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lowQualScore                  :     33  55  2   33   2       1 2 2    33 44 33333 11 2  1 1 44 2 1  444444444 1 44 22 1 1  333  11 1 22 1 2 2  22 111 22 3  3  444  4444 1 1  333 55 33 4 1 22 3333 22  1   1 2 222 1 1   1 11 444 11 11 1 22   1   11 1 44    33333   333333  555 11         6 
lowQualScore                  :     ..  ..  .   ..   .       . . .    .. .. ..... .. .  . . .. . .  ......... . .. .. . .  ...  .. . .. . . .  .. ... .. .  .  ...  .... . .  ... .. .. . . .. .... ..  .   . . ... . .   . .. ... .. .. . ..   .   .. . ..    .....   ......  ... ..         . 
lowQualScore                  :     55  11  8   11   6       3 6 6    11 44 44444 77 5  2 2 00 4 2  777777777 1 99 66 2 1  444  44 1 55 1 1 1  55 888 55 2  2  444  3333 1 1  999 33 99 2 1 55 3333 55  1   1 1 999 1 1   1 44 555 44 44 1 55   1   44 1 77    99999   222222  777 55         0 
consensus                     : CTCA--GC-GAC-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--AGA-AA---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-C-CA----G-G-CC---AA-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ATAGTTGTTTT
Reference ( gi|69588 )        : CTCA--GC-AAC-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA--A--T--C--G--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--AGA-AA---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-C-CA----G-G-CC---AG-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ATAGTTGTTCT
gi|69590                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-AGAC--A--T--T--G--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--AGA-AT---TG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-C-CA----G-G-CC---AG-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A-T--GCAG-----TTT------TG---T--ATAGTTG
gi|69591                      : CTCA--GC-GAC-GTT--ACG-GTAACCA-G-A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--AGA-AA---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-C-CA----G-G-CC---AA-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-G-A--C--G-G--CAT-GAC--A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ATTGTAGTTTgttt
gi|69589                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-AGAA--A--T--T--G--A-CA-A-A--GGC-TG---------T-A--T--AGA-AA---AG--T-A--C-C-T-AAATA---T--G-CA-CT-C-CA----G-G-CC---AA-G--T-G-A--C----G--T--ACA-A-----G-A-AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GGC--A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ATAGTTGTTT
gi|69592                      : CTCA--GC-GAT-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-A--TTAAAA-AA---AA--A-G--C-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-C-CA----G-A-CC---AA-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AGA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ATAGT
gi|69595                      : CTCA--GC-GAC-CTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-G-A--G-C-TG---------T-A--T--AGA-AA---AG--T-T--C-C-T-AA--A---T--A-CA-CT-A-CA----G-G-CC---GA-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-AAC--A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ACAGTagcttt
gi|69597                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAAT-A--T-----G--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-T--T--AGA-AA---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--GCCA-CT-TACAG---G-G-CCA--AA-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A-T--ACAG-----TTT------TGT--T--ATAGTTGTTT
gi|69593                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAG-GAAAACC-G-AAGGAA--A--TATT--G--A-CA-G-G--G-C-TG---------T-A--T--AAT-AA---AA--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-C-CT----G-G-CC---AA-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-G-G--C--G-T--CAT-AAC--A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ATAGTTGTTT
gi|69596                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA--AT-T--T--G--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-AT-T--AGA-AA---AG--T-A--C-C-C-AA--A---T--G-CA-CT-A-CA----T-G--C---AA-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---GAA-AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC-------ACAG-----TTT------TG---T--ATAGTTGT
gi|69594                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-AGAA--A--T--T--G--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--AGA-AA---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-A-GA----G-G-TC---AA-A--T-G-A--C----A--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-TAC--A-T--GCAG-----TTG------TG---T--Aatt
gi|69600                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAG-GAAACTC-G-A-GGAA--A--T--G--G--A-CA-A-A--A-C-TG---------T-A--T--AGA-AA--------------------------T--G-CA-CT-C-CA----G-G-CC---AG-A--T-G-A--C----G--CC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-GAA--C--G-T--C---GAC--A-TC-ACAG-----TTT------TG---T--ATAGTTGTTT
gi|69598                      : CTCA--GC-GAC-GT----AA-GAAACCC-GGA-GGAA--A--T--TT-G--A-CA-A-AA-G-C-TG---------TTA--T--AGA-AA---AA--T-A--C-C-TTAA--A---T--G-CA-CT-A-CA----G-G-CC---AA-A--TTG-A--C----G--TC-CCA-A-T---G-A-AAA-A--T-G----C--G-T--CAT-GAC--A-T--ACA------TTT------TG---T--ATAGTTGTTT
gi|69599                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GAAA--A--C--T--G--A-CA-G-A--G-T-TG---------T-A--T--C-A-AT---AG--T-A--C-A-T-AA--A---T--G-CA-TT-C-CA----G-A-CA---AA-A--T-A-A--A----G--TC-GCA-A-G---G-A-ATA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ACAGTTGTTT
gi|69601                      : CTCA--GC-GACCGTTTTAAG---AACCC-G-A-GGAA--A--T--T--G--A-CAGG-A--G-C-TG---------T-A-----AGA-AA---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--C-TA-CT-A-CA----G-G-CC---AA-A--TGG-A--C----G--T--ACA-A-T---G---AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A-TG-ACAG-----TTT------TGTGAT--ATAGTTGTT
gi|69603                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAT-GAAAAC--G-A-GGGA--A---------------------G-C-TT---------T-A-----AGA-AA---AG--T-A--C-C-T-AA--A---TTTG-CA-CT-C-CA----G-G-CC---AG-A--TTG-A--C----G--TC-ACA---T---G-A-AAA----T-G-A--C--G-T--CAA-GAC--A-T--TCAG-----TTT------TGC--T--ATAGTTGTTTt
gi|69602                      : CTCA---T-GAC-GTT--A-G-GACACCC-G-A-GCAA--A--T--T--G--A-CA-G-A--G-C-TG---------T-A--T--A-A-AA---AG--T-A--C-T-T-AA--A---T--G-CA-CT-A-CA----G-A-TC---AA-A--T-G-A--CTGACG--TC-ACA-A-C---G-A-AAC-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A-T-----------T-------------T--ATAGTTGTTT
gi|69604                      : CTCAA-GC-GAC-GTT--AGG-AAACCCC-G-A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-AGA--G-C-TG---------T-A--T--AGA-AA---AT--T-A--T-C-T-AAC-A---T--G-CA-CT-A-CA----G-GACC---AA-AT-T-G-A--A----G--TC-A-A-A-T---G-A-AAA-A----G-A--C--GTT--CAT-TGC-------ACAG-----TTT------TT---T--ATAGTTG
gi|69607                      : CTCAATGC-AACTGTT--AAGCGAAACC--G-A-GGGA--AATT--C--G--A-CA-A-AA-G-C-TG---------T-AA-T--AGA-AA---AG--T-A--C-C-T-AA--AAATT--GGCT-AT-C-TA----G-G-CC---AG----T-G-AA-C----G--TC-ACATA-T---G-A-TAA-A--TTG-A--C--G-T--CAT-GAC--A-T--AC-------TTT------GG---T--ATTGTTGTT
gi|69606                      : CTCA--GC-AAA-GTT--ACC-GAAACCC-A-A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-A-A--G-----------------------------------T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-TT-C-CA----G-T-CC---AA-A--T-G-A--C----T--TC-ACG-G-T---T---AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAT--A-T--CCAC-----TTTCCTAACTG---T--TTAGTTGTTTt
gi|69605                      : CTCA--GCGAAC-GTT--CAG-GAAACCC-G-AAGGAA--G--T--T--G--AACA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--AGA-AA---AG--T-A--C-CGTAAA--A---T--G-CA-C--C-CAGGGGG-G-CC---AG-A------A--C----T--TC-ACA-A-TTGAA-A-AAA-A--T-G-AACC--G-T--CAT-GAC--A-
gi|69608                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAT-GGAACCT---A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-G-A--G-C-GT---------T-A--T--GAG-AA---AG----A--C-CAT-AA--A---T--G-CA-CT-A-CA----G-G--T---AA-A--T-G-A--C-------TC-ACA-A-----G-A-AAA-A--TGG-A--C--G-TC-CAT-GAC--------TCG-----TTT------TG---T--Aaatgactagatcgtttgctatagtgtttt
gi|69609                      : CTCA--GC-GAC-GTT--AAGCGAAACCC-T-A-G-AT--A--T--G--T--A-CT-G----G-CGTG---------T-AG-T--AGG-AACA-AG--TCA--CGC-T-AA--A---T--G-CAACTAC-CA----G-G-CC---AA-AATTAG-A--C----G--TC-CCA-C-T---G-A-GAA-ACAT-G-A--C--G-T--CATAGAC--A-T--ACAG------TT------TG---T--ATAccccagtaggcgtttt
gi|69610                      : CTCA--GC-TAA-GTT--AAG-GCTTCCC---A-TGAACCA--T--T-----A-CA-A-T--A-T-TG---------A-A--T--ATA-AA---TG--T-T--C-T-T-CT--G---T--G-CA-CT-T-TG----C-A-CC---AT-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-ATT---G-A-AAA-G--T---A--C--G-T--CAT-GAT--A-T--ACAG-----ATT------TT---T--ACTGTTGT
gi|69611                      :  TCA--GT-GAC-GTT--ACG-GAAACCC-G-A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-G-A--G-C-TG---------T-A--T--AAA-AA---AAATT-A--C-C-T-AG--A---T--G-CA-CT-C-CA----G-G-CC---GG-A--C-G-G-------A--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-T-G--C--G-T--CAT-TAA--A-T--ACAG-----TTT------AT---T--ATAGCTGTT
gi|69612                      :   CA--AC-AAC-GTT--AAG-GAAACCT-G-A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--GTA-AA---CG--T-A--C-T-T-AA--A---T--G-CA-TG-C-CA----G-G-TC---AA-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-ATA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GCC--A-T--TCAG-----TTT------TG---T--ATAGTTGTTTt
gi|69613                      :   CA--GC-AAC-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-AGAA--A--T--T--G--T-AA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--AAA-AA---GG--T-A--C-C-T-AA--A---T--A-CG-CT-C-CA----G-G-CC---AA-A--T-G-A--A----T--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T-G-A--T--G-T--CAA-GAC--ATT--ACAG-----TTT------CG---T--ATAGTAGTTT
gi|69614                      :   CA--GC-GAC-GTT--AAG-GAA--CC-G-A-GGAA--A--T--T--G--AACA-A-A--G-C-TG---------T-AGAT--AGA-AA---AA--T-A--C-C-T-AA--A---TT-G-CAGCT-A-CA----G-G-CC---AA-A--T-G-A--C----G--TC-CCA---T---G-A-AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GGA--A-T--ACAGT----TTT------TG---T--ATAGTTGTTT
gi|69615                      :    A--GC-GAC-GTTT-AAG-GAAACCC-G-A-GGAA--A--T--T--G--A-CA-A-A--GTC-TGATATGTTTTT-A--T--AGA-AT---TA--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CAGCTAT-CA----G-G-CCA--AA-A--T-G-A--C----GC-TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--T---A--C--G-TTCCAT-GAC--A-T--ACAG------TT------GG---T--A-AGTTG
gi|69616                      :           AC-GTT--AAG-GAAACC--G-A-GGAA--A--T--T--G----CA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--AGA-AA---AA--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-A-CA----G-G-CC---AA-A--T-G-A--C----G--TC-CCA-A-T---G---AAA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ATAGTTGTTTatt
gi|69617                      :             -GTT--AAG-GAAACCCTG-A-GGTA--A--T--TTTG--A-CA-A-A--G-C-TG---------T-A--T--TAA-AA---AA--C-AAGC-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-CTCA----GAA-CC---AA-A--T-GAA--CG---G--TC-ACA-A-------A-AGA-A--T-G-A--C--G----CAT-GAC--A-TA-ACAG-----TTT------GG---T--ATAGT
gi|69618                      :               TT--AAG-GAA--CC-A-T-GGAA--A--T-----GTTA-CA-A------C-TG---------T-A--TG-AGA-AATTAAG--T-A--C---T-AA--A---T----C--CT-C-CA----G---CC---AG-A--T-G-A--C----G--TC-G-A-A-T---G-G-GGA-A--T-G-A--C--G-T--CAT-G----A-T--ACAG-----TTT------TG---T--ATA-TTGTTagcttt
gi|69619                      :                T--AGG-GAAACCC-GAA-GGAA--AT-T--T--G--A-CA-C-AGCG-C-TG---------C-A--T--ACG-AA---AG--T-AC-C-C-T-AA--A---T--GTCA-CT-C-AAG---G-G-CC---AGAA--T-G-AACC----GGTCC-ACA-A-T---G-ACAAA-A--T-GAA--CCGG-T--CAT-GGC--A-T--ACAA-----GTT------TG---TTCATAGTTATTT
gi|69620                      :                                                   --A-CA-G-G--G-C-TG---------T-A--T--AAATAA---AA--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-CT-C-T-----G-G-CC---AA-AATT-G-A-------G--TCAACA-A-T---G-A-AAA-A--TGG-G--C--G-T--CAT-AATCGA-TCGACAG-----CTT------TGTT-T--GTAGTAGTTT
gi|69623                      :                                            gaaggaaatatttttga--G-C-TG---------A-A--T--ATC-AA---TG--C-A--C-C-T-CT--G---T--G-CA-CT-T-CG----C-G-CC---AT-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-ATT---G-C-AAA-G--T---A--C--G-T--CAT-GAC--G-T--ACAG-----GTT------CT---T--ACATTTG
gi|69621                      :                                                             --G-C-TG---------T-A--C--ATA-AA---TG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-CA-AT-T-CA----G-T-CCACTAT-A--T-G-G--C----A--TC-ATA-C-T---G-A-AAGCA--T---A--C--A-T--CAT-GGC--A-T--ACAG---------------G---T--ATA-TTATT
gi|69624                      :                                                                               -A--T--ATA-AA---TG--T-A--C-C-T-CT--G---T--G-CA-CT-G-CG----C-A-CC---AT-A--T-G-A--C----G--CC-ACA-A-TT--G-A-AAA-G--T---A--C--G-T--CAT-GAC--G-T--ACAG-----GTT------CT---T--ACAGTTG
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gi|69622                      :                                                                                         -AA---TG--T-A--T-C-T-CT--G---T--G-CA-CT-T-CG----C-A-CC---AT-A--T-G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA-A--G-T-A--C--G-T--CAT-GAC--G-T--ACAGGTTCTTTT------TG---T--
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Reference ( family-489 )      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
gi|69588                      : CTCA--GCAA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA---A-T-----C--GA-CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-A--G-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTCT
gi|69589                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-AGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--GGCTG---------T-A--T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AAATA---T--G-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-A--A-G--T--G-A--C----G--T--ACA-A-----G-A-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GGC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
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gi|69596                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA---ATT-----T--GA-CA-A-A--G-CTG---------T-AT-T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-C-AA--A---T--G-C-A-CT-A-CA----T-G--C-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---GAA-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC------------ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTATT
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gi|69599                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GAAA---A-C-----T--GA-CA-G-A--G-TTG---------T-A--T--C-A-A--T---AG--T-A--C-A-T-AA--A---T--G-C-A-TT-C-CA----G-A-CA-A--A-A--T--A-A--A----G--TC-GCA-A-G---G-A-ATA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------CAGTTGTTTT
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gi|69602                      : CTCA---TGA-C-GTT--A-G-GACACCC-G-A-GCAA---A-T-----T--GA-CA-G-A--G-CTG---------T-A--T--A-A-A--A---AG--T-A--C-T-T-AA--A---T--G-C-A-CT-A-CA----G-A-TC-A--A-A--T--G-A--CTGACG--TC-ACA-A-C---G-A-AAC--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T-------------T-------------T--A------TAGTTGTTTT
gi|69603                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAT-GAAAAC--G-A-GGGA---A---------------------G-CTT---------T-A-----AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AA--A---TTTG-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-A--G-A--TT-G-A--C----G--TC-ACA---T---G-A-AAA---T-G-A--C--G-T--CAA-GAC--A------T--TCA--G-----TTT------TGC--T--A------TAGTTGTTTT
gi|69604                      : CTCAA-GCGA-C-GTT--AGG-AAACCCC-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-AGA--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AT--T-A--T-C-T-AAC-A---T--G-C-A-CT-A-CA----G-GACC-A--A-AT-T--G-A--A----G--TC-A-A-A-T---G-A-AAA--A--G-A--C--GTT--CAT-TGC------------ACA--G-----TTT------TT---T--A------TAGTTG
gi|69605                      : CTCA--GCGAAC-GTT--CAG-GAAACCC-G-AAGGAA---G-T-----T--GAACA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AG--T-A--C-CGTAAA--A---T--G-C-A-C--C-CAGGGGG-G-CC-A--G-A-------A--C----T--TC-ACA-A-TTGAA-A-AAA--AT-G-AACC--G-T--CAT-GAC--AAATGACT--AGATCG-----TTT------GC---T--A------TAG-TGTTTT
gi|69606                      : CTCA--GCAA-A-GTT--ACC-GAAACCC-A-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--G------------------------------------T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-TT-C-CA----G-T-CC-A--A-A--T--G-A--C----T--TC-ACG-G-T---T---AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAT--A------T--CCA--C-----TTTCCTAACTG---T--T------TAGTTGTTTT
gi|69607                      : CTCAATGCAA-CTGTT--AAGCGAAACCG-A-G-GGAA---A-T-----TC-GA-CA-A-AA-G-CTG---------T-AA-T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AA--AAATT--GGC-T-AT-C-TA----G-G-CC-A--G----T--G-AA-C----G--TC-ACATA-T---G-A-TAA--ATTG-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--AC---------TTT------GG---T--A------TTGTTGTTT
gi|69608                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAT-GGAACCT---A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-G-A--G-CGT---------T-A--T--GAG-A--A---AG----A--C-CAT-AA--A---T--G-C-A-CT-A-CA----G-G--T-A--A-A--T--G-A--C-------TC-ACA-A-----G-A-AAA--ATGG-A--C--G-TC-CAT-GAC-------------TC--G-----TTT------TG---T--ACCCCAGTAGGCGTTTT
gi|69609                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAGCGAAACCC-T-A-GATATGTA-C-----T--GG-CG---------TG---------T-AG-T--AGG-AACA---AG--TCA--CGC-T-AA--A---T--G-CAA-CTAC-CA----G-G-CCAA--A-A--TTAG-A--C----G--TC-CCA-C-T---G-A-GAAACAT-G-A--C--G-T--CATAGAC--A------T--ACA--G------TT------TG---T--A------TA
gi|69610                      : CTCA--GCTA-A-GTT--AAG-GCTTCCC---A-TGAACC-A-T-----T---A-CA-A-T--A-TTG---------A-A--T--ATA-A--A---TG--T-T--C-T-T-CT--G---T--G-C-A-CT-T-TG----C-A-CC-A--T-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-ATT---G-A-AAA--GT---A--C--G-T--CAT-GAT--A------T--ACA--G-----ATT------TT---T--A------CTGTTGT
gi|69611                      :  TCA--GTGA-C-GTT--ACG-GAAACCC-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-G-A--G-CTG---------T-A--T--AAA-A--A---AAATT-A--C-C-T-AG--A---T--G-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-G----------G-A--C----GGATC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-T-G--C--G-T--CAT-TAA--A------T--ACA--G-----TTT------AT---T--A------TAGCTGTTT
gi|69612                      :   CA--ACAA-C-GTT--AAG-GAAACCT-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--GTA-A--A---CG--T-A--C-T-T-AA--A---T--G-C-A-TG-C-CA----G-G-TC-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-ATA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GCC--A------T--TCA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
gi|69613                      :   CA--GCAA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-AGAA---A-T-----T--GT-AA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AAA-A--A---GG--T-A--C-C-T-AA--A---T--A-C-G-CT-C-CA----G-G-CC-A--A-A--T--G-A--A----T--TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-G-A--T--G-T--CAA-GAC--AT-----T--ACA--G-----TTT------CG---T--A------TAGTAGTTTT
gi|69614                      :   CA--GCGA-C-GTT--AAG-GAA--CC-G-A-GGAA---A-T-----T--GAACA-A-A--G-CTG---------T-AGAT--AGA-A--A---AA--T-A--C-C-T-AA--A---TT-G-C-AGCT-A-CA----G-G-CC-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-CCA---T---G-A-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GGA--A------T--ACA--GT----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
gi|69615                      :    A--GCGA-C-GTTT-AAG-GAAACCC-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--GTCTGATATGTTTTT-A--T--AGA-A--T---TA--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-AGCTAT-CA----G-G-CCAA--A-A--T--G-A--C----GC-TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT---A--C--G-TTCCAT-GAC--A------T--ACA--G------TT------GG---T--A-------AGTTGATT
gi|69616                      :          A-C-GTT--AAG-GAAACC--G-A-GGAA---A-T-----T--G--CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AA--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-A-CA----G-G-CC-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-CCA-A-T---G---AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
gi|69617                      :             -GTT--AAG-GAAACCCTG-A-GGTA---A-T-----TTTGA-CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--TAA-A--A---AA--C-AAGC-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-CTCA----GAA-CC-A--A-A--T--GAA--CG---G--TC-ACA-A-------A-AGA--AT-G-A--C--G----CAT-GAC--A------TA-ACA--G-----TTT------GG---T--A------TAGTAGCTTT
gi|69618                      :               TT--AAG-GAA--CC-A-T-GGAA---A-TG----T--TA-CA-A------CTG---------T-A--TG-AGA-A--ATTAAG--T-A--C---T-AA--A---T----C---CT-C-CA----G---CC-A--G-A--T--G-A--C----G--TC-G-A-A-T---G-G-GGA--AT-G-A--C--G-T--CAT-G----A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TA-TTGTT
gi|69619                      :                T--AGG-GAAACCC-GAA-GGAA---ATT-----T--GA-CA-C-AGCG-CTG---------C-A--T--ACG-A--A---AG--T-AC-C-C-T-AA--A---T--GTC-A-CT-C-AAG---G-G-CC-AG-A-A--T--G-AACC----GGTCC-ACA-A-T---G-ACAAA--AT-GAA--CCGG-T--CAT-GGC--A------T--ACA--A-----GTT------TG---TTCA------TAGTTATTTT
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gi|69621                      :                                                            ga--G-CTG---------T-A--C--ATA-A--A---TG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-AT-T-CA----G-T-CC-ACTATA--T--G-G--C----A--TC-ATA-C-T---G-A-AAGC-AT---A--C--A-T--CAT-GGC--A------T--ACA--G---------------G---T--A------TA-TTATT
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Reference ( family-489 )      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
gi|69588                      : CTCA--GCAA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA---A-T-----C--GA-CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-A--G-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTCT
gi|69589                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-AGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--GGCTG---------T-A--T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AAATA---T--G-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-A--A-G--T--G-A--C----G--T--ACA-A-----G-A-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GGC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
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gi|69596                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA---ATT-----T--GA-CA-A-A--G-CTG---------T-AT-T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-C-AA--A---T--G-C-A-CT-A-CA----T-G--C-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---GAA-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC------------ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTATT
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gi|69602                      : CTCA---TGA-C-GTT--A-G-GACACCC-G-A-GCAA---A-T-----T--GA-CA-G-A--G-CTG---------T-A--T--A-A-A--A---AG--T-A--C-T-T-AA--A---T--G-C-A-CT-A-CA----G-A-TC-A--A-A--T--G-A--CTGACG--TC-ACA-A-C---G-A-AAC--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T-------------T-------------T--A------TAGTTGTTTT
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gi|69605                      : CTCA--GCGAAC-GTT--CAG-GAAACCC-G-AAGGAA---G-T-----T--GAACA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AG--T-A--C-CGTAAA--A---T--G-C-A-C--C-CAGGGGG-G-CC-A--G-A-------A--C----T--TC-ACA-A-TTGAA-A-AAA--AT-G-AACC--G-T--CAT-GAC--AAATGACT--AGATCG-----TTT------GC---T--A------TAG-TGTTTT
gi|69606                      : CTCA--GCAA-A-GTT--ACC-GAAACCC-A-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--G------------------------------------T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-TT-C-CA----G-T-CC-A--A-A--T--G-A--C----T--TC-ACG-G-T---T---AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAT--A------T--CCA--C-----TTTCCTAACTG---T--T------TAGTTGTTTT
gi|69607                      : CTCAATGCAA-CTGTT--AAGCGAAACCG-A-G-GGAA---A-T-----TC-GA-CA-A-AA-G-CTG---------T-AA-T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AA--AAATT--GGC-T-AT-C-TA----G-G-CC-A--G----T--G-AA-C----G--TC-ACATA-T---G-A-TAA--ATTG-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--AC---------TTT------GG---T--A------TTGTTGTTT
gi|69608                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAT-GGAACCT---A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-G-A--G-CGT---------T-A--T--GAG-A--A---AG----A--C-CAT-AA--A---T--G-C-A-CT-A-CA----G-G--T-A--A-A--T--G-A--C-------TC-ACA-A-----G-A-AAA--ATGG-A--C--G-TC-CAT-GAC-------------TC--G-----TTT------TG---T--ACCCCAGTAGGCGTTTT
gi|69609                      : CTCA--GCGA-C-GTT--AAGCGAAACCC-T-A-GATATGTA-C-----T--GG-CG---------TG---------T-AG-T--AGG-AACA---AG--TCA--CGC-T-AA--A---T--G-CAA-CTAC-CA----G-G-CCAA--A-A--TTAG-A--C----G--TC-CCA-C-T---G-A-GAAACAT-G-A--C--G-T--CATAGAC--A------T--ACA--G------TT------TG---T--A------TA
gi|69610                      : CTCA--GCTA-A-GTT--AAG-GCTTCCC---A-TGAACC-A-T-----T---A-CA-A-T--A-TTG---------A-A--T--ATA-A--A---TG--T-T--C-T-T-CT--G---T--G-C-A-CT-T-TG----C-A-CC-A--T-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-ATT---G-A-AAA--GT---A--C--G-T--CAT-GAT--A------T--ACA--G-----ATT------TT---T--A------CTGTTGT
gi|69611                      :  TCA--GTGA-C-GTT--ACG-GAAACCC-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-G-A--G-CTG---------T-A--T--AAA-A--A---AAATT-A--C-C-T-AG--A---T--G-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-G----------G-A--C----GGATC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-T-G--C--G-T--CAT-TAA--A------T--ACA--G-----TTT------AT---T--A------TAGCTGTTT
gi|69612                      :   CA--ACAA-C-GTT--AAG-GAAACCT-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--GTA-A--A---CG--T-A--C-T-T-AA--A---T--G-C-A-TG-C-CA----G-G-TC-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-ATA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GCC--A------T--TCA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
gi|69613                      :   CA--GCAA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-AGAA---A-T-----T--GT-AA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AAA-A--A---GG--T-A--C-C-T-AA--A---T--A-C-G-CT-C-CA----G-G-CC-A--A-A--T--G-A--A----T--TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-G-A--T--G-T--CAA-GAC--AT-----T--ACA--G-----TTT------CG---T--A------TAGTAGTTTT
gi|69614                      :   CA--GCGA-C-GTT--AAG-GAA--CC-G-A-GGAA---A-T-----T--GAACA-A-A--G-CTG---------T-AGAT--AGA-A--A---AA--T-A--C-C-T-AA--A---TT-G-C-AGCT-A-CA----G-G-CC-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-CCA---T---G-A-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GGA--A------T--ACA--GT----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
gi|69615                      :    A--GCGA-C-GTTT-AAG-GAAACCC-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--GTCTGATATGTTTTT-A--T--AGA-A--T---TA--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-AGCTAT-CA----G-G-CCAA--A-A--T--G-A--C----GC-TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT---A--C--G-TTCCAT-GAC--A------T--ACA--G------TT------GG---T--A-------AGTTGATT
gi|69616                      :          A-C-GTT--AAG-GAAACC--G-A-GGAA---A-T-----T--G--CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AA--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-A-CA----G-G-CC-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-CCA-A-T---G---AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT
gi|69617                      :             -GTT--AAG-GAAACCCTG-A-GGTA---A-T-----TTTGA-CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--TAA-A--A---AA--C-AAGC-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-CTCA----GAA-CC-A--A-A--T--GAA--CG---G--TC-ACA-A-------A-AGA--AT-G-A--C--G----CAT-GAC--A------TA-ACA--G-----TTT------GG---T--A------TAGTAGCTTT
gi|69618                      :               TT--AAG-GAA--CC-A-T-GGAA---A-TG----T--TA-CA-A------CTG---------T-A--TG-AGA-A--ATTAAG--T-A--C---T-AA--A---T----C---CT-C-CA----G---CC-A--G-A--T--G-A--C----G--TC-G-A-A-T---G-G-GGA--AT-G-A--C--G-T--CAT-G----A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TA-TTGTT
gi|69619                      :                T--AGG-GAAACCC-GAA-GGAA---ATT-----T--GA-CA-C-AGCG-CTG---------C-A--T--ACG-A--A---AG--T-AC-C-C-T-AA--A---T--GTC-A-CT-C-AAG---G-G-CC-AG-A-A--T--G-AACC----GGTCC-ACA-A-T---G-ACAAA--AT-GAA--CCGG-T--CAT-GGC--A------T--ACA--A-----GTT------TG---TTCA------TAGTTATTTT
gi|69620                      :                                -A-GGAA---A-TATTTTT--GAACA-G-G--G-CTG---------T-A--T--AAATA--A---AA--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-C-T-----G-G-CC-A--A-AATT--G-A-------G--TCAACA-A-T---G-A-AAA--ATGG-G--C--G-T--CAT-AATCGA------TCGACA--G-----CTT------TGTT-T--G------TAGTAGTTTT
gi|69621                      :                                                            ga--G-CTG---------T-A--C--ATA-A--A---TG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-AT-T-CA----G-T-CC-ACTATA--T--G-G--C----A--TC-ATA-C-T---G-A-AAGC-AT---A--C--A-T--CAT-GGC--A------T--ACA--G---------------G---T--A------TA-TTATT
gi|69622                      :                                                                                         -A--A---TG--T-A--T-C-T-CT--G---T--G-C-A-CT-T-CG----C-A-CC-A--T-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AG-T-A--C--G-T--CAT-GAC--G------T--ACA--GGTTCTTTT------TG---T--
gi|69623                      :                                                     gttgaatat--G-CTG---------A-A--T--ATC-A--A---TG--C-A--C-C-T-CT--G---T--G-C-A-CT-T-CG----C-G-CC-A--T-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-ATT---G-C-AAA--GT---A--C--G-T--CAT-GAC--G------T--ACA--G-----GTT------CT---T--A------CATTTG
gi|69624                      :                                                                               -A--T--ATA-A--A---TG--T-A--C-C-T-CT--G---T--G-C-A-CT-G-CG----C-A-CC-A--T-A--T--G-A--C----G--CC-ACA-A-TT--G-A-AAA--GT---A--C--G-T--CAT-GAC--G------T--ACA--G-----GTT------CT---T--A------CAGTTG
gi|69625                      :                                                                                 --T--AAA-A--A---TG--T-A--C-C-A-TT--A---T--G-C-A-CT-T-CA----C-A-CC-A--T-A--T--G-A--C----G--TG-ATA-A-T---G-A-AAA--AG-T-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--ACA--A--------------TA---T--A------TCGTTGTT
gi|69626                      :                                                                                                  G--T-A--C-C-T-CT--G---T--G-C-A-CT-C-CG----C-A-CC-A--T-A--T--G-G--T----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-T-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--A


blockSeqs                     :     AT    A C   TT   C       T G A    TGT T ATTTT TT  A  G G GC G   ATATGTTTT T GA TA   T AC TTA  AT C AG G G T  AT AAT TT C A G  TA   GGGG A A  A CT T AT TA A AC TGAC GA  A   T T TGA A C   AC  GA  AC CG T TC   A   CG AATGAC CG   TC GTTCT   CCTAAC  TGA TC CCCCAG
blockSeqs                     :     A     . T   T    C       . A A    CC  T AT    T   A  . . A  T   .         . T  G    . .  .    .  . C  . A A  C  .   T  G . G  AC   G    . .  A G  . T  T  . A  G    GT  .   . T T   . .   C   TG  .  .  . C    .   .  T      C    .  T       .       TT  .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . G     C   A  . . A  .   .         . A  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  T . .  AT   G    . .  A .  . .  G  . .  .    C   .   . . .   . .   .   GG  .  .  . .    .   .  .      G    .  .       .       T   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . G  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  CT   .    . .  . .  . .  T  . .  .    .   .   . . .   . .   .   GA  .  .  . .    .   .  .      A    .  .       .       C   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   GG  .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  T    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   T   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :     .     . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :           . .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :             .   .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  A    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :                 .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   G   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :                 .    .       . . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   T   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :                                . .    .   . .     .   .  . . .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   T   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :                                                              .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  T    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   T   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :                                                              .  .   .         . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  T    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   .   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :                                                                               . .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  T    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   .   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :                                                                                 .  .    . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  G    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   .   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .  .     
blockSeqs                     :                                                                                         . .  .    .  . .  . . .  .  .   .  . . .  T    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   .   .  .  . .    .   .  .      .    .  .       .       .   .        
blockSeqs                     :                                                                                                   .  . .  . . .  .  .   .  . . .  C    .    . .  . .  . .  .  . .  .    .   .   . . .   . .   .   .   .  .  . .    .   .  .      .                                    


blockSeqCons                  : 
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finalCons                     : CTCA--GCGA-C-GTT--AAG-GAAACCC-G-A-GGAA---A-T-----T--GA-CA-A-A--G-CTG---------T-A--T--AGA-A--A---AG--T-A--C-C-T-AA--A---T--G-C-A-CT-C-CA----G-G-CC-A--A-A--T--G-A--C----G--TC-ACA-A-T---G-A-AAA--AT-G-A--C--G-T--CAT-GAC--A------T--ACA--G-----TTT------TG---T--A------TAGTTGTTTT