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Reference ( gi|17921 )        :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-------A--G-ATCTTT-T-TGTC-G-AC----TTG-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C----A--TG-TTCAA-G---A-ATT--C-A------T--G-T-TA--A-A-A-CGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
gi|17920                      :                      TTGA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-------A--G-ATCTTT-T-TGTC-G-AC----TTG-T-CAGAT----A-----T--TC--A--C----G--TG-TTCGA-G---A-ATT--C-A------T--GAT-GA--A-A-A-CGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
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gi|17922                      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-TTGT--C-------AA-G-ATCTTT-T-TGTG-G-AC----T-G-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C----A--TG-TTCAA-G---A-ATT--C-A------T--G---TA--A-A-A-C-TG-TTCA--T-GCC-CAGTG--TGTGCCAATCCA
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Reference ( family-480 )      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C--G-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T--G--TNA--A-A-ACGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
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Reference ( family-480 )      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C--G-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G--ATGAAAACGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
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Reference ( family-480 )      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C--G-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G--ATGAAAACGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
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gi|17944                      :                       TTA-T-A-T-C-TA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTGTT-CAGA-A---A-----T--TT--A--T--G-T--
gi|17945                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-T-TTGT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAT----A-----T--TT--A--T--G-T--
gi|17946                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAT----A-----T--TT--A--T--G-T--
gi|17947                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-TGT-GT--C-A--G-AT-------CTTT-ATTGT---G-AC----TTG-T-CAGATA---
gi|17948                      :                       TTA-T-G-T-C-GAT--C-T-T-GTTTC-A--GGAT-------CTTTTA-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--AGCC--A-T--G-A--TT--AG-G-A-ATtt
gi|17949                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GC--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--GC-C--A-T--G-A--TT--AG-G-A-ACTC-A------G-G--AT-----CTTG-TT-A--T-GCC-
gi|17950                      :                       TTA-T-G-T-T-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-T-G-CC----TTG-T-CAGAT
gi|17950                      :                      TTTA-T-G-T-T-GC---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-ctttatgt
gi|17951                      :   ttatgttgacttgtcagatcTTA-T-G-T-T-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------AATT-A-TGT-T-G-AC----TTG-T-CAGAT
gi|17951                      :                       TTA-T-G-T-T-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-ctttatgt
gi|17952                      :  ttatgttgacttgtcagataaTTA-T-G-T-C-GA---C-T-G-GT--C-A--A-AT-------CATT-T-TGT-C-G-AA----TTG-T-CA-CTT---A-----T--TC--A--C--G-T--GCT--TA--AA-G-A-ATCG-A------C-A--A-GAAAACATG-TCCA--T-GCC-
gi|17953                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--A-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-GC----TTG-T-CAGATA---T-----T--T
gi|17954                      :                       TTA-T-G-T---GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-CAG-AC----TTG-T-CAGATCTTTA-----TG-TCG-A--C--T-T--G-T--TC---A-G-A-ATatg
gi|17954                      :                      TTTA-T-G-T-CAGA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTGTT-CAGA
gi|17955                      :    ttatgtgacttgtcagatcTTA-T-G-T-C-AA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------GATT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---at
gi|17956                      :                       TTA-T-G-T-T-GATTCC-C-T-GC--T-A-----T-------CTTT-T-TGC-T-G-AC----TTG-T---GCTT---G-----T--TCG-A--C--GGT--G-T--T----A-A-A-ACCC-A------A-C--ATGAAAATATG-TCCA--C-GCC-CAGTT--TTATCC-ATTCA
gi|17957                      :                         A-T-G-T-C--A---C-T-TAGT--C-A--G-GT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--AC-C--A-T--GAT--T----A-G-A-ACTC-GGTATCTT-GTTATTAATGCGTG-TTAA--T-GCC-
gi|17958                      :                          -T-G-TAC-AA---C-T-T-GC--C-A--G-AT-------CTTT---TGTGC-A-AC----TTA-T-C--ACT---A-----T--TC--A--C--G-CCAA-T--TCTAAA-A-A-ATTCAA------C-G--ATGAAAA-GTG--TCA--T-GCC-CAG-T--TGTGCC-AT
gi|17959                      :                            -G-T-C--A---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--AC-C--A-T--G-A--TT--AG-G-A-ACTC-GTTATTTT-GTTATTAATGCGTG-TTAA--T-GCC---ACT--AATGCC-AT


blockSeqs                     :                                  A  TTC G   T  GG C AG G  GTTAGAT    AT        G  CAAC   T       AATCATGT       CG GC AA G CA A GA CTA  C A T    T GTATCTTGTT   T        T    TT G   A     TG      A
blockSeqs                     :                                  A  T   A   T  TT C A  G  A          TA        C  .      T       CTTTATG        A  C  .  . .  C .  C    . . .    A ATATCTTGTT   T        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   A  .  . .  .  .          T         .  .      T       AATAA          G  C  .  . .  A .  C    . . .    . GTATCTTGTT   G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          T         .  .      .       AATAA          G  C  .  . .  . .  T    . . .    . TTATTTTGTT   G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AATAA          .  C  .  . .  . .  C    . . .    . TTG          T        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          T         .  .      .       AATAA          .  C  .  . .  . .  T    . . .    . TGG          G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AATAA          .  .  .  . .  . .  C    . . .    . TG           G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AATAA          .  .  .  . .  . .  T    . . .    . TG           T        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AATAA          .  .  .  . .  . .  C    . . .    . TG           G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          T         .  .      .       AAT            .  .  .  . .  . .  C    . . .    . TG           G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AAT            .  .  .  . .  . .  C    . . .    . TG           G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       TAT            .  .  .  . .  . .  C    . . .    . TG           G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       TAT            .  .  .  . .  . .  T    . . .    . TG           G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AAT            .  .  .  . .  . .  T    . . .    . AC           G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          T         .  .      .       TAT            .  .  .  . .  . .  C    . . .    . TG           G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          T         .  .      .       ATT            .  .  .  . .  . .  T    . . .    . CA           G        .    .  .   .     .       .
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          T         .  .      .       TGT            .  .  .  . .  . .  T    . . .    . AC           T        .    .  .   .              
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          T         .  .      .       TAT            .  .  .  . .  . .  C    . . .    . GG           G        .    .  .   .              
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AT             .  .  .  . .  . .  T    . . .    . CA           T        .    .  .   .              
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          T         .  .      .       AT             .  .  .  . .  . .  T    . . .    . AC           .        .    .  .   .              
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          T         .  .      .       AT             .  .  .  . .  . .  A    . . .    . CG           .        .    .  .   .              
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AT             .  .  .  . .  . .  C    . . .    . C            .                                   
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AT             .  .  .  . .  . .  T    . . .                                                       
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AT             .  .  .  . .  . .  .    . . .                                                       
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AT             .  .  .  . .  . .  .    . .                                                         
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AT             .  .  .  . .                                                                        
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AT             .  .  .  . .                                                                        
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AT             .  .  .  . .                                                                        
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       AT             .  .  .  . .                                                                        
blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          A         .  .      .       A                                                                                                  
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blockSeqs                     :                                  .  .   .   .  .  . .  .  .          .                                                                                                                              


blockSeqCons                  :                      
originalCons                  :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C--G-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G--ATGAAAACGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
finalCons                     :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C--G-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G--ATGAAAACGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA





Alignments
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lowQualScore                  :                          0 0 0 0 1  222 1 0 2  22 1 22 1  3333333    333   0 1 2  2222   2 1     7777777777777  55 88 11 1 11 4 22 333  1 1 1    3 77777777777  3        1    22 1   1     33      2     
lowQualScore                  :                          . . . . .  ... . . .  .. . .. .  .......    ...   . . .  ....   . .     .............  .. .. .. . .. . .. ...  . . .    . ...........  .        .    .. .   .     ..      .     
lowQualScore                  :                          9 9 9 9 8  444 8 9 7  44 8 11 8  8888888    666   9 0 0  1111   9 0     6666666666666  88 55 88 3 88 6 11 111  5 5 6    5 99999999999  0        8    55 8   8     22      4     
consensus                     :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C--G-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G--ATGAAAACGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
Reference ( family-480 )      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C--G-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G--ATGAAAACGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
gi|17920                      :                      TTGA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-T-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---------T--TC--A--C--G-T--G-T--TC--GA-G-A-ATTC-A------T-G--ATGAAAACGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
gi|17921                      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-T-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C--A-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G---TTAAAACGTG-TTCA--T-GCC-CAGTT--TGTGCC-ATCCA
gi|17922                      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-TTGT--C-AA-G-AT-------CTTT-T-TGT-G-G-AC----T-G-T-CAGATA---A-----T--TC--A--C--A-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G---T-AAAAC-TG-TTCA--T-GCC-CAGTG--TGTGCCAATCCA
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gi|17925                      :                      TTTA-T-G-T-C-AA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--AC-C--A-T--G-A--TT--AA-G-
gi|17926                      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------ATTT-A-TGT-C-A-AC----TTG-T-CAGAT
gi|17926                      :                      TTTA-T-G-T-C-AA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-ctttatgt
gi|17927                      : tttatgtcgacttgtcagataTTTA-T-G-T-C-GA---CGT-T-GT--C-A--G-AT-------ATAT-T-TGT-C-G-AC----T-G-T-CAGATA---------T--TC--A--T--G-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G--AAGAAAACGTGTTTCA--T-GCC-CAGTT--TGT-CC-ATCCA
gi|17928                      :                      TTTA-T-G-T-C-AA---C-T-T-GT--CCA--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--A--C--C-T--A-TGATT--GG-A-A-ACTC-GATATCTT-GTTATTAATGCGTG-TTAA--T-GCC-
gi|17929                      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------ATTT-A-TGT-C-A-AC----TTG-TCCAGAT
gi|17929                      :                      TTTA-T-G-T-C-AA---C-T-T-GT--CCA--G-AT-------CTTT-A-TGT-ctttatgt
gi|17930                      : tttatgtcgacttgtcagataTTTA-TTG-T-C-GA---C-T-T-GGGGC-A--G-AT-------ATTT-A-TGT-C-GGAC----TTG-T-CAGATA---------T--TC--A--CAAG-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------TTG--ATGAAAACGTG-TTCA--T-GCC-CGGTT--TGTGCC-ATCCA
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gi|17933                      :                      TTTA-T-G-T-C-GA---T-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-T-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA------------TT--A--C--G-T--G-T--TC--AA-G-A-ATTC-A------T-G--ATGAAAACGT
gi|17934                      :                      TTT--T-G-T-T-GC---T-T-T-GT--C-A--G-ATA------CTTT---TGT-C-G-AC----TTG-T-CACTTA---------T--TC--A--C--G-T--G-C--TT--AA---A-ATTCTA------C----ATGAAAATGTG-TCCA--T-TTC-CAGTT--CGTGCC-ATCCA
gi|17935                      :                      TCTA-T-G-T-T-GT---C-T-T-GT--T-A--G-AT-------ATTT-T-GGT-C-G-AT----TTT-T-C-TATT---A-----T--AC--A--A--G-T--G-T--TT--AA-A-A-ATTC-A------A-C--ATGAAAACGCG-GCCA--T-GCC-CAGTT--TGTGAC-ATCCA
gi|17936                      :                      TTTA-T-G-T-T-GA---C-T-T-TT--C-A--G-AT-------CGTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGA
gi|17937                      :                      TTTA-T-GAT-A-GA---C-T---AC--T-A--G-AC-------CCTT-T-TGT-C---AC----TTA-T----------A-----T--TC--A--C--G-T--G-T--TC--AACG-A-ATTC-A------T-G--ATGAAAAAGTG-TTC---T-GGC-CAGTT--TGTG-C-ATCC
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gi|17939                      : tttatgtcctcttgtcagaccTTTA-T-G-T-T-TT---C-T-T-GT--C-A--G-ATGTTAGATCGTT-T-TGT-C-G-AT----TTG-T-CACGTA---------T--TC--A--C--G-T--G-T--TT--AA-A-A-TTTC-A------A-C--ATGAACACGTG-TTCA--T-GTC-ATGTT--TGTGTT-TTCCA
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gi|17941                      :                      TTTA-T-G-T-CAGA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTGTT-CAGA
gi|17942                      :                       TTA-T-G-T-T-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AA-------AATT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---
gi|17943                      :                       TTA-T-G-T-T-GA---C-G-T-GT--C-A--G-AT-------AATT-A-TGT-T-G-AC----TTG-T-CAAGAA---ATCATGT--TCCGA--C--T-T--G-T--TC--AG-G-ATATTT-A------TGG--ATGACAA-GTA-GTTA--T-G-G-CAGTT--AGTGGC-ATtt
gi|17944                      :                       TTA-T-A-T-C-TA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTGTT-CAGA-A---A-----T--TT--A--T--G-T--
gi|17945                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-T-TTGT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAT----A-----T--TT--A--T--G-T--
gi|17946                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAT----A-----T--TT--A--T--G-T--
gi|17947                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-TGT-GT--C-A--G-AT-------CTTT-ATTGT---G-AC----TTG-T-CAGATA---
gi|17948                      :                       TTA-T-G-T-C-GAT--C-T-T-GTTTC-A--GGAT-------CTTTTA-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--AGCC--A-T--G-A--TT--AG-G-A-ATtt
gi|17949                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GC--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--GC-C--A-T--G-A--TT--AG-G-A-ACTC-A------G-G--AT-----CTTG-TT-A--T-GCC-
gi|17950                      :                       TTA-T-G-T-T-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-T-G-CC----TTG-T-CAGAT
gi|17950                      :                      TTTA-T-G-T-T-GC---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-ctttatgt
gi|17951                      :   ttatgttgacttgtcagatcTTA-T-G-T-T-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------AATT-A-TGT-T-G-AC----TTG-T-CAGAT
gi|17951                      :                       TTA-T-G-T-T-GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-ctttatgt
gi|17952                      :  ttatgttgacttgtcagataaTTA-T-G-T-C-GA---C-T-G-GT--C-A--A-AT-------CATT-T-TGT-C-G-AA----TTG-T-CA-CTT---A-----T--TC--A--C--G-T--GCT--TA--AA-G-A-ATCG-A------C-A--A-GAAAACATG-TCCA--T-GCC-
gi|17953                      :                       TTA-T-G-T-C-GA---C-T-T-GT--C-A--A-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-GC----TTG-T-CAGATA---T-----T--T
gi|17954                      :                       TTA-T-G-T---GA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-CAG-AC----TTG-T-CAGATCTTTA-----TG-TCG-A--C--T-T--G-T--TC---A-G-A-ATatg
gi|17954                      :                      TTTA-T-G-T-CAGA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTGTT-CAGA
gi|17955                      :    ttatgtgacttgtcagatcTTA-T-G-T-C-AA---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------GATT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGATA---at
gi|17956                      :                       TTA-T-G-T-T-GATTCC-C-T-GC--T-A-----T-------CTTT-T-TGC-T-G-AC----TTG-T---GCTT---G-----T--TCG-A--C--GGT--G-T--T----A-A-A-ACCC-A------A-C--ATGAAAATATG-TCCA--C-GCC-CAGTT--TTATCC-ATTCA
gi|17957                      :                         A-T-G-T-C--A---C-T-TAGT--C-A--G-GT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--AC-C--A-T--GAT--T----A-G-A-ACTC-GGTATCTT-GTTATTAATGCGTG-TTAA--T-GCC-
gi|17958                      :                          -T-G-TAC-AA---C-T-T-GC--C-A--G-AT-------CTTT---TGTGC-A-AC----TTA-T-C--ACT---A-----T--TC--A--C--G-CCAA-T--TCTAAA-A-A-ATTCAA------C-G--ATGAAAA-GTG--TCA--T-GCC-CAG-T--TGTGCC-AT
gi|17959                      :                            -G-T-C--A---C-T-T-GT--C-A--G-AT-------CTTT-A-TGT-C-G-AC----TTG-T-CAGAAA---A-----TAATC--AC-C--A-T--G-A--TT--AG-G-A-ACTC-GTTATTTT-GTTATTAATGCGTG-TTAA--T-GCC---ACT--AATGCC-AT