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gi|125020 : CCTC-AAT-A-GG-TTGA-A-G-TTA-C--A--C-C-----T-CTC-C--AT-G-A--C-C-----G----T-TA--ACAG--GAA---TT-C-C-ATT
gi|125021 : CCTC-A-A-A-GG-T--A-A-G-TTA-C--AAAC-C----AC-CTC-C--AG-G-C--C-C----------T-AA--C-AG--GGAAT-TT-C-C-AT
gi|125022 : CCTC-A-TCA-GG-T-GACA-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTCAC--A--G-G--C-C-----G------AA--TCA---GGAATAAT-C-C-ATTT
gi|125023 : CTC-A-T-A-GGGT-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CTGCTC-C--AG-G-G--C-C-----G----T-AA--CCA---GGAAT-TT-C-CAATTT
gi|125024 : CTC-A-C-A-GG-T-GA-A-G-TTA-CTAA--C-C----CT-CTC-C--AG-G-G--C-T-----G----T-AA--CCA---GGAAT-TT-CTC-ATT
gi|125025 : CTC-A-T-A-GG-TTGA-A-G-TTAAC--A--CAC----CT-CTC-A--AG-G-G--CGC-----G----T-AAA-CCAG--G-AAT-TT-C-C-ATTT
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gi|125027 : -A-GG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C-----T-CTC-C--AG-G-G--C-C-----G----T-AA--CCAG--A-----TT-C-C-ATTT
gi|125028 : a-A-GG-T-GA---G-TTA-C--A--C-C----CT--TC-C---G-G-G--C-C-----T----A-AA--CCAG--GAA---TT-C-C-ATTT
gi|125029 : a-A-GG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTC-C--AG-G-G--C-C-----C----T-AA--C--A--GGATT-TT-C-C-ATT
gi|125030 : -A-GG-T-GA-A-G-TT--C--A--C-C----CT-CTC-CCAAG-G-C--C-C-----G----T-AA--CCAG--GAAAT-TT-C-C-ATTT
gi|125031 : -A-GG-T-GA-A-G-TT--C--A--C-C----CT-CTC-CCAAG-G-C--C-C-----G----T-AA--CCAG--GAAAT-TT-C-C-ATTT
gi|125032 : -A-GG-T-GA-A-G-TCA-C--A--C-C----CT-ACC-A--AG-G-G--C-C-----G----T-AA--CCAG--GAAAT-TT-
gi|125033 : G-T-GA-A-G-TTA-C--A--T-C----CT-CTC-C--GGAG-G--C-C-----G----T-AA--CCA---GGAAT-TT-C-C-ATTttcc
gi|125034 : A-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-TTC-C--AG-G-G--C-C-----G----T-AA--CCAG--GCAAT-TT-C-
gi|125035 : -CTA-C--AG-G-G--C-C-----G----T-AA--CCA---GGAAT-TT-C-C-ATTT
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blockSeqs : . A . A G T . . . A . . . . . A CA . . . . . TA . G G . . . .
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originalCons : CCTC-A-T-A-GG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTC-C--AG-G-G--C-C-----G----T-AA--CCAG--GGAAT-TT-C-C-ATTT
finalCons : CCTC-A-T-A-GG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTC-C--AG-G-G--C-C-----G----T-AA--CCA---GGAAT-TT-C-C-ATTT
Alignments
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lowQualScore : . . . . . . . . . . .. .. . .... . . .. . . .. . ..... .... .. .. . ... . ... . . . .
lowQualScore : 4 1 1 3 2 2 1 1 1 2 55 55 1 3333 1 1 44 1 1 44 1 66666 3333 44 66 1 888 2 333 1 1 1 1
consensus : CCTC-A-T-A-GG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTC-C--AG-G-G--C-C-----G----TA--A--CCA-G---G-AA---T-T-TC-C-ATTT
Reference ( family-504 ) : CCTC-A-T-A-GG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTC-C--AG-G-G--C-C-----G----TA--A--CCA-G---G-AA---T-T-TC-C-ATTT
gi|124998 : CCTC-A-T-A-GG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTC-C--AG-G-G--C-C-----G----TA--A--CCAGG---G-AA---T-T-TC-C-ATTT
gi|124999 : CCTC-A-T-A-GG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTC-C--A--G-G--C-C-----G----TA--A--CCA-G---G-AA---T-T-TC-C-ATTT
gi|125000 : CCTC-A-T-A-AG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTC-C--AG-G-G----C-----G----TA--A--CCA-G---G-AA---T-T-TC-C-ATTT
gi|125001 : CCTC-A-T-AAGG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-CTC-C--AG-G-G--C-C-----G----TA--A--CCA-G---GAAA---T-T-AC-C-ATTT
gi|125002 : CCTC-A-T-A-TG-T-GA-A-G-TTA-C--A--T-C----CT-CTC-C--AG-G-G--C-C-----G----TA--A--CCA-G---G-AA---T-T-TC-C-ATT
gi|125003 : CCTC-A-A-A-GG-T-GA-A-G-TTA-C--A--C-C----CT-TTC-C--AA-G-G--C-C-----A----TA--A--CCA-G---G-AA---T-T-TC-C-
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gi|125035 : -CTA-C--AG-G-G--C-C-----G----TA--A--CCA-G---G-AA---T-T-TC-C-ATTT