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lowQualScore : 8 5 55 4 8 2222222 6 3 2 2 2 7777 55555555 5 2 2 2 2 2 1 4444 1 666 1 1 6666666 9 8 111 2 77 1 1 1 55 66 2 6666 2 2 4 2222222222222 4444 55555 77 66666666666666666666666 44 2 3 8888 88 88
consensus : TATCGT-G--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-C-A----C--------TGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA--GA-T-CA----T--GTTGG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CAC-GGG----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATTGT
Reference ( family-515 ) : TATCGT-G--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-C-A----C--------TGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA--GA-T-CA----T--GTTGG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CAC-GGG----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATTGT
gi|91837 : TATCGT-G--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-C-A----C--------TGC-C-C-AAT-T-T-CCAT-CA----C-AA--GA-T-CA----T--GTTGG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CAC-GGG----AT-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTAT--A-TAT-TT----A--AAT--CCAGTGATTGT
gi|91838 : TATCATTG--T-AA-AT-------TC-CC-CCA-T-A----C--------TGT-C---AAT-T-T-CCGT-TA----C-AA--GA-T-CA----T--GTTGG---GAGTTT--A-TG-AAA-CA-GA--CAC-AGG----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATATTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATT
gi|91839 : TATCAT-G--T-AG-AT-------TT-CC-C-A-C-A----C--------TGT-C-C-AGT-T-T-TCGT-CA----C-TA--GA-T-CA----T--GTTGG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CGT-GGG----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-AA---T----A--AAT--CCGGCGATTGT
gi|91840 : TATCGT-A--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-T-G----C--------TGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CC----C-AA--GA-T-CA----T--GTTGG---GAGATT--A-CG-AAA-TA-GA--CAC-GGG----TT-T-CTGAC-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATTGT
gi|91841 : TATCGT-G--T-AA-AT-------TT-TC-C-A-C-G----C--------TGT-C-C-AAT-A-T-CCGT-CA----T-AA--CA-T-CA----T--G---G---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CAC-GGG----TT-T-CT-AT-------------T----G-----T--A------------------A----CCCGATGTTTT--A-TAT-CT----A--AAT--CCGGTGCTTG
gi|91842 : TATCGT-ACAT-AC-AT-------TT-CC-C-A-T-G----C--------TGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA--GA-T-CAATCAT--GTTGG---GAGTGT--A-TG-AAA-TA-GA--CAT-GGA----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TA----A--AAT--GCGGTGATTGT
gi|91843 : TATCAT-G--TTAA-AT-------TTTCC-C-A-C-A----C--------TGTTC-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA--GA-TTCA----T--GTTGG---GAGTTTGAA-TG-AAA-TA-GA--CACCGGG----TTGT-CTTAG-------------TT---G-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT---CGGTGAT
gi|91844 : TATCAT-G--T-AA-AT-------TT-TC-C-A-C-G----C--------TGT-C-C-AAT-T-T-TCGT-TA----C-AA--GA-T-CT----T--GATGG---GAATTT--A-TA-AAA-TG-GA--CAC-GGG----T----------------------T----G-----C--A-------------------------AGATATTTT--A-TAT-TT----G--AAT--CCGGTGATTGT
gi|91845 : TATAAT-G--T-AA-ATGGATGTTTT-CC-A-A-C-A----C--------AGT-C-CGAAT-T-T-CCGT-CA----C-AA--GA-T-AT----T--GTTGG---GAGTTT--A-TG-AAG-TA-GA--CAC-AAG----TT-C-CT-GG-------------T----G-----TTCATTTCAAATGTTAGCTAGTA----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATTGT
gi|91846 : TATCAT-G--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-C-A----G--------AGT-C-C-AAC-T-T-CCGT-CA----C-AA-----------------TTAG---G--CCT--A-TA-AAA-TC-GA--CAC-GGG----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T--ACATGTAGGTA--------A----CCAGATATTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATTAT
gi|91847 : TATCGT-A--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-T-A----C--------TGT-T-C-A------------------------GA-T-TA----T--GTTGG---GAATTT--A-TG-AAA-CA-GA--CTC-GGG----AT-T-CT-GG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----T--AAT--CCATTGATTGT
gi|91848 : TATCGT-G--TCAA-AT-------TC-CC-C-A-C-A----A--------TGT-C-C-AAT-T----CGT-CA----C-AA--AG-T-CA----AAAGTTGG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CAC-GGG-----A-T-CT-AG-------------T----GT----T--A------------------A----------GTTTTAAA-TAT-CT----A--AAT--CCAGTGATTGT
gi|91849 : TATC-T-G--C-AACAT-------TCGCC-C-ATC-A----A--------TGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AAAGAA-T-CA----A--GTTGG---GAGTTTA-A-TGAAAA-TA-GA--CAC-GGG-----T-T-GT-AG-------------T----GT----T--A------------------A----C-------TTTAAA-TAT-TT----A--AAT--CCAGTGATTGT
gi|91850 : TATCAT-G--TTAA-AT-------AT-CC-C-A-CCG----C--------TGT-C-A-ATT-T-T-CCGT-CA----C-AA--CA-T-CA----T--G---G---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CAC-ACG----TT-G-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGAAGTTTT--A-T
gi|91851 : TATCAT-G--T-AA-AT-------TT-CT-C-G-C-A----C--------AGT-C-C-AAT-T-T-C----------------GA-T-CA----C--ATTCA---CAAT----A-TG-AAA-TC-GA--CAC-GGG----TT-T-TT-AG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGAGATTtta
gi|91852 : TATCAT-G--T-AA-AT-------TT-CC---A-C-A----C--------AGT-C-C-AAT-T-T-TCGT-CA----T-AA-----T-TA----T--GCC----------T--A-TG-AAA-TC-GA--TAC-GGG----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T--ATATGTAAGTA--------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCAGTGATT
gi|91853 : TATCAT-G--T-AC-AT-------TT-CC-C-A-C-A----C--------AGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA----------------------------TT--A-TG-AAA-TC-GA--CAT-GGG----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T---------------------A----C---ATG-------------T----A--AAT--CCGGTGATT
gi|91854 : TATCAT-G--T-AC-AT-------TT-CC-C-A-C-A----C--------AGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA----------------------------TT--A-TG-AAA-TC-GA--CAT-GGG----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T---------------------A----C---ATG-------------T----A--AAT--CCGGTGATT
gi|91855 : TACCAT-G--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-C-A----C--------AGT-C-C-AAT-T-T-CCAT-CA----C-AT-----T-CA----C--A--------A---T--A-TG-AAA-TC-GA--CAC-GGG----TT-TTCT-AG-------------T----G-----T--A------------------AGTAACCAGATGTTTT--A-TAT-
gi|91856 : TATCCT-G--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-C-A----CAGTCACACTGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA--G----------T--ATT---------------TG-AAA-TA-TA--CAC-GGG----AT-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGAT
gi|91857 : TATTGT-A--A-AA-AT-------TT-CC-C-A-C-A----C--------TGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----T-AA--GA-T-CA----T--G
gi|91858 : TATCAT-GC-T-AACAT-------TT-CCGC-A-C-A----C--------AGT-C-C-AAT-T-TGGCGT-CA----C-AA--GA-------------------------T--A-TG-AAACTACAA--CAC-AGG----TA-T-TT-AG-------------T----GTAAGTT--A------------------A----CC-GA-GTTTT--A-TAT-TTAAAAA--AATAATCGGTGATT
gi|91859 : TCGT-G--T-AA-AT-------TT-TT-C-A-C-G----C--------TGT-C-C-AAT-TAT-CCGT-AA----T-AA--A----CA----T---CTGGAAAGAGTTT--A-TG-AAA-TA-GGACCAC-GGG----TT-T-CT-AT-------------T----G-----T--AAC----------------A----CCCAATGTTTT--A-TAT-CT----A--AAT--CCGAGGCTTG
gi|91860 : CGT-G--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-T-A----C--------TGC-C-C-AAT-T-T-CCGT-CG----C-AA--GA-T-CA----T--GTTGG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--C
gi|91861 : T-G--T-AA-AT-------TG-TC-C-A-C-AGCAGC--------AGT-C-C-AATGT-T-CTGT-CAGCGAC-GA--GA-T-AA----T--ATTGG-----------------AA-TC-GA--CAC-GGT----TT-T-CT-AG-------------TGTAAG-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--AGTAT-TT----ACTAAT--CGACTGATT
gi|91862 : aT-G--T-AA-AT-------TT-CC-C-A-C-A----C--------AGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA--GA-T-AA--------------------T--A-TG-AAG-TC-GA--CAC-GGG----GT-G-CA-AGTACA---------T----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATT
gi|91863 : -G--T-AA-AT-------TT-CC---A-C-A----C--------T-T-C-T-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AG--GACT-CA----T--GTTGGT--GAGTTC--ATTG-AAA-T--GA--CA---AG----TT-T-CT-A-------------------------T--A------------------A------------TTC--A-----------A--AAT--CCAGTGATTGT
gi|91864 : A-AT-------TT-CC-C-A-C---------------TAT-----AGT-----CCGT-CA----C-AA--GA-T-----------------------T--A-TG-AAA-TC-GA--CAC-GG-----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------AGTAACCAGATGTTTT--A-TATATT----A--AAT--CCAGTGATT
gi|91865 : -AT-------TT-TC-C-A-T-G----C--------TGTGCAC-AAT-T-T-CCGTTCA----CCAA--GA-T-CAATAAT--GTGGG---AAGTGT--A-TG-AAA--A-GA--CAT-GA------T-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------------CAGAT--CTT--A-TAT-TA----A--AAT--GCGGTGATTGT
gi|91866 : T-------TT-CC-C-A-C-A----C--------TGT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA--GA-T-CT----T--GTTGG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CAT-AAGTAAATT-T-CT-AGTGTGCATTTCAAAT----G-----T--A------------------A----CCAGATGTTT------------------GAT--TCGGTGATTGT
gi|91867 : T-------TT-CC-C-A-C-G----C--------TTT-C-C-AAT-T-T-CCGT-CA----C-AA--GA-T-CA----T--GTTGG---
gi|91868 : -A-C-A----C--------AGT-C-C-AAT-T-T-CTGT-CA----C-AA--GA-T-AA--------------------T--A-TG-AAA-TC-GA--CAC-GGG----TT-T-CT-AG-------------TGTAAG-----T--A------------------A----CCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATT
gi|91869 : GT-CA----C-AA--GA-T-CA----T--GTTGG---GAGTTC--A-TG-AAA-TA-GA--CAA-GGG----TT-T-C-----------------------------------------------------------------T--A-TAT-TC----A--AAT--CCAGTGATTGT
gi|91870 : T-CA----C-AA--GA-T-CA----T--GTTAG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CAC-AGG----TT-T-CT-AA-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATATTTT--A-TAA-TT----A--AAT--CCGGTGATTGT
gi|91871 : T-CA----C-AA--GA-T-CA----T--GTTAG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CAC-AGG----TT-T-CT-AA-------------T----G-----T--A------------------A----CCAGATA-TTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATTGT
gi|91872 : T-CA----C-AA---A-T-CA----T--GTTAG---GAGTTT--A-TG-AAA-TA-GA--CA
gi|91873 : T--A-TG-AAA-TC-GA--CAC-GGT----TT-T-CT-AG-------------T----G-----T--A------------------AGTAACCAGATGTTTT--A-TAT-TT----A--AAT--CCGGTGATT