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gi|71420                      :  TTTGA-AGTATA-T--T-G--C-A-TT-ACGTTG-CG-T-T-A-CG-AA--CG-TC-A-TA-G-TT--A-GTAA-T-GCA------------T-C-AGA-T-T--CCCTC--A-A--T-A--T----TG--------------------C----C-GG-T-C----------A----AT-A-----GA-TC---G-C-CG-GT--CC-A-A-AA--T-TCAAAA
gi|71427                      :  TTTGA-AGTCTA-T--T-G--C-A-TT-ACGT-G-CG-T-T-A-CG-AA--CG-TC-A-TA-G-TT--A-GCAA-T-GCA------------T-C-AGA-T-T--CCCTC--A-A--T-A--T----TG--------------------C----C-GG-T-C----------A----A--T-----GG-TC---G-C-CG-GTG-CC-A-A-AA--T-TAAAAA
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gi|71433                      :           TTTGA-AGTCTA-T--T-G--C-A-TT-ACGTTG-CGTT-T-A-TG-AA--CGTTC-A-AG-GT-T--A-GCAAT-GAT------------T-CAAGA-T-T--CCCTC--AAT-T-A--T-TG--------------------T----C-GGT---T-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-CG-GT--CCAA-A-AA--T-TCAAAA
gi|71434                      :                      A-T--T-C--C-A-TT-ACGTTG-CG-T-T-A-CG-AA--TG-TC---TA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AGA-T-T--CCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-
gi|71435                      :     tttaaaaataA-AGTCTG-T--T-G--C-A-TT-ACGTTG-TG-T-T-G-CG-AA--CG-TC-A-TA-GT-T--A-GCAAT-GCAT-----------T-C-AGA-T-T--CCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-CCCAA-ATTCAAAAACTATTGA-CC---G-G-CG-GT--CC-A-A-
gi|71436                      :      tttaaTTTGA-AGTCTA-T--T-G--C-A-TT-ACGTTG-CG-T-C-A-CG-AAT-CG-AC-A-TA-GT-A--A-GC-AT-GCA------------T-C-AGA-TAT--CCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-C---A-A
gi|71437                      :           TTTGA-AGTCTG-T--TTG--C-A-TTTACGTTG-CG-T-T-A-CGGAA--CG-TC-AGTA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AAG-A-T--CCCTC--AAGGT-AATT-CG--------------------C----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-TC---A-CGGG-GTAACC---A-AA--T-TCAAGA
gi|71438                      :                      A-T--T-C--C-A-TT-ACGTTG-CG-T-T-A-CG-AA--TG-TC---TA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AGA-T-T--CCCTC--AA--TAA--T-TG-------------------------C-GG----T-C---A-TA--A---------GA-TC---G-C-
gi|71439                      : tttaaaaataTTTGA-AGTCTAAT--T-A--T-A-TT-ACGTTG-CG-T-TCA-CG-AA--CG-TC-A-TA-GT-TG-A-GC-AT-GCA------------T-T-CAA-T-TC-CCCTC--AAG-TAA--T-TG-------------------------C-GG----T-C-----AT--A---------GA-CT---G-C-CG-GT--CC---A-AA--T-TCACAA
gi|71440                      :            TTGAGAGTCTA-T--T-G--C-A-TT-A-------------A-CG-AAG-CG-TC-A-TAGGT-TTAA-GCAAT-GCA------------TGC-AGA-T-T--CCCTC---A--T-AT-T-TG--------------------CGTGGC-GG----------A-AT--A---------GA-TC---GTC-CG-GT--CA-G-A-AA--TGTCAAAA
gi|71441                      :               A-AGTCTACT--T-G--CCA-TT-ACTTTG-CG-T-T-A-TG-AA--AC-TC-A-TA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AGACT-T--CCCTC--AAG-T-A--TCTG--------------------C----C-GG----T-C---ATAT--A---------GA-TC---G-C-CGCGT--CC-A-A-AA--T-TCAAAA
gi|71442                      :         tcaTTGA-AGTCTA-TGTT-G--C-A-TT-ACGTTG-CG-T-TTA-CGCAA--CG-TC-ACTA-GT-T--A-GCAAT-GCAG-----------T-C-AGA-T-TGTCCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----TGC---A-AT--ATAG------GA-TC---G-C-CG-GT--CC-A-A-AA--A-TTAAA
gi|71443                      :               A-AGTTTA-T--T-G--C-A-TT-ACATTA-CG-T-T-A-CG-AA--CG-TC-A-TA-GT-T--A-GCAAT-GCATCACTGTTTAATT-C-AGA-T-T--CACTC--AA--T-G--C-TG--------------------C----C-GG----TCC---A-AT--A---------AA-T
gi|71444                      :             tca-AGTCTA-T--T-G--C-A-TT-ACGTTA-CG-T-T-A-TG-TA--CG-TC-A-TA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-A
gi|71445                      :            tcag-AGTATA-C--G-G--C-A-TT-ACGTT---------A-CG-AA--TG-TC-A-TA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AAA-T-T--CACTC--A----------TG--------------------G----C-GG----C-C---A-
gi|71446                      :            tcag-AGTCTA-T--T-G--C-A-TA-ACGTTA-CG-T-T-A-CA-TA--CA-TC-A-CA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-A
gi|71447                      :            tcag-AGTCTA-T--T-G--C-A-TA-ACGTTA-CG-T-T-A-CA-TA--CA-TC-A-CA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-A
gi|71448                      :            tcag-AGTCTA-C--T-G--C-A-TT-ACGTTA-TG-T---------A--TG-TC-A-TA-GT-T--A-GCAAT-GCT------------T-C-AAA-T-C--CACTT--A----------TG--------------------G----C-GG----C-C---A-
gi|71449                      :           tcagA-AGTCTA-T--T-G--C-AATT-ACGTTG-AG-T-T-A-CG-AA--CG-TA-T-TA-GTAT--A--CAAT-GCA------------TTC-AAA-T-T--CCCTC--A---T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-TCATGG-C-C--GT--CC-ACA-AA--T-
gi|71450                      :                -AGTCTA-T--T-AGTC-A-T--AC-TTG----T-T-A-CG-AA--CG-TC-A-TA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AGA-T-T--CCCTC--AA--T----T-TG--------------------C----C-GG----T-C-----AT--A---------GA-TC---G-C-CG-GT--CC-A-A-AA--T-TCAAAA
gi|71451                      :                      A-T--T-G--C-A-TT-ACGCTG-CG-T-T-A-CG-GA--CG-TC------GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AGC-T-T--CCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-AC---A-C-TG-GT--CC-A-A-AA----TCAAAA
gi|71452                      :                                 -A-TT-ACGTTGGCG-T-T-AACG-A---CG-TCCA-TA-GT-T--AAGCAATAGCA------------A-T-AGA-T-T--TCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----CGGG----T-C---AGAT--A---------GA-TT---G-C-T--GT--CC-A-A-------TCAAAA
gi|71453                      :                                                -T-T-A-CG-AAATCG-TC-A-TA-GT-TT-A-GCAATTGCA------------T-CTAGA-T-T--TCCCCGTAG--T-A--T-TGGCACCTGCCGCCCAACGATCT----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-CG-TT--CC-A-A-AA--T-TTAAAA
gi|71454                      :                                                                                -GCAAT-GCA------------T-C-AGA-T-T--CCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-TGCCGTT-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-TG-GT--CC-A-A-AA--T-TCAAAA
gi|71455                      :                                                                                     T-GCA------------C-C-AGA-T-T--CCTTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-CG-GT--CC-A-A-AATTT-TCAAAA


blockSeqs                     :                G      A AT T GT C A  T      G  T G C C  G  AT  T  C G  G  A TA A     A   TCACTGTTTAAT G A   C A GT     GT  GG A AT C  GCACCTGCCGCCCAACGATC GTGG G  CCGT G CCA T  TC AAAACTATT  T  ATG T G  C  AA  A C T  TT G
blockSeqs                     :                .      C AT T .  . .  .      .  . . T A  C  T   .  . C  .  . G  .     T   T            T T   . A C      .   T  A T  .  .                    .    .  T    C .   G  .  TAG        .  .   . .  .  G   . . .  .  .
blockSeqs                     :                .      . GT . .  . .  .      .  . . . .  .  G   .  . .  .  . T  .     .   G            . .   . . .      .   G  . .  .  .                    .    .  .    . .   .  .  .          .  .   . .  .  .   . . .  .  .
blockSeqs                     :                .      . .  . .  . .  .      .  . . . .  .  .   .  . .  .  . .  .     .   .            . .   . . .      .   G  . .  .  .                    .    .  .    . .   .  .  .          .  .   . .  .  .   . . .  .  .
blockSeqs                     :                .      . .  . .  . .  .      .  . . . .  .  .   .  . .  .  . .  .     .   .            . .   . . .      .   .  . .  .  .                    .    .  .    . .   .  .  .          .  .   . .  .  .   . . .  .  .
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finalCons                     :           TTTGA-AGTCTA-T--T-G--C-A-TT-ACGTTG-CG-T-T-A-CG-AA--CG-TC-A-TA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AGA-T-T--CCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-CG-GT--CC-A-A-AA--T-TCAAAA





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lowQualScore                  :                4      5 22 5 77 2 2  2      2  2 2 4 4  4  00  2  2 4  2  2 00 1     2   999999999999 2 2   2 5 00     77  55 5 00 2  22222222222222222222 7777 2  9999 5 222 5  99 999999999  4  555 4 4  5  77  5 5 5  22 6      
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Reference ( family-538 )      :           TTTGA-AGTCTA-T--T-G--C-A-TT-ACGTTG-CG-T-T-A-CG-AA--CG-TC-A-TA-GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AGA-T-T--CCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-CG-GT--CC-A-A-AA--T-TCAAAA
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gi|71425                      :           TTTAA-AGTCTG-T--T-G--C-A-TT-ACGTTG-CG-T-T-A-CG-AA--CG-TC-A-T--GT-T--A-GCAAT-GCA------------T-C-AGT-T-T--CCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-CG-GT--CG-C-A-AA--T-TCAAAA
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gi|71454                      :                                                                                -GCAAT-GCA------------T-C-AGA-T-T--CCCTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-TGCCGTT-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-TG-GT--CC-A-A-AA--T-TCAAAA
gi|71455                      :                                                                                     T-GCA------------C-C-AGA-T-T--CCTTC--AA--T-A--T-TG--------------------C----C-GG----T-C---A-AT--A---------GA-TC---G-C-CG-GT--CC-A-A-AATTT-TCAAAA