lowQualScore : 11111111 1
lowQualScore : 1 555 11 11 1 1 2 222 22 99999999 0 0 88 33 2 1 3 22 111 44 1 11 1 2 0 1 11 8
lowQualScore : . ... .. .. . . . ... .. ........ . . .. .. . . . .. ... .. . .. . . . . .. .
lowQualScore : 2 333 66 66 1 1 3 000 77 22222222 2 8 11 88 6 1 2 66 999 55 1 55 1 2 5 1 55 2
consensus : TAG-AA-C-AA--AA--G-T-T-GT---A--GATAAAT-GACAAGGCCGTA--TTCGACNAT-A-TCAA--G---TTTTA-GGGGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TTAAGGGCCGA
Reference ( gi|84105 ) : TAG-AA-T-AA--AA--G-T-T-GT---A--GGTAAAT-TACAAAGCCGTA--TTCGACCAT-A-TCAA--G---TTTTA-GGGGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TTAAGAGCTGA
gi|84106 : TAG-AA-T-AA--AA--G-T-T-GT---A--GGTTAAT--ACA--GCCGTGATTTCGACCAT-A-TCAA--G---TTTTA-GGGGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TTAAGGGCTGA
gi|84107 : TAG-AA-TTAA--AA--G-T-T-GTTATA--GGTAA-T-TACAA-GCCGTA--TTCGACCAT-A-TCAA--GGTTTTTTA-GGGGCCA-GC--CC-TTCCAA-A--TTAAGGGCTGA
gi|84088 : TAG-AA-C-AA--AA--G-T-T-GT---A--GGTAA-T-TACAAGGT-GTA--TTCGACGAT-A-TCAA--G---TTTTA-GGAGCCA-GT--CC-TT-CAA-A--TAAAGGGCAGA
gi|84085 : tgTAG-AA-C-AA--AA--G-T-T-GT---A--GA-AAAT-GACAAGGCAAT---TTCATCCAT-A-TCAA--G---TTTTA-GAGGCCA-GC--TC-TT-CAA-A--TTAAGGGCCGA
gi|84091 : tgTAG-AA-C-AA--AA--G-C-T-GT---A--GGTAA-T-TACAAGGC-GTA--TTCGACAAT-A-TCAA--G---TTTGG-GGGGCCA-GA--TT-TT-CCA-A--TTAAG
gi|84108 : taTAT-AA-T-AA--AA--G-T-T-CT---A--GATA--TGTACAAGGCC-TA--TTCGACGAT-A-TCAA--G---TTTT----GGCCA-GC--CC-TT-CAC-A--TTAGGGGCTGAgac
gi|84102 : TAG-AA-C-AA--AA--G-C-T-GT---A--GATAA-T-GACAA-GCCCTA--TTCGCCCAT-A-T-GA--G---TTTTA-GGGGCCA-GC--TC-TT-TTA-A--TTAAG
gi|84089 : tgTAG-AA-C-AA--AT--G-T-T-GT---A--GA-AAAT-GGCAAGGC-GTA--TTCGACAAT-A-TCAA--G---CTTAT-GGGTCCA-GC--CC-TT-CCA-A--TTAAGGGCCGAg
gi|84090 : tgTAG-AA-C-AA--AT--G-T-T-GT---A--GA-AAAT-GGCAAGGC-GTA--TTTGACCAT-A-TCAC--G---TTTAT-TGGGCCA-GC--CT-TT-CCA-A--TTAAGAGCCGA
gi|84081 : tgTAG-AA-C-AA--AA--A-T-T-GT---A--GA-ACAT-GA-AAAGGCGTA--TTCGACAAT-A-TCAA--G---TTTTA--GGGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TTAAG-GCCGA
gi|84103 : tgTAG-AA-C-AA--AA--G-C-T-GT---A--GATAA-T-GACAT-GCCCTA--TACGCCCAT-A-TCAA--G---TTTAA-GGGGCCA-GC--TC-TT-TTA-A--TTAAGGa
gi|84084 : tgTAG-AA-C-AA--A---G-T-T-GT---A--GAT---T-GACAA-GACGTA--TTCGACAAT-A-TGAA--G---TTTTA-GGA--CA-GG--CC-TT-CAA-A--TTAAGGGCCGA
gi|84101 : taTAG-AA-C-AA--AT--G-C-T-GT---A--GATAA---TGAGAAGTCTTA--TTCGCCCAT-A-TCAA--G---TTTAA-AGAGCCA-GC--CC-TT-TGA-G--TTAAGGGC
gi|84092 : tgTAG-A--C-AA--AA--A-T-T-GT---A--G--AAAT-TG-GAAGC-GTA--TTCGACAAT-A-TCAA--G---TTTTA--GGGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TTAAAGGCCGA
gi|84094 : tgTAG-AA-C-AA--AA--G-C-T-GT---A--GATCA-T-GACAA-GCCCTA--TTTGCCCAT-A-TGAC--G---TTTTA--GGGCCA-GC--CC-TT--AA-A--TTAAGG
gi|84097 : tgTAG-AA-C-CA--AA--A-T-T-GT---A--G--AAAG-TGAAAAGCCGTAG-TTCGACAAT-AGTCAA--G---TTTTA-GGGGCCATTC--CC-TT-CGT-A--TTTAAA
gi|84087 : tgTAG-AAAC-AA--AA--G-T-T-GT---AACGGTAA-T-GACAAGGCCTCT--TTCGACCAT-A-TCAAAGA---TTTTA--GGGTCA-AT--CT-TTAAAA-A--TTAAGGGCTGAg
gi|84100 : tgTAG-AA-C-AA--AC--G-TCT-GA---A--GATAA-----TGATGTCCTA--TTCG-CCAT-A-TCAA--G---TTTTA-GGGGC---AC--CC-TT-CAA-A--TTAAG-GCCGA
gi|84086 : tgTAG-AA-C-AA--AA--G-T-TTGT---A--G--AAAT-GACAAGGCAA-A--TTCATCCAT-A-TCAAG-G---TTTTA-GAGG-CA-GC--TC--T-CAA-A--TTAAG-GCCGAa
gi|84098 : tgTGG-AG-T-AACAAA--A-T-T-GT---A--G--AAAA-TGCCAAGGCGTAA-TTCGACTAT-A-TCAA--G---TTTTAGGGGGCCA-G---CC-TT-CAA-a
gi|84082 : TAG-AA-C-AA--AA--AAT-T-GT---A--GA-AAAT-GA-AAGGGCGTA--TACGACAATTA-TCAA--G---TTTTA--GGGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TTAAGGGCtgaagtggccga
gi|84083 : tgTAG-AA---AA--AA--A-T-T-GT---A--GA-AAAT-GA-AAAGGCGTA--TTCGACAAT-ATTCAA--G---TTTTA-GGGG-CA-ACTACC-TT-GTA-----TAAGGGCTGAgaa
gi|84095 : tgTAG-AA-C-AA--A---G-C-T--T---A--GTCAAAT-GACAA-GCCCTA--TTTGCCCAT-A-T-GA--C---TTTTA-GGG-CCA-GC--CC-TT-TAA-A--TTAAGG
gi|84099 : tgTAGTAA-C-AA--AATAG-T-TTGT---A--AGAAGAT-GACAAGGCTAAA--T-CGACCAT-A-TCAA--G---GTGTA-GGGGCCA-GC--CT-AT-C---A--TTAAAGGCCGA
gi|84110 : tgAG-AA-C-AA--AA--G-T-T-GT---A--AA-AAAT-GACAAGTCC-TA--TTCGGCCAT-A-TCAA--G---TTTTA-GGGACCA-TC--CC-TT-CAA-A--TTAAGGGCCGA
gi|84096 : G-AA-T-AA--AA--G-T-T-CT---A--GATAA-T-TACAGGACA--A--TTCGCAGAT-A-TCAA--G---TTTTC-GGGGCCA-GC--CC-TT-C-A-A--TT-AGGGCTGA
gi|84113 : tgtat-AA-C-AA--AA--G-T-T-GT---AT-GG--AAT-TACAAGGC-ATA--TTTGACCAT-A-TCAA--G---TTTTA-TGGGCCA-GC--CC-TT-TAA-A--TAAAGGACTGA
gi|84111 : -AA-T-AA--AA--G-T-T-CT---A--GATAA-T-TACAAGGCCA-A--TTCGCCGAT-A-TCAA--G---TTTTA-GGGGCCA-GC--CCATT-CAA-AATTTAGGGGCTGA
gi|84115 : -AA-T-AA--A---G-T-T-CT---A--TATAA---TACAAGGTC-TA--TTCGACGAT-A-TCAA--G---TTTTAAGGGGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TTAGGGGCTGA
gi|84112 : -AA-T-AA--AA--G-T-T-CT---A--GATAA-T-TACAGGACCA-A--TTCGCCGAT-A-TCAA--G---TTTTC-GGGGCCA-GC--CC-TT-CAAGA--TTAGGGGCTGA
gi|84114 : -AA-T-AA--AA----T-T-CT---A--GATAATT-TACAAGGCC-TA--TTCGACAAT-A-TCAA--G---TTTTT-AGGGCCA-G---CC-TT-CAA-A--TT-AGGGCTGA
gi|84109 : -AA-C-AA--AA--A-T-T-GT---A--GA-ACAT-GA-AAAGGCGTA--TTCGACAAT-A-TCAA--G---TTTTA-GGGGCCA-TC--CC-TT-CGT-A---TAAGGGCTGA
gi|84093 : aga-AA-C-AA--AA--A-T-T-GT---A--G--AAAT-TG-GAAGC-GCA--TTCGACAAT-AATCA---G---TTTTA--GGGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TTAAAGGCCGA
gi|84117 : tgta-AA--AA--G-T-T-GT---A--GGTAA-T-TACAA-GCGGTA--TTCGACCAT-A-TCAA--T---TTTTT-TGGGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TTAGGGGCCGA
gi|84116 : -AA--CA--G-T-T-GT---A--GGTCA-T-GACAA-GCCGTA--TTCGACCAA-A-TCAA--G---TTTTA-TGGGCCA-GT--CC-TT-CAA-A--TTA
gi|84118 : agAAT-GACAAGGCCTT---TTCGACCAT-A-TCAA--G---ATTTA-GGGGCCA-AT--TC-TT-TAA-A--TTAAGGGCTGA
gi|84119 : TCGACGAT-A-TCAA--G---TTTTA-GGGG-CA-GC--CC-TT-CAA-A--TT-AGGGCTGA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|84104 ): TGTAGAACAAACAATGTAGAATATGAAAAGGCGTCTTCCCGACGACAATATCCAGTTTAGGAAGGCCATCCCTTCGTATTAAGGGCCGA
Alignments
lowQualScore : 1111 11
lowQualScore : 1 1 1 11 1 1 2 111 22 6666 1 1 44 33 22222 1 1 2 1 22 111 22 11 1 11 1 2 1 1 11 11 1
lowQualScore : . . . .. . . . ... .. .... . . .. .. ..... . . . . .. ... .. .. . .. . . . . .. .. .
lowQualScore : 1 1 1 55 1 1 2 999 66 9999 1 1 99 66 66666 0 0 1 0 44 888 55 44 0 44 0 1 7 0 44 44 1
consensus : TAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GATAAATG-ACAAGGCCGTA--TTC-----GACNAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CGA-A--TT--AAG-GGCCGA
Reference ( family-496 ) : TAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GATAAATG-ACAAGGCCGTA--TTC-----GACNAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84081 : TAG-AA-C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-ACATG-AAAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTA--G--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AA--GGCCGA
gi|84082 : tgTAG-AA-C-AAAA--AAT-T-GT---A--GA-AAATG-A-AAGGGCGTA--TAC-----GACAATTA-T-CAA--G---TTTTA-GG--G-CCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAG-GGCa
gi|84083 : tgTAG-AA---AAAA--A-T-T-GT---A--GA-AAATG-AAAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-TTCAA--G---TTTTA-GG--GG-CA-ACTACC-TT-GTA-----T--AAG-GGCTGAgaa
gi|84084 : tgTAG-AA-C-AAA---G-T-T-GT---A--GAT---TG-ACAAGAC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-GAA--G---TTTTA-GG--A--CA-GG--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84085 : taTAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GA-AAATG-ACAAGGCAAT---TTC-----ATCCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GA--GGCCA-GC--TC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84086 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-T-TTGT---A--GA--AATG-ACAAGGCAA-A--TTC-----ATCCAT-A-T-CAAG-G---TTTTA-GA--GG-CA-GC--TC--T-CAA-A--TT--AA--GGCCGA
gi|84087 : tgTAG-AAAC-AAAA--G-T-T-GT---AACGGTAA-TG-ACAAGGCCTCT--TTC-----GACCAT-A-T-CAAAGA---TTTTA--G--GGTCA-AT--CT-TTAAAA-A--TT--AAG-GGCTGAa
gi|84088 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GGTAA-TT-ACAAGGT-GTA--TTC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--AGCCA-GT--CC-TT-CAA-A--TA--AAG-GGCAGA
gi|84089 : tgTAG-AA-C-AAAT--G-T-T-GT---A--GA-AAATG-GCAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---CTTAT-GG--GTCCA-GC--CC-TT-CCA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84090 : tgTAG-AA-C-AAAT--G-T-T-GT---A--GA-AAATG-GCAAGGC-GTA--TTT-----GACCAT-A-T-CAC--G---TTTAT-TG--GGCCA-GC--CT-TT-CCA-A--TT--AAG-AGCCGA
gi|84091 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GGTAA-TT-ACAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTGG-GG--GGCCA-GA--TT-TT-CCA-A--TT--AAG-GAC
gi|84092 : taTAG-A--C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-AATTG-G-AAG--CGTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTA--G--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAA-GGCCGA
gi|84093 : tg-AA-C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-AATTG-G-AAG--CGCA--TTC-----GACAAT-AAT-CA---G---TTTTA--G--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAA-GGCCGA
gi|84094 : tgtaTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GATCA-TG-ACAAGCCC-TA--TTT-----GCCCAT-A-T-GAC--G---TTTTA--G--GGCCA-GC--CC-TT--AA-A--TT--AAG-GG
gi|84095 : tgTAG-AA-C-AAA---G-C-T--T---A--GTCAAATG-ACAAGCCC-TA--TTT-----GCCCAT-A-T--GA--C---TTTTA-GG--G-CCA-GC--CC-TT-TAA-A--TT--AAG-GG
gi|84096 : tgG-AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATAA-TT-ACAGGACA--A--TTC-----GCAGAT-A-T-CAA--G---TTTTC-GG--GGCCA-GC--CC-TT-C-A-A--TT---AG-GGCTGA
gi|84097 : tgtatTAG-AA-C-CAAA--A-T-T-GT---A--GA-AAGTG-A-AAAGCCGTAG-TTC-----GACAAT-AGT-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCATTC--CC-TT-CGT-A--TTTAAAG-
gi|84098 : tg-AA-C-AAAA----T-T-GT---A--GA-AAATG-CCAAGGC-GTAA-TTC-----GACTAT-A-T-CAA--G---TTTTAGGG--GGCCA-G---CC-TT-C-A-A--TG--AAGTGGCCGA
gi|84099 : tggagtTAGTAA-C-AAAATAG-T-TTGT---A--AGAAGATG-ACAAGGCTAAA--T-C-----GACCAT-A-T-CAA--G---GTGTA-GG--GGCCA-GC--CT-AT-C---A--TT--AAA-GGCCGA
gi|84100 : tgTAG-AA-C-AAAC--G-TCT-GA---A--GATAA-TG-AT---GTCCTA--TTC-----G-CCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGC---AC--CC-TT-CAA-A--TT--AA--GGCCGA
gi|84101 : tgTAG-AA-C-AAAT--G-C-T-GT---A--GATAA-TG-AGAAGTCT-TA--TTC-----GCCCAT-A-T-CAA--G---TTTAA-AG--AGCCA-GC--CC-TT-TGA-G--TT--AAG-GGCa
gi|84102 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GATAA-TG-ACAAGCCC-TA--TTC-----GCCCAT-A-T--GA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--TC-TT-TTA-A--TT--AAG-
gi|84103 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GATAA-TG-ACA-TGCCCTA--TAC-----GCCCAT-A-T-CAA--G---TTTAA-GG--GGCCA-GC--TC-TT-TTA-A--TT--AAG-GG
gi|84104 : tgTAG-AA-C-AAAC--A-A-T-GT---A--GA-ATATG-AAAAGGC-GTC--TTCCCGACGACAAT-A-T-CCA--G---TTT-A-GGAAGGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84105 : tgTAG-AA-T-AAAA--G-T-T-GT---A--GGTAAATT-ACAAAGCCGTA--TTC-----GACCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-AGCTGA
gi|84106 : TAG-AA-T-AAAA--G-T-T-GT---A--GGTTAAT--ACA--GCCGTGATTTC-----GACCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCTGA
gi|84107 : TAG-AA-TTAAAA--G-T-T-GTTATA--GGTAA-TT-ACAAG-CCGTA--TTC-----GACCAT-A-T-CAA--GGTTTTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TTCCAA-A--TT--AAG-GGCTGA
gi|84108 : TAT-AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATA--TGTACAAGGCC-TA--TTC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTT------GGCCA-GC--CC-TT-CAC-A--TT--AGG-GGCTGA
gi|84109 : -AA-C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-ACATG-AAAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A---T--AAG-GGCTGA
gi|84110 : agaAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--AA-AAATG-ACAAGTCC-TA--TTC-----GGCCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GACCA-TC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84111 : -AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATAA-TT-ACAAGGCCA-A--TTC-----GCCGAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CCATT-CAA-AATTT--AGG-GGCTGA
gi|84112 : -AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATAA-TT-ACAGGACCA-A--TTC-----GCCGAT-A-T-CAA--G---TTTTC-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAAGA--TT--AGG-GGCTGA
gi|84113 : -AA-C-AAAA--G-T-T-GT---AT-GG--AATT-ACAAGGC-ATA--TTT-----GACCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-TG--GGCCA-GC--CC-TT-TAA-A--TA--AAG-GACTGA
gi|84114 : -AA-T-AAAA----T-T-CT---A--GATAATTT-ACAAGGCC-TA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTT-AG--GGCCA-G---CC-TT-CAA-A--TT---AG-GGCTGA
gi|84115 : AAA--G-T-T-CT---A--TATAA-T--ACAAGGTC-TA--TTC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTTAAGG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AGG-GGCTGA
gi|84116 : aatAG-AA-C-A-----G-T-T-GT---A--GGTCA-TG-ACAAG-CCGTA--TTC-----GACCAA-A-T-CAA--G---TTTTA-TG--GGCCA-GT--CC-TT-CAA-A--TT--A
gi|84117 : -AAAA--G-T-T-GT---A--GGTAA-TT-ACAAG-CGGTA--TTC-----GACCAT-A-T-CAA--T---TTTTT-TG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AGG-GGCCGA
gi|84118 : AATG-ACAAGGCCTT---TTC-----GACCAT-A-T-CAA--G---ATTTA-GG--GGCCA-AT--TC-TT-TAA-A--TT--AAG-GGCTGA
gi|84119 : TC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GG-CA-GC--CC-TT-CAA-A--TT---AG-GGCTGA
Alignments
lowQualScore : 1111 11
lowQualScore : 1 1 1 11 1 1 2 111 22 6666 1 1 44 33 22222 1 1 2 1 22 111 2 11 1 11 1 2 6 1 11 11 1
lowQualScore : . . . .. . . . ... .. .... . . .. .. ..... . . . . .. ... . .. . .. . . . . .. .. .
lowQualScore : 1 1 1 55 1 1 2 999 66 9999 1 1 99 66 66666 0 0 1 0 44 888 1 44 0 44 0 1 1 0 44 44 1
consensus : TAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GATAAATG-ACAAGGCCGTA--TTC-----GACNAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CGA-A--TT--AAG-GGCCGA
Reference ( family-496 ) : TAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GATAAATG-ACAAGGCCGTA--TTC-----GACNAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CGA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84081 : TAG-AA-C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-ACATG-AAAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTA--G--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AA--GGCCGA
gi|84082 : tgTAG-AA-C-AAAA--AAT-T-GT---A--GA-AAATG-A-AAGGGCGTA--TAC-----GACAATTA-T-CAA--G---TTTTA-GG--G-CCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAG-GGCa
gi|84083 : tgTAG-AA---AAAA--A-T-T-GT---A--GA-AAATG-AAAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-TTCAA--G---TTTTA-GG--GG-CA-ACTACC-TT--GT-A---T--AAG-GGCTGAgaa
gi|84084 : tgTAG-AA-C-AAA---G-T-T-GT---A--GAT---TG-ACAAGAC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-GAA--G---TTTTA-GG--A--CA-GG--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84085 : taTAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GA-AAATG-ACAAGGCAAT---TTC-----ATCCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GA--GGCCA-GC--TC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84086 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-T-TTGT---A--GA--AATG-ACAAGGCAA-A--TTC-----ATCCAT-A-T-CAAG-G---TTTTA-GA--GG-CA-GC--TC--T-CAA-A--TT--AA--GGCCGA
gi|84087 : tgTAG-AAAC-AAAA--G-T-T-GT---AACGGTAA-TG-ACAAGGCCTCT--TTC-----GACCAT-A-T-CAAAGA---TTTTA--G--GGTCA-AT--CT-TTAAAA-A--TT--AAG-GGCTGAa
gi|84088 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GGTAA-TT-ACAAGGT-GTA--TTC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--AGCCA-GT--CC-TT-CAA-A--TA--AAG-GGCAGA
gi|84089 : tgTAG-AA-C-AAAT--G-T-T-GT---A--GA-AAATG-GCAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---CTTAT-GG--GTCCA-GC--CC-TT-CCA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84090 : tgTAG-AA-C-AAAT--G-T-T-GT---A--GA-AAATG-GCAAGGC-GTA--TTT-----GACCAT-A-T-CAC--G---TTTAT-TG--GGCCA-GC--CT-TT-CCA-A--TT--AAG-AGCCGA
gi|84091 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GGTAA-TT-ACAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTGG-GG--GGCCA-GA--TT-TT-CCA-A--TT--AAG-GAC
gi|84092 : taTAG-A--C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-AATTG-G-AAG--CGTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTA--G--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAA-GGCCGA
gi|84093 : tg-AA-C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-AATTG-G-AAG--CGCA--TTC-----GACAAT-AAT-CA---G---TTTTA-GG--G-CCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAA-GGCCGA
gi|84094 : tgtaTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GATCA-TG-ACAAGCCC-TA--TTT-----GCCCAT-A-T-GAC--G---TTTTA--G--GGCCA-GC--CC-TT--AA-A--TT--AAG-GG
gi|84095 : tgTAG-AA-C-AAA---G-C-T--T---A--GTCAAATG-ACAAGCCC-TA--TTT-----GCCCAT-A-T--GA--C---TTTTA-GG--G-CCA-GC--CC-TT-TAA-A--TT--AAG-GG
gi|84096 : tgG-AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATAA-TT-ACAGGACA--A--TTC-----GCAGAT-A-T-CAA--G---TTTTC-GG--GGCCA-GC--CC-TT-C-A-A--TT---AG-GGCTGA
gi|84097 : tgtatTAG-AA-C-CAAA--A-T-T-GT---A--GA-AAGTG-A-AAAGCCGTAG-TTC-----GACAAT-AGT-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCATTC--CC-TT-CGT-A--TTTAAAG-
gi|84098 : tg-AA-C-AAAA----T-T-GT---A--GA-AAATG-CCAAGGC-GTAA-TTC-----GACTAT-A-T-CAA--G---TTTTAGGG--GGCCA-G---CC-TT-C-A-A--TG--AAGTGGCCGA
gi|84099 : tggagtTAGTAA-C-AAAATAG-T-TTGT---A--AGAAGATG-ACAAGGCTAAA--T-C-----GACCAT-A-T-CAA--G---GTGTA-GG--GGCCA-GC--CT-AT-C---A--TT--AAA-GGCCGA
gi|84100 : tgTAG-AA-C-AAAC--G-TCT-GA---A--GATAA-TG-AT---GTCCTA--TTC-----G-CCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGC---AC--CC-TT-CAA-A--TT--AA--GGCCGA
gi|84101 : tgTAG-AA-C-AAAT--G-C-T-GT---A--GATAA-TG-AGAAGTCT-TA--TTC-----GCCCAT-A-T-CAA--G---TTTAA-AG--AGCCA-GC--CC-TT-TGA-G--TT--AAG-GGCa
gi|84102 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GATAA-TG-ACAAGCCC-TA--TTC-----GCCCAT-A-T--GA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--TC-TT-TTA-A--TT--AAG-
gi|84103 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GATAA-TG-ACA-TGCCCTA--TAC-----GCCCAT-A-T-CAA--G---TTTAA-GG--GGCCA-GC--TC-TT-TTA-A--TT--AAG-GG
gi|84104 : tgTAG-AA-C-AAAC--A-A-T-GT---A--GA-ATATG-AAAAGGC-GTC--TTCCCGACGACAAT-A-T-CCA--G---TTT-A-GGAAGGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84105 : tgTAG-AA-T-AAAA--G-T-T-GT---A--GGTAAATT-ACAAAGCCGTA--TTC-----GACCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-AGCTGA
gi|84106 : TAG-AA-T-AAAA--G-T-T-GT---A--GGTTAAT--ACA--GCCGTGATTTC-----GACCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCTGA
gi|84107 : TAG-AA-TTAAAA--G-T-T-GTTATA--GGTAA-TT-ACAAG-CCGTA--TTC-----GACCAT-A-T-CAA--GGTTTTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TTCCAA-A--TT--AAG-GGCTGA
gi|84108 : TAT-AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATA--TGTACAAGGCC-TA--TTC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTT------GGCCA-GC--CC-TT-CAC-A--TT--AGG-GGCTGA
gi|84109 : -AA-C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-ACATG-AAAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A---T--AAG-GGCTGA
gi|84110 : agaAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--AA-AAATG-ACAAGTCC-TA--TTC-----GGCCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GACCA-TC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84111 : -AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATAA-TT-ACAAGGCCA-A--TTC-----GCCGAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CCATT-CAA-AATTT--AGG-GGCTGA
gi|84112 : -AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATAA-TT-ACAGGACCA-A--TTC-----GCCGAT-A-T-CAA--G---TTTTC-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAAGA--TT--AGG-GGCTGA
gi|84113 : -AA-C-AAAA--G-T-T-GT---AT-GG--AATT-ACAAGGC-ATA--TTT-----GACCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-TG--GGCCA-GC--CC-TT-TAA-A--TA--AAG-GACTGA
gi|84114 : -AA-T-AAAA----T-T-CT---A--GATAATTT-ACAAGGCC-TA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTT-AG--GGCCA-G---CC-TT-CAA-A--TT---AG-GGCTGA
gi|84115 : AAA--G-T-T-CT---A--TATAA-T--ACAAGGTC-TA--TTC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTTAAGG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AGG-GGCTGA
gi|84116 : aatAG-AA-C-A-----G-T-T-GT---A--GGTCA-TG-ACAAG-CCGTA--TTC-----GACCAA-A-T-CAA--G---TTTTA-TG--GGCCA-GT--CC-TT-CAA-A--TT--A
gi|84117 : -AAAA--G-T-T-GT---A--GGTAA-TT-ACAAG-CGGTA--TTC-----GACCAT-A-T-CAA--T---TTTTT-TG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AGG-GGCCGA
gi|84118 : AATG-ACAAGGCCTT---TTC-----GACCAT-A-T-CAA--G---ATTTA-GG--GGCCA-AT--TC-TT-TAA-A--TT--AAG-GGCTGA
gi|84119 : TC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GG-CA-GC--CC-TT-CAA-A--TT---AG-GGCTGA
blockSeqs : T A T TA A C T TAT AC CAAA T G CG AT CCGAC A T A T AG GTT G AA T TA A A G G AT TA T
blockSeqs : . . . . . . T . T AAGA . G AA G . A . G . G . A . . . . C G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAAA . A AA A . A . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TTAA . G CT . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAAT . G CG . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAA . G CG . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAA . G CG . . G . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAA . G TA . . A . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G CC . . C . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G CC . . A . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAA . C CG . . A . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAA . C CG . . A . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . A CG . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAT . G CA . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAT . G CA . . G . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TCA . G CG . . A . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G GG . . T . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAG . T CT . . C . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAA . C G . . C . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G G . . C . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G G . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G G . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G G . . A . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . ATA . G G . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G C . . C . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . ACA . T C . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AAA . G A . . G . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . A G . . A . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G T . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G C . . G . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TCA . G G . . G . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TAA . G C . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AA . . G . . A . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TA . . C . . G . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . A . . C . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GATAAATG-ACAAGGCCGTA--TTC-----GACNAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CGA-A--TT--AAG-GGCCGA
finalCons : TAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GATAAATG-ACAAGGCCGTA--TTC-----GACNAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CGA-A--TT--AAG-GGCCGA
Alignments
lowQualScore : 1111 11
lowQualScore : 1 1 1 11 1 1 2 111 22 6666 1 1 44 33 22222 1 1 2 1 22 111 2 11 1 11 1 2 6 1 11 11 1
lowQualScore : . . . .. . . . ... .. .... . . .. .. ..... . . . . .. ... . .. . .. . . . . .. .. .
lowQualScore : 1 1 1 55 1 1 2 999 66 9999 1 1 99 66 66666 0 0 1 0 44 888 1 44 0 44 0 1 1 0 44 44 1
consensus : TAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GATAAATG-ACAAGGCCGTA--TTC-----GACNAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CGA-A--TT--AAG-GGCCGA
Reference ( family-496 ) : TAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GATAAATG-ACAAGGCCGTA--TTC-----GACNAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CGA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84081 : TAG-AA-C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-ACATG-AAAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTA--G--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AA--GGCCGA
gi|84082 : tgTAG-AA-C-AAAA--AAT-T-GT---A--GA-AAATG-A-AAGGGCGTA--TAC-----GACAATTA-T-CAA--G---TTTTA-GG--G-CCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAG-GGCa
gi|84083 : tgTAG-AA---AAAA--A-T-T-GT---A--GA-AAATG-AAAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-TTCAA--G---TTTTA-GG--GG-CA-ACTACC-TT--GT-A---T--AAG-GGCTGAgaa
gi|84084 : tgTAG-AA-C-AAA---G-T-T-GT---A--GAT---TG-ACAAGAC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-GAA--G---TTTTA-GG--A--CA-GG--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84085 : taTAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GA-AAATG-ACAAGGCAAT---TTC-----ATCCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GA--GGCCA-GC--TC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84086 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-T-TTGT---A--GA--AATG-ACAAGGCAA-A--TTC-----ATCCAT-A-T-CAAG-G---TTTTA-GA--GG-CA-GC--TC--T-CAA-A--TT--AA--GGCCGA
gi|84087 : tgTAG-AAAC-AAAA--G-T-T-GT---AACGGTAA-TG-ACAAGGCCTCT--TTC-----GACCAT-A-T-CAAAGA---TTTTA--G--GGTCA-AT--CT-TTAAAA-A--TT--AAG-GGCTGAa
gi|84088 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--GGTAA-TT-ACAAGGT-GTA--TTC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--AGCCA-GT--CC-TT-CAA-A--TA--AAG-GGCAGA
gi|84089 : tgTAG-AA-C-AAAT--G-T-T-GT---A--GA-AAATG-GCAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---CTTAT-GG--GTCCA-GC--CC-TT-CCA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84090 : tgTAG-AA-C-AAAT--G-T-T-GT---A--GA-AAATG-GCAAGGC-GTA--TTT-----GACCAT-A-T-CAC--G---TTTAT-TG--GGCCA-GC--CT-TT-CCA-A--TT--AAG-AGCCGA
gi|84091 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GGTAA-TT-ACAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTGG-GG--GGCCA-GA--TT-TT-CCA-A--TT--AAG-GAC
gi|84092 : taTAG-A--C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-AATTG-G-AAG--CGTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTA--G--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAA-GGCCGA
gi|84093 : tg-AA-C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-AATTG-G-AAG--CGCA--TTC-----GACAAT-AAT-CA---G---TTTTA-GG--G-CCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAA-GGCCGA
gi|84094 : tgtaTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GATCA-TG-ACAAGCCC-TA--TTT-----GCCCAT-A-T-GAC--G---TTTTA--G--GGCCA-GC--CC-TT--AA-A--TT--AAG-GG
gi|84095 : tgTAG-AA-C-AAA---G-C-T--T---A--GTCAAATG-ACAAGCCC-TA--TTT-----GCCCAT-A-T--GA--C---TTTTA-GG--G-CCA-GC--CC-TT-TAA-A--TT--AAG-GG
gi|84096 : tgG-AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATAA-TT-ACAGGACA--A--TTC-----GCAGAT-A-T-CAA--G---TTTTC-GG--GGCCA-GC--CC-TT-C-A-A--TT---AG-GGCTGA
gi|84097 : tgtatTAG-AA-C-CAAA--A-T-T-GT---A--GA-AAGTG-A-AAAGCCGTAG-TTC-----GACAAT-AGT-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCATTC--CC-TT-CGT-A--TTTAAAG-
gi|84098 : tg-AA-C-AAAA----T-T-GT---A--GA-AAATG-CCAAGGC-GTAA-TTC-----GACTAT-A-T-CAA--G---TTTTAGGG--GGCCA-G---CC-TT-C-A-A--TG--AAGTGGCCGA
gi|84099 : tggagtTAGTAA-C-AAAATAG-T-TTGT---A--AGAAGATG-ACAAGGCTAAA--T-C-----GACCAT-A-T-CAA--G---GTGTA-GG--GGCCA-GC--CT-AT-C---A--TT--AAA-GGCCGA
gi|84100 : tgTAG-AA-C-AAAC--G-TCT-GA---A--GATAA-TG-AT---GTCCTA--TTC-----G-CCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGC---AC--CC-TT-CAA-A--TT--AA--GGCCGA
gi|84101 : tgTAG-AA-C-AAAT--G-C-T-GT---A--GATAA-TG-AGAAGTCT-TA--TTC-----GCCCAT-A-T-CAA--G---TTTAA-AG--AGCCA-GC--CC-TT-TGA-G--TT--AAG-GGCa
gi|84102 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GATAA-TG-ACAAGCCC-TA--TTC-----GCCCAT-A-T--GA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--TC-TT-TTA-A--TT--AAG-
gi|84103 : tgTAG-AA-C-AAAA--G-C-T-GT---A--GATAA-TG-ACA-TGCCCTA--TAC-----GCCCAT-A-T-CAA--G---TTTAA-GG--GGCCA-GC--TC-TT-TTA-A--TT--AAG-GG
gi|84104 : tgTAG-AA-C-AAAC--A-A-T-GT---A--GA-ATATG-AAAAGGC-GTC--TTCCCGACGACAAT-A-T-CCA--G---TTT-A-GGAAGGCCA-TC--CC-TT-CGT-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84105 : tgTAG-AA-T-AAAA--G-T-T-GT---A--GGTAAATT-ACAAAGCCGTA--TTC-----GACCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-AGCTGA
gi|84106 : TAG-AA-T-AAAA--G-T-T-GT---A--GGTTAAT--ACA--GCCGTGATTTC-----GACCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCTGA
gi|84107 : TAG-AA-TTAAAA--G-T-T-GTTATA--GGTAA-TT-ACAAG-CCGTA--TTC-----GACCAT-A-T-CAA--GGTTTTTTA-GG--GGCCA-GC--CC-TTCCAA-A--TT--AAG-GGCTGA
gi|84108 : TAT-AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATA--TGTACAAGGCC-TA--TTC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTT------GGCCA-GC--CC-TT-CAC-A--TT--AGG-GGCTGA
gi|84109 : -AA-C-AAAA--A-T-T-GT---A--GA-ACATG-AAAAGGC-GTA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-TC--CC-TT-CGT-A---T--AAG-GGCTGA
gi|84110 : agaAG-AA-C-AAAA--G-T-T-GT---A--AA-AAATG-ACAAGTCC-TA--TTC-----GGCCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GACCA-TC--CC-TT-CAA-A--TT--AAG-GGCCGA
gi|84111 : -AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATAA-TT-ACAAGGCCA-A--TTC-----GCCGAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GGCCA-GC--CCATT-CAA-AATTT--AGG-GGCTGA
gi|84112 : -AA-T-AAAA--G-T-T-CT---A--GATAA-TT-ACAGGACCA-A--TTC-----GCCGAT-A-T-CAA--G---TTTTC-GG--GGCCA-GC--CC-TT-CAAGA--TT--AGG-GGCTGA
gi|84113 : -AA-C-AAAA--G-T-T-GT---AT-GG--AATT-ACAAGGC-ATA--TTT-----GACCAT-A-T-CAA--G---TTTTA-TG--GGCCA-GC--CC-TT-TAA-A--TA--AAG-GACTGA
gi|84114 : -AA-T-AAAA----T-T-CT---A--GATAATTT-ACAAGGCC-TA--TTC-----GACAAT-A-T-CAA--G---TTTTT-AG--GGCCA-G---CC-TT-CAA-A--TT---AG-GGCTGA
gi|84115 : AAA--G-T-T-CT---A--TATAA-T--ACAAGGTC-TA--TTC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTTAAGG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AGG-GGCTGA
gi|84116 : aatAG-AA-C-A-----G-T-T-GT---A--GGTCA-TG-ACAAG-CCGTA--TTC-----GACCAA-A-T-CAA--G---TTTTA-TG--GGCCA-GT--CC-TT-CAA-A--TT--A
gi|84117 : -AAAA--G-T-T-GT---A--GGTAA-TT-ACAAG-CGGTA--TTC-----GACCAT-A-T-CAA--T---TTTTT-TG--GGCCA-GC--CC-TT-CAA-A--TT--AGG-GGCCGA
gi|84118 : AATG-ACAAGGCCTT---TTC-----GACCAT-A-T-CAA--G---ATTTA-GG--GGCCA-AT--TC-TT-TAA-A--TT--AAG-GGCTGA
gi|84119 : TC-----GACGAT-A-T-CAA--G---TTTTA-GG--GG-CA-GC--CC-TT-CAA-A--TT---AG-GGCTGA