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Reference ( family-487 )      : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ACGCCTGCTG-CCC-GA-T---C-CATT--CG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATATT
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gi|108023                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ATGCCTGTTG-CCC-AA-T---C-CATT--TG-----AG---T--TAT--------C-----T--------A--ATA--AAATAT
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Reference ( family-487 )      : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ACGCCTGCTG-CCC-GA-T---C-CATT--CG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATATT
gi|108022                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ATGCCTGTTG-CCC-AA-T---C-CATT--TG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATGTT
gi|108023                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ATGCCTGTTG-CCC-AA-T---C-CATT--TG-----AG---T--TAT--------C-----T--------A--ATA--AAATAT
gi|108024                     : GGAGAGG-GCT-TATA---GGC--T-ATGTCTGTTG-TCC-AA-T---C-CATT--TG-----AA---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATAT
gi|108025                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ATACCTGTTG-ACC-AA-T---C-CTTT--TG-----AA---T--TAT--------T-----T--------A--ATA--AAATAT
gi|108026                     : GGAGAGG-GCT-TCTA-TAGGC--T-CAGCCTGCTG-CCC-GA-T---C-CATT--TA-----CA---T--TAT--------A-----C--------ATGATA--AAATAT
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gi|108046                     : GGAGAGG-GCT-AACA-TAGGC--A-ATACCTGCTG-CCC-GA-TC--C-CATT--CACAT--AT---T--TAT--------T-----TGTG-----A--ATA--AAATATT
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gi|108049                     : GGAGAGG-GCT-AACA-TAGGC--A-ATGCCTGCTA-CCC-GG-TC--C-CATT--CACAATTAT---T--TCT--------T-----TGTG-----A--ATA--AAATATT
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gi|108051                     : GGAGAGG-GCT-AAAACTAGGC--A-GTGTCTGCTG-CCCAGT-T---C-CATC--TAT----AT---T--TAT--------T-----TTAA-----A--ATA--AAATATT
gi|108052                     : GGAGAGG-GCT-TACA-TAGGC--A-ATACCTGATG-CCC-GA-TC--C-CATT--CACGT--AT---T--TTT--------T-----G--------A--ACA--AAATATT
gi|108053                     : GAAGAGG-GCT-CGTA-TAGGC--A-AAGCCTGCTG-CCCAAA-TGGGC-AATC--CC-----ATCAAT--TAT--------T-----G--------A--AT---AAATATT
gi|108054                     : GGGGAGG-GTC-CCGA-TAGGC--C-AAGCCTGCTG-CCC-AA-T---C-CCAT--CA-----AA---T--TAG--------T-----G--------A--AT---AAATATT
gi|108055                     : GGAAAAG-TCT-TCTA-TAGGC--T-ACCCCTGTTG-TCT-AA-T---T-CATTTATG-----CT---T--TAT--------A-----CAAACATGTA--ATA--AAATATT
gi|108056                     :  GAGAGG-GCT-TACA-TAGGCATT-GCGCCTGTTG-CCC-AA-T---C-CAAT--TT-----AT---G--TATGTTTTACAT-----G--------A--ATA--AAATATT
gi|108057                     :  GAGATG-GCT-TATA-TAGGC--A-ACGACTGTTG-TGC-AA-T---C-CTTT--C------AT---G--TAT--------TATACAT--------A--ATA--AAATGTT
gi|108058                     :   AGAGG-GCT-TATA-TAGGC--A-ACGTCTATTG-TCC-AA-T---C-C--T--TG-----TA---T--TAT--------A-----C--------ATCATA--AAATATT
gi|108059                     :     AGG-GCT-TATA-TAGGC--TAATGTTTGTTGCCCC-AA-T---C-TTTT--TG-----AA---TAATAA--------TAATCAC--------A--ATA--AAAT
gi|108060                     :        -GCT-TATA-TAGGC--T-ACGCTTGTTG-CCC-AA-T---C-CATT--TG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATAT
gi|108061                     :        -GCT-TATA-TAGGC--T-ATACCTGTTG-CCC-AA-T---T-CATT--TG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATAT


blockSeqs                     :        C   A    C     TTTGT         C   AG T GGG T    TATGCTTTATACAAACATGT                        TG   TT
blockSeqs                     :        .   .    .     ATTGC         .   AA . C   .    TTATGTATGTTTTACATG                          AT   . 
blockSeqs                     :        .   .    .     ATTGC         .   A  . C   .    TTATTGTGTTCTTACATG                          TC   . 
blockSeqs                     :        .   .    .     ATTGC         .   A  . C   .    CACAATTATTTCTTTGTG                          .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     ATTGC         .   A  . C   .    TTATGTATGTTTTACATG                          .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAAT          .   G  . C   .    TGAATAATAATAATCAC                           .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAT           .   A  . C   .    CACATATTTATTTGTG                            .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAT           .   G  . C   .    CACATATTTATTTGTG                            .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAT           .   A  . C   .    CACATATTTATTTGTG                            .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TCA           .   A  . .   .    CACATATTTATTTGTG                            .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAT           .   A  . .   .    CACATATTTCTTTGTG                            .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TCA           .   G  . .   .    TATATTTATTTTAA                              .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAT           .   G  . .   .    CATGTATTATACAT                              .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAC           .   A  . .   .    TTATGTATTATAC                               .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TCA           .   A  . .   .    CACGTATTTTTTG                               .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TCA           .   A  . .   .    CCATCAATTATTG                               .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TCA           .   A  . .   .    TGTGTTATACAT                                .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAC           .   G  . .   .    CATGTTATACCT                                .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAA           .   G  . .   .    TATGTTATACCT                                .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAC           .   A  . .   .    CATATTATTTG                                 .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAT           .   A  . .   .    CATATTTTTTT                                 .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TGT           .   G  . .   .    TGAGTTATCT                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAG           .   G  . .   .    TGAATTATTC                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAT           .   A  . .   .    TGAATTATTT                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAT           .   A  . .   .    TACATTATAC                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAT           .   G  . .   .    TCATTTATTC                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAC           .   C  . .   .    GGAATGATTC                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAT           .   G  . .   .    CACGTTATAC                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAT           .   G  . .   .    CAATTTATTG                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TGT           .   G  . .   .    CAAATTAGTG                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AGT           .   G  . .   .    TGTATTATAC                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAT           .   A  . .   .    TGATTTATTC                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAA           .   A  . .   .    TGATTTATTC                                  .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     CAA           .   A  . .   .    AATGTATTG                                   .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     TAC           .   A  . .   .    TTATGTATC                                   .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAC           .   A  . .   .    CATG                                        .    . 
blockSeqs                     :        .   .    .     AAC           .   A  . .   .                                                       
blockSeqs                     :        .   .    .     TAC           .   A  . .   .                                                       
blockSeqs                     :        .   .    .     TAT           .   A  . .   .                                                       


blockSeqCons                  : 
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finalCons                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ACGCCTGCTG-CCC-GA-T---C-CATT--CG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATATT





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lowQualScore                  :        .   .    .     ......        .   .. . ... .    ........................................... ..   ..       
lowQualScore                  :        0   0    0     666666        0   66 0 888 0    4444444444444444444444444444444444444444444 55   55       
consensus                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ACGCCTGCTG-CCC-GA-T---C-CATT--CG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATATT
Reference ( family-487 )      : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ACGCCTGCTG-CCC-GA-T---C-CATT--CG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATATT
gi|108022                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ATGCCTGTTG-CCC-AA-T---C-CATT--TG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATGTT
gi|108023                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ATGCCTGTTG-CCC-AA-T---C-CATT--TG-----AG---T--TAT--------C-----T--------A--ATA--AAATAT
gi|108024                     : GGAGAGG-GCT-TATA---GGC--T-ATGTCTGTTG-TCC-AA-T---C-CATT--TG-----AA---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATAT
gi|108025                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ATACCTGTTG-ACC-AA-T---C-CTTT--TG-----AA---T--TAT--------T-----T--------A--ATA--AAATAT
gi|108026                     : GGAGAGG-GCT-TCTA-TAGGC--T-CAGCCTGCTG-CCC-GA-T---C-CATT--TA-----CA---T--TAT--------A-----C--------ATGATA--AAATAT
gi|108027                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGA--T-ATGCCTGTTG-CCC-AA-T---C-CATT--TC-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATG--AAGTAT
gi|108028                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-CAGCCTGCTG-CTT-GA-T---C-CATT--TG-----TG---T--TAT--------A-----CAT------A--GTA--AAATAT
gi|108029                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGGC--T-ATGCCTGTTG-TCC-AA-T---C-CATT--TG-----AT---T--TTT--------T-----
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gi|108032                     : GGAGAGG-GCT-TATA-TAGAC--T-CAGCCTGCTG-TCT-GA-T---C-CATT--T------ATG--T--TAT--------A-----CCT------A--ATG--AAATAT
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gi|108034                     : GGAGAGC-GCT-TATA-TAGGC--A-ACGCCTGCTG-TCC-AA-T---T-CTTT--TT-----AT---G--TAT--------TATA--C--------AATATA--AAATATTta
gi|108035                     : GGAGAGG-GCT-TGTA-TAGGC--A-AAGCCTGCTA-CCC-AATT---C-CATT---A-----AT---G--TAT--------T-----G--------A--AT---AAATATT
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gi|108037                     : GGAGAGG-GCT-TACA-TAGGCTTT-GTGCCTGCTG-CCC-AA-T---C-CAAT--CA------------------------T-----G--------A--ATA--AAATATTcatacataataaa
gi|108038                     : GGAGAGG-GCT-AATA-TAGGC--A-ATGCCTGCTG-CCC-GA-TC--C-CATT--CACAT--AT---T--TAT--------T-----TGTG-----A--ATA--AAATATT
gi|108039                     : GGAGAGG-GCTATA-A-TAGGC--T-GTGCCTGCTG-CCC-GA-T---CTCAAT--C------ATA--T--TAT--------T-----TG-------A--ATG--AAATATT
gi|108040                     : GGAGAGG-GCT-TACA-TAGGCATT-GCGCCTGCTG-CCC-AA-T---C-CAAT--TT-----AT---G--TATGTTTTACAT-----G--------A--ATA--AAATATT
gi|108041                     : GGAGAGG-GAT-CATA-TAGGC--T-AGGTCTGCTA-TCC-AA-T---C-CCAG--CA-----AT---T--TAT--------T-----G--------A--ATATTAAATATT
gi|108042                     : GGAGAGG-GCT-AACA-TAGGC--A-ATGCCTGCTG-CCC-GA-TC--C-CATT--CACAT--AT---T--TAT--------T-----TGTG-----A--ATA--AAATATT
gi|108043                     : GGAGAGG-GCT-AACA-TAGGC--A-ATGCCTGCTG-CCC-GA-TC--C-CATT--CACAT--AT---T--TAT--------T-----TGTG-----A--ATA--AAATATT
gi|108044                     : GGAGAGG-GCT-TACA-TAGGCATT-GCGCCTGCTG-CCC-AA-T---C-CA-----------AT---T--TAT--------
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gi|108046                     : GGAGAGG-GCT-AACA-TAGGC--A-ATACCTGCTG-CCC-GA-TC--C-CATT--CACAT--AT---T--TAT--------T-----TGTG-----A--ATA--AAATATT
gi|108047                     : GGAAAGG-GCT-TATA-TAGGC--A-ACGCCTGTTG-TCC-CA-T---C-C-TT--TT-----AT---G--TAT--------C-----------------ATA--CAATGT
gi|108048                     : GGAGAGG-GCT-AACA-TAGGC--A-ATGCCTGCTG-CCC-GA-TC--C-CATT--CACAT--AT---T--TCT--------T-----TGTG-----A--ATA--AAATATTacataataaatatt
gi|108049                     : GGAGAGG-GCT-AACA-TAGGC--A-ATGCCTGCTA-CCC-GG-TC--C-CATT--CACAATTAT---T--TCT--------T-----TGTG-----A--ATA--AAATATT
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gi|108051                     : GGAGAGG-GCT-AAAACTAGGC--A-GTGTCTGCTG-CCCAGT-T---C-CATC--TAT----AT---T--TAT--------T-----TTAA-----A--ATA--AAATATT
gi|108052                     : GGAGAGG-GCT-TACA-TAGGC--A-ATACCTGATG-CCC-GA-TC--C-CATT--CACGT--AT---T--TTT--------T-----G--------A--ACA--AAATATT
gi|108053                     : GAAGAGG-GCT-CGTA-TAGGC--A-AAGCCTGCTG-CCCAAA-TGGGC-AATC--CC-----ATCAAT--TAT--------T-----G--------A--AT---AAATATT
gi|108054                     : GGGGAGG-GTC-CCGA-TAGGC--C-AAGCCTGCTG-CCC-AA-T---C-CCAT--CA-----AA---T--TAG--------T-----G--------A--AT---AAATATT
gi|108055                     : GGAAAAG-TCT-TCTA-TAGGC--T-ACCCCTGTTG-TCT-AA-T---T-CATTTATG-----CT---T--TAT--------A-----CAAACATGTA--ATA--AAATATT
gi|108056                     :  GAGAGG-GCT-TACA-TAGGCATT-GCGCCTGTTG-CCC-AA-T---C-CAAT--TT-----AT---G--TATGTTTTACAT-----G--------A--ATA--AAATATT
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gi|108058                     :   AGAGG-GCT-TATA-TAGGC--A-ACGTCTATTG-TCC-AA-T---C-C--T--TG-----TA---T--TAT--------A-----C--------ATCATA--AAATATT
gi|108059                     :     AGG-GCT-TATA-TAGGC--TAATGTTTGTTGCCCC-AA-T---C-TTTT--TG-----AA---TAATAA--------TAATCAC--------A--ATA--AAAT
gi|108060                     :        -GCT-TATA-TAGGC--T-ACGCTTGTTG-CCC-AA-T---C-CATT--TG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATAT
gi|108061                     :        -GCT-TATA-TAGGC--T-ATACCTGTTG-CCC-AA-T---T-CATT--TG-----AT---T--TAT--------T-----C--------A--ATA--AAATAT