lowQualScore                  :          0 11  0    000 0 7777 0   000   0   000  0   1 3333   000   0    1   0 1      0 2222   0  0                 11   0      00 000 11 0000    0   0000         
lowQualScore                  :          . ..  .    ... . .... .   ...   .   ...  .   . ....   ...   .    .   . .      . ....   .  .                 ..   .      .. ... .. ....    .   ....         
lowQualScore                  :          4 00  4    777 4 7777 8   777   4   777  4   6 9999   777   4    4   4 2      4 7777   4  4                 44   4      66 777 00 9999    4   9999         
consensus                     :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
Reference ( gi|12003 )        :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12008                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12005                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12039                      :     AAAGG-T--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11975                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12055                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTTGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12053                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-ATAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11963                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CACCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12075                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12074                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12068                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12065                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12064                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12007                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-TC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12006                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGAGAT
gi|12060                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAGGTGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12059                      :     AAAGT-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12077                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12062                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAT---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAA----AGGTGGGAT
gi|12030                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12025                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-T----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11801                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-T----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12042                      : atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGA
gi|11970                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12043                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCTTG--G---A--C----ACAC-CAG----AAGTGGGAT
gi|12040                      :     AAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCTCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGAGAT
gi|12070                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--T-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12017                      :     AAAGG-C--GC-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11996                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT-A----TCG---TAA-GTCCTAGA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12014                      :     AAAGG-C--AA-AGAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGGGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11969                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAG-GTCCTAAA-T-AGAATA-CA-A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11972                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AGGTGGGGT
gi|12035                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCT---TAA-ATCCTAAA-T-AAAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12009                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12036                      :     AAAGA-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CGG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTGAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11981                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-ATCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACAC-TAG----AGGTGGGAT
gi|12037                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CGG-TGA---TC-ACT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAT-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12048                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAAAGTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTCGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12032                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-CA-A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-GAG----AGGTGGGAT
gi|12001                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-GAT-C----TCG---TAA-GTCGTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12029                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-ATCCTAAT-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12026                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-T----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAT-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12050                      :     AAAGG-C--CA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT-C----TCG---CAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11800                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCC-AAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGACAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AAGTGGGAT
gi|12044                      : atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAT-CAG----AGGTGGGAT
gi|12018                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AT-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11997                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGAAAAACAC--GGA-CCTCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12021                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-ATTAAC-GAA---CAG-TGA---TA-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11968                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATTC----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11967                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATTC----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11966                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATTC----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11979                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12000                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAA--T-AGAATA-C--A-AAA-A--AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12041                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAA-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C----AAA-AC-AAGATTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11977                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGG-CCCCTG--G---A--T----ACAC-CAT----AGGTGGGAT
gi|12023                      :     AAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTAAA-T-ATAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11789                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGCTGGGCAAACAC--AGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12067                      : atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCTTG--T---A--C----ATAC-CAG----ATGTGGGAT
gi|12066                      :     AAATG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12034                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-AA---C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-ACAAAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAA----AAGTGGGAT
gi|12024                      :     AAAAG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-ATCCCAAA-T-AGAATA-CAAA-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AGGTGGGGT
gi|11807                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAG-TGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----ATGTGGGAT
gi|12010                      : atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAT-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTTTCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11821                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCT---TAA-GTCCTAAA-T-AGAAAA-C----AAA-AC-AAAAGTGGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11974                      : atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-A----TCG---TAA-ATCTCTAA-T-AGAATA-C--A-AAAAAC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12058                      :     AAATG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-ATCCTAAA-T-A------C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12011                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-CA-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATAC-CAG----AAGTAGAAT
gi|11985                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT-C----TCG---TAA-GTCGCAAA-T-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----AAAC-CAG----ATGTGGGAT
gi|12022                      :     AAAGG-C--GA-AGCT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C--A-GAA-GC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----AAAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11791                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAC-C----TCG---TAA-ATCCCAAA-T-AGAATA-C----GAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--A---A--T----ACAC-CAG----AAGTGGGAT
gi|11802                      : atatAAAGA-T--GA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCATAAA-G-AGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11818                      : atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT-C----TCG---TAA-ATCCCAAA-T-AGAAAA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CTCCTA--G---A--C----ACAT-CAG----AGGTGGGAT
gi|11790                      : atatAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA----AG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCTCGAA-C-AGAATA----A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11900                      : atgaAAAGG-C--GA-AGAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-T-AGAATA-C----AAA-AC-AAGATTTGGGCAAACAC--GAA-CCCGTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGGGGT
gi|11998                      :  tgaAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT-A----TCG---TAA-GTCC-AAA-T-AGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGCTGGACAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACGC-CAA----AGGTGGGAT
gi|11933                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----A-GAA---CAG-TGA---TC-ATT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-C-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGACAAACAC--GGA-TCCATG--G---A--C----GTAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11813                      :    aAAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---CAA-GTCCCAAC-C-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAT--GGA-CCCCTG--G---G--T----ACAC-TAA----AAGTGGGAT
gi|11931                      : atcaAAAGG-C--GA-AAAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AGT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-C-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTCGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATAC-CAG----AGTTGG
gi|11971                      :    aAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT-C----TCG---CAA-GCCCCAAA-C-AGCAAA-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---G--T----ATAC-CAG----AGGTGGGATat
gi|11792                      :     AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT-C----TCA---TAA-ATCTCAAA-C-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAT--GGA-CCCCTT--G---G--T----ATAT-CAG----AGGTGGGAT
gi|11784                      : atgaAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-AAA---CAG-TGA---TC-AAT-T----TCA---TAA-GTC------T-GAAATA-C--A-AAA--C-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|11995                      : atggAAAAG-CCAAA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-CGA---TCAAAT-C----TCG---TAA-ATCCCAGA-C-AGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-GCCCTG--G---A--T----ACAC-CAG----AGGTGGGAT
gi|12045                      :     AAAGG-C--AA-AGAC---ACA----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-T----TCG---TAA-GTCCTAAAAT-ACTACA-T--A-ACA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-C------AGGTGGGAT
gi|11823                      :     AAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCTGTA-C-GGAATT-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTGTAT---A--T----ATAC-CAA----AGGTGGGGT
gi|11797                      : atgaAAAGG-T--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCC-----C-AGAATA-C----AAA-AT-AAGCGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACAC-CAG----GCGTGAGAT
gi|11772                      : atacAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT-TCA--TCG---TAA-ATC--------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATAC-C------AGGTGGGAT
gi|11773                      : ataaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT------TCG---T-----CGTAAA-TCAGAATA-T--ATAAA-AC-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATAC-C------AGGTGGGAT
gi|11775                      : ataaAAAGG-C--GAGACAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT------TCA---T-----CATAAA-TCAGAATAAC--A-AAA-A---AAAGTTAGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATAC-C------AGGTGGGAT
gi|11780                      : ataaAAAGG-C--AA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT-TCT--TCG---TAA-ATC--------AGAATA-C--A-AAA--C-AA-AGTTGGGGGAAAAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATAC-C
gi|11776                      : ataaAAAGG-C--GG-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGG----C-GAT------TCA---T-----CATAAA-TCAGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGTTAGGAAAACAC--GGA--CCCTG--G---A--T----ATAC-CA-------GTGGGAT
gi|11781                      : ataaAAAGA-C--GA-AAAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GTTTC----ACG---TAA-ATC--------AGAATA------AAA-AC-AAAGGTTGGGGAAACAC--GG--CCCCTG--G---A--T----ATAC-T------AGGTGGGAT
gi|11778                      : acaaAAAGGACG-AA-AGATCAAA-A----CCGAA---CAG-TGG---CG-ATT-CA---TCG---TAA-ATC--------AGAATA-C--A-AAC-AA-AAAGGTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATAC-ATGTACCAGGTGGGAT
gi|11779                      :  ataAAAGG-T--GA-AGAC---A-AAA--C-GAG---CAG-TGG---GC-GAT-TCA--TCG---TAA-ATC----------AATA-C--A-AAA--C-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA--CCCTG--G---A--T----ATAC-C------CGGTGGGAT
gi|11782                      : ataaAAAGG-A--GA-AAAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT-TACATTCG---TTA-CTC--------AGAATG-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGGAAAACACG-GGA-CCCCTG--ATATA--CGGTAATAC-CA-----AGGTGGGAT
gi|11783                      : ataaAAAGG-T--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAT-TGA---GC-AAT-TCA--TTG---TAA-ATTC--------AAATA-C--A-AA---C-AAG--TTGGA-AAACAC--GAA-CCCCTG--G---AT-T----ATAC-T------AGGTGGGAT
gi|11922                      : attaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAAAAT-GAA---CAG-TGA---GC-GA---------G---CAG-ACCGTAAA-T-CAGATA-C--A-AAA--C-AAAAATTGGGGAAACACCGGGACCCCCTG--G---AATG----ATAC-CAG-----GTCGGGAT
gi|11924                      :   aaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAAAAATAG-TGA---C---AT-T----TCG---T-----CGTAAT-C-ATAACA-C--A-AAA--C-AA-ATTGGGGGAAACACC-GGA-CCCCCG--G---A--T----ATACGC------AGGTGG
gi|11816                      :     aaAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT-C----TCG---TAA-GTCCCAAA-C-AGAATA-C----CAA-AC-TAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACAC-CAG----AGGTGAGAT
gi|12313                      :  ataaatGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT------TCGCTGTAA-ATC--------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGA-AAACAC--GGA-CCCTTG--G---A--T----ATAC-C------AGGTGGAAT
gi|11825                      :                    T---A-A----CAGAA---CAG-TGACGATT-ATT-CA---TCG---TAA-ATC--------AGAATA-C--A-AAA-CA-AACAGTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCT---G---A--T----TTAC---G----AGGTGAGA





Alignments
lowQualScore                  :                             0 11  0    000 0 7777 0   000   0   000  0   222 6666      0    1   0       0 2222   0  0                 11   0      00 000 00 0000       1111         
lowQualScore                  :                             . ..  .    ... . .... .   ...   .   ...  .   ... ....      .    .   .       . ....   .  .                 ..   .      .. ... .. ....       ....         
lowQualScore                  :                             4 00  4    777 4 6666 8   777   4   777  4   333 1111      4    5   4       4 6666   4  4                 44   4      55 777 99 8888       3333         
consensus                     :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
Reference ( family-49 )       :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11772                      :                        AAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCA--TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGGAT
gi|11773                      :                    ataaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCG--TCGTAA-ATC-------AGAATA-T--ATAAA-AC-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGGAT
gi|11775                      :                    ataaAAAGG-C--GAGACAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCA--TCATAA-ATC-------AGAATAAC--A-AAA-A---AAAGTTAGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGGAT
gi|11776                      :                    ataaAAAGG-C--GG-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGG---CG-ATT---CA---TCATAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGTTAGGAAAACAC--GGA--CCCTG--G---A--T----ATACCA-------GTGGGAT
gi|11778                      :                    ataaAAAGGACG-AA-AGATCAAA-A----CCGAA---CAG-TGG---CG-ATT---CA---TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAC-AA-AAAGGTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACATGTACCAGGTGGGAT
gi|11779                      :                     ataAAAGG-T--GA-AGAC---A-AAA--C-GAG---CAG-TGG---GC-GAT---TCA--TCGTAA-ATC---------AATA-C--A-AAA--C-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA--CCCTG--G---A--T----ATACC------CGGTGGGAT
gi|11780                      :                    ataaAAAGG-C--AA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCT--TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AA-AGTTGGGGGAAAAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC
gi|11781                      :                    ataaAAAGA-C--GA-AAAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GTTT--C----ACGTAA-ATC-------AGAATA------AAA-AC-AAAGGTTGGGGAAACAC--GG--CCCCTG--G---A--T----ATACT------AGGTGGGAT
gi|11782                      :                    acaaAAAGG-A--GA-AAAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TACATTCGTTA-CTC-------AGAATG-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGGAAAACACG-GGA-CCCCTG--ATATA--CGGTAATACCA-----AGGTGGGAT
gi|11783                      :                    ataaAAAGG-T--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAT-TGA---GC-AAT---TCA--TTGTAA-ATTC-------AAATA-C--A-AA---C-AAG--TTGGA-AAACAC--GAA-CCCCTG--G---AT-T----ATACT------AGGTGGGAT
gi|11784                      :                    attaAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-AAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCATAA-GTC------TGAAATA-C--A-AAA--C-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11789                      :                    atggAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGCTGGGCAAACAC--AGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11790                      :                    atatAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA----AG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCTCGAA-CAGAATA----A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11791                      :                    atgaAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAC---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAATA-C----GAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--A---A--T----ACACCAG----AAGTGGGAT
gi|11792                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT---C----TCATAA-ATCTCAAA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAT--GGA-CCCCTT--G---G--T----ATATCAG----AGGTGGGAT
gi|11797                      :                    atgaAAAGG-T--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCC-----AGAATA-C----AAA-AT-AAGCGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----GCGTGAGAT
gi|11800                      :                    atacAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCC-AAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGACAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AAGTGGGAT
gi|11801                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11802                      :                    atatAAAGA-T--GA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCATAAA-GAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11807                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAG-TGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----ATGTGGGAT
gi|11813                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGCAA-GTCCCAAC-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAT--GGA-CCCCTG--G---G--T----ACACTAA----AAGTGGGAT
gi|11816                      :                      atcaAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-CAGAATA-C----CAA-AC-TAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGAGAT
gi|11818                      :                  ataaatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAAAA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CTCCTA--G---A--C----ACATCAG----AGGTGGGAT
gi|11821                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCTTAA-GTCCTAAA-TAGAAAA-C----AAA-AC-AAAAGTGGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11823                      :                    atatAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTGTA-CGGAATT-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTGTAT---A--T----ATACCAA----AGGTGGGGT
gi|11825                      :                                   atgaT---A-A----CAGAA---CAG-TGACGATT-ATT---CA---TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA-CA-AACAGTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCT---G---A--T----TTAC--G----AGGTGAGA
gi|11900                      : ataaaaaccaaacaacaacctttAAAGG-C--GA-AGAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGATTTGGGCAAACAC--GAA-CCCGTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGGT
gi|11922                      :                     tgaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAAAAT-GAA---CAG-TGA---GC-GAG---CAGA-CCGTAA-ATC-------AGA-TA-C--A-AAA--C-AAAAATTGGGGAAACACCGGGACCCCCTG--G---AATG----ATACCAG-----GTCGGGAT
gi|11924                      :                      aaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAAAAATAG-TGA---C---AT---T----TCGT-----CGTAAT-CATAACA-C--A-AAA--C-AA-ATTGGGGGAAACACC-GGA-CCCCCG--G---A--T----ATAC--GC---AGGTGG
gi|11931                      :                      aaAAAGG-C--GA-AAAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AGT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTCGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACCAG----AGTTGG
gi|11933                      :                       aAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----A-GAA---CAG-TGA---TC-ATT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGACAAACAC--GGA-TCCATG--G---A--C----GTACCAG----AGGTGGGATat
gi|11963                      :                       aAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CACCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11966                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATT--C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11967                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATT--C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11968                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATT--C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11969                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAG-GTCCTAAA-TAGAATA-CA-A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11970                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11971                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---C----TCGCAA-GCCCCAAA-CAGCAAA-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---G--T----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11972                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGGT
gi|11974                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---A----TCGTAA-ATCTCTAA-TAGAATA-C--A-AAAAAC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11975                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11977                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGG-CCCCTG--G---A--T----ACACCAT----AGGTGGGAT
gi|11979                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11981                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACTAG----AGGTGGGAT
gi|11985                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT---C----TCGTAA-GTCGCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----AAACCAG----ATGTGGGAT
gi|11995                      :                        AAAAG-CCAAA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-CGA---TCAAAT---C----TCGTAA-ATCCCAGA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-GCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11996                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---A----TCGTAA-GTCCTAGA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11997                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGAAAAACAC--GGA-CCTCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11998                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---A----TCGTAA-GTCC-AAA-TAGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGCTGGACAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACGCCAA----AGGTGGGAT
gi|12000                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAA--TAGAATA-C--A-AAA-A--AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12001                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-GAT---C----TCGTAA-GTCGTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12003                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12005                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12006                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGAGAT
gi|12007                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-TC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12008                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12009                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12010                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAT-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTTTCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12011                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CA-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AAGTAGAAT
gi|12014                      :                        AAAGG-C--AA-AGAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGGGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12017                      :                        AAAGG-C--GC-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12018                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AT-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12021                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-ATTAAC-GAA---CAG-TGA---TA-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12022                      :                        AAAGG-C--GA-AGCT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-GAA-GC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----AAACCAG----AGGTGGGAT
gi|12023                      :                        AAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TATAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12024                      :                        AAAAG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAATA-CAAA-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGGT
gi|12025                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12026                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAT-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12029                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCTAAT-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12030                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|12032                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-CA-A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACGAG----AGGTGGGAT
gi|12034                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-AA---C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-ACAAAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAA----AAGTGGGAT
gi|12035                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCTTAA-ATCCTAAA-TAAAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12036                      :                        AAAGA-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CGG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTGAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12037                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CGG-TGA---TC-ACT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAT-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12039                      :                        AAAGG-T--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12040                      :                        AAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCTCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGAGAT
gi|12041                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAA-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGATTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12042                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGA
gi|12043                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCTTG--G---A--C----ACACCAG----AAGTGGGAT
gi|12044                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACATCAG----AGGTGGGAT
gi|12045                      :                        AAAGG-C--AA-AGAC---ACA----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAAATACTACA-T--A-ACA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACC------AGGTGGGAT
gi|12048                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAAAGTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTCGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|12050                      :                        AAAGG-C--CA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---C----TCGCAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12053                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TATAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12055                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTTGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12058                      :                        AAATG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCTAAA-TA------C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12059                      :                        AAAGT-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12060                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAGGTGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12062                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAT---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAA----AGGTGGGAT
gi|12064                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12065                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12066                      :                        AAATG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12067                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCTTG--T---A--C----ATACCAG----ATGTGGGAT
gi|12068                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12070                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--T-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12074                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12075                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12077                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12313                      :                           GG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GATTCGC----T-GTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGA-AAACAC--GGA-CCCTTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGAAT





Alignments
lowQualScore                  :                             0 11  0    000 0 7777 0   000   0   000  0   222 6666      0    1   0       0 2222   0  0                 11   0      00 000 00 0000       1111         
lowQualScore                  :                             . ..  .    ... . .... .   ...   .   ...  .   ... ....      .    .   .       . ....   .  .                 ..   .      .. ... .. ....       ....         
lowQualScore                  :                             4 00  4    777 4 6666 8   777   4   777  4   333 1111      4    5   4       4 6666   4  4                 44   4      55 777 99 8888       3333         
consensus                     :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
Reference ( family-49 )       :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11772                      :                        AAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCA--TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGGAT
gi|11773                      :                    ataaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCG--TCGTAA-ATC-------AGAATA-T--ATAAA-AC-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGGAT
gi|11775                      :                    ataaAAAGG-C--GAGACAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCA--TCATAA-ATC-------AGAATAAC--A-AAA-A---AAAGTTAGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGGAT
gi|11776                      :                    ataaAAAGG-C--GG-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGG---CG-ATT---CA---TCATAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGTTAGGAAAACAC--GGA--CCCTG--G---A--T----ATACCA-------GTGGGAT
gi|11778                      :                    ataaAAAGGACG-AA-AGATCAAA-A----CCGAA---CAG-TGG---CG-ATT---CA---TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAC-AA-AAAGGTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACATGTACCAGGTGGGAT
gi|11779                      :                     ataAAAGG-T--GA-AGAC---A-AAA--C-GAG---CAG-TGG---GC-GAT---TCA--TCGTAA-ATC---------AATA-C--A-AAA--C-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA--CCCTG--G---A--T----ATACC------CGGTGGGAT
gi|11780                      :                    ataaAAAGG-C--AA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCT--TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AA-AGTTGGGGGAAAAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC
gi|11781                      :                    ataaAAAGA-C--GA-AAAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GTTT--C----ACGTAA-ATC-------AGAATA------AAA-AC-AAAGGTTGGGGAAACAC--GG--CCCCTG--G---A--T----ATACT------AGGTGGGAT
gi|11782                      :                    acaaAAAGG-A--GA-AAAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TACATTCGTTA-CTC-------AGAATG-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGGAAAACACG-GGA-CCCCTG--ATATA--CGGTAATACCA-----AGGTGGGAT
gi|11783                      :                    ataaAAAGG-T--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAT-TGA---GC-AAT---TCA--TTGTAA-ATTC-------AAATA-C--A-AA---C-AAG--TTGGA-AAACAC--GAA-CCCCTG--G---AT-T----ATACT------AGGTGGGAT
gi|11784                      :                    attaAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-AAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCATAA-GTC------TGAAATA-C--A-AAA--C-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11789                      :                    atggAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGCTGGGCAAACAC--AGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11790                      :                    atatAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA----AG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCTCGAA-CAGAATA----A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11791                      :                    atgaAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAC---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAATA-C----GAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--A---A--T----ACACCAG----AAGTGGGAT
gi|11792                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT---C----TCATAA-ATCTCAAA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAT--GGA-CCCCTT--G---G--T----ATATCAG----AGGTGGGAT
gi|11797                      :                    atgaAAAGG-T--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCC-----AGAATA-C----AAA-AT-AAGCGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----GCGTGAGAT
gi|11800                      :                    atacAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCC-AAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGACAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AAGTGGGAT
gi|11801                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11802                      :                    atatAAAGA-T--GA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCATAAA-GAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11807                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAG-TGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----ATGTGGGAT
gi|11813                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGCAA-GTCCCAAC-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAT--GGA-CCCCTG--G---G--T----ACACTAA----AAGTGGGAT
gi|11816                      :                      atcaAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-CAGAATA-C----CAA-AC-TAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGAGAT
gi|11818                      :                  ataaatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAAAA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CTCCTA--G---A--C----ACATCAG----AGGTGGGAT
gi|11821                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCTTAA-GTCCTAAA-TAGAAAA-C----AAA-AC-AAAAGTGGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11823                      :                    atatAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTGTA-CGGAATT-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTGTAT---A--T----ATACCAA----AGGTGGGGT
gi|11825                      :                                   atgaT---A-A----CAGAA---CAG-TGACGATT-ATT---CA---TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA-CA-AACAGTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCT---G---A--T----TTAC--G----AGGTGAGA
gi|11900                      : ataaaaaccaaacaacaacctttAAAGG-C--GA-AGAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGATTTGGGCAAACAC--GAA-CCCGTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGGT
gi|11922                      :                     tgaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAAAAT-GAA---CAG-TGA---GC-GAG---CAGA-CCGTAA-ATC-------AGA-TA-C--A-AAA--C-AAAAATTGGGGAAACACCGGGACCCCCTG--G---AATG----ATACCAG-----GTCGGGAT
gi|11924                      :                      aaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAAAAATAG-TGA---C---AT---T----TCGT-----CGTAAT-CATAACA-C--A-AAA--C-AA-ATTGGGGGAAACACC-GGA-CCCCCG--G---A--T----ATAC--GC---AGGTGG
gi|11931                      :                      aaAAAGG-C--GA-AAAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AGT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTCGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACCAG----AGTTGG
gi|11933                      :                       aAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----A-GAA---CAG-TGA---TC-ATT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGACAAACAC--GGA-TCCATG--G---A--C----GTACCAG----AGGTGGGATat
gi|11963                      :                       aAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CACCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11966                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATT--C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11967                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATT--C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11968                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATT--C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11969                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAG-GTCCTAAA-TAGAATA-CA-A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11970                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11971                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---C----TCGCAA-GCCCCAAA-CAGCAAA-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---G--T----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11972                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGGT
gi|11974                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---A----TCGTAA-ATCTCTAA-TAGAATA-C--A-AAAAAC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11975                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11977                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGG-CCCCTG--G---A--T----ACACCAT----AGGTGGGAT
gi|11979                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11981                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACTAG----AGGTGGGAT
gi|11985                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT---C----TCGTAA-GTCGCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----AAACCAG----ATGTGGGAT
gi|11995                      :                        AAAAG-CCAAA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-CGA---TCAAAT---C----TCGTAA-ATCCCAGA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-GCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11996                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---A----TCGTAA-GTCCTAGA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11997                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGAAAAACAC--GGA-CCTCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11998                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---A----TCGTAA-GTCC-AAA-TAGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGCTGGACAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACGCCAA----AGGTGGGAT
gi|12000                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAA--TAGAATA-C--A-AAA-A--AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12001                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-GAT---C----TCGTAA-GTCGTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12003                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12005                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12006                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGAGAT
gi|12007                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-TC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12008                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12009                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12010                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAT-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTTTCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12011                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CA-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AAGTAGAAT
gi|12014                      :                        AAAGG-C--AA-AGAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGGGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12017                      :                        AAAGG-C--GC-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12018                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AT-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12021                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-ATTAAC-GAA---CAG-TGA---TA-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12022                      :                        AAAGG-C--GA-AGCT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-GAA-GC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----AAACCAG----AGGTGGGAT
gi|12023                      :                        AAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TATAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12024                      :                        AAAAG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAATA-CAAA-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGGT
gi|12025                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12026                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAT-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12029                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCTAAT-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12030                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|12032                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-CA-A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACGAG----AGGTGGGAT
gi|12034                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-AA---C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-ACAAAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAA----AAGTGGGAT
gi|12035                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCTTAA-ATCCTAAA-TAAAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12036                      :                        AAAGA-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CGG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTGAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12037                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CGG-TGA---TC-ACT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAT-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12039                      :                        AAAGG-T--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12040                      :                        AAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCTCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGAGAT
gi|12041                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAA-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGATTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12042                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGA
gi|12043                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCTTG--G---A--C----ACACCAG----AAGTGGGAT
gi|12044                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACATCAG----AGGTGGGAT
gi|12045                      :                        AAAGG-C--AA-AGAC---ACA----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAAATACTACA-T--A-ACA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACC------AGGTGGGAT
gi|12048                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAAAGTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTCGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|12050                      :                        AAAGG-C--CA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---C----TCGCAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12053                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TATAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12055                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTTGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12058                      :                        AAATG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCTAAA-TA------C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12059                      :                        AAAGT-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12060                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAGGTGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12062                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAT---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAA----AGGTGGGAT
gi|12064                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12065                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12066                      :                        AAATG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12067                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCTTG--T---A--C----ATACCAG----ATGTGGGAT
gi|12068                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12070                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--T-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12074                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12075                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12077                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12313                      :                           GG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GATTCGC----T-GTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGA-AAACAC--GGA-CCCTTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGAAT


blockSeqs                     :                                              AAAA                        TCG ACAT           C             AAA                         CG                               TACC
blockSeqs                     :                                              TTAA                        T   AGA            C             AT                          G                                C   
blockSeqs                     :                                              AA                          T   CG             C             AA                          C                                .   
blockSeqs                     :                                              AA                          T   CA             C             AA                          .                                .   
blockSeqs                     :                                              AA                          T   CA             C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              AA                          .   CT             T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              AA                          .   CA             T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              AA                          .   A              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              AA                          .   A              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              AA                          .   A              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              AA                          .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              A                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             T                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             A                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              T             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              C             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                .   
blockSeqs                     :                                              .                           .   .              .             .                           .                                    


blockSeqCons                  :                                              ****                            ****
originalCons                  :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
finalCons                     :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT





Alignments
lowQualScore                  :                             0 11  0    000 0 7777 0   000   0   000  0   222 6666      0    1   0       0 2222   0  0                 11   0      00 000 00 0000       1111         
lowQualScore                  :                             . ..  .    ... . .... .   ...   .   ...  .   ... ....      .    .   .       . ....   .  .                 ..   .      .. ... .. ....       ....         
lowQualScore                  :                             4 00  4    777 4 6666 8   777   4   777  4   333 1111      4    5   4       4 6666   4  4                 44   4      55 777 99 8888       3333         
consensus                     :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
Reference ( family-49 )       :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11772                      :                        AAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCA--TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGGAT
gi|11773                      :                    ataaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCG--TCGTAA-ATC-------AGAATA-T--ATAAA-AC-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGGAT
gi|11775                      :                    ataaAAAGG-C--GAGACAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCA--TCATAA-ATC-------AGAATAAC--A-AAA-A---AAAGTTAGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGGAT
gi|11776                      :                    ataaAAAGG-C--GG-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGG---CG-ATT---CA---TCATAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGTTAGGAAAACAC--GGA--CCCTG--G---A--T----ATACCA-------GTGGGAT
gi|11778                      :                    ataaAAAGGACG-AA-AGATCAAA-A----CCGAA---CAG-TGG---CG-ATT---CA---TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAC-AA-AAAGGTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACATGTACCAGGTGGGAT
gi|11779                      :                     ataAAAGG-T--GA-AGAC---A-AAA--C-GAG---CAG-TGG---GC-GAT---TCA--TCGTAA-ATC---------AATA-C--A-AAA--C-AAAATTTGGGGAAACAC--GGA--CCCTG--G---A--T----ATACC------CGGTGGGAT
gi|11780                      :                    ataaAAAGG-C--AA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TCT--TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AA-AGTTGGGGGAAAAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACC
gi|11781                      :                    ataaAAAGA-C--GA-AAAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GTTT--C----ACGTAA-ATC-------AGAATA------AAA-AC-AAAGGTTGGGGAAACAC--GG--CCCCTG--G---A--T----ATACT------AGGTGGGAT
gi|11782                      :                    acaaAAAGG-A--GA-AAAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GAT---TACATTCGTTA-CTC-------AGAATG-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGGAAAACACG-GGA-CCCCTG--ATATA--CGGTAATACCA-----AGGTGGGAT
gi|11783                      :                    ataaAAAGG-T--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAT-TGA---GC-AAT---TCA--TTGTAA-ATTC-------AAATA-C--A-AA---C-AAG--TTGGA-AAACAC--GAA-CCCCTG--G---AT-T----ATACT------AGGTGGGAT
gi|11784                      :                    attaAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-AAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCATAA-GTC------TGAAATA-C--A-AAA--C-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11789                      :                    atggAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGCTGGGCAAACAC--AGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11790                      :                    atatAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA----AG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCTCGAA-CAGAATA----A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11791                      :                    atgaAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAC---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAATA-C----GAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--A---A--T----ACACCAG----AAGTGGGAT
gi|11792                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT---C----TCATAA-ATCTCAAA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAT--GGA-CCCCTT--G---G--T----ATATCAG----AGGTGGGAT
gi|11797                      :                    atgaAAAGG-T--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCC-----AGAATA-C----AAA-AT-AAGCGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----GCGTGAGAT
gi|11800                      :                    atacAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCC-AAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGACAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AAGTGGGAT
gi|11801                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11802                      :                    atatAAAGA-T--GA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCATAAA-GAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11807                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAG-TGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----ATGTGGGAT
gi|11813                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGCAA-GTCCCAAC-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAT--GGA-CCCCTG--G---G--T----ACACTAA----AAGTGGGAT
gi|11816                      :                      atcaAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-CAGAATA-C----CAA-AC-TAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGAGAT
gi|11818                      :                  ataaatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAAAA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CTCCTA--G---A--C----ACATCAG----AGGTGGGAT
gi|11821                      :                    atatAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCTTAA-GTCCTAAA-TAGAAAA-C----AAA-AC-AAAAGTGGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11823                      :                    atatAAAGG-C--GA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTGTA-CGGAATT-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTGTAT---A--T----ATACCAA----AGGTGGGGT
gi|11825                      :                                   atgaT---A-A----CAGAA---CAG-TGACGATT-ATT---CA---TCGTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA-CA-AACAGTTGGGGAAACAC--GGA-CCCCT---G---A--T----TTAC--G----AGGTGAGA
gi|11900                      : ataaaaaccaaacaacaacctttAAAGG-C--GA-AGAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGATTTGGGCAAACAC--GAA-CCCGTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGGT
gi|11922                      :                     tgaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAAAAT-GAA---CAG-TGA---GC-GAG---CAGA-CCGTAA-ATC-------AGA-TA-C--A-AAA--C-AAAAATTGGGGAAACACCGGGACCCCCTG--G---AATG----ATACCAG-----GTCGGGAT
gi|11924                      :                      aaAAAGG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAAAAATAG-TGA---C---AT---T----TCGT-----CGTAAT-CATAACA-C--A-AAA--C-AA-ATTGGGGGAAACACC-GGA-CCCCCG--G---A--T----ATAC--GC---AGGTGG
gi|11931                      :                      aaAAAGG-C--GA-AAAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AGT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTCGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ATACCAG----AGTTGG
gi|11933                      :                       aAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----A-GAA---CAG-TGA---TC-ATT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGACAAACAC--GGA-TCCATG--G---A--C----GTACCAG----AGGTGGGATat
gi|11963                      :                       aAAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CACCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11966                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATT--C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11967                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATT--C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11968                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AATT--C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CC-AAGAGCTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11969                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAG-GTCCTAAA-TAGAATA-CA-A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11970                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11971                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---C----TCGCAA-GCCCCAAA-CAGCAAA-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---G--T----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11972                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGGT
gi|11974                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---A----TCGTAA-ATCTCTAA-TAGAATA-C--A-AAAAAC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11975                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11977                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGG-CCCCTG--G---A--T----ACACCAT----AGGTGGGAT
gi|11979                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11981                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACTAG----AGGTGGGAT
gi|11985                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AC-AAT---C----TCGTAA-GTCGCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----AAACCAG----ATGTGGGAT
gi|11995                      :                        AAAAG-CCAAA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-CGA---TCAAAT---C----TCGTAA-ATCCCAGA-CAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-GCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11996                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---A----TCGTAA-GTCCTAGA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|11997                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGAAAAACAC--GGA-CCTCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|11998                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---A----TCGTAA-GTCC-AAA-TAGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGCTGGACAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACGCCAA----AGGTGGGAT
gi|12000                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAA--TAGAATA-C--A-AAA-A--AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12001                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-GAT---C----TCGTAA-GTCGTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12003                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12005                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12006                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGAGAT
gi|12007                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-TC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12008                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12009                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12010                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAT-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTTTCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--T----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12011                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-CA-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AAGTAGAAT
gi|12014                      :                        AAAGG-C--AA-AGAA---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGGGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12017                      :                        AAAGG-C--GC-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12018                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---AT-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12021                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-ATTAAC-GAA---CAG-TGA---TA-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12022                      :                        AAAGG-C--GA-AGCT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-GAA-GC-AAGAGTTGGGAAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----AAACCAG----AGGTGGGAT
gi|12023                      :                        AAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---GC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TATAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12024                      :                        AAAAG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCCAAA-TAGAATA-CAAA-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGGT
gi|12025                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12026                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAT-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12029                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCTAAT-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12030                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|12032                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-CA-A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACGAG----AGGTGGGAT
gi|12034                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-AA---C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-ACAAAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAA----AAGTGGGAT
gi|12035                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCTTAA-ATCCTAAA-TAAAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12036                      :                        AAAGA-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CGG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTGAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAAAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12037                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CGG-TGA---TC-ACT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAT-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12039                      :                        AAAGG-T--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12040                      :                        AAAGG-C--AA-AGAC---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCTCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGAGAT
gi|12041                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAA-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGATTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12042                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGTAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGA
gi|12043                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCTTG--G---A--C----ACACCAG----AAGTGGGAT
gi|12044                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACATCAG----AGGTGGGAT
gi|12045                      :                        AAAGG-C--AA-AGAC---ACA----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---T----TCGTAA-GTCCTAAAATACTACA-T--A-ACA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACC------AGGTGGGAT
gi|12048                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAAAGTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTCGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ATACCAG----AGGTGGGAT
gi|12050                      :                        AAAGG-C--CA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---CC-AAT---C----TCGCAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12053                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TATAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12055                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTTGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12058                      :                        AAATG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-ATCCTAAA-TA------C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12059                      :                        AAAGT-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12060                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAGGTGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12062                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAT---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAA----AGGTGGGAT
gi|12064                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12065                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12066                      :                        AAATG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C----AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12067                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAAACAC--GGA-CCCTTG--T---A--C----ATACCAG----ATGTGGGAT
gi|12068                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12070                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--T-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12074                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12075                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCTAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12077                      :                        AAAGG-C--AA-AGAT---A-A----C-GAA---CAG-TGA---TC-AAT---C----TCGTAA-GTCCCAAA-TAGAATA-C--A-AAA-AC-AAGAGTTGGGCAATCAC--GGA-CCCCTG--G---A--C----ACACCAG----AGGTGGGAT
gi|12313                      :                           GG-C--GA-AGAC---A-AAA--C-GAA---CAG-TGA---GC-GATTCGC----T-GTAA-ATC-------AGAATA-C--A-AAA--C-AAAAGTTGGA-AAACAC--GGA-CCCTTG--G---A--T----ATACC------AGGTGGAAT