lowQualScore : 11111111111111111111 2
lowQualScore : 2 1 2222 1 444444 1 222 22 555555 1 2 1 88888888888 11111111111111111111 11 1 1 11 1 11 22 5555 3333 1 1 2 33333 2 2 222 1 5555 55 1
lowQualScore : . . .... . ...... . ... .. ...... . . . ........... .................... .. . . .. . .. .. .... .... . . . ..... . . ... . .... .. .
lowQualScore : 4 1 4444 1 333333 1 999 55 888888 1 2 1 88888888888 99999999999999999999 66 2 2 77 2 77 99 9999 8888 2 2 1 00000 4 4 111 2 0000 33 3
consensus : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--A-GT-G--A-GG--C--G----GG----AG-G-GCGAA-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--TATTTT
Reference ( gi|49848 ) : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--A-GT-G--A-GG--C--G----GG----AG-G-GTGAA-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--T-TTTT
gi|49840 : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------CAAA--------------------AA--A-GT-G--A-GG--C--G----AG----AG-G-GCGAA-----ATTA-TT-T---T-ATAAA----TGT--TATTTT
gi|49849 : ttTAAGGCCACA-GCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTCT--TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--A-GT-GGCG-GG--C--G----GG----AG-G-GTG-A-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--T-TTTTt
gi|49829 : TAAAGCAATA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--T-GT-G--A-GG--C--A----GG----AG-G-GTGAA-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--TATTTT
gi|49830 : ttttTAAGGCCACA-CCAA-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA-----T-G--A-GG--C--G----GG----AG-G-ACGAT-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--T-ATTT
gi|49850 : ttttggTGAGGCCACA-CCAA-TTT------------------A-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--A-GT-G--A-GG--C--G----GG----AG-G-GCGAA-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--TATTTT
gi|49842 : TAAAACCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGTA--TT------T-TCA-A-AC------------AAA--------------------AA--A-GT-G--A-GA--C--G----GG----AG-G-GCGAT-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--t
gi|49846 : tcTACGGCCACA-CCAA-TTTA----TAAA-A------TA-GTTC---ATCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------ATGA--------------------AA--T-GT-G--A-GG--T--G----GG----AA-G-GTGAA-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--TATTTTcatatttt
gi|49831 : tTAAAGCAATA-TCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--T-ATGG--A-GG--C--A----GG----AG-G-GTGAA-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--TATTTTt
gi|49832 : ttttTAAAGCAATATCCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--T-AT-G----GG--C--GAA--GG----AG-G-GTGAA-----ATTA-TT-T---T-ACAAA----TAT--TATTTT
gi|49833 : ttttTAAAGCAATATCCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--T-AT-G----GG--CAAA----GG----AG-G-GTGAA-----ATTA-TT-T---T--CAAA----TAT--TATTTT
gi|49834 : ttttTAAAGCAATA-TCAA-TTTG----TGAA-A------TATATTC---TTCAGAA-TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--T-AT-G--A-GG--CA-A----GG----AG-G-GT-AA-----ATTATTT-T---T-ACAAA----TAT--TATTTT
gi|49851 : ttttTAAGATCACA-CCAA-GTTG----TAAA-G------TA-GTTT---TTCAGA--AT------A-TCA-A-ACTAACCAACAACAAAA--------------------AA--A-AT-G--A-AG--C--G----GG----AG-G-GCAAA-----ATTA-GT-T---T-ACTAA----TATCAT-TTTT
gi|49852 : TAAAGCT-CG-CCAAGTTTG----TAAA-A------TA-GTTC---T-CGGA--AT---------CC-A-AC-----------AAAA--------------------A-----GT-G--G-GG--T--G----AG----AG-GCGCGAA-----ATTA-TT-T---T-ATAAA----TAT--TATTTT
gi|49843 : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-AA-----TA-GTTC---TTCGGA--CT------G-TTA-A-AC-----------AAAA--------------------GA--A-t
gi|49853 : ttAAGGCCACA-CCAA-TTTG----GAAA-A------TA-GTTA---TTTGGA--TT------T-TCA-A-ACCA---------AAAA--------------------AA--A-GT-G--A-GG--C--G----GGAGCTAG-G-GCGAA-----ATTA-TT-T---T-ACAAATTT-TAT--T-TTTa
gi|49854 : AAGGCCACG-CCAA-TTTGGTGCTAAA-A------TA--TTG---TTCGGA--TT------T-TCC-A-AT-----------TAAA--------------------AA--A-GT-G--A-GG--C--A----AG----AG-G-CCGAA-----A-GA-TT-T---T-ATAAAATATTAT--T-TTT
gi|49855 : AAGGCCACA-CCAA-TTTA----TGAA-A------TT-GTTC---GCCGGA--TT------T-TCA-A-AG-----------AA
gi|49841 : AGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--A-GT-G--A-GG--C--G----AG----AG-G-GCGAA-----ATTA-TT-T---T-ATAAA----TAT--TATTTT
gi|49835 : tttAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAG--------------------AG--A-GT-G--A-GG--C--G----AG----AG-G-GCGAT-----ATTA-TT-TAAAT-ACAAA----TAT--TATTTTt
gi|49836 : ttttttAGGCCACA-CCAA-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TG------T-TCA-A-TC------------AAA--------------------AT--A-GT-G--A-GA--C--G----AG----AG-G-GCGAA-----ATTA-TT-T---T-ATAAA----TAT--TATTTTt
gi|49837 : tttctAGGCCACA-CTAA----G----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAAT-------------------AA--A-GT-G--A-AG--C--G----AG----AG-G-GCGAA-----ATTA-TT-T---T-t
gi|49838 : ttgtttAGGCCACA-CTAG----A----TAAAGA------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAAT-------------------AA--ACGT-G--A-AG--C--G----AG----AG-G-GCGAA-----ATTA-TT-T---T-
gi|49856 : ttgtttAAGCCACA-GCAA-TTTG----TAAA-A------CA-GTTC---TTCAGA--TA------T-TCA-A-AG-----------AAAA--------------------AT--G-GT-A--A-TG--T--A----GA----AA-G-TAAAA-----ATTA-TT-T---A-ACAAA----TAT--T-TTT
gi|49857 : AGGCCACA-CCAA-TTCG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------A
gi|49847 : AAGCCACA-CCAA-TGTA----TGAA-A------TA-ACTC---GTCGAA--TT------T-TAA-A-AA-----------AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA--A-GT-G--A-GG--C--G----AG----A--G-GTG-A-----ATTATTT-T---T-ACAAA----TAT--T-TTT
gi|49844 : ttcAGGCCACA-CCAA-TTT-----TAAA-AATTGATTA-GACCAGTTTCTAA--TT------T-CCATATAC-----------AAAA--------------------AA--A-GT-G--A-TG--C--A----AGT---AGAG-GCGAA-----ATTA-TT-T---T-ATAAA----TATCAT-TTTTcatttt
gi|49858 : tttAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGAA--TT------T-TTA-A-GC-----------
gi|49839 : AGGTCACA-CCAA-TT-G----TAAA-A------TA-GTTC---TTC-GA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAgtaatttcaaaatg
gi|49859 : ttttagtagAGGCCACG-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGcatgaaatg
gi|49845 : AAGCCACA-TCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCAGA--
gi|49860 : tttGCCACA-CAAA-TTTG----TAAA-A------TA-GATC---TTCCGA--TT------T-TTA-A-ACA----------AAAA--------------------AA--A-GT-G--A-GG--T--G----GG----AG-G-GCGAA-----ATTG-TT-G---T-ACAAA----TAT--C-ATTT
gi|49861 : CCACA-CAAC-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TGCGAA--TT------T-TCA-A-AC------------AAA--------------------AA--A-TT-G--G-GG--T--G----GG----AG-G-ACGAA-----ATCC-TT-T---T-ACTAA----CAT--T-GTTTct
gi|49862 : CATA-CCAA-TTTG----TAAA-A------T--GTTC---TACTG---TT------T-TCA-A-AA-----------GACA--------------------AA--A-AC-G--G-GG--C--GAA--GG----AG-G-GCCAA-------TA--T-T---T-ATAAA----TAT--TATTTTtt
gi|49863 : -CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTG---ATTGGAATTT------T-TCAGA-ACA----------AAAA--------------------AA--A-GT-G--A-GGGAC--GACGCGC----AG-----GAA-----ATTA-TTAT---T----AA----TAT--T-t
gi|49864 : -TTTG----TAAG-A------TC-GTTT---TTAGGA--TT------T-TCG-A-AC-----------AAAA--------------------AA--A----------------------G----AG-G-GCGAA-----ATTA-CT-T---C-ATCAA----TAT--T-ATTT
gi|49865 : ----TAGA-T------TA-GCTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AG--A-GT-G--A-GG--C--G----GG----A--G-GCGAATATTTATTG-TT-T---T--CAAA-----AT--T-TT
gi|49866 : A-ATTC---TTTGGA--TTAAATT-T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AA--A-TT-G--A-GG--C--A----GA----AG-G-GTGAA-----ATTA-TA-T---T-GCAAA----TAT--TATTTTcaatattattttt
gi|49867 : A-ATTC---TTTGGA--TTAAATTTTATCA-A-AC-----------CAAA--------------------AA--A-TT-G--ACGG--C--A----GA----AG-G-GTGAA-----ATTA-TTAT---T-GCAAA----TAT--TATTTTt
gi|49868 : GA--TA------T-TCA-A-AC-----------AAAA--------------------AAAAA-GT-G--G-AA--A--T----GA----AG-G-GCGAA-----ATTA-TT-T---G-ACAAA----TAT--TATTTTt
gi|49869 : AAA--------------------AA--A-GT-G--A-GA--C--A----GG----AG-G-GCAAA-----ATTA-TT-T---TAACAAA----TATCAT-TTTTt
Alignments
lowQualScore : 2 1 2222 1 444444 1 222 22 555555 1 2 1 77777777777 88888888888888888888 3 22 1 11 1 22 33 3333 1 1 1 11 22222 2 2 222 1 1 44444444 11 2222
lowQualScore : . . .... . ...... . ... .. ...... . . . ........... .................... . .. . .. . .. .. .... . . . .. ..... . . ... . . ........ .. ....
lowQualScore : 3 1 3333 1 222222 0 888 44 777777 1 1 1 55555555555 88888888888888888888 4 77 2 66 2 88 22 7777 2 2 2 66 99999 4 4 111 2 2 55555555 77 7777
consensus : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
Reference ( family-471 ) : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49829 : TAAAGCAATA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--GT-G--A-GGC--A--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49830 : ttttTAAGGCCACA-CCAA-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AA----T-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-AC--GAT-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTT
gi|49831 : ttttggTAAAGCAATA-TCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--ATGG--A-GGC--A--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49832 : ttttTAAAGCAATATCCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--AT-G----GGC--GAAGG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49833 : ttttTAAAGCAATATCCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--AT-G----GGCAAA--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T--C-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49834 : ttttTAAAGCAATA-TCAA-TTTG----TGAA-A------TATATTC---TTCAGAA-TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--AT-G--A-GGCA-A--GG----A-G-G-GT---AA-----ATTATTT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49835 : ttttAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AG-AGA--GT-G--A-GGC--G--AG----A-G-G-GC--GAT-----ATTA-TT-TAAAT-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49836 : ttttttAGGCCACA-CCAA-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TG------T-TCA-A-TC-----------AA--------------------AA-TA---GT-G--A-GAC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49837 : tttctAGGCCACA-CTAA----G----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AATAAA--GT-G--A-AGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-t
gi|49838 : ttgtttAGGCCACA-CTAG----A----TAAAGA------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AATAAAC-GT-G--A-AGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-
gi|49839 : ttgtttAGGTCACA-CCAA-TT-G----TAAA-A------TA-GTTC---TTC-GA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------
gi|49840 : ttttagtagTAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------CA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATGT--T----ATTTTcatgaaatg
gi|49841 : ttAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49842 : tttTAAAACCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGTA--TT------T-TCA-A-AC------------A--------------------AA-AAA--GT-G--A-GAC--G--GG----A-G-G-GC--GAT-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATATCAT----ATTTTt
gi|49843 : tcTAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-AA-----TA-GTTC---TTCGGA--CT------G-TTA-A-AC-----------AA--------------------AA-GAA--
gi|49844 : ttAGGCCACA-CCAA-TTT-----TAAA-AATTGATTA-GACCAGTTTCTAA--TT------T-CCATATAC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-TGC--A--AGT---A-GAG-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--C----ATTTTa
gi|49845 : tttAAGCCACA-TCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCAGA--t
gi|49846 : tttTACGGCCACA-CCAA-TTTA----TAAA-A------TA-GTTC---ATCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AT--------------------GA-AAT--GT-G--A-GGT--G--GG----A-A-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49847 : tAAGCCACA-CCAA-TGTA----TGAA-A------TA-ACTC---GTCGAA--TT------T-TAA-A-AA-----------AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAA--GT-G--A-GGC--G--AG----A---G-GT--G-A-----ATTATTT-T---T-AC-A--------AATAT--TTTTCATTTTt
gi|49848 : ttcTAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T-----TTTT
gi|49849 : TAAGGCCACA-GCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTCT--TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-GGCG-GGC--G--GG----A-G-G-GT--G-A-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T-----TTTT
gi|49850 : TGAGGCCACA-CCAA-TTT------------------A-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49851 : TAAGATCACA-CCAA-GTTG----TAAA-G------TA-GTTT---TTCAGA--AT------A-TCA-A-ACTAACCAACAACAA--------------------AA-AAA--AT-G--A-AGC--G--GG----A-G-G-GC--AAA-----ATTA-GT-T---T-AC-T--------AATAT--C----ATTTTt
gi|49852 : TAAAGCT-CG-CCAAGTTTG----TAAA-A------TA-GTTC---T-CGGA--AT---------CC-A-AC-----------AA--------------------AA-A----GT-G--G-GGT--G--AG----A-G-GCGC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49853 : AAGGCCACA-CCAA-TTTG----GAAA-A------TA-GTTA---TTTGGA--TT------T-TCA-A-ACCA---------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GGAGCTA-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATTT--T----ATTTTt
gi|49854 : AAGGCCACG-CCAA-TTTGGTGCTAAA-A------TA--TTG---TTCGGA--TT------T-TCC-A-AT-----------TA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--A--AG----A-G-G-CC--GAA-----A-GA-TT-T---T-ATAA--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49855 : AAGGCCACA-CCAA-TTTA----TGAA-A------TT-GTTC---GCCGGA--TT------T-TCA-A-AG-----------AA--------------------t
gi|49856 : AAGCCACA-GCAA-TTTG----TAAA-A------CA-GTTC---TTCAGA--TA------T-TCA-A-AG-----------AA--------------------AA-ATG--GT-A--A-TGT--A--GA----A-A-G-TA--AAA-----ATTA-TT-T---A-AC-A--------AATAT--T-----TTT
gi|49857 : AGGCCACA-CCAA-TTCG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------A
gi|49858 : AGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGAA--TT------T-TTA-A-GC-----------
gi|49859 : AGGCCACG-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGgtaatttcaaaatg
gi|49860 : GCCACA-CAAA-TTTG----TAAA-A------TA-GATC---TTCCGA--TT------T-TTA-A-AC-----------AA--------------------AAAAAA--GT-G--A-GGT--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTG-TT-G---T-AC-A--------AATAT--C----ATTT
gi|49861 : CCACA-CAAC-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TGCGAA--TT------T-TCA-A-AC------------A--------------------AA-AAA--TT-G--G-GGT--G--GG----A-G-G-AC--GAA-----ATCC-TT-T---T-AC-T--------AACAT--T----GTTTTct
gi|49862 : CATA-CCAA-TTTG----TAAA-A------T--GTTC---TACTG---TT------T-TCA-A-AA-----------GA--------------------CA-AAA--AC-G--G-GGC--GAAGG----A-G-G-GC--CAA-------TA--T-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49863 : -CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTG---ATTGGAATTT------T-TCAGA-ACA----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGG--A--CG----ACG-C-GCAGGAA-----ATTA-TTAT---T-------------AATAT--T----t
gi|49864 : -TTTG----TAAG-A------TC-GTTT---TTAGGA--TT------T-TCG-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA-------------------G----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-CT-T---C-AT-C--------AATAT--T----ATTT
gi|49865 : ----TAGA-T------TA-GCTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AGA--GT-G--A-GGC--G--GG----A---G-GC--GAATATTTATTG-TT-T---T--C-AAAATTTTCAATAT--T----ATTTT
gi|49866 : A-ATTC---TTTGGA--TTAAATT-T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--TT-G--A-GGC--A--GA----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TA-T---T-GC-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49867 : A-ATTC---TTTGGA--TTAAATTTTATCA-A-AC-----------CA--------------------AA-AAA--TT-G--ACGGC--A--GA----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TTAT---T-GC-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49868 : GA--TA------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAAAAGT-G--G-AAA--T--GA----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---G-AC-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49869 : A--------------------AA-AAA--GT-G--A-GAC--A--GG----A-G-G-GC--AAA-----ATTA-TT-T---TAAC-A--------AATAT--C----ATTTTt
Alignments
lowQualScore : 2 1 2222 1 444444 1 222 22 555555 1 2 1 77777777777 88888888888888888888 3 22 1 11 1 22 33 3333 1 1 1 11 22222 2 2 222 1 1 44444444 11 2222
lowQualScore : . . .... . ...... . ... .. ...... . . . ........... .................... . .. . .. . .. .. .... . . . .. ..... . . ... . . ........ .. ....
lowQualScore : 3 1 3333 1 222222 0 888 44 777777 1 1 1 55555555555 88888888888888888888 4 77 2 66 2 88 22 7777 2 2 2 66 99999 4 4 111 2 2 55555555 77 7777
consensus : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
Reference ( family-471 ) : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49829 : TAAAGCAATA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--GT-G--A-GGC--A--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49830 : ttttTAAGGCCACA-CCAA-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AA----T-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-AC--GAT-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTT
gi|49831 : ttttggTAAAGCAATA-TCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--ATGG--A-GGC--A--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49832 : ttttTAAAGCAATATCCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--AT-G----GGC--GAAGG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49833 : ttttTAAAGCAATATCCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--AT-G----GGCAAA--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T--C-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49834 : ttttTAAAGCAATA-TCAA-TTTG----TGAA-A------TATATTC---TTCAGAA-TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--AT-G--A-GGCA-A--GG----A-G-G-GT---AA-----ATTATTT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49835 : ttttAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AG-AGA--GT-G--A-GGC--G--AG----A-G-G-GC--GAT-----ATTA-TT-TAAAT-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49836 : ttttttAGGCCACA-CCAA-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TG------T-TCA-A-TC-----------AA--------------------AA-TA---GT-G--A-GAC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49837 : tttctAGGCCACA-CTAA----G----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AATAAA--GT-G--A-AGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-t
gi|49838 : ttgtttAGGCCACA-CTAG----A----TAAAGA------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AATAAAC-GT-G--A-AGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-
gi|49839 : ttgtttAGGTCACA-CCAA-TT-G----TAAA-A------TA-GTTC---TTC-GA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------
gi|49840 : ttttagtagTAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------CA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATGT--T----ATTTTcatgaaatg
gi|49841 : ttAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49842 : tttTAAAACCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGTA--TT------T-TCA-A-AC------------A--------------------AA-AAA--GT-G--A-GAC--G--GG----A-G-G-GC--GAT-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATATCAT----ATTTTt
gi|49843 : tcTAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-AA-----TA-GTTC---TTCGGA--CT------G-TTA-A-AC-----------AA--------------------AA-GAA--
gi|49844 : ttAGGCCACA-CCAA-TTT-----TAAA-AATTGATTA-GACCAGTTTCTAA--TT------T-CCATATAC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-TGC--A--AGT---A-GAG-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--C----ATTTTa
gi|49845 : tttAAGCCACA-TCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCAGA--t
gi|49846 : tttTACGGCCACA-CCAA-TTTA----TAAA-A------TA-GTTC---ATCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AT--------------------GA-AAT--GT-G--A-GGT--G--GG----A-A-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49847 : tAAGCCACA-CCAA-TGTA----TGAA-A------TA-ACTC---GTCGAA--TT------T-TAA-A-AA-----------AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAA--GT-G--A-GGC--G--AG----A---G-GT--G-A-----ATTATTT-T---T-AC-A--------AATAT--TTTTCATTTTt
gi|49848 : ttcTAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T-----TTTT
gi|49849 : TAAGGCCACA-GCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTCT--TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-GGCG-GGC--G--GG----A-G-G-GT--G-A-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T-----TTTT
gi|49850 : TGAGGCCACA-CCAA-TTT------------------A-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49851 : TAAGATCACA-CCAA-GTTG----TAAA-G------TA-GTTT---TTCAGA--AT------A-TCA-A-ACTAACCAACAACAA--------------------AA-AAA--AT-G--A-AGC--G--GG----A-G-G-GC--AAA-----ATTA-GT-T---T-AC-T--------AATAT--C----ATTTTt
gi|49852 : TAAAGCT-CG-CCAAGTTTG----TAAA-A------TA-GTTC---T-CGGA--AT---------CC-A-AC-----------AA--------------------AA-A----GT-G--G-GGT--G--AG----A-G-GCGC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49853 : AAGGCCACA-CCAA-TTTG----GAAA-A------TA-GTTA---TTTGGA--TT------T-TCA-A-ACCA---------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GGAGCTA-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATTT--T----ATTTTt
gi|49854 : AAGGCCACG-CCAA-TTTGGTGCTAAA-A------TA--TTG---TTCGGA--TT------T-TCC-A-AT-----------TA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--A--AG----A-G-G-CC--GAA-----A-GA-TT-T---T-ATAA--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49855 : AAGGCCACA-CCAA-TTTA----TGAA-A------TT-GTTC---GCCGGA--TT------T-TCA-A-AG-----------AA--------------------t
gi|49856 : AAGCCACA-GCAA-TTTG----TAAA-A------CA-GTTC---TTCAGA--TA------T-TCA-A-AG-----------AA--------------------AA-ATG--GT-A--A-TGT--A--GA----A-A-G-TA--AAA-----ATTA-TT-T---A-AC-A--------AATAT--T-----TTT
gi|49857 : AGGCCACA-CCAA-TTCG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------A
gi|49858 : AGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGAA--TT------T-TTA-A-GC-----------
gi|49859 : AGGCCACG-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGgtaatttcaaaatg
gi|49860 : GCCACA-CAAA-TTTG----TAAA-A------TA-GATC---TTCCGA--TT------T-TTA-A-AC-----------AA--------------------AAAAAA--GT-G--A-GGT--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTG-TT-G---T-AC-A--------AATAT--C----ATTT
gi|49861 : CCACA-CAAC-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TGCGAA--TT------T-TCA-A-AC------------A--------------------AA-AAA--TT-G--G-GGT--G--GG----A-G-G-AC--GAA-----ATCC-TT-T---T-AC-T--------AACAT--T----GTTTTct
gi|49862 : CATA-CCAA-TTTG----TAAA-A------T--GTTC---TACTG---TT------T-TCA-A-AA-----------GA--------------------CA-AAA--AC-G--G-GGC--GAAGG----A-G-G-GC--CAA-------TA--T-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49863 : -CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTG---ATTGGAATTT------T-TCAGA-ACA----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGG--A--CG----ACG-C-GCAGGAA-----ATTA-TTAT---T-------------AATAT--T----t
gi|49864 : -TTTG----TAAG-A------TC-GTTT---TTAGGA--TT------T-TCG-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA-------------------G----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-CT-T---C-AT-C--------AATAT--T----ATTT
gi|49865 : ----TAGA-T------TA-GCTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AGA--GT-G--A-GGC--G--GG----A---G-GC--GAATATTTATTG-TT-T---T--C-AAAATTTTCAATAT--T----ATTTT
gi|49866 : A-ATTC---TTTGGA--TTAAATT-T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--TT-G--A-GGC--A--GA----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TA-T---T-GC-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49867 : A-ATTC---TTTGGA--TTAAATTTTATCA-A-AC-----------CA--------------------AA-AAA--TT-G--ACGGC--A--GA----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TTAT---T-GC-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49868 : GA--TA------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAAAAGT-G--G-AAA--T--GA----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---G-AC-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49869 : A--------------------AA-AAA--GT-G--A-GAC--A--GG----A-G-G-GC--AAA-----ATTA-TT-T---TAAC-A--------AATAT--C----ATTTTt
blockSeqs : T G GTGC G ATTGAT T AGT AT AAATTT A T T TAACCAACAAC AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA T AA G GC C AA AA AGCT C A C AG TATTT T A AAA A A AAATTTTC CA TTTC
blockSeqs : T . . . A . T A AAATT . G . CA . T C . . . A AA T . . . . . T A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
finalCons : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
Alignments
lowQualScore : 2 1 2222 1 444444 1 222 22 555555 1 2 1 77777777777 88888888888888888888 3 22 1 11 1 22 33 3333 1 1 1 11 22222 2 2 222 1 1 44444444 11 2222
lowQualScore : . . .... . ...... . ... .. ...... . . . ........... .................... . .. . .. . .. .. .... . . . .. ..... . . ... . . ........ .. ....
lowQualScore : 3 1 3333 1 222222 0 888 44 777777 1 1 1 55555555555 88888888888888888888 4 77 2 66 2 88 22 7777 2 2 2 66 99999 4 4 111 2 2 55555555 77 7777
consensus : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
Reference ( family-471 ) : TAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49829 : TAAAGCAATA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--GT-G--A-GGC--A--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49830 : ttttTAAGGCCACA-CCAA-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AA----T-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-AC--GAT-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTT
gi|49831 : ttttggTAAAGCAATA-TCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--ATGG--A-GGC--A--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49832 : ttttTAAAGCAATATCCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--AT-G----GGC--GAAGG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49833 : ttttTAAAGCAATATCCAA-TTTG----TGAA-A------TA-TTTC---TTCAGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--AT-G----GGCAAA--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T--C-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49834 : ttttTAAAGCAATA-TCAA-TTTG----TGAA-A------TATATTC---TTCAGAA-TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAT--AT-G--A-GGCA-A--GG----A-G-G-GT---AA-----ATTATTT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49835 : ttttAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AG-AGA--GT-G--A-GGC--G--AG----A-G-G-GC--GAT-----ATTA-TT-TAAAT-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49836 : ttttttAGGCCACA-CCAA-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TG------T-TCA-A-TC-----------AA--------------------AA-TA---GT-G--A-GAC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49837 : tttctAGGCCACA-CTAA----G----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AATAAA--GT-G--A-AGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-t
gi|49838 : ttgtttAGGCCACA-CTAG----A----TAAAGA------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AATAAAC-GT-G--A-AGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-
gi|49839 : ttgtttAGGTCACA-CCAA-TT-G----TAAA-A------TA-GTTC---TTC-GA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------
gi|49840 : ttttagtagTAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------CA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATGT--T----ATTTTcatgaaatg
gi|49841 : ttAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--AG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49842 : tttTAAAACCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGTA--TT------T-TCA-A-AC------------A--------------------AA-AAA--GT-G--A-GAC--G--GG----A-G-G-GC--GAT-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATATCAT----ATTTTt
gi|49843 : tcTAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-AA-----TA-GTTC---TTCGGA--CT------G-TTA-A-AC-----------AA--------------------AA-GAA--
gi|49844 : ttAGGCCACA-CCAA-TTT-----TAAA-AATTGATTA-GACCAGTTTCTAA--TT------T-CCATATAC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-TGC--A--AGT---A-GAG-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--C----ATTTTa
gi|49845 : tttAAGCCACA-TCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCAGA--t
gi|49846 : tttTACGGCCACA-CCAA-TTTA----TAAA-A------TA-GTTC---ATCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AT--------------------GA-AAT--GT-G--A-GGT--G--GG----A-A-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49847 : tAAGCCACA-CCAA-TGTA----TGAA-A------TA-ACTC---GTCGAA--TT------T-TAA-A-AA-----------AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-AAA--GT-G--A-GGC--G--AG----A---G-GT--G-A-----ATTATTT-T---T-AC-A--------AATAT--TTTTCATTTTt
gi|49848 : ttcTAAGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T-----TTTT
gi|49849 : TAAGGCCACA-GCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTCT--TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-GGCG-GGC--G--GG----A-G-G-GT--G-A-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T-----TTTT
gi|49850 : TGAGGCCACA-CCAA-TTT------------------A-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATAT--T----ATTTT
gi|49851 : TAAGATCACA-CCAA-GTTG----TAAA-G------TA-GTTT---TTCAGA--AT------A-TCA-A-ACTAACCAACAACAA--------------------AA-AAA--AT-G--A-AGC--G--GG----A-G-G-GC--AAA-----ATTA-GT-T---T-AC-T--------AATAT--C----ATTTTt
gi|49852 : TAAAGCT-CG-CCAAGTTTG----TAAA-A------TA-GTTC---T-CGGA--AT---------CC-A-AC-----------AA--------------------AA-A----GT-G--G-GGT--G--AG----A-G-GCGC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49853 : AAGGCCACA-CCAA-TTTG----GAAA-A------TA-GTTA---TTTGGA--TT------T-TCA-A-ACCA---------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--G--GGAGCTA-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---T-AC-A--------AATTT--T----ATTTTt
gi|49854 : AAGGCCACG-CCAA-TTTGGTGCTAAA-A------TA--TTG---TTCGGA--TT------T-TCC-A-AT-----------TA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGC--A--AG----A-G-G-CC--GAA-----A-GA-TT-T---T-ATAA--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49855 : AAGGCCACA-CCAA-TTTA----TGAA-A------TT-GTTC---GCCGGA--TT------T-TCA-A-AG-----------AA--------------------t
gi|49856 : AAGCCACA-GCAA-TTTG----TAAA-A------CA-GTTC---TTCAGA--TA------T-TCA-A-AG-----------AA--------------------AA-ATG--GT-A--A-TGT--A--GA----A-A-G-TA--AAA-----ATTA-TT-T---A-AC-A--------AATAT--T-----TTT
gi|49857 : AGGCCACA-CCAA-TTCG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------A
gi|49858 : AGGCCACA-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGAA--TT------T-TTA-A-GC-----------
gi|49859 : AGGCCACG-CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTC---TTCGgtaatttcaaaatg
gi|49860 : GCCACA-CAAA-TTTG----TAAA-A------TA-GATC---TTCCGA--TT------T-TTA-A-AC-----------AA--------------------AAAAAA--GT-G--A-GGT--G--GG----A-G-G-GC--GAA-----ATTG-TT-G---T-AC-A--------AATAT--C----ATTT
gi|49861 : CCACA-CAAC-ATTG----TAAA-A------TA-GTTC---TGCGAA--TT------T-TCA-A-AC------------A--------------------AA-AAA--TT-G--G-GGT--G--GG----A-G-G-AC--GAA-----ATCC-TT-T---T-AC-T--------AACAT--T----GTTTTct
gi|49862 : CATA-CCAA-TTTG----TAAA-A------T--GTTC---TACTG---TT------T-TCA-A-AA-----------GA--------------------CA-AAA--AC-G--G-GGC--GAAGG----A-G-G-GC--CAA-------TA--T-T---T-AT-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49863 : -CCAA-TTTG----TAAA-A------TA-GTTG---ATTGGAATTT------T-TCAGA-ACA----------AA--------------------AA-AAA--GT-G--A-GGG--A--CG----ACG-C-GCAGGAA-----ATTA-TTAT---T-------------AATAT--T----t
gi|49864 : -TTTG----TAAG-A------TC-GTTT---TTAGGA--TT------T-TCG-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA-------------------G----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-CT-T---C-AT-C--------AATAT--T----ATTT
gi|49865 : ----TAGA-T------TA-GCTC---TTTGGA--TT------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AGA--GT-G--A-GGC--G--GG----A---G-GC--GAATATTTATTG-TT-T---T--C-AAAATTTTCAATAT--T----ATTTT
gi|49866 : A-ATTC---TTTGGA--TTAAATT-T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAA--TT-G--A-GGC--A--GA----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TA-T---T-GC-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49867 : A-ATTC---TTTGGA--TTAAATTTTATCA-A-AC-----------CA--------------------AA-AAA--TT-G--ACGGC--A--GA----A-G-G-GT--GAA-----ATTA-TTAT---T-GC-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49868 : GA--TA------T-TCA-A-AC-----------AA--------------------AA-AAAAAGT-G--G-AAA--T--GA----A-G-G-GC--GAA-----ATTA-TT-T---G-AC-A--------AATAT--T----ATTTTt
gi|49869 : A--------------------AA-AAA--GT-G--A-GAC--A--GG----A-G-G-GC--AAA-----ATTA-TT-T---TAAC-A--------AATAT--C----ATTTTt