCGT----GATC-----TTCTT
gi|78424 : ACATA-C-TATTGAAT-A-T-G-A-AT-T-TGA-TCTG-A-CGCCA-T--G---GTCC-T-G-T--ACG-TT----T---C-CTTG-A---A-AG-AAGTAA---C-----C-AC-C-TGAGAA---TG-TC-TGAGGGAG-AT-A--CT----TCCT---C-ATT--G-AGAA-ATTA--CT--A-CT-T-TT-ATGCC--A-A---TG-T-T-GC-C-CA-AC-T-TCA-ACCGCTGACT--C-GTT-C-ACC-AG-----GATG---C-AA-ATTC-ATACT----CTTAC----C-TG-ATCC---AA----C-----TCCGA-GA-CT-G-A--T---AT----------T-------------A------T-G--C--G-C---ACTT-AT--C---TCCC--T-T-ACT---C-TGAC----T---CAA--------G-----GT-CCTCGT----GA--GTCTT--C-CA-ATGTGA--T--G-A--A-A-T-T-AT--GAT-A-T-----C-T--
gi|78425 : ACATA-C-T--TGAAT-AAT-G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CG-T--G-C-G--C-T-GTT--ATG-TTC---T---T-C-TG-A---A-AG-G---GA---C-----C-AC-C-T--GAA---TC-TT-TG-----GTAT-A--TT----T--GGA-T-ATT--G-A-AA-ATGG--CTGGG-TTGT-CT-G---CTTA-A-T-TT-T-T-G--C-CA-ACGT-TCA-G--ACT--CTGGC-G-T-TGA-T-TTG----GACA-----AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AAGGTTC-----T--GA-G---G-G-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--C--T-GGATA--T-AT--A---TTCC------A-TG--T-TGAC----T--GCGATG------C-----AT-T----TTGTAGAGCG--TT--CATA-G----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-TAAT-A-T-----T-T--T---GGCCA--TT-GAC-TAAT-AGAA-C-------C-T-G----TACC-T----A--CATGTATTCTT
gi|78426 : ATATA-C-----GAATCA-T-GGA-AT-T-GGCGTC-GTA-TGGCA-T--GGCAG--C-T-G-TT-ATG-TT----T---T-C-GG-A---A-AG-GAA-AA---ATTTTAC-GC-A-T--GAAC--TT-TG-TG-----G-AT-ACTTT----T--T---C-ATC--T-G-AA-ATGG--C---A-TT-T-TTTG---CT-A-ATT-TT-T-T-G--C--A-AC-T-TTA-A--GAC--TT--C-GGT-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-C-TC-A---TG---TTTA-----C-TG-ATAATGCAA----C-----T--GA-G--TG-G-A--TAGATTAAATAAATAATAA----------GAGAATT-T-GAAC--T-A---A--T--T--A---GTCCTGT-C-A-TCCAT-TGAC----CTAGGAA-GATTCAAG-----GT-T----T----GA--G--AT--C-TA-A----GCTT--A-ACTA-A-TCC-AT-CAAT-A-T-----T-TCCT--GGGCCAG-CT-GACAT-AT-AG-A-A-------C-T-G----TACC-T----
gi|78427 : ACATT-T-T--TGAAT-AGT-G-A-TT-A-TGC-TTAG-A-CA--A-T--G-C-A------G----ATG-TT----TAATT-C-TGTA---A-AG-GGA-TA---C-------AC-A-T--GAA---TGATG-TG-----G-AT-C--TT----T--TT--C-ATTTGA-A-AA-AAGG--CT--A-TT-TATT-G---C--ATATT-TT-TATAG--C-CA-CCAT-TCA-A--G-T--CT--C-G-TTC-A-TTAT-----GACAAAAC-AA-A-TA-A---CAAAATTTATATATC-TG-ATCG---AA----C-----T--GA----TG-T-A--T---T-------------G----------GA----T-T-G--C--T-A---A----ATG-A---TTTC--T-T-A-T---T-TAA-----T--GCAG-T------G-----GT-T----T----GA--A--GT--C-CAGA----G--T--G-A--ATA-T-C-A---AAT-A-T-----T-T--T--GG-TCAG-TT-GAC-T-AT-AGAG-A---------T-G----T
gi|78428 : ATA-CCT--TGAAT-A-T-G-ACAT-T-TGC-TT-G-A-CG-CA-T----C-G--C---G-T--AT--TC----T---T-CGTC-A---A-TG-GAA-AC---C-----C-AC-C-T--GAA---TT-GG--A-----G-AT-A--TT----T--TT--C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--G---C--A-ATT-TTAT-TAG--C-CA-AC-T-GCA-A--GCA--TT--T-G---C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TCCA---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----TGACTAT--AA-G--CG-G-A--T---TTG---------TTG----------GA----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTGC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-CT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TGCC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78429 : -C-T--TAAGT---T-G-A-AT-A-TGC-TC-A-A--G-AA-A--G-C-G--C-T-G-T--ATG-TT----T---G-C-T--A---A-AG-GAA-A----C-----C-AC-C-T--GAA---TT-TG--------A-AT-A--TT----T--T---T-GTT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-A-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-ATAATATGACA---C-AA-A-TC-A---T----TCTG-----C-TG-AATA---AA----C-----T--GA-GGCCG-G-C--T---TG----------TT-------------------T-G--C--T-A---G--T-CT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----CA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-C--A-A-A-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-AT-GAC-T-TT-TACC-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78430 : -T--TGAAT---T-A-AGAT-CATGC-TC-G-A-CG-CA-T--G-C-G--C-T-G-T--G-A-TTATAGT---T-C-TG-ACATA-AG-GAA-AA---C-----C-A----T--GAA---TT-TGGTG-----G-ATTA--TT----T--T---CTATTA-G-A-AT-ATAG--C---A-TT-T-TT-G---C--C-ATG-TT-T---G--C-CA-AC-T-TTA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTC-------------------A----C-----T--GA-G--TG-G-A--TG--TT----------TTG----------AG----TAT-GC-C--T-A---A--TCATGCA---TTCA----T-A-T---T-TGAC----TG-GCAAGG------G-----GT-T----T----GA--G--TCG-C-GA-A----G--TTCG-A--A-A-T-CAAT-CAATAA-TATTTAT-T--T--GGGCCAG-CT-GACTT-AT-AGGA-ACAT----C-T-G----TACC-T----A--G-----TTCTTT
gi|78431 : G-CA-T--G-C-A--C-T-G-T--ATG-AT----T---T-C-TG-A---A-AG-GAA-AA---A-----C-AC-C-T--GAA---TG-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--C---T-ATT--G-A-AA-ATGA--T---A-CT-T-TT-G---C--A-
gi|78432 : AA-AA---C-----T----C-T--GGA---TT-TG-TG-----A-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-A---C--A-GTT-TT-T-TTG--C-AA-AC-T-TCA-A--GCT--TC--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---T-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-GG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-A---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A------------------------------------GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G------A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGACAG-TT-GAC-A-TT-AAAA-A-------A-T-GTATATACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78433 : --GAA---TT-TG-AG-----G-AT-A--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGA--C---A-TT--------------------T-T-T-G--C--A-AT-T---------------------------------------A---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----A-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-G-A--
gi|78434 : AA---TT-TG-TG-----G-AT-A--TT----T--G---C-ATT--G-A-AA--TGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-ATT-TT-T-T-G--C-CG-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TA-ATCA---AA----T-----T--GG-A--CG-G-A--T---TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-G---A--T-AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--G-----TTCTTT
gi|78435 : ---A-TA-T-TT-G---T--A-ATT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-A----CC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----T-----T--GA-G--CG-G-A--TG--TT----------TTG----------GT----T-T-G--C--C-G---C--T-A-----------------A-T------GAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--C--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-TT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78436 : T-TG-T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GTT--CT--C-G-T-C-A-T-AT-----GATG---C-AA-A-TC-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-A--
gi|78437 : -T-T-G--C-CA-AC-T-TCA-A--GCT--CT--C-G-T-C-A-C-AG-----GATG---C-AA-A-TT-A---T----TTTA-----C-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CG-A-A--T---TT----------TTG----------GA----T-T-G--C-------------AT--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--ACAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----G-T--T---GGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-A-------C-T-G----TACC-T----A--C-----TTNT
gi|78438 : CA-A--GCT--CT--T-G-T-C-A-T-AT-----GACA---C-AT-A-TC-A---T----TTTA-----T-TG-ATCA---AA----C-----T--GA-G--CA-G-A--T---T----------------------------------G--C--T-A---------T--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----G--T--G-A--A-A-T-C-AT-CAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGAA-ACGCGTAGC-T-G----TACC-T----A--C-----TTCTTT
gi|78439 : T-----GACA---C-AA-A-TC-A---T----TCTG-----C-TG-AATA---AA----C-----T--GA-G--CC-G-G--C---TT----------T------------GT----T-T-G--C--T-A---GTCT-AG--A---TTCC--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----AT-T----T----CA--G--TT--C-
gi|78440 : --T---TG----------TTG----------GT----T-T-G--C--T-A---G--T-CT--G---TCCT--T-T-A-T---T-TGAC----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--CT--C-CA-A----G--T--G-A--A-T-T-C-TT-CGAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG----------AT-AGAA-A-------C-T-G----TACT-TTATAA--A-----TTCTTT
gi|78441 : C----T--GCAA-G------G-----GT-T----T----GA--G--TT--C-CA-A----A--T--G-A--A-A-G-C-AT-AAAT-A-T-----T-T--T--GGGCCAG-TT-GAC-T-AT-AGA