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Reference ( gi|113628 )       : AAAAGTT-G---C-A--TC-GAA-TA-C---AA--TT--G-ATTT-A-A-TAA---TT--CCTT-GCCCTT-G---TTC-TA-TGCA-C---TTTT-AG-T-G-T-A-T-GC---T-A-A-A--CG--C---AT--G-CC-T--ATA-T-T-T-A-GCTG----GT-CA--CA-TG-ACT-CA-G--AG-CA-C---G-T--GATGATT-C------AA--TTTT--ATA--TG-AC-C-A-TGCG--A-TTGC-C--TTG-ACT---CG---C-A--TG-T-TGAA-CCAT---T-A------CTA-C--A-TA------AA----T-GTATT--A--G-T--TGT---C-TTTAAT-TT---------T--TA-A-TT-TACC-GAC-CA---ATC-A-T-G-T-------G-TA--T---T-TG-TA-CAGAACGTTG-AT--T-TAT---AA--CAC-T-TATA-TTA-A-T-G--CA-GGC---T--T-C---CTT-AACG-TCGC---TGAG
gi|113629                     : AAACGTT-G---C-A--TT-GAA-TA-C---AA--TT--G-ATTT-A-A-TA-----T--CCTT-GCCCTTTG---TGC-TA-TGCATC---TTTT-AG-T-G-T-A-T-CA---T-A-A-A--T---C---AT--G-CC-T--ATA-T-T-T-A-ACTG----GT-CA--CA-TG-ACT-CA-G--AG-CA-C---G-T--GATGATT-T------TA--ATTT--ATG--TG-AC-A-A-TGTG--A-TTGC-C--TTG-CCT---CG---C-A--TG-T-TGAA-CCAT---T-A------CTA-CA-A-TA------AA----T-GTATC--A--G-T--TGT---G-TTCAA--TT---------T--TA-A-TT-TCCC-AAC-CA---AAC-A-T-G-T-------G-CA--T---T-TG-TA-AAGAACGTTG-AT--T-TAT---CG--CAC-T-TATA-TTA-A-T-G--CA-GGC---T--T-C---CTT-AACG-TTGC---TGAG
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gi|113645                     :   AAGTT-G---C-A--TT-GGA-TA-C---AA--TT--G-ATTT-A-A-CAA---TT--CCTT-GCCCTT-GCCATGCATA-TGCA-C---TTTT-AG-T-G-T-A-T--C---TGA-A-A--CT--C---AT--G-CC-T--ATA-T-T-T-A-GCTG----GT-CA--GA-TG-ACT-TA-T--AG-CA-C---G-T--AATGATT-C------AA--TTTT--ATG--TG-GC-C-A-TGCG--A-TTAC-C--TTG-CCT---CG---C-A--TG-T-TGAA-CCAT---T-A------CTA-CA-A-TA------AA----T-GTATC--A--G-T--TGT---G-TTTATT-TT---------T--TA-A-TT-TACC-AAC-CA---A---A-C-G-T-------G-CA--T---T-TG-TA-CAGAACGTTG-AT--T-TAT---AG--CAC-T-CATA-TTA-A-T-G--TA-GGC---T--T-C---CTT-AATG-TCGC---TGAG
gi|113646                     :   AAGTT-G---C-A--TT-GAA-TA-C---AA--TT--G-ATTT-A-G-CAA---TT--CCTT-GTCCTT-----TCCATA-TGTA-C---TTTA-AG-T-A-T-A-C-CA---T-A-A-A--CT--C---AG--G-CC-T--ATA-T-T-T-A-GCTG----GT-CA--CA-TG-ACT-CA-A--AA-CA-C---G-T--GATGATT-C------AT--CTTT--ATG--TG-AC-C-A-TGCG--A-TTGT-C--TTA-CCT---CG---T-A--TG-T-TGAA-CCAT---T-G------CTA-TA-A-TG------AA----T-GTATC--A--G-T--TGT---G-TTTCAA-TT---------T--TA-A-TT-TACC-AAC-CA---AAC-A-T-A-TAACGTGGG-CA--T---T-TG-TA-CAGAACGTTG-AG--T-TAT---AG--CAC-T-TATA-TTA-A-T-G--CA-
gi|113647                     :   AAGTT-G---C-A--TC--AA-TA-C---AA--TT--G-CTTT-A-A-TAA---TT--CCT--GCC-TT-G---TGC-TA--GCA-C---TTT--AG-T-G-TTA-T-CA---T-A-A-A--TT--C---AT--G-CC-A--TTA-T-T-T-A-GCTG----GT-CA--CA-TG-A-T-CA-A--AG-CA-C-----T--GATGATT-C------A----TTT--ATG---G-AC-C-A-TGCG--A-TTGC-C--TTG-ACT---CG---C-AT-TG-T-TGAA-CCAT---T-A-------TA-CA-A-TA------GA----T-GTATC--A--G----TGT---T-GTTAAT-TT---------T--TA-A--T-TACC-AAC-CA---AAC-A-C-G-T-------G-CA--T---T-TG-TACCAGAACGTTG-AT--T-TATC--GA--CAC-T-TA-A-TTA-A-C-G--CA--GC---T--T-C---CTT-AACGTTCGC---TGAG
gi|113648                     :   AAGTT-G---C-A--TT-GAA-TA-T---AA--TT--C-ATTT-T-A-CAA---TT--TCTT-GCCCTT-G---ACA-TA-TGAA-C---TTTT-AA-T-G-T-A-T-CA---C-A-A-A--CG--C---AT--G-TC-T--ATA-C-T-T-A-TTTG----GT-CA--TA-TT-ACT-CA-A--AG-CA-C---G-T--GATGATT-C------AA--TTAT--ATA--TG-AC-C-A-TGTG--A-TTGC-C--TTG-CCT---CA---C-A--TG-T-AAAA-CGGT---T-G------CTA-CA-A-TA------AA----C-GTATC--A--G-TTCTGT---TATTT--T-TT---------T--TA-A-TT-TAGC-AAC-CA---AAC-A-A-G-A-------G-CA--T---T-TG-TA-CAGAAGTTTG-AT--T-TAA---AG--CAC-T-TGCG-TTA-A-T-G--CA-GGC---T--C-C---CTT-AACA-TCGC---TG
gi|113649                     :   AAGTT-G---C-A--TT-AAA-TG-C---AA--TT--G-CTTT-A-A-CAA---TC--CCTT-ACCCCT-C---CCA-CA-TCCA-G---TCTT-AG-T-G-C-A-T-CA---T-A-A-A--T---C---AT--G-TCAT--ATA-T-T-T-A-CCTA-----T-CA--CA-TG-ACT-AA-A--AG-CA-C---G-T--AATGATT-C------TA--TTTT--ATG--TG-AT-C-A-TGCG--A-TTGTAT--TTT-TCT---CG---A-A--TG-T-TGAT-CTAT---T-A------CTA-CT-A-TA------AA----T-ATATC--A--G-T--TGT---G-TTTCAT-CTACATGTAGAT--TA-G-TT-TAGC-AAC-CA---AAC-A-T-G-T-------G-CA--T---T-TT-TA-CAGAACGTTG-AT--T-TAT---AG--CAC-TGTATA-TCA-A-T-G--CA-GGC---T--A-C---CTT-AACG-TCGC---TGA
gi|113650                     :   AAGTT-G---C-A--T--AAA-TA-C---AA--TT--G-ATT--A-A-TAA---TT--CCT--GCCCTT-G---TGC-TA-TGCA-------TT-A--T-G-T-G-G-GCATAT-ATA-A--C---T---AT--G-C--T--ATA-T-T-T-ATGCT------T-CA--CA-TATACT-CA----AG-CA-C---G-T--GATGATT-C------AA--TTTT--GTA--TC-GC-C-A-TGCG--A-TTGC-CTTTTG-ACT---CG---C-A--TG-T-TG-A-CTAT---T-A------CTA-CA-A-TA------GA----T-GTATC-----G-T--TGT---G-TTTAAT-GT---------T--TA-A-TT-TACC-AAC-AA---AAC-ATT-G-G-------G-CA--T---T-TA-TT-CAGAACGTTG-TT--A-TAT---CG--CAC-T-TATA-TTT-A-C-G--CA-GGA---C--T-CGGACTT-AACG-TCGC---TGAG
gi|113651                     :   AAGTT-G---C-A--TT-AAA-TA-A---AA--TT--C-ATTT-C-A-CAA---TG--CCTT-GCCTTT-G---CCA-TA-TGCA-C---TTTT-AG-T-G-T-A-T-CA---T-A-A-A--AT--A---AT--G-CC-C---TA-T-T-C-A-GCTG----GT-CA--CATTG-ACT-CA-A--AG-CA-C---G-T--GATGATT-C------AA--TTTT--ACG--GG-AC-C-A-TGCA--A-TTGC-C--TTT-CCT---CG---C-A--TG-T-TCAA-CCAT---T-A------CTA-CA-A-TA------AA----T-GTA
gi|113652                     :   AAGTT-G---C-T--TT-GGAGTA-C---AA--TT--G-ATTTTG-A-TAA---TTT-CCTT-GCT-TT-G---CCA-TAATGC-------CTT-AG-T-G-T-AAT-AT---G-A-A-A--TG--TCCAAT--G-C--T--ATA-T-T-T-A-GGTG-----T-CA---A-TG-A-T-CA-A--AG-CA-C---C-T--GATGATTTC------AA--TTTT--ATG--TG-AC-C-A-TGCG--A-TTAC-C--TTG-CCT---TG---C-A--TG-T-TCAA-CCAT---T-G------CTA-A--ATTA------AA----T-GTaactcaggtg
gi|113653                     :   AAGTTTG---CGA--TT-GAA-TA-C---AAATTT--G-ATTT-A---TAA---TT--TCTT--TCCTT-A---TGAATA-TGCA-T---GTTT-AG-T-G-T-A-T-AT---C-A------CT--C---AT--G-CC-T--ATA-T-T-TTA-GCTG----GT-CA--CA-TG-A
gi|113654                     :                       A-TA-A---AA--TT--G-ATTT-A-A-CAA---TT--CCTA-GCCCT-----------G-TGCA-C---TTTT-AG-T-G-T-A-T-CA---T-A-A-A--CT--C---AT--G-
gi|113655                     :                           -C---AA--TT--G-ATTT-T-A-CAA---TC--CCTT-GCACTT-G---CCA-TA-TGCA-C---TTTT-AG-T-G-T-A-T-CA---T-A-A-A--CT--C---AA--G-CC-T--ATT-T-T-T-A-GTTG----GT-TA--CA-TG-ACT-CA-A--AA-AA-C---A-T--AATGATC-T------AA--TTTT--ATG--TG-AC-C-A-TGTC--A-TTGC-C--CTG-CCT---CG---C-A--TG-T-TGAA-TCAT---T-A------CTA-TA-A-TA------AA----T--TATC--A--A-A--TCT---G-TTTAAT-TT---------T--TA-A-TT-TCCC-AGC-AA---AAC-A-T-G-T-------G-CA--T---C-TA-TA-CAAAACTTTG-AT--T-TAT---AT--CAC-T-TATA-ATA-A-T-G--CA-GTG---T--T-T---CTT-AACG-TCGC---TGAG
gi|113656                     :                                      --G-ATTT-A-G-CAT---CT--CCTT-GCCCTT-----------------------TT-AG-T-A-T-A-T-CA---T-A-A-A------------------------------T-A-GCTG----GT-CC--CC-TG-ACA-CA-A--AG-CA-C---G-T--GATAATT-C------AA--CTTT--ACG--TG-AA-C-A-TGCA--A-TTGC-C--TTG-CCT---CG---C-A--TG-T-CGAA------------------------A-TA------A--------TATC--A--G-T--TGT---G-CTTAAT-TT---------C--TA-A--A-TACC-AAG-CA---AAC-A-T-G-T-------G-CA--T---T-TG-TA-CAGAACGTTA-AT--T-GAT---GG--CAA---TATA-TCA-A-T-G--TA-AGC---T--T-T---CTT-GACG-TCGC---TGAG
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