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lowQualScore : . .. . . . .... .. . .. ..... .. . . ...... .. .. .. . .. .. .... . . . . ...... . ... .. . . . . . . . . . . . .
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Reference ( gi|84023 ) : GAAGCT-C--C-T-G-AA----TTTT--A-G--TGA-----T--T-T-T----A-GG--A--G--TA-A--A--ATTTA-TAACC-A-TA-T-A------A-T---T--A-GCC-C-T-C-A-T-A-G-G-TG-A-AGTTA
gi|84024 : GAAGCT-C--C-T-G-AA----TTTT--A-C--TGA-----T--T-T-T----T-GG--A--G--TA-A--A--ATT---TAACC-A-TA-T-A------A-T---T--A-GCC-C-C-C-A-T-A-G-G-TG-A-AGTTA
gi|84026 : GAAGTT-C--C-T-G-AA----TTTT--A-G--TGA-----T--T-T-T----T-GG--A--G--TA-A--A--ATT---TAACC-A-TA-T-A------A-T---T--A-GCC-C-T-C-A-A-A-G-G-TG-A-AGTTA
gi|84027 : GAAGCT-C--C-T-G-AA----TTTTT-A-G--TGA-----T--T-T-T----A-GG--A--G--TA-A--A--ATT---TAACC-A-TA-T--------A-T---T--A-GCC-T-T-C-A-T-A-G-G-TG-A-AGTTA
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Alignments
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lowQualScore : 3 33 1 1 1 6666 44 2 44 33333 22 1 1 777777 22 22 22 2 33 22 6666 1 1 3 1 222222 1 222 22 1 3 1 1 1 3 3 2 1 2 1 1
lowQualScore : . .. . . . .... .. . .. ..... .. . . ...... .. .. .. . .. .. .... . . . . ...... . ... .. . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-495 ) : GAAGCT-C--C-T-G-AA----TTTT--A-G--TGA-----T--T-T-T----A-GG--A--G--TA-A--A--ATTTA-TAACC-A-TA-T-A------A-T---T--A-GCC-C-T-C-A-T-A-G-G-TG-A-AGTTA
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gi|84034 : GAAGCT-C--C-T-GTAA----TTTT--A-GG-TGA-----T--T-T-T----A-GGA-A--G--TA-A--A--A--TT-T--AAT-----C-A-TA-T-AA-T---T--A-G-C-C-T-C-A-TAA-G-G-TG-A-AGTTA
gi|84035 : GAAGCT-C--C-T-G-AA----TTTT--A-G--TTG-----T--T-T-T------GG--A--GT-TA-A--A--A--TT-T--AAC-----C-A-TATT-AA-T---T--A-GCC-C-TCC-G-T-A-G-G-TG-A-AGTTA
gi|84036 : GAAGCT-C--C-T-G-AA----TTTT--A-G--TGATTTATT--T-T-T----A-GGAAA--G--TA-A--AT-A--TT-T--AAC-----C-A-TA-T-AG-T---T--A-GCCTC-T-C-A-T-AGG-G-TG-A-AGTTA
gi|84037 : GAAGCT-C----T-G-AA----TTTT--AAG--TGA-----T--T-T-TT---A-GG--A--G--TA-A--A--A--TT-C--AAC-----C-A--A-T-AA-T---T--A-GCC-T-C-T-A-T-A-G-G-TG-A-AATTA
gi|84038 : GAAGCT-C----T-G-AA----TTTT--A-G--TG------T--T-T-T----A-GG--A--G--TA-A--A--A--TT-TA-A-------C-A--A-T-AG-TATAT--A-GTC-C-T-C-A-T-A-G-G-TG-A-AGTTA
gi|84039 : GAAGCT-C----T-G-AA----TTTT--A-G--TGAG----T--T-T-T----A-GG--A--A--TA-A--A--A--TTCTT-AAC-----C-A-TA-T-AA-T---T--A--CC-C-T-C-A-T-A-G-G-TG-
gi|84040 : GAAGTT-C--C-C-A-GA----TTC---A-G--TGG-----T--T-T-T------GG--A--G--TT-A--A--A--TT-TA-AAC-----C-A-TA-T-AA-TA--T--A-GCC-C-T-C-A-T-A-T-G-TG-A-AGTTA
gi|84041 : GAAGCT-C--C-TTG-AA----TATT--C-G--TGA-----T--T-T-T----TTGG--A--G--TA-A--A--ACCTT-TA-A-C-----C-A-TA-T-AA-T---T--A-ACC-C-T-C-A-T-A---G-TG-A-
gi|84042 : GAAGC--C--C-T-G-AA----TTTT--A-G--TGA-----T--T-T------A-GG--A--G--CA-A--A--A--TT-T--AAC-----C-A-TAGT-AA-T---T--A-ACC-C---C-A---A-G-G-TG---AGTTA
gi|84043 : GAAGCT-C--C-T-G-AAA---TTTT--AAG--TGA-----T--T-T------A-GG--AAAG--TA-A--A--A--TT-TATAAC-----C-A-TA-T-AA-TGGAT--A-GCC---T-C-A-C-A-G-G-TG-A-AGTT
gi|84044 : GAAGTT-C--C-C-G-AA----TTC---A-G--TGT-----T--T-T-T------GG--A--G--TT-A--A--A--TT-TA-A-C-----C-A-TA-TTAA-T---T----GCC-C-T-C-A-T-ATGTG-TG-A-AGTTA
gi|84045 : GAAGCT-C--C-C-G-AT----TATC--A-G--TGA-----T--T-T-T----T-GG--A--G--TA-A--G--AT-TT-TT-AAC-----C-A-TA-T-AA-T---T--A-GCC-CTT-C-AGT-A-G-GCTG-A-AGTTA
gi|84046 : GAAGTT-C--A-G-G-AA----TTTT--T-G--TGA-----T--T-T-T----A-GG--A--G--CA-A--A--A--TT-T--AAC-----C-T-TA-T-AA-T---T--A-GCT-T-T-C-A-T-
gi|84047 : GAAGCT-C--C---G-AA----TTTC--A-G--TGA-----T--T-T-TTTTTG-GA--A--G--TA-A--A--A--TT-TA-AAC-----C-A-T-----A-T---T--A-GCC-C-T-T-A-A-A-G-G-TG-A-AGTTA
gi|84048 : GAAGCTTC--C-T-G-AA----TTTT--A-T--TGA--------T-T-T----A-GG--A--G--TA-AC-G--A--TT-TA-CAC-----C-A-TT-A-AA-T---T--A-GCC-C-T-A-ATT-A-G-G-TG-A-AGTT
gi|84049 : GAAGCTTC--C-T-G-AA----TTTT--A-T--TGA--------T-T-T----A-GG--A--G--TA-AC-G--A--TT-TA-CAC-----C-A-TT-A-AA-T---T--A-GCC-C-T-A-ATT-A-G-G-TG-A-AGTT
gi|84050 : GGAGCT-CA-C-C-G-AG----TTTC--A-G--TGA-----T--T-T-T----T-GG--A--G--TA-A--A--A--AT-TT-AAC-----C-ACTA-T-AATT---T--A-GCC-C-T-C-A-T-A-G-
gi|84051 : GAAGCTTC--C-T-G-AAATATTTCTCAA-G--TGA-----T--T-T-T----A-GG--A--G--TATA--A--A--TTCTA-A-------C-A-TA-T--A-T---T--A-GCC-C-T-C-A-TCA-G-G-TG-ACAGTTAtcagaagct
gi|84052 : GAAACT-C--CCT-G-AA----TTTT--A-G--TGA-----TTGT-T-C----A-GG--A--G--TA-T--A--A--TT-T--AAC-----C-A-T--T-AA-----T--A-GCT-C-T-
gi|84053 : AAGCT-C--C-T-G-AA----TTGT--A-G--TG---------T-T-T----A-GG--A--G--TA-A--A--A--TT-TA-A-C-----C-A-TA-T-AA-T---T--A-GCC-C-T-C-A-T-A-G-G-CG-A-AGTTA
gi|84054 : AGGCT-C--C-----GA----TTTC--A-G--TGA-----T--TAT-T----T-GG--A--G--TT-A--A--A--TT-TT-AAC-------A-TA-T-AA-T---T--AGGCC-C-T-CAA-T-A-T-G-TG-A-AGTTA
gi|84055 : AGCT-C--C-T-G-AAAT--TTTT--A-G--TGA-----T--T-T-T----AAGG--A--G--TA-AGGA--A--TT-TA-A-C-----C-A-TA-T-AC-T---T--A-GCC-C-T-C-A-T-A-G-G-TG-A-AGT
gi|84056 : AGCT-CAAC-T-G-AA----TTTTC-A-G--TGA-----TA-T-T-T----T-GG--A--G--TT-A--A--A--TT-TA-A-------C-A-TA-T-AA-T---C--A-GCC-C-T-C-A---A-T-G-TG-A-AGTTA
gi|84057 : GCT-C--C-T-G-AAA---TTTT--A-G--TGA-----T--T-T-T----A-GG--A--G--TA-A--A--A--TT-T--AAC-----C-A-TA-T-AA-T---T--A-AGC-C-T-
gi|84058 : GCT-CA-C-T-G-AA----TTTT--A-GCCTGA-----T--T-A-C----G-CG--A--G--TA-A--A--A--AT-TT-AAC-----C-A-TA-T-AA-T---CTAA-GCCTC-T-C-A-T-A-G-GTTG-A-AGTTA
gi|84059 : CT-C--A-T-G-AA----TTTT--A-G--TGA-----T--T-T-T----A-GG--A--G--TA-A--A--A--AT-TC-AAC-----C-A-TA-T-AA-T---T--A-GCCTC-T-C-
gi|84060 : CT-C--C-G-G-AA----TTTTT-A-G--TGA-----T--T-G-T----T-GG--A--GTATA-A--A--A--TT-T--AAC-----C-A-T--T-A------T--A-GCC-T-T-T-C-T-A-G-G-TG-A-AGTCA
gi|84061 : T-C--C-T-G-AA----TTTT--A-G--TG------T--T-T-T----A-GG-----G--TA-A--A--A--TT-TA-ACCATATAC-A-TG-T-AA-T---T--A-GCC-C-T-C-A-T-A-A-G-TG-A-AGTTA