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lowQualScore                  :      . .    . .  .  .. .   .  ..   ..  .. . . ... .. . .   ....  ..  .. ....   .. ..  ..... . . .  .. .  . ..   .. . .... .....  .... .............  ..    ....  ... .........  . ... .. ...    ..  . .... ..  .  ..... . . .... . .. .  . . .  ..   ..  . .   .  . .  .........  . . . . ...  ... . .   . . .  . ...... . .. .... . .........  ......... . .  ...... . .  .. .  .  .....   ....  .  .. . . . . ..   .. . . .  .  . .  ..  ...   . . .............. ..... . . . .  .  . . .  .  .. . .. .  ........ ..  ... .. ...  . .  . ... .     .  ... ..... .  . . .. ...... ... .  .  .. ..... . ... ...  .... .. ... . ........  .. .. .  .    .. ... .  . . .. .  .. ..  .  . . . .. .  .  . .  . . .. .  .. . . ...  ..... . .... . . . ... .   . . .  ... ....    .....           
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Reference ( gi|71562 )        : AACAACA-TTGG-A-AC-GT--T-ATT-CC--TAA--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--C-ATC--A--CG-----A-A-T-AA--A-CA-T--TTT-TC-C-G--C-GC--TT----T-------------GT--CAAA--A-TG---A---------GT-C---T--G---AAAA--CA-G---CC--AA-AT-----G-T-G----A-T--A-CA-G-A-TT--ATT--GC-T-CAGGAA-A-AG------A--TG-T-G-C-G---CA---T-T-TGT-C-G-AG-C------A-A--A---AT-G---------AA--TA-T---A-ATAT------A-T-AT--T-GT-GT-----ATC----AT-TA--T-A-A-G-A--TGA--A-A-A-AC-AT-A-CT--TG---AAT-A-T----------G---A-----A-T-T-T-GC-TC-G-A-CG-CA--T-G--C-GC-T----T-T--AT-G-T--T---TT-C-TG-A---A-AGGAA-AA---C-----C-AC-C-T--G------A---A-TT-TG-TG-----G-A-C-A---TT----T--T---C-A--------TT--G--A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-CA--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--G-CT--C-TTG---TC-----A-T----A-T-GCC---A-CAA-A-T-CA---T----TTTA-----CTGATCAAACT
gi|71561                      : AACAACA-TTGG-A-AC-GT--T-ATT-CC--TAA--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--C-ATC--A--CG-----A-A-A-AAG-A-CA-T--TTT-CC-C-G--C-CT--TT----T-------------GT--CAAA--A-TG---A---------GT-C---T--G---AAAA--CA-G---CC---A-AT-----G-T-G----A-T--A-CA-G-A-TT--ATT--GC-T-CAGGAA-A-AG------A--TG-T-G-C-G---CA---T-T-TGT-C-G-AG-C------A-A--A---AT-G---------AA--AA-T---A-ATAT------A-T-AT--T-GT-GT-----ATC----AT-TA--T-A-A-G-A--TGA--A-A-A-AC-ATAA-CT--TG---AAT-A-T----------G---A-----A-T-T-T-GC-TC-T-A-CG-CA--T-G--C-GC-T----T-T--AT-G-T--T---TT-C-TG-A---A-AGGAA-AA---C-----C-AC-C-T--G------A---A-TT-TG-TG-----G-A-C-A----T----T--T---C-A--------TT--G--A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-CA--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--G-CT--C-TTG---TC-----A-T----A-T-GCC---A-CAA-A-T-CA---T----TTTA-----CTGATCAAACT
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gi|71570                      : AACAA-A-TTGG-A-AT-GT--T-CTT-CC--TAA--TT--T-G-G---T--A-G-CAT----GA--TG--A--C-ATC--A--CG-----A-A-T-AAGTA-CA-T--TTT-CC-C-G--C-CT--TT----T-------------GT--CAAAT-A-C----A---------GTAC---T------AAAA--CA-GA--TC--AA-AT-----G-T-G----A-T--A-CA-G---TT--AAG--GC-T-CAGGAA-A-AG------A--T--T-G-C-G---CA---C-T-GGTCC-G-AG-C--------A--A---AT-G---------AA--AA-A---A-ATAT-----------T--T-GTAGT-----ATC----AA-TATTT-G-A-G-AT-TGA--ACA-A-AC-AT-A-CT--TG---AATAA-T----------G---A-----A-T-T-T-GC-TC-G-A-CG-CG--T-G--C-GC-TG---T-T--AT-G-T--TC--TT-C-TG-A---A-AGG---GA---C-----C-AC-C-T--G------A---A-TC-TT-TG-----GTA-T-A---TT----T--GGA-T-A--------TT--G--A-AA-ATGG--CTGGG-TTGT-C--T-GCTTA--AT-TT-T-T-G--C-CA-ACGT-TC-A-G--A-CT--C-TGGCGTTG-----A-T----T-TGGAC---A--AA-A-T-CA---T----TTTA-----CTGATCAAA
gi|71572                      : AACAATA-TTT----AC-GG--T-AAT-CT----A--TT--C-C-A---T--ATG-TAT-----A--TG--A----AT---A---G-----ATA-T-AAT-A-CA-T--T----C-C-G--C-TA--TT----T-------------GT--TCAA--A-TG---T---------GT-T---G--GTCAAAAA--CA-G---TC--GA-ATATATTG-C-G----A-T--A-CATG-A-TT--ACTATGC-T-CAGGAA-A-AT------A--T--T-GTC-G---CACTGT-T-TAT-CTG-AG-A------C-A--G---AT-G---------AA--TAAT---A-AGAT------T-T-AC--T-AT-GTTGGTTATCC---AC-TA--TGA-A-G-A--TAACAA-A-A-AC------TT--TG---AAT---T----------A---AG----A-T-CAT-GC-TC-G-A-CG-CA--T-G--C-GC-TGTGAT-T--ATAG-T--T------C-TG-ACATA-AGGAA-AA---C-----C-A----T--G------A---A-TT-TGGTG-----G-A-TTA---TT----T--T---CTA--------TTA-G--A-AT-ATAG--C---A-TT-T-T--T-GC-CA--TG-TT-T---G--C-CA-AC-T-TT-A-A--G-CT--C-TCG---TC-----A-T----A-T-GAC---A-CAA-A-T-CA---T----TTCA-----CTGA
gi|71573                      : AACAAAA-TCAG-A-TC-AT--T-ATT-CC--TAA--TT--T-G-A---T--A-G---------A--TG--A--AGATG--A--CG---------T-------CA-T--CTT-CC-C-A--C--C--TTA---T-------------TC--CAAA--A-TA---A---------GC-T---T--G---AAAA--CT-G---TC--AA-AT-----G-T-T----A-T--A-CA-C-A-TT--ATT--GG-T-CAGAAA-A-AG------G--TG-T-G-C-----CA---T-C-TGT-C-A-AG-C------A-A--A---AT-G---------AA--AA-T---C-ATAT------A-T-AT--T-GT-GT-----ATC----AT-TT--T-A-A-G-A--TGAACA-A-G-AT-GT-G-TT--TGTGAAAC-A-C----------G---A-----A-T-
gi|71574                      : AACAA-A-TTGGGA-AG-GA--T--TT-CC--GAA--T-----G-A---TGAA-G-CAT----TA--TGCAAT-C-ATCCAA--CGCCCATA-A-T-AATGA-CA-C--ATT-TC-CTG--C-CA--TTATTGT-------------AT--TTGA--A-TA---ATTCTACACAGT-T---T--G---AAAAAACA-G---CT--CA-AT-----G-T-G----T-T--A-AA-TCA-TG--ATT--GA-T-CAGAAATA-AGTCTCGAA--TG-C-A---G---CA---T-TGTCT-C-A-AG-C------C-ACTA---AT-GGAACCGAAAAA--TA-----A-ATAT------G-T-AT----GC-GT-----ATC----ATATA--T-C-A-G-A--TGA--A-T-A--C-AT-A-CTATTG---AAT-A-T----------G---A-----A-T-T-T-GA-TCTG-A-CGCCA--T-GGTC--C-T----G-T--AC-G-T--T---TC-CTTG-A---A-AGAAGTAA---C-----C-AC-C-TGAG------A---A-TG-TC-TGAGGGAG-A-T-A---CT----TCCT---C-A--------TT--G--AGAA-ATTA--CT--A-CT-T-TTAT-GC-CA--AT-GT-T-G-C--C-CA-AC-T-TC-A-ACCG-CTGAC-TCGT--TC-----A-CCAGGA-T-G-------CAA-ATT-CATACT----CTTAC----CTGATCCAACT
gi|71571                      : AACAAAA-TTGA-A-AC-AT--T-ATT-CC--TAA--TT--C-T-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--T-ATC--A--CG-----A-A-T-AAG-A-CA-T--TTT-CC-C-G--C-CT--TT----T-------------TT--CAAA--A-TA---G---------ATAC---T--G---TAAA--
gi|71575                      : AACAAAA-TTGG-A-AC-GT--T-TTT-CC--TAA--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--C-A
gi|71577                      :  ACAAAA-TTGG-A-AC-TT--T-ATT-CC--TAA--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--C-ATC--A--CA-----A-A-TTAG--A-CA-T--TTC--C-C-G--C-TT--TT----T-------------GT--CAAAT-A-TG---A---------GT-C---T--G---AAAA--CA-GG--TC--AA-AT-----G-T-G----A-T--A-CA-C-A-TT--ATT--GC-T-CAGGAA-A-AG------A--TG-T-G-C-G---CA---T-T-TGT-C-G-AG-C------A-A--A---AT-G---------AAAATA-T---A-AAATT-----A-T-AT--T-GT-GT-----ATC----ATATA--T-A-A-G-AATTGA--A-A-A--C-AT-A-CT--TG---AAT-A-T----------G---A-----A-T-T-T-GC-TC-G-A-CG-CA--T-G--C-GC-T----G-T--AT-G-T--T---TT-C-TG-A---A-AGGAA-AA---C-----C-AC-C-T--G------A---A-TT-TG-AG-----G-A-T-A---TT----T--C---C-A--------TT--G--A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-AA--TT-TT-T-T-G--C-CC-AC-T-TC-A-A--G-CT--C-TCG---TC-----A-T----A-----C---A---------TG---T----ATGA-----CTGATCAAAC
gi|71576                      :  ACAACA-TTGA-A-GT-GTATT-ATC-CT--AAA--TT--T-GTA---T--A-G-CAT----TACCTG--A--C-ATC--A--CG-----A-A-T-AA--AACA-T--TTT--C-C-GT-C-AC--TT----T-------------GTGTCAAA--AATT---A---------GT-C---TCTG---AAAA--AACG---CC--AA-AT-----GAT-G----A-TC-A-CA-ATC-TT--ATT--GC-T-CAGGAA-G-AT------AGTTG-TAG-C-G---CA---T-T-TGT-T-G-AG-C------A-A--T---ATTG---------AAACTA-T---A--TATCAACTAA-T-ATGAT-G--GT-----ATT----CT-TT--T-T-A-A-A--TGA--A-AGA-AC-AT-A-CT--TG---AAT-A-T----------G---A-----A-T-T-T-GT-CT-G-A-CGACA--T-G--C-GC-T----T-TTAAT-G-TTGT---TT-C-TG-A---ACAGGAA-AA---C-----C-ACAC-T--G------AAATA-TT-GG-TG-----G-A-C-ATTTTT----T--T---C-A--------TT--G--A-AATATGGATT---ATTT-T-T--T-GC-CAT-TT-TT-T-T-G--C-TAGAC-T-TC-A-A--G-CT--CTTTG---TC-----A-T----ATT-GCC---A-GCA-A-T-CA---T----TTTA-----
gi|71578                      :  ACAACAATTGG-A-AC-AT--T-ATT-CC--TAA--TT--TTA-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--C-ATC--A--CG-----A-A-T-AAG-A-CA-T--TTTCTC-G-G--C-CT--TT----T-------------GT--CAAA--A-TG---AG--------GT-C---T--G---AAAT--CA-G---TC--AA-AT-----T-T-GT---A-T--A-CA-G-A-TT--ATTG-GC-T-CAGG-A-A-AG------A---G-T-G-C-G---AT---T-T-TGT---G-AG-C------A-AT-A---AT-G---------AA--AA-T---A-ATAT------A-A-TT--T-GT-GT-----GTC----AT-TA--T-A-A-GTA--TGA--A-A-A-AC-AT-A-CT--TG-----T-A-T----------T---A-----A-TAT-T-GC-TC-G-A-CATCA--TCG--C-GC-T----G-T--AT-T-T--T---TT-C-TG-A---A-AGGAA-AA---C-----CTAT-C-T--A------A---A-TT-T
gi|71579                      :    AAAA-TCGG-A-AC-GT--C-ATT-CC--TAA--AT--T-G-A---T--A-G-CAT----TT--TG--A--C-ATT--A--GG-----A-A-G-AAG-A-CA-T--TTT-CC-C-G--C-CG--TT----T-------------TT--CAAA--A-TA---A---------GC-C---T--G---AAAA--CT-G---CC--AA-AG-----A-T-C----A-T--A-CA-G-A-TT--ATT--TC-T-CAGGAA-A-AG------G--TG-T-G-C-G---CA---T-T-TGT-C-G-AG-C------A-A--A---AT-G---------AA--AA-T---A-ATAT------A-A-AT--T-GT-GT-----ATC----AT-TA--T-G-A-G-G--TGA--A-A-A-AT-AT-A-TT--TG---AAT-T-T----------G---A-----A-T-G-T-GC-TC-G-A-CG-CA--T-G--C-GC-T----G-T--AT-C-T--T---TT-C-TG-A---A-AGGAA-AA---C-----C-AC-C-T--G------A---A-TT-TG-TG-----G-A-A-A---TG----T--C---C-A--------TT--G--A-AA-ATGA--C---A-TT-T-T--T-GC-AA--TG-TT-A-T-G--C-CA-GC-T-TC-A-A--G-CT--C-TTG---TC-----A-T----A-T-GAC---A-CAA-A-T-CA---T----TTTG-----CTGATCAAACT
gi|71580                      :    AACA-TTGG-A-AT-GT--T-ATT-CC--TAA--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--C-ATC--T--CA-----A-A-T-AAG-A-CA-G--TTT-CC-C-G--C-TT--TT----T--------------T--CAAA--A-TG---G---------GT-C---T--G---AAAA--CA-G---TC--AA-AT-----G-T-C----A-T--A-CA-G-A-T----------------------------------G-T-G-C-G---CA---T-T-CGT-C-G-AG-C------A-A--A---AT-G---------AA--AA-T---A-ATAT------A-T-AT--T-GT-GT-----ATC----AT-TA--T-A-A-G-A--TGA--A-A-G-AC-AT-A-TT--TG---AAT-A-T----------G---A-----A-T-T-T-GC-TC-G-A-CG-GA--T-G--C-GC-T----A-T--AT-G-T--T---TT-C-TG-----A-AGGAA-AG---C-----C-AC-C-T--G------A---A-TT-TG-TG-----G-A-T-A---AT----T--T---C-A--------TT--G--A-AA-ATGG--C---A-T-------------------TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--G-AT--T-TCG---TC-----A-T----A-T-GAC---A-CAA-A----A----------TA-----CTGATCAAAC
gi|71581                      :       A-TTGG-A-AC-GT--T-AT--CC--TAT--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA---G--A--C-ATC--A--CA-----A-ACT-AG--A-C--C--TTT-TC------C-GT--TT----T-------------CT--CACAGGA-TG---AT--------GT-----T--G---AAAT--CA-G---
gi|71582                      :        -TCGG-A-AT-TT--T-ATT-CC--TAA--TA--T-G-A---T----G-CAT-----A--TG--A--C-ATT--AG-CG-----A-A-A-AAG-A-CA-T--GTT-TCGC-GG-C-GC--TT----TT------------GTACCAAA--A-TG---A---------GT-C---T--G---AAAAG-CA-G---TC--AA----------T-G----A-TTAA-CA-G-A-TT--ACT--ACGC-CAGGAA-A-GA------T--TG-T-G-C-G---CA---C-T-TGT-C-G-AGTC------AGA--A---AT-GG--------AA--AA-TG--A-AGAT------A-TTAG--T-GT-GT------TCCCAAAT-TA--T-A-A-G-A--TAA--A-A-A-AC-AT-A-AT--AC---AAT-A-TACGAATCATGG---A-----A-T-T-G-GCGTC-GTA-TGGCA--T-GG-CAGC-TG---T-T--AT-G-T--T---TT-C-GG-A---A-AGGAA-AA---ATTTTAC-GC-A-T--G------A---ACTT-TG-TG-----G-A-T-ACT-TT----T--T---C-A--------TC--T--G-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--TTGC-TAA-TT-TT-T-T-G----CA-AC-T-TT-A-A--GACT--T-CGG---TC-----A-T----A-T-GAC---A-CAA-C-T-CA---TG---TTTA-----CTGAT
gi|71583                      :          TGG-A-ATAGC--T-ATT-CC--T--------T-G-A---T--A-GACATGCTATA--TG--C--T-ATT-----C------A-G-T-AA--A-TGCT--TTT-TA-C-G--C-GC--AA----T-------------GT--CCG-----TG---A---------TC-C---T--G---ACAA--TA-AGTTTC--AA-TT-----G-T-GGGCTA-T--C-TA-G-A-TT--TTTTTG--T-CAGAGA-A-AG------C--T--T-G-TAG---CA---C-T-GAT-C-G-AG-C------T-A--ATATAT-G---------AA--AA-TT--A-AGAT------A-T-AT--A-GT-GT-----ATC----AT-TA--T-ATA-G-A--TGA--ATA-ATAC-AT-T-TT--TG---AAT-AGT----------G---A-----T-T-A-T-GC-TTAG-A-CA--A--T-G--CAG------------AT-G-T--TTAATT-C-TGTA---A-AGGGA-TA---------C-AC-A-T--G------A---A-TGATG-TG-----G-ATC-T---TT----T--T---C-A--------TTTGA--A-AA-AAGG--CT--A-TT-TAT--T-GCATA--TT-TT-TATAG--C-CA-CCAT-TC-A-A--G--T--C-TCGT--TC-----ATT----A-T-GACAAAA-CAA-A-T-AA---CAAAATTTATATATCTGATCGAACT
gi|71584                      :            G-A-AC-GT--T-AT--AC--TAC--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--C-ATC--A--CA-----A-A-T-AAG-A-CG-T--TTT-CC-C----------TT----T-------------TT--CAAA--AATA---A---------GT-C---T--G---AAAA--CT-G---GT--AATAT-----A-C-T----A-T--A-C--G-A-TT--ATT--GC-T-CAGGAA-ATGG------G--TG-T-G-C-T---CA---T-T--GT-C-G-AG-C------A-A--A---AT-G---------AA--AAAT---A-ACAT------A-T-TTG-T-GT-GT-----ATC----AT--A--T-A-A-G-A--TGA--A-A-AGAC-A--G-CT--TA---AGT---T----------G---A-----A-T-A-T-GC-TC-A-A--G-AA--A-G--C-GC-T----G-T--AT-G-T--T---TG-C-T--A---A-AGGAA-A----C-----C-AC-C-T--G------A---A-TT-TG--------A-A-T-A---TT----T--T---T-G--------TT--G--A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GC-AA--TT-TT-A-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--G-CT--C-TCG---TCATATAA-T----A-T-GAC---A-CAA-A-T-CA---T----TCTG-----CTGAATAAACT
gi|71585                      :                           T-CT--TAA--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--G--C-ATC--A--CG-----A-A-T-AA--G--A-C--TTT-TC-C-T--C-GC--CT----T-------------TT--CAAA-----G---A---------GT-C---T--G---AAAA--CA-G----C--AA-ATTC---G-T-G----A-T--AGCATG-A-TT--ATT--GC-T-CAGACT-A-AG------A--TG-T-G-C-G----A---T-T-T-T-C-G-AG-C------ACA--AT--AT-G---------AA--AA-T-----ATAT------A-T-AT--TGGT-GT-----ATC----AT-TA--A-A-A-G-A--T----A-A-A-ACAAT-ACCT--TG---AAT-A-T----------G---AC----A-T-T-T-GC-TT-G-A-CG-CA--TCG--C-G---------T--AT---T--C---TT-CGTC-A---A-TGGAA-AC---C-----C-AC-C-T--G------A---A--T-TG-GA-----G-A-T-AT--TT----T--T---C-A--------TT--G--A-AA-ATGG--C---A--T-T-T--T-GC-AA--TT-TTAT-TAG--C-CA-AC-T-GC-A-A--G-CA--T-TTG----C-----A-T----A-T-GAC---A-CAA-A-TCCA---T----TTTA-----CTGATCAAA
gi|71586                      :                                                   --A-G-CAA----AA--TG--AAAN-ATC--A--CG-----A-A-T-AA--GGCA-T--TTT-CC-T-G--C-CT--TT----T-------------GT--TAAA--A-TT---A---------GT-T---T--G---AAAA--CA-G---TC--AA-AT-----G-T-G----A-T--A-CA-G-A-TG--ATT--GA-T-AAGGAA-A-AG------C--TA-T-G-C-G---CA---T-T-TCT-C-G-AG-C------A-A--A---AT-G---------AA--
gi|71587                      :                                                                               C--A--CA-----A-A-T-AAG-A-CA-T--TTT-CC-C-G--C-CT--TT----T-------------GT--CACA--A-TG---A---------GT-C---T--G---AAAA--CA-G---annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattgttgccaacttcaagttctcgtcatatgatgcaaatcattttactgatcaaactgagcgaangttgccaacttcaagctctcgtcacaggatgcaaattattttactgatcaaact
gi|71567                      :                                                                                                                                                                                   ---T--G---AAAA--TA-T---CCTCAA-AT-----T-TAG----A-T-------G-G-TTTTCTT--TT-T-CAG-AA-A-AC------A--TA-CAG-C-G---CA---T-G-TGT-C-G-AG-C--------A--A---AT-T---------TA--TA-TTC-A-A-GT------A-T-GT--T-TT-TC-----ATC-----T-TA--T-A-ATG-A--CAC--A-C-A-AT-AT-A-TA--TT---ATT-T-T----------C---C-----ATT-T-T-GC-TC-G-A-CA-AA--T-G--C-GC------A-C--AT-C-T--T---TTCC-TG-------AGCAA-TA-----------AT-C-T--GTATACAA---A-TT-T---------G-A-CTG---TT----T--T---C-AGCCTCTT-TT--GACA-AA-ATGG--C---
gi|71588                      :                                                                                                                                                 aacaaaatggaaattattcctaattttaatatagcattatgaccatcacgataagacatttcc-AT-----G-T-C----A-T--A-CA-G-A-TT--ATT--GC-T-CAGGAA-A-AG------AG-TG-T-G-T-G---CA---T-T-GGT-C-A-AG-CAAATAAA-A--A---AT-G---------AT--TA-T---T-ATAttgaaaatggcagttttgcaattttttgccaactcaagctctcgtcatatgacacaaatcattttatatcaaact
gi|71589                      :                                                                                                                                                                                                                         -T-G----A-T--A-CA-G-A-TG--ATT--GC-T-CAGGAAGA-AG------C--TA-T-G-C-G---CA---T-T-TCT-C-G-AG-C------A-A--A---AT-G---------AA--cttcctgtaaaatg
gi|71561                      :                                                                                                                                                                                                                                                          -T-CAG-AA-A-AC------A--TA-AAG-C-G---CA---T-G-CGT-A-G-AG-C------A-A--A----T-T---------CA--TA-TTC-A-AGTT------A-T-GT--T-TT-TC-----ATC-----T-TA--T-A-ATG-A--TAC--A-C-A-AT-AT-A-TA--TT---ATT-T-T----------C---A-----T-T-T-T-GC-TC-G-A-CA-AA--T-G--C-GC------A-C--AT-C-T--T---TTCC-TG-A---a
gi|71577                      :                                                                                                                                       aacaacattggaacgttattcctaatttgatagcattatgacatcacgaaaaagacattttcccgccttttgtcaaaatgagtctgaaaacagccaatgtgatacagattattgc-T-CAG-AA-A-AC------A--TA-CAG-C-G---CA---T-G-CGT-C-G-AG-C------A-A--A----T-T---------CA--TA-TTC-A-A-GT------A-T-GT--T-TT-CA-----ATT----CT-TA--T-ATATG-A--TAC--A-C-A-AT-AT-A-AT--TT---TAT-A-T----------TTTCA-----T-T-T-T-GC-TC-G-A-CA-AA--T-G--C-GC------A-C--AT-C-T--T---TTCC-TG-A---aaggaaaaccacctgaatttgtggacatttcattgaaaatggcatttttgccattttttgccaacttcaagctcttgtcatatgccacaaatcattttactgatcaaact
gi|71579                      :                                                                                                                                      acaaaattggaactttattcctaatttgatagcattatgacatcacaaattagacatttcccgctttttgtcaaatatgagtctgaaaacaggtcaaatgtgatacacattattgc-T-CAG-AA-A-AG------A--TA-CAG-C-G---CA---T-G-CGT-C-G-AG-C------A-C--A---TTCA---------AA--TT-C---A-A-AT------A-T-AT--T-TT-TC-----ACC-----T-CA--T-A-A------TGA--T-A-C-AC-A--A-TT--T-----AT-A-T----------T---ATTTTCA-T-T-TTGC-TC-G-A-CA-AA--T-G--C-GC------A-C--AC-C-T--T---TTCC-TG-A--------GA-AA---T-----A-AT-C-T--GTAT---G---A-TC-TT-TG-----G---C-AG--TT----T--T---C-AGGCTTATTTT--G--A-AA-Aaaggaaaaccacctgaatttgaggatatttccattgaaaatggcatttttgcaattttttgcccacttcaagctctcgtcatacatgtatgactgatcaaac
gi|71580                      :                                                                                                                                                                                        aaaatcggaacgtcattcctaaattgatagcattttgacattaggaagaagacattttcccgccgt-T-CAG-AA-A-AC------A--TA-TAG-C-G---CA---T-C-CGT-C-G-AG-C------A-A--A----T-T---------CA--TA-TTCAA-ATAT------G-T-CT--T--T--C-----ATC-----T-TA--T-A-ATG-A--TAC--A-C-A-AT-AT-A-TA--TT---ATT-T-T----------C---A-----T-T-T-T-GC-TC-G-A-CG-AA--T-G--C-GC-aaggaaaaccacctgaatttgtggaaatgtccattgaaaatgacatttttgcaatgttatgccagcttcaagctcttgtcatatgacacaaatcattttgctgatcaaact
gi|71590                      :                                                                                                                                                                                                                                           aacattggaatgttattcctaatttgatagcattatgacatctcaaataagacagtttcccgcttttttcaaaatgggtctgaaaacagtcaaatgtcatacagatgt---A-ATAT------A-T-AT--T-GT-GT-----ATC----AT-TA--T-A-AAG-A--TGA--A-A-A-AC-AT-G-CT--TG---AAT-A-T----------G---A-----A-T-T-T-GC-TC-G-A-CG-CA--T-GC-C-GC-T----G-T--AT-GTT--T---TT-C-TG-T---A-GGCAA-AAGGGC-----C-AC-C-A--A------A---A-TT-TG-TG-----G-A-T-A---TTAAGGT--G---C-A--------TT--G----AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-GG-CAATTT-TT-T-T-G--CGCG-AC-T-TCAA-A--G-CT--C-TCG---TC-----A-T----A-T-GAC---ACCAA-A-T-CA--------TTTA-----CTAATCAAAaggaaagccacctgaatttgtggataatttcattgaaaatggcatttttgccaacttcaagatttcgtcatatgacacaaaatactgatcaaac
gi|71591                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -----ATG----AT-TA--T-G-A-G-A--TGA--A-A-A-AC-AT-A-CT--TA---AAT-A-T----------GG--A-----A-T-T-T-GC-TC-G-AACG-CA--T-G--C-GCAT----G-T--AT---T--T---TT-C-TG-A---A-AGGAA-AA---C-----T-TC-C-T--G------A---A-TT-TG-AG-----G-A-T-A---TA----T--T---C-A--------TT--C--A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T----GC-AA--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--G-CT--C-TTG---TC-----A-T----A-T-GAC---A-CAA-A-T-CAT--T----TTTA-----CTGATCAAACT
gi|71592                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AC-GT-A-CT--TG---AAT-A-T----------A---A-----A-T-T-T-GC-TC-G-A-CG-CG--T-G--C-GC-T----G-T--AT-G-T--T---TT-C-CG-A---A-GGGAA-AA---C-----T-AC-C-T--G------A---A-TT-TG-AG-----G-A-T-A---TT----T--C---C-A--------TT--G--A-AA-ATGG--C---A-GT-T-T--T-GC-AA--TT-TT-T-T-G--C-AA-AT-T-TC-A-A--G-CT--C-TCG---TC-----C-T----A-G-GAC---A-CAA-A-T-CA---T----TTTA-----CTGATCAAACT
gi|71593                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             G-CA--T-G--C-AC-T----G-T--AT-G-A--T---TT-C-TG-A---A-AGGAA-AA---A-----C-AC-C-T--G------A---A-TG-TG-TG-----G-A-T-A---TT----T--C---T-A--------TT--G--A-AA-ATGA--T---A-CT-T-T--T-GC-
gi|71594                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AA-AA---C-----T----C-T--G------G---A-TT-TG-TG-----A-A-T-A---TT----T--T---C-A--------TT--G--A-AA-ATGG--C---A-TT-T-T--T-AC-AG--TT-TT-T-TTG--C-AA-AC-T-TC-A-A--G-CT--T-CCG---TC-----A-T----A-T-GAC---A-TAA-A-T-CA---T----TTTA-----CGGATCAAACT
gi|71595                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --G------A---A-TT-TG-AG-----G-A-T-A---TT----T--T---C-A--------TT--G--A-AA-ATGA--C---A-TT-T-T--T-GC-AA--TT-
gi|71596                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ------A---A-TT-TG-TG-----G-A-T-A---TT----T--G---C-A--------TT--G--A-AA--TGG--C---A-TT-T-T--T-GC-AA--TT-TT-T-T-G--C-CG-AC-T-TC-A-A--G-CT--C-TCG---TC-----A-T----A-T-GAC---A-CAA-A-T-CA---T----TTTA-----CTAATCAAATTacaaatcattttaatgatcaaact
gi|71597                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---A-TA-T-T--T-GT-AA--TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--G-CT--C-TCG---TC-----A-T----A-T-GAC---A-C---A-C-CA---T----TTTA-----CTGATCAAATT
gi|71586                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-TG-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--G-TT--C-TCG---TC-----A-T----A-T-GAT---G-CAA-A-T-CA---T----TTTA-----CTGATCAAACT
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Reference ( family-488 )      :                                                                                                                                                                                               AACAANA-TTGG-A-AC-GT--T-ATT-CC--TAA--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--C-ATC--A--CG-----A-ATAA-G-A--CAT-TTT-CC--C-G--CN-TT-TT-----------GT--C----AA-A--A-TG------A--GT-C---T--G---AAAA--CA-G---CCAA-AT-----G-TG----A-T--A-CA-G-A-TTATT--GC-T-CAGGAA-A-AG------A--T-G-T-GCG---CA---T-T-TGT-C-G-AG-CA-A--A---AT-G-------AA-AA-T-A----A-TAT------A-T-AT--T-GT-GT-----ATC----AT-TA--T-A-A-G-A--TGA--A-A-A-AC-AT-A-CT--TG---AAT-A-T----------G-A-AT-T-TGC-TC-G-A-CG-CA--T-G-C-G--C-T-NT--ATG-T--T----TTC-TG-A---A-AGGAA-AA---C-----C-AC-C-T--GA---A-TT-TG-TG-----G-AT-A---TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-A-TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--GCT--C-T--CG-TC-----A-TA-T-GAC---A-CAA-A-T-CA---T----TTTA-----CTGATCAAACT
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gi|71582                      :                                                                                                                                                                                                      -TCGG-A-AT-TT--T-ATT-CC--TAA--TA--T-G-A---T----G-CAT-----A--TG--A--C-ATT--AG-CG-----A-AAAA-G-A--CATGTTT-CG--C-GG-CGCTT-TT-----------GTACC----AA-A--A-TG------A--GT-C---T--G---AAAAG-CA-G---TCAA----------TG----A-TTAA-CA-G-A-TTACT--ACGC-CAGGAA-A-GA------T--T-G-T-GCG---CA---C-T-TGT-C-G-AGTCAGA--A---AT-GG------AA-AA-TGA----A-GAT------A-TTAG--T-GT-GT------TCCCAAAT-TA--T-A-A-G-A--TAA--A-A-A-AC-AT-A-AT--AC---AAT-A-TACGAATCATGG-A-AT-T-GGCGTC-GTA-TGGCA--T-GGCAG--C-T-GTT-ATG-T--T----TTC-GG-A---A-AGGAA-AA---ATTTTAC-GC-A-T--GA---ACTT-TG-TG-----G-AT-ACT-TT----T--T---C-ATC--T-G-AA-ATGG--C---A-TT-T-TTTG---CT-A-A-TT-TT-T-T-G--C--A-AC-T-TT-A-A--GAC--T-T--CGGTC-----A-TA-T-GAC---A-CAA-C-T-CA---TG---TTTA-----CTGAT
gi|71583                      :                                                                                                                                                                                                        TGG-A-ATAGC--T-ATT-CC--T--------T-G-A---T--A-GACATGCTATA--TG--C--T-ATT-----C------A-GTAA-ATG--C-T-TTT-TA--C-G--CG-CA-AT-----------GT--C----CG------TG------A--TC-C---T--G---ACAA--TA-AGTTTCAA-TT-----G-TGGGCTA-T--C-TA-G-A-TTTTTTTG--T-CAGAGA-A-AG------C--TTG-T-A-G---CA---C-T-GAT-C-G-AG-CT-A--ATATAT-G-------AA-AA-TTA----A-GAT------A-T-AT--A-GT-GT-----ATC----AT-TA--T-ATA-G-A--TGA--ATA-ATAC-AT-T-TT--TG---AAT-AGT----------G-A-TT-A-TGC-TTAG-A-CA--A--T-G-C--------AG--ATG-T--TTAA-TTC-TGTA---A-AGGGA-TA---------C-AC-A-T--GA---A-TGATG-TG-----G-AT-CT--TT----T--T---C-ATTTGA-A-AA-AAGG--CT--A-TT-TATT-G---C--ATA-TT-TT-TATAG--C-CA-CCAT-TC-A-A--G-T--C-T--CGTTC-----ATTA-T-GACAAAA-CAA-A-T-AA---CAAAATTTATATATCTGATCGAACT
gi|71584                      :                                                                                                                                                                                                          G-A-AC-GT--T-AT--AC--TAC--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--A--C-ATC--A--CA-----A-ATAA-G-A--CGT-TTT-CC--C-------TT-TT------------T--C----AA-A--AATA------A--GT-C---T--G---AAAA--CT-G---GTAATAT-----A-CT----A-T--A-C--G-A-TTATT--GC-T-CAGGAA-ATGG------G--T-G-T-GCT---CA---T-T--GT-C-G-AG-CA-A--A---AT-G-------AA-AAAT-A----A-CAT------A-T-TTG-T-GT-GT-----ATC----AT--A--T-A-A-G-A--TGA--A-A-AGAC-A--G-CT--TA---AGT---T----------G-A-AT-A-TGC-TC-A-A--G-AA--A-G-C-G--C-T-GT--ATG-T--T----TGC-T--A---A-AGGAA-A----C-----C-AC-C-T--GA---A-TT-TG--------A-AT-A---TT----T--T---T-GTT--G-A-AA-ATGG--C---A-TT-T-TT-G---C--A-A-TT-TT-A-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--GCT--C-T--CG-TCATATAA-TA-T-GAC---A-CAA-A-T-CA---T----TCTG-----CTGAATAAACT
gi|71585                      :                                                                                                                                                                                                                         T-CT--TAA--TT--T-G-A---T--A-G-CAT----TA--TG--G--C-ATC--A--CG-----A-ATAA-G-A--CTT-TTC-CT--C-G--CC-TT-T-------------T--C----AA-A-----G------A--GT-C---T--G---AAAA--CA-G----CAA-ATTC---G-TG----A-T--AGCATG-A-TTATT--GC-T-CAGACT-A-AG------A--T-G-T-GCG----A---T-T-T-T-C-G-AG-CACA--AT--AT-G-------AA-AA-T------A-TAT------A-T-AT--TGGT-GT-----ATC----AT-TA--A-A-A-G-A--T----A-A-A-ACAAT-ACCT--TG---AAT-A-T----------G-ACAT-T-TGC-TT-G-A-CG-CA--T---C-G--C---GT--AT--T--C----TTCGTC-A---A-TGGAA-AC---C-----C-AC-C-T--GA---A--T-TG-GA-----G-AT-AT--TT----T--T---C-ATT--G-A-AA-ATGG--C---A--T-T-TT-G---C--A-A-TT-TTAT-TAG--C-CA-AC-T-GC-A-A--GCA--T-T--TG--C-----A-TA-T-GAC---A-CAA-A-TCCA---T----TTTA-----CTGATCAAA
gi|71586                      :                                                                                                                                                                                                                                                 --A-G-CAA----AA--TG--AAAN-ATC--A--CG-----A-ATAA-G-G--CAT-TTT-CC--T-G--CC-TT-TT-----------GT--T----AA-A--A-TT------A--GT-T---T--G---AAAA--CA-G---TCAA-AT-----G-TG----A-T--A-CA-G-A-TGATT--GA-T-AAGGAA-A-AG------C--T-A-T-GCG---CA---T-T-TCT-C-G-AG-CA-A--A---AT-G-------AA-A
gi|71586                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-TG-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--GTT--C-T--CG-TC-----A-TA-T-GAT---G-CAA-A-T-CA---T----TTTA-----CTGATCAAACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattgttgccaacttcaagttctcgtcatatgatgcaaatcattttactgatcaaactgagcgaangttgccaacttcaagctctcgtcacaggatgcaaattattttactgatcaaact
gi|71586                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agcaaaatgaaanatcacgaataaggcattttcctgccttttgttaaaattagtttgaaaacagtcaaatgtgatacagatgattgataaggaaaagctatgcgcatttctcgagcaaaatgaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnta-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--GCT--C-T--CG-TC-----A-CA-G-GAT---G-CAA-A-T-TA---T----TTTA-----CTGATCAAACTgagcgaangttgccaacttcaagctctcgtcacaggatgcaaattattttactgatcaaact
gi|71587                      : agcaaaatgaaanatcacgaataaggcattttcctgccttttgttaaaattagtttgaaaacagtcaaatgtgatacagatgattgataaggaaaagctatgcgcatttctcgagcaaaatgaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattgttgccaacttcaagttctcgtcatatgatgcaaatcattttactgatcaaactgagcgaangC--A--CA-----A-ATAA-G-A--CAT-TTT-CC--C-G--CC-TT-TT-----------GT--C----AC-A--A-TG------A--GT-C---T--G---AAAA--CA-G---
gi|71588                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -AT-----G-TC----A-T--A-CA-G-A-TTATT--GC-T-CAGGAA-A-AG------AG-T-G-T-GTG---CA---T-T-GGT-C-A-AG-CA-A--A---TA-A-------AA-AA-T-G----A-T----------T-AT--T-AT-AC-----TTC-----C-TG--T-A-A-A-A--TG
gi|71589                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TG----A-T--A-CA-G-A-TGATT--GC-T-CAGGAAGA-AG------C--T-A-T-GCG---CA---T-T-TCT-C-G-AG-CA-A--A---AT-G-------AA-A
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gi|71597                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---A-TA-T-TT-G---T--A-A-TT-TT-T-T-G--C-CA-AC-T-TC-A-A--GCT--C-T--CG-TC-----A-TA-T-GAC---A-C---A-C-CA---T----TTTA-----CTGATCAAATT
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