lowQualScore                  :                                                                                                                                                                              2222222222222222222222222222222                                                                                 11111111111111111111                                                                                                           
lowQualScore                  :      1   3333 1 1 222  1 2 3333 1 3333 5555555   1 11 1 77777777777 1 22 3 11  33 1     22 111  555 1 3 1  2 6666666666 444444 2 55555555 3 1  666666 33 33333333  555 3 111 1111111111111111111111111111111 11  11 1 1 1 1   777   33 1   555555 1 44  111 3  2 1 333 33 2 5555  22  333  2 66666666666666666666   2 1  2 44444  33 6666666666 44  2  7777 11 66  333 333 11 22 1 7 2 1   3333  1 44444   11 1  2 11 2     
lowQualScore                  :      .   .... . . ...  . . .... . .... .......   . .. . ........... . .. . ..  .. .     .. ...  ... . . .  . .......... ...... . ........ . .  ...... .. ........  ... . ... ............................... ..  .. . . . .   ...   .. .   ...... . ..  ... .  . . ... .. . ....  ..  ...  . ....................   . .  . .....  .. .......... ..  .  .... .. ..  ... ... .. .. . . . .   ....  . .....   .. .  . .. .     
lowQualScore                  :      2   7777 2 1 000  1 3 6666 1 6666 3333333   1 55 1 55555555555 1 66 2 55  00 1     99 888  888 1 2 1  1 7777777777 333333 1 33333333 2 1  777777 66 88888888  444 1 888 9999999999999999999999999999999 44  44 0 0 0 0   222   66 1   111111 1 66  888 2  1 1 333 66 1 5555  55  666  1 77777777777777777777   1 0  1 44444  99 8888888888 11  2  4444 55 66  000 000 55 66 1 6 2 1   0000  1 00000   66 2  4 77 6     
consensus                     : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TC-----G-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC--G-G--C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
Reference ( gi|32083 )        : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TC-----A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC--A-G--C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32084                      : TAATA-GTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TA-----A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----TTAATA-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC--G-A--C--TG---C---A--C--C-ACT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T--TAA
gi|32086                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------TTT-T--G-A-----------T-A--AAT--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TA-----A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---C---------A-----ACAA-T----A-----C--CG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-AAA------A-C--AA---A-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC--G-G--C--TG---G---A--C--T-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ACAAA
gi|32087                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--AAT--TA--T-CACCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TA-----A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-AAAAC---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---AACGTTCA--AG-GC--G-A--C--TG---C---A--G--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATA
gi|32089                      : TAAAA-T-A----C-A-TATATT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TC-----A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----C---G--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAAC-----A-C--AA---G-TT-T-A---C--CGG----TT--TG---TG-A--------------------C-T-C-AT-A-----GC--T---G------A--AG-AC--G-A--C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-
gi|32093                      : TAAAG-TTC----C-A----------C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A---------------CCA--A---AA---C-T-C-TG-C----------TC-----A-T--------G-A-CA------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC--G-G--C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32085                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--CA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TG-----G-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--AG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-T--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---T------A--AT-GC--G-G--C--TT---C---A--C--C-A-T-T-TAA----TT-C-----AGA--C-CA-A--T-ATAAA
gi|32095                      : TAAAA-GTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CA-C----------TC-----A-T--------G-A-CT------T--A--------AT---A-A---C-----------------------------------------------TG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC--G-A--C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32088                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-AA----------T-A--A-T--TA--T-TAC-A--A---AA---C---C-CG-C----------TC-----T-T--------GCA-C-------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT---A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC--G-A--C--TG---C---A--C--C-A-T-T-T----T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32092                      : TAAAA-T-A----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-------------T-A--A-T--TA--T-TAC----A---AA---C---C-CG-C----------TC-----A-T--------G-AGTA------T--A--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T---G-C-GTG---ATT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC--G-A--C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32090                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TC-A-C----T-T----A-------CTG-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-CATCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------CC-----G-T--------G-A-TG------T--A--------AA---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--C-T-G-C-GTG---TGT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC--G-G--C--TC---G---A--C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32094                      : TAAAA-TTT----C-A-T---TT-A-A----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-G--A-T--TA--T-AATCA--A---AA---C-T-T-CG-C----------TC-----G-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----T--GG--T-T-G-C-ATG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TTAT-A---C--A-G----TT--TG---TG-A--------------------CGA-C-AT-A-----GT--T---G------A--AA-GC--G-G--T--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-
gi|32096                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TAACA--A---AA---T-T-C----------------------G-T--------G-A-TG------C--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----G-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---T--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC--G-G--C--TG---C---A--C-----------GA--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--A-ATAAA
gi|32098                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----AGTTACTACTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------GG-----G-T--------G-G-CG------T--A--------AT---A--------------------------T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-T--AA---G-TT-T-A---C--C-G-----T--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC--G-G--T--TG---C---A-----C-A-T-T-TTG--A-TT-T-----AGG--C-TG-A--A-GTAAA
gi|32097                      : TAAAACTTA----C-G-T---TT-A-C----T-TT---A-------CTT-T--A-AA----------T-A--A-T--CA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TG-----G-T--------GGA-CGGTAATAC--A--------AT---A-G---T---------A-----A----T----A-----C--GA--T-T-G-C-GTGGT-TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-ACG------------------CGT-C-AT-A-----GT--C---C------A--AG-GC--G-G--C--TGGGAC------C--C-A-T-T-TGA----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32099                      : TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----A-------CGT-T--A-A-----------T-G--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-TG-C----------TG-----G-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-T-GTG---TTT--G-TGA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---
gi|32102                      : TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----C-------TTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C----------TA-----A-T--------G-A-CG------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTGTTTTTT--G-TAA------A-CT-AA---GTTT-T-A---C--C-GGTTTTT--TGGTTTG-GGGAAC---------------CGTCC-AT-A-----GTAAC---G------AATAG-GC--A-G--CTTTG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TATA--T-ATAAA
gi|32101                      : TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----C-------TTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C----------TA-----A-T--------G-A-CG------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTGTTTTTT--G-TAA------A-CT-AA---GTTT-T-A---C--C-GGTTTTT--TGGTTTG-GGGAAC---------------CGTCC-AT-A-----GTAAC---G------AATAG-GC--A-G--CTTTG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TATA--T-ATAAA
gi|32103                      : TAAAA-TT-----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTG-T--A-A-----------T-AG-A-T--TA--C--ATCA--A---AA---C-----CG-C-----------C-----G-T--------G-A-CG------TC-A--------GT---A-A---C---------A-----A----T----AATTTAC--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--GGTAA------A-A--CA---G-TT-T-A---CT-C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-CCATTA-----GT--T---A------A--AG-GC--G-G--C--T----C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAGA
gi|32091                      : TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----A-------CTT-T--T-A-----------T-A--AAT--TA--T-TACCA--A---AA---C-TAC-CG-C----------TT-----AAT--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---C---------A-----ACAA-T----A-----C--GT--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-CA-AA---G-TT-T-A---C--CTT----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-GTTAACGT--TTTCA------A--GG-GC--G-G-----TG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AG
gi|32107                      : TAATA-TTA----A-A-T---TT-AAC----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-G--A-A--TA--G-TACCA--A---GA---C-T-C-CG-C----------T------A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---ACA---C---------AATAGGA----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTTC-G-TAA------A-C--AA-----TT-T-AAG-C--C-G----TT--TG---TG-ATGGGGGGGGGGTTGGTGGCGCGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AGAAC--A-GATC--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-TA----AGG--C-TA-A--T-TTAAAct
gi|32104                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------TAA--A-T--TA--T-TACC---A---AA---C-T-C-CG-C----------TA-----A-T--------T-A-CG------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C----------------------------------------A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC--G-G--C--TG---T---A--TA-C-A---C-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--
gi|32108                      : TAAGA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T------------CTT-T--GAA-----------T-A--A-T--TA--T-TACC---A---AA---C-T-CGCG-C----------TC-----A----------G-A-CG--------------------------------------------------T----A-----T--GG--TCT-G-C-ATG---TTT--G-T-A------A-C--AA---GCTT-T-A---C--C-A----TT--TG---T--A--------------------C-T-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-G-----G--C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----A-G--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32100                      : TAAAA-GTA----C-AAT---TT-A-C----T-T----A-------C--------A-----------T-A--A-T--CC--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-T----------TC-----A-T--------G-A--G------TAAA--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----T--CA--T-T-G-C-GAG----CG--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G-----T--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC--G-A--C--TG---C---A--C--C-A---T-TG-----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32105                      : TAAAA-TAA----C-A-T---TT-A-A----C-T----A-------CTG-T--G-A-----------T-A--A-T--TAATTATACCA--A---A------C-C-CG-C----------TC-----A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----C--GG--C-T-G-C-GTG---TTT--G-TAAG-----A-C--AC---C-GT-T-A---C--C-G-----T--TG---TGAA--------------------CGT-C-AT-A-----GTC-T---G------AT-AG-AC--GTA--C--TG----------C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32109                      : TAAAA-GTAG---C-A-T---CT-A-CC---T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-AGAA-T--TA--T-TACCA--A---AAACTC-T-C-CG-C----------TC-----A-TTTGGGGGAG-A-CG------T--A--------AT---A-A---CTGAACTTACA-----A----T----A-----C--GG--T-T-GAC-GTG---TTTT-G-TAA------AGC--AA---G-TT-T-AATCCGGC-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-ACGAA-A--CT-TC---C---AACC--C-A-TGT-TGG--T-TT-TATTTAAGG--C-TA-A--T-AT
gi|32110                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-A----ATT-----CTT-T--A-AAATATAAATTTT-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---T-T-C-CG-CT---------TT-----T-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---CAT-------A-----A----A----A-----C--GG--T-T---C-GTA---TTT--G-TAA------A-C---A---G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG----G-A--------------------AGT-C-AT-A-----TT--T---C------A--GA-GC--G-C--C--TG---CATAA--C--C-GTT-T-TGG--T-TT-
gi|32106                      : TAAAA-TTAACAAT-A-T---AT-A-C----T-T----A-------CTA-TAGG-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---TAC-C-CGTC----------TC-----AGTAG------A-A-CGT-----T--A--------AT---A-A---C---------A-----AATT-T----AATAT-C--GGGCT-T-G-C-GTGT--TTT--G-TAA------A----AACGTG-TT-T-A---C--C-G----TTGATG---TG-AACG-----------------CGT-C--T-A-----GT--T---G------A--AGAAC--G-A--CAATG---C---A--C--C-ATT-T-TGG--TATTAT-----AGG--CTTA-ATGT-ATAAAa
gi|32112                      : TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-T--G-A--TA--T-TATC--------G---T-T-C-CA-CATCGGTGGCGTC-----A-T--------G-G-AG------T--A--------AT---G-A---A---------T-----A----T----A-----CGGGG--T-T-G-CGGTGT--TTT--G-TAG------A-TCGAA---G-TTCT-A------C-G----TTG-TG---TG-A--------------------GAT-C-AT-ATGT--GT--T---G------A--AG-GC--AGG--CG-TG---CG--A--C--C-A-TAT-TGGGAT-TT-T-----AAG--
gi|32111                      : TAAAA-TTA----CCA-T---TTTA-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TAGTT-TACCAATA---AA---C-TCC-CGTC----------TC-----A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---ATA---CACACTT---A-----A----TAACCA-----C--GG--T-T-G-C-acaaa
gi|32113                      :  AAAG-TTA------A-T---T--A-C----T-T----A-------CTT-T----A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCACAA---AA---C---C-CG-CC---------TC-----A-T--------GGA-CG------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--G---T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--A----G-TT-T-A---A--C-GG---TT--TG---TGGA--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T----------A--AG-AC--G-A--C--TG---C---A--CACC-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGA--C-TA-A--T-ATAAActctgctcgttctagtaaccacataagtgtttctaaccgtttaccccagtccccgtgcaccttcaccgacgctctcgcggtgacgtcatagttgaagacgactgacaccatttgttttaggctaatcataaa
gi|32114                      :  AAAA-TCA----C-A-T---TT-A-C----TGT----A-------CTG-G--G-G-----------T-A--A-TAATA--T-CATCA--A---AATAAC-T-C-CG-C----------CCC----G-T--------G-A-CGGTAAA-T--A--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TGT--G-TAA--------C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-ATAA-----GT--T---C------A--A--GC--G-G--C--TC---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--A-TA-A--T-GTAA
gi|32116                      :   AAA-TTA----C-A-T---TT-AAC----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T---CG------------TC-----A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---ATA---C---------A-----A----T----A-----C--AG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-T-A------A-C--AA---G-TT-TGA---C--C-G----TT-------TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC--A----C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT--------AG--C-TA-A--T--TAAA
gi|32115                      :   AAC-TTA----C-A-A---TA-A-A----T-A----A-------CTG-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------CT-----G-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AAATA-C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---A-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-AC--G-G--C--TC---C---A--C--C-A-T-T-TGG----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32117                      :      -TTA----C-T-T---TT-A-TGTGTT-T----A-------CTTGT--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACTA--A---A----C-T-C-GG-C----------TC-----G-T--------G-A-CG------TA-A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATAACC--GG--T-T-G-C-GTG---TTTTCC-TAAACACACA-C--AA---G-TT-T-A---C--C-C----GT--TG---TG-A---------------------GT-C-AA-C-----GT--T---G------A--AG-AC--T-G------G---C---A--C--CTA-T-TATGGGTT-TT-T-----AGGCTC-TG-A--TGATAAA
gi|32118                      :                 -T---TT-A-T----T-TGTAAA-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TT-----G-T--------G-A-CG------T--ATGCCCCTAAT---A-A---C---------A-----A----TGAT-A-----C--GG--T-T-G-C-GTA---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG---TG-A--------------------TGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--TG-GC--G-G--C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--C-AAAAA
gi|32119                      :                                                TT-T--A-A-----------T-A----T--TA--T---CTA--ATTCAA---T-T-C-CG-C----------TTTTGTGA-T--------C-A-TG------T--A---------T---A-A---C---------A-----AATAAT----A--------GG--T-T-G-C-GTA---TT---G-TAA------A-C--A----G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----
gi|32120                      :                                                                       --A-T--TA--T-CATCA--A---TT---C-CAC-CG-C----------TC-----A-T--------G---CG------T--A--------AT---A-A-------------------A----T----AAG---C--GG--C-TAG-C-GTG---TTT----TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---CT-C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--GA-AC--G-A--C--TG---C---G--C------T-T-TGG----AT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32121                      :                                                                                  aatACCA--A---AA---C-T-C-CG-C----------TC-----A-T--------G-A-CG------T--A--------AT---A-A---A---------A-----A----TGAT-A-----T--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AC---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GA--T---A------A--AG-GC--G-G--C--GG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-
gi|32122                      :                                                                                                                                                                    ---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-G-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-G---C--C-A----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-CA--A-G--C--TG---C---A--C--C-A---T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32111                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                      G---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC--G-A--C--TGA--C---A--C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--TCATAAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   2222222222222222222222222222222                                                                                 11111111111111111111                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               1   3333 1 1 111  1 2 3333 1 3333 5555555   1 11 1 77777777777 1 22 3 11  22 1     22 111  555 1 3 1  2 3 66666 55555555 3 2 33333333 666666 33 44444444  555 3 111 0000000000000000000000000000000 11  11 1 1 1 1   777   33 1   555555 1 44  111 3  2 1 333 33 2 5555  22  333  2 66666666666666666666   2 1  2 44444  33 6666666666 33  2  1 1 333 55  222 222 11 22 1 7 2 1   22 1  1 33333   11 1  2 11 2     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               .   .... . . ...  . . .... . .... .......   . .. . ........... . .. . ..  .. .     .. ...  ... . . .  . . ..... ........ . . ........ ...... .. ........  ... . ... ............................... ..  .. . . . .   ...   .. .   ...... . ..  ... .  . . ... .. . ....  ..  ...  . ....................   . .  . .....  .. .......... ..  .  . . ... ..  ... ... .. .. . . . .   .. .  . .....   .. .  . .. .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               1   6666 1 1 999  1 2 5555 1 5555 1111111   1 55 1 33333333333 1 55 2 44  99 1     88 888  666 0 1 0  1 1 22222 11111111 1 1 77777777 555555 55 77777777  222 0 888 5555555555555555555555555555555 44  44 0 0 0 0   111   55 0   000000 0 55  888 1  1 0 222 55 1 4444  44  555  0 22222222222222222222   0 0  0 22222  88 4444444444 99  1  1 1 333 44  999 999 44 55 1 4 1 1   99 1  1 99999   66 2  4 77 5     
consensus                     :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
Reference ( family-481 )      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32083                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-A-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32084                      :                                                                                                                                                                          TAATA-GTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----TTAATA-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-ACT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T--TAA
gi|32085                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--CA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--AG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-T--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---T------A--AT-GC-G-G---C--TT---C---A--C--C-A-T-T-TAA----TT-C-----AGA--C-CA-A--T-ATAAA
gi|32086                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------TTT-T--G-A-----------T-A--AAT--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----ACAA-T----A-----C--CG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-AAA------A-C--AA---A-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---G---A--C--T-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ACAAA
gi|32087                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--AAT--TA--T-CACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-AAAAC---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---AACGTTCA--AG-GC-G-A---C--TG---C---A--G--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATA
gi|32088                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-AA----------T-A--A-T--TA--T-TAC-A--A---AA---C---C-CG-C-TC--T-T--------GCA-C---------------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT---A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-T----T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32089                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-T-A----C-A-TATATT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----C---G--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAAC-----A-C--AA---G-TT-T-A---C--CGG----TT--TG---TG-A--------------------C-T-C-AT-A-----GC--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-
gi|32090                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TC-A-C----T-T----A-------CTG-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-CATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-CC--G-T--------G-A-T--------G------T--A--------AA---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--C-T-G-C-GTG---TGT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TC---G---A--C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32091                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----A-------CTT-T--T-A-----------T-A--AAT--TA--T-TACCA--A---AA---C-TAC-CG-C-TT--AAT--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----ACAA-T----A-----C--GT--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-CA-AA---G-TT-T-A---C--CTT----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-GTTAACGT--TTTCA------A--GG-GC-G-G------TG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AG
gi|32092                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-T-A----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-------------T-A--A-T--TA--T-TAC----A---AA---C---C-CG-C-TC--A-T--------G-AGT--------A------T--A--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T---G-C-GTG---ATT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAAct
gi|32093                      :                                                                                                                                                                          TAAAG-TTC----C-A----------C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A---------------CCA--A---AA---C-T-C-TG-C-TC--A-T--------G-A-C--------A------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32094                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTT----C-A-T---TT-A-A----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-G--A-T--TA--T-AATCA--A---AA---C-T-T-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----T--GG--T-T-G-C-ATG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TTAT-A---C--A-G----TT--TG---TG-A--------------------CGA-C-AT-A-----GT--T---G------A--AA-GC-G-G---T--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-
gi|32095                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-GTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CA-C-TC--A-T--------G-A-C--------T------T--A--------AT---A-A---C-----------------------------------------------TG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32096                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TAACA--A---AA---T-T-C----------G-T--------G-A-T--------G------C--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----G-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---T--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C-----------GA--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--A-ATAAA
gi|32097                      :                                                                                                                                                                          TAAAACTTA----C-G-T---TT-A-C----T-TT---A-------CTT-T--A-AA----------T-A--A-T--CA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG--G-T--------GGA-C--------GGTAATAC--A--------AT---A-G---T---------A-----A----T----A-----C--GA--T-T-G-C-GTGGT-TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-ACG------------------CGT-C-AT-A-----GT--C---C------A--AG-GC-G-G---C--TGGGAC------C--C-A-T-T-TGA----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32098                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----AGTTACTACTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-GG--G-T--------G-G-C--------G------T--A--------AT---A--------------------------T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-T--AA---G-TT-T-A---C--C-G-----T--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---T--TG---C---A-----C-A-T-T-TTG--A-TT-T-----AGG--C-TG-A--A-GTAAA
gi|32099                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----A-------CGT-T--A-A-----------T-G--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-TG-C-TG--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-T-GTG---TTT--G-TGA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---
gi|32100                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-GTA----C-AAT---TT-A-C----T-T----A-------C--------A-----------T-A--A-T--CC--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-T-TC--A-T--------G-A----------G------TAAA--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----T--CA--T-T-G-C-GAG----CG--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G-----T--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A---T-TG-----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32101                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----C-------TTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTGTTTTTT--G-TAA------A-CT-AA---GTTT-T-A---C--C-GGTTTTT--TGGTTTG-GGGAAC---------------CGTCC-AT-A-----GTAAC---G------AATAG-GC-A-G---CTTTG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TATA--T-ATAAA
gi|32102                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----C-------TTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTGTTTTTT--G-TAA------A-CT-AA---GTTT-T-A---C--C-GGTTTTT--TGGTTTG-GGGAAC---------------CGTCC-AT-A-----GTAAC---G------AATAG-GC-A-G---CTTTG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TATA--T-ATAAA
gi|32103                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TT-----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTG-T--A-A-----------T-AG-A-T--TA--C--ATCA--A---AA---C-----CG-C--C--G-T--------G-A-C--------G------TC-A--------GT---A-A---C---------A-----A----T----AATTTAC--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--GGTAA------A-A--CA---G-TT-T-A---CT-C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-CCATTA-----GT--T---A------A--AG-GC-G-G---C--T----C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAGA
gi|32104                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------TAA--A-T--TA--T-TACC---A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------T-A-C--------G------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C----------------------------------------A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---T---A--TA-C-A---C-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--
gi|32105                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TAA----C-A-T---TT-A-A----C-T----A-------CTG-T--G-A-----------T-A--A-T--TAATTATACCA--A---A------C-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----C--GG--C-T-G-C-GTG---TTT--G-TAAG-----A-C--AC---C-GT-T-A---C--C-G-----T--TG---TGAA--------------------CGT-C-AT-A-----GTC-T---G------AT-AG-AC-GTA---C--TG----------C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32106                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTAACAAT-A-T---AT-A-C----T-T----A-------CTA-TAGG-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---TAC-C-CGTC-TCA-G-TAG------A-A-C--------GT-----T--A--------AT---A-A---C---------A-----AATT-T----AATAT-C--GGGCT-T-G-C-GTGT--TTT--G-TAA------A----AACGTG-TT-T-A---C--C-G----TTGATG---TG-AACG-----------------CGT-C--T-A-----GT--T---G------A--AGAAC-G-A---CAATG---C---A--C--C-ATT-T-TGG--TATTAT-----AGG--CTTA-ATGT-ATAAA
gi|32107                      :                                                                                                                                                                          TAATA-TTA----A-A-T---TT-AAC----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-G--A-A--TA--G-TACCA--A---GA---C-T-C-CG-C-T---A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---ACA---C---------AATAGGA----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTTC-G-TAA------A-C--AA-----TT-T-AAG-C--C-G----TT--TG---TG-ATGGGGGGGGGGTTGGTGGCGCGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AGAAC-A-GAT-C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-TA----AGG--C-TA-A--T-TTAAA
gi|32108                      :                                                                                                                                                                          TAAGA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T------------CTT-T--GAA-----------T-A--A-T--TA--T-TACC---A---AA---C-T-CGCG-C-TC--A----------G-A-C--------G--------------------------------------------------T----A-----T--GG--TCT-G-C-ATG---TTT--G-T-A------A-C--AA---GCTT-T-A---C--C-A----TT--TG---T--A--------------------C-T-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG----G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----A-G--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32109                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-GTAG---C-A-T---CT-A-CC---T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-AGAA-T--TA--T-TACCA--A---AAACTC-T-C-CG-C-TC--A-TTTGGGGGAG-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CTGAACTTACA-----A----T----A-----C--GG--T-T-GAC-GTG---TTTT-G-TAA------AGC--AA---G-TT-T-AATCCGGC-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-AAACT--TC---C---AACC--C-A-TGT-TGG--T-TT-TATTTAAGG--C-TA-A--T-AT
gi|32110                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-A----ATT-----CTT-T--A-AAATATAAATTTT-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---T-T-C-CG-CTTT--T-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAT-------A-----A----A----A-----C--GG--T-T---C-GTA---TTT--G-TAA------A-C---A---G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG----G-A--------------------AGT-C-AT-A-----TT--T---C------A--GA-GC-G-C---C--TG---CATAA--C--C-GTT-T-TGG--T-TT-
gi|32111                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----CCA-T---TTTA-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TAGTT-TACCAATA---AA---C-TCC-CGTC-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---ATA---CACACTT---A-----A----TAACCA-----C--GG--T-T-G-C-a
gi|32111                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           G---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TGA--C---A--C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--TCATAAActctgctcgttctagtaaccacataagtgtttctaaccgtttaccccagtccccgtgcaccttcaccgacgctctcgcggtgacgtcatagttgaagacgactgacaccatttgttttaggctaatcataaa
gi|32112                      : taaaattaccattttacttactttgataattagtttaccaataaactcccgtctcatgacgtaatatacacacttaataaccacggttgcctctgctcgttctagtaaccacataagtgtttctaaccgtttaccccagtccccgtgcaccttcaccgacgctctcgcgTAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-T--G-A--TA--T-TATC--------G---T-T-C-CA-CATCG-G-T--------G-G-CGTCATGGAG------T--A--------AT---G-A---A---------T-----A----T----A-----CGGGG--T-T-G-CGGTGT--TTT--G-TAG------A-TCGAA---G-TTCT-A------C-G----TTG-TG---TG-A--------------------GAT-C-AT-ATGT--GT--T---G------A--AG-GCAG-G---CG-TG---CG--A--C--C-A-TAT-TGGGAT-TT-T-----AAG--
gi|32113                      :                                                                                                                                                                           AAAG-TTA------A-T---T--A-C----T-T----A-------CTT-T----A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCACAA---AA---C---C-CG-CCTC--A-T--------GGA-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--G---T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--A----G-TT-T-A---A--C-GG---TT--TG---TGGA--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T----------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--CACC-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGA--C-TA-A--T-ATAAAacaaa
gi|32114                      :                                                                                                                                                                           AAAA-TCA----C-A-T---TT-A-C----TGT----A-------CTG-G--G-G-----------T-A--A-TAATA--T-CATCA--A---AATAAC-T-C-CG-C-CCC-G-T--------G-A-C--------GGTAAA-T--A--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TGT--G-TAA--------C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-ATAA-----GT--T---C------A--A--GC-G-G---C--TC---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--A-TA-A--T-GTAA
gi|32115                      :                                                                                                                                                                            AAC-TTA----C-A-A---TA-A-A----T-A----A-------CTG-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-CT--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AAATA-C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---A-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-AC-G-G---C--TC---C---A--C--C-A-T-T-TGG----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32116                      :                                                                                                                                                                            AAA-TTA----C-A-T---TT-AAC----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T---CG---TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---ATA---C---------A-----A----T----A-----C--AG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-T-A------A-C--AA---G-TT-TGA---C--C-G----TT-------TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC---A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT--------AG--C-TA-A--T--TAAA
gi|32117                      :                                                                                                                                                                               -TTA----C-T-T---TT-A-TGTGTT-T----A-------CTTGT--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACTA--A---A----C-T-C-GG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------TA-A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATAACC--GG--T-T-G-C-GTG---TTTTCC-TAAACACACA-C--AA---G-TT-T-A---C--C-C----GT--TG---TG-A---------------------GT-C-AA-C-----GT--T---G------A--AG-AC-T-G-------G---C---A--C--CTA-T-TATGGGTT-TT-T-----AGGCTC-TG-A--TGATAAA
gi|32118                      :                                                                                                                                                                                          -T---TT-A-T----T-TGTAAA-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TT--G-T--------G-A-C--------G------T--ATGCCCCTAAT---A-A---C---------A-----A----TGAT-A-----C--GG--T-T-G-C-GTA---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG---TG-A--------------------TGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--TG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--C-AAAAA
gi|32119                      :                                                                                                                                                                                                                         TT-T--A-A-----------T-A----T--TA--T---CTA--ATTCAA---T-T-C-CG-C-TTTTG-T--------G-ATC--------A------T--GT-------AT---A-A---C---------A-----AATAAT----A--------GG--T-T-G-C-GTA---TT---G-TAA------A-C--A----G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----
gi|32120                      :                                                                                                                                                                                                                                                --A-T--TA--T-CATCA--A---TT---C-CAC-CG-C-TC--A-T--------G---C--------G------T--A--------AT---A-A-------------------A----T----AAG---C--GG--C-TAG-C-GTG---TTT----TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---CT-C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--GA-AC-G-A---C--TG---C---G--C------T-T-TGG----AT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32121                      :                                                                                                                                                                                                                                                           aatACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---A---------A-----A----TGAT-A-----T--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AC---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GA--T---A------A--AG-GC-G-G---C--GG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-
gi|32122                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-G-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-G---C--C-A----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-CA-A-G---C--TG---C---A--C--C-A---T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   2222222222222222222222222222222                                                                                 11111111111111111111                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               1   3333 1 1 111  1 2 3333 1 3333 5555555   1 11 1 77777777777 1 22 3 11  22 1     22 111  555 1 3 1  2 3 66666 55555555 3 2 33333333 666666 33 44444444  555 3 111 0000000000000000000000000000000 11  11 1 1 1 1   777   33 1   555555 1 44  111 3  2 1 333 33 2 5555  22  333  2 66666666666666666666   2 1  2 44444  33 6666666666 33  2  1 1 333 55  222 222 11 22 1 7 2 1   22 1  1 33333   11 1  2 11 2     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               .   .... . . ...  . . .... . .... .......   . .. . ........... . .. . ..  .. .     .. ...  ... . . .  . . ..... ........ . . ........ ...... .. ........  ... . ... ............................... ..  .. . . . .   ...   .. .   ...... . ..  ... .  . . ... .. . ....  ..  ...  . ....................   . .  . .....  .. .......... ..  .  . . ... ..  ... ... .. .. . . . .   .. .  . .....   .. .  . .. .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               1   6666 1 1 999  1 2 5555 1 5555 1111111   1 55 1 33333333333 1 55 2 44  99 1     88 888  666 0 1 0  1 1 22222 11111111 1 1 77777777 555555 55 77777777  222 0 888 5555555555555555555555555555555 44  44 0 0 0 0   111   55 0   000000 0 55  888 1  1 0 222 55 1 4444  44  555  0 22222222222222222222   0 0  0 22222  88 4444444444 99  1  1 1 333 44  999 999 44 55 1 4 1 1   99 1  1 99999   66 2  4 77 5     
consensus                     :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
Reference ( family-481 )      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32083                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-A-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32084                      :                                                                                                                                                                          TAATA-GTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----TTAATA-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-ACT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T--TAA
gi|32085                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--CA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--AG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-T--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---T------A--AT-GC-G-G---C--TT---C---A--C--C-A-T-T-TAA----TT-C-----AGA--C-CA-A--T-ATAAA
gi|32086                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------TTT-T--G-A-----------T-A--AAT--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----ACAA-T----A-----C--CG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-AAA------A-C--AA---A-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---G---A--C--T-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ACAAA
gi|32087                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--AAT--TA--T-CACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-AAAAC---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---AACGTTCA--AG-GC-G-A---C--TG---C---A--G--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATA
gi|32088                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-AA----------T-A--A-T--TA--T-TAC-A--A---AA---C---C-CG-C-TC--T-T--------GCA-C---------------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT---A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-T----T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32089                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-T-A----C-A-TATATT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----C---G--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAAC-----A-C--AA---G-TT-T-A---C--CGG----TT--TG---TG-A--------------------C-T-C-AT-A-----GC--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-
gi|32090                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TC-A-C----T-T----A-------CTG-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-CATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-CC--G-T--------G-A-T--------G------T--A--------AA---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--C-T-G-C-GTG---TGT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TC---G---A--C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32091                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----A-------CTT-T--T-A-----------T-A--AAT--TA--T-TACCA--A---AA---C-TAC-CG-C-TT--AAT--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----ACAA-T----A-----C--GT--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-CA-AA---G-TT-T-A---C--CTT----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-GTTAACGT--TTTCA------A--GG-GC-G-G------TG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AG
gi|32092                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-T-A----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-------------T-A--A-T--TA--T-TAC----A---AA---C---C-CG-C-TC--A-T--------G-AGT--------A------T--A--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T---G-C-GTG---ATT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAAct
gi|32093                      :                                                                                                                                                                          TAAAG-TTC----C-A----------C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A---------------CCA--A---AA---C-T-C-TG-C-TC--A-T--------G-A-C--------A------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32094                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTT----C-A-T---TT-A-A----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-G--A-T--TA--T-AATCA--A---AA---C-T-T-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----T--GG--T-T-G-C-ATG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TTAT-A---C--A-G----TT--TG---TG-A--------------------CGA-C-AT-A-----GT--T---G------A--AA-GC-G-G---T--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-
gi|32095                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-GTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CA-C-TC--A-T--------G-A-C--------T------T--A--------AT---A-A---C-----------------------------------------------TG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32096                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TAACA--A---AA---T-T-C----------G-T--------G-A-T--------G------C--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----G-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---T--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C-----------GA--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--A-ATAAA
gi|32097                      :                                                                                                                                                                          TAAAACTTA----C-G-T---TT-A-C----T-TT---A-------CTT-T--A-AA----------T-A--A-T--CA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG--G-T--------GGA-C--------GGTAATAC--A--------AT---A-G---T---------A-----A----T----A-----C--GA--T-T-G-C-GTGGT-TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-ACG------------------CGT-C-AT-A-----GT--C---C------A--AG-GC-G-G---C--TGGGAC------C--C-A-T-T-TGA----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32098                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----AGTTACTACTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-GG--G-T--------G-G-C--------G------T--A--------AT---A--------------------------T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-T--AA---G-TT-T-A---C--C-G-----T--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---T--TG---C---A-----C-A-T-T-TTG--A-TT-T-----AGG--C-TG-A--A-GTAAA
gi|32099                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----A-------CGT-T--A-A-----------T-G--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-TG-C-TG--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-T-GTG---TTT--G-TGA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---
gi|32100                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-GTA----C-AAT---TT-A-C----T-T----A-------C--------A-----------T-A--A-T--CC--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-T-TC--A-T--------G-A----------G------TAAA--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----T--CA--T-T-G-C-GAG----CG--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G-----T--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A---T-TG-----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32101                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----C-------TTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTGTTTTTT--G-TAA------A-CT-AA---GTTT-T-A---C--C-GGTTTTT--TGGTTTG-GGGAAC---------------CGTCC-AT-A-----GTAAC---G------AATAG-GC-A-G---CTTTG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TATA--T-ATAAA
gi|32102                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----C-------TTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTGTTTTTT--G-TAA------A-CT-AA---GTTT-T-A---C--C-GGTTTTT--TGGTTTG-GGGAAC---------------CGTCC-AT-A-----GTAAC---G------AATAG-GC-A-G---CTTTG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TATA--T-ATAAA
gi|32103                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TT-----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTG-T--A-A-----------T-AG-A-T--TA--C--ATCA--A---AA---C-----CG-C--C--G-T--------G-A-C--------G------TC-A--------GT---A-A---C---------A-----A----T----AATTTAC--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--GGTAA------A-A--CA---G-TT-T-A---CT-C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-CCATTA-----GT--T---A------A--AG-GC-G-G---C--T----C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAGA
gi|32104                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------TAA--A-T--TA--T-TACC---A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------T-A-C--------G------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C----------------------------------------A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---T---A--TA-C-A---C-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--
gi|32105                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TAA----C-A-T---TT-A-A----C-T----A-------CTG-T--G-A-----------T-A--A-T--TAATTATACCA--A---A------C-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----C--GG--C-T-G-C-GTG---TTT--G-TAAG-----A-C--AC---C-GT-T-A---C--C-G-----T--TG---TGAA--------------------CGT-C-AT-A-----GTC-T---G------AT-AG-AC-GTA---C--TG----------C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32106                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTAACAAT-A-T---AT-A-C----T-T----A-------CTA-TAGG-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---TAC-C-CGTC-TCA-G-TAG------A-A-C--------GT-----T--A--------AT---A-A---C---------A-----AATT-T----AATAT-C--GGGCT-T-G-C-GTGT--TTT--G-TAA------A----AACGTG-TT-T-A---C--C-G----TTGATG---TG-AACG-----------------CGT-C--T-A-----GT--T---G------A--AGAAC-G-A---CAATG---C---A--C--C-ATT-T-TGG--TATTAT-----AGG--CTTA-ATGT-ATAAA
gi|32107                      :                                                                                                                                                                          TAATA-TTA----A-A-T---TT-AAC----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-G--A-A--TA--G-TACCA--A---GA---C-T-C-CG-C-T---A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---ACA---C---------AATAGGA----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTTC-G-TAA------A-C--AA-----TT-T-AAG-C--C-G----TT--TG---TG-ATGGGGGGGGGGTTGGTGGCGCGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AGAAC-A-GAT-C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-TA----AGG--C-TA-A--T-TTAAA
gi|32108                      :                                                                                                                                                                          TAAGA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T------------CTT-T--GAA-----------T-A--A-T--TA--T-TACC---A---AA---C-T-CGCG-C-TC--A----------G-A-C--------G--------------------------------------------------T----A-----T--GG--TCT-G-C-ATG---TTT--G-T-A------A-C--AA---GCTT-T-A---C--C-A----TT--TG---T--A--------------------C-T-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG----G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----A-G--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32109                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-GTAG---C-A-T---CT-A-CC---T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-AGAA-T--TA--T-TACCA--A---AAACTC-T-C-CG-C-TC--A-TTTGGGGGAG-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CTGAACTTACA-----A----T----A-----C--GG--T-T-GAC-GTG---TTTT-G-TAA------AGC--AA---G-TT-T-AATCCGGC-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-AAACT--TC---C---AACC--C-A-TGT-TGG--T-TT-TATTTAAGG--C-TA-A--T-AT
gi|32110                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-A----ATT-----CTT-T--A-AAATATAAATTTT-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---T-T-C-CG-CTTT--T-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAT-------A-----A----A----A-----C--GG--T-T---C-GTA---TTT--G-TAA------A-C---A---G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG----G-A--------------------AGT-C-AT-A-----TT--T---C------A--GA-GC-G-C---C--TG---CATAA--C--C-GTT-T-TGG--T-TT-
gi|32111                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----CCA-T---TTTA-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TAGTT-TACCAATA---AA---C-TCC-CGTC-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---ATA---CACACTT---A-----A----TAACCA-----C--GG--T-T-G-C-a
gi|32111                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           G---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TGA--C---A--C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--TCATAAActctgctcgttctagtaaccacataagtgtttctaaccgtttaccccagtccccgtgcaccttcaccgacgctctcgcggtgacgtcatagttgaagacgactgacaccatttgttttaggctaatcataaa
gi|32112                      : taaaattaccattttacttactttgataattagtttaccaataaactcccgtctcatgacgtaatatacacacttaataaccacggttgcctctgctcgttctagtaaccacataagtgtttctaaccgtttaccccagtccccgtgcaccttcaccgacgctctcgcgTAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-T--G-A--TA--T-TATC--------G---T-T-C-CA-CATCG-G-T--------G-G-CGTCATGGAG------T--A--------AT---G-A---A---------T-----A----T----A-----CGGGG--T-T-G-CGGTGT--TTT--G-TAG------A-TCGAA---G-TTCT-A------C-G----TTG-TG---TG-A--------------------GAT-C-AT-ATGT--GT--T---G------A--AG-GCAG-G---CG-TG---CG--A--C--C-A-TAT-TGGGAT-TT-T-----AAG--
gi|32113                      :                                                                                                                                                                           AAAG-TTA------A-T---T--A-C----T-T----A-------CTT-T----A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCACAA---AA---C---C-CG-CCTC--A-T--------GGA-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--G---T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--A----G-TT-T-A---A--C-GG---TT--TG---TGGA--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T----------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--CACC-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGA--C-TA-A--T-ATAAAacaaa
gi|32114                      :                                                                                                                                                                           AAAA-TCA----C-A-T---TT-A-C----TGT----A-------CTG-G--G-G-----------T-A--A-TAATA--T-CATCA--A---AATAAC-T-C-CG-C-CCC-G-T--------G-A-C--------GGTAAA-T--A--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TGT--G-TAA--------C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-ATAA-----GT--T---C------A--A--GC-G-G---C--TC---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--A-TA-A--T-GTAA
gi|32115                      :                                                                                                                                                                            AAC-TTA----C-A-A---TA-A-A----T-A----A-------CTG-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-CT--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AAATA-C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---A-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-AC-G-G---C--TC---C---A--C--C-A-T-T-TGG----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32116                      :                                                                                                                                                                            AAA-TTA----C-A-T---TT-AAC----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T---CG---TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---ATA---C---------A-----A----T----A-----C--AG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-T-A------A-C--AA---G-TT-TGA---C--C-G----TT-------TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC---A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT--------AG--C-TA-A--T--TAAA
gi|32117                      :                                                                                                                                                                               -TTA----C-T-T---TT-A-TGTGTT-T----A-------CTTGT--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACTA--A---A----C-T-C-GG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------TA-A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATAACC--GG--T-T-G-C-GTG---TTTTCC-TAAACACACA-C--AA---G-TT-T-A---C--C-C----GT--TG---TG-A---------------------GT-C-AA-C-----GT--T---G------A--AG-AC-T-G-------G---C---A--C--CTA-T-TATGGGTT-TT-T-----AGGCTC-TG-A--TGATAAA
gi|32118                      :                                                                                                                                                                                          -T---TT-A-T----T-TGTAAA-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TT--G-T--------G-A-C--------G------T--ATGCCCCTAAT---A-A---C---------A-----A----TGAT-A-----C--GG--T-T-G-C-GTA---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG---TG-A--------------------TGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--TG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--C-AAAAA
gi|32119                      :                                                                                                                                                                                                                         TT-T--A-A-----------T-A----T--TA--T---CTA--ATTCAA---T-T-C-CG-C-TTTTG-T--------G-ATC--------A------T--GT-------AT---A-A---C---------A-----AATAAT----A--------GG--T-T-G-C-GTA---TT---G-TAA------A-C--A----G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----
gi|32120                      :                                                                                                                                                                                                                                                --A-T--TA--T-CATCA--A---TT---C-CAC-CG-C-TC--A-T--------G---C--------G------T--A--------AT---A-A-------------------A----T----AAG---C--GG--C-TAG-C-GTG---TTT----TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---CT-C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--GA-AC-G-A---C--TG---C---G--C------T-T-TGG----AT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32121                      :                                                                                                                                                                                                                                                           aatACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---A---------A-----A----TGAT-A-----T--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AC---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GA--T---A------A--AG-GC-G-G---C--GG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-
gi|32122                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-G-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-G---C--C-A----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-CA-A-G---C--TG---C---A--C--C-A---T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               C   ACAA C A ATA  T A GTGT G GTAA GTTACTA   G AG A AATATAAATTT A GA A AA  AT A     AT TTC  ACT A A G  T T TTTG  TTGGGGGA C G GTCATGGA GTAATA AA TGCCCCTA  AAC C AAA ACACTTAATAACCA                  GG  GC C A A G   TTT   TC G   ACACAC G CG  CGT T  A G ATC GG G GTTT  GA  GTT  A TGGGGGGGGGGTTGGTGGCG   C C  T TTAAC  AA AACGTTC    AT  A  A T AAC TT  GGA ATA AC AC T C G A   GA A  A ATTTA   CT T  T TG C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   G    . . .    . A C    . T    TT        . .  . A           . G  A .   GT .     CA .    TAA . C .  T A TAA   AG       G T .        GTAAA  C  T         AAC T .   TGAACTTACAATA                   .   .  . . . .   TTT   C  .   C      . A   .   T  C . AG  T  T GTTT  G   GTT  G GGAAC                  C .  A TGT    AA TTCA       AT  A  . . AT  TT  A   G   .  A  . T A .   GT .  . A       .  .  T .  G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . A           . .  A .   .  .     .  .    T   . A .  . C CAG   .        G . .        T      A  .         AAC T .   AAATTTAATAT                     .   .  . . . .   GT    T  .   G      . T   .   C  . . .   T  . G     .   .    . GGAAC                  . .  . .      C  G          T   .  . . .   AA  .   .   .  .  . T . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    T   . . .  . . CGG   .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAATTTA                       .   .  . . . .   T     .  .   .      . T   .   .  . . .   .  . .     .   .    . ACG                    . .  . .      .  T          .   .  . . .   G   .   .   .  .  . T . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CCG   .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAGGATA                       .   .  . . . .   T     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . CG                     . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . T . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . AA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAATAAC                       .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . T . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . GG    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATTAATA                        .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . T . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . AA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAAATA                        .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . AA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AAATAATA                        .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CT    .        . . .        .      .  .         .   . .   AACAATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CG    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AACAATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CG    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . GG    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . GG    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATAATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . GG    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATGATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  A          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATGATA                         .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . AA    .        . . .        .      .  .         .   . .   ATAAAA                          .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . AA    .        . . .        .      .  .         .   . .   ATAAG                           .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CG    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . AA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATG                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . TT    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . TG    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  . .   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CG    .        . . .        .      .  .         .   . .   TATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  C          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .  .  .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .   .    . . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . TG    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .       .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                          . .    . . .    . .    .         . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  A          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  . .                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                           . .  . .           . .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . CA    .        . . .        .      .  .         .   . .   AATA                            .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  G          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  .                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                .  . .   .  .     .  .    .   . . .  . . G     .        . . .        .      .  .         .   . .   TA                              .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .  .          .   .  . . .   .   .   .   .  .  . . . .   .  .  .                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                  .  .    .   . . .  . . A     .        . . .        .      .  .         .   . .   TA                              .   .  . . . .   .     .  .   .      . .   .   .  . . .   .  . .     .   .    . .                      . .  . .      .                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .   . .   .                               .   .  . . . .                                                           .    . .                      . .  . .                                                                                           


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                          
originalCons                  :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
finalCons                     :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   2222222222222222222222222222222                                                                                 11111111111111111111                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               1   3333 1 1 111  1 2 3333 1 3333 5555555   1 11 1 77777777777 1 22 3 11  22 1     22 111  555 1 3 1  2 3 66666 55555555 3 2 33333333 666666 33 44444444  555 3 111 0000000000000000000000000000000 11  11 1 1 1 1   777   33 1   555555 1 44  111 3  2 1 333 33 2 5555  22  333  2 66666666666666666666   2 1  2 44444  33 6666666666 33  2  1 1 333 55  222 222 11 22 1 7 2 1   22 1  1 33333   11 1  2 11 2     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               .   .... . . ...  . . .... . .... .......   . .. . ........... . .. . ..  .. .     .. ...  ... . . .  . . ..... ........ . . ........ ...... .. ........  ... . ... ............................... ..  .. . . . .   ...   .. .   ...... . ..  ... .  . . ... .. . ....  ..  ...  . ....................   . .  . .....  .. .......... ..  .  . . ... ..  ... ... .. .. . . . .   .. .  . .....   .. .  . .. .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                               1   6666 1 1 999  1 2 5555 1 5555 1111111   1 55 1 33333333333 1 55 2 44  99 1     88 888  666 0 1 0  1 1 22222 11111111 1 1 77777777 555555 55 77777777  222 0 888 5555555555555555555555555555555 44  44 0 0 0 0   111   55 0   000000 0 55  888 1  1 0 222 55 1 4444  44  555  0 22222222222222222222   0 0  0 22222  88 4444444444 99  1  1 1 333 44  999 999 44 55 1 4 1 1   99 1  1 99999   66 2  4 77 5     
consensus                     :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
Reference ( family-481 )      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32083                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC-A-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32084                      :                                                                                                                                                                          TAATA-GTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----TTAATA-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-ACT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T--TAA
gi|32085                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--CA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--AG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-T--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---T------A--AT-GC-G-G---C--TT---C---A--C--C-A-T-T-TAA----TT-C-----AGA--C-CA-A--T-ATAAA
gi|32086                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------TTT-T--G-A-----------T-A--AAT--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----ACAA-T----A-----C--CG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-AAA------A-C--AA---A-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---G---A--C--T-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ACAAA
gi|32087                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--AAT--TA--T-CACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-AAAAC---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---AACGTTCA--AG-GC-G-A---C--TG---C---A--G--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATA
gi|32088                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-AA----------T-A--A-T--TA--T-TAC-A--A---AA---C---C-CG-C-TC--T-T--------GCA-C---------------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT---A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-T----T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32089                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-T-A----C-A-TATATT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----C---G--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAAC-----A-C--AA---G-TT-T-A---C--CGG----TT--TG---TG-A--------------------C-T-C-AT-A-----GC--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-
gi|32090                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TC-A-C----T-T----A-------CTG-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-CATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-CC--G-T--------G-A-T--------G------T--A--------AA---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--C-T-G-C-GTG---TGT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TC---G---A--C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32091                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----A-------CTT-T--T-A-----------T-A--AAT--TA--T-TACCA--A---AA---C-TAC-CG-C-TT--AAT--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----ACAA-T----A-----C--GT--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-CA-AA---G-TT-T-A---C--CTT----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-GTTAACGT--TTTCA------A--GG-GC-G-G------TG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AG
gi|32092                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-T-A----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-------------T-A--A-T--TA--T-TAC----A---AA---C---C-CG-C-TC--A-T--------G-AGT--------A------T--A--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T---G-C-GTG---ATT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAAct
gi|32093                      :                                                                                                                                                                          TAAAG-TTC----C-A----------C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A---------------CCA--A---AA---C-T-C-TG-C-TC--A-T--------G-A-C--------A------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32094                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTT----C-A-T---TT-A-A----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-G--A-T--TA--T-AATCA--A---AA---C-T-T-CG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----T--GG--T-T-G-C-ATG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TTAT-A---C--A-G----TT--TG---TG-A--------------------CGA-C-AT-A-----GT--T---G------A--AA-GC-G-G---T--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-
gi|32095                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-GTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CA-C-TC--A-T--------G-A-C--------T------T--A--------AT---A-A---C-----------------------------------------------TG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32096                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TAACA--A---AA---T-T-C----------G-T--------G-A-T--------G------C--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----G-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---T--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---C---A--C-----------GA--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--A-ATAAA
gi|32097                      :                                                                                                                                                                          TAAAACTTA----C-G-T---TT-A-C----T-TT---A-------CTT-T--A-AA----------T-A--A-T--CA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TG--G-T--------GGA-C--------GGTAATAC--A--------AT---A-G---T---------A-----A----T----A-----C--GA--T-T-G-C-GTGGT-TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-ACG------------------CGT-C-AT-A-----GT--C---C------A--AG-GC-G-G---C--TGGGAC------C--C-A-T-T-TGA----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32098                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----AGTTACTACTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-GG--G-T--------G-G-C--------G------T--A--------AT---A--------------------------T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-T--AA---G-TT-T-A---C--C-G-----T--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---T--TG---C---A-----C-A-T-T-TTG--A-TT-T-----AGG--C-TG-A--A-GTAAA
gi|32099                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----A-------CGT-T--A-A-----------T-G--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-TG-C-TG--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-T-GTG---TTT--G-TGA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---
gi|32100                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-GTA----C-AAT---TT-A-C----T-T----A-------C--------A-----------T-A--A-T--CC--T-TACCA--A---AA---C-T-C-CG-T-TC--A-T--------G-A----------G------TAAA--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----T--CA--T-T-G-C-GAG----CG--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--C-G-----T--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G---------AG-AC-G-A---C--TG---C---A--C--C-A---T-TG-----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32101                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----C-------TTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTGTTTTTT--G-TAA------A-CT-AA---GTTT-T-A---C--C-GGTTTTT--TGGTTTG-GGGAAC---------------CGTCC-AT-A-----GTAAC---G------AATAG-GC-A-G---CTTTG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TATA--T-ATAAA
gi|32102                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---T--A-C----T-T----C-------TTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AAT--C-T-C-CG-C-TA--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTGTTTTTT--G-TAA------A-CT-AA---GTTT-T-A---C--C-GGTTTTT--TGGTTTG-GGGAAC---------------CGTCC-AT-A-----GTAAC---G------AATAG-GC-A-G---CTTTG---C---A--C--T-ATT-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TATA--T-ATAAA
gi|32103                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TT-----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTG-T--A-A-----------T-AG-A-T--TA--C--ATCA--A---AA---C-----CG-C--C--G-T--------G-A-C--------G------TC-A--------GT---A-A---C---------A-----A----T----AATTTAC--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--GGTAA------A-A--CA---G-TT-T-A---CT-C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-CCATTA-----GT--T---A------A--AG-GC-G-G---C--T----C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAGA
gi|32104                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------TAA--A-T--TA--T-TACC---A---AA---C-T-C-CG-C-TA--A-T--------T-A-C--------G------T--A--------ATAACA-A---C---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C----------------------------------------A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CAT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-GC-G-G---C--TG---T---A--TA-C-A---C-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--
gi|32105                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TAA----C-A-T---TT-A-A----C-T----A-------CTG-T--G-A-----------T-A--A-T--TAATTATACCA--A---A------C-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAAT------A-----A----T----A-----C--GG--C-T-G-C-GTG---TTT--G-TAAG-----A-C--AC---C-GT-T-A---C--C-G-----T--TG---TGAA--------------------CGT-C-AT-A-----GTC-T---G------AT-AG-AC-GTA---C--TG----------C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32106                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTAACAAT-A-T---AT-A-C----T-T----A-------CTA-TAGG-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---TAC-C-CGTC-TCA-G-TAG------A-A-C--------GT-----T--A--------AT---A-A---C---------A-----AATT-T----AATAT-C--GGGCT-T-G-C-GTGT--TTT--G-TAA------A----AACGTG-TT-T-A---C--C-G----TTGATG---TG-AACG-----------------CGT-C--T-A-----GT--T---G------A--AGAAC-G-A---CAATG---C---A--C--C-ATT-T-TGG--TATTAT-----AGG--CTTA-ATGT-ATAAA
gi|32107                      :                                                                                                                                                                          TAATA-TTA----A-A-T---TT-AAC----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-G--A-A--TA--G-TACCA--A---GA---C-T-C-CG-C-T---A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---ACA---C---------AATAGGA----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TTTC-G-TAA------A-C--AA-----TT-T-AAG-C--C-G----TT--TG---TG-ATGGGGGGGGGGTTGGTGGCGCGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AGAAC-A-GAT-C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-TA----AGG--C-TA-A--T-TTAAA
gi|32108                      :                                                                                                                                                                          TAAGA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T------------CTT-T--GAA-----------T-A--A-T--TA--T-TACC---A---AA---C-T-CGCG-C-TC--A----------G-A-C--------G--------------------------------------------------T----A-----T--GG--TCT-G-C-ATG---TTT--G-T-A------A-C--AA---GCTT-T-A---C--C-A----TT--TG---T--A--------------------C-T-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG----G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----A-G--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32109                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-GTAG---C-A-T---CT-A-CC---T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-AGAA-T--TA--T-TACCA--A---AAACTC-T-C-CG-C-TC--A-TTTGGGGGAG-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CTGAACTTACA-----A----T----A-----C--GG--T-T-GAC-GTG---TTTT-G-TAA------AGC--AA---G-TT-T-AATCCGGC-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-AAACT--TC---C---AACC--C-A-TGT-TGG--T-TT-TATTTAAGG--C-TA-A--T-AT
gi|32110                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-A----ATT-----CTT-T--A-AAATATAAATTTT-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---T-T-C-CG-CTTT--T-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---CAT-------A-----A----A----A-----C--GG--T-T---C-GTA---TTT--G-TAA------A-C---A---G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG----G-A--------------------AGT-C-AT-A-----TT--T---C------A--GA-GC-G-C---C--TG---CATAA--C--C-GTT-T-TGG--T-TT-
gi|32111                      :                                                                                                                                                                          TAAAA-TTA----CCA-T---TTTA-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TAGTT-TACCAATA---AA---C-TCC-CGTC-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---ATA---CACACTT---A-----A----TAACCA-----C--GG--T-T-G-C-a
gi|32111                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           G---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-AC-G-A---C--TGA--C---A--C--C-A-T-T-T-G--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--TCATAAActctgctcgttctagtaaccacataagtgtttctaaccgtttaccccagtccccgtgcaccttcaccgacgctctcgcggtgacgtcatagttgaagacgactgacaccatttgttttaggctaatcataaa
gi|32112                      : taaaattaccattttacttactttgataattagtttaccaataaactcccgtctcatgacgtaatatacacacttaataaccacggttgcctctgctcgttctagtaaccacataagtgtttctaaccgtttaccccagtccccgtgcaccttcaccgacgctctcgcgTAAAA-TTA----C-A-T---TT-A-C----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-T--G-A--TA--T-TATC--------G---T-T-C-CA-CATCG-G-T--------G-G-CGTCATGGAG------T--A--------AT---G-A---A---------T-----A----T----A-----CGGGG--T-T-G-CGGTGT--TTT--G-TAG------A-TCGAA---G-TTCT-A------C-G----TTG-TG---TG-A--------------------GAT-C-AT-ATGT--GT--T---G------A--AG-GCAG-G---CG-TG---CG--A--C--C-A-TAT-TGGGAT-TT-T-----AAG--
gi|32113                      :                                                                                                                                                                           AAAG-TTA------A-T---T--A-C----T-T----A-------CTT-T----A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCACAA---AA---C---C-CG-CCTC--A-T--------GGA-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATA--C--G---T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--A----G-TT-T-A---A--C-GG---TT--TG---TGGA--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T----------A--AG-AC-G-A---C--TG---C---A--CACC-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGA--C-TA-A--T-ATAAAacaaa
gi|32114                      :                                                                                                                                                                           AAAA-TCA----C-A-T---TT-A-C----TGT----A-------CTG-G--G-G-----------T-A--A-TAATA--T-CATCA--A---AATAAC-T-C-CG-C-CCC-G-T--------G-A-C--------GGTAAA-T--A--------AC---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-C-GTG---TGT--G-TAA--------C--AA---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-ATAA-----GT--T---C------A--A--GC-G-G---C--TC---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--A-TA-A--T-GTAA
gi|32115                      :                                                                                                                                                                            AAC-TTA----C-A-A---TA-A-A----T-A----A-------CTG-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-CT--G-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AAATA-C--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---A-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--AG-AC-G-G---C--TC---C---A--C--C-A-T-T-TGG----TT-T-----AGG--C-TA-A--T-GTAAA
gi|32116                      :                                                                                                                                                                            AAA-TTA----C-A-T---TT-AAC----T-T----A-------CTT-T--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACCA--A---AA---C-T---CG---TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---ATA---C---------A-----A----T----A-----C--AG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-T-A------A-C--AA---G-TT-TGA---C--C-G----TT-------TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-GC---A---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT--------AG--C-TA-A--T--TAAA
gi|32117                      :                                                                                                                                                                               -TTA----C-T-T---TT-A-TGTGTT-T----A-------CTTGT--G-A-----------T-A--A-T--TA--T-TACTA--A---A----C-T-C-GG-C-TC--G-T--------G-A-C--------G------TA-A--------AT---A-A---C---------A-----A----T----AATAACC--GG--T-T-G-C-GTG---TTTTCC-TAAACACACA-C--AA---G-TT-T-A---C--C-C----GT--TG---TG-A---------------------GT-C-AA-C-----GT--T---G------A--AG-AC-T-G-------G---C---A--C--CTA-T-TATGGGTT-TT-T-----AGGCTC-TG-A--TGATAAA
gi|32118                      :                                                                                                                                                                                          -T---TT-A-T----T-TGTAAA-------CTT-T--A-A-----------T-A--A-T--TA--T-TATCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TT--G-T--------G-A-C--------G------T--ATGCCCCTAAT---A-A---C---------A-----A----TGAT-A-----C--GG--T-T-G-C-GTA---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG---TG-A--------------------TGT-C-AT-A-----GT--T---C------A--TG-GC-G-G---C--TG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--C-AAAAA
gi|32119                      :                                                                                                                                                                                                                         TT-T--A-A-----------T-A----T--TA--T---CTA--ATTCAA---T-T-C-CG-C-TTTTG-T--------G-ATC--------A------T--GT-------AT---A-A---C---------A-----AATAAT----A--------GG--T-T-G-C-GTA---TT---G-TAA------A-C--A----G-TT-T-A---C--T-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----
gi|32120                      :                                                                                                                                                                                                                                                --A-T--TA--T-CATCA--A---TT---C-CAC-CG-C-TC--A-T--------G---C--------G------T--A--------AT---A-A-------------------A----T----AAG---C--GG--C-TAG-C-GTG---TTT----TAA------A-C--AA---G-TT-T-A---CT-C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--GA-AC-G-A---C--TG---C---G--C------T-T-TGG----AT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA
gi|32121                      :                                                                                                                                                                                                                                                           aatACCA--A---AA---C-T-C-CG-C-TC--A-T--------G-A-C--------G------T--A--------AT---A-A---A---------A-----A----TGAT-A-----T--GG--T-T-G-C-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AC---G-TT-T-A---C--C-G----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GA--T---A------A--AG-GC-G-G---C--GG---C---A--C--C-A-T-T-TGG--T-TT-
gi|32122                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ---A-A---T---------A-----A----T----A-----C--GG--T-T-G-G-GTG---TTT--G-TAA------A-C--AA---G-TT-T-G---C--C-A----TT--TG---TG-A--------------------CGT-C-AT-A-----GT--T---G------A--AG-CA-A-G---C--TG---C---A--C--C-A---T-TGG--T-TT-T-----AGG--C-TA-A--T-ATAAA