lowQualScore                  :        1    33333   111                                                                                        111                                                                                          33333333333333333333333333333333333                                                                                                                            11111      2222                                                                                           33333                                                              1111111111111                              1111                                             11111111                                                                                                                            11111111                                                         1                                                        11111                                       2                                                              111111111111111                                                                       
lowQualScore                  :        4    88888   222 22   3333  3333 333    22  22 1  33 444    9999999999 44  222       1 1  44    1 1 1 1 222 22     44   666666    22 222  1  1    1 3 222 222 3    1 444  5555   3 22  77777  44  5  66666666666666666666666666666666666  1 1   1 22  9999999999999 1  66 1  555   3 444  222 1  1  555 1  1  44 1 666666          3  3    666    3333 1 1     1    44444  1   3333 22 1   1 1 3 5555555   1 3  8888888888   1 44  9999999      1  44444 1 1  7777777     22  66666 1  22    1 22 1  3  7777   1 8888888   5 666 22   88  333    2222222222222   333 1 3 555555  88   555 2 7777 22 2  2   8888888 2  4  2 333     2 2    4  00000000    55   2 333    4  4     2      444    2  33    8888888     33   55  5 2 77777 7777  2      444 2     5 5  2 2   2 66  2  66666666    2     5 2     33    2      5     2 2    2     2   2  4 2 2  777 2   66 77 2 2 2  2  2 2  2     5 33     2     99999  2       2  2    2  3 3   44   44 44  1 3  2   3  3     9999     3          33    33 777777777       000000000000000            55 5 666  2  5555555  5  5   2 2   777     777777          
lowQualScore                  :        .    .....   ... ..   ....  .... ...    ..  .. .  .. ...    .......... ..  ...       . .  ..    . . . . ... ..     ..   ......    .. ...  .  .    . . ... ... .    . ...  ....   . ..  .....  ..  .  ...................................  . .   . ..  ............. .  .. .  ...   . ...  ... .  .  ... .  .  .. . ......          .  .    ...    .... . .     .    .....  .   .... .. .   . . . .......   . .  ..........   . ..  .......      .  ..... . .  .......     ..  ..... .  ..    . .. .  .  ....   . .......   . ... ..   ..  ...    .............   ... . . ......  ..   ... . .... .. .  .   ....... .  .  . ...     . .    .  ........    ..   . ...    .  .     .      ...    .  ..    .......     ..   ..  . . ..... ....  .      ... .     . .  . .   . ..  .  ........    .     . .     ..    .      .     . .    .     .   .  . . .  ... .   .. .. . . .  .  . .  .     . ..     .     .....  .       .  .    .  . .   ..   .. ..  . .  .   .  .     ....     .          ..    .. .........       ...............            .. . ...  .  .......  .  .   . .   ...     ......          
lowQualScore                  :        1    99999   555 88   9999  9999 222    55  55 8  00 888    0000000000 00  999       7 7  00    7 7 7 7 111 33     66   555555    33 999  7  7    7 3 999 999 3    7 888  2222   3 33  44444  88  2  11111111111111111111111111111111111  8 8   7 33  2222222222222 7  99 7  555   3 666  999 7  7  222 7  7  44 6 222222          2  1    666    3333 5 5     5    33333  5   8888 11 5   5 5 1 0000000   5 2  6666666666   7 00  4444444      7  22222 7 7  1111111     33  55555 7  44    7 44 7  6  7777   8 5555555   8 000 66   33  333    4444444444444   333 9 8 555555  33   222 0 8888 88 0  0   9999999 0  0  3 777     2 2    4  33333333    33   2 999    4  4     2      111    4  22    3333333     22   66  3 9 11111 1111  7      777 7     6 0  5 1   5 77  9  55555555    9     7 9     99    9      7     9 9    9     9   9  3 9 9  999 9   88 44 9 9 9  9  9 9  9     7 99     9     66666  9       9  9    9  1 1   22   22 22  2 1  8   1  1     6666     1          77    44 888888888       666666666666666            99 0 999  5  4444444  0  0   5 5   888     222222          
consensus                     :     TTTTTTTA--TCTTCTA--T--TAT----GT----G---AAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAA-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TAAA--T---GG-AG-ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-C-TT----ATG-C--TG---A-GA--AG-GTG-TAG--AT----------------TTTTTT----AA-T-GTA-T--TT-------------T-AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-TCAA--A--TT-TTT--N-A--A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--CGTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TT--AAA---A-A---CA--T-GA-AAT----T--A-TG-TTAA---AATTT-C-ACTT-CT--------ATTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--TT-G-C-----AG--GAT-CATACC---T-CAAACAA-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCCG-TTTGA-CAG-AT-G-G-GG---T-ACA--CG-T-A-A-TA-AA-A-AT-ACCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AA-CCCC-CT-A-ATT--TTT--T--GCTT-TTTATC-AT-ACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AA-GT----A--GG-TC-CAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
Reference ( gi|94420 )        :     TTTATTTA-ATGTTCTT--T--TAT----GT----G---AAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAA-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TAAA--T---GG-AG-ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-T-TT----ATG-C--TG---A-GA--AG-GT--TAG--AT----------------TTTTTT---TAA-T-GTA-T--TT-------------T-AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-GAAT-GGAAAA----T-C-ACAAG-TCAA--A--TT-TTT--G-A--A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GA-----T-GC--CGTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TT--AAA---A-A---CA--T-GA-AAT----T--A-TG-TTAA---AATTT-C-ACTT-CT--------ATTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--TT-G-C-----AG--GAT-CATACC---T-CAAACAA-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCCG-TTTGA-CAG-AT-G-G-GG---T-ACA--CA-T-A-A-TA-AA-A-AT-ACCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AA-CCCC-CT-A-ATT--TTT--T--GCTT-TTTATC-AT-ACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AA-GT----A--AG-TC-CAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94419                      :     TTTTTTTA--TCTTCTA--T--TAT----GT----G---AAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAA-A-T-A-A---T--TGTAA--AAA------TAAA--T---GG-AG-ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-T-TT----ATG-C--TG---A-GA--AG-GTG-TAT--A-----------------TTTTTT---AAA-T-GCA-T--TT-------------T-AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CA------------TATGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-TCAA--AT-TT-TTT--T-A--A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GA-----C-AC--CGTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GACCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TTA-AAA---A-A---CA--T-GA-AAT----T--A-TG-TTAA---AATTT-C-ACTT-CT--------ATTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCAT-GT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--TT-G-C-----AG--GAT-CATACC---T-CAAAC-A-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCCG-TTTGA-CAG-ATGG-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TA-AA-A-AT-ACCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AA-CCCC-CT-A-ATT--TTT--T--GC-T-ATTATC-AT-ACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AA-GT----A--AG-TC-TAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94421                      :     TTTTTTTA-----TCTT--TGTTAT----GT----G---AAAA--TC--A-TCC-TT--CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAA-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TAAA--T---GG-AG-ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-T-TT----ATG-C--TG---A-GA--AG-GTG-TAG--AT----------------TTTTTT----AA-T-GCA-T--TT---------------AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-TCAA--T--TT-TTTTTG-A----TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--T------T-ACTGCGTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----A-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TT--AAA---A-A---CA--T-GA-AAT----T--A-TG-TTAA---AATTT-C--CTT-CT--------ATTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TAAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--TT-G-C-----AG--GAT-CATACC---T-CAAACAA-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-AGGAC-C-TCTTT--AATG-AATTCTGGATAT-T-GCCG-TTTGA-CGG-ATGG-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TA-AA-A-AT-ACCAA-T--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AA-CCCC-CT-A-ATT--TTT--T--GC-T-TTTATC-AT-ACCCT----AAAAT-TAACAATCTC--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATCAAA-C---AA-GT----A--AG-TC-C-G-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94422                      :     TTTTTTTA--TCTTCTA--T--TAT----GT----G---AA----TC--A-TCC-T---CAAAT---------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAACA-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TAAA--T---GG-AG-ATGCCT-G---T---G-AAA--T-T-TT----ATG-C--TG---A-AA--AG-TG--TAG--AT----------------TTTTTT---TAA-T-GCA-T--TT-------------T-AA--C-AA-AACCT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CACAT-A------TTTTGCGAGTATT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-TCAA--T--TT-TTTT-G-A--A-TAT-TTC-A-------TAT---AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--CGGT-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-TTA------TT--AAA---A-AA--CA--T-GA-AAT----T--A-TG-TTAA---A-TTT-C-ACTT-CT--------ATT---ATC-T---AATT-AG-ACATA--CTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAAATTT-G-C-----AG---AT-CATACC---T-CAAACCA-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCTTAGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCCG-TTTGA-CAG-AT-G-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TA-AA-A-AT-ACCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AA-CCCC-CT-A-ATT--TTT--T--GC-T-TTTA-C-AT-ACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--G--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AA-GT----A--AG-TC-CAG-GAAGT---A-GGA------CCTACCATAA
gi|94425                      :     TTTTTTTA--TTCTCTA--T--TAT----GT----G---AAAA--TGTAA-TCT-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT---GG--CCAA-A-A-A-ACTAT--TGTAA--ATA------TAAA--T---GG-AGAATGC-T-G---T---G-AAAA-TAT-TA----ATGTC--TG---GTGA--AGAGTG-TAG--ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNN-T-ATA-T--TTTTTAAATGCATTTT-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-ATATAA-AA-C---T-A------TTATGCAAGT-TT-G--------AA----T-C-ACAAG-TCAA--T--TT-TTT--T-A--AGCAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--CGTG-G--G-CC-GT----ATC-C-----A-GTTAAT--T--TTT--GT---ACCAGGTGGACCGCGTGCCA---T-T-A------TCA-AAA---A-A---CA--T-GA-AAT----T--A-TGTTTAA---AATGT-C-ACTT-CTAATTAATAATTT--ATT-T---AATT-AG-AC--A-TTTATT---TCAT-AT--ATAA-----G-GGAAA--AAA--TT-G-C-----AG--CATCCATACC---T-CAAAC-A-AA-ATTTG-T-GGA-CA--T--A--TTCT-AGGAC-T-CCTTC--AATT-AATTCT-GATAT-T-TCCG-TTTGA-CAG-ATAG-G-GG---T-ACA--CG-T-A-ATTA-AA-A-AT-ACCAT-A--ATTTA-CTCAT-----CA-TACTGAC-AA-CCCC-CT-A-ATT--TTT--T--GC-G-TTTATC-AT-ACCCT----CAAAT-GAACAATC--------------------TAAACTC--ATTTTT-------TTTTTAGAAATC--A-C---AA-GC----A--GG-TC-CAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94426                      :     TTTTTTTA-----TCTTG-T--TAT----GT----G---AAAG--TT--A-TCT-T---CAAA----------A--TG---GCTAATT-T-GG--C----A-A-A-A---T-----AA--ATG------TAAA--T---GG-AA-TTGC-T-A---T---G-AACA-T-C-GT----AGG-C--TG---T-GA--AA-GTG-CAG--AT----------------TTTCAA----AA-T-GTA-T--TT-------------T-AA--C-AA-G-CGA-T---CA---T-AT-GT---G-AA-CT--T-A------TTATGCGAGT-TT-----------------------------------TT-TTTA-G-A--A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TC-------TTTTT--GAC----T-AC--AGTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----A-GTTTAT--T--TTT--AT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TT--AAA---A-A----A--T-GG-AAT----T--A-TG-GTAA---CATAT-C-ATTT-CT--------ACTT--ATT-T---AATT-AG-ACATA-TTCATT---TCAT-AT--TTGA-----A-GAAAA--AAA---T-G-C-----AG--CAT-CATACC---T-CAAACAA-AA-TTTTA-T-GGA-CA--T--A--TTCT-CGTAC-T-TCTTC--AATG-AATTAT-GATAT-T-GCCG-TTTTA-CAA-ACGG-G-GG---T-ACA--CA-T-A-A-TA-AA-C-AT-ATCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACCGAC-GA-TCCC-CT-A-ATG--TTT--T--GC-T-TTCACC-AT-ACCCT----GAAAT-CAAAGATCTA--AGTG--T--T------TAATTTC--G--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AA-GT----A--GG-TC-CAG-G-GGT---AAGGA------CCTACCTT
gi|94427                      :     TTTATCTG-----TCTA--T--TCT----GT----G---AAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------AAATG---GCTTTTT-T-GG--CCAA-A-C-A--------TG-AA--ATA------TAAA--T---GG-AA-ATGC-TTG---T---G-AAAA-T-A-------AT--C--TG---A--A--AG-GT--AA-----------------------TTTT---TAA-T-G-A-T--T----------------AA--C-AA---CAT-T---CA---T-ATTAT---G-AA-CA--T-A------TTATCGGAGT-T--GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-T-AA--A--TT-TTT----A--A-T-T-T-C-A-------TAT-T-A-----------TGA-T--TT--------GCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTT---GAC----T-GC--C-CG-T--G-CC-TT----ATT-G-----G--TTCAA--T--TTTTTGT---ACCC-------------CCA---T-T-A------TT--AAA---A-AA--CA--T-GA-AAT-------A-TG-TTGA---AATT--C-ACTT-CT--------ATT---ATC-T---A--T-AG-ACA-A-GCTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--T--G-C-----A----AT-CATACC---T-CAAA-AA-AA-AATTA-T-TGA-CA--AA-T--TTCT-AGGA--T-TCTTC--AATGGAATTCT-AAT---T-ACCG-TT-GA-CAG-AT-G-GCGG---T-ACA--CA-T-A-A-TA-AA-A-ATAACCAA-A--ATTTA--TCATA----TA-TACT-AT-AACCCCC-CT-A-A-T--TTT--T--GCTT-TTATTC-AT-ACCCT----AAAAT-GAA-AATCTA--ATTA--T--G------TAAACTC--A--A----------TTTGAGAAATC--A-CA--AA-GT----A--AG--C-CAG----AT---AGGAG------CCTAC
gi|94429                      : ttttTTTTTTTA--TATTCTA--T--TTT----GT----G---AAAA--TT--G-TCT-A---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CAAA-A-A-A-AAAAT--TGTAA--ATA------TAAA--C---GG-AG-ATGC-T-G---T---G-AGAA-T-C-TT----ATG-C--TG---T-GA--AA-GTG-CAG--AT----------------TTTT------AA-TTGTA-T--TT-------------T-AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-CT---G-AA-CA--T-A------T---GCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-ACAA--A--GT-TTTA-G-A--A-TAT-T-C-A-------TAT-C-AG----------TGG-T--TA-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--CGTT-G--G-CC-GT----ATT-G-----A-GTTCAT--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------T-------------------------AT----T--A-TG-CTAA---AACTT-T-GCTT-CT--------AATT--ATT-T---AATT-AG-AC-TA-TTTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--T
gi|94431                      :     TTTTTTTA--TCTTTAT--T--TAT----GT----A---AAAAAATC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAA-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TAAA--T---GG-AG-ATGC-T-----T---G-GAAA-A-T-TT----ATG-C--TG---A-GA--AG-GTG-TAG--AT----------------TTTTT------A-T-GCA-T--TT-------------T-AA--C--A-G-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-G-AT--GAAAA----T-C-ACAAG-TCAT--T--TT-TTT--T-A--A-AATAT-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--CGTG-G--G-CG-AT----ATT-G-----
gi|94433                      :     TTTTTTTATATG--CTA--T--TG-----GT----G---AAAT--TT--G-TC--T---CAAATGCTACCCCGA--GG---GGTATTT-T-GGGGCCAA-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TAAAAAC---GG-AG-ATAC-T-G---T---G-AGAA-T-C-TT----ATG-C--TG---
gi|94436                      :         TTTT-ATGTTCTTGTT--TCT----GT----G---AAAA--TT----TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAA-A-A-A-A---TTCTGTAA--ATA------TATA--T---GG-AG-ATGC-C-G---G---GTAAAA-T-TCTT----ATG-C--TG---A-GA--AGAGTG-TAG--A--------------------TTT---TAA-T-GC--T--TT-------------T-TA--C-AA-T-CAC-TTCACA---T-AT-AT---G-AA-CA--T--------TTATGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-CAACAAG-TCAATCT--TT-TTT--A-A--A-TAT-T-CAA-------TAT-T-AG----------TGA-T--TG-------TGCA-T-GC-----T-A-TA--------TTTT--GAC----T-GC--CGTG-G--G--C-GT----ATT-G-----G-GTTCAAAGT--TTT--GTACAACTA-------------CCACACT-T-A------TT---AA---A-A---CA--T-GA-AATC---T--ATTGTTTTA---AATTT-C-ACTT-CT--------TTTT--ATCTT---AATT-AGAACATA-TC-ATT---TCAT-AC--TTAA-----G-GAAAA--AAAT-TT-GCC-----AG--GAT-CATACC---T-CAAACAATAG-AACTG-T-
gi|94423                      :             -ATCTTCTA--T--TAT----GT----G---AAAA--TC--AATCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAA-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TCAA--T---GG-AG-AT-C-TGG---T---G-GAAA---T-TT----ATG-C--TG---A-GA--AG-GTG-TCG--A-----------------TTTTTT---TAA-T-GCA-T--TT-------------T-AA--CAAA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-TCAAT-T--TT-TTT--T-A--A-TAT-T-C-A-------TAT-TAAA----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-G---CGTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TC--AAA---A-AAACCA--T-GA-AAT----T--A-TG-TTAA---AA-TT-C-ACTT-CT--------ATTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-AAAAA--AAA--TTGG-G-----AG--GAT-CATACC---T-CAAAC-A-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-A-GACGT-TCTTTCAAATG-AATTCT-GATAT-T-G-CG-TTTGA-CAG-AG-G-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TATAA-A-AT-ACCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AA--CCC-CT-A-ATT--TTT--T--GC-T-TTTATC-AT-CACCT----AGAAT-G-ACAATCTA--AGTA--T--
gi|94424                      :          tttttgtTTCTT--C--TAT----GT----ATGTGAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCT-TTT-T-GG--CCAA-A-A-A-AA--T--TGTAATAATA-------AAA--T---AG-AG-ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-T-TT----ATG-C--TG---A-GA--GGTGT--AAG--AT----------------TTTTT-----AA-T-GTA-T--TT-------------T-AAAAC-AA-G-CAT-TT--CA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-A------TT-TGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-TCAA--T--TT-TTT--T-A--A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGAAT--TT-------TGCAGT-GC-----TCG-TC-------TTTTT--GAC----T-GC---GTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTT-AA--T--TTT--GT---ACAA-------------CCA---T-T-A------TT--AAA---A-AA--CA--TTGA-ACT----T--A-TG-TTAA---A-TTT-C-ACTT-CT--------ATTTTAATC-T---AATTCAG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAAA----G-GAAAATAAAA--TA-G-C-----AG--GAT-CATACC---T-CAAAACA-AA-AATTAAT-TGAACA--AGTT--TCCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GC-G-TTTGA-CAG-AT-G-G-GGG--T-ACAA-CA-CCA-A-TA-AA-A--T-AC-AT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGA--AA-CCCC--T-A-ATTATTTT--T--GCTT-TT-----AT-ATCCT----AAAAT-GA-CAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAG-AATC--A-C---AA-GT----A--AG-TCGCAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94435                      :          tttttttTTCTA--T--TAT----GT----G---AAAA--TC--A-TCT-T---CAAA----------A--TG---CCTATTT-T-GG--CCCC-A-A-A-A---A--TGTAA--ATA-------AAA--T---GA-GA-ATGC-T-----T---G-AAAA-T----------------------------G-GC---AA--AT----------------TTTCAA----AA-T-GTA-T--TT-------------T-AA--C-AAAG-CATAC---CA---T-AT-A------AA-CA--T-ACATGTATTATGAAAGT-TTTGAAT-TAAAAA----TTC-ACAAG-TCGA--ATTTT-TTT--A-AATA-TAT-T-T-A-------TAT-TAAG----------TGG-TGCCT-------GGCAGT-GC-----T-G-TACATGTATTTTCT--CAC----T-GC--CGAG-G--G-CCAGT----CTT-G-----------------------GT---ACCA-------------TCA---T-T-ATTTTTTTT------------------T-TA-AAT----T--G-TT-TT------GTTT-C-ACTT-CTA-------ATTA--ATT-T---AATT-A--ACA-A-TTCA-T---TCAT-AT--TTGAGAAGGG-GGAAA--AAA--TT-
gi|94434                      :        tttgttatccTCTT--T--TATTATTGT----G---AAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAC-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TAAA--T---GG-AG-ATGC-T-G---T---G-AAAATT-T-TT----ATG-C--T------AA--AA-GT--TAG--A-----------------TCTTTT---TAA-T-GCA-T--TT-------------T-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-C---T-A------TT-TGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-TCAA--AT-TT-TTT--T-A--A-TA--T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--CATG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---A-AA-------------CCA---T-T-A------TTA-AAA---A-A---CA--T-GATAAT----T--A-TG-TTAA---AATTT-C-ACTT-CT--------ATTT--ATT-T---AATTAAG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAA-------GAAAA--AAA--TT-G-C-----A---GAT-CATACC---T-CAAACAA-AA-AA-TA-T-TGA-CA--A------TCT-AGGAC-T---TTC--AATG-AA-TCT-GATA--T-GCCG-TTTGA-CAG-ATGG-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TA-AA-A-A--ACCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AA-CCCC-CT-A-ATT--TTT--T--GC---TTTATC-AT-ACCCT----AAAAT-GAA-AATCTA-----A--T--T------TAAACTC--G--GAT-------TTTTGAGAAATC--A-C---GA-AT----A--AG-TC-CAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94428                      :           ttttttaTCTA--T--TAT----GTTGAAA---AAAA--T---A-TTC-TGTTCAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CCAA-A-A-ATA---T--TGTAA--ATAA-----TAAA--T---GG-AT-ACGC-T-AGTAT---G-AAAA-T-T-TTCTCAATG-C--TGTTAA-AA--AG-GTGTTAG--GA----------------TTTTTT---AAAGT-GTA-T--TT-------------T-AAAAC-AA-GACAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-AAATT-AA-----TTATGCAAGT-TTTGAA--GAAAAA----T-C-ACAAGATCAAT-A--TTGTTT--T-A--A-TAA-T-C-A-------TAT-T-AGCTACGTATAGTGG-T--TTC------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GACT---T-GC--CGTGAG--G-CC-AT----ATCCG-----GCGTTCAT--TCATTT--GT---ACCAG------------CCA---T-T-A------TTTTAAA---ATA---AA--T-GA-AAT----T--A-TG-TTCACCCAATTTTC-ACTTATT--------ACTT--ATT-T---AATT-AGTAGATA-TTTAAT---TCAT-ATATTCAA-----G-AAAAA--AAA--AT-G-CTCGTTAGCAGAT-CATACC---T-CAAACAA-A-----TA-T-GGA-CA--T--A--TCCT-AGGACAT-CCTTT--AATG-AATTCTTGATAT-T-GCTG-TTTGA-CAG-AT-GAG-GG---T-ACAAACG-T-A-A-TA-AA-A-AT-ACCATTA--ATTTA-CTCGTGGTTGTA-TACTGAC-AA-TCCC-CTTA-ATT--TTT--T--GCTT-TT-ATC-AT-ACCCTCATGAAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTCTTT--TTT-------TTTTTAGAAATC--A-CATAAG-GT----A--GGATC-CAG-G-AGT---AGGGA-------CTACCTTAA
gi|94432                      :      tttttttataccTCTA--T--TAT----GT----G---AAAA--TC--A-TCT-T---CAAA----------A--TG---CCTATTT-T-GG--CCAA-A-A-A-A---T--GGTAAGTATA------TAAA--T---GG--G-ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-A-TT----ATG-CTATG---A-AA--AA-G---CAA--A-----------------TTTTTA---AAA-T-GTA-T--TT-------------T-AA--C-AA-G-CAT-C---CA---T-AT-AT---G-AA-CA--A-A------TTATGAAAGT-TT-GAAT--GAAAA----T------------------TT-TTT--A-A--A-TAT-T-T-A-------TAT-
gi|94438                      :        ttttgttatcaCTC--T--TAT-----T----G---AAAA--TC--A-TC--T---CAAA----------A--T------T-CTT-T-GG--CCAA-A-ACA-A---T--GGTAA--ATA------TAAA--T---A-----ATGC-T-A---T---T-GAAA-T-C-TT----ATGAC--TT---A-GA--AT-GC---AA--AT----------------TTTAA-----AA-T-GTAAT--TT-------------T-AA--C-AA-G-CAT-C---TA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-A------TTATGAAAGT-TT-GAAT-GAAAAT----T-C-ACAAA-TC-G--A--TT-TTT----A--A-TAT-T-T-A-------TAT-T-AG----------TTG-T--GT-------TGCAGT-GCGTTCAT-G-TA-------TTTTTCCAC-----T-GT--CG-A-G--G-CC---------T-G------------------TTT--GT---ACCA-------------TCA---T-T-A------TT--GAA---A-A----------A-AAT----T--G-TG-TT------GTTT-C-A-TT-CT--------AATT--ATT-T---AATT-AA-ACATA-TTCAAT---TCA--AT--TTGA-----GAGTAAA--AAA--TT-G-C-----A---CCT-CATACC---T--AAACAA-TA-ATTTA-TGTCA-CA--------TTCT-AGGGA-T-TCTTC--AGTG-AATTC--GATATAT-GCT-------------T-G-G-TT---T-ACA--CATT-A-A-TA-AACA-AT-ACCAT-A--A--TA-CTCATA----TATTACTGAC----CCCC-C
gi|94439                      :                 attta--T--TAT----GT----G---AAA---TT--A-TCTAT---CAAA----------A--TG---GCTATTT-TTGG--CCAA-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TAAG--TATGGG-AG-ACGC-T-G---T---GAAAAA-T-C-TC----ATG-C--TG---T-AA--AG-GTG-TAGA-AT----------------TTTATT---AAA-T-GTA-T--TT-------------T-AAACT-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT---GAAA-AA--T-A------ATATGCAAGTATT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAA--TCAAT-A--TA-GTT----A--A-TAA-T-C-ATTTTGGCTATAT-AG----------TGG-T--TTTG-----TGCAGT-GC-----T-GTTAT------TTTTT--GAGCGCGTAGC--AGTG-GTTGCCC-AT----ATC-------G-GTTCAATTT--TTT--GT---ACCA-------------CCA---TAT-A------TC--AAATATA-A----A--T-GA-AAT----T--A-TG-TTCA---AATTT-CAACTT-TT--------AATT--ATT-TGGGAATT-AG-AGATATTTTATT---TCATAAT--TTCA-----GAAAAAA--AAA--AT-G-C-----AG--CAG-CATACTGCGTGCAAACCA-AA-ATTTA-TATGG--A--A--TTATCCT-AGGAC-TACCTTT--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCTGTTTTGACCAGAAT-G-A-GGAGATAACA--CG-T-A-A-TA-AA-ATAT-ACCAT-AAGATTTA-CTCGTTA---TA-TACTG---AA-TCCC-CT-ACATT--TTT--TTGGCTTATTCTTCAAT-ACCCTC---ACAATGGAACAATCTATGAGTA--TACTCGCAAATAAACTC--A--TTTTGTTTAATTTTAAGAAATC--ACC---AA-GTGTAGA--AA-TCATAG-G-AGTTTCAGGGAGAGGATCCTACCTTAA
gi|94440                      :                       ta--TAT----GT----A---AAAA--TT--A-TCT-T---AAAA----------A--TG---GCTATTT-T-AG--CCAA-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA------TAAA--T---GT-GA-ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-C-TT----ATG-C--TG---T-GATCAT-G---CAG--A-----------------TTTTTA---GAA-T-GTA-T--TT-------------T-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-G------TTATGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACGTG-TCAA--A--TA-TTT--ACA--A-TAT-T-C-A-------TAT-C-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--TGTG-G--G-CC-GTTTTGATC-G-----A-GTT-AA--T--TTTA-GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TT--AAA---
gi|94437                      :                         --TAA----GT----A---AAAA--TT--A-TCT-T---AAAA----------A--AG---GCTATTT----G--CCAA-A-A-A-A---T--TGTAA--ATA-------AAA--T---GA-A--ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-C-TT----ATG-C--TG---T-GATCAG-TG--CAG--AT----------------TTAG------AG-A-GTA-T--TT-------------T-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-G------TTATGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACGTG-TCAA--A--TA-TTA--C-A--A-TAT-T-C-A-------TAT-C-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--TGTG-G--G-CC-GTTTTGATC-G-----A-GTT-AA--T--TTTA-GT---A-CA--------------CA---T-T-A------TT--AAA---A-A---GA--A-GA-AGA----TAGA-TG-TTA
gi|94430                      :                  tatattacatgT----GT----G---AAAA--TC--A-TCC-T----AAA----------A--TGAGGGTTAATT-T-GG--CCAG-A-A-A-AGAAT--T-TAA--A-A-------AAA--T---GGCAG-ATGT-T-G---TTGTG-AAAA-T-T-TTT---ATG-C--TG---A-GA--AG-GT--TTGGTAT----------------ATTTTTACGTAA-T-GTA-TCCTT-------------TGAA--C-AA-G-CAT-T---CA---TGAT-AT---G-AAACA--TGA------ATATGCGAGT-TT-GAATTGGAAAAAATCC-C-ACAAG-TTAA--T--TT-TTT--T-A----TAT-T-CCA-------TAT-T-AGA---------TGA-T--TT-------TGCAGTTGC-----T-G-TA-------TTTTT--TAC----T-GC--CGTG-G--G-CC-GT----A---G-----G-GTTTAA--T--GT---GT---ACCA-------------CCA---T-TCA------TT--AAA---A-AA--CA--T-GA-AAT----TTAA-TG-TTGA---AATTT-C-ACTTTCT--------ATTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCA--AT--TAAG-----G-AAAAA--AAA--TTGG-C-----AG--GAT-CATACC---T-CAAATAACAACAATTA-
gi|94441                      :          tttttgtattttcgatatat----GT----A---AAAA--TT--A-TCT-T---AAAA----------AA-TG---GCTATTTGT-AG--CCAA-A-A-A-AA--T--TGTAA--ATA------TAAA--T---GT-GA-ATGC-T-G---T---G-AAA--T-C-TT----ATG-C--TG---T-CA--TG-ATG-CAG--AT----------------TTTTAG----AA-T-GTA-T--TT-------------T-AA--C-AA-A-CATCT---CA---T-AT-A----G-AA-CA--T-G------TTATGCGAGT-TT-GAAT-GAAAAA----T-C-ACGTG-TCAA--A--TA-TTT--A-C--A-AAT-T-C-A-------TAT-C-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--TGTG-G--G-CC-GT----TTT-GATCGAG-GTT-AA--T--TTTA-GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TT--AAC---A-A---GA--A-GA-AGTAAAGA--A-TG-TTAA---
gi|94442                      :                                                         CT-T---CAAA----------A--TG---CCTATTT-T-GG--CCAA-A-A-A-A---T---GTTA--ACA------TAAA--T---GG-AG-ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-C-CT----ATG-C--TG---C-GA--AA-GTG-CAG--AT----------------TT---------------------T-------------T-AA----------------------------------AA-TG--T-A------TTATGCAAGT-TT-GATT-GAAAAA----T-C-ACAAG-TCGA--A--TT-TTT--ATA--A-TAT-T-T-A-------AAT-T-AG----------TGG-TG-TTGCAGTCATGCAGT-GC-----T-G-CA-------TTTTT--GAC----T-GC--CAAA-G--G-CCTGT----A---G-----GAGTTCAT--A--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TC--A--------------------------------------A---AATTT-C-ACTT-CT--------AATT--ATC-A---TATT-A--ACATA-T
gi|94443                      :                                                                    ----------A--TG---GCTGTTT-T-AGT-CCAA-ACA-A-A---T--CGTAA--ATACATGTATAAA--T---GG-AA-ATGC-T-G---T---G-AAAA-T-C-TT----ATG-C--TG---T-GA--AG-GT--
gi|94444                      :                                                                                                                                                                                                                                                       A-T--TC-------------A-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-AT---G-AA-CA--T-A------T---GCGAGT-TT-GAAT-AAAAAA----T-C-ACAAG-TCAA--A--GT-TTT--GCA--A-TAT-T-C-A-------TAT-T-CG----------TGG-T--TT-------TGAATT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GAC----T-GC--CATC-G--G-TC-GT----ATT-G-----A-GTAAAT--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-A------TT--AAAC--A-A---GAAGT-AA-AA--------A-TG-TTAA---ACTGT-T-AATA-C---------ATTTC-ATC------ACT-AT-CCGTG-T-TATTGTATCAT-AA--TTAA-----C-CAAAA--AAA--
gi|94445                      :                                                                                                                                                                                                                                                       A-T--TT-------------T-AA--C-AAAG-CAT-T---TAAATT-AT-ATCT-G-AA-CA--T-A--------ATGCGAGT-TT-GAAT-T-AAAA----T-C-ACATG-ACAA--AG-TT-TTTA-G-A--A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TG
gi|94446                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--T-A------TCATGCGAGT-TT-GAAT-AAAAAA----T-C-ACAAA-TCAA--A--TT-TTT--ACA--A-TAT-T-C-A-------TA-----------------------TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA--------CTTT--GAC----T-GC--CGTG-G--G-C
gi|94447                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-GAAT-GAAAAA----T-C-ACAAG-TCAA--A--TT-TTT--A-A--A-TAT-T-C-A-------TTT-T-AG----------TGA-T--TT-------TCCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT--GA-----
gi|94448                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AT-AATACC---T-GAAACAA-AA-T-TTA-T-GGA-CCGCA--T--CT-T-AAGAT-T-TCTTC--AGTG-AATTCT-GATAT-TGGCCG-TT-------------G-GG---T-ACA--CG-T-A-A-TA-AT-T-AA-ACCATAA--ATTTAGCTCAT-----TA-TACTGCC-TC-CCCC-TT-A-A-----TT--T--G-TT-TTTATC--------------------AACAATCCA--AGTA-----T------TAAACTCA-A--AAT-------TGTTGAGAAATCA-A-C---AA-CT----G--GGTTC-CAG-G-AAT---AGGAC------CCT-CCTTAAc
gi|94449                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-AA-AAT-A-T--GA-CC--A--T--TTCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCTG--TTGA-CAG-AT-G-G-CG---T-ACA--CA-T-ACA-T---A-A-AT-ACCAT-A--ATTTA-CTCTTA----TA-TACATACAAA-CCCCGCT-G-ATT--TTTTCT--GC-T-TTTATC-ATCACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTATGT--T------TAAACTC--A--A-T-------TTTTGAGAAATC--AGC---CA-G-----A--AG--C-CAGCG-AGTAA-AGGGA-------CTACCTTAA
gi|94450                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCA--AGTA--TC-T------TAAACTC--A--AAA-------TTTTGAGAA-TC--A-C---AA-G-----ACTGG-TC-AAG-G-AAT---TAGTA------CCTACCTTAA
gi|94451                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A--AATG--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-T---AA-GT----A--GA-TC-CAG-G-AGT---AGAAA------CCTACCTTAA
gi|94452                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TA--T--T------TAAACTC--A--A-T-------TTTTGAGAAAT-----C---AA-GT-------AG-TC-CAG-G-AGT---A-GGA------CCTA-CTTAA
gi|94453                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --A--ATA-------TTTTGAGAAATC--A-C---AAGGT----T--GG-TC-CAG-G-AAT---GGGAC------CCTACCTTAA

lowQualScore                  :                                                                                                                       1111111111111                                                                                                              22222                                                                                                                1111       111                                                                                                                                                              1111111111111                        22222222222                                                                                                                                                                                11111111                                                         1                                                        11111                                       1                                                                                                                                                   
lowQualScore                  :         2 222 2    22 5 1  3  3333     22  22 1  22 444    8888888888 33  222       1 1  33  8888888888888  1 444 1 1 0000000000000   22  44   666666    22 222 5555555 1   1   444 55 222 222 1     3  6666   1   4444  22  1  222  22  1     1 11111  1 1   1 22   1  66 1  444   3 444  222 1  1  22 444  1  44 1 666666          3  3    22      222 1 1     1    4444 1 1   555 222 1   1 1 3 4444444   1 3  8888888888   1 33  9999999      1  44444 1 1  6666666     1 1   1  444444   1 22 1  3  7777   1 7777777   5 555 22   88  333    1111111111111   333 1 3   66   555 1 00000000000 1  1   8888888 1  1  22 333     2 2    4  2 77777777   55   2 333    4  4     2      333    2  33    77777 4     33   55  5 2 66666  555   2     444 2     1 4  2 2   2 55  2  44444444    2     5 2     33    2      5     2 2    2     2   2  3 2 2  777 2   66 77 2 2 2  2  2 2   2    5 33     2     88888  2       2      2 2 2 2   33   33 33  9 2  2   2  2     8888     2          33    33 55 777777       777777777777777            55 4 666   55 5555 0 4  4   2 2   777     666666          
lowQualScore                  :         . ... .    .. . .  .  ....     ..  .. .  .. ...    .......... ..  ...       . .  ..  .............  . ... . . .............   ..  ..   ......    .. ... ....... .   .   ... .. ... ... .     .  ....   .   ....  ..  .  ...  ..  .     . .....  . .   . ..   .  .. .  ...   . ...  ... .  .  .. ...  .  .. . ......          .  .    ..      ... . .     .    .... . .   ... ... .   . . . .......   . .  ..........   . ..  .......      .  ..... . .  .......     . .   .  ......   . .. .  .  ....   . .......   . ... ..   ..  ...    .............   ... . .   ..   ... . ........... .  .   ....... .  .  .. ...     . .    .  . ........   ..   . ...    .  .     .      ...    .  ..    ..... .     ..   ..  . . .....  ...   .     ... .     . .  . .   . ..  .  ........    .     . .     ..    .      .     . .    .     .   .  . . .  ... .   .. .. . . .  .  . .   .    . ..     .     .....  .       .      . . . .   ..   .. ..  . .  .   .  .     ....     .          ..    .. .. ......       ...............            .. . ...   .. .... . .  .   . .   ...     ......          
lowQualScore                  :         0 777 0    66 5 8  5  7777     44  44 7  55 666    6666666666 88  888       6 6  88  8888888888888  6 444 6 6 4444444444444   22  44   222222    22 888 2222222 6   6   444 44 888 888 6     6  6666   6   9999  33  7  999  44  7     7 66666  7 7   6 22   6  66 6  999   2 444  888 6  6  22 444  6  22 5 000000          1  0    00      666 5 5     5    7777 5 5   777 666 5   5 5 0 8888888   5 1  3333333333   6 88  0000000      6  00000 6 6  8888888     6 6   7  111111   7 33 7  5  4444   7 6666666   1 333 55   00  222    8888888888888   222 8 6   11   000 9 88888888888 9  9   0000000 9  9  55 555     1 1    2  1 66666666   00   1 777    2  2     1      999    2  11    88888 4     11   33  0 7 77777  333   5     444 5     6 7  4 8   4 77  7  22222222    7     3 7     77    7      3     7 7    7     7   7  3 7 7  333 7   33 44 7 7 7  7  7 7   7    3 77     7     33333  7       7      7 7 9 9   99   99 99  0 9  0   9  9     9999     9          44    22 66 222222       888888888888888            66 7 555   66 0000 5 7  7   4 4   444     888888          
consensus                     : TTTTTTTA-T-C-T-TCTA--T-T-AT-GT----GAAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAA--T---G-------G-AGA-TGC---T--G---T---G-AAAATCTT----ATG-CTG---AGA--AG-GT---GT--AG-ATTTT-T--TN-AA-T-GTA-T--TTT-AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--A-T-T-TTT-N-A---A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----C-GTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-ATT--AAA---A-A---CA------T-GA-AAT----T--A-TG-TT-AA---AATTT-C-ACTT-CT-A--------TTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--TT-G-C-----AG--GATC-ATACC---T-CAAACAA-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCCG-TTTGA-CAG-AT-G-G-GG---T-ACA--CG-T-A-A-TA-AA-A-ATA-CCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AACCCC-C-T-A-ATT--TTT--T--GCTT-TTTATC-AT-ACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AAG--T----AGG-TC-CAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
Reference ( family-540 )      : TTTTTTTA-T-C-T-TCTA--T-T-AT-GT----GAAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAA--T---G-------G-AGA-TGC---T--G---T---G-AAAATCTT----ATG-CTG---AGA--AG-GT---GT--AG-ATTTT-T--TT-AA-T-GTA-T--TTT-AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--A-T-T-TTT-N-A---A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----C-GTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-ATT--AAA---A-A---CA------T-GA-AAT----T--A-TG-TT-AA---AATTT-C-ACTT-CT-A--------TTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--TT-G-C-----AG--GATC-ATACC---T-CAAACAA-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCCG-TTTGA-CAG-AT-G-G-GG---T-ACA--CG-T-A-A-TA-AA-A-ATA-CCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AACCCC-C-T-A-ATT--TTT--T--GCTT-TTTATC-AT-ACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AAG--T----AGG-TC-CAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94419                      : TTTTTTTA-T-C-T-TCTA--T-T-AT-GT----GAAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---T-A-A---T---------TGT--AA--AAA------TAAA--T---G-------G-AGA-TGC---T--G---T---G-AAAATTTT----ATG-CTG---AGA--AG-GT---GT--AT-ATTTT-T--TA-AA-T-GCA-T--TTT-AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA------------TATGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--ATT-T-TTT-T-A---A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-AC--AC----C-GTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GACCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-ATTA-AAA---A-A---CA------T-GA-AAT----T--A-TG-TT-AA---AATTT-C-ACTT-CT-A--------TTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCAT-GT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--TT-G-C-----AG--GATC-ATACC---T-CAAAC-A-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCCG-TTTGA-CAG-ATGG-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TA-AA-A-ATA-CCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AACCCC-C-T-A-ATT--TTT--T--GC-T-ATTATC-AT-ACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AAG--T----AAG-TC-TAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94420                      : TTTATTTAAT-G-T-TCTT--T-T-AT-GT----GAAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAA--T---G-------G-AGA-TGC---T--G---T---G-AAAATTTT----ATG-CTG---AGA--AG-GT----T--AG-ATTTT-T--TTTAA-T-GTA-T--TTT-AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-GAAT--GGAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--A-T-T-TTT-G-A---A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-A-T-GC----C-GTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-ATT--AAA---A-A---CA------T-GA-AAT----T--A-TG-TT-AA---AATTT-C-ACTT-CT-A--------TTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--TT-G-C-----AG--GATC-ATACC---T-CAAACAA-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCCG-TTTGA-CAG-AT-G-G-GG---T-ACA--CA-T-A-A-TA-AA-A-ATA-CCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AACCCC-C-T-A-ATT--TTT--T--GCTT-TTTATC-AT-ACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AAG--T----AAG-TC-CAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94421                      : TTTTTTTA-T-C-T-T-TG--T-T-AT-GT----GAAAA--TC--A-TCC-TT--CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAA--T---G-------G-AGA-TGC---T--G---T---G-AAAATTTT----ATG-CTG---AGA--AG-GT---GT--AG-ATTTT-T--TT-AA-T-GCA-T--TT--AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--T-T-T-TTT-TTG---A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-TTACT-GC------GTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----A-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-ATT--AAA---A-A---CA------T-GA-AAT----T--A-TG-TT-AA---AATTT-C--CTT-CT-A--------TTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TAAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--TT-G-C-----AG--GATC-ATACC---T-CAAACAA-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-AGGAC-C-TCTTT--AATG-AATTCTGGATAT-T-GCCG-TTTGA-CGG-ATGG-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TA-AA-A-ATA-CCAA-T--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AACCCC-C-T-A-ATT--TTT--T--GC-T-TTTATC-AT-ACCCT----AAAAT-TAACAATCTC--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATCAAA-C---AAG--T----AAG-TC-C-G-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94422                      : TTTTTTTA-T-C-T-TCTA--T-T-AT-GT----GAA----TC--A-TCC-T---CAAAT---------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AACA---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAA--T---G-------G-AGA-TGCC--T--G---T---G-AAA-TTTT----ATG-CTG---AAA--AG--T---GT--AG-ATTTT-T--TTTAA-T-GCA-T--TTT-AA--C-AA-AACCT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CACAT-A------TTTTGCGAGTATT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--T-T-T-TTT-TGA---A-TAT-TTC-A-------TAT---AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----C-GGT-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-TTATT--AAA---A-AA--CA------T-GA-AAT----T--A-TG-TT-AA---A-TTT-C-ACTT-CT-A--------TT---ATC-T---AATT-AG-ACATA--CTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAAATTT-G-C-----AG---ATC-ATACC---T-CAAACCA-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCTTAGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCCG-TTTGA-CAG-AT-G-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TA-AA-A-ATA-CCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AACCCC-C-T-A-ATT--TTT--T--GC-T-TTTA-C-AT-ACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--G--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AAG--T----AAG-TC-CAG-GAAGT---A-GGA------CCTACCATAA
gi|94423                      : TTTTTGTA-T-C-T-TCTA--T-T-AT-GT----GAAAA--TC--AATCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TCAA--T---G-------G-AGA-T-C---TG-G---T---G-GAAAT-TT----ATG-CTG---AGA--AG-GT---GT--CG-ATTTT-T--TT-AA-T-GCA-T--TTT-AA--CAAA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCAAT-T-T-T-TTT-T-A---A-TAT-T-C-A-------TAT-TAAA----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-G-----C-GTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-ATC--AAA---A-AAACCA------T-GA-AAT----T--A-TG-TT-AA---AA-TT-C-ACTT-CT-A--------TTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-AAAAA--AAA--TTGG-G-----AG--GATC-ATACC---T-CAAAC-A-AA-AATTA-T-TGA-CA--A--T--TTCT-A-GACGT-TCTTTCAAATG-AATTCT-GATAT-T-G-CG-TTTGA-CAG-AG-G-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TATAA-A-ATA-CCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AA-CCC-C-T-A-ATT--TTT--T--GC-T-TTTATC-AT-CACCT----AGAAT-G-ACAATCTA--AGTA--T--
gi|94424                      : TTTTTTTT-T-C-T-TCTA--TGT-AT-GT----GAAA---TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCT-TTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-AA--T---------TGT--AATAATA-------AAA--T---A-------G-AGA-TGC---T--G---T---G-AAAATTTT----ATG-CTG---AGA---G-GT---GT--AA-GATTT-T--TT-AA-T-GTA-T--TTT-AAAAC-AA-G-CAT-TT--CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-A------TT-TGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--T-T-T-TTT-T-A---A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGAAT--TT-------TGCAGT-GC-----TCG-TC-------TTTTT-G-ACT-GC------GTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTT-AA--T--TTT--GT---ACAA-------------CCA---T-T-ATT--AAA---A-AA--CA------TTGA-ACT----T--A-TG-TT-AA---A-TTT-C-ACTT-CT-A--------TTTTAATC-T---AATTCAG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAAA----G-GAAAATAAAA--TA-G-C-----AG--GATC-ATACC---T-CAAAACA-AA-AATTAAT-TGAACA--AGTT--TCCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GC-G-TTTGA-CAG-AT-G-G-GGG--T-ACAA-CA-CCA-A-TA-AA-A--TA-C-AT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGA--AACCCC---T-A-ATTATTTT--T--GCTT-TT-----AT-ATCCT----AAAAT-GA-CAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAG-AATC--A-C---AAG--T----AAG-TCGCAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94425                      : TTTTTTTA-T-T-C-TCTA--T-T-AT-GT----GAAAA--TGTAA-TCT-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT---GG--CCAAAAAACTATTGTAA-ATATA-A-A---TGGAGAATGCTGTGAAA--ATA------TTAA--T---GTCTGGTGA-AGAGTGTAGAT--N---N---N-NNNNNNNN----NNN-NNN---NNN--NN-NN---NT--AT-ATTTT-T--TA-AA-T-GCA-T--TTT-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-AT--ATAAAA-C---T-A------TTATGCAAGT-TT-GAAT-------------C-ACAAG-TCAA--T-T-T-TTT-T-A---AGCAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----C-GTG-G--G-CC-GT----ATC-C-----A-GTTAAT--T--TTT--GT---ACCAGGTGGACCGCGTGCCA---T-T-ATC--AAA---A-AA--CA------T-GA-AAT----T--A-TG-TTTAA---AATGT-C-ACTT-CT-AATTAATAATTT--ATT-T---AATT-AG-ACAT---TTATT---TCAT-AT--ATAA-----G-GGAAA--AAA--TT-G-C-----AG--CATCCATACC---T-CAAACAA-AA-T-TTG-T-GGA-CA--T--A--TTCT-AGGAC-T-CCTTC--AATT-AATTCT-GATAT-T-TCCG-TTTGA-CAG-ATAG-G-GG---T-ACA--CG-T-A-ATTA-AA-A-ATA-CCAT-A--ATTTA-CTCAT-----CA-TACTGAC-AACCCC-C-T-A-ATT--TTT--T--GC-G-TTTATC-AT-ACCCT----CAAAT-GAACAATC--------------------TAAACTC--ATTTTT-------TTTTTAGAAATC--A-C---AAG--C----AGG-TC-CAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94426                      : TTTTTTTA-T-C-T-T--G--T-T-AT-GT----GAAAG--TT--A-TCT-T---CAAA----------A--TG---GCTAATT-T-GG--C-----------------A---A-A-A---T--------------AA--ATG------TAAA--T---G-------G-AAT-TGC---T--A---T---G-AACATCGT----AGG-CTG---TGA--AA-GT---GC--AG-ATTTT-C--AA-AA-T-GTA-T--TTT-AA--C-AA-G-CGA-T---CA---T-AT-GT--G---AA-CT--T-A------TTATGCGAGT-TT----------------------------------T-T-TTT-AGA---A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TC-------TTTTT-G-ACT-AC----A-GTG-G--G-CC-GT----ATT-G-----A-GTTTAT--T--TTT--AT---ACCA-------------CCA---T-T-ATT--AAA---A-A----A------T-GG-AAT----T--A-TG-GT-AA---CATAT-C-ATTT-CT-A--------CTT--ATT-T---AATT-AG-ACATA-TTCATT---TCAT-AT--TTGA-----A-GAAAA--AAA---T-G-C-----AG--CATC-ATACC---T-CAAACAA-AA-TTTTA-T-GGA-CA--T--A--TTCT-CGTAC-T-TCTTC--AATG-AATTAT-GATAT-T-GCCG-TTTTA-CAA-ACGG-G-GG---T-ACA--CA-T-A-A-TA-AA-C-ATA-TCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACCGAC-GATCCC-C-T-A-ATG--TTT--T--GC-T-TTCACC-AT-ACCCT----GAAAT-CAAAGATCTA--AGTG--T--T------TAATTTC--G--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-C---AAG--T----AGG-TC-CAG-G-GGT---AAGGA------CCTACCTT
gi|94427                      : TTTTTTTA-T-C-TGTCTA--T-T-CT-GT----GAAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------AAATG---GCTTTTT-T-GG--CC-------------AA-A---C-A---------------TG---AA--ATA------TAAA--T---G-------G-AAA-TGC---TT-G---T---G-AAAATA------AT--CTG---A-A--AG-GT---A------ATTTT-T-----AA-T-G-A-T--T---AA--C-AA---CAT-T---CA---T-ATTAT--G---AA-CA--T-A------TTATCGGAGT-T--GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-T-AA--A-T-T-TTT---A---A-T-T-T-C-A-------TAT-T-A-----------TGA-T--TT--------GCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTT--G-ACT-GC----CCGTG------CC-TT----ATT-G-----G--TTCAA--T--TTTTTGT---ACCC-------------CCA---T-T-ATT--AAA---A-AA--CA------T-GA-AAT-------A-TG-TT-GA---AATT--C-ACTT-CT-A--------TT---ATC-T---A--T-AG-ACA-A-GCTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--T--G-C-----A----ATC-ATACC---T-CAAA-AA-AA-AATTA-T-TGA-CA--AA-T--TTCT-AGGA--T-TCTTC--AATGGAATTCT-AAT---T-ACCG-TT-GA-CAG-AT-G-GCGG---T-ACA--CA-T-A-A-TA-AA-A-ATAACCAA-A--ATTTA--TCATA----TA-TACT-AT-AACCCC-CCT-A-ATT--TTT-----GCTT-TTATTC-AT-ACCCT----AAAAT-GAA-AATCTA--ATTA--T--G------TAAACTC--A--A----------TTTGAGAAATC--A-CA--AAG--T----AAG--C-CAG----AT---AGGAG------CCTAC
gi|94428                      : TTTTTTTA-TAC-C-TCTA--T-T-AT-GTTGAAAAAAA--T---A-TTC-TGTTCAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-ATA---T---------TGT--AA--ATAA-----TAAA--T---G-------G-ATA-CGC---T--AGTAT---G-AAAATTTTCTCAATG-CTGTTAAAA--AG-GT---GTTAGG-ATTTT-T--TA-AAGT-GTA-T--TTT-AAAAC-AA-GACAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-AAATT-AA-----TTATGCAAGT-TTTGAA---GAAAAA---T-C-ACAAGATCAAT-A-T-TGTTT-T-A---A-TAA-T-C-A-------TAT-T-AGCTACGTATAGTGG-T--TTC------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACTTGC----C-GTGAG--G-CC-AT----ATCCG-----GCGTTCAT--TCATTT--GT---ACCAG------------CCA---T-T-ATTTTAAA---ATA---AA------T-GA-AAT----T--A-TG-TT-CACCCAATTTTC-ACTTATT-A--------CTT--ATT-T---AATT-AGTAGATA-TTTAAT---TCAT-ATATTCAA-----G-AAAAA--AAA--AT-G-CTCGTTAGCAGATC-ATACC---T-CAAACAA-A-----TA-T-GGA-CA--T--A--TCCT-AGGACAT-CCTTT--AATG-AATTCTTGATAT-T-GCTG-TTTGA-CAG-AT-GAG-GG---T-ACAAACG-T-A-A-TA-AA-A-ATA-CCATTA--ATTTA-CTCGTGGTTGTA-TACTGAC-AATCCC-C-TTA-ATT--TTT--T--GCTT-TT-ATC-AT-ACCCTCATGAAAAT-GAACAATCTA--AGTA--T--T------TAAACTCTTT--TTT-------TTTTTAGAAATC--A-CATAAGG--T----AGGATC-CAG-G-AGT---AGGGA-------CTACCTTAA
gi|94429                      : TTTTTTTA-T-A-T-TCTA--T-T-TT-GT----GAAAA--TT--G-TCT-A---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CA-------------AA-A---A-A-AAAAT---------TGT--AA--ATA------TAAA--C---G-------G-AGA-TGC---T--G---T---G-AGAATCTT----ATG-CTG---TGA--AA-GT---GC--AG-ATTTT-T-----AA-TTGTA-T--TTT-AA--C-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-CT--G---AA-CA--T-A------T---GCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-ACAA--A-G-T-TTT-AGA---A-TAT-T-C-A-------TAT-C-AG----------TGG-T--TA-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----C-GTT-G--G-CC-GT----ATT-G-----A-GTTCAT--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-AT-----------------------------AT----T--A-TG-CT-AA---AACTT-T-GCTT-CT-A--------ATT--ATT-T---AATT-AG-AC-TA-TTTATT---TCAT-AT--TTAA-----G-GAAAA--AAA--T
gi|94430                      : TTTTTGTA-T-T-T-TCGA--TAT-ATTGT----GAAAA--TC--A-TCC-T----AAA----------A--TGAGGGTTAATT-T-GG--CC-------------AG-A---A-A-AGAAT---------T-T--AA--A-A-------AAA--T---G-------GCAGA-TGT---T--G---TTGTG-AAAATTTTT---ATG-CTG---AGA--AG-GTTTGGT--AT-ATTTT-TACGT-AA-T-GTA-TCCTTTGAA--C-AA-G-CAT-T---CA---TGAT-AT--G---AAACA--TGA------ATATGCGAGT-TT-GAATTGGAAAAAATCC-C-ACAAG-TTAA--T-T-T-TTT-T-A-----TAT-T-CCA-------TAT-T-AGA---------TGA-T--TT-------TGCAGTTGC-----T-G-TA-------TTTTT-T-ACT-GC----C-GTG-G--G-CC-GT----A---G-----G-GTTTAA--T--GT---GT---ACCA-------------CCA---T-TCATT--AAA---A-AA--CA------T-GA-AAT----TTAA-TG-TT-GA---AATTT-C-ACTTTCT-A--------TTT--ATC-T---AATT-AG-ACATA-TCTATT---TCA--AT--TAAG-----G-AAAAA--AAA--TTGG-C-----AG--GATC-ATACC---T-CAAATAACAACAATTA-
gi|94431                      : TTTTTTTA-T-C-T-T-TA--T-TTAT-GT----AAAAAAATC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAA--T---G-------G-AGA-TGC---T--T---G---G-AAAAT-TT----ATG-CTG---AGA--AG-GT---GT--AG-ATTTT-T--T---A-T-GCA-T--TTT-AA--C--A-G-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-A------TTATGCGAGT-TT-G-AT--G-AAAA---T-C-ACAAG-TCAT--T-T-T-TTT-T-A---A-AATAT-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----C-GTG-G--G-CG-AT----ATT-G-----
gi|94432                      : TTTTGTTA-T-C-A-TCTA--T-T-AT-GT----GAAAA--TC--A-TCT-T---CAAA----------A--TG---CCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------GGT--AAGTATA------TAAA--T---G-------G--GA-TGC---T--G---T---G-AAAATATT----ATG-CTA---TGA--AA-AA---GC--AA-ATTTT-T--AA-AA-T-GTA-T--TTT-AA--C-AA-G-CAT-C---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--A-A------TTATGAAAGT-TT-GAAT--G-AAAA---T-----------------T-T-TTT-A-A---A-TAT-T-T-A-------TAT-
gi|94433                      : TTTTTTTA-T-A-T-GCTA--T-T-G--GT----GAAAT--TT--G-TC--T---CAAATGCTACCCCGA--GG---GGTATTT-T-GGGGCC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAAAAC---G-------G-AGA-TAC---T--G---T---G-AGAATCTT----ATG-CTG---
gi|94434                      :  TTTTTTA-T-C-T-TTTA--T-T-ATTGT----GAAAA--TC--A-TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AC-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAA--T---G-------G-AGA-TGC---T--G---T---G-AAAATTTTT---ATG-CTA---AAA-----GT----T--AG-ATCTT-T--TT-AA-T-GCA-T--TTT-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-C---T-A------TT-TGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--ATT-T-TTT-T-A---A-TA--T-C-A-------TAT-T-AG----------TGA-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----C-ATG-G--G-CC-GT----ATT-G-----G-GTTCAA--T--TTT--GT---A-AA-------------CCA---T-T-ATTA-AAA---A-A---CA------T-GATAAT----T--A-TG-TT-AA---AATTT-C-ACTT-CT-A--------TTT--ATT-T---AATTAAG-ACATA-TCTATT---TCAT-AT--TTAA-------GAAAA--AAA--TT-G-C-----A---GATC-ATACC---T-CAAACAA-AA-AA-TA-T-TGA-CA--A------TCT-AGGAC-T---TTC--AATG-AA-TCT-GATA--T-GCCG-TTTGA-CAG-ATGG-G-GG---T-ACA--CT-T-A-A-TA-AA-A-A-A-CCAT-A--ATTTA-CTCAT-----TA-TACTGAC-AACCCC-C-T-A-ATT--TTT--T--GC---TTTATC-AT-ACCCT----AAAAT-GAA-AATCTA-----A--T--T------TAAACTC--G--GAT-------TTTTGAGAAATC--A-C---GAA--T----AAG-TC-CAG-G-AGT---AGGGA------CCTACCTTAA
gi|94435                      :  TTTGTTA-T-CCT-TCTA--T-T-AT-GT----GAAAA--TC--A-TCT-T---CAAA----------A--TG---CCTATTT-T-GG--CC-------------CC-A---A-A-A---A---------TGT--AA--ATA-------AAA--T---G-------A-GAA-TGC---T------T---G-AAAAT-------------------------G----GC--AA-ATTTT-C--AA-AA-T-GTA-T--TTT-AA--C-AAAG-CATAC---CA---T-AT-A-------AA-CA--T-ACATGTATTATGAAAGT-TTTGAAT--TAAAAA---TTC-ACAAG-TCGA--ATT-T-TTT-T-AAATA-TAT-T-T-A-------TAT-TAAG----------TGG-TGCCT-------GGCAGT-GC-----T-G-TACATGTATTTTCT-C-ACT-GC----C-GAG-G--G-CCAGT----CTT-G-----------------------GT---ACCA-------------TCA---T-T-ATT----------------TTTTTTT-TA-AAT----T--G-TT-TT-------GTTT-C-ACTT-CTAA--------TTA--ATT-T---AATT-A--ACA-A-TTCA-T---TCAT-AT--TTGAGAAGGG-GGAAA--AAA--TT-
gi|94436                      :    TTTTA-T-G-T-TCTTGTT-T-CT-GT----GAAAA--TT----TCC-T---CAAA----------A--TG---GCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-A---TTC-------TGT--AA--ATA------TATA--T---G-------G-AGA-TGC---CGGG---T---A-AAATTCTT----ATG-CTG---AGA--AGAGT---GT--AG-A---T-T--TT-AA-T-GC--T--TTT-TA--C-AA-T-CAC-TTCACA---T-AT-AT--G---AA-CA--T--------TTATGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-CAACAAG-TCAATCT-T-T-TTT-A-A---A-TAT-T-CAA-------TAT-T-AG----------TGA-T--TG-------TGCA-T-GC-----T-A-TA--------TTTT-G-ACT-GC----C-GTG-G--G--C-GT----ATT-G-----G-GTTCAAAGT--TTT--GTACAACTA-------------CCACACT-T-ATT---AA---A-A---CA------T-GA-AATC---T--ATTGTTT-TA---AATTT-C-ACTT-CT-T--------TTT--ATCTT---AATT-AGAACATA-TC-ATT---TCAT-AC--TTAA-----G-GAAAA--AAAT-TT-GCC-----AG--GATC-ATACC---T-CAAACAATAG-AACTG-T-
gi|94437                      :       TA-T-A-T-TACA--TGT-AA-GT----AAAAA--TT--A-TCT-T---AAAA----------A--AG---GCTATTT----G--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA-------AAA--T---G-------A-A-A-TGC---T--G---T---G-AAAATCTT----ATG-CTG---TGATCAG--T---GC--AG-ATTTA-G-----AG-A-GTA-T--TTT-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-G------TTATGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACGTG-TCAA--A-T-A-TTA-C-A---A-TAT-T-C-A-------TAT-C-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----T-GTG-G--G-CC-GTTTTGATC-G-----A-GTT-AA--T--TTTA-GT---A-CA--------------CA---T-T-ATT--AAA---A-A---GA------A-GA-AGA----TAGA-TG-TT-A
gi|94438                      :        A-T-T-T-ACTC--T-T-AT--T----GAAAA--TC--A-TC--T---CAAA----------A--T------T-CTT-T-GG--CC-------------AA-A---ACA-A---T---------GGT--AA--ATA------TAAA--T---A-----------A-TGC---T--A---T---T-GAAATCTT----ATGACTT---AGA--A---T---GC--AA-ATTTT-A--A--AA-T-GTAAT--TTT-AA--C-AA-G-CAT-C---TA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-A------TTATGAAAGT-TT-GAAT--GAAAAT---T-C-ACAAA-TCGA------T-TTT-T-A---A-TAT-T-T-A-------TAT-T-AG----------TTG-T--GT-------TGCAGT-GCGTTCAT-G-TA-------TTTTTCC-ACT-GT----C-G-A-G--G-CC---------T-G------------------TTT--GT---ACCA-------------TCA---T-T-ATT--GAA---A-A--------------A-AAT----T--G-TG-TT-------GTTT-C-A-TT-CT-A--------ATT--ATT-T---AATT-AA-ACATA-TTCAAT---TCA--AT--TTGA-----GAGTAAA--AAA--TT-G-C-----A---CCTC-ATACC---T--AAACAA-TA-ATTTA-TGTCA-CA--------TTCT-AGGGA-T-TCTTC--AGTG-AATTC--GATATAT-GCT-------------T-G-G-TT---T-ACA--CATT-A-A-TA-AACA-ATA-CCAT-A--A--TA-CTCATA----TATTACTGAC---CCCC-C-
gi|94439                      :                  TA--T-T-AT-GT----GAAA---TT--A-TCTAT---CAAA----------A--TG---GCTATTT-TTGG--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAG--TATGG-------G-AGA-CGC---T--G---T---GAAAAATCTC----ATG-CTG---TAA--AG-GT---GT--AGAATTTTAT--TA-AA-T-GTA-T--TTT-AAACT-AA-G-CAT-T---CA---T-AT-AT--GA--AA-AA--T-A------ATATGCAAGTATT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAA--TCAAT-A-T-A-GTT---A---A-TAA-T-C-ATTTTGGCTATAT-AG----------TGG-T--TTTG-----TGCAGT-GC-----T-GTTAT------TTTTT-G-AGC-GCGTAGCAGTG-GTTGCCC-AT----ATC-------G-GTTCAATTT--TTT--GT---ACCA-------------CCA---TAT-ATC--AAATATA-A----A------T-GA-AAT----T--A-TG-TT-CA---AATTT-CAACTT-TT-A--------ATT--ATT-TGGGAATT-AG-AGATATTTTATT---TCATAAT--TTCA-----GAAAAAA--AAA--AT-G-C-----AG--CAGC-ATACTGCGTGCAAACCA-AA-ATTTA-TATGG--A--A--TTATCCT-AGGAC-TACCTTT--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCTGTTTTGACCAGAAT-G-A-GGAGATAACA--CG-T-A-A-TA-AA-ATATA-CCAT-AAGATTTA-CTCGTTA---TA-TACTG---AATCCC-C-T-ACATT--TTT--TTGGCTTATTCTTCAAT-ACCCTC---ACAATGGAACAATCTATGAGTA--TACTCGCAAATAAACTC--A--TTTTGTTTAATTTTAAGAAATC--ACC---AAG--TGTAGAAA-TCATAG-G-AGTTTCAGGGAGAGGATCCTACCTTAA
gi|94440                      :                       -T-AT-GT----AAAAA--TT--A-TCT-T---AAAA----------A--TG---GCTATTT-T-AG--CC-------------AA-A---A-A-A---T---------TGT--AA--ATA------TAAA--T---G-------T-GAA-TGC---T--G---T---G-AAAATCTT----ATG-CTG---TGA--TC-AT---GC--AG-ATTTT-T--AG-AA-T-GTA-T--TTT-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-G------TTATGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACGTG-TCAA--A-TAT-TTA-C-A---A-TAT-T-C-A-------TAT-C-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----T-GTG-G--G-CC-GTTTTGATC-G-----A-GTT-AA--T--TTTA-GT---ACCA-------------CCA---T-T-ATT--AAA---
gi|94441                      :                            -GT----AAAAA--TT--A-TCT-T---AAAA----------AA-TG---GCTATTTGT-AG--CC-------------AA-A---A-A-AA--T---------TGT--AA--ATA------TAAA--T---G-------T-GAA-TGC---T--G---T---G-AAA-TCTT----ATG-CTG---TCA--TG-AT---GC--AG-ATTTT-T--AG-AA-T-GTA-T--TTT-AA--C-AA-A-CATCT---CA---T-AT-A---G---AA-CA--T-G------TTATGCGAGT-TT-GAAT--GAAAAA---T-C-ACGTG-TCAA--A-T-A-TTT-A-C---A-AAT-T-C-A-------TAT-C-AG----------TGG-T--TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----T-GTG-G--G-CC-GT----TTT-GATCGAG-GTT-AA--T--TTTA-GT---ACCA-------------CCA---T-T-ATT--AAC---A-A---GA------A-GA-AGTAAAGA--A-TG-TT-AA---
gi|94442                      :                                                 CT-T---CAAA----------A--TG---CCTATTT-T-GG--CC-------------AA-A---A-A-A---T----------GT--TA--ACA------TAAA--T---G-------G-AGA-TGC---T--G---T---G-AAAATCCT----ATG-CTG---CGA--AA-GT---GC--AG-ATTT---------------------TT-AA-----------------------------------AA-TG--T-A------TTATGCAAGT-TT-GATT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCGA--A-T-T-TTT-ATA---A-TAT-T-T-A-------AAT-T-AG----------TGG-TG-TTGCAGTCATGCAGT-GC-----T-G-CA-------TTTTT-G-ACT-GC----C-AAA-G--G-CCTGT----A---G-----GAGTTCAT--A--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-A--------------------------------------------TC-AA---AATTT-C-ACTT-CT-A--------ATT--ATC-A---TATT-A--ACATA-T
gi|94443                      :                                                            ----------A--TG---GCTGTTT-T-AGT-CC-------------AA-AC--A-A-A---T---------CGT--AA--ATACATGTATAAA--T---G-------G-AAA-TGC---T--G---T---G-AAAATCTT----ATG-CTG---TGA--AG-GT---
gi|94444                      :                                                                                                                                                                                                                                                              A-T--TCA-AA--C-AA-A-CAT-T---CA---T-AT-AT--G---AA-CA--T-A------T---GCGAGT-TT-GAAT--AAAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--A-G-T-TTT-GCA---A-TAT-T-C-A-------TAT-T-CG----------TGG-T--TT-------TGAATT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-ACT-GC----C-ATC-G--G-TC-GT----ATT-G-----A-GTAAAT--T--TTT--GT---ACCA-------------CCA---T-T-ATT--AAAC--A-A---GAAG----T-AA-AA--------A-TG-TT-AA---ACTGT-T-AATA-C--A--------TTTC-ATC------ACT-AT-CCGTG-T-TATTGTATCAT-AA--TTAA-----C-CAAAA--AAA--
gi|94445                      :                                                                                                                                                                                                                                                              A-T--TTT-AA--C-AAAG-CAT-T---TAAATT-AT-ATCTG---AA-CA--T-A--------ATGCGAGT-TT-GAAT--T-AAAA---T-C-ACATG-ACAA--AGT-T-TTTAG-A---A-TAT-T-C-A-------TAT-T-AG----------TG
gi|94446                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A--T-A------TCATGCGAGT-TT-GAAT--AAAAAA---T-C-ACAAA-TCAA--A-T-T-TTTAC-A---A-TAT-T-C-A-------TA-----------------------TT-------TGCAGT-GC-----T-G-TA--------CTTT-G-ACT-GC----C-GTG-G--G-C
gi|94447                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T-GAAT--GAAAAA---T-C-ACAAG-TCAA--A-T-T-TTT-A-A---A-TAT-T-C-A-------TTT-T-AG----------TGA-T--TT-------TCCAGT-GC-----T-G-TA-------TTTTT-G-AC
gi|94448                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATA-ATACC---T-GAAACAA-AA-T-TTA-T-GGA-CCGCA--T--CT-T-AAGAT-T-TCTTC--AGTG-AATTCT-GATAT-TGGCCG-TT-------------G-GG---T-ACA--CG-T-A-A-TA-AT-T-AAA-CCATAA--ATTTAGCTCAT-----TA-TACTGCC-TCCCCC-T-T-A-A-----TT--T--G-TT-TTTATC--------------------AACAATCCA--AGTA-----T------TAAACTCA-A--AAT-------TGTTGAGAAATCA-A-C---AAC--T----GGGTTC-CAG-G-AAT---AGGAC------CCT-CCTTAA
gi|94449                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-AA-AAT-A-T--GA-CC--A--T--TTCT-AGGAC-T-TCTTC--AATG-AATTCT-GATAT-T-GCTG--TTGA-CAG-AT-G-G-CG---T-ACA--CA-T-ACA-T---A-A-ATA-CCAT-A--ATTTA-CTCTTA----TA-TACATACAAACCCCGC-T-G-ATT--TTTTCT--GC-T-TTTATC-ATCACCCT----AAAAT-GAACAATCTA--AGTATGT--T------TAAACTC--A--A-T-------TTTTGAGAAATC--AGC---CAG--A----AG---C-CAGCG-AGTAA-AGGGA-------CTACCTTAA
gi|94450                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCA--AGTA--TC-T------TAAACTC--A--AAA-------TTTTGAGAA-TC--A-C---AAGACT-----GG-TC-AAG-G-AAT---TAGTA------CCTACCTTAA
gi|94451                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A--AATG--T--T------TAAACTC--A--ATT-------TTTTGAGAAATC--A-T---AAG--T----AGA-TC-CAG-G-AGT---AGAAA------CCTACCTTAA
gi|94452                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TA--T--T------TAAACTC--A--A-T-------TTTTGAGAAAT-----C---AAG--T----A-G-TC-CAG-G-AGT---A-GGA------CCTA-CTTAA
gi|94453                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --A--ATA-------TTTTGAGAAATC--A-C---AAGG-T----TGG-TC-CAG-G-AAT---GGGAC------CCTACCTTAA