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lowQualScore                  :              11   2  1    1     2222  1  111 1  2  33333 11 11 222 2  1 1   55  44444  2  77777777   11  111  2 333 1 1 2222   1 2222 1     1 1   77   1 1 222    6 33        
lowQualScore                  :              ..   .  .    .     ....  .  ... .  .  ..... .. .. ... .  . .   ..  .....  .  ........   ..  ...  . ... . . ....   . .... .     . .   ..   . . ...    . ..        
lowQualScore                  :              55   2  1    1     3333  1  999 1  2  88888 55 55 999 2  1 1   66  22222  2  44444444   55  999  2 111 1 1 4444   1 4444 1     3 3   99   3 3 333    7 55        
consensus                     :       TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TTGT-AAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
Reference ( gi|74892 )        :       TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-CCGG-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TTGA-AAC-G-A---AATGTC--TATTTTAC
gi|74878                      :       TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-T-G-TT-T-CCGG-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---A-A-A----CGA-A----T-CTGCT-G-TTGT-AACAA-A---AATGCC--TCTTTTAC
gi|74893                      :      aTATATAG--TCA-GC-TCAC-GTTAC----AA-CA---G-CC-AT-----A--T--T-C-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGC--AG---TC-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TTGT-AAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74879                      :       TGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTAAC----AA-CG---A-C--AC-----G--T--T-C-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGT--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TTGT-AAC-G-A---AATGCC--TATGTTAC
gi|74880                      :      aTATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-T-G-TT-T-CCGG-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A-----A-A----CGA-A----T-CTGCT-G-TTGT-AAC-A-A---GATG-C--TTCTTTAC
gi|74894                      :      aTATACAG--TGA-GC-TCTT-GTTAC----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-T-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-C----CGA-A----T-CTACC-A-TTGT-AAC-GAA---AATGCC--TATTTT
gi|74895                      :       TGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-TG---G-CC-AC-----G--T--T-T-G-TT-T-CTGA-AC-----AT-TT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CAA-A----T-CTGCC-G-TTCT-AAC-G-AAATAATGCC--TGTTTTAC
gi|74896                      :       TAGACAG--TCA-GG-TCTC-ATTAC----AA-TG---G-CC-AT-----G--T--T-T-G-TT-T-CTGA-TC-----AT-TT--------TGT--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTACC-G-TTGT-AAC-A-A---AATGCC--TATTATAC
gi|74884                      :       TGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-ATGA-TC-----AT-TTAACGAATCTGC--CG---TT-G---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TTTT-AAC-A-A---AATGCC--CATTTT
gi|74883                      :      aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T--------------------------TGC--CG---AT-A---T-A-A----TGA-A----T-CTGCC-G-TTGT-AAC-G-A---AATGCC--CATTTTAC
gi|74885                      :      aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AT-----G--T--T-C-G-TT-T-TTA--TC-----AT-TT--------CGC--CG---TT-A---T-A-C----CGA-A----T-CTGCC-G-TTGT-AAC-G-A---TATGCC--TAT
gi|74886                      :      aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CT-AC-----G--T--T-T-G-TT-T-GCGG-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---A-A-A----GGA-A----T-GTGCT-G-TTGT-AAC-A-A---A
gi|74888                      :      aTATAGAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-T-G-TT----CGGTTC-----AT-TT--------TGC--TT---GT-A---T-A-G----C
gi|74889                      :      aTGTACAA--GCA-GC-TCT--GTTAC----AA-AG---G-CCCAC-----G--TATT-T-G-TA-T-TCGG-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TTAA---A-A-A----CGA--------TTG-T-G-TTGT-AAC---A---CTTGCC--TCTTTTAC
gi|74897                      :      aTATACGG--TCA-AC-TCTC-GATAT----AAACC---G-CC-AC-------------C-T-TT-T-TTGT-TCTTTGAATCTT--------TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTG
gi|74898                      :       TGTACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CC---G-CC-AC-----C--T--T-----TT-T----A-TC-----TT-TTGAATCCA-TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTGC
gi|74891                      :       TATACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CG-----CC-ACCTTTTG--T--T-C-T-TT-T-GAAT-CC-----AT------------GG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-gat
gi|74899                      :       aATACAG--TCA-AC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AC-----G--T--T-T-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CAA-A----T-CTGCC-G-TTGT-AAT-G-A---AATGCT--TATTTTACtggcgat
gi|74901                      :        ATAAAG--TCA-GC-TCTC-GTTAT----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-A-TTGT-AAC-G-A---TTTGCC--TATTTAAC
gi|74902                      :        ATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AC-----G--T--T-T-G--T-T-CCGG-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TTGA---TAA-A----CGA-A----T-CTGCTAG-TTGT-AAC-A-A---AATGCC--TCTTTTAC
gi|74900                      :        ATACAG--TCA-GC-TCTA-GCTAC----AA-CG---G-CC-AC-----A--T--T-C-A-TT-T-CCAA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTCCA-G-TTGT-AAC-A-A---AATGCC--AATTTTAC
gi|74903                      :        ATACAG--TCAAGC-TCTC-GTTAC----AA-CG---GCCC-AC-----AGTT--T-C-G-TT-T-CC-A-TC-----AT-TT--------TGCCTCG---GT-AT--T-A-A----CGA-A----T-CTG-C-A-TT----AT-G-A---AATGCC--TATTTT
gi|74904                      :        ATACA---TCA-GC-TCTCCGTTAC----AA-CA---G-CCCAT-----G--T--TGT-GATT-T-CCGA-TTTT---AT-TT--------TGC--CC---TT-A---C-ATA----CGA-A----T-CTGCC-GTTTGT-AAC-G-A---AATACCA-TATTTTAC
gi|74887                      :        ATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------
gi|74905                      :      acATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC-----------------------------------------------------AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TTGT-AAC-G-G---AATGCCTATATTTTAC
gi|74906                      :        ATACAAGTTCA-GC-TCTC-GTTAC----AC-GG---G-CC-AC-----G--T--T-C-A-TT-T-CCGA-TC-----A--TT--------TGC--CA---TT-AATTC-A-A----TGA-A----A-CT
gi|74890                      :        ATACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CC---G-CC-AC-----C--T--T-TTG-TT-C-TTTG--C-----ATCTT--------TGG--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTG
gi|74882                      :       acTACAG--TCA-GC-TCAC-ATTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----TGA-A----T-CTGCC-A-TTGT-AAC-A-A---AATGTC--TAGTTTAC
gi|74881                      :     atatTAAAA--TCA-GC-TCTC-GTTACGATTAA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-CCAG-TC-----AT-TT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTGCC-G-TTGT-AAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74907                      :     atatTACAG--TCA-GC-TCTC-CTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-TTGA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-ACGATCGA-A----T-CTGCC-G-TTAT-AAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74909                      :         TACAG--TCA-GC-TCTC-ATTAC----AA-CG---A-CC-AT-----G--T--T-TTG-CT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-A-TTGT-AAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74910                      :         TACAG--TCA-GCCTCTG-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGATG----T-CT--C-G-TTGGTAAC-G-A---TATGCC--GATTTTAC
gi|74911                      :         TACAG--TCAAGC-TCTC-GTTAC----AA-CG-----CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-C-GA-TC-----AT-TT---------GC--CG---TT-A---T-A------CAA-A----T-CT-CC-G-TTGT-AAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74908                      :         TACAG--T-A-G--TCTC-GTTAC----AA-TAAACG-CC-AC-----G--T--T-T-G-TT-T-CCGG-T------AT-TT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCT-G--TGT-AAC-A-A---AATGCC--TCATTTAC
gi|74912                      :         TACAG--TCA-AC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-C---T-----G--T--T-A-G------ACG---------AA-TT--------TGC--CG---GT-A---A-A-T----CAA-A----TGCTGCC-G-CTGT-AAC-A-A---
gi|74912                      :         TACAG--TCA-GC-GCTT-GTTAC----AG-CG---G-CA-GC-----A--T--T-T-GATT-TACCGG-CA-----AA-TT--------CGT--C-----------T-A-A----CA-----------GTC-G-TTGT-AAC-G-A---GAgcgctgactgtac
gi|74913                      : tacagtcaacCAG--TAA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C-G-TT-T-CCGA-TC-----AT-TT--------TGC--CG---TG-A---T-A-A----CGA-ATCTGT-CTGCC-G-TTGT-AAC-G-A---AATGCC--TTTTTTACc
gi|74914                      :              --TCA-GA-TC-C-GTTAC----AA-CG-----CC-ACC----G--T--T-T-G-TTAT-CCGA-TC-----AT-TT--------TGT--CGCGTTT-A-----A-A----CGA-A----T-CTA-C-G-TTGT-AAT-G-A---AATACC--TATT





Alignments
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lowQualScore                  :            ..   .  .    .     ....  .  ... .  .  ..... .. .. ..... .  .     .  ..    ........   ..  ...  . ... . . ....   . .... .     . .  .     . . ...      ..        
lowQualScore                  :            55   2  1    1     3333  1  999 1  2  55555 55 55 22222 1  2     1  55    55555555   55  999  2 111 1 1 4444   1 4444 1     3 3  3     3 3 333      33        
consensus                     :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
Reference ( family-519 )      :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74878                      :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---A-A-A----CGA-A----T-CTGCT-G-TT-GTAACAA-A---AATGCC--TCTTTTAC
gi|74879                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTAAC----AA-CG---A-C--AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGT--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATGTTAC
gi|74880                      :    aTATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A-----A-A----CGA-A----T-CTGCT-G-TT-GTAAC-A-A---GATGCT--T-CTTTAC
gi|74881                      :      aTAAAA--TCA-GC-TCTC-GTTACGATTAA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCAG-TC--ATTT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74882                      :   atatTACAG--TCA-GC-TCAC-ATTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----TGA-A----T-CTGCC-A-TT-GTAAC-A-A---AATGTC--TAGTTTAC
gi|74883                      : atatTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-T---------------------TGC--CG---AT-A---T-A-A----TGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--CATTTTAC
gi|74884                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TATGA-TC--ATTTAACGAATCTGC--CG---TT-G---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-TTAAC-A-A---AATGCC--CATTTT
gi|74885                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AT-----G--T--T-C---G-TT-TTT-A-TC--ATTT--------CGC--CG---TT-A---T-A-C----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---TATGCC--TAT
gi|74886                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CT-AC-----G--T--T-T---G-TT-TGCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---A-A-A----GGA-A----T-GTGCT-G-TT-GTAAC-A-A---A
gi|74887                      :     aATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------
gi|74888                      :   acTATAGAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-T---G--T-TCGGT-TC--ATTT--------TGC--TT---GT-A---T-A-G----C
gi|74889                      :    aTGTACAA--GCA-GC-TCT--GTTAC----AA-AG---G-CCCAC-----G--TATT-T---G-TA-TTCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TTAA---A-A-A----CGA--------TTG-T-G-TT-GTAAC---A---CTTGCC--TCTTTTAC
gi|74890                      :     aATACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CC---G-CC-ACCTTTTG--T--T-C-----TT-TGC-A-TC----TT--------TGG--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTG
gi|74891                      :   acTATACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CG-----CC-ACCTTTTG--T--T-C---T-TT-T--GA-----ATCCA-------TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-
gi|74892                      :    aTATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GAAAC-G-A---AATGTC--TATTTTACtggcgat
gi|74893                      :     TATATAG--TCA-GC-TCAC-GTTAC----AA-CA---G-CC-AT-----A--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--AG---TC-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74894                      :     TATACAG--TGA-GC-TCTT-GTTAC----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-C----CGA-A----T-CTACC-A-TT-GTAAC-GAA---AATGCC--TATTTT
gi|74895                      :     TGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-TG---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCTGA-AC--ATTT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CAA-A----T-CTGCC-G-TT-CTAAC-G-AAATAATGCC--TGTTTTAC
gi|74896                      :     TAGACAG--TCA-GG-TCTC-ATTAC----AA-TG---G-CC-AT-----G--T--T-T---G-TT-TCTGA-TC--ATTT--------TGT--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTACC-G-TT-GTAAC-A-A---AATGCC--TATTATAC
gi|74897                      :     TATACGG--TCA-AC-TCTC-GATAT----AAACC---G-CC-AC-----C--T--T-TTTTG-TTCTTTGAATC----TT--------TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTG
gi|74898                      :     TGTACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CC---G-CC-AC-----C--T--T-------TT-T---A-TC--TTTTGAATCCA-TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTGC
gi|74899                      :      ATACAG--TCA-AC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CAA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAT-G-A---AATGCT--TATTTTACgat
gi|74900                      :      ATACAG--TCA-GC-TCTA-GCTAC----AA-CG---G-CC-AC-----A--T--T-C---A-TT-TCCAA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTCCA-G-TT-GTAAC-A-A---AATGCC--AATTTTAC
gi|74901                      :      ATAAAG--TCA-GC-TCTC-GTTAT----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-A-TT-GTAAC-G-A---TTTGCC--TATTTAAC
gi|74902                      :      ATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AC-----G--T--T-T---G--T-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TTGA---TAA-A----CGA-A----T-CTGCTAG-TT-GTAAC-A-A---AATGCC--TCTTTTAC
gi|74903                      :      ATACAG--TCAAGC-TCTC-GTTAC----AA-CG---GCCC-AC-----AGTT--T-C---G-TT-TCC-A-TC--ATTT--------TGCCTCG---GT-AT--T-A-A----CGA-A----T-CTG-C-A-TT----AT-G-A---AATGCC--TATTTT
gi|74904                      :      ATACA---TCA-GC-TCTCCGTTAC----AA-CA---G-CCCAT-----G--T--TGT---GATT-TCCGA-TTTTATTT--------TGC--CC---TT-A---C-ATA----CGA-A----T-CTGCC-GTTT-GTAAC-G-A---AATACCA-TATTTTAC
gi|74905                      :      ATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----A-----------------------------------------------TTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-G---AATGCCTATATTTTAC
gi|74906                      :      ATACAAGTTCA-GC-TCTC-GTTAC----AC-GG---G-CC-AC-----G--T--T-C---A-TT-TCCGA-TC--A-TT--------TGC--CA---TT-AATTC-A-A----TGA-A----A-CT
gi|74907                      :       TACAG--TCA-GC-TCTC-CTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TTTGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-ACGATCGA-A----T-CTGCC-G-TT-ATAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74908                      :       TACAG--T-A-G--TCTC-GTTAC----AA-TAAACG-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGG-T---ATTT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCT-G--T-GTAAC-A-A---AATGCC--TCATTTAC
gi|74909                      :       TACAG--TCA-GC-TCTC-ATTAC----AA-CG---A-CC-AT-----G--T--T-TT--G-CT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-A-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74910                      :       TACAG--TCA-GCCTCTG-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGATG----T-CT--C-G-TTGGTAAC-G-A---TATGCC--GATTTTAC
gi|74911                      :       TACAG--TCAAGC-TCTC-GTTAC----AA-CG-----CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TC-GA-TC--ATTT---------GC--CG---TT-A---T-A------CAA-A----T-CT-CC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74912                      :       TACAG--TCA-AC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-C---T-----G--T--T-A---G-----ACGA-----A-TT--------TGC--CG---GT-A---A-A-T----CAA-A----TGCTGCC-G-CT-GTAAC---A---AGCGCT--GACTGTAC
gi|74913                      :         CAG--TAA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TG-A---T-A-A----CGA-ATCTGT-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TTTTTTAC
gi|74914                      :            --TCA-GA-TC-C-GTTAC----AA-CG-----CC-ACC----G--T--T-T---G-TTATCCGA-TC--ATTT--------TGT--CGCGTTT-A-----A-A----CGA-A----T-CTAC--G-TT-GTAAT-G-A---AATACC--TATT





Alignments
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lowQualScore                  :            ..   .  .    .     ....  .  ... .  .  ..... .. .. ..... .  .     .  ..    ........   ..  ...  . ... . . ....   . .... .     . .  .     . . ...      ..        
lowQualScore                  :            55   2  1    1     3333  1  999 1  2  55555 55 55 22222 1  2     1  55    55555555   55  999  2 111 1 1 4444   1 4444 1     3 3  3     3 3 333      33        
consensus                     :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
Reference ( family-519 )      :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74878                      :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---A-A-A----CGA-A----T-CTGCT-G-TT-GTAACAA-A---AATGCC--TCTTTTAC
gi|74879                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTAAC----AA-CG---A-C--AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGT--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATGTTAC
gi|74880                      :    aTATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A-----A-A----CGA-A----T-CTGCT-G-TT-GTAAC-A-A---GATGCT--T-CTTTAC
gi|74881                      :      aTAAAA--TCA-GC-TCTC-GTTACGATTAA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCAG-TC--ATTT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74882                      :   atatTACAG--TCA-GC-TCAC-ATTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----TGA-A----T-CTGCC-A-TT-GTAAC-A-A---AATGTC--TAGTTTAC
gi|74883                      : atatTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-T---------------------TGC--CG---AT-A---T-A-A----TGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--CATTTTAC
gi|74884                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TATGA-TC--ATTTAACGAATCTGC--CG---TT-G---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-TTAAC-A-A---AATGCC--CATTTT
gi|74885                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AT-----G--T--T-C---G-TT-TTT-A-TC--ATTT--------CGC--CG---TT-A---T-A-C----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---TATGCC--TAT
gi|74886                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CT-AC-----G--T--T-T---G-TT-TGCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---A-A-A----GGA-A----T-GTGCT-G-TT-GTAAC-A-A---A
gi|74887                      :     aATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------
gi|74888                      :   acTATAGAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-T---G--T-TCGGT-TC--ATTT--------TGC--TT---GT-A---T-A-G----C
gi|74889                      :    aTGTACAA--GCA-GC-TCT--GTTAC----AA-AG---G-CCCAC-----G--TATT-T---G-TA-TTCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TTAA---A-A-A----CGA--------TTG-T-G-TT-GTAAC---A---CTTGCC--TCTTTTAC
gi|74890                      :     aATACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CC---G-CC-ACCTTTTG--T--T-C-----TT-TGC-A-TC----TT--------TGG--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTG
gi|74891                      :   acTATACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CG-----CC-ACCTTTTG--T--T-C---T-TT-T--GA-----ATCCA-------TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-
gi|74892                      :    aTATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GAAAC-G-A---AATGTC--TATTTTACtggcgat
gi|74893                      :     TATATAG--TCA-GC-TCAC-GTTAC----AA-CA---G-CC-AT-----A--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--AG---TC-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74894                      :     TATACAG--TGA-GC-TCTT-GTTAC----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-C----CGA-A----T-CTACC-A-TT-GTAAC-GAA---AATGCC--TATTTT
gi|74895                      :     TGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-TG---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCTGA-AC--ATTT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CAA-A----T-CTGCC-G-TT-CTAAC-G-AAATAATGCC--TGTTTTAC
gi|74896                      :     TAGACAG--TCA-GG-TCTC-ATTAC----AA-TG---G-CC-AT-----G--T--T-T---G-TT-TCTGA-TC--ATTT--------TGT--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTACC-G-TT-GTAAC-A-A---AATGCC--TATTATAC
gi|74897                      :     TATACGG--TCA-AC-TCTC-GATAT----AAACC---G-CC-AC-----C--T--T-TTTTG-TTCTTTGAATC----TT--------TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTG
gi|74898                      :     TGTACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CC---G-CC-AC-----C--T--T-------TT-T---A-TC--TTTTGAATCCA-TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTGC
gi|74899                      :      ATACAG--TCA-AC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CAA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAT-G-A---AATGCT--TATTTTACgat
gi|74900                      :      ATACAG--TCA-GC-TCTA-GCTAC----AA-CG---G-CC-AC-----A--T--T-C---A-TT-TCCAA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTCCA-G-TT-GTAAC-A-A---AATGCC--AATTTTAC
gi|74901                      :      ATAAAG--TCA-GC-TCTC-GTTAT----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-A-TT-GTAAC-G-A---TTTGCC--TATTTAAC
gi|74902                      :      ATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AC-----G--T--T-T---G--T-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TTGA---TAA-A----CGA-A----T-CTGCTAG-TT-GTAAC-A-A---AATGCC--TCTTTTAC
gi|74903                      :      ATACAG--TCAAGC-TCTC-GTTAC----AA-CG---GCCC-AC-----AGTT--T-C---G-TT-TCC-A-TC--ATTT--------TGCCTCG---GT-AT--T-A-A----CGA-A----T-CTG-C-A-TT----AT-G-A---AATGCC--TATTTT
gi|74904                      :      ATACA---TCA-GC-TCTCCGTTAC----AA-CA---G-CCCAT-----G--T--TGT---GATT-TCCGA-TTTTATTT--------TGC--CC---TT-A---C-ATA----CGA-A----T-CTGCC-GTTT-GTAAC-G-A---AATACCA-TATTTTAC
gi|74905                      :      ATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----A-----------------------------------------------TTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-G---AATGCCTATATTTTAC
gi|74906                      :      ATACAAGTTCA-GC-TCTC-GTTAC----AC-GG---G-CC-AC-----G--T--T-C---A-TT-TCCGA-TC--A-TT--------TGC--CA---TT-AATTC-A-A----TGA-A----A-CT
gi|74907                      :       TACAG--TCA-GC-TCTC-CTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TTTGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-ACGATCGA-A----T-CTGCC-G-TT-ATAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74908                      :       TACAG--T-A-G--TCTC-GTTAC----AA-TAAACG-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGG-T---ATTT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCT-G--T-GTAAC-A-A---AATGCC--TCATTTAC
gi|74909                      :       TACAG--TCA-GC-TCTC-ATTAC----AA-CG---A-CC-AT-----G--T--T-TT--G-CT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-A-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74910                      :       TACAG--TCA-GCCTCTG-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGATG----T-CT--C-G-TTGGTAAC-G-A---TATGCC--GATTTTAC
gi|74911                      :       TACAG--TCAAGC-TCTC-GTTAC----AA-CG-----CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TC-GA-TC--ATTT---------GC--CG---TT-A---T-A------CAA-A----T-CT-CC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74912                      :       TACAG--TCA-AC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-C---T-----G--T--T-A---G-----ACGA-----A-TT--------TGC--CG---GT-A---A-A-T----CAA-A----TGCTGCC-G-CT-GTAAC---A---AGCGCT--GACTGTAC
gi|74913                      :         CAG--TAA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TG-A---T-A-A----CGA-ATCTGT-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TTTTTTAC
gi|74914                      :            --TCA-GA-TC-C-GTTAC----AA-CG-----CC-ACC----G--T--T-T---G-TTATCCGA-TC--ATTT--------TGT--CGCGTTT-A-----A-A----CGA-A----T-CTAC--G-TT-GTAAT-G-A---AATACC--TATT


blockSeqs                     :            GT   A  C    C     GATT  A  AAC C  C  CTTTT GT AT TTTT  A  C     A  TT    AACGAATC   CT  CGT  A ATT A T CGAT   T TCTG G     A T  G     . A AAT      TA
blockSeqs                     :            .    A  .    .     .     .  .   .  C  CTTTT .  .  GT    .  A     .  .     GAATCCA    .   .    G T   . . .      . .    .     . .  .     . . .        A 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  C     .  .  TT    .  .     .  .     A          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .        . 
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .     . .  .     . . .          
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .                               
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .                               
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  A     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .                               
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  C     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .                               
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  T     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .      . .    .                               
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  .     .  .     .  .     .          .   .    . .   . . .                                             
blockSeqs                     :            .    .  .    .     .     .  .   .  .  .     .  .  .     .  .     .  .     .                                                                           


blockSeqCons                  :     
originalCons                  :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
finalCons                     :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC





Alignments
lowQualScore                  :            11   2  1    1     2222  1  111 1  2  66666 11 11 33333 1  2     1  11    88888888   11  111  2 333 1 1 2222   1 2222 1     1 1  1     1 1 222      33        
lowQualScore                  :            ..   .  .    .     ....  .  ... .  .  ..... .. .. ..... .  .     .  ..    ........   ..  ...  . ... . . ....   . .... .     . .  .     . . ...      ..        
lowQualScore                  :            55   2  1    1     3333  1  999 1  2  55555 55 55 22222 1  2     1  55    55555555   55  999  2 111 1 1 4444   1 4444 1     3 3  3     3 3 333      33        
consensus                     :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
Reference ( family-519 )      :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74878                      :     TATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---A-A-A----CGA-A----T-CTGCT-G-TT-GTAACAA-A---AATGCC--TCTTTTAC
gi|74879                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTAAC----AA-CG---A-C--AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGT--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATGTTAC
gi|74880                      :    aTATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A-----A-A----CGA-A----T-CTGCT-G-TT-GTAAC-A-A---GATGCT--T-CTTTAC
gi|74881                      :      aTAAAA--TCA-GC-TCTC-GTTACGATTAA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCAG-TC--ATTT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74882                      :   atatTACAG--TCA-GC-TCAC-ATTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----TGA-A----T-CTGCC-A-TT-GTAAC-A-A---AATGTC--TAGTTTAC
gi|74883                      : atatTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-T---------------------TGC--CG---AT-A---T-A-A----TGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--CATTTTAC
gi|74884                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TATGA-TC--ATTTAACGAATCTGC--CG---TT-G---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-TTAAC-A-A---AATGCC--CATTTT
gi|74885                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AT-----G--T--T-C---G-TT-TTT-A-TC--ATTT--------CGC--CG---TT-A---T-A-C----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---TATGCC--TAT
gi|74886                      :    aTGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CT-AC-----G--T--T-T---G-TT-TGCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---A-A-A----GGA-A----T-GTGCT-G-TT-GTAAC-A-A---A
gi|74887                      :     aATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------
gi|74888                      :   acTATAGAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-T---G--T-TCGGT-TC--ATTT--------TGC--TT---GT-A---T-A-G----C
gi|74889                      :    aTGTACAA--GCA-GC-TCT--GTTAC----AA-AG---G-CCCAC-----G--TATT-T---G-TA-TTCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TTAA---A-A-A----CGA--------TTG-T-G-TT-GTAAC---A---CTTGCC--TCTTTTAC
gi|74890                      :     aATACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CC---G-CC-ACCTTTTG--T--T-C-----TT-TGC-A-TC----TT--------TGG--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTG
gi|74891                      :   acTATACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CG-----CC-ACCTTTTG--T--T-C---T-TT-T--GA-----ATCCA-------TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-
gi|74892                      :    aTATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GAAAC-G-A---AATGTC--TATTTTACtggcgat
gi|74893                      :     TATATAG--TCA-GC-TCAC-GTTAC----AA-CA---G-CC-AT-----A--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--AG---TC-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74894                      :     TATACAG--TGA-GC-TCTT-GTTAC----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-C----CGA-A----T-CTACC-A-TT-GTAAC-GAA---AATGCC--TATTTT
gi|74895                      :     TGTACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-TG---G-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCTGA-AC--ATTT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CAA-A----T-CTGCC-G-TT-CTAAC-G-AAATAATGCC--TGTTTTAC
gi|74896                      :     TAGACAG--TCA-GG-TCTC-ATTAC----AA-TG---G-CC-AT-----G--T--T-T---G-TT-TCTGA-TC--ATTT--------TGT--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTACC-G-TT-GTAAC-A-A---AATGCC--TATTATAC
gi|74897                      :     TATACGG--TCA-AC-TCTC-GATAT----AAACC---G-CC-AC-----C--T--T-TTTTG-TTCTTTGAATC----TT--------TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTG
gi|74898                      :     TGTACAG--TCA-AC-TCTC-GATA-----AA-CC---G-CC-AC-----C--T--T-------TT-T---A-TC--TTTTGAATCCA-TGG--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-TTGC
gi|74899                      :      ATACAG--TCA-AC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CAA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAT-G-A---AATGCT--TATTTTACgat
gi|74900                      :      ATACAG--TCA-GC-TCTA-GCTAC----AA-CG---G-CC-AC-----A--T--T-C---A-TT-TCCAA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTCCA-G-TT-GTAAC-A-A---AATGCC--AATTTTAC
gi|74901                      :      ATAAAG--TCA-GC-TCTC-GTTAT----AA-CA---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-A-TT-GTAAC-G-A---TTTGCC--TATTTAAC
gi|74902                      :      ATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-CC-AC-----G--T--T-T---G--T-TCCGG-TC--ATTT--------TGC--CG---TTGA---TAA-A----CGA-A----T-CTGCTAG-TT-GTAAC-A-A---AATGCC--TCTTTTAC
gi|74903                      :      ATACAG--TCAAGC-TCTC-GTTAC----AA-CG---GCCC-AC-----AGTT--T-C---G-TT-TCC-A-TC--ATTT--------TGCCTCG---GT-AT--T-A-A----CGA-A----T-CTG-C-A-TT----AT-G-A---AATGCC--TATTTT
gi|74904                      :      ATACA---TCA-GC-TCTCCGTTAC----AA-CA---G-CCCAT-----G--T--TGT---GATT-TCCGA-TTTTATTT--------TGC--CC---TT-A---C-ATA----CGA-A----T-CTGCC-GTTT-GTAAC-G-A---AATACCA-TATTTTAC
gi|74905                      :      ATACAG--TCA-GC-TCTC-GTTAC----A-----------------------------------------------TTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-G---AATGCCTATATTTTAC
gi|74906                      :      ATACAAGTTCA-GC-TCTC-GTTAC----AC-GG---G-CC-AC-----G--T--T-C---A-TT-TCCGA-TC--A-TT--------TGC--CA---TT-AATTC-A-A----TGA-A----A-CT
gi|74907                      :       TACAG--TCA-GC-TCTC-CTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TTTGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-ACGATCGA-A----T-CTGCC-G-TT-ATAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74908                      :       TACAG--T-A-G--TCTC-GTTAC----AA-TAAACG-CC-AC-----G--T--T-T---G-TT-TCCGG-T---ATTT--------TGC--CA---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCT-G--T-GTAAC-A-A---AATGCC--TCATTTAC
gi|74909                      :       TACAG--TCA-GC-TCTC-ATTAC----AA-CG---A-CC-AT-----G--T--T-TT--G-CT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGA-A----T-CTGCC-A-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74910                      :       TACAG--TCA-GCCTCTG-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TT-A---T-A-A----CGATG----T-CT--C-G-TTGGTAAC-G-A---TATGCC--GATTTTAC
gi|74911                      :       TACAG--TCAAGC-TCTC-GTTAC----AA-CG-----CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TC-GA-TC--ATTT---------GC--CG---TT-A---T-A------CAA-A----T-CT-CC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TATTTTAC
gi|74912                      :       TACAG--TCA-AC-TCTC-GTTAC----AA-CG---A-C---T-----G--T--T-A---G-----ACGA-----A-TT--------TGC--CG---GT-A---A-A-T----CAA-A----TGCTGCC-G-CT-GTAAC---A---AGCGCT--GACTGTAC
gi|74913                      :         CAG--TAA-GC-TCTC-GTTAC----AA-CG---G-CC-AC-----G--T--T-C---G-TT-TCCGA-TC--ATTT--------TGC--CG---TG-A---T-A-A----CGA-ATCTGT-CTGCC-G-TT-GTAAC-G-A---AATGCC--TTTTTTAC
gi|74914                      :            --TCA-GA-TC-C-GTTAC----AA-CG-----CC-ACC----G--T--T-T---G-TTATCCGA-TC--ATTT--------TGT--CGCGTTT-A-----A-A----CGA-A----T-CTAC--G-TT-GTAAT-G-A---AATACC--TATT