lowQualScore                  :         1        5  2222           22222  888888888888888    333333    222         1      
lowQualScore                  :         .        .  ....           .....  ...............    ......    ...         .      
lowQualScore                  :         5        1  4444           99999  777777777777777    333333    111         2      
consensus                     : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AG----------C----GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
Reference ( gi|21351 )        : AAAGTTTCCTGGAAATCTAT----CAACAAATGAA-----AG----------T----GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21357                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AG----------T----GTTA------TCCA---GGCAACAAC-ATGCTA
gi|21354                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAATAAATGAA-----AG----------C----GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATACT
gi|21355                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----GG----------C----ACTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21356                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----TAACAAATGAA-----AG----------C----GTTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21359                      : AAAGTTTCCTGGCGATCCAT----CAACAAATGAA-----AG----------C----GCTA------TCCC---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21361                      : AAAGTTTTCTGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AG----------C----GCTA------TCCA---GACGACAGC-ATGCTA
gi|21362                      : AAAGTTTCCTGGAAATATAT----CAACAAATGAA-----AG----------C----GCTA------CCAA---GGTGACAAT-ATGCTA
gi|21363                      : AAAGTTTCATAGAAATCCAT----CCACAAATGTA-----AG----------C----GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21364                      : AAAGTTTCATGAAAATCCAT----TAACAAATGGA-----AA----------T----GCTA------TCCA---GGCGACAAT-ATGCT
gi|21365                      : AAAGTTTTGTGGAAATCCAT----TGACAAATAAA-----AG----------C----GCTA------TCCA---GGCGACAAT-ATGCTA
gi|21358                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----TAATAAATGAA-----AG----------C----ACTA------TCCA---GGTGACATT-ATGCTA
gi|21369                      : AAAGTTTCTTGGAAATCCAT----CAACAAATCGA-----AG----------T----GCTA------TCCA---TGCGACTAC-ATGCCA
gi|21368                      : AGAATTTCCTGCAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AG----------C----GCAA------TCCA---GGCGACAAC-ATGTTA
gi|21352                      : AAAATTTCGTAGAAATCCAT----CGAGAAATGAA-----AG----------C----GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGTTA
gi|21372                      : AAAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AG----------T----GCTA------CTTA---GTCGACAAC-ATGCT
gi|21375                      : AAGGTTTCCTAGAAATCTAT----TGACAAATGAC-----AG----------C----GATA------TCCA---GGCGACAAC-ATATTA
gi|21353                      : AAAGTTTCGTGGAAATCCAT----CAACAAA---------AG----------T----GCTA------TCCA---GGCGCTAAC-ATGTTA
gi|21374                      : AAAGTTTCATAGAAATCCAT----TCACAACTGAA-----AG----------T----GCTA------TTCA---GGCGACAAT-AT
gi|21373                      : AAGGTTCCCTGGAAATCCAG----CAACAGACGAA-----AG----------C----GCTA------TTCA---TGTGACAAC-ATTCTA
gi|21367                      : AAAGTTTCGTTGAAATCCAT----CAAGAAATGAA-----AG----------T----GCTA------TCCT---GG---CAAC-ATGTTA
gi|21360                      : AAGGTTTCCTGGAAATCCTT----TCACAAATAAA-----AG----------C----CCTA------TCCA---AGCGACAAT-ATGTT
gi|21366                      : AAAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAACTGAA-----AG----------C----TCCA------TACA---GGCGACAGC-ATTCTA
gi|21376                      : AAAGTTTGC--GAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AG----------C----CCTA------TCTA----GCAACAAC-AT
gi|21371                      : AAGGTTTCGTAGAAATCCGT----CAAGGAATGAA-----AG----------T----GCTACATGTTTCCA---GGCAACAA
gi|21377                      : AAAGTGTCGTGGAAATTCAT----TTACAAATGAACAAACAGCTGGACGGACT----GCTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGC
gi|21370                      : AGAGTTTCGTGGAAATCCAT----CAAGAAATGAA-----AG----------C----GCTA------
gi|21379                      :  AAGGTTCCTGGAAATCCATGGATCAACAAATGAA-----AG----------T----GCTA------TCCGGGCGGCGACAACAATGCTA
gi|21378                      :  AAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AG----------C----GATA-------ACA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21380                      :  AAGTTTCCAATCAATGCAT----CAAGAAATGAA-----AG----------C----GCTA------CACA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21381                      :   AGTTTCATGGAAATCCAT----TGATAATTGAA-----AG----------C----GCTA------TACA---AGTGGCAAC-ATGCTA
gi|21382                      :   AGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AA----------C----GCCA------GACA---GGCGACAAC-ACGGTA
gi|21383                      :   AGTTTCCAGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AG----------CTAGAGATA------GCCG---GG---CAAC-ATGCTA
gi|21385                      :      TTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AG----------T----GCTA------TCCA---GGTGACAAC-AT
gi|21384                      :      TTCCTGGATATCCAT----CCACAAATGAA-----AG----------C----GTTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21386                      :                TCCAT----CAGCAAATGAA-----AG----------C----GCAA------T-CA---AGCAACAAC-ATACTA





Alignments
lowQualScore                  :         1           2222 2         22222   7777777777    333333    222         1      
lowQualScore                  :         .           .... .         .....   ..........    ......    ...         .      
lowQualScore                  :         2           4444 8         88888   2222222222    222222    000         2      
consensus                     : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
Reference ( family-536 )      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21351                      : AAAGTTTCCTGGAAATCTAT----CAACAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21352                      : AAAATTTCGTAGAAATCCAT----CGAGAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGTTA
gi|21353                      : AAAGTTTCGTGGAAATCCAT----CAACA----AA-----AGT----------GCTA------TCCA---GGCGCTAAC-ATGTTA
gi|21354                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAATAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATACT
gi|21355                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----GGC----------ACTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21356                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----TAACAAATGAA-----AGC----------GTTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21357                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGT----------GTTA------TCCA---GGCAACAAC-ATGCTA
gi|21358                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----TAATAAATGAA-----AGC----------ACTA------TCCA---GGTGACATT-ATGCTA
gi|21359                      : AAAGTTTCCTGGCGATCCAT----CAACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCC---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21360                      : AAGGTTTCCTGGAAATCCTT----TCACAAATAAA-----AGC----------CCTA------TCCA---AGCGACAAT-ATGTT
gi|21361                      : AAAGTTTTCTGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GACGACAGC-ATGCTA
gi|21362                      : AAAGTTTCCTGGAAATATAT----CAACAAATGAA-----AGC----------GCTA------CCAA---GGTGACAAT-ATGCTA
gi|21363                      : AAAGTTTCATAGAAATCCAT----CCACAAATGTA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21364                      : AAAGTTTCATGAAAATCCAT----TAACAAATGGA-----AAT----------GCTA------TCCA---GGCGACAAT-ATGCT
gi|21365                      : AAAGTTTTGTGGAAATCCAT----TGACAAATAAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAT-ATGCTA
gi|21366                      : AAAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAACTGAA-----AGC----------TCCA------TACA---GGCGACAGC-ATTCTA
gi|21367                      : AAAGTTTCGTTGAAATCCAT----CAAGAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCT---GG---CAAC-ATGTTA
gi|21368                      : AGAATTTCCTGCAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCAA------TCCA---GGCGACAAC-ATGTTA
gi|21369                      : AAAGTTTCTTGGAAATCCAT----CAACAAATCGA-----AGT----------GCTA------TCCA---TGCGACTAC-ATGCCA
gi|21370                      : AGAGTTTCGTGGAAATCCAT----CAAGAAATGAA-----AGC----------GCTA------
gi|21371                      : AAGGTTTCGTAGAAATCCGT----CAAGGAATGAA-----AGT----------GCTACATGTTTCCA---GGCAACAA
gi|21372                      : AAAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AGT----------GCTA------CTTA---GTCGACAAC-ATGCT
gi|21373                      : AAGGTTCCCTGGAAATCCAG----CAACAGACGAA-----AGC----------GCTA------TTCA---TGTGACAAC-ATTCTA
gi|21374                      : AAAGTTTCATAGAAATCCAT----TCACAACTGAA-----AGT----------GCTA------TTCA---GGCGACAAT-AT
gi|21375                      : AAGGTTTCCTAGAAATCTAT----TGACAAATGAC-----AGC----------GATA------TCCA---GGCGACAAC-ATATTA
gi|21376                      : AAAGTTTGC--GAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGC----------CCTA------TCTA----GCAACAAC-AT
gi|21377                      : AAAGTGTCGTGGAAATTCAT----TTACAAATGAACAAACAGCTGGACGGACTGCTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGC
gi|21378                      :  AAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AGC----------GATA-------ACA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21379                      :  AAGGTTCCTGGAAATCCATGGATCAACAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCGGGCGGCGACAACAATGCTA
gi|21380                      :  AAGTTTCCAATCAATGCAT----CAAGAAATGAA-----AGC----------GCTA------CACA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21381                      :   AGTTTCATGGAAATCCAT----TGATAATTGAA-----AGC----------GCTA------TACA---AGTGGCAAC-ATGCTA
gi|21382                      :   AGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AAC----------GCCA------GACA---GGCGACAAC-ACGGTA
gi|21383                      :   AGTTTCCAGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGCTAGA------GATA------GCCG---GG---CAAC-ATGCTA
gi|21384                      :      TTCCTGGATATCCAT----CCACAAATGAA-----AGC----------GTTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21385                      :      TTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCA---GGTGACAAC-AT
gi|21386                      :                TCCAT----CAGCAAATGAA-----AGC----------GCAA------T-CA---AGCAACAAC-ATACTA





Alignments
lowQualScore                  :         1           2222 2         22222   7777777777    333333    222         1      
lowQualScore                  :         .           .... .         .....   ..........    ......    ...         .      
lowQualScore                  :         2           4444 8         88888   2222222222    222222    000         2      
consensus                     : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
Reference ( family-536 )      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21351                      : AAAGTTTCCTGGAAATCTAT----CAACAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21352                      : AAAATTTCGTAGAAATCCAT----CGAGAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGTTA
gi|21353                      : AAAGTTTCGTGGAAATCCAT----CAACA----AA-----AGT----------GCTA------TCCA---GGCGCTAAC-ATGTTA
gi|21354                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAATAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATACT
gi|21355                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----GGC----------ACTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21356                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----TAACAAATGAA-----AGC----------GTTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21357                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGT----------GTTA------TCCA---GGCAACAAC-ATGCTA
gi|21358                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----TAATAAATGAA-----AGC----------ACTA------TCCA---GGTGACATT-ATGCTA
gi|21359                      : AAAGTTTCCTGGCGATCCAT----CAACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCC---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21360                      : AAGGTTTCCTGGAAATCCTT----TCACAAATAAA-----AGC----------CCTA------TCCA---AGCGACAAT-ATGTT
gi|21361                      : AAAGTTTTCTGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GACGACAGC-ATGCTA
gi|21362                      : AAAGTTTCCTGGAAATATAT----CAACAAATGAA-----AGC----------GCTA------CCAA---GGTGACAAT-ATGCTA
gi|21363                      : AAAGTTTCATAGAAATCCAT----CCACAAATGTA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21364                      : AAAGTTTCATGAAAATCCAT----TAACAAATGGA-----AAT----------GCTA------TCCA---GGCGACAAT-ATGCT
gi|21365                      : AAAGTTTTGTGGAAATCCAT----TGACAAATAAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAT-ATGCTA
gi|21366                      : AAAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAACTGAA-----AGC----------TCCA------TACA---GGCGACAGC-ATTCTA
gi|21367                      : AAAGTTTCGTTGAAATCCAT----CAAGAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCT---GG---CAAC-ATGTTA
gi|21368                      : AGAATTTCCTGCAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCAA------TCCA---GGCGACAAC-ATGTTA
gi|21369                      : AAAGTTTCTTGGAAATCCAT----CAACAAATCGA-----AGT----------GCTA------TCCA---TGCGACTAC-ATGCCA
gi|21370                      : AGAGTTTCGTGGAAATCCAT----CAAGAAATGAA-----AGC----------GCTA------
gi|21371                      : AAGGTTTCGTAGAAATCCGT----CAAGGAATGAA-----AGT----------GCTACATGTTTCCA---GGCAACAA
gi|21372                      : AAAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AGT----------GCTA------CTTA---GTCGACAAC-ATGCT
gi|21373                      : AAGGTTCCCTGGAAATCCAG----CAACAGACGAA-----AGC----------GCTA------TTCA---TGTGACAAC-ATTCTA
gi|21374                      : AAAGTTTCATAGAAATCCAT----TCACAACTGAA-----AGT----------GCTA------TTCA---GGCGACAAT-AT
gi|21375                      : AAGGTTTCCTAGAAATCTAT----TGACAAATGAC-----AGC----------GATA------TCCA---GGCGACAAC-ATATTA
gi|21376                      : AAAGTTTGC--GAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGC----------CCTA------TCTA----GCAACAAC-AT
gi|21377                      : AAAGTGTCGTGGAAATTCAT----TTACAAATGAACAAACAGCTGGACGGACTGCTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGC
gi|21378                      :  AAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AGC----------GATA-------ACA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21379                      :  AAGGTTCCTGGAAATCCATGGATCAACAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCGGGCGGCGACAACAATGCTA
gi|21380                      :  AAGTTTCCAATCAATGCAT----CAAGAAATGAA-----AGC----------GCTA------CACA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21381                      :   AGTTTCATGGAAATCCAT----TGATAATTGAA-----AGC----------GCTA------TACA---AGTGGCAAC-ATGCTA
gi|21382                      :   AGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AAC----------GCCA------GACA---GGCGACAAC-ACGGTA
gi|21383                      :   AGTTTCCAGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGCTAGA------GATA------GCCG---GG---CAAC-ATGCTA
gi|21384                      :      TTCCTGGATATCCAT----CCACAAATGAA-----AGC----------GTTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21385                      :      TTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCA---GGTGACAAC-AT
gi|21386                      :                TCCAT----CAGCAAATGAA-----AGC----------GCAA------T-CA---AGCAACAAC-ATACTA


blockSeqs                     :         G           GGAT G         CAAAC   TGGACGGACT    CATGTT    GGC         A
blockSeqs                     :         G           .    A         .       TAGA          .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    C         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    G         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         A           .    C         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         A           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         G           .    G         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         A           .    G         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         G           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    G         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         T           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         G           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         G           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         A           .    G         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         A           .    C         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    G         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         G           .    T         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         A           .    G         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         A           .    G         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         A           .    G         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    C         .       .             .         .           .
blockSeqs                     :         C           .    A         .       .             .         .            
blockSeqs                     :                     .    A         .       .             .                      


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
finalCons                     : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA





Alignments
lowQualScore                  :         1           2222 2         22222   7777777777    333333    222         1      
lowQualScore                  :         .           .... .         .....   ..........    ......    ...         .      
lowQualScore                  :         2           4444 8         88888   2222222222    222222    000         2      
consensus                     : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
Reference ( family-536 )      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21351                      : AAAGTTTCCTGGAAATCTAT----CAACAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21352                      : AAAATTTCGTAGAAATCCAT----CGAGAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGTTA
gi|21353                      : AAAGTTTCGTGGAAATCCAT----CAACA----AA-----AGT----------GCTA------TCCA---GGCGCTAAC-ATGTTA
gi|21354                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAATAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATACT
gi|21355                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----GGC----------ACTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21356                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----TAACAAATGAA-----AGC----------GTTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21357                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGT----------GTTA------TCCA---GGCAACAAC-ATGCTA
gi|21358                      : AAAGTTTCCTGGAAATCCAT----TAATAAATGAA-----AGC----------ACTA------TCCA---GGTGACATT-ATGCTA
gi|21359                      : AAAGTTTCCTGGCGATCCAT----CAACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCC---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21360                      : AAGGTTTCCTGGAAATCCTT----TCACAAATAAA-----AGC----------CCTA------TCCA---AGCGACAAT-ATGTT
gi|21361                      : AAAGTTTTCTGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GACGACAGC-ATGCTA
gi|21362                      : AAAGTTTCCTGGAAATATAT----CAACAAATGAA-----AGC----------GCTA------CCAA---GGTGACAAT-ATGCTA
gi|21363                      : AAAGTTTCATAGAAATCCAT----CCACAAATGTA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21364                      : AAAGTTTCATGAAAATCCAT----TAACAAATGGA-----AAT----------GCTA------TCCA---GGCGACAAT-ATGCT
gi|21365                      : AAAGTTTTGTGGAAATCCAT----TGACAAATAAA-----AGC----------GCTA------TCCA---GGCGACAAT-ATGCTA
gi|21366                      : AAAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAACTGAA-----AGC----------TCCA------TACA---GGCGACAGC-ATTCTA
gi|21367                      : AAAGTTTCGTTGAAATCCAT----CAAGAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCT---GG---CAAC-ATGTTA
gi|21368                      : AGAATTTCCTGCAAATCCAT----CGACAAATGAA-----AGC----------GCAA------TCCA---GGCGACAAC-ATGTTA
gi|21369                      : AAAGTTTCTTGGAAATCCAT----CAACAAATCGA-----AGT----------GCTA------TCCA---TGCGACTAC-ATGCCA
gi|21370                      : AGAGTTTCGTGGAAATCCAT----CAAGAAATGAA-----AGC----------GCTA------
gi|21371                      : AAGGTTTCGTAGAAATCCGT----CAAGGAATGAA-----AGT----------GCTACATGTTTCCA---GGCAACAA
gi|21372                      : AAAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AGT----------GCTA------CTTA---GTCGACAAC-ATGCT
gi|21373                      : AAGGTTCCCTGGAAATCCAG----CAACAGACGAA-----AGC----------GCTA------TTCA---TGTGACAAC-ATTCTA
gi|21374                      : AAAGTTTCATAGAAATCCAT----TCACAACTGAA-----AGT----------GCTA------TTCA---GGCGACAAT-AT
gi|21375                      : AAGGTTTCCTAGAAATCTAT----TGACAAATGAC-----AGC----------GATA------TCCA---GGCGACAAC-ATATTA
gi|21376                      : AAAGTTTGC--GAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGC----------CCTA------TCTA----GCAACAAC-AT
gi|21377                      : AAAGTGTCGTGGAAATTCAT----TTACAAATGAACAAACAGCTGGACGGACTGCTA------TCCA---GGTGACAAC-ATGC
gi|21378                      :  AAGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AGC----------GATA-------ACA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21379                      :  AAGGTTCCTGGAAATCCATGGATCAACAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCGGGCGGCGACAACAATGCTA
gi|21380                      :  AAGTTTCCAATCAATGCAT----CAAGAAATGAA-----AGC----------GCTA------CACA---GGTGACAAC-ATGCTA
gi|21381                      :   AGTTTCATGGAAATCCAT----TGATAATTGAA-----AGC----------GCTA------TACA---AGTGGCAAC-ATGCTA
gi|21382                      :   AGTTTCATGGAAATCCAT----TGACAAATGAA-----AAC----------GCCA------GACA---GGCGACAAC-ACGGTA
gi|21383                      :   AGTTTCCAGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGCTAGA------GATA------GCCG---GG---CAAC-ATGCTA
gi|21384                      :      TTCCTGGATATCCAT----CCACAAATGAA-----AGC----------GTTA------TCCA---GGCGACAAC-ATGCTA
gi|21385                      :      TTCCTGGAAATCCAT----CAACAAATGAA-----AGT----------GCTA------TCCA---GGTGACAAC-AT
gi|21386                      :                TCCAT----CAGCAAATGAA-----AGC----------GCAA------T-CA---AGCAACAAC-ATACTA