lowQualScore                  :                                                                                                              1111111111111111111                              4444444444444444444444444444444444444444444444444                                                                                         555555555555555555555555555555555                    111  1111                      111111111111111111111                                                  111111111111111111                  444444444444444444444444444                                             22222222222222                         222222222   1111111     11                            1111111111111         22222222222222      222222                          4444444444444444444444444              1                                                   
lowQualScore                  :          2 44 2 2  44 4444   2 333 2 1 555  3  1   555   22   22  1   22    1 1 55   4444   2222   6666    1 3333333333333333333     1    1 1    11 7777   1  5555555555555555555555555555555555555555555555555 222 33 333333  11   4444444 1 1 1 1  555555555555 1 44444     6666666666     44444 1    111111111111111111111111111111111   44444  1 5555555 000  7777 1   1 222  666666 11 777777777777777777777 222  33333    1 1 22 444 11 11   2  4444 44444 1 111111111111111111 1     1 33 11 1  444444444444444444444444444   1   999  6666   7777 1 888888  44444 2222 88888888888888 2 5 1 1 1  5 1    222 1 111111111   7777777     22 22 1  666  1 5 1 55 99     8888888888888     555 11111111111111    1 888888  55    666666666   2     0000000000000000000000000 1 555 22     0  1 333       1 55   2     22  2    99999   22     
lowQualScore                  :          . .. . .  .. ....   . ... . . ...  .  .   ...   ..   ..  .   ..    . . ..   ....   ....   ....    . ...................     .    . .    .. ....   .  ................................................. ... .. ......  ..   ....... . . . .  ............ . .....     ..........     ..... .    .................................   .....  . ....... ...  .... .   . ...  ...... .. ..................... ...  .....    . . .. ... .. ..   .  .... ..... . .................. .     . .. .. .  ...........................   .   ...  ....   .... . ......  ..... .... .............. . . . . .  . .    ... . .........   .......     .. .. .  ...  . . . .. ..     .............     ... ..............    . ......  ..    .........   .     ......................... . ... ..     .  . ...       . ..   .     ..  .    .....   ..     
lowQualScore                  :          0 88 0 0  88 2222   0 555 0 9 222  8  9   777   55   55  8   55    5 5 22   8888   8888   3333    3 8888888888888888888     2    2 2    77 8888   2  5555555555555555555555555555555555555555555555555 222 00 666666  77   1111111 2 2 2 2  222222222222 2 33333     2222222222     11111 2    777777777777777777777777777777777   77777  3 5555555 000  6666 3   3 333  666666 88 000000000000000000000 333  33333    2 2 00 777 77 77   5  4444 11111 3 111111111111111111 3     3 22 88 3  666666666666666666666666666   3   444  3333   4444 3 222222  55555 9999 44444444444444 7 3 3 3 3  5 3    333 3 666666666   9999999     44 00 5  111  5 9 5 66 55     2222222222222     222 11111111111111    7 000000  44    000000000   3     0000000000000000000000000 8 777 11     5  9 333       9 66   0     66  1    33333   99     
consensus                     : CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TC---TG---TC----T--TCA----T-C---A---CT----GN-CC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CCAGA---G-GA---GGTAC---T-G-CAGA--A--T----------CC----AC---G---A-GGT----CTC-C-------AGCCCT--G-T-AGT-G---TG-AT---C--A----------C--------G-G---TC--T--GTAT-C-T-CT---T--C--ATT-CT----T-C---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--T-CTA---T---C-GTT-GT---G---A---TCA-GTA---TA----AAC---CA-G--A---TC---C-C----CG-----CCGT---CT-G-T-C-A-CTGC-TATG---T-C-C--C---NTGG-AT-N-GTTCCCN-G--A-CT---TG-G-T-T-GTG-ATTGA---CT---TC---AGTAG---TN-NN----------CCCT-GA---TTGA-CGTTG-------AGGAGCTTCAT-G---G-----T-GTT-N---T---T-A---T-CCCCGCGTG-T---CCAGACT-TC-TTCNTCACT-CAG-ACAG-GC-AACA--TTGTA
Reference ( gi|102283 )       : CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TC---TG---TC----T--TTA----T-C---A---CT----CT-CC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CCAGA---G-GA---GGTAC---T-G-CAGA--A--T----------CC----AC---G---A-GGT----TTC-C-------AGTTCT--T-T-AGT-G---TG-GT---C--A----------T--------G-G---TC--T--GTAT-C-T-CT---T--C--ATT-CT----T-C---A-C----AA--TA--------T-TCACA-G--T--T-CTA---T---G-ATT-GT---G---A---TCA-GTA---TA----AAC---CA-G--G---TC---C-C----CA-----CTGT---TT-G-T-C-A-CTAC-TATG---T-C-T--T---GTGG-AT-A-GTTCCCA-G--A-CT---TG-G-T-T-GTG-ATTGA---TT---TG---AGTAG---TG-AT----------CCCT-GA---TTGA-TGTTG-------AAGAGTTTCAT-G---G-----A-GCT-T---T---T-A---T-CCCCACCTG-T---CCAGATT-TC-TTCATCACT-CAG-ACAG-GC-AACA--TTGTA
gi|102284                     : CAGAAGAAT-A--G-A-GT--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ATT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTT----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TT---TG---TC----A--TTT----T-C---A---CT----TT-CC---A--T------TA--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CCAGC---G-GA---GGCAC---T-G-CAGA--C--T----------CC----AC---G---A-GGT----ATC-C-------AATTCT--G-T-AGT-G---TG-AT---C--A----------T--------G-G---TC--T--GTAT-C-T-CT---T--C--ATT-CT----T-T---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--T-CTA---T---C-ATC-GT---A---A---TCA-GTA---TA----AAC---CA-G--A---TC---C-C----CG-----CTGT---TT-G-T-C-A-CTGC-TATG---T-A-C--C---ATGG-AG-T-TTTCCCA-G--A-AT---TT-G-T-T-GTG-AGTGA---CT---TG---AGTAG---TG-AT----------CCCT-GA---TTGA-TGCTG-------TAGAGTTTAAT-G---G-----T-GTG-A---C---C-A---C-TTCCATTTG-T---CCAGATC-TC-CTCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACA--TTGTA
gi|102285                     : CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ATT--GA-ATA--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------ATAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TC---CA---TC----T--TT----------------T----TT-T-------T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CAAGA---G-GA---GGTAC---T-G-CAGA--C--A----------CC----AC---A---A-GGT----TTC-C-------AGTTCT--G-T-AGT-C---TG-AT---C--A----------C--------A-G---TC--T--GTAT-C-T-CT---T--C--ATT-CT----T-C---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--T-CTA---T---C-ATA-CC---A---A---TCA-GTA---TA----AAC---CA-G--A---TC---C-C----CG-----CTGT---TT-G-T-C-A-CTGT-AAGG---T-A-C--T---GTGG-AT-T-TTCCCCA-G--A-CT---TG-G-T-T-GTG-ATTGA---CT---TG---AGTAG---TG-AT----------GGCT-GA---TTGA-TGCTG-------TAGAGTTTCAT-G---A-----T-GCT-G---C---T-A---T-CTCCACTTG-T---CCAGATT-TC-CTCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACG--TTGTA
gi|102286                     : CAGATGAAT-A--T-A-GT--T----TGC-A---ATT-A---TG-AT-CGT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--TTC----TCT----TTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-CACA-A-CTTT--G----CAT-TG---AC---TG---GG----A--TCA----T-C---A---TT----AT-TC---A--T------GG--AAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CCAGA---G-GA---GGAAC---T-A-CAGA--C--A----------CC----AT---A---A-GGT----CTC-C-------ACCCCT--G-T-AGT-T---TG-AT---C--A----------T--------G-G---TC--T--GTAT-C-T-CT---T--C--ATT-CT----T-C---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--TATC-CCA-------------GT---A---A---TCA-GTA---TA----AAC---CA-G--A---TC---C-C----CA-----CTGT---TT-G-T-C-A-CTGC-TATG---T-C-T--G---TTGG-AT-A-GTTCCCT-G--A-CT---TG-G-T-T-GTG-ATTGA---CT---TG---AGTAG---TG-TC----------CCCT-GA---TTGA-TGCTG-------TAGAGTTTCAT-G---G-----T-GCT-G---C---T-A---T-TTCCACGTG-T---CCAGATT-TC-CTCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACA--TTGTA
gi|102287                     : CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---AGT-C---TG-GT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-A--GTC----GCT----TTTG-AACCAG-A------------------GAAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TGATTTC---TG---TC---------A----T-C---A---CT----GA-TC---A--T------GGGTTAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---T-CCAGA---G-GA---GGTAC---A-A-CAAAC-A--T----------TG----A----G---A-GGT----TTC-C-------ATCCCTGTT-TGAGT-G---TG-AT---C--A----------C--------G-C---TC--C--GTAC-G-A-TT---T--C--CTT-CT----T-T---A-C----AA--TG--------T-TTACA-G--T--T-CTA---T---C-ACT-GA---C---A---TCA-GTA---TA----AAC---CA-G--G---TC---A-C----CA-----CTGT---TT-G-T-C-A-CTGC-TATG---T-C-A--T---TTGG-AG-T-GTACCCA-G--A-CT---TT-G-T-T-CTG-ATTGA---CT---GG---AGTAA---TG-AT----------CTAT-GA---TTGA-TGCTG-------TAAAGTTTCAT-G---A-----A-GCT-G---T---T-T---T-CTCCTCGTG-T---CCAGATT-TC-TCCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACA--TTG
gi|102288                     : CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GTT-G---ACC-T---TG-AT-CAT---TAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--CTC----TCT----GTGG-AGTCAA-A------------------ATAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---CT---TGTTATC----T--TT-----------A---CT----GT-TC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-TCAGA---G-GG---GGTAC---T-G-CTGAC-A--T----------TG----A----A---A-GGT----CTC-C-------ACCCCT--G-T-AGT-G---TG-AT---C--A----------G--------G-G---TC--T--GTAT-C-T-GT---T--T--ATT-CT----T-C---A-C----TA--TA--------T-GTACA-G--T--T-TTA---T---T-CTT-CG---G---A---TCG-GTA---TA----AAC---AA-G--A---TC---C-C----CA-----TTCC---GT-G-T-C-A-CTGC-TATG---T-C-C--T---CTGG-CA-C-GTTCCCT-G--A-CT---CA-G-T-C--T--ATTGA---TG---TC---AATAT---TG-TA----------CCCT-G------GA-GGTTG-------ACGAGCTTCAT-----G-----A-TTT-TG--T---T-A---T-TCCCACGTG-T---CCAGATT-TC-TTCATCA
gi|102289                     : CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ATC-C---TG-AT-CAT---CAA--ATT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCTAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-GG---TT---T----CC----TA-TCA----T-C---A---CT----GA-TC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-TCAGA---A-GC---GGTAC---T-G-CAGAC-A--T----------TG----A----A---A-GGT----TGC-C-------ACCCCT--G-T-AGT-G---TA-AT---G--A----------C--------C-G---TC--T--GTGT-C-T-GT---A--C--ATT-CT----T-C---A-C----TA--GG--------T-TTACA-G--T--T-CTA---T------T-----------A---TCA-GTA---TA----AAC---AA-G--A---TA---T-C----CATC---CCG-----T-G-T-T-A-CCGC-TAGG---T-C-C--C---AT-G-AT-GCGCTTCAT-G--A-CT---TG-GTT-T-GT--ATTGA---TG---TC---AGTAG---TT-CA----------CCCT-GG----TG---GTCG-------AGTAGTTTCAT-G---A-----T-ATT-G---T---C-A---T-CCCAACATG-T---CCAGACT-TG-ATCCTCACT-GAA-GCAG-CT-GACA--CTGTA
gi|102292                     : CAAACGAAT-A--G-A-GA--G----GTC-G---ACC-T---TG-AT-CAT---CTG--ACT--GA-ATA--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------TAAACG-CACA-A-CTTT--G----GATATG---T----TA---TC----A--TTT----T-C---A---CT----GT-TC---A--T------TG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--G-------T-C---A-CCAGA---N-NN---NNNNN---N-N-NNNN--N--N----------NN----NN---N---N-NNN----NNN-N-------NNNNNN--N-N-NNN-N---NN-NN---N--NNNNNNNNNNNT--------G-A---TC--T--GTAT-C-T-GT---T--T--ATT-TT----T-C---A-C----TA--TG--------T-TTACA-G--T--T-CT----T---GTGCT-GG---G---G---TCG-GTA---TA----AAC---AA-G--A---TC---T-C----CG-----CTCC---GT-G-C-C-A-CTGC-TATG---T-C-C--C---GCGG-CT-C-ATGCCCC-G--A-CT---CA-G-T-T-TGG-ATCGA---CT---CC---AGTAG---TT-CT----------CCCT-G------GA-GGTTG-------CGGAGCTTTAT-G---A---------T-T---T---T-GTCTT-CCCCACTTG-T---CCAGATT-TT-TTCGTCACT-GAG-ACAG-GT-AACG--CTG
gi|102291                     : CAGATGAAT-A--A-A-GG--G----CAC-A---ATC-T---TG-GT-CAT---CAT--ATT--GA-ATA--GTTT-G-T--GTA----TTC----AAGG-AGCCAT-A------------------GTAACG-GACA-A-CAAT--G----GAT-TG---TTGGTTA---TC----T--TTA--------------CT----GT-CC---A--T------GA--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---T-TCATC---G-GA---GGTAC---T-G-CAGA--C--A----------CC----AT---G---G-GGT----CTC-C-------ACCCCT--G-T-AGTCG---T--AT---C--A----------A--------G-G---T---T--GTAT-T-C-TT---T--C--ATT-CT----T-C---A-C-----A--TG--------T-TCACA-GT-T--T-CTA---TC--C-AGT-AT-----------CCA-GTAG--TA----AACGA-CA-G--A---TC---C-C----TG-----AT-T---CT-G-T---A-CTGC-TAT----T-C-TTCT---GGGG-GT---GTTTCCA-G--A-CTCC-TG-G-T-T-AT--ATTGG---CT---TG---AGTA----TG-AT----------CCTTAGA---TT---TTCTG-------TAGAGTGCCAT-AAGTG-----A-TTA-T---T---C-A---T-CTCCAAGTG-T---CCAATTT-TCATTTAT-ATT-CCG-ACAGAGC--ACA--TTGTA
gi|102290                     : CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GTT-T---ATT-C---TG-AT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-TTGGGC-----------ATAGCAGTCAC-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TG---TT---CC----A--TCA----T-C---A---CT----GT-GC---A--T------GA--TAA-------C-T-A-G-GA-A--A-------C-CATAA-CAACA---G-GA---GGTAC---A-G-CAGAC-A--T-----------T----GC---T---A-GGT----CTC-C-------ATCCCT--G-T-AGT-T---TG-AT------A----------T--------G-G---CT--T--TCAT-T-T-TG---C--T--GTTGGT----T-T---A-C----AG--AG--------T-TCACA-G--T--T-CTA---T---C-TTC-GT---A---G---TTT-GTA---TA----AA----CA-A--G---TC---CAC----CA------TAC---TT-G-T-TAA-CTGT-TATG---T-C-A--T---TTGG-AA-T-GTACCCA-G--A-CA---AG-G-C-T-GTG-ATTGC---AT---TG---CGTGT---TG-AT----------CCGT-TA---TTGA-TTCTG-------AGGAGGTTTAT-A---G---------T-G---T---T-A---T-AGCCAGAAG-T---CCAGATTGTT-TTTAT-ACT-CCA-ACAG-GC-CACA--TTGTA
gi|102293                     : CATATGAAT-ATGG-A-G---G----GAC-G---AGC-C---TG-GT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-GAGCAG-A------------------GTAAGG-GACA-T-CTTT--G----GAT-TG---TT---TT---TCAACAT--TCA----T---------CT----C--CC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TATT--A-------T-C---A-TCAGA-----GA---GGTAG---T-G-CAGAC-A--T----------------AC---GATTA-GGT----ATC----------ACCCT--G-T-AGT-G---TG-AT---C--A----------C--------G-G---TA--C--GTAT-T-T-CT---T--C--ATT-CT----T-T---A-CTCT-CA--GG--------T-TTACA-G--T--T-------T---C-ATT-ATA--G---G---TC--GTA---TATT--GAC---AA-G--A---TC---C-CAAAGCC-----CCG-----T-G-T-C---CCGC-TATGGTCC-C-T--C---TTGG-AT-G-GAACCCT-G--ACCT---TA-G-T-T-CTT-ATTGA---ATAGGTC---AGTAGTTTTT-AC----------TCCT-GG-----AA-CGTTG-------AGGAGCTTCAT-G---GTCTTTATGCT-G---T---T-ATG-T-CCCTGTCTG-T---CCAGACT-T
gi|102295                     : CATATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---AGC-C---TG-GT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TT---TT---TC----A--ACA----T-C---A---CT----CT-CC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TA-T--A-------T-C---A-TCAGA---G-GC---GGTAG---T-G-CAGA--
gi|102294                     : CATATGAAT-A--GGA-GAA-G----GAC-G---AGCAC---TG-GT-CATAT-CAA--ACT--GA-ATG--GTT--G-T--GTC----TCT----GTGG-GACCAG-A------------------GTAACGTGACA-T-CTTT--G----GAT-----------TG---TT----T--TTAACATT-C---A---CT----CTCCC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TA-T--A-------TCC---A-TCAGA-----GA---GG--C---T-GTCAGAC-A--T----------------AC---GATTA-GGT----ATC----------ACCCT--G-T-AAG-G---TG-AT---C--ACT--------T--------G-G---TA--C--GTATAT-T-CT---T--CCGATT-CT----T-T---A-C------------------T-TCAGG-T--T--T-TTACACT---C-ATTAATCA-G---G---TCA-GTA---TA----GAC---TA-A--G---AT---C-C----CAAGCCCCCG-----T-G-T-C-A-CCGC-TATG---TCC-C--C---TTGG-AT-G-GAACCCT-G--A-CTG--TA-G-T-T-CTT-ATTGAATGTC---AG---AGTTT---TT-A-----------CCCT-GG-----AA-CG-TG-------AGGAGCTTCAT-G---G-------TCT-TTGCT---T-A---TGTCCCGCTTGAT---CCAGACT-TG-ATCTTCACA-CGG-AGAA-ACTAACA--CTGTAcatagataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttggatggaaccctgacttagttcttattgatgtcagtagtttaccctggacgttgaggagcttcatggttttgttattcccgcttgtccagacttgatcttcaccgagacaactaacactgta
gi|102296                     :  AGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTT----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------ATAACG-CACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TT---TT---TC----A--TCA----C-C---A---CT----GA-CC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-T---A-CCAGA---G-GC---GGCAC---T-G-TAGAC-A--T----------TG----A----G---A-GGT----ATC-C-------ACCCCT--G-T-AGT-G---TG-AT---C--A----------C--------G-G---TC--T--GTAT-C-T-GT---T--G--GTT-CT----T-C---A-C----TA--GG--------T-TGACA-G--T--T-CCA---T---C-ATT-AG---G---G---TCA-GAA---TA----AAT---AA-G--A---TC---A-C----CG-----TTCT---GT-G-T-C-A-CTGC-TATG---T-C-C--C---ACGG-CG-T-TTTCTTG-G--A-CT---TG-GTT-T-GT--ACTGA---TG---AC---AGCAG---TT-TT----------CCCT-GA------A-GGTTG-------AGGAGCTTCAT-A---A-----T-GTT-G---C---T-A---T-TCCCGCGTG-T---CCAGACT-TG-ATCTTCACT-GAG-ACAG-CT-AACA--CTGTA
gi|102297                     :  AGATGAAT-A--C-A-GG--G----GAC-G---AGC-G---TG-AT-CAT---CGA--AAT--GA-ATG--GATT-G-T--A------TCT----GTG-------G-A------------------GTAACG-GACA-ATTTTT--A----CAC-TG---TT---TGA--TC---------A----T-C---A---CT----TA-CC---A--TGATACAGG--TAA-------C-C-A-G-GG-T--C-------T-C---A-TCAGA---A-G----GGTAG---T-G-CAGAC-A--C----------TG----AC-------A-GGTGTCATTC-CA------AG--------T-AGT-T---TG-AG---C--A----------T--------T-G---CC--T--CTAT-C-T-GT---T--A--ATT-TT----T-C---ATC----AG--GG--------T-TTACA-G--T----------------GTT-AC---T---A---TCA-GTA---TA----AACATGCA-A--GATATCCGTC-C----CG-----C---------G-T-C-G-CTGC-TAAA---T-C-C--T---TTGG-GT-T-ATTCCCT-G--A-AT---TG-A-T-T-TTT-ATAGA---TG---AC---AGTAC---TT-AA----------CCC-------TTGA-GTTTA-------AGGAAATTCTT-G---A-----T-ATT-G---T---T-A---T-TTCTACAGG-C---CAGGATT-TCTTTTTTCACT-GAC-TCAG-CT-AACA--TTG
gi|102298                     :   GATGAAT-A--C-A-AA--G----ATT-T---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ATT--CA-ATG--GTTT-G-C--TTT----TCT----TTGA-GACCAG-ACGAACCTGTGGGCAAGGCATAACG-GACA-A-TTTT--T----GAT-TG---------A---TT----C--CAA----T-C---AATTCT----GT-CC---A--T------GG--TTA-------C-C-A-G-AA-T--G-------T-C---A-CCATT---G-AA---GGTAA---C-A-CAGA--C--T----------TT----GA---A---A-GGC----TGC-C-------AACCCT--C-C-AGC-T---TG-AT---G--A----------C--------T-T---CC--T--GTAT-C-T-GC---T--T--ATT-TT----T-G---A-C----CA--TG--------T-TTACA-G--T--T-TT----T---GTACC-AT---C---A---TCT-GTG---TA----GAA---GA-G--A---TT---A-C----CA-----TCCT---TT-G-C-A-A-CCGC-TATG---T-C-A--C---ATGGCAC-A-TTTCCC--G--A-TT---TG-G-T-T-TCA-ACTGA---CC---TC---AATAGCC-TG-------------CCCT-G------GA-GATTG-------CATAATCTCAT-----G-----A-TCT-T---T---TCA---T-TTCCACGGA-T---CCAGATT-TC-TTCATCGCT-GAG-GCAT-GT-AACACCTCGTA
gi|102299                     :     TGAAT-AA-G-A-GA--G----GGG-GTTAACC-C---CG--T-CATGTTCAA---CT--GA-ATGAGGTTT-GCT--TTC----TCT----TCAG-AGCCAGCA------------------GTAGCG-GACA-A-CTTTAGA----GAC-TG---TT---CGTAATC----T--CTA----G-C---A---CT----GA-TC---ATTT------GG--TGA-------C-CTA-GCGA-T--A-------T-C---ATTTAAT---GTGA---GGTACTTTT-G-CAAA----------------CC----ACGGAG---A-GGT----GTCGC-------GACTCC--TGG-AGT-G---TGAAT---C--A----------C--------G-G---TC--TC-GTAT-CTT-CT---C--T--ATT-CT----T-C---A------AC--TAGGTTGGAGC-TTACGTG--T--T-C---------G-TTT-AT-----------TCG-GTA---TAGGGTAAC---AATT--G---TC---T-C-----------CTGTCCCTC-G-T-T-A-CTGT-TA-G---T-T-T--TCCATTGG-TC-T-GTTCCT--G--A-AG---CG-G-TCT-GT--ATTGA---T---------AGT-G---TG-GTATTAGTTTCCCCCT-GA----TG---GTTG-------AGGAG-CTCAT-G---A-----T-GTT-G---T---T-A---T-CTCC
gi|102300                     :      GAATGA--G-ATGA--G----GAC-T---GCC-CAACTG-A--CAT---CGT--ACT--GG-ATG--GTCT-G-TT-GTC----TCT----GTGG--GCCAG-AA-----------------GTAACG-CACC-A-CT----G----GAT-TG---TC---T-----C----T---------------A---CT----GA-TC---A--T------GG--TA--------C-C-A-G-GA-G--A-------T-G---A-T-AGC---G-GG---CGGAC---CCA-CAGA----------------CT----AA---G---A-G-T----CCC-C-------ACCCCT--G-T-AGT-GCTGTG-AT---C--A----------C--------G-G---TA--C--GTGT-C-TTCT---G--T--GCTGCT----T-C---A-C----TAGGTA--------T---ATA-G--T----CTA---T---T-ATC-AT---A---G---TCA-GTA---TA----AAAA--CA-A--A---TC---G-C----CGTC---CCG-------G-T-C-A-CGGT-T--G---T-C-C--C---CTGG-ATCA-GTCCCCATG--A-AC---TG-G-T-TTGTT-ATTGA---TT---TGTCGAGTCG---TT-CA----------CTCT-G------GAGCGTTG-------AGGAGCTTCATTG---G-----T-GTTGT---C---T-A---C-TCCCACATG-T---CCAGACT-TG-TTCTTCACT-CAG-ACAG-CT-AACA--
gi|102302                     :      GAAT-A--T-A-AA--G----GATTG-----C-C---TGTGT-CAC---TGT--ATT--GT-ATT--TCTT-G-T--GTG----ACT----GTAG-GTCCAG-A------------------GTAACG-GACT-A-CTTT--A----GCT-GG---TA---TA---TA----A--ACA----T-C---A---GA----CA-GC---A--T------GG--TGA-------C-C-A-G-TA-A--G-------T-C---G-TCTGT---G-GA---GGTAC---T-A-CAGAT-G--G----------CC-----T---G---T-GGT----CTC-C-------AGCCCT--G-T-AGT-T---TG-AT---C--A---------------------G---ACATT--CTAT-C-T-TC---C--C--ATT-CT----T-C---T-G----TA--TG--------T-TGATA-C--T--T-CTA---T---C-CTTAAT---G-------TCA-GTG---TA----CAC---CA-G--A---TC---T-C----C------CTCC---CTGG-T-C-A-CCGT-CAGA---T-C-A--T---CTGG-AG-A-ATTTCCT-G--A-CT---TT-G-T-T-ATG-ATCTC---CC---CC---AGTAG---TG-TC----------CCCT-CAGTGTCGA-TGT
gi|102301                     :      GAAT-T--G-A-GA--GATAAGAC-G---AGC-C---CG-AT-CAT---CAA--ACT--GATATG--CTTT-G-T--GTC----TCT----GTGA-AGCCAG-A------------------GTATCG-CACA-A-CTTT--G----GAT-TG--------TG---TCCCATT--TCA----T-C---A---CG----GA-CC---T--T------GA--TAA-------CAC-G-G-GA-GCCA-------T-C---A-TCAgtctgatgatgttatttttacc
gi|102303                     :        AT-A--G-G-GGAGG----GAA-G---ACC-CA--CG-ATTCAT---CAATAACTAGGA-ATG--GTTTTG-TA-GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------ATAACG-CACACA-CCTT--G----GAT-TGCA-TT---TA---TC---------A----TCC---A---CT----AT-CCATTA--T------AA--TAA-------C-C-ATG-GA-G--ATGAGAAGT-C---A-TCAGA---T-GG---TGCGT---T-A-CAGC--A--TGGAGCGATGGTCAATAAC---G---ACGGT----CTC-CACCCCGGAGTGCT-------GA-G---TG-G----C--A----------TAAGCGACGA-A---TC--T--GTTT-T-T-CT---G--C--TTA-CT----T------------AG--TA--------TATTATA-GTAT--C-CTA---T----------T---A---A---TCA-GTAT--TACT--AAC---AA-G--A---TC---C-C----CGGCC--CCG-----T-G-TCC-ACCCACTTATG---T-C-C--C---CTGT-AT---GTTCGC--GTTA-CT---TG-A-T-T-GTtgcacgcaaccccatcagtccacctcggcagtacacgcgaaggttcaccacaccccctgtagtgttatgacgcacggatctctttattctcaccctaggtatcagttttatctggtagcgtcagtataaacgcatcaccgccctggtcactgttaagtcacctggcctgtttcttgactagcaggtttcttagaattgacagtagtgtacccctg
gi|102304                     :                                     C-C---TGTAT-CAC---TGT--ATT--GT-ATT--TCTT-G-T--GTG----ACT----GTAG-AACCAG-A------------------GTAACG-GACT-A-CTTT--A----ACT-GG---TG---TG---AG----A--AGA----T-C---A---GA----CA-CC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TA-A--G-------T-C---A-TCTGT---G-GA---GGTAC---T-A-CAGAT-G--G----------CC----TC---T-----GGT----CTC-C-------AGCCCT--G-T-AGT-T---TG-AC---CAGA----------T--------G-T---TC------TAT-C-T-TG---C--C--ATT-CT----T-C---
gi|102305                     :                                                   T---CAA--ACT--GG-ATA--ATTT-C-C--TTC----TCTTCACGT-----CCAT-G------------------ATACCG-GACA-A-CTCT--A---------G---TT---TC---AC----T--T------T-C---C---CT----CG-TC---A--T------TA--CGA-------C-C-A-A-AA-G--A-------T-C---G-TCAGC---G-GA---AGTGA---C-G-CAAA--A--G----------CC----AT---G---A-ACT----CCC-C-------AACCAT--G-T-ACA-T---TG-AT---C--A----------A--------T-G---TT--T--CACT-C-T-GT---T--C--ATG-TT----T-T---A-C----AA--TG--------T-
gi|102306                     :                                                                           TT-G-T--GTG----ACT----GTAG-AACCAG-A------------------GTAACG-GACT-A-CTTT--A----GCT-GG---TGA--TA---GA----TAATCA----T-C---A---GA----CA-GC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TA-A--G-------T-C---G-TCTGT---G-GA---GGTAC---T-A-CAGATGG--C----------CC----AT---------GGC----CTC-C-------AGTCCT--G-T-AGT-C---TG-AC---C--A----------A--------GCA---TT--C--G----C-T-CT---TGCC--ATT-CT----T-C---G-C----TC--TG--------T-TGATA-C--T--T-TTA---T---C-TCC-CC---G---G---TCA-GTG---TA----CAC---CA-GATG---TC---CTT----CA-----CTG-------G-T-G-A-CCGT-CAGA---T-C-T--T---CTGG-AG-A-TTTTCCT-G--A-TT---TG-A-T-G-GTG-AT
gi|102307                     :                                                                           TT-G-T--TTC----ACT----GTGT-CTCCAT-G------------------ATAACG-GGCA-A-TTTT--A----TTT-TG---GC---TA---TA----A--TCA----G-T---A---GT----AT-CC---A--T------AC--TGA-------C-C-A-G-GA-T--G-------T-C---C-CCTGA---C-TT---CGTGC---A-G-CATA--G--T----------CT----GT---C---T-GGA----TGC-C-------AGCCCT--G-T-GAT-G---TG-GT---T--A----------TCA------GTG---TC--TCGGT-T-C-T-CC------C--GTG-TC----T-G---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--T-CT----------ATT-GTGAGG---A---TCA-CTG---TA----TAC---CA-G--T---TC---T-C----C------CTGC---CTGG-T-C-A-CTGT-GATG---T-CAT--T---AGGG-A--A-GTTTTTA-C--A-TG---TG-G-T-G-GTG-Actccaccagtagtttccccttagtgtccatgtgtatgacggtcttactgtcaccacg
gi|102308                     :                                                                           TT-G-T--ATCACTTTCT----GTC----CCTG-A-------------------TAACG-AACA-A-TTTT--GC---GAT--G---AC---T----------T--TTA----T-C---A-----------------A--T------AG--TAAAAACTGAT-C-A-G-GA-T--A-------T-C---C-CCTGA---T-CT---GGTGC---A-G-CAAA--G--T----------CC----CC---T-----GGT----TTC-C-------AGCCCC-------GC-G---TG--C---C--G----------T--------G-A---AC--A--GTGT-C-T-CTG--T--C---TT-CCCGTGT-CTG-A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--T-C-----------GTT-GG---GACCA---TCA-CTG---TA----AAT---CA-G--C---TC---T-C-----------GTGT---CT-GTT-C-A-CTGT-AATG---T-C-
gi|102309                     :                                                                            T-G-T--GTCAC--TCT----CTGC-C-CCTG-A-------------------TAACG-GACA-A-TTTT--G----TAA-CG---AC---T----------T--CTA----T-CGATA---GT----AA-AC---A--T------AC--TGA-------C-C-A-A-GA-T--A-------T-C---C-CCTGA---C-CT---GGTGA---G-G-CAAA--G--T----------CC----CC---C---T-GGT----TTC-C-------AGCCCT--G-T-GGT-G---TG-GTGAAC--A----------G--------T-G---TC--T--CTGT-C-T-TT---C--C--ATG-TC----T-G---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--T-CT----------GTT-GG---G---A---CCA-TCACAGTA----AAT---AA-G--T---TC---T-C----CA------TAT---CT-GTT-C-A-CTGT-AATG---T-C-attagggtatt
gi|102310                     :                                                                                    TC----TCT----GTC----CCTG-A-------------------TAACG-GACA-A-TTTT--ACTATGAC-T----TC---CA---CC----A--ATA----G-T---A---C--------AC---A--T------AC--TGA-------C-C-A-A-GA-T--G-------T-C---C-CCTGA---T-CT---GGTAC---A-G-CACA--G--T----------CC----CT---C---T-GGA----TAC-C-------AGCCCT--G-T-GTT-G---TG-GT---G--A----------T--------C-AATTTC--T--CTGT-C-T-TC---C--C--GTG-TC----T-G---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--T-CT----------ATT-GA---G---ACTTTCA-CTG---TA----AAT---CA-G--T---TC---T-C----C------CTGT---CT-GTT-C-A-CTGT-AATG---T-C-attagggtatt
gi|102311                     :                                                                                    TC----TCT----GTC----CCTG-A-------------------TAACG-GACA-A-TTTT--GTGAAGAC-T----TC---CA---TC---------A----G-T---A---GT----AT-GC---A--T------AC--TGA-------C-C-A-G-GA-T--G-------T-C-----CCTGA------ATCTGGTAC---A-G-CACA--G--T----------CC----CT---G---T-GGA----ATC-C-------AGTCCC--TGT-AGT-G---TG-TT-----------------T--------G-A---TC--A--GTGT-C-T-CTG--T--C---TT-CTGG--TGCTGAA-C----AA--TA--------T-TCACT-G--T--T-C
gi|102312                     :                                                                                    TC----TCT----GTT----CCTG-A-------------------TAACA-GAGA-A-TTTT--G----AAA-TG---AT---T----CC----T--GTA----T-C---A---GTAGTACT-CA---AC-T------GG----A-------G-C-A-G-GA-T--G-------T-C-----CCAGATCTG-G-----GTAC--------AGA--AGTT----------CC----AT---C---T-GAT----ACG-C-------AGCCCC--G-T-GG--G---TG-G---------------------------G-A---TC--A--GTGT-C-T-CTGTCT--C--CCT-TT----T-T---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--TCCTA---TTGCG-AT---A---G---A---TCA-CTG---TA----AA
gi|102313                     :                                                                                           CT----GTGT-AGCCAG-A------------------ATATCG-CACA-A-CTTT--G----GAT-T-----C---CG---TT----TCATCA----T-C---A---CT----GG-CC---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-TTAGC---G-GC---GGTAC---T-G-TAGAC-A--T----------AG----A----G---A-GGT----TTC-C-------ACCCCT--G-T-AGT-G---TG-AT---C--A----------C--------G-G---TA--C--GTAC-C-T-GT---T--T--ATT-CT----T-C---A-C----TA--GG--------T-TTATA-G--T--G-TTA---T---T-ATC-AG---G---G---TCA-GTA---TA----AAC---AA-G--A---TC---T-C----CGTC---CCG-----C-G-T-C-A-CTGT-TATG---C-C-A--C---ATGG-TT-T-CTTCCCA-G--A-CT---TG-GTT-T-GT--ATTGA---TG---TC---AGTCG---TT-CA----------CTCT-G------GA-GGTTG-------AGGAGCTTCAT-G---G-----T-GTTGTTG-T---T-A---T-ACCCACATG-T---CCAGACT-TG-TTCTTCACT-CAG-ACAG-CT-AACA--CTGT
gi|102314                     :                                                                                                       GCCAG-A------------------GTAACG-CACA-A-CTTT--G----CTT-TG---AC---TG---TA----T--TTA----T-C---A---TT----GA-TC---A--T------GG--TAA-------T-C-A-G-GA-G--A-------T-T---G-TTGGA---G-GA---GGTTC---T-G-CAGA--C--T----------TT----GC---A---T-GGT----TTC-C-------AGTTCT--G-T-AGT-C---TG-AT---C--A----------T--------G-G---TC--T--TTAT-C-T-CT---T--T--ATT-CT----T-C---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--T-CTA---T---C-ACT-GT---C---A---TCG-GTA---TA----AAC---GA-G--A---TC---C-C----CG-----CTGT---AT-G-T-C-A-CTGC-TATG---T-C-T--G---CTGG-AT-A-TTTCCCG-G--A-TC---TT-G-T-T-CTG-ATTGA---CT---TG---AGTAG---TA-AT----------CCCT-GA---TTGA-TGCTG-------AAGAGTTTCAT-G---G-----T-GGT-G---T---C-A---T-TTCCACATG-T---CCAGATT-TC-TTCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACA--TCGTA
gi|102315                     :                                                                                                                                   ACG-AACA-A-TTTT--GC---GAT--G---AC---T----------T--TTA----T-C---A---AT----GT-AA---A--A------AC--TGA-------T-C-A-G-GA-T--A-------T-C---C-CCTGA---T-CT---GGT-------G-CAGA--AAGT----------CC----CC---T-----GGT----TTC-C-------AGCCCG--C---GGT-G---CG-GTGAAC--A----------G--------T-G---TC--T--CTGT-C-T-TC---C--C--GTG-TC----T-G---A-C----AA--TG--------T-TCACA-G--T--T-CT----------GTT-G----G---A---CCA-TCATGGTA----AAT---CA-G--C---TC---T-C-----------GTGT---CT-GTT-C-A-CTGT-AATG---T-C-
gi|102316                     :                                                                                                                                                                                                                                                                   -C---A-TCAGA---C-GC---GGTAC---T-G-TAGAT-A--T----------AG----A----G---A-GGG----TAC-C-------ACCCCT--G-T-AGT-G---TG-AT---G--A----------C--------G-G---GA--C--GGAT-C-T-TC---T--T--ATT-CT----T-C---A-C----TA--GG--------T-TTATA-G--T--T-TTA---T---C-TTTAGT---G-------TCA-GTA---TA----AAC---AA-G--A---TC---C-C----CG-----CCCC---GT-G-T-G-A-CGGT-TATG---T-C-C--C---CTGG--T-ACTTTCCCT-G--A-CT---TG-GTT-T-GTG--CTGA---TG---AC---AATAG---TT-TC----------CCCT-G------GA-CGGTG-------AGGAGCTTCAT-G---A---------T-T---TCGCT-A---T-CCCCGCACG-T---CCAGACT-TG-GTCATCATT-GAG-ACAG-CT-AACA--CTGattagggtatt
gi|102301                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AT-C-T-CT---T--T--ATT-C-----T-C---A-CCCTAGG--TA--------T----CA-G--T--T-TTATC-T---G-GTA-GC---G-------TCA-GTA---TA----AACG--CA--------TC---A-C----CG-----CC-C---TG-G-T-C-A-CTGT-TAAG---T-C-A--C---CTGG-CC-T-GTTTCTT-G--A-CTAGCAG-G-T-T--TC-TTAGA---AT---TGAC-AGTAG---TGTAC----------CCCT-G
gi|102296                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaattgagagataagacgagcccgatcatcaaactgatatgctttgtgtctctgtgaagccagagtatcgcacaactttggattgtgtcccatttcatcacggaccttgataacacgggagccatcatcatgcacgcaaccccatcagtccacctcggcagtacacgcgaaggttcaccacaccccctgtagtgttatgacgcacggT-GT---C---A---TCA-GTA---CA----AAC---CA-A--G---TC---C-
gi|102317                     :                                                                                                                                                                                                                                     agatgaatagagaggacgaccctgatcatcaaactgaatggtttgtgtttctgtggagccagaataacgcacaactttggattgtttttcatcaccactgaccatggtaaccaggagattaccagaggcggcactgtagacattgagaggtatccacccctgtagtgtgatcacggtctgtatctgttggttcttcactaggttgacagttccatcattagggtcagaataaataagatcaccgttctgtgtcactgctatgtcccacggcgttttctt---A---TCAAGTAATTTA----AAC---CA-G--A---AC---C-C----CA-----TTGT---TT-G-T-C-G-CTGC-TATG---T-C----C---ATGG-A--A-TGTCCCT-G--A-AT---TATG-T-T-GGG-ATT-A---CT---GG---AGTAG---TG-AT----------CCCC-AG---ATGA-TGCTGTATACATAAGAGTTCAAT-----------A-GTT-TATAT---T-A---T-CTC--TCTG-TGTCCCAAATT-TC-TTCATCACTGCAGAACAGTGC-CACA--TTgcagttttccctgaaggttgaggagcttcataatgttgctattcccgcgtgtccagacttgatcttcactgagacagctaacactgta
gi|102318                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              T-G-T-C-A-CTGC-TATG---T-C-C--C---GCGG-TC-T-GTTTCCT-G--A-CT---CG-G-T-T--TGTATGGA---TG---CC---AGTAG---TT-TA----------CCCT-G-----T-A-GGTTG-------AGGAGCTTCAT-----------A-ATT-T---TGC-T-A---T-TCCCGCGTG-T---CCAGACG-TG-TTCTTCACT-GAG-ACAG-CT-AACA--
gi|102295                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agatctccgtcccgTGG-AT-G-GAACCCT-G--A-CT---TA-G-T-T-CTT-ATTGA---TG---TC---AGTAG---TT-TA----------CCCT-G------GA-CGTTG-------AGGAGCTTCAT-G---G-----T-TTT-G---T---T-A---T-TCCCGCTTG-T---CCAGACT-TG-ATCTTCACC-GAG-ACAA-CT-AACA--CTGTA

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        1111111111111111111                              33333333333333333333           111111111111                                                                                                         444444444444444444444444444444444                                          1111                11111111111111111111                                                               2222222222222222222222222                   11111                    2222222222222222                                                                 111111111     111111111111                     2222222                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1 44 1 1  44 4444   1 333 1 1 555  3  1   555   22   22  1   22    1 1 55   4444   2222   5555    1 3333333333333333333     1    1 1    11 6666   1  11111111111111111111 11 22 1   333333333333 222 33 333333  11   3333333 1 1 1 1  4444 3333333 1 33333     44444 4444    8888888888888888888888 1    777777777777777777777777777777777 1 11 222 66666 1  66666 1     222 11 1 1 1111  333 1 6666 11 55555555555555555555  1  22    1 1 22  11 11   2   22 1 6666  1  1 0    33  22222  4444444444444444444444444   1   999  6666   11111 11 1   444444 2222 4444444444444444 5 33333 1       11 1  1  22 1 1  888888    1  22  1  666  1 1 1 666666666     222222222222  222   666 333    1 5555555    5555555           3  777777  1 1 333 1 1 22 1    2 3  1 1       1 44   1     2   2    77777   22     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    . .. . .  .. ....   . ... . . ...  .  .   ...   ..   ..  .   ..    . . ..   ....   ....   ....    . ...................     .    . .    .. ....   .  .................... .. .. .   ............ ... .. ......  ..   ....... . . . .  .... ....... . .....     ..... ....    ...................... .    ................................. . .. ... ..... .  ..... .     ... .. . . ....  ... . .... .. ....................  .  ..    . . ..  .. ..   .   .. . ....  .  . .    ..  .....  .........................   .   ...  ....   ..... .. .   ...... .... ................ . ..... .       .. .  .  .. . .  ......    .  ..  .  ...  . . . .........     ............  ...   ... ...    . .......    .......           .  ......  . . ... . . .. .    . .  . .       . ..   .     .   .    .....   ..     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    9 55 9 9  55 0000   9 333 4 8 000  6  8   444   44   44  7   44    5 5 00   7777   7777   1111    2 1111111111111111111     2    2 2    77 2222   2  99999999999999999999 77 99 2   999999999999 111 33 555555  77   9999999 2 2 2 2  7777 9999999 2 99999     11111 9999    2222222222222222222222 2    333333333333333333333333333333333 2 77 666 11111 2  99999 2     111 77 2 2 4444  333 2 4444 77 77777777777777777777  2  99    2 2 66  77 77   4   55 2 6666  2  2 5    11  88888  6666666666666666666666666   3   444  3333   11111 88 3   000000 7777 6666666666666666 2 22222 3       88 3  3  00 0 5  777777    5  55  5  111  5 5 5 222222222     333333333333  777   333 000    6 3333333    4444444           3  777777  7 7 999 7 7 44 7    5 0  8 8       8 99   0     0   0    44444   88     
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TC-TG---TC----N--T--C--A-TCA---CT-GNC---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CCAGA---G-GA---GGTA---------------C---T--G-CAGA--A--T----------CC----AC---G---A-G-G--TC--T-----C-CA---G-C-CCTGT---A--G-T-G----TG---A-T----C--A----C----------G----GT-CT--GTAT-C-T-CTT--C--ATT-CTTC-A-C---NAT-GT-TCACAG--TT-C---TA-----TC--GTC-GT--G---A---TCA-GTA---TA----AAC---C-A--G-ATC-C----C----CG---C--CGT--CT--G-T-----C-ACTGCTA--T-GT-CC--CNT-GG-AN-C-GTTC-CCT-GA-CT---TG-G-T-T-----GTG-ATTGAC--T---T--C-AG---TAG---TNNNCCCT-GA-TGA-CGTTG-------AGGAGCTTCAT-GG------TG-T-T--GT-T-A--T-CCCCGCGTG-T-CCAGATT-TC-TTCATCACT-CAG-ACAG-GC-AACA--TTGTA
Reference ( family-532 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TC-TG---TC----T--T--C--A-TCA---CT-GNC---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CCAGA---G-GA---GGTA---------------C---T--G-CAGA--A--T----------CC----AC---G---A-G-G--TC--T-----C-CA---G-C-CCTGT---A--G-T-G----TG---A-T----C--A----C----------G----GT-CT--GTAT-C-T-CTT--C--ATT-CTTC-A-C---AAT-GT-TCACAG--TT-C---TA-----TC--GTT-GT--G---A---TCA-GTA---TA----AAC---C-A--G-ATC-C----C----CG---C--CGT--CT--G-T-----C-ACTGCTA--T-GT-CC--CNT-GG-AT-N-GTTC-CCN-GA-CT---TG-G-T-T-----GTG-ATTGAC--T---T--C-AG---TAG---TNNNCCCT-GATTGA-CGTTG-------AGGAGCTTCAT-GG------TG-T-T--NT-T-A--T-CCCCGCGTG-T-CCAGACT-TC-TTCNTCACT-CAG-ACAG-GC-AACA--TTGTA
gi|102283                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TC-TG---TC----T--T--T--A-TCA---CT-CTC---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CCAGA---G-GA---GGTA---------------C---T--G-CAGA--A--T----------CC----AC---G---A-G-G--TT--T-----C-CA---G-T-TCTTT---A--G-T-G----TG---G-T----C--A----T----------G----GT-CT--GTAT-C-T-CTT--C--ATT-CTTC-A-C---AAT-AT-TCACAG--TT-C---TA-----TG--ATT-GT--G---A---TCA-GTA---TA----AAC---C-A--G-GTC-C----C----CA---C--TGT--TT--G-T-----C-ACTACTA--T-GT-CT--TGT-GG-AT-A-GTTC-CCA-GA-CT---TG-G-T-T-----GTG-ATTGAT--T---T--G-AG---TAG---TGATCCCT-GATTGA-TGTTG-------AAGAGTTTCAT-GG------AG-C-T--TT-T-A--T-CCCCACCTG-T-CCAGATT-TC-TTCATCACT-CAG-ACAG-GC-AACA--TTGTA
gi|102284                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGAAGAAT-A--G-A-GT--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ATT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTT----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TT-TG---TC----A--T--T--T-TCA---CT-TTC---C---A--T------TA--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CCAGC---G-GA---GGCA---------------C---T--G-CAGA--C--T----------CC----AC---G---A-G-G--TA--T-----C-CA---A-T-TCTGT---A--G-T-G----TG---A-T----C--A----T----------G----GT-CT--GTAT-C-T-CTT--C--ATT-CTTT-A-C---AAT-GT-TCACAG--TT-C---TA-----TC--ATC-GT--A---A---TCA-GTA---TA----AAC---C-A--G-ATC-C----C----CG---C--TGT--TT--G-T-----C-ACTGCTA--T-GT-AC--CAT-GG-AG-T-TTTC-CCA-GA-AT---TT-G-T-T-----GTG-AGTGAC--T---T--G-AG---TAG---TGATCCCT-GATTGA-TGCTG-------TAGAGTTTAAT-GG------TG-T-G--AC-C-A--C-TTCCATTTG-T-CCAGATC-TC-CTCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACA--TTGTA
gi|102285                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ATT--GA-ATA--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------ATAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TC-CA---TC----T--T-------TTT---TT--------------T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CAAGA---G-GA---GGTA---------------C---T--G-CAGA--C--A----------CC----AC---A---A-G-G--TT--T-----C-CA---G-T-TCTGT---A--G-T-C----TG---A-T----C--A----C----------A----GT-CT--GTAT-C-T-CTT--C--ATT-CTTC-A-C---AAT-GT-TCACAG--TT-C---TA-----TC--ATA-CC--A---A---TCA-GTA---TA----AAC---C-A--G-ATC-C----C----CG---C--TGT--TT--G-T-----C-ACTGTAA--G-GT-AC--TGT-GG-AT-T-TTCC-CCA-GA-CT---TG-G-T-T-----GTG-ATTGAC--T---T--G-AG---TAG---TGATGGCT-GATTGA-TGCTG-------TAGAGTTTCAT-GA------TG-C-T--GC-T-A--T-CTCCACTTG-T-CCAGATT-TC-CTCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACG--TTGTA
gi|102286                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--T-A-GT--T----TGC-A---ATT-A---TG-AT-CGT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--TTC----TCT----TTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-CACA-A-CTTT--G----CAT-TG---AC-TG---GG----A--T--C--A-TCA---TT-ATT---C---A--T------GG--AAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-CCAGA---G-GA---GGAA---------------C---T--A-CAGA--C--A----------CC----AT---A---A-G-G--TC--T-----C-CA---C-C-CCTGT---A--G-T-T----TG---A-T----C--A----T----------G----GT-CT--GTAT-C-T-CTT--C--ATT-CTTC-A-C---AAT-GT-TCACAG---------TA-----TC--CCA-GT--A---A---TCA-GTA---TA----AAC---C-A--G-ATC-C----C----CA---C--TGT--TT--G-T-----C-ACTGCTA--T-GT-CT--GTT-GG-AT-A-GTTC-CCT-GA-CT---TG-G-T-T-----GTG-ATTGAC--T---T--G-AG---TAG---TGTCCCCT-GATTGA-TGCTG-------TAGAGTTTCAT-GG------TG-C-T--GC-T-A--T-TTCCACGTG-T-CCAGATT-TC-CTCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACA--TTGTA
gi|102287                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---AGT-C---TG-GT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-A--GTC----GCT----TTTG-AACCAG-A------------------GAAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TGATTTC-TG---TC-------------A-TCA---CT-GAT---C---A--T------GGGTTAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---T-CCAGA---G-GA---GGTA---------------C---A--A-CAAAC-A--T----------TG----A----G---A-G-G--TT--T-----C-CA---T-C-CCTGTTTGA--G-T-G----TG---A-T----C--A----C----------G----CT-CC--GTAC-G-A-TTT--C--CTT-CTTT-A-C---AAT-GT-TTACAG--TT-C---TA-----TC--ACT-GA--C---A---TCA-GTA---TA----AAC---C-A--G-GTC-A----C----CA---C--TGT--TT--G-T-----C-ACTGCTA--T-GT-CA--TTT-GG-AG-T-GTAC-CCA-GA-CT---TT-G-T-T-----CTG-ATTGAC--T---G--G-AG---TAA---TGATCTAT-GATTGA-TGCTG-------TAAAGTTTCAT-GA------AG-C-T--GT-T-T--T-CTCCTCGTG-T-CCAGATT-TC-TCCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACA--TTG
gi|102288                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GTT-G---ACC-T---TG-AT-CAT---TAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--CTC----TCT----GTGG-AGTCAA-A------------------ATAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---CT-TG---TT----A--T--C--T-TTA---CT-GTT---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-TCAGA---G-GG---GGTA---------------C---T--G-CTGAC-A--T----------TG----A----A---A-G-G--TC--T-----C-CA---C-C-CCTGT---A--G-T-G----TG---A-T----C--A----G----------G----GT-CT--GTAT-C-T-GTT--T--ATT-CTTC-A-C---TAT-AT-GTACAG--TT-T---TA-----TT--CTT-CG--G---A---TCG-GTA---TA----AAC---A-A--G-ATC-C----C----CATT-C--CG----T--G-T-----C-ACTGCTA--T-GT-CC--TCT-GG-CA-C-GTTC-CCT-GA-CT---CA-G-T-C------T--ATTGAT--G---T--C-AA---TAT---TGTACCCT-G---GA-GGTTG-------ACGAGCTTCAT-GA------TT-T-T--GT-T-A--T-TCCCACGTG-T-CCAGATT-TC-TTCATCA
gi|102289                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ATC-C---TG-AT-CAT---CAA--ATT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCTAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-GG---TT-T----CC----TA-T--C--A-TCA---CT-GAT---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-TCAGA---A-GC---GGTA---------------C---T--G-CAGAC-A--T----------TG----A----A---A-G-G--TT--G-----C-CA---C-C-CCTGT---A--G-T-G----TA---A-T----G--A----C----------C----GT-CT--GTGT-C-T-GTA--C--ATT-CTTC-A-C---TAG-GT-TTACAG--TT-C---TA-----TT--------------A---TCA-GTA---TA----AAC---A-A--G-ATA-T----C----CATC-C--CG----T--G-T-----T-ACCGCTA--G-GT-CC--CAT--G-ATGC-GCTT-CAT-GA-CT---TG-G-T-T------TGTATTGAT--G---T--C-AG---TAG---TTCACCCT-GG-TG---GTCG-------AGTAGTTTCAT-GA------TA-T-T--GT-C-A--T-CCCAACATG-T-CCAGACT-TG-ATCCTCACT-GAA-GCAG-CT-GACA--CTGTA
gi|102290                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GTT-T---ATT-C---TG-AT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-TTGGGC-----------ATAGCAGTCAC-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TG-TT---CC----A--T--C--A-TCA---CT-GTG---C---A--T------GA--TAA-------C-T-A-G-GA-A--A-------C-CATAA-CAACA---G-GA---GGTA---------------C---A--G-CAGAC-A--T-----------T----GC---T---A-G-G--TC--T-----C-CA---T-C-CCTGT---A--G-T-T----TG---A-T-------A----T----------G----GC-TT--TCAT-T-T-TGC--T--GTTGGTTT-A-C---AGA-GT-TCACAG--TT-C---TA-----TC--TTC-GT--A---G---TTT-GTA---TA----AAC---A-A--G-----T----C----CA---C--CATACTT--G-T-----TAACTGTTA--T-GT-CA--TTT-GG-AA-T-GTAC-CCA-GA-CA---AG-G-C-T-----GTG-ATTGCA--T---T--G-CG---TGT---TGATCCGT-TATTGA-TTCTG-------AGGAGGTTTAT-AG------TG-------T-T-A--T-AGCCAGAAG-T-CCAGATTGTT-TTTAT-ACT-CCA-ACAG-GC-CACA--TTGTA
gi|102291                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGATGAAT-A--A-A-GG--G----CAC-A---ATC-T---TG-GT-CAT---CAT--ATT--GA-ATA--GTTT-G-T--GTA----TTC----AAGG-AGCCAT-A------------------GTAACG-GACA-A-CAAT--G----GAT-TG---TT-GG---TT----A--T--C--T-TTA---CT-GTC---C---A--T------GA--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---T-TCATC---G-GA---GGTA---------------C---T--G-CAGA--C--A----------CC----AT---G---G-G-G--TC--T-----C-CA---C-C-CCTGT---A--G-TCG----T----A-T----C--A----A----------G----GT--T--GTAT-T-C-TTT--C--ATT-CTTC-A-C----AT-GT-TCACAGT-TT-C---TA-----TC---CA-GT--A---T---CCA-GTAG--TA----AACGA-C-A--G-ATC-C----C----TG---A--T-T--CT--G-T-------ACTGCTA--T--T-CT--TCTGGG-GG-T-GTTT-CCA-GA-CTCC-TG-G-T-T-----AT--ATTGGC--T---T--G-AG---TA----TGATCCTTAGATTTT-C--TG-------TAGAGTGCCATAAG------TGAT-T--AT-TCA--T-CTCCAAGTG-T-CCAATTT-TCATTTAT-ATT-CCG-ACAGAGC--ACA--TTGTA
gi|102292                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAAACGAAT-A--G-A-GA--G----GTC-G---ACC-T---TG-AT-CAT---CTG--ACT--GA-ATA--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------TAAACG-CACA-A-CTTT--G----GATATG---T--TA---TC----A--T--T--T-TCA---CT-GTT---C---A--T------TG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--G-------T-C---A-CCAGA---N-NN---NNNN---------------N---N--N-NNNN--N--N----------NN----NN---N---N-N-N--NN--N-----N-NN---N-N-NNNNN---N--N-N-N----NN---N-N----N--N----NNNNNNNNNNTG----AT-CT--GTAT-C-T-GTT--T--ATT-TTTC-A-C---TAT-GT-TTACAG--TT-C---TT-----GT--GCT-GG--G---G---TCG-GTA---TA----AAC---A-A--G-ATC-T----C----CG---CTCCGT------G-C-----C-ACTGCTA--T-GT-CC--CGC-GG-CT-C-ATGC-CCC-GA-CT---CA-G-T-T-----TGG-ATCGAC--T---C--C-AG---TAG---TTCTCCCT-G---GA-GGTTG-------CGGAGCTTTAT-GA------TT-T-T--GT-C-T--T-CCCCACTTG-T-CCAGATT-TT-TTCGTCACT-GAG-ACAG-GT-AACG--CTG
gi|102293                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATATGAAT-ATGG-A-G---G----GAC-G---AGC-C---TG-GT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-GAGCAG-A------------------GTAAGG-GACA-T-CTTT--G----GAT-TG---TT-TT---TCAACAT--T--C--A-TCT---C----C---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TATT--A-------T-C---A-TCAGA-----GA---GGTA---------------G---T--G-CAGAC-A--T----------------AC---GATTA-G-G--TA--T-----C------A-C-CCTGT---A--G-T-G----TG---A-T----C--A----C----------G----GT-AC--GTAT-T-T-CTT--C--ATT-CTTT-A-CTCTCAG-GT-TTACAG--TT------------TC--ATT-ATA-G---G---TC--GTA---TATT--GAC---A-A--G-ATC-C----CAAAGCC---C--CG----T--G-T-----C--CCGCTA--TGGT-CCCTCTT-GG-AT-G-GAAC-CCT-GACCT---TA-G-T-T-----CTT-ATTGAA--TAGGT--C-AG---TAGTTTTTACTCCT-GG--AA-CGTTG-------AGGAGCTTCAT-GGTCTTTATG-C-T--GT-T-ATGT-CCCTGTCTG-T-CCAGACT-T
gi|102294                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATATGAAT-A--GGA-GAA-G----GAC-G---AGCAC---TG-GT-CATAT-CAA--ACT--GA-ATG--GTT--G-T--GTC----TCT----GTGG-GACCAG-A------------------GTAACGTGACA-T-CTTT--G----GAT-TG---T-------TT----T--TAAC--ATTCA---CTCTCC---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TA-T--A-------TCC---A-TCAGA-----GA---GG-----------------C---T--GTCAGAC-A--T----------------AC---GATTA-G-G--TA--T-----C------A-C-CCTGT---A--A-G-G----TG---A-T----C--A----CTT--------G----GT-AC--GTATAT-T-CTT--CCGATT-CTTT-A-C--------T-TCAGGT--TT-T---TACAC--TC--ATTAATCAG---G---TCA-GTA---TA----GAC---TAA--G-ATC-CCAAGC----CC---C--CG----T--G-T-----C-ACCGCTA--T-GTCCC--CTT-GG-AT-G-GAAC-CCT-GA-CTG--TA-G-T-T-----CTT-ATTGAA--TG--T--C-AG----AGTT-TTTACCCT-GG--AA-CG-TG-------AGGAGCTTCAT-GG------TC-T-TTGCT-T-A--TGTCCCGCTTGAT-CCAGACT-TG-ATCTTCACA-CGG-AGAA-ACTAACA--CTGTA
gi|102295                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---AGC-C---TG-GT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------GTAACG-GACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TT-TT---TC----A--A--C--A-TCA---CT-CTC---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TA-T--A-------T-C---A-TCAGA---G-GC---GGTA---------------G---T--G-CAGA--
gi|102295                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --CTT-GG-AT-G-GAAC-CCT-GA-CT---TA-G-T-T-----CTT-ATTGAT--G---T--C-AG---TAG---TTTACCCT-G---GA-CGTTG-------AGGAGCTTCAT-GG------TT-T-T--GT-T-A--T-TCCCGCTTG-T-CCAGACT-TG-ATCTTCACC-GAG-ACAA-CT-AACA--CTGTAcatagataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttggatggaaccctgacttagttcttattgatgtcagtagtttaccctggacgttgaggagcttcatggttttgttattcccgcttgtccagacttgatcttcaccgagacaactaacactgta
gi|102296                     : catatgaatagagaggacgagcctggtcatcaaactgaatggtttgtgtctctgtggagccagagtaacggacaactttggattgtttttcaacatcactctccatggtaaccagtatatcatcagaggcggtagtgcagacatagataggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGATGAAT-A--G-A-GA--G----GAC-G---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ACT--GA-ATG--GTTT-G-T--GTT----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------ATAACG-CACA-A-CTTT--G----GAT-TG---TT-TT---TC----A--T--C--A-CCA---CT-GAC---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-T---A-CCAGA---G-GC---GGCA---------------C---T--G-TAGAC-A--T----------TG----A----G---A-G-G--TA--T-----C-CA---C-C-CCTGT---A--G-T-G----TG---A-T----C--A----C----------G----GT-CT--GTAT-C-T-GTT--G--GTT-CTTC-A-C---TAG-GT-TGACAG--TT-C---CA-----TC--ATT-AG--G---G---TCA-GAA---TA----AAT---A-A--G-ATC-A----C----CG---T--TCT--GT--G-T-----C-ACTGCTA--T-GT-CC--CAC-GG-CG-T-TTTC-TTG-GA-CT---TG-G-T-T------TGTACTGAT--G---A--C-AG---CAG---TTTTCCCT-GA---A-GGTTG-------AGGAGCTTCAT-AA------TG-T-T--GC-T-A--T-TCCCGCGTG-T-CCAGACT-TG-ATCTTCACT-GAG-ACAG-CT-AACA--CTGTA
gi|102297                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGATGAAT-A--C-A-GG--G----GAC-G---AGC-G---TG-AT-CAT---CGA--AAT--GA-ATG--GATT-G-T--A------TCT----GTG-------G-A------------------GTAACG-GACA-ATTTTT--A----CAC-TG---TT-TG---------A--T--C--A-TCA---CT-TAC---C---A--TGATACAGG--TAA-------C-C-A-G-GG-T--C-------T-C---A-TCAGA---A-G----GGTA---------------G---T--G-CAGAC-A--C----------TG----AC---A---G-GTG--TCATT-----C-CA---A------GT---A--G-T-T----TG---A-G----C--A----T----------T----GC-CT--CTAT-C-T-GTT--A--ATT-TTTC-ATC---AGG-GT-TTACAG--T-----------------GTT-AC--T---A---TCA-GTA---TA----AACATGCAA--G-ATA-T----C----CGTC-C--CG----C--G-T-----C-GCTGCTA--A-AT-CC--TTT-GG-GT-T-ATTC-CCT-GA-AT---TG-A-T-T-----TTT-ATAGAT--G---A--C-AG---TAC---TTAACCC----TTGA-GTTTA-------AGGAAATTCTT-GA------TA-T-T--GT-T-A--T-TTCTACAGG-C-CAGGATT-TCTTTTTTCACT-GAC-TCAG-CT-AACA--TTG
gi|102298                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GATGAAT-A--C-A-AA--G----ATT-T---ACC-C---TG-AT-CAT---CAA--ATT--CA-ATG--GTTT-G-C--TTT----TCT----TTGA-GACCAG-ACGAACCTGTGGGCAAGGCATAACG-GACA-A-TTTT--T----GAT-TG------------A----T--T--CCAA-TCAATTCT-GTC---C---A--T------GG--TTA-------C-C-A-G-AA-T--G-------T-C---A-CCATT---G-AA---GGTA---------------A---C--A-CAGA--C--T----------TT----GA---A---A-G-G--CT--G-----C-CA---A-C-CCTCC---A--G-C-T----TG---A-T----G--A----C----------T----TC-CT--GTAT-C-T-GCT--T--ATT-TTTG-A-C---CAT-GT-TTACAG--TT-TTTGTA-----CC--ATC---------A---TCT-GTG---TA----GAA---G-A--G-ATT-A----C----CA---T--CCT--TT--G-C-----A-ACCGCTA--T-GT-CA--CAT-GG-CA-C-ATTT-CCC-GA-TT---TG-G-T-T-----TCA-ACTGAC--C---T--C-AA---TAG---CCTGCCCT-G---GA-GATTG-------CATAATCTCAT-GA------TC-T-T--TT-C-A--T-TTCCACGGA-T-CCAGATT-TC-TTCATCGCT-GAG-GCAT-GT-AACACCTCGTA
gi|102299                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGAAT-AA-G-A-GA--G----GGG-GTTAACC-C---CG--T-CATGTTCAA---CT--GA-ATGAGGTTT-GCT--TTC----TCT----TCAG-AGCCAGCA------------------GTAGCG-GACA-A-CTTTAGA----GAC-TG---TT-CGTAATC----T--C--T--A-GCA---CT-GAT---C---ATTT------GG--TGA-------C-CTA-GCGA-T--A-------T-C---ATTTAAT---GTGA---GGTA---------------CTTTT--G-CAAA----------------CC----ACGGAG---A-G-G--TG--T-----CGCG---A-CTCCTGG---A--G-T-G----TGA--A-T----C--A----C----------G----GT-CTC-GTAT-CTT-CTC--T--ATT-CTTCAA-C---TAG-GT-T-GGAG--CT-----TACGTGTTC--GTT--T--A---T---TCG-GTA---TAGGGTAAC---A-ATTG-TCT-C----C----TGT--C--CCT--C---G-T-----T-ACTGTTAGTT-TT-CC--ATT-GG-TC-T-GTT--CCT-GA-AG---CG-G-TCT-----GT--ATTGATAGT---G--T-GGTATTAGT--TTCCCCCT-GA-TG---GTTG-------AGGAGC-TCAT-GA------TG-T-T--GT-T-A--T-CTCC
gi|102300                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAATGA--G-ATGA--G----GAC-T---GCC-CAACTG-A--CAT---CGT--ACT--GG-ATG--GTCT-G-TT-GTC----TCT----GTGG--GCCAG-AA-----------------GTAACG-CACC-A-CT----G----GAT-TG---TC-T-----C----T------------A---CT-GAT---C---A--T------GG--TA--------C-C-A-G-GA-G--A-------T-G---A-T-AGC---G-GG---CGGA---------------C---CC-A-CAGA----------------CT----AA---G---A-G----TC--C-----C-CA---C-C-CCTGT---A--G-T-GCTG-TG---A-T----C--A----C----------G----GT-AC--GTGT-C-TTCTG--T--GCTGCTTC-A-C---TAG-GT-ATATAG--T--C---TA-----TT--ATC-AT--A---G---TCA-GTA---TA----AAAA--C-A--A-ATC------------G---C--CGT--CCCGG-T-----C-ACGGTT-----GT-CC--CCT-GG-AT-CAGTCC-CCATGA-AC---TG-G-T-TT----GTT-ATTGAT--T---TGTCGAG---TCG---TTCACTCT-G---GAGCGTTG-------AGGAGCTTCATTGG------TG-T-T--GTCT-A--C-TCCCACATG-T-CCAGACT-TG-TTCTTCACT-CAG-ACAG-CT-AACA--
gi|102301                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAAT-T--G-A-GA--GATAAGAC-G---AGC-C---CG-AT-CAT---CAA--ACT--GATATG--CTTT-G-T--GTC----TCT----GTGA-AGCCAG-A------------------GTATCG-CACA-A-CTTT--G----GAT-TG------TG---TCCCATT--T--C--A-TCA---CG-GAC---C---T--T------GA--TAA-------CAC-G-G-GA-GCCA-------T-C---A-TCAT----G-CA---CGCAACCCCATCAGTCCACC---TCGG-CAGT--A--C----------AC----GC---G---A-A-GGTTC--A-----C-CACACC-C-CCTGT---A--G-T-G----TT---A-TGACGC--A----C----------G----G--------AT-C-T-CTT--T--ATT-C-TC-A-C---CCTAGG-TATCAG--TT-T---TA-----TCTGGTA-GC--G-------TCA-GTA---TA----AAC--------GCATC-A----C----CG---C--C----CTG-G-T-----C-ACTGTTA--A-GT-CA--CCT-GG-CC-T-GTTT-CTT-GA-CTAGCAG-G-T-TTCTTAG-A-ATTGA----------C-AG---TAG---TGTACCC
gi|102302                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAAT-A--T-A-AA--G----GATTG-----C-C---TGTGT-CAC---TGT--ATT--GT-ATT--TCTT-G-T--GTG----ACT----GTAG-GTCCAG-A------------------GTAACG-GACT-A-CTTT--A----GCT-GG---TA-TA---TA----A--A--C--A-TCA------GACAG-C---A--T------GG--TGA-------C-C-A-G-TA-A--G-------T-C---G-TCTGT---G-GA---GGTA---------------C---T--A-CAGAT-G--G----------CC-----T---G---T-G-G--TC--T-----C-CA---G-C-CCTGT---A--G-T-T----TG---A-T----CAGA----C----------A----TT-C----TAT-C-T-TCC--C--ATT-CTTC-T-G---TAT-GT-TGATAC--TT-C---TA-----TC--CTTAAT--G-------TCA-GTG---TA----CAC---C-A--G-ATCTC----C----CT---C--C----CTG-G-T-----C-ACCGTCA--G-AT-CA--TCT-GG-AG-A-ATTT-CCT-GA-CT---TT-G-T-T-----ATG-ATCTCC--C---C--C-AG---TAG---TGTCCCCT-CAGT----GTCG-------ATGTGTCTGAT-GA------TG-T-T--AT-T-ctg
gi|102303                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AT-A--G-G-GGAGG----GAA-G---ACC-CA--CG-ATTCAT---CAATAACTAGGA-ATG--GTTTTG-TA-GTC----TCT----GTGG-AGCCAG-A------------------ATAACG-CACACA-CCTT--G----GAT-TGCA-TT-TA---TC----A--T--C-----CA---CT-ATC---CATTA--T------AA--TAA-------C-C-ATG-GA-G--ATGAGAAGT-C---A-TCAGA---T-GG---TGCG---------------T---T--A-CAGC--A--TGGAGCGATGGTCAATAAC---G---ACG-G--TC--T-----C-CA-----C-CCCGG---A--G-T-GC---TG---AGTGG--C--ATAAGC----------GACGAAT-CT--GTTT-T-T-CTG--C--TTA-CTT--------AGT-ATATTATAGTATC-C---TA-----T--------T--A---A---TCA-GTAT--TACT--AAC---A-A--G-ATC-C----C----CGGCCC--CG----T--G-TCCACCC-ACT--TA--T-GT-CC--CCT-GT-AT---GTTCGCGT-TA-CT---TG-A-T-T-----GTtttacc
gi|102304                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C-C---TGTAT-CAC---TGT--ATT--GT-ATT--TCTT-G-T--GTG----ACT----GTAG-AACCAG-A------------------GTAACG-GACT-A-CTTT--A----ACT-GG---TG-TG---AG----A--A--G--A-TCA---GA-CAC---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TA-A--G-------T-C---A-TCTGT---G-GA---GGTA---------------C---T--A-CAGAT-G--G----------CC----TC---T-----G-G--TC--T-----C-CA---G-C-CCTGT---A--G-T-T----TG---A-C----C--A---------------G----ATGTT--CTAT-C-T-TGC--C--ATT-CTTC-
gi|102305                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T---CAA--ACT--GG-ATA--ATTT-C-C--TTC----TCTTCACGT-----CCAT-G------------------ATACCG-GACA-A-CTCT--A----GTT-TC---AC-TT---TC----CC-T--C--G-TCA---TT-----------A--C------G-----A-------C-C-A-A-AA-G--A-------T-C---G-TCAGC---G-GA---AGTG---------------A---C--G-CAAA--A--G----------CC----AT---G---A-A-C--TC--C-----C-CA---A-C-CATGT---A--C-A-T----TG---A-T----C--A----A----------T----GT-TT--CACT-C-T-GTT--C--ATG-TTTT-A-C---AAT-GT-
gi|102306                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TT-G-T--GTG----ACT----GTAG-AACCAG-A------------------GTAACG-GACT-A-CTTT--A----GCT-GG---TGATA---GA----TAAT--C--A-TCA------GACAG-C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-TA-A--G-------T-C---G-TCTGT---G-GA---GGTA---------------C---T--A-CAGATGG--C----------CC----AT---------G-G--CC--T-----C-CA---G-T-CCTGT---A--G-T-C----TG---A-C----C--A----A----------GC---AT-TC--G----C-T-CTTGCC--ATT-CTTC-G-C---TCT-GT-TGATAC--TT-T---TA-----TC--TCC-CC--G---G---TCA-GTG---TA----CAC---C-A--G-ATG-T----C----CT---T--CAC--TG--G-T-----G-ACCGTCA--G-AT-CT--TCT-GG-AG-A-TTTT-CCT-GA-TT---TG-A-T-G-----GTG-ATCTCC--A---C--C-AG---TAG---TTTCCCCT-
gi|102307                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TT-G-T--TTC----ACT----GTGT-CTCCAT-G------------------ATAACG-GGCA-A-TTTT--A----TTT-TG---GC-TA---TA----A--T--C--A-GTA---GT-ATC---C---A--T------AC--TGA-------C-C-A-G-GA-T--G-------T-C---C-CCTGA---C-TT---CGTG---------------C---A--G-CATA--G--T----------CT-----------------G--TC--TGGATGC-CA---G-C-CCTGT---G--A-T-G----TGGTTA-T----C--A----G----------T----GT-CTCGGT-T-C-T-CC---C--GTG-TCTG-A-C---AAT-GT-TCACAG--TT-C---TA-----TT--GTG-AG--G---A---TCA-CTG---TA----TAC---C-A--G-TTC-T----C----C----C--TGC--CTG-G-T-----C-ACTGTGA--T-GT-Ctagtgtccatgtgtatgacggtcttactgtcaccacg
gi|102308                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TT-G-T--ATCACTTTCT----GTC----CCTG-A-------------------TAACG-AACA-A-TTTT--GC---GAT--G---AC-T----------T--T--T--A-TCA----------------A--T------AG--TAAAAACTGAT-C-A-G-GA-T--A-------T-C---C-CCTGA---T-CT---GGTG---------------C---A--G-CAAA--G--T----------CC----CC---T-----G-G--TT--T-----C-CA---G-C-CCCGC------G-T-GCCG-TG---A-A----C--A----G----------T----GT-CT--CTGT-C-T-TCC--C--GTG-TCTG-A-C---AAT-GT-TCACAG--T-------------TC--GTT-GG--GACCA---TCA-CTG---TA----AAT---C-A--G-CT--C----T----CG------TGT--CT--GTT-----C-ACTGTAA--T-GT-Cattagggaagtttttacatgtggtggtga
gi|102309                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-G-T--GTCAC--TCT----CTGC-C-CCTG-A-------------------TAACG-GACA-A-TTTT--G----TAA-CG---AC-T----TC----TA-T--C--G-ATA---GT-AAA---C---A--T------AC--TGA-------C-C-A-A-GA-T--A-------T-C---C-CCTGA---C-CT---GGTG---------------A---G--G-CAAA--G--T----------CC----CC---C---T-G-G--TT--T-----C-CA---G-C-CCTGT---G--G-T-G----TG---G-TGAA-C--A----G----------T----GT-CT--CTGT-C-T-TTC--C--ATG-TCTG-A-C---AAT-GT-TCACAG--TT-C---T----------GTT-GG--G---A---CCA-TCACAGTA----AAT---A-A--G-TTC-T----C----CA------TAT--CT--GTT-----C-ACTGTAA--T-GT-Cattagggtatt
gi|102310                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TC----TCT----GTC----CCTG-A-------------------TAACG-GACA-A-TTTT--------AC-TA---T---G---AC----T--T--CC-A-CCA---AT-AGTACAC---A--T------AC--TGA-------C-C-A-A-GA-T--G-------T-C---C-CCTGA---T-CT---GGTA---------------C---A--G-CACA--G--T----------CC-----C--------------TC--TGGATAC-CA---G-C-CCTGT---GTTG-T-GG---TG---A-T----C--A----A----------T----TT-CT--CTGT-C-T-TCC--C--GTG-TCTG-A-C---AAT-GT-TCACAG--TT-C---TA----------TT-GA--G---ACTTTCA-CTG---TA----AAT---C-A--G-TTC-T----C----C----C--TGT--CT--GTT-----C-ACTGTAA--T-GT-Cattagggtatt
gi|102311                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TC----TCT----GTC----CCTG-A-------------------TAACG-GACA-A-TTTT--GT---GA--AG---AC-T----------T--C--C--A-TCA---GT-AGTATGC---A--T------AC--TGA-------C-C-A-G-GA-T--G-------T-C-----CCTGA------ATCTGGTA---------------C---A--G-CACA--G--T----------CC----CT---G---T-G-G--AA--T-----C-CA---GTC-CCTGT---A--G-T-GTGTTTG---A-T----C--A----G----------T----GT-CT--CTGT-C-T-TCT--G--GTG-CTGA-A-C---AAT-AT-TCACTG--TT-C---
gi|102312                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TC----TCT----GTT----CCTG-A-------------------TAACA-GAGA-A-TTTT--GAAATGAT-T----CC-TG---TA----T-----C--A-GTA---GT-ACT---C---AACT------GG----A-------G-C-A-G-GA-T--G-------T-C-----CCAGATCTG-G-----GTA---------------C---------AGA--AGTT----------CC----AT---C---T-G-A--TA--C-----G-CA---G-C-CCCGT---G--GGT-G----GG---A-T----C--A----G----------T----GT-CT--CTGT-C-T-C----C--CTT-TTT--A-C---AAT-GT-TCACAG--TTCC---TA-----TT--GCG-ATA-G---A---TCA-CTG---TA----AA
gi|102313                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CT----GTGT-AGCCAG-A------------------ATATCG-CACA-A-CTTT--G----GAT-T-----C-CG---TT----TCAT--C--A-TCA---CT-GGC---C---A--T------GG--TAA-------C-C-A-G-GA-G--A-------T-C---A-TTAGC---G-GC---GGTA---------------C---T--G-TAGAC-A--T----------AG----A----G---A-G-G--TT--T-----C-CA---C-C-CCTGT---A--G-T-G----TG---A-T----C--A----C----------G----GT-AC--GTAC-C-T-GTT--T--ATT-CTTC-A-C---TAG-GT-TTATAG--TG-T---TA-----TT--ATC-AG--G---G---TCA-GTA---TA----AAC---A-A--G-ATC-T----C----CGTC-C--CG----C--G-T-----C-ACTGTTA--T-GC-CA--CAT-GG-TT-T-CTTC-CCA-GA-CT---TG-G-T-T------TGTATTGAT--G---T--C-AG---TCG---TTCACTCT-G---GA-GGTTG-------AGGAGCTTCAT-GGTGT---TG-T-T--GT-T-A--T-ACCCACATG-T-CCAGACT-TG-TTCTTCACT-CAG-ACAG-CT-AACA--CTGT
gi|102314                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCCAG-A------------------GTAACG-CACA-A-CTTT--G----CTT-TG---AC-TG---TA----T--T--T--A-TCA---TT-GAT---C---A--T------GG--TAA-------T-C-A-G-GA-G--A-------T-T---G-TTGGA---G-GA---GGTT---------------C---T--G-CAGA--C--T----------TT----GC---A---T-G-G--TT--T-----C-CA---G-T-TCTGT---A--G-T-C----TG---A-T----C--A----T----------G----GT-CT--TTAT-C-T-CTT--T--ATT-CTTC-A-C---AAT-GT-TCACAG--TT-C---TA-----TC--ACT-GT--C---A---TCG-GTA---TA----AAC---G-A--G-ATC-C----C----CG---C--TGT--AT--G-T-----C-ACTGCTA--T-GT-CT--GCT-GG-AT-A-TTTC-CCG-GA-TC---TT-G-T-T-----CTG-ATTGAC--T---T--G-AG---TAG---TAATCCCT-GATTGA-TGCTG-------AAGAGTTTCAT-GG------TG-G-T--GT-C-A--T-TTCCACATG-T-CCAGATT-TC-TTCATCACT-CAG-ACAG-GC-CACA--TCGTA
gi|102315                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACG-AACA-A-TTTT--GC---GAT--G---AC-T----------T--T--T--A-TCA---AT-GTA---A---A--A------AC--TGA-------T-C-A-G-GA-T--A-------T-C---C-CCTGA---T-CT---GGT-----------------------G-CAGA--AAGT----------CC----CC---T-----G-G--TT--T-----C-CA---G-C-CC-GC---G--G-T-GCGG-TG---A-A----C--A----G----------T----GT-CT--CTGT-C-T-TCC--C--GTG-TCTG-A-C---AAT-GT-TCACAG--TT-C---T----------GTT-G---G---A---CCA-TCATGGTA----AAT---C-A--G-CT--C----T----CG------TGT--CT--GTT-----C-ACTGTAA--T-GT-C
gi|102316                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -C---A-TCAGA---C-GC---GGTA---------------C---T--G-TAGAT-A--T----------AG----A----G---A-G-G--GT--A-----C-CA---C-C-CCTGT---A--G-T-G----TG---A-T----G--A----C----------G----GG-AC--GGAT-C-T-TCT--T--ATT-CTTC-A-C---TAG-GT-TTATAG--TT-T---TA-----TC--TTTAGT--G-------TCA-GTA---TA----AAC---A-A--G-ATC-C----C----CG---C--CCC--GT--G-T-----G-ACGGTTA--T-GT-CC--CCT-GGTAC-T--TTC-CCT-GA-CT---TG-GTT-T-----GTG--CTGAT--G---A--C-AA---TAG---TTTCCCCT-G---GA-CGGTG-------AGGAGCTTCAT-GA------TT-T-C--GC-T-A--T-CCCCGCACG-T-CCAGACT-TG-GTCATCATT-GAG-ACAG-CT-AACA--CTGattagggtatt
gi|102317                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---A---TCAAGTAATTTA----AAC---C-A--G-AAC-C----C----CA---T--TGT--TT--G-T-----C-GCTGCTA--T-GT--C--CAT-GG-AA-T-G-TC-CCT-GA-AT---TATG-T-T-----GGG-ATT-AC--T---G--G-AG---TAG---TGATCCCC-AGATGA-TGCTGTATACATAAGAGTTCAAT-AG------TT-TAT--AT-T-A--T-CTCTCTGTG-TCCCAAATT-TC-TTCATCACTGCAGAACAGTGC-CACA--TT
gi|102318                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -A--G-ATC-T----C----CGTC-C--CGT------G-T-----C-ACTGCTA--T-GT-CC--CGC-GG-TC-T-GTTT-CCT-GA-CT---CG-G-T-TT----GT--ATGGAT--G---C--C-AG---TAG---TTTACCCT-G--T-A-GGTTG-------AGGAGCTTCAT-AA------TT-T-T--GC-T-A--T-TCCCGCGTG-T-CCAGACG-TG-TTCTTCACT-GAG-ACAG-CT-AACA--