lowQualScore                  :                                                 111111      1111111               111111111                                                                             1111111                                                            1111111111           111111111                                                                   11111111                                                                     1111111111                11111111                                                                                                 111                                               
lowQualScore                  :             555   1 222 22  1 3333 1 1 22 44  1 000000  1 1 2222222 333 1 11  444 666666666 1  22 3333333  11 1 88888888888 2  33 2   2222      55555 1 3 3333 555   3  3333333 22 1   555   777777 66666666 1  555 44 3333 22 55   66 333 2222222222   5555 22 111111111 333 44    1 22 44 22  1 44 888   1 1  555555 1   555555 555555  3 00000000 1  9999999999  1   333 3   44444 44 1 44 1 22  22  6666  999999999  2222222222  3 444 33   22 22222222   1 444 1 66  22 333 3333   1 1 3333 3 66666   777777   8888  1   1 1 6666    22   2 666 333 33 666   33 2  2   2 33 4444 4 5555 2        2 33    
lowQualScore                  :             ...   . ... ..  . .... . . .. ..  . ......  . . ....... ... . ..  ... ......... .  .. .......  .. . ........... .  .. .   ....      ..... . . .... ...   .  ....... .. .   ...   ...... ........ .  ... .. .... .. ..   .. ... ..........   .... .. ......... ... ..    . .. .. ..  . .. ...   . .  ...... .   ...... ......  . ........ .  ..........  .   ... .   ..... .. . .. . ..  ..  ....  .........  ..........  . ... ..   .. ........   . ... . ..  .. ... ....   . . .... . .....   ......   ....  .   . . ....    ..   . ... ... .. ...   .. .  .   . .. .... . .... .        . ..    
lowQualScore                  :             222   2 111 88  2 7777 2 2 88 00  2 333333  2 2 9999999 222 2 66  333 000000000 1  77 7777777  66 1 11111111111 3  88 4   6666      00000 7 3 9999 000   8  6666666 66 9   000   000000 66666666 8  000 33 9999 55 00   11 222 3333333333   4444 44 111111111 000 11    7 44 88 44  7 11 999   7 7  000000 7   222222 222222  6 00000000 8  8888888888  8   222 6   55555 33 8 33 8 55  44  1111  000000000  7777777777  5 888 66   44 22222222   7 888 7 00  44 000 7777   7 7 7777 5 77777   777777   6666  9   9 9 0000    66   2 999 999 22 666   11 2  2   2 11 7777 4 0000 4        9 99    
consensus                     :      AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AAA--C---G------C---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------CCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---T-CN-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----ATGA--AAC-G---T---A-GATG-AAA--C-GT-AGA-A--A----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
Reference ( gi|95161 )        :      AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CA-----TT-T-C---G---G---G-C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AAA--C---G------T---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------TCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---T-CT-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----ATGA--AAC-G---T---A-AATC-AAA--C-GT-AGA-A--A----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
gi|95164                      :      AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-A--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-AG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TATT-----A--------C-GT---A--G----G--A--AAA--C---G------T---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA---------CCC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---T-CA-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----G--ACA-A-C----ATGA--AAC-G---T---A-GAAG-AAA--C-GT-AGA-A--A----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
gi|95163                      :      AAAGTCA---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--T-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AAA--C---G------C---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-C--A---CGG-C-TA------T-ACA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-C-------CCC-G---T-ATAT--A--------TGG-G---T-CA-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----ATGA--AAC-G---T---A-GATA-AAA--C-GT-AGA-A--A----A-A----C-GCACA
gi|95167                      :      AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G-----C--AT---C---C-----G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-G--------AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AAA--C---G------T---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---C-G-C-TA------T-ACA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-G--CT--TC----AT--C------GA-T-------TCC-G---T-TGAT--AT-------TTG-G---T-CT-GC--A---C----AAT-A-C------A-----ACG------T-G----GC-AAA-A-A----ATAA--AAC-G---T---A-AATT--AA--C-GT-AGA-A--A----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
gi|95166                      :      AAAGTCA---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--TC-CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AAA--C---G------C---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--AA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA---------CCC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---T-CA-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----ATTA--AAC-G---T---A-GAAG-AAA--C-GT-AG--A--A----A-A----C-GTAGAGAA-A--
gi|95168                      :      AAAGCCC----AG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-C---------G---G-C--AT---C---C-T---G-TT--T--------A--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAA-CG-----T-A-A----C---AGC-AC-------C--G-CTA----AT------A--------C-GT---G--G----------AAA--C---G------T---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-CA------T-ATA------C------GT-C---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------TCC-G---T-TGAT--A--------TTG-G---T-CT-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----ATG---AAC-G---T---A-AATT-AAA--C-GT-AGA-A--A----A-A----C-GTACAGAA-A--
gi|95171                      :      AAAGTCA---CAG-T---C--C--A----C-T-GC-T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-C-----------A-CG-TT-TTG----AAAACG-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--GAAACC---G------T---ATC----G--A---------T---GC-CGTA-A--A--T--GG-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA---------CCC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---T-CA-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TTG----GC-AAA-A-A----GTGA--AAC-G---T---A-GA---AAA--C-GT-ACA-C--G----ATA----C-GT--AGAA-ATGCGTA
gi|95172                      :      AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---------C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-AAG----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AA---C---G------T---ATC----G--AA--------T---G--CGTA-A--AAAT--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G--------C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-A--CT--TT----AT--C------GATT-------TCC-G---T-TTAT--A--------TT--G---T-CT-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----ATGA--AAataataaacgta
gi|95169                      :      AAAGTCA---CAG-T---C--C--A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G-----C--AT---A---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC------T-A-G----C---AGC-AC-------C--C-CTA---TAT------A--------C-TTG--A--G----G--A--AAA--C---G------C---ATC----G--A---------T---G--CATA-A--A--T--GA-A------CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--T------GA-C--------CC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---T-CA-GC--A---G----AAT-A-C----A-A-----ACT------TGG----GC-AAA-A-A----ATGG--AAC-G---T---A-GATG-AAA-----T-AGA-A--A----A-A----C-GTACA
gi|95174                      :      AAAGCCC---CAG-T---C--AA-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-T---G---G---C-C--AT---C---A-A---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----GAAACG-----T-A-G----C---ACA-AC-------C--G-TTA---TAT------A--------C-GT---A--G----T--A--AAC--C---G------T---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------C-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-ATT-----C--A-A--T-T--GT--TC----AT--C------AA-T-------ACC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---T-CT-GC--T---C----AAT-A-T----A-T-----AC
gi|95185                      :      AAAGCCC---CA----------C-A----C-TTG--T--CA-C------TT-T-C---G---G---T-C--AT---CA--C-C---T-TT--T-------TA--G-G-----------A-CG-TT-TTA----GAAACGATTTAC-A-G----C---AGC-AC-------C--CTCTA----AT------A--------C-GT---AA-G----G--AGGAAA--C---G------C---ATC----GCGA---------T---G--CGCGTA--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------TGATA------C------GT-G-----------------------A-CGT---A-CAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----ATA-C------GA-C-------CCC-----T-ATAT--A--------TTG-G---TGC---C--A---C----AAT-A-CACAAA-A-----ACG------TGGGT--GC-AAA-A-AAAACATGA--AAC-G---TAGAA-AATG-AAA--C-GT-AGA-A--A----A-AAAAGC-GTACACAA-A--
gi|95175                      : aaatcAAAGTCCAAACAG-T---C--CCCAT---C-T-G--T--CA-CG-----TT-TTC---GT--G---G-C--ATA--CAGGC-C---G-CTGTT-------TA--C-TGTTTTGCCATCA-CG-TT-TTA----AAAA-G-----T-A-G----C---AGC-ATGGT----C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---AGTG----G--AACAAA--C---GGTC---T---ATCT---A--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GAGA--A---CGGTC-TA------T-ATT------A------GTGG---G----C-TAT---------TATCGG---A-G-T-----C----A--T-C--CT--TCAA--AT--A------GA-T-------TCC-G-----TTA--------------------------------------AAT-A-C----A-A-----ACA------TGGT---GC-AAATA-A----ATG---AAC-G---T---A-GAGT-GAAGGC-GT-AGA-A--A----A-A----C-GTACAGAAGA--CGTAac
gi|95170                      :      AAAGCCCGA-CAGGTACAC--TA-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-T---T---G---G-CTCATT--C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------AACGGTTGTTA----AAAACG-----T-G-GAGCGC---AAC-AC-------G--C-CTAA--TAT------A--------CCGT---A--G----G--A--AAAA-C---G------C---ATC-------A---------T---G--CGTA-A--A--T---A-A--A---CGG-CGTA------A-CTA------T------GT-A---GACAAC-TA----------T--CGTTCAATAAT-----C--A-AC-T-C--CA--TC----AT--G------GA-T-------CCC-GATTT-TTAC--A--------TTG-G---T-CT-GCTTA--------AAT-A-T----ATA-----ACG------T-G----GC-AAA-A-T----ATTACCAACAG---T---A-GAAA-GAA--C-GT-AGAGA--A----A-A----CTGTAC
gi|95177                      :      AAAGCCC---CAG-T---C-----A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--AT---C---C-CCCCG-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-G----C---A
gi|95173                      :      AAGGCCC---TAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---A---G-C--AC---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-
gi|95176                      :      AAAGTCCA--CAG-T---CT-CC-A----C-A-GGTT--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--AT---C---A-A---A-TT--T-------TA--CGTG----------A-CG-TTCTTT----AAAACG-----A-T-G----C---A-C-ATTCTTCTAC--G-CTA---T-T------AATTAATTTC-GT---A--A----G--A--AA---C---G------CTA-ATC----G--AGATAATCGCT---G--C-TA-ATGA--T--GA-A--AAC-CGG-C-T-------T-ATGAATTAGC------GT-G---A----C-TA----------TA-T-T---A-GAT-----CTAA-AGCT-CAATT--TC----AT--A------GA-C-------CCCAG---T-ATTT--A--------TTG-G---T-AA-AC--A---C----AAT-AAC----AGA-----ACGGT----TGG----GG-AAA-ATA----ATGA--AAC-GGTAC---A-GATG-AAA--CGGT-AGG-A--A----A-
gi|95165                      :      AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--GT---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAACG-----taagagcgta
gi|95178                      :      AAAGCCC---TAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--AT---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAACG-----
gi|95162                      :      AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--GT---G---T-A---G-GT--T-------CA--C-------------A-CG-TT-TTG----AAAACG-----C-A-
gi|95179                      :      AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--GT---C---TAG---G-TT--T-------CA--T-T-----------A-CG-TT-T
gi|95180                      :      AAAGCCC----AG-T---C--CC-A----C-T-A--T--CA-CT-----TT-T-C-------G---G-C--GT---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG-TT-TGA----AAA
gi|95182                      :       AAGCCC---CAG-T---C--AC-G----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-A-----------A-CA-TT-TTA----AAAACG-----T-G-G----C---ACG-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AAA--C---G------C---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-TGT---A-CAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------CCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---T-CT-GC--T---C----AAT-A-T----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----ATCA--AAC-G---T---A-GATG-AAA--T-AT-AGA-A--A----A-A----C-GTACAAAA-A--CGTA
gi|95183                      :       AAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---GC--G-C--AT---T---C-C---G--T--T-------TA--C-T-----------A-CGTTT-TTA----AAAACG-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---T-T------A--------C-TT---A--G----G--A--AAA--C---G------T---ATC----G--A---------T---G--CGT--A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA--------ATA------T------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----CA-A-A--T-T--CT--TC----AT--CG-----GA-T-------TCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---T-CT-GC--A---C-----AT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GCAAAA-A-A----AGGA--AAC-G---T---A-AATG-AAA--C-GT-AG--A--A----A-A----C-ATACAGTA-A--CGTA
gi|95184                      :       AAGCTC---CAG-T---C--GC-AACAAC-T-G--T--TG-CGGAGTGTG-T-C---G---G---G-C--ATAGTCA--C-C---GATT--T-------TATCC-T-----------A-CG-TT-TTATTATAAAACG-----TTATG----CG--AGCTAC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----GAAA--AAA--C---G------T---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--AATT--AG-A--ATGTCGG-G-CA------T-ATA------TAAACAAGT-GA--G----CAAA----------TA-CGT------AT-----A--A-A--T-C--CT--CC----GT--TTATTCGGA-T-------TCC-G---TATTATCCAT-------TTGCG---T-CT-GC--AACCT----AAT-A-C----A-ACG---ATG------TGGTGGTGC-AAA-A-AT---ATGA--
gi|95188                      :       AAGCCC---CAG-T---C--AC-A----C-T-G--C--CA-CG-----TT-T-C---G---G---C-C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-T
gi|95186                      :       AAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-C-T---C---G---G-C--GT---T---C-TTAGG-TT--T-------CA--C-T-----------A-CGTTT-TTG----AAAACG-----
gi|95187                      :       AAGCCC---CAG-T---C--AC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--GT---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAACG-----
gi|95181                      :       AAGCCC---CAG-G---T--CC-A----C-T-G--TA-CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--GT---C---T-A---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG-TT-TGA----AAAGC
gi|95189                      :       AAGCCC---CAC-T---C--AC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--GT---C---TAA---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAACG-----
gi|95191                      :        AGCCC---CAG-T---C--AC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---GCGTG-T--A----------A---G-TT--T-------AA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAACG-----
gi|95190                      :        AGCCC---CAG-T---C--C--A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--GT---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-------------A-CG--T-TTG----AAAACG-----
gi|95192                      :           CC---AAG-T---CACCC-A----C-T-G--TGTCATCG-----TTAT-C---GCGAG---A-C--AT---T---C-A---G-TT--TCCAATTGTA--G-TGA---------A-CG-GT-TTT----GAAACG-----T-A-G----C---AGC-ACGCCT---C--A-CTAGCCTAA------C--------C-GCTAGA--G----G--A--ACA--CCCAG------CTTCATCTCGGG--A---------T---G--CGAA-A--A--TAAGA-AC-A---CGT-T-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CG----A-GAT-----C--A-A--T-C--CTCTTC----ATGCT------GA-TAAGTCGCTCC-G---T-TTAT--ACC------TTG-GGTAT-CT-GC--T---CCCTCAATTA-G----A-ATAGCCACG------TAA----GC-AAA---A----ATAA--ACC-ATT-T---A-A----AAA--C-GTGAGA-G--ATGTCA-A----C-G-ATAGAG-A--CGTA
gi|95194                      :            g---CAG-T---C--AC-A----G-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--AT---C---A-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-
gi|95195                      :                   -T---C--AC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---T---G---C-C--AT---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AAA--C---G------T---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATG------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--G-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------CCC-G---T-CTAT--A--------TTG-G---T-CT-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----ATCA--AAC-A---T---A-GAAG-AAA--C-GT-ACA-C--G----ATA----C-GTACAAAT-G--CGTA
gi|95193                      :                     ---C--CC-A----CGT-G--T--CA-CG-----TT-T-CTGTG---G---GTC--AT---T---CTC---G-TTG-T-------TA--C-T-----------AGCG-TT-CTA----AATACAGA---T-A-A----CCTAAACTAC-------CTAG-TTA---TACGCTATGA--------C-GT---G--GCGGGG--A--AAA--C---GCTCTTAT---ATC----G--A---------TTGTG--CGTA-A--A--T--GA-ATTA---CGG-C-TAGTTATTT-ATA------T------CT-GTATG----A-TACCAAATTATTTA-CGT---A-CATTTTTCT--A-A--TGC--CT--TCCAAGAT--C------TA-C-------CCC-GT--T-TTAT--AGCTTATTTTTG-GT--T-CA-GC--A---C----AAT---T----A-A-----ATGACGTTATGG----GC-AAA-A-A----ATGA--A
gi|95196                      :                                                                      cacatgttc---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAACG-----T-A-G----C---ATT-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--T--AAA--C---G------C---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-gtaccggagccaagaaa
gi|95197                      :                                                                                                                                     TA----AAAACA-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-TTA---TAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AAA--C---G------C---ATC----G--A---------T---G--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TT------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-CAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AA--C------GA-C-------CCC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---T-CA-GC--A---C----AAT-A-A----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----ATGA--AAC-G---T---A-GAAG-AAA--C-GT-AGA-A--A----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
gi|95198                      :                                                                                                                                                                                       A---CAT------A--------C-GT---A--G----G--A--AAAA-C---A------C---ATC----G------------T------CGTA-A--A--T--GA-A--AA--CGG-C-TA--------ATA------C------GTTG---A----C-TA----------TA-CGT---ACGAT-----C--ATA--T-C--CT--CT----AT--CT-----GA-C-------CCCCG---T-ATAT--A--------TTG-G---T-CGAGC--A---C----A-T-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----A-----------------A-GATC--AA--C-GT-AGA-AAGA----A-A----C-GTACAAAA-A--CGT
gi|95199                      :                                                                                                                                                                                                                                                   ---ATC----G--AAA-------T---GATCGCA-T--A--T--GA-A--AA--CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--G-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------CCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---T-CT-GC--A---C----AAT-----------------------------------------------TGA----------T---ATAATCAAAA--C-GT-AGA-A--A----A-A----T-GTACAGAA-A--CGTAcacaatacgta
gi|95200                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TC----AT--G------GA-T-------CCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---T-CT-GC--T---T----AAT-A-T----A-T-----ACG------Tca

lowQualScore                  :                                                            1111111                111111111                                                                               1111111                                                         1111111111           111111111                                                                                                                                             111111111                 11111111                                                                                                                                               
lowQualScore                  :            555   1 222 22  1 3333 1 1 22 33  1  22222  1 1 2222222 333 1 11 1 444 444444444 1  22 3333333  11 1 77777777777 2  33 2   2222     11 33333 1 3 3333 444   3  3333333 22 1   444   666666 66666666 1  8888 44  22 44   55 333 0000000000   5555 22 333333333  44    1 22 44 22  1 44 888   1 1  444444 1   555555 555555  3 99999999 1  9999999999  1   333 3   44444 44 1 44 1 22  22  5555  888888888  000000000   3 444 33   22 11111111   1 444  33  22 222 3333   1 1 3333 3 66666   777777   8888  1   1 1 5555  1  55   2 333   555 99   2  2  2   2  4444 4 4444 2        5 33    
lowQualScore                  :            ...   . ... ..  . .... . . .. ..  .  .....  . . ....... ... . .. . ... ......... .  .. .......  .. . ........... .  .. .   ....     .. ..... . . .... ...   .  ....... .. .   ...   ...... ........ .  .... ..  .. ..   .. ... ..........   .... .. .........  ..    . .. .. ..  . .. ...   . .  ...... .   ...... ......  . ........ .  ..........  .   ... .   ..... .. . .. . ..  ..  ....  .........  .........   . ... ..   .. ........   . ...  ..  .. ... ....   . . .... . .....   ......   ....  .   . . ....  .  ..   . ...   ... ..   .  .  .   .  .... . .... .        . ..    
lowQualScore                  :            000   2 000 77  1 6666 1 1 77 99  1  99999  1 1 3333333 111 1 66 1 222 444444444 1  66 6666666  55 1 99999999999 2  44 4   5555     77 11111 6 2 7777 888   6  0000000 55 8   888   777777 33333333 7  5555 11  44 88   99 000 7777777777   2222 33 555555555  00    7 33 66 33  7 00 555   7 7  888888 7   000000 000000  5 11111111 7  3333333333  7   000 5   33333 11 7 11 7 44  33  8888  222222222  000000000   3 666 00   33 77777777   7 666  22  33 999 5555   7 7 5555 3 55555   444444   2222  8   8 8 7777  8  00   1 777   888 11   1  1  1   1  5555 2 7777 2        7 99    
consensus                     :     AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---C------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------CCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---TCN-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-GA--AAC-G---TAG---A-TGAA-AC-GT-AGA-AA----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
Reference ( family-485 )      :     AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---C------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------CCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---TCN-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-GA--AAC-G---TAG---A-TGAA-AC-GT-AGA-AA----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
gi|95161                      :     AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CA-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---T------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------TCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---TCT-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-GA--AAC-G---TAA---A-TCAA-AC-GT-AGA-AA----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
gi|95162                      :     AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--G-T---G---T-A---G-GT--T-------CA--C-------------A-CG-TT-TTG----AAAAC--G-----C-A-
gi|95163                      :     AAAGTCA---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--T-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---C------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-C--A---CGG-C-TA------T-ACA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-C-------CCC-G---T-ATAT--A--------TGG-G---TCA-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-GA--AAC-G---TAG---A-TAAA-AC-GT-AGA-AA----A-A----C-GCACA
gi|95164                      :     AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-A--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-AG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TATT-----A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---T------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA---------CCC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---TCA-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----G--ACA-A-C----AT-GA--AAC-G---TAG---A-AGAA-AC-GT-AGA-AA----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
gi|95165                      :     AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--G-T---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAAC--G-----
gi|95166                      :     AAAGTCA---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--TC-CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---C------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--AA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA---------CCC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---TCA-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-TA--AAC-G---TAG---A-AGAA-AC-GT-AG--AA----A-A----C-GTAGAGAA-A--
gi|95167                      :     AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G-----C--A-T---C---C-----G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G--------AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---T------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---C-G-C-TA------T-ACA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-G--CT--TC----AT--C------GA-T-------TCC-G---T-TGAT--AT-------TTG-G---TCT-GC--A---C----AAT-A-C------A-----ACG------T-G----GC-AAA-A-A----AT-AA--AAC-G---TAA---A-TT-A-AC-GT-AGA-AA----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
gi|95168                      :     AAAGCCC----AG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-C---------G---G-C--A-T---C---C-T---G-TT--T--------A--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAA-C--G-----T-A-A----C---AGC-AC-------C--G-CTA----AT------A--------C-GT----G--G------AAA--C---G---T------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-CA------T-ATA------C------GT-C---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------TCC-G---T-TGAT--A--------TTG-G---TCT-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-G---AAC-G---TAA---A-TTAA-AC-GT-AGA-AA----A-A----C-GTACAGAA-A--
gi|95169                      :     AAAGTCA---CAG-T---C--C--A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G-----C--A-T---A---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--------T-A-G----C---AGC-AC-------C--C-CTA---TAT------A--------C-TTG---A--GG--A--AAA--C---G---C------ATC----G--A---------TG--CATA-A--A--T--GA-A------CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--T------GA---------CCC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---TCA-GC--A---G----AAT-A-C----A-A-----ACT------TGG----GC-AAA-A-A----AT-GG--AAC-G---TAG---A-TGAA-A---T-AGA-AA----A-A----C-GTACA
gi|95170                      :     AAAGCCCGA-CAGGTACAC--TA-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-T---T---G---G-CTCA-TT--C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------AACGGTTGTTA----AAAAC--G-----T-G-GAGCGC---AAC-AC-------G--C-CTAA--TAT------A--------CCGT----A--GG--A--AAAA-C---G---C------ATC-------A---------TG--CGTA-A--A--T---A-A--A---CGG-CGTA------A-CTA------T------GT-A---GACAAC-TA----------T--CGTTCAATAAT-----C--A-AC-T-C--CA--TC----AT--G------GA-T-------CCC-GATTT-TTAC--A--------TTG-G---TCT-GCTTA--------AAT-A-T----ATA-----ACG------T-G----GC-AAA-A-T----AT-TACCAACAG---TAG---A-AAGA-AC-GT-AGAGAA----A-A----CTGTAC
gi|95171                      :     AAAGTCA---CAG-T---C--C--A----C-T-GC-T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-C-----------A-CG-TT-TTG----AAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--GAAACC---G---T------ATC----G--A---------TGC-CGTA-A--A--T--GG-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA---------CCC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---TCA-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TTG----GC-AAA-A-A----GT-GA--AAC-G---TAG---A---AA-AC-GT-ACA-CG----ATA----C-GT--AGAA-ATGCGTA
gi|95172                      :     AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---------C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-AAG----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AA---C---G---T------ATC----G--AA--------TG--CGTA-A--AAAT--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G--------C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--T-A--CT--TT----AT--C------GATT-------TCC-G---T-TTAT--A--------TT--G---TCT-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-GA--AAataataaacgta
gi|95173                      :     AAGGCCC---TAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---A---G-C--A-C---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-
gi|95174                      :     AAAGCCC---CAG-T---C--AA-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-T---G---G---C-C--A-T---C---A-A---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----GAAAC--G-----T-A-G----C---ACA-AC-------C--G-TTA---TAT------A--------C-GT----A--GT--A--AAC--C---G---T------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------C-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-ATT-----C--A-A--T-T--GT--TC----AT--C------AA-T-------ACC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---TCT-GC--T---C----AAT-A-T----A-T-----AC
gi|95175                      :     AAAGTCCAAACAG-T---C--CCCAT---C-T-G--T--CA-CG-----TT-TTC---GT--G---G-C--A-TA--CAGGC-C---G-CTGTT-------TA--C-TGTTTTGCCATCA-CG-TT-TTA----AAAA---G-----T-A-G----C---AGC-ATGGT----C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----AGTGG--AACAAA--C---GGTCT------ATCT---A--A---------TG--CGTA-A--A--T--GAGA--A---CGGTC-TA------T-ATT------A------GTGG---G----C-TAT---------TATCGG---A-G-T-----C----A--T-C--CT--TCAA--AT--A------GA-T-------TCC-G-----TTA-------------------------------------AAT-A-C----A-A-----ACA------TGGT---GC-AAATA-A----AT-G---AAC-G---TAG---AGTGAAGGC-GT-AGA-AA----A-A----C-GTACAGAAGA--CGTA
gi|95176                      :     AAAGTCCA--CAG-T---CT-CC-A----C-A-GGTT--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---A-A---A-TT--T-------TA--CGTG----------A-CG-TTCTTT----AAAAC--G-----A-T-G----C---A-C-ATTCTTCTAC--G-CTA---T-T------AATTAATTTC-GT----A--AG--A--AA---C---G---CTA----ATC----G--AGATAATCGCTG--C-TA-ATGA--T--GA-A--AAC-CGG-C-T-------T-ATGAATTAGC------GT-G---A----C-TA----------TA-T-T---A-GAT-----CTAA-AGCT-CAATT--TC----AT--A------GA-C-------CCCAG---T-ATTT--A--------TTG-G---TAA-AC--A---C----AAT-AAC----AGA-----ACGGT----TGG----GG-AAA-ATA----AT-GA--AAC-GGTACAG---A-TGAA-ACGGT-AGG-AA----A-
gi|95177                      :     AAAGCCC---CAG-T---C-----A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---C-CCCCG-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---Ataagagcgta
gi|95178                      :     AAAGCCC---TAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--A-T---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAAC--G-----
gi|95179                      :     AAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--G-T---C---TAG---G-TT--T-------CA--T-T-----------A-CG-TT-T
gi|95180                      :     AAAGCCC----AG-T---C--CC-A----C-T-A--T--CA-CT-----TT-T-C-------G---G-C--G-T---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG-TT-TGA----AAA
gi|95181                      :      AAGCCC---CAG-G---T--CC-A----C-T-G--TA-CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--G-T---C---T-A---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG-TT-TGA----AAAGC--
gi|95182                      :      AAGCCC---CAG-T---C--AC-G----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-A-----------A-CA-TT-TTA----AAAAC--G-----T-G-G----C---ACG-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---C------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-TGT---A-CAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------CCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---TCT-GC--T---C----AAT-A-T----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-CA--AAC-G---TAG---A-TGAA-AT-AT-AGA-AA----A-A----C-GTACAAAA-A--CGTA
gi|95183                      :      AAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---GC--G-C--A-T---T---C-C---G--T--T-------TA--C-T-----------A-CGTTT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---T-T------A--------C-TT----A--GG--A--AAA--C---G---T------ATC----G--A---------TG--CGT--A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA--------ATA------T------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----CA-A-A--T-T--CT--TC----AT--CG-----GA-T-------TCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---TCT-GC--A---C-----AT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GCAAAA-A-A----AG-GA--AAC-G---TAA---A-TGAA-AC-GT-AG--AA----A-A----C-ATACAGTA-A--CGTA
gi|95184                      :      AAGCTC---CAG-T---C--GC-AACAAC-T-G--T--TG-CGGAGTGTG-T-C---G---G---G-C--A-TAGTCA--C-C---GATT--T-------TATCC-T-----------A-CG-TT-TTATTATAAAAC--G-----TTATG----CG--AGCTAC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GGAAA--AAA--C---G---T------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--AATT--AG-A--ATGTCGG-G-CA------T-ATA------TAAACAAGT-GA--G----CAAA----------TA-CGT------AT-----A--A-A--T-C--CT--CC----GT--TTATTCGGA-T-------TCC-G---TATTATCCAT-------TTGCG---TCT-GC--AACCT----AAT-A-C----A-ACG---ATG------TGGTGGTGC-AAA-A-AT---AT-GA--
gi|95185                      :     AAAGCCC---CA----------C-A----C-TTG--T--CA-C------TT-T-C---G---G---T-C--A-T---CA--C-C---T-TT--T-------TA--G-G-----------A-CG-TT-TTA----GAAAC--GATTTAC-A-G----C---AGC-AC-------C--CTCTA----AT------A--------C-GT----AA-GG--AGGAAA--C---G---C------ATC----GCGA---------TG--CGCGTA--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------TGATA------C------GT-G-----------------------A-CGT---A-CAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----ATA-C------GA-C-------CCC-----T-ATAT--A--------TTG-G---T-G-CC--A---C----AAT-A-CACAAA-A-----ACG------TGGGT--GC-AAA-A-AAAACAT-GA--AAC-G---TAGAAAA-TGAA-AC-GT-AGA-AA----A-AAAAGC-GTACACAA-A--
gi|95186                      : aaatcAAGCCC---CAG-T---C--CC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-C-T---C---G---G-C--G-T---T---C-TTAGG-TT--T-------CA--C-T-----------A-CGTTT-TTG----AAAAC--G-----ac
gi|95187                      :      AAGCCC---CAG-T---C--AC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--G-T---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAAC--G-----
gi|95188                      :      AAGCCC---CAG-T---C--AC-A----C-T-G--C--CA-CG-----TT-T-C---G---G---C-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-T
gi|95189                      :      AAGCCC---CAC-T---C--AC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--G-T---C---TAA---G-TT--T-------CA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAAC--G-----
gi|95190                      :       AGCCC---CAG-T---C--C--A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C-------G---G-C--G-T---C---TAG---G-TT--T-------CA--C-------------A-CG--T-TTG----AAAAC--G-----
gi|95191                      :       AGCCC---CAG-T---C--AC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---GCGTG-T--A-----------A---G-TT--T-------AA--C-T-----------A-CG--T-TTG----AAAAC--G-----
gi|95192                      :          CC---AAG-T---CACCC-A----C-T-G--TGTCATCG-----TTAT-C---GCGAG---A-C--A-T---T---C-A---G-TT--TCCAATTGTA--G-TGA---------A-CG-GT-TTT----GAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-ACGCCT---C--A-CTAGCCTAA------C--------C-GCTAG-A--GG--A--ACA--CCCAG---CTTC---ATCTCGGG--A---------TG--CGAA-A--A--TAAGA-AC-A---CGT-T-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CG----A-GAT-----C--A-A--T-C--CTCTTC----ATGCT------GA-TAAGTCGCTCC-G---T-TTAT--ACC------TTG-GGTATCT-GC--T---CCCTCAATTA-G----A-ATAGCCACG------TAA----GC-AAA---A----AT-AA--ACC-A---TTT---A--AAA-AC-GTGAGA-GATGTCA-A----C-G-ATAGAG-A--CGTA
gi|95193                      :                   g---C--CC-A----CGT-G--T--CA-CG-----TT-T-CTGTG---G---GTC--ATT---C---T-C---G-TTG-T-------TA--C-T-----------AGCG-TT-CTA----AATACAGA-----T-A-A----CCTAAACTAC-------CTAG-TTA---TACGCTATGA--------C-GTGGCGG--GG--A--AAA--C---G---CTCTTATATC----G--ATTG------TG--CGTA-A--A--T--GA-ATTA---CGG-C-TAGTTATTT-ATA------T------CT-GTATG----A-TACCAAATTATTTA-CGT---A-CATTTTTCT--A-A--TGC--CT--TCCAAGAT--C------TA-C-------CCC-GT--T-TTAT--AGCTTATTTTTG-GT--TCA-GC--A---C----AAT---T----A-A-----ATGACGTTATGG----GC-AAA-A-A----AT-GA--A
gi|95194                      :   cacatgttc---CAG-T---C--AC-A----G-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---G---G---G-C--A-T---C---A-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-gtaccggagccaagaaa
gi|95195                      :                  -T---C--AC-A----C-T-G--T--CA-CG-----TT-T-C---T---G---C-C--A-T---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---T------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-ATG------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--A-A--G-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------CCC-G---T-CTAT--A--------TTG-G---TCT-GC--A---C----AAT-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-CA--AAC-A---TAG---A-AGAA-AC-GT-ACA-CG----ATA----C-GTACAAAT-G--CGTA
gi|95196                      :                                                                               ---C---C-C---G-TT--T-------TA--C-T-----------A-CG-TT-TTA----AAAAC--G-----T-A-G----C---ATT-AC-------C--G-CTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--T--AAA--C---G---C------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TA------T-
gi|95197                      :                                                                                                                                     TA----AAAAC--A-----T-A-G----C---AGC-AC-------C--G-TTA---TAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAA--C---G---C------ATC----G--A---------TG--CGTA-A--A--T--GA-A--A---CGG-C-TT------T-ATA------C------GT-G---A----C-TA----------TA-CGT---A-CAT-----C--A-A--T-C--CT--TC----AA--C------GA-C-------CCC-G---T-ATAT--A--------TTG-G---TCA-GC--A---C----AAT-A-A----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AT-GA--AAC-G---TAG---A-AGAA-AC-GT-AGA-AA----A-A----C-GTACAGAA-A--CGTA
gi|95198                      :                                                                                                                                                                                         A---CAT------A--------C-GT----A--GG--A--AAAA-C---A---C------ATC----G------------T---CGTA-A--A--T--GA-A--AA--CGG-C-TA--------ATA------C------GTTG---A----C-TA----------TA-CGT---ACGAT-----C--ATA--T-C--CT--CT----AT--CT-----GA-C-------CCCCG---T-ATAT--A--------TTG-G---TCGAGC--A---C----A-T-A-C----A-A-----ACG------TGG----GC-AAA-A-A----AA-GATCAAC-G---TAGA--A-AGAA-AC-GT-ACA-AA----A-A----C-GT-CACAATA--CGTA
gi|95199                      :                                                                                                                                                                                                                                               ------ATC----G--AAA-------TGATCGCA-T--A--T--GA-A--AA--CGG-C-TA------T-ATA------C------GT-G---G----C-TA----------TA-CGT---A-GAT-----C--G-A--T-C--CT--TC----AT--C------GA-T-------CCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---TCT-GC--A---C----AAT-------------------------TG--------ATA-T-A----ATCAA--AAC-G---TAG---A--AAA-AT-GT-ACA-GA----A-A----C-GTACA
gi|95200                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --TC----AT--G------GA-T-------CCC-G---T-TTAT--A--------TTG-G---TCT-GC--T---T----AAT-A-T----A-T-----ACG------T